3PZ9A

Native structure of endo-1,4-beta-d-mannanase from thermotoga petrophila rku-1
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
357
structure length
357
Chain Sequence
FRFIGSNNYYMHYKSNRMIDSVLESARDMGIKVLRIWGFLDGESYCRDKNTYMHPEPGVFGVPEGISNAQNGFERLDYTIAKAKELGIKLIIVLVNNWDDFGGMNQYVRWFGGTHHDDFYRDERIKEEYKKYVSFLINHVNVYTGVPYREEPTIMAWELANELRCETDKSGNTLVEWVKEMSSYIKSLDPNHLVAVGDEGFFSNYEGFKPYGGEAEWAYNGWSGVDWKKLLSIETVDFGTFHLYPSHWGVSPENYAQWGAKWIEDHIKIAKEIGKPVVLEEYGIPKSAPVNRTAIYRLWNDLVYDLGGDGAMFWMLAGIGEGSDRDERGYYPDYDGFRIVNDDSPEAELIREYAKLF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga petrophila
publication title Structural characterization of a novel hyperthermostable endo-1,4-beta-D-mannanase from Thermotoga petrophila RKU-1
rcsb
molecule keywords Mannan endo-1,4-beta-mannosidase. Glycosyl Hydrolase family
total genus 156
structure length 357
sequence length 357
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2010-12-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3pz9A00
3SCOA 3QHOA 4BA0A 4Z2HA 3SCUA 2WYSA 3M6DA 4TX8A 3PHAA 1FHDA 5A8MA 1UQZA 3WNMA 4J28A 1CLXA 3EDFA 4DM2A 3BCDA 2D3LA 1E0XA 4HMDA 1QNPA 3PZVA 1UR8A 4LGXA 4PMOA 2BNJA 1TFVA 2UWFA 1HNYA 3EDEA 3WDQA 2PF0A 2FH8A 1VB9A 4KMQA 4TOQA 3LMYA 3K46A 3AICA 3GBDA 4RE3A 3CTTA 1CBGA 3BLKA 1IZKA 3O9NA 2VX5A 1QW8A 3CIVA 3VPLA 1CGWA 1CXIA 4MAZA 1ODZA 2XPKA 3G6MA 2BXZA 3AFBA 1EHNA 1SMDA 3NUKA 4ZE4A 2VNCA 2BV9A 3ARUA 1MYRA 4HPHA 3VD4A 1J0HA 3WNOA 1KBBA 1V08A 4CVWA 5TD4A 2ZX9A 3AXIA 2XYLA 3VGEA 4P7OA 1V0LA 4J3UA 3CUFA 5EFDA 3EYPA 1UQYA 4JFUA 3GH5A 3JUGA 4D6IA 3QOMA 4CD8A 5A8QA 1J01A 1UKPA 2PWFA 4NRRA 1AMYA 3VIHA 3WUEA 1E56A 1W32A 1H5VA 4MAVA 1BGAA 2VO5A 1VAHA 2ZXDA 4QCEA 2WWDA 1VFFA 2J4GA 5FIPA 1B3VA 1YHTA 1OBAA 1G9HA 4N0RA 2YIHA 1H11A 2XVGA 3MUY1 2CBVA 3DHPA 4DWSA 1HJXA 1TVPA 1MW3A 4UQAA 4UR9A 3NSMA 1XYZA 3WENA 1OGBA 4CN1A 3UEQA 4F66A 3EDKA 2G8ZA 2GVYA 5M3WA 1W1PA 1DEDA 2X1IA 2VZTA 3U5UA 1OT2A 3NDYA 3VMPA 1TR1A 3FN9A 3F5LA 1L0PA 4J27A 4B9YA 4JHOA 1UR2A 5I77A 2IXUA 1MXGA 4BQ2A 2J77A 3BAKA 3VINA 2J7HA 4UZSA 1BPLB 4AY1A 3MUZ1 1RPKA 2XIBA 1CLVA 4WKAA 4DM1A 1XRVA 4GXPA 1AQHA 5LA1A 4L4PA 4P8VA 3VDHA 2OSWA 3N12A 4IPLA 2WMIB 4Y7EA 5CZKA 1MQPA 1W9BM 2QV4A 4JCMA 2WVUA 4EKJA 3W27A 5DF0A 3PZ9A 3W28A 4A3YA 4H8UA 1JNDA 2XFRA 4CD5A 2W91A 3W24A 2G3IA 3VIIA 1J9YA 4BQ4A 1JYXA 3GXMA 2BXYA 1KWGA 3VGGA 4Z2GA 2FH6A 3GNRA 1WZKA 3MANA 4XUYA 2GJXB 1KR0A 4W89A 4GZEA 1ZU8A 1OWQA 2NT1A 4YPJA 1ESWA 1BF2A 2VX4A 3W53A 1KXQA 3W37A 4B3KA 3WH8A 2D2OA 3NYDA 2BFGA 1QNSA 2XM1A 1G94A 4LPCA 1E4NA 1QHZA 2CETA 2GJPA 4AEEA 2ZE0A 3PZMA 1VF8A 3DYOA 4PTWA 3WH6A 1EDQA 4UQ9A 1EO7A 1UWUA 2QPSA 4D1IA 2CBIA 1V0NA 5ABFA 1JL8A 1I75A 3BAIA 2DPEA 2NSXA 3AYRA 1X1NA 1PAMA 1X6LA 3WD0A 4MB5A 3ECQA 1HP5A 2VJXA 2VZOA 5KEZA 1UG6A 3T08A 4CD7A 4RL3A 5A6AA 4ACYA 3ARWA 1V6VA 1H1NA 1XCWA 4FMVA 4B16A 3QR3A 1E55A 3PZUA 1VJZA 1LWHA 4U33A 4W5UA 4AD2A 1Z32X 5A8NA 4MNJA 2WMGA 2WVVA 4WSKA 1US2A 2WKGA 4WJXA 5JIWA 8CGTA 2EQDA 4V27A 5E9AA 3VDBA 1M01A 3L4UA 4S3JA 3WMBA 1OB0A 3OIHA 2ZIDA 1JZ8A 4MB1A 1AVAA 1RD6A 4ZFMA 2XM2A 4TTUA 3SUWA 4GZJA 2E3ZA 3AOFA 4WLCA 3WFZA 1HJSA 1GONA 3AHXA 5IFPA 4HA4A 2WBGA 2J62A 4BQ5A 1ECEA 3A4WA 3CBWA 1EGZA 5GNZA 5ABFB 2W4XA 3TOPA 1E5JA 4U2ZA 4H8VA 5A6BD 1K9FA 1GQLA 5HOSA 1QI5A 1E5NA 5I2UA 5BCAA 4PTVA 1V3LA 1JI2A 3VIOA 3L4ZA 1KCLA 3A6OA 1W9XA 3T0BA 2YA1A 3OLGA 4ACZA 2DIJA 3KE0A 1UR1A 3WDRA 1R7OA 4TUFA 1KQZA 2WHJA 4IPNB 5E6YA 4JHZA 2BHUA 1DP0A 1O7AA 3CHFA 1C7TA 4PUEA 2YA2A 5CLWA 5JUVA 2WVVB 1VFMA 4F8XA 2JEQA 1CIUA 1JF5A 1BYBA 1V6YA 1V0KA 1VJSA 4M82A 2D0FA 4AD4A 5C71A 1BG4A 4NI3A 2ZUMA 3FNDA 3NSXA 1FFRA 4GINA 3MSDA 1TE1A 3AMKA 4QAWA 3KWXA 3NCOA 5HDRA 5BRPA 2V5CA 1KCKA 2XVLA 3PZQA 4YHGA 3W26A 2VX7A 1ZJBA 4KRUA 3T0AA 2EBNA 3N04A 1E6NA 1EHAA 1DWFM 5E0CA 1VENA 1TVNA 1TZ7A 1F4HA 3K1DA 1HF6A 3L2LA 2V3GA 1V02A 3AS3A 1HKJA 3K8MA 4FK9A 4UFKA 1CTNA 4CGTA 1HJQA 5ABGA 1HT6A 1WP6A 1UD8A 5BRQA 1BLIA 4ACZB 5A69A 2NT0A 1UWRA 2CHOA 1KWKA 1E6RA 3BSGA 5D4YA 4AZIA 5HXMA 2XTKA 1ZB5A 2J47A 4FLSA 4AZCA 3NDZA 4OOZA 1CXHA 1EO5A 3KEHA 2WVTA 4MDOA 1JG9A 1UZ4A 2QF8A 2A3BA 2VTFA 1XYFA 3GH4A 2DH2A 3SCSA 2WXDM 3MSGA 3PTKA 1B30A 4FF5A 3UG4A 2CITA 3GDBA 4EANA 4Z2LA 3PZIA 2YL9A 2J25A 2OWCA 3J7HA 1GW1A 1QHOA 4V28A 2ZUWA 4XX6A 3MU7A 3VOCA 5D9MA 2WMFA 2XGIA 3T0DA 1B3YA 2YLAA 2VCAA 3CUJA 3L4YA 2DSZA 2WC4A 4CVUA 3W81A 3FHQA 4W7VA 4CN6A 2DSVA 1E6SM 3OB8A 1XHGA 3BLPX 2WHKA 4TVCA 3A3HA 4ZXOA 3CHCA 2QMJA 4QDMA 1UYQA 1RP8A 4ZENA 1W2VA 5FOOA 2X0HA 3VGFA 5JBEA 2D24A 4QP0A 1FH8A 2G41A 3K4DA 3VX0A 4HMEA 1JDDA 4AYSA 3M46A 2A3HA 3OGRA 1K9EA 2WW5A 1UH3A 1V3KA 3BH4A 1C8YA 1V3MA 3WBEA 4HOXA 1BSIA 1NOUA 1SR0A 1ZL1A 1UHVA 3N15A 3CMGA 1UA7A 1IZJA 2DQXA 3UR7A 4AD1A 1B1YA 1M03A 1K6AA 3QOKA 1R87A 2CNCA 5CSUA 3KL3A 2A3AA 3WL1A 2QLYA 2GUYA 1PX3A 1SFSA 5D9NA 4PRWA 4F79A 4E8DA 1LL7A 4OBSA 3TA9A 2C0HA 2BHYA 3W0KA 4P7NA 4P7QA 1JNEA 2J8FA 3LPPA 3OA5A 3ZSSA 2EEXA 1E3XA 2C7FA 4W93A 1E3ZA 1MW1A 4P8UA 1JGIA 5KZ6A 3THDA 1W3JA 1HVQA 4NSBA 3RPMA 1QNRA 4ATLA 4D1JA 3VIGA 5AC5A 4AIOA 3TTYA 3AQUA 1E73M 1N82A 1CGUA 2DSKA 3CGTA 3L2MA 1AQMA 2Q8XA 1B90A 2E9MA 3WUFA 1KB3A 5CGMA 4C7DA 4TTGA 1UKTA 1VIWA 2CKRA 4R5EA 1WE5A 3AIUA 3CZLA 3TTOA 3VO0A 2QPUA 1U33A 5EBAA 1V6WA 3MKKA 3TONA 4OKDA 3AMGA 3VU2A 2E0PA 5AY7A 3WD2A 1B3WA 2CCRA 2BS9A 4XZWA 3K4AA 2OYMA 1LF1A 3WF2A 3ARSA 2WC3A 2WVSA 4DUXA 3ZO9A 1Q6DA 3DHUA 2XSAA 1JI1A 3WDIA 1EOKA 1BVNP 1PBGA 4PUDA 3WNKA 3AI0A 1NH6A 5A6JA 3WFLA 1KGXA 1OM0A 2FGZA 4U5KA 1TA3B 3ZJ6A 1B2YA 4HOWA 3ZT7A 5IHSA 1UZ1A 2NW0A 1EQPA 3U7VA 3UR8A 1QI4A 1BHGA 3RO8A 2Y8VA 3ARQA 4UOZA 2WM0A 1WDRA 4JFVA 3ZR6A 3L4TA 1GOOA 5ABHA 3PTMA 5ECUA 4PMNA 3ZJKA 3AS1A 2JEPA 1ZJAA 1MQRA 4KWUA 2VVSA 1V6UA 1GQIA 3B9AA 5BXPA 1SMAA 4E4PA 1DHKA 3MV11 4PMXA 3ZT5A 5C70A 2BHZA 4H2CA 2OWWA 1Q6FA 1K9TA 1H2JA 3MMWA 3BAWA 2WHMA 1XGZA 3MS8A 1UD2A 5D9OA 3SCPA 3U7BA 1E6ZA 1FH7A 2VCBA 2E9BA 1EDTA 2DT2A 3UG5A 1NARA 1JDCA 1NWTA 1GOKA 1DWHM 3HJEA 4XZBA 9CGTA 2WZEA 1VBRA 3T2PA 4EK7A 4CCEA 4U5IA 4AXNA 2XJ7A 1IT0A 2F8QA 3RM8A 3AXHA 1FA2A 2OSYA 1CECA 1E1EA 2XVPA 3W4RA 2WZHA 2BVTA 1JZ5A 2PI6A 2B31A 3WF4A 3QHMA 3SIMA 1MFUA 4W7WA 4WKHA 2JFEX 4KGJA 3ARTA 4QLKA 1MFVA 4W7UA 4UQBA 2CEQA 3CMJA 4Z2JA 3AZSA 1HIZA 4UTFA 3ALFA 3WH5A 1E6XM 4HA1A 4JAWA 1V0MA 4NZCA 3ZJ8A 1H4PA 5A2AA 3CH9A 1E0VA 4AIUA 3WKZA 5DO8A 1J0ZA 3CO4A 3ARVA 2W92A 4J7RA 4JZ5A 4U2YA 4J3WA 1H49A 4HU8A 2YJQA 1BYAA 3RJXA 4Q22A 1CNVA 3WSUA 2VRKA 3VILA 5A8OA 3BGAA 1WO2A 2DSWA 4JL1A 5GPRA 4FLQA 4DWSB 2WNWA 3DYPA 2ZUUA 1KXHA 3IJ8A 2XVKA 4DUVA 1JZ6A 4X0NA 3BMVA 1A47A 1DWJM 1HL9A 3W29A 2XHYA 1NM9A 1PX4A 1HKMA 2VX6A 5AC4A 3AHVA 1I1XA 3ZT6A 4ATWA 2XWEA 4YHEA 2JIWA 2EPLX 4KGLA 4PMYA 3SCTA 1E0WA 5E09A 4W84A 2YDQA 4FLOA 3WQWA 1QI0A 3VGHA 2VURA 1J11A 1E15A 1KGUA 1W9PA 5A94A 2W5FA 1IV8A 1JIBA 3E1F1 1C93A 4LQ1A 1UD5A 5JIPA 3MO4A 2O92A 2YA0A 1AQ0A 2O9RA 1E71M 3WEZA 2TAAA 1EQCA 4Z2KA 3N18A 4A3HA 1M04A 2BVYA 4D71A 1UH2A 4HZ6A 1RP9A 3VDAA 1G0CA 2GK1A 1BYCA 3GH7A 3NJ3A 2GDUA 1CXKA 1QHPA 5I6SA 3VD9A 1PEZA 5EMYA 4DWSC 1M53A 3OLIA 4B9ZA 2WLYA 2D0GA 2F2HA 6A3HA 1H0GA 2CHNA 3I3DA 4U3CA 4AZ5A 2JF7A 2VI0A 3CZKA 3OBAA 1HN1A 1WKYA 4W88A 2D23A 3VGDA 5M5DA 3GZAA 3NSNA 4WKFA 1CXFA 3IAPA 2E8YA 4OJYA 4AZGA 4D6JA 2HVMA 1C90A 5IDIA 3LPGA 1ISVA 2ZX6A 3VIPA 3IAQA 1MXDA 1E4LA 3ZR5A 4AWEA 3IJ7A 2DH3A 1J10A 2DGAA 2W63A 2YDRA 4MJ2A 3ZOAA 4V2XA 4AZHA 1LG2A 3K8LA 4TX6A 5A8PA 2HISA 5AYIA 4UFHA 1LG1A 2DIEA 2J75A 1EA9C 3VNZA 2J8GA 4F9JA 5A6LA 4M56A 4J3XA 4C7GA 3SEPA 2V38A 4PYSA 1K9DA 3WDPP 1XCXA 2VUYA 2FHFA 3AXXA 1C8QA 1XH1A 3WNLA 5M03A 1XD0A 4Q7NA 3WF0A 2D20A 3QGVA 2XFYA 4Z2IA 1OIMA 4TXEA 1PIFA 3CZJA 3T09A 5DT5A 2XVNA 2UY3A 1NWRA 2EPNA 1JF6A 2PBOA 4JKLA 3VTRA 4CU7A 1JFXA 4BZYA 1XC6A 3CZGA 2WAGA 3SUVA 2VC9A 1VEOA 4UOQA 1BVZA 5LYRA 2V3DA 1DTUA 4J3SA 3TTQA 2D0HA 3WY1A 2C8NA 3PZOA 1UR0A 5C8BB 2PWGA 2CESA 2OWXA 4W85A 3VD5A 3AZRA 3RMEA 3VMNA 3WUBA 2J7BA 1ISXA 2XIIA 3CPUA 1CXEA 4CD4A 2WHLA 1CENA 7CGTA 4CCDA 2AAAA 1GVYA 4QLJA 2BY1A 2UY5A 3CZ8A 2ESCA 4AC1X 2V5DA 3AIWA 3U5YA 5FL1A 3AHYA 3OLDA 3BAJA 4X0VA 5HPCA 2FHCA 4A4AA 3WEMA 1UKOA 4WK9A 1FFQA 4HZ7A 4MDPA 5HBFA 4BS0A 2YOCA 3PZNA 2VL4A 1ZBKA 5IXEA 3SCVA 4CU8A 3FW6A 4UZUA 1J0IA 1U2YA 1HL8A 3VDCA 2VR5A 3LPOA 1LQ0A 3NIYA 3MMUA 1CXLA 1D2KA 1GOQA 1W9VA 3WNPA 1GJUA 1J0KA 4ZXLA 2D1ZA 3OZOA 3APGA 1B3XA 4MTVA 4E8CA 1TMQA 3GTNA 1D7FA 4K68A 3UERA 3I3EA 2ZWYA 2PBGA 1H09A 2PB1A 4ATDA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3SCO A;  3QHO A;  4BA0 A;  4Z2H A;  3SCU A;  2WYS A;  3M6D A;  4TX8 A;  3PHA A;  1FHD A;  5A8M A;  1UQZ A;  3WNM A;  4J28 A;  1CLX A;  3EDF A;  4DM2 A;  3BCD A;  2D3L A;  1E0X A;  4HMD A;  1QNP A;  3PZV A;  1UR8 A;  4LGX A;  4PMO A;  2BNJ A;  1TFV A;  2UWF A;  1HNY A;  3EDE A;  3WDQ A;  2PF0 A;  2FH8 A;  1VB9 A;  4KMQ A;  4TOQ A;  3LMY A;  3K46 A;  3AIC A;  3GBD A;  4RE3 A;  3CTT A;  1CBG A;  3BLK A;  1IZK A;  3O9N A;  2VX5 A;  1QW8 A;  3CIV A;  3VPL A;  1CGW A;  1CXI A;  4MAZ A;  1ODZ A;  2XPK A;  3G6M A;  2BXZ A;  3AFB A;  1EHN A;  1SMD A;  3NUK A;  4ZE4 A;  2VNC A;  2BV9 A;  3ARU A;  1MYR A;  4HPH A;  3VD4 A;  1J0H A;  3WNO A;  1KBB A;  1V08 A;  4CVW A;  5TD4 A;  2ZX9 A;  3AXI A;  2XYL A;  3VGE A;  4P7O A;  1V0L A;  4J3U A;  3CUF A;  5EFD A;  3EYP A;  1UQY A;  4JFU A;  3GH5 A;  3JUG A;  4D6I A;  3QOM A;  4CD8 A;  5A8Q A;  1J01 A;  1UKP A;  2PWF A;  4NRR A;  1AMY A;  3VIH A;  3WUE A;  1E56 A;  1W32 A;  1H5V A;  4MAV A;  1BGA A;  2VO5 A;  1VAH A;  2ZXD A;  4QCE A;  2WWD A;  1VFF A;  2J4G A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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