4W7VA

Crystal structure of xaccel5a in complex with cellobiose
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
HMLKYVGVNLSGAEFNSRKKPGTLFKDYTYPAASDFSYFAGKGMNTIRLPFLWERVQPELNGPLDQAQLGLIKKSLEAAKANKQYLILDLHNYATYSGKRIGTSDVPAGALADLWRRLALEFKDDKAVIFGLMNEPNGISAPDWANAAQGTITAIRKTGAKNLILVPGTAYTGAHSWRSTSYGVSNAKALEILKDPGNNLAFEAHQYLDKDYSGTKPVCTSDSVGQEKLQGFTSWLRENKQKGFLGEFATANNPVCDKALEGMLTYMEKNSDVWLGWTWWAAGAWWKPDYPFTVQPGKDGSDKPQMAILSKYA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
publication title Crystal structure of XacCel5A in complex with cellobiose
rcsb
molecule keywords Cellulase
total genus 124
structure length 313
sequence length 313
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4w7vA00
3AIEA 1VJSA 3NDYA 5HNNA 3WUEA 1QI3A 1GHRA 4MAVA 1EHAA 4UOJA 2VX4A 4TTGA 2D1ZA 1PIFA 4FF5A 1MW2A 2WWDA 5I23A 3MMUA 4QLLA 3RILA 1AQ0A 1E73M 3WUFA 4B16A 3WNPA 1WZAA 3AZRA 4JFVA 5DEZA 3SCWA 3WDIA 4BQ3A 1KR0A 4JZ5A 4IPNB 1JYXA 1XSJA 1RP8A 1OINA 1E56A 3OBAA 3SCNA 1MFVA 4HOXA 1BLIA 1WCGA 4W88A 3AI0A 2RGMA 2AOSA 4QFUA 1FP9A 1UUQA 4U5KA 3EMCA 4UQCA 4JL1A 4PTXA 2XVGA 5IXEA 3O9NA 2XFYA 4ZEPA 1CTNA 4ZE5A 1U33A 1G5AA 2VR4A 1HJUA 2ZWYA 4ZFMA 1CDGA 2CKSA 2CXGA 1WP6A 3BAWA 2WHLA 4W89A 3CPUA 1VJZA 4H41A 2CBIA 5GNYA 2NW0A 2XIBA 3SUSA 2XFRA 1KB3A 5ABEA 1HIZA 2YOCA 1WPCA 3U7BA 3VDCA 1BYCA 3UR8A 4YHEA 1WZLA 1E43A 5I79A 3IK2A 3SCPA 1XH2A 1JNEA 3AHTA 3DYOA 3T0DA 4WJXA 1BPLB 2ZXBA 4MADA 3UERA 3KEHA 2YBTA 1HP4A 1GOWA 2V3GA 4CN6A 2WK2A 4EAMA 2BHYA 3VNZA 1FHDA 2DH2A 2V3DA 1ZS2A 1J01A 4MNKA 4HPHA 1CBGA 6A3HA 1FFRA 3CZ8A 3SUUA 2QMJA 3U7VA 3AMKA 2G3IA 3ZT6A 1MXDA 3WL0A 7TAAA 1JYVA 1C92A 5E70A 4XB3A 1HJSA 3AMDA 5DF0A 4MNMA 1M04A 1JDDA 3CZKA 3UEQA 1QI0A 4YN5A 2F2HA 2WSKA 4WKAA 1NWUA 1DWGM 3VTRA 1JFHA 5BXPA 5AY7A 2NSXA 3W53A 4H8HA 4F9JA 1ISXA 2CERA 1EQPA 1DP0A 1OSEA 3VDAA 1FOBA 1VAHA 3T0BA 1OD8A 3RM8A 1PIGA 3VNYA 2VJXA 4OKDA 1B9ZA 1TCMA 4HMEA 1UD5A 2F8QA 5A69A 1H11A 1CGTA 3GXMA 1B1YA 5F7UA 2BVDA 2CBJA 1JAEA 2HVMA 1FH8A 3W25A 4Z2HA 1VRXA 1E3XA 3AXHA 2WKLA 1W9PA 1E15A 1E4MM 1UOKA 2WMIA 1EIBA 2ZX9A 2XJ7A 2ZUNA 1CXEA 1G0CA 1V0NA 4KRTA 1J0IA 3GBEA 3L4YA 3OG2A 3AXIA 4QDMA 5FL1A 2J7EA 3N18A 2WKGA 4AD1A 4P7LA 4DM2A 4GI8A 3CHCA 4ATLA 3WF0A 1DWIM 4NF7A 1DTUA 4UQBA 3WF1A 4E2OA 2X09A 1V02A 2GSJA 1WKYA 4ZENA 1GORA 2ZUSA 3AIWA 1QNQA 1HNYA 3U5UA 1JYWA 2VMFA 2WVVA 1MQPA 2Y2WA 1NOUA 1EGZA 2VZUA 4BQ4A 2GJPA 1WE5A 2BHUA 1UR4A 4AD2A 2VT0A 1H0IA 2XHYA 5A6LA 1KWKA 5EBAA 4H7VA 3WDQA 3W81A 1Q6DA 2WPGA 5A1AA 1XH0A 2AAAA 1W3HA 3SCQA 1E6QM 2PWDA 5HPOA 1PZ2A 3S6TA 2BNJA 1KXTA 3WNOA 4LXFA 4GKLA 4AWEA 4GINA 4AZ5A 3W6LA 4N0RA 3BAXA 3OGRA 1JNDA 1B3ZA 1UWIA 5E6YA 1EDQA 3L4VA 1JDAA 1KXVA 1JZ6A 3FHQA 1TVPA 4JFUA 1ISYA 4MB4A 1QNOA 1UR2A 2O9PA 1VFMA 3RIKA 1OIMA 1E0XA 1PX3A 5ABFA 1UH4A 2XYLA 1V3JA 1VIWA 1O6IA 1TMQA 2Y8KA 2J75A 1JAKA 1ITXA 3APGA 2XM2A 5CGMA 2OSWA 3W38A 1E5NA 1ZJBA 2YL9A 4PMUA 3WH7A 3QHMA 3TTQA 3RM9A 4PUDA 3BCDA 4CD8A 3WKZA 1Q6GA 2E4TA 2WMFA 3AYRA 3L4WA 3MSDA 2FDMA 5TD4A 5D9OA 3A6OA 3WMSA 3SCTA 4HP5A 1TG7A 1UQYA 1B31A 3DECA 3L4ZA 5HBFA 2V5CA 2WVTA 3ALFA 3PTKA 3KL0A 3CLWA 3KL5A 4MNLA 1UKSA 3EBVA 1LG2A 3ARPA 4YPJA 1UR8A 5BROA 4UFMA 5CGTA 1V3KA 1QVBA 3WH5A 2E9LA 2J8GA 4W8BA 1V0KA 3ZIZA 1LG1A 1HL8A 5M5DA 5CZKA 1K6AA 4LGXA 2ZWZA 5ABHA 3ZT7A 1KCKA 4XV0A 4A3HA 2E0PA 4HZ7A 3M7SA 1BSIA 3VIMA 2G41A 2C7FA 2J25A 4P7OA 1GNXA 1JD7A 2IUZA 2GJXA 4WSKA 1E3ZA 1HJQA 1D7FA 2QV4A 1G9HA 1JXJA 3WD3A 1V0MA 4AZHA 1UWUA 3VIFA 3SUVA 3GZAA 1ZBWA 4U2ZA 4JKLA 5D8WA 1R85A 2VZTA 1B30A 4P7QA 2GVYA 2WAGA 3VDBA 5JBDA 4DWSA 4DUVA 5I5RA 4F9DA 1R87A 2WVUA 3SURA 1OGSA 2GK1A 4JKMA 1WZKA 3MV11 3PZGA 3FXYA 3VIOA 2Y4SA 2ZUWA 4CD7A 4MNJA 5GNZA 5CG0A 2W91A 5IHRA 4TX8A 5GQBA 1E6ZA 4TUFA 3ZSSA 3WF4A 2VTFA 2W62A 4CCDA 1VF8A 1SFSA 4HU0A 1EOKA 3IJ7A 4TVDA 1E40A 5HOSA 1ODZA 2Y24A 1E4IA 4LQ1A 3BSGA 1O7AA 2PC8A 2G3MA 4BF7A 1V6YA 3ZJ6A 3VU2A 1UG6A 3SCRA 5CPQA 4PYSA 4W7VA 5HDRA 5HPCA 1QI2A 1DWFM 2EJ1A 3PZMA 3K4AA 2FH8A 1GOKA 4AD5A 1VENA 3I3DA 1CXHA 4KGLA 4KMQA 5CXPA 2BS9A 3WIJA 1NWSA 2E9BA 3CHFA 4KH2A 3DC0A 1GHSA 3II1A 1TA3A 3TTYA 4W87A 1J11A 2D3NA 3AHXA 3VIPA 2QLYA 1JFXA 2J78A 4UTFA 4WK9A 3S2CA 2X0HA 4BQ2A 4UFIA 3GYCA 4GO8A 5I2UA 2CBUA 4D71A 3IANA 3QHNA 4HZ8A 3K8LA 4FLRA 1ITCA 3F5KA 1LWJA 1UWQA 1BYAA 4Y7EA 4P7NA 4DM1A 4P8XA 1Q6CA 2GDVA 2XWEA 4NI3A 3VX0A 4DWSD 4MB5A 1GVYA 1C8QA 1FP8A 4ZE4A 2VVSA 2XVNA 3AS3A 4Z2GA 3NJ3A 1XC6A 4GQQA 2XVLA 2E8YA 2WYSA 1EHNA 3WL1A 1ISZA 3NIYA 2WMGA 2EPKX 3LPGA 2DDXA 4DWSC 5BCAA 4PRWA 3GH7A 4PMRA 5DT7A 3EDKA 3PZVA 4UFJA 4D1JA 3QOMA 1P6WA 4ACYA 5BWFA 2ZUMA 2VCBA 1OWQA 2WW5A 3DYPA 1D3CA 2CEQA 2PWFA 1KXHA 3AOFA 4JL2A 3WFLA 1KFWA 5DMYA 1W2PA 1V03A 9CGTA 2DSWA 4MDOA 4ACZB 2PB1A 3AHYA 1W9BM 1ZBKA 4D6HA 2OSXA 1B3XA 4MJ4A 1V3MA 3ARQA 1VFUA 3W4RA 3EDDA 2BVTA 5LA0A 2G3JA 3AIRA 2FGLA 4D72A 1G01A 2WVSA 2W5FA 2WCGA 3W24A 3WF2A 1ZBVA 3CZLA 4W93A 1UKQA 2CHNA 1J0JA 4CVUA 4MDPA 1VEPA 1NM9A 2VOTA 3CZEA 4QCFA 4AD0A 3EDFA 2PBOA 1MYRA 3VIIA 1ZL1A 4AZCA 3AXXA 3MU7A 3VD3A 2GFTA 3F5LA 3BCFA 1F4HA 1BAGA 2W67A 1AQHA 1XSIA 2GJRA 5CSYA 3GNOA 1OCQA 2XPKA 3AJ7A 4MTVA 4AZ7A 1RH9A 4WLCA 1GOMA 1E0VA 4BQ5A 1MQQA 4FLSA 1JZ5A 1UKPA 3N17A 1QNSA 5E0FA 3WUGA 1W9XA 5IFPA 3AS1A 1H1NA 3LPOA 3ZT5A 3VD4A 3WEMA 3MUZ1 1KBBA 4D6CA 2EPMX 1HKIA 4M29A 1MW3A 4OOZA 3CMJA 2YL6A 4AD4A 3I3EA 4BZYA 1Q6EA 1M7XA 1XCWA 2DT3A 3NCOA 4AEFA 3WQ5A 4M82A 4GO9A 4UFHA 1FHLA 2X0YA 5DT5A 1S46A 3WBEA 1K9TA 4AISA 1CLVA 3EMZA 4N42A 2OWXA 1PPIA 5CSUA 3BAKA 5JBFA 4HPGA 3RM4A 4TVCA 3AFBA 2UY4A 4P8WA 4PCTA 1EO5A 4PMYA 4D1IA 1UD2A 1IZKA 1X1NA 1HKKA 2WHJA 5AC4A 3VD9A 2V3FA 4GZEA 2OYKA 4CCEA 1PJ9A 2DPEA 1OBAA 2VI0A 4U5IA 4A4AA 4WKHA 4AEEA 3BGAA 2B31A 5A6MA 7CGTA 5A2CA 3ZR5A 2BHZA 1CGYA 1DHKA 2VCCA 2GJXB 3WDRA 4W7UA 5A8QA 3WSUA 4HU8A 2DIJA 1WDPA 1VBUA 3BAYA 3E1F1 4KWUA 2YBUA 1UR9A 2CPUA 3WY1A 1BTCA 2IXUA 3ZOAA 4R27A 2PWEA 1RP9A 4IUGA 1GQJA 3FHAA 3KL3A 1Q4NX 1W91A 2JIEA 4B3LA 2VX6A 4DWSB 4FMVA 4PMNA 1GCYA 1QHOA 1WDRA 1B0IA 2J8FA 2GK1B 2PF0A 3MV01 1J0KA 3FY1A 1EDTA 3B9EA 4GPNA 4UOZA 3ARZA 4CKQA 2WLZA 1TUXA 1J10A 1MW0A 4P8UA 3ZR6A 4CD6A 1XHGA 3VIHA 1JGIA 1E4NA 1F4AA 4OBSA 3N12A 2W92A 4AZGA 1Y7VA 2IXVA 3MO4A 3VDHA 4M81A 4H8UA 1SR0A 1RD6A 3RDKA 1B3WA 2PI6A 1CLXA 1H4PA 2XTKA 3O6AA 3VMNA 2EXOA 1BG9A 2X2YA 2Z1SA 1BQCA 3T2PA 4DUXA 3U57A 2Q8XA 1JI2A 1KCLA 3QGVA 5A8OA 4ZXOA 2WHKA 3PN8A 3SCOA 5AYIA 4M56A 4F79A 5C70A 1AQMA 1PZ3A 3CUGA 1UA7A 1AMYA 4UNIA 2WBGA 6TAAA 2EEXA 2QPUA 3PZIA 1E9LA 1J12A 3VINA 1MW1A 4AMCA 1JZ2A 1B3VA 3TP4A 3WD4A 1W9UA 1N82A 2FHBA 3CUJA 3TOPA 4CN4A 3OGVA 4URIA 3GM8A 1JZ8A 4JHOA 5ECUA 2VUYA 5A6BA 3MANA 1DWJM 3AIBA 4CD4A 3GH5A 5A6KA 1CGXA 1MFUA 1GQKA 3VILA 1YQ2A 3W0KA 3PHAA 2EPOA 1FH9A 1NARA 1V6XA 1NQ6A 2VCAA 4J3TA 2D23A 5LA1A 1H0GA 3HN3A 3N1AA 2TAAA 2D0FA 4K68A 2J7BA 4CU7A 3M07A 1K9FA 5FKYA 3WH6A 2ZXQA 2D22A 2BY3A 2XVPA 3THDA 4EE9A 1VBRA 3CUIA 1XD0A 3CMGA 1QBAA 2WHMA 2J7GA 2ZX6A 2D0GA 1VEMA 1G94A 1ZU8A 1JZ4A 4L4OA 3UG5A 3K8KA 3T2QA 1E0WA 1EH9A 3WQ8A 4PSRA 3L4XA 3OLIA 2XVKA 2D3LA 3ECQA 3VOCA 1XH1A 4H2CA 3F5JA 4UCFA 3CIVA 1R7OA 4J28A 1UD3A 5IFTA 4JFWA 3MUY1 3AYSA 4U3CA 1E6PA 4DUWA 3RPMA 2JFEX 1GOIA 4WIWA 1CXFA 1R8LA 8CGTA 4JHZA 5FIPA 1EO7A 4U3AA 1I1XA 3AMCA 1W9DM 1LQ0A 5I78A 1H5VA 1OGBA 4UR9A 3WDJA 1QW8A 5IDIA 3AROA 5DO8A 1OB0A 4MB3A 3AZTA 4MB1A 1LL7A 3VGHA 1UKOA 5GNXA 3GNPA 4J7RA 3WNLA 2CIPA 2GDUA 3PZQA 1OGGA 5BXSA 1UR0A 1J18A 1HT6A 4CU8A 4HMCA 5D9PA 3RJYA 5BXRA 4UZSA 1TR1A 1XSKA 4PMZA 5A8PA 2ZE0A 5HXMA 5CLWA 1LJYA 1UWRA 4QAWA 1HL9A 1X6NA 3QR3A 4J3SA 3WQ4A 2ZOXA 5FD0A 3RCNA 4JKKA 1E6RA 5CJ5A 3UR7A 3W37A 4JFTA 2W61A 4C7DA 3O2LA 4W8AA 3MMWA 1KR1A 4LYRA 5FCZA 4MPKA 5EFDA 4TTUA 1BGGA 3G6MA 1W9VA 3VGFA 3WENA 1V6VA 2D2OA 4HOWA 3WDPP 2ZUVA 1K9DA 1MQRA 2WC3A 1E70M 1ISWA 2J7FA 1WZMA 3WD0A 2FH6A 2J4GA 4M1RA 4D6FA 1DEDA 4AZIA 4OIFA 3AZSA 2YLAA 2WMKA 3EDJA 4GIAA 3OLDA 2VX7A 1AVAA 1D2KA 3SCUA 4ZXLA 1A3HA 4J3WA 2VRKA 3T0AA 3IAPA 4Q7NA 5CLTA 2W66A 3OB8A 1JF6A 1NOWA 2W63A 3BMWA 1UWTA 2NT1A 1FH7A 4NRSA 2ZX8A 4U2YA 2YDQA 3WNMA 2O9TA 4IPLA 3CZGA 5LA2A 4C7FA 4HOZA 1US2A 5A2BA 1QOXA 1NP2A 1WDQA 1WO2A 4JCMA 1NOFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AIE A;  1VJS A;  3NDY A;  5HNN A;  3WUE A;  1QI3 A;  1GHR A;  4MAV A;  1EHA A;  4UOJ A;  2VX4 A;  4TTG A;  2D1Z A;  1PIF A;  4FF5 A;  1MW2 A;  2WWD A;  5I23 A;  3MMU A;  4QLL A;  3RIL A;  1AQ0 A;  1E73 M;  3WUF A;  4B16 A;  3WNP A;  1WZA A;  3AZR A;  4JFV A;  5DEZ A;  3SCW A;  3WDI A;  4BQ3 A;  1KR0 A;  4JZ5 A;  4IPN B;  1JYX A;  1XSJ A;  1RP8 A;  1OIN A;  1E56 A;  3OBA A;  3SCN A;  1MFV A;  4HOX A;  1BLI A;  1WCG A;  4W88 A;  3AI0 A;  2RGM A;  2AOS A;  4QFU A;  1FP9 A;  1UUQ A;  4U5K A;  3EMC A;  4UQC A;  4JL1 A;  4PTX A;  2XVG A;  5IXE A;  3O9N A;  2XFY A;  4ZEP A;  1CTN A;  4ZE5 A;  1U33 A;  1G5A A;  2VR4 A;  1HJU A;  2ZWY A;  4ZFM A;  1CDG A;  2CKS A;  2CXG A;  1WP6 A;  3BAW A;  2WHL A;  4W89 A;  3CPU A;  1VJZ A;  4H41 A;  2CBI A;  5GNY A;  2NW0 A;  2XIB A;  3SUS A;  2XFR A;  1KB3 A;  5ABE A;  1HIZ A;  2YOC A;  1WPC A;  3U7B A;  3VDC A;  1BYC A;  3UR8 A;  4YHE A;  1WZL A;  1E43 A;  5I79 A;  3IK2 A;  3SCP A;  1XH2 A;  1JNE A;  3AHT A;  3DYO A;  3T0D A;  4WJX A;  1BPL B;  2ZXB A;  4MAD A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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