2J75A

Beta-glucosidase from thermotoga maritima in complex with noeuromycin
Total Genus 178
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
178
sequence length
443
structure length
438
Chain Sequence
VKKFPEGFLWGVATASYQIEGSPLADGAGMSIWHTFSHTPGNVKNGDTGDVACDHYNRWKEDIEIIEKLGVKAYRFSISWPRILPEGTGRVNQKGLDFYNRIIDTLLEKGITPFVTIYHWDLPFALQLKGGWANREIADWFAEYSRVLFENFGDRVKNWITLNEPWVVAIVGHLYGVHAPGMRDIYVAFRAVHNLLRAHARAVKVFRETVKDGKIGIVFNNGYFEPASEDIRAVRFMHQFNNYPLFLNPIYRGDYPELVLEFAREYLPENYKDDMSEIQEKIDFVGLNYYSGHLVKFDAPAKVSFVERDLPKTAMGWEIVPEGIYWILKKVKEEYNPPEVYITENGAAFDDVVSEDGRVHDQNRIDYLKAHIGQAWKAIQEGVPLKGYFVWSLLDNFEWAEGYSKRFGIVYVDYSTQKRIVKDSGYWYSNVVKNNGLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
publication title Glycosidase Inhibition: An Assessment of the Binding of 18 Putative Transition-State Mimics.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE A
total genus 178
structure length 438
sequence length 443
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2006-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2j75A00
1KR0A 1E4NA 1QBAA 3WF1A 4UFKA 2DT3A 1VJZA 1JFXA 5A8OA 1CIUA 2WVVB 3CHDA 3BAXA 3K8MA 4KRUA 5D9NA 3W27A 3THDA 4W84A 4E8DA 3OGSA 3MSDA 1P6WA 1XSKA 3TOPA 2WSKA 2CXGA 3SCOA 1SMAA 1KQYA 1UH4A 3SCTA 1JAKA 3VU2A 4DUVA 3AISA 1CBGA 3VKKA 1J0YA 3GDBA 3WUGA 1QHZA 4RE2A 4DM1A 1VFMA 4M80A 4IISA 3BH4A 3PBGA 4OBSA 4MB5A 3WQ5A 1W9XA 1WZLA 1W32A 1ODUA 1W1YA 1LLOA 2X05A 1CXFA 1LG2A 2NT1A 4ACZA 2WHKA 1UD2A 2YA1A 1NWUA 5A1AA 1OIMA 4WLCA 1EDQA 3MS8A 3B9EA 3WNMA 1Z32X 1V03A 1GHRA 2F2HA 4GQRA 4W8LA 1KCKA 1J10A 4BQ3A 3OA5A 3VUPA 4GI6A 3CHCA 4UFMA 3W37A 4CD7A 5JBDA 3ARQA 1TZ7A 4LYQA 4J3VA 3S2CA 1E72M 2ZXQA 4M81A 4ACZB 1ZBKA 2XGIA 1J0KA 1ISXA 4HPGA 3DHPA 4L4PA 1FP9A 4RE4A 1UA3A 3AIBA 3ARSA 4EE9A 3II1A 3SUSA 2CETA 2XWDA 2J7FA 1GOOA 1ECEA 1CXKA 1ZL1A 1BG9A 4GZJA 4Q7NA 4JL1A 2WANA 2FHBA 1G94A 3GNPA 3WH6A 1BVZA 2WMIA 4CU8A 2EEXA 1K9FA 2ZICA 4N0RA 2YL5A 3B9AA 1BQCA 2A3BA 1AQ0A 1FP8A 2DDXA 1UR4A 3RCNA 3MUZ1 3FXYA 4PMZA 1UD3A 2VVNA 4AZCA 4D6DA 2XPKA 1CYGA 4JFWA 2CEQA 1V6WA 2WMIB 2YBTA 3TP4A 3VINA 3WF3A 3GXMA 1UD6A 4HOZA 3T2OA 3L4VA 2J7EA 3GH7A 2WZHA 4BZYA 1VBRA 1ZBWA 5AY7A 4AISA 4LYPA 1W3HA 3AS1A 1I1WA 1HX0A 1W9DM 4OUEA 3WQ8A 2VCBA 4UQCA 1FA2A 4PCTA 1PBGA 2WB5A 2YA0A 1N82A 4AZCB 1V0MA 4D6HA 4U3CA 1BGAA 3VD5A 1LWHA 3OLEA 1OCQA 2VRKA 2PWEA 4U5IA 2WVUA 3K8KA 1VEPA 2GK1B 2WBGA 5GNZA 3KL0A 1AQMA 1C91A 1E3ZA 1WKYA 4MNMA 1UWIA 1C8QA 1QHPA 1GQIA 1X6LA 1CZ1A 2QHAA 4QFUA 3AS2A 2IXUA 3AZTA 1GW1A 1GZJA 4W7VA 3RM4A 3VDHA 1EQPA 1HF6A 3EDJA 5JBFA 4DWSB 4L4OA 3S6TA 2UWFA 3IJ9A 2BFGA 1QNPA 5D9OA 1JI2A 3ARVA 1C8XA 2MANA 4H7VA 2OLHA 1NOWA 4Q22A 1I75A 2G8ZA 3PZTA 3VIIA 1ISWA 1GOQA 4HU0A 4K68A 4F79A 4RL3A 4YHEA 3KL5A 2DSUA 4FF5A 3WH7A 4B15A 1FFQA 4JAWA 4ML4A 3HN3A 4W93A 2EPNA 3TTOA 2YBUA 4WSKA 3EDFA 1J0JA 1BSIA 3OG2A 2VVSA 4GO9A 1OGGA 4HTYA 3IAQA 3RPMA 3VIFA 5IFTA 3ARRA 3AFBA 4MADA 1E0XA 3BCDA 3VIOA 5CZKA 1IZJA 1EOKA 4D1JA 2J7HA 3SUWA 5F7UA 5A94A 3WNLA 5A6SA 3PHAA 3AICA 4XB3A 2CESA 3NSXA 1E15A 4A3HA 3AMDA 4BF7A 1GORA 5CPSA 1UQZA 3WD4A 5DT5A 1JDAA 5DMYA 5I0DA 1K9EA 2OYMA 2VO5A 1PX8A 1OBAA 2WNWA 3ZO9A 3QR3A 2PWFA 1CGWA 3FHQA 2QPUA 3J7HA 3ZR6A 5IHSA 7CGTA 4ZENA 3WD0A 2X0YA 1E55A 1G1YA 4WK9A 5BCAA 2J77A 1EH9A 5JBEA 1DWAM 2EPMX 3TTYA 5EMYA 3A3HA 4EANA 4B16A 3EMQA 4LXFA 3NYDA 3VM7A 3AMGA 4ZXLA 2ZXBA 3N18A 5I5RA 2IXVA 3PZOA 2X2YA 4S3JA 4BQ4A 1VJSA 5JIPA 4D72A 1CGYA 4LYRA 2F61A 1KFWA 1C90A 1OSEA 3W38A 2DQXA 3FW6A 3WENA 2VRQA 1MXDA 4HP5A 2WMKA 3NSNA 3KE0A 3VX0A 3N12A 1FHDA 5A2BA 2XGBA 4B3KA 2VZSA 3EDKA 2YOCA 2W4XA 4WF7A 1W2VA 3GBDA 1ESWA 2FHCA 2FH6A 4AD5A 1KGWA 3U7VA 1JXJA 1E6XM 3OBAA 4UOQA 3ALFA 3CMJA 4RE3A 2WK2A 2E9MA 4PEEA 2WHMA 4HMEA 3ARXA 4UR9A 1TA3B 2ZX6A 2EO7A 5DF0A 5HOSA 1PZ3A 5DO8A 4W85A 1EO5A 4EK7A 1RD6A 2PI6A 3CH9A 1V6UA 2J74A 1WP6A 4NSBA 2OWXA 4FLRA 3WELA 2XM1A 1V3KA 1E6PA 2E3ZA 3RJYA 2UY4A 2CBIA 3W53A 2VNCA 2XYLA 3O2LA 3DYOA 1OT1A 2EPKX 4ATWA 1C92A 4XZBA 1DWJM 1ZBCA 4W5UA 3SCQA 1W1VA 1A47A 2XTKA 4WSJA 3W81A 2WYSA 3CPUA 3EDEA 4AZ7A 4F66A 3T0DA 4D6IA 3OLGA 3W0KA 1H2JA 5BYWA 3BSHA 1PZ2A 4PYSA 1CXLA 1H4PA 3QOMA 3LMYA 1GOKA 1IT0A 1HVQA 2XIBA 3ZSSA 2O9TA 4UQDA 4GO8A 4W8AA 1JDDA 3A6OA 3WDPP 1M04A 1MW1A 3VD9A 1ISYA 3KL3A 1CLVA 1EHAA 2GJXA 4MPKA 4ZE5A 1SYTA 4V27A 3ZJ7A 3VD7A 1GJUA 3MUY1 1UH3A 4UQBA 4F9DA 1CDGA 2BHZA 3W29A 4JFSA 1B0IA 1RP8A 1ZJBA 3CBWA 1CECA 1MWOA 4PMNA 1RP9A 2CPUA 5ABFB 3T2PA 3L2MA 3WDJA 3IJ7A 1H1NA 1S46A 2ZUMA 3M6DA 4DUXA 1HL8A 1MYRA 4HMCA 4P8WA 4JFVA 1W2PA 4FLOA 1NQ6A 4WIWA 2XG9A 1J0ZA 4CKQA 1F4HA 4PMQA 1TCMA 2G4FA 2BXYA 2XUCA 2FH8A 1E73M 1M53A 3BSGA 1V6XA 1EQCA 1QI2A 1ITXA 1QPKA 1W1PA 4PUEA 1KR1A 1GJWA 4PMDA 2G3IA 4Z2HA 1MXGA 1J12A 2BY1A 1V3JA 1WDPA 1QI3A 1F4AA 5GPRA 2HVMA 1EXPA 1XYZA 2ZX7A 1UWTA 2WCSA 1OGSA 4W5ZA 4AZ5A 4D71A 1JFHA 4HOWA 4HPHA 2FHFA 4A3YA 4CCEA 4AYSA 4QCEA 2WPGA 2JE8A 2YKKA 1X6NA 3VM5A 1FHLA 2W91A 1VEMA 3W26A 1OB0A 1CPUA 4NRSA 5HPCA 3THCA 3G6LA 5AC5A 3PZUA 1QW9A 3T0BA 1FFRA 1FOBA 1UR8A 2YLAA 4R5EA 3VGGA 6A3HA 2QMKA 3HMCA 2EPOA 5BXRA 1UKPA 1HP4A 1JAEA 2ZOXA 3ALGA 3B9DA 2VZOA 3CLWA 5IHRA 3EDDA 2JFEX 5M17A 1C7TA 5JIWA 1B31A 5TD4A 2ZUWA 4TVDA 3PZGA 1K9TA 2WCGA 2OWCA 1V0LA 1TVNA 1O7AA 1H41A 2D3LA 1ISVA 1W9BM 1R86A 3WY1A 2W5FA 4D6GA 4UQAA 1H11A 1KWGA 4PTVA 2WVVA 1XD0A 5FD0A 3WKZA 2JF6A 4QLKA 2YLLA 1HL9A 3MMWA 5A8MA 4M1RA 4XZWA 3VPLA 5E09A 3SCNA 2VTFA 4CCDA 3HJEA 4M24A 3GH4A 1PIFA 3ZJ6A 1OT2A 2PBOA 4OBRA 4CD8A 4HZ8A 4NI3A 4YN5A 1XHGA 3CZJA 4KWUA 2GJPA 3WMCA 4M29A 1LL6A 4KGLA 4JCLA 5BXPA 3VMNA 1B9ZA 3I3DA 4NRRA 1HKIA 2XSAA 4JKLA 5C8BB 1H5VA 1GCYA 4WJXA 1L0PA 1GVYA 3CUHA 4E2OA 1AVAA 1UWUA 5CGMA 4HZ7A 1JNEA 3AHZA 1Q6DA 4QDMA 3NDYA 3SCSA 5A8PA 2W61A 4AWEA 3CIVA 3U7BA 4C7FA 2J75A 3SCVA 2CBJA 1CENA 1DWFM 3AYRA 3VGHA 4BA0A 5A6LA 1SMDA 1HP5A 1W91A 2Y8KA 4JCMA 1WZKA 3CHEA 3KEHA 3WMBA 4BQ2A 4MB3A 4CVWA 4U31A 4AW7A 1HT6A 5A3HA 1E6QM 2WM0A 2O9RA 1BHGA 3U5YA 1KBBA 3AIWA 1BGGA 4F8XA 2DT0A 5FKYA 4KH2A 1V08A 4MB4A 3U57A 2YIHA 1V6VA 4GQQA 2D0HA 4AIEA 1MFUA 1WO2A 2PC8A 1GOMA 4CU7A 2JIWA 4XUYA 2HISA 3UG4A 5BRPA 3EBVA 4H41A 3AMCA 1V0KA 4P8UA 3AZRA 3AIQA 2PWGA 1NWSA 2X09A 2J47A 1E5JA 4AEFA 5E9AA 1UR0A 3DYMA 5BROA 2A3AA 4AD4A 2DSKA 1HJUA 4U2YA 1IV8A 4MNLA 2QLYA 4UZUA 2VT0A 4PTXA 3WF0A 1NOFA 2DSVA 5FIPA 3OZPA 3WQWA 4ATLA 3BAWA 2VC9A 4AZBA 5A2CA 3QOKA 1K6AA 4XV0A 1JZ8A 3UCQA 4QAWA 3AOFA 2VL4A 3CUJA 5BRQA 5EB8A 2WHLA 1D7FA 3L2LA 2WXDM 3SCWA 3E1F1 1O6IA 5E6YA 3MMUA 2YL8A 2GK1A 2ZUVA 3VIJA 3ZSTA 2X8RA 1JL8A 2WSPA 3PZMA 2XHYA 3AHXA 3ZIZA 3DC0A 1JXKA 4GZIA 3CZLA 1WDRA 2XIIA 3VGBA 2C0HA 4HU8A 4DWSA 3ZJ8A 2VZTA 5HXMA 4DWSC 4J3UA 4DM2A 4PCSA 8A3HA 3BAJA 4CGTA 4CCCA 2WBKA 1WDQA 2AOSA 1XCXA 2RGLA 1XV8A 4TXEA 3LPOA 4X0NA 2CNCA 1NP0A 2XVKA 8CGTA 1GOIA 1UR9A 1E40A 4NZCA 2VX4A 3PZNA 3CO4A 2WVTA 2ZUTA 3D5HA 5M3WA 1QI0A 3I3BA 3WBEA 1UD4A 3N11A 1QNRA 2E9LA 3O6AA 4IUGA 5ABGA 3W28A 1R7AA 1V3IA 2ZWZA 3RJXA 4TUFA 1CEOA 1BYBA 1WPCA 2NT0A 3F5JA 3MV11 4A4AA 5A6KA 3IJ8A 4D6JA 4P7NA 3WFLA 1QVBA 2F8QA 3UERA 1M01A 2DIJA 4MAVA 3QGVA 4C7DA 1CGVA 3M07A 4IPNB 2TAAA 3DYPA 3MUIA 1CGXA 1EIBA 1E3XA 3OLDA 2D0FA 3EYPA 1C7SA 3N15A 3CZGA 1E4MM 3K4DA 1W9UA 2OSYA 1B1YA 2A3CA 1OWQA 5E0CA 5KZ6A 4JHZA 4FMVA 1JZ7A 4FLSA 5LYRA 4AY1A 1VFOA 1GPFA 2WZIA 2XVGA 2XVLA 5FOOA 5E6ZA 2J62A 4PBGA 3WBAA 2C8NA 1XSIA 1BLIA 4N42A 3L4ZA 2GUYA 3LPPA 1E0VA 1MFVA 1H49A 2V5CA 2WMGA 1G9HA 4AD2A 3W6LA 7A3HA 2EQDA 2G41A 3VX1A 1US3A 1ZB5A 1U2YA 1ODZA 2BVDA 4CN4A 5A6JA 4YPJA 2JF7A 2GJRA 4IPLA 5I78A 2DT1A 3QHMA 3WDHA 5D8WA 2DH2A 2J7CA 3RIKA 2B31A 1E70M 1WZMA 4PMVA 3L4WA 1PJ9A 1K9DA 3MANA 5M03A 3GYCA 1HIZA 3SEPA 1QHOA 2ZUNA 1V6YA 4J28A 3HU7A 3NIYA 2DEPA 4D1IA 1UH2A 2D2OA 4X0VA 1TA3A 4GKLA 3AIEA 3SUVA 2AMGA 1H0IA 2J8GA 1PX3A 1R7OA 3GTNA 4HA3A 2BHYA 4W87A 3M7SA 3WNPA 1LQ0A 1HKKA 2XFFA 1MW2A 2A3EA 3SCPA 4JHOA 4JIEA 3PZIA 3VOCA 4ZEPA 3SIMA 1UUQA 3PN8A 3CMGA 3WF2A 2WC4A 5EBAA 3WSUA 1BAGA 3SUTA 1KXVA 2XJ7A 4DWSD 4OKDA 3BC9A 3DHUA 2V5DA 3PTKA 3WNKA 3U5UA 4Z2LA 4AD3A 1DHKA 2D23A 2WHJA 4UOZA 4Z2GA 5A95A 1Q4NX 5C71A 4AEEA 4IM4A 2Q8XA 2D3NA 2WVSA 1JF5A 2ESCA 1UKTA 1JNDA 3JUGA 5EFDA 1J0IA 3GM8A 1BPLB 4M82A 1ZBVA 1R87A 4GZEA 2ZX8A 4EKJA 3WNOA 2JEQA 1JZ4A 1TFVA 1QOXA 3BAYA 3L4YA 2VRJA 5CPQA 1JD9A 5ABFA 3GXFA 3WD2A 3WH5A 4J7RA 4KGJA 1D2KA 1E9LA 3WQ6A 2WMHA 2D0GA 3FNDA 5CQ1A 5KEZA 3K4AA 2E0PA 1AMYA 3AIVA 2X1IA 2ZIDA 3NSMA 4BQ5A 3ARTA 1GQLA 1E1EA 3VVGA 2W62A 3ZT6A 1UKOA 1SFSA 3WH9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1KR0 A;  1E4N A;  1QBA A;  3WF1 A;  4UFK A;  2DT3 A;  1VJZ A;  1JFX A;  5A8O A;  1CIU A;  2WVV B;  3CHD A;  3BAX A;  3K8M A;  4KRU A;  5D9N A;  3W27 A;  3THD A;  4W84 A;  4E8D A;  3OGS A;  3MSD A;  1P6W A;  1XSK A;  3TOP A;  2WSK A;  2CXG A;  3SCO A;  1SMA A;  1KQY A;  1UH4 A;  3SCT A;  1JAK A;  3VU2 A;  4DUV A;  3AIS A;  1CBG A;  3VKK A;  1J0Y A;  3GDB A;  3WUG A;  1QHZ A;  4RE2 A;  4DM1 A;  1VFM A;  4M80 A;  4IIS A;  3BH4 A;  3PBG A;  4OBS A;  4MB5 A;  3WQ5 A;  1W9X A;  1WZL A;  1W32 A;  1ODU A;  1W1Y A;  1LLO A;  2X05 A;  1CXF A;  1LG2 A;  2NT1 A;  4ACZ A;  2WHK A;  1UD2 A;  2YA1 A;  1NWU A;  5A1A A;  1OIM A;  4WLC A;  1EDQ A;  3MS8 A;  3B9E A;  3WNM A;  1Z32 X;  1V03 A;  1GHR A;  2F2H A;  4GQR A;  4W8L A;  1KCK A;  1J10 A;  4BQ3 A;  3OA5 A;  3VUP A;  4GI6 A;  3CHC A;  4UFM A;  3W37 A;  4CD7 A;  5JBD A;  3ARQ A;  1TZ7 A;  4LYQ A;  4J3V A;  3S2C A;  1E72 M;  2ZXQ A;  4M81 A;  4ACZ B;  1ZBK A;  2XGI A;  1J0K A;  1ISX A;  4HPG A;  3DHP A;  4L4P A;  1FP9 A;  4RE4 A;  1UA3 A;  3AIB A;  3ARS A; 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