3KXQA

Crystal structure of triosephosphate isomerase from bartonella henselae at 1.6a resolution
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
249
structure length
237
Chain Sequence
IRPFIAGNWKMNGTGESLGELRAIAAGISRLFEALICVPATLLSRAFDILGGENILLGGQNCHFDDYGPYTGDISAFMLKEAGASHVIIGHSERRTVYQESDAIVRAKVQAAWRAGLVALICVGETLEERKSNKVLDVLTRQLEGSLPDGATAENIIIAYEPVWTSADVAEVHAFIHHKMHSRFGDEGAKIRLLYGGSVKPSNAFELLSTAHVNGALIGGASLKAIDFLTICDVYRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Crystal structure of triosephosphate isomerase from bartonella henselae at 1.6A resolution
rcsb
source organism Bartonella henselae
total genus 86
structure length 237
sequence length 249
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2009-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3kxqA00
4NJIA 4UFJA 3U2OA 5J5RA 3H53A 4AMAA 3LM7A 4PA8A 1ZCOA 5CKSA 5I3JA 1OFRA 3CC1A 3R2GA 1EWEA 4TMBA 4IWWA 4IXHA 1KLZA 2YSWA 2ABBA 3PG9A 3QC3A 4EF8A 1JUBA 2ZTKA 3A9IA 5HWMA 3V1PA 3UWQA 4ZQCA 3SW6A 3HO8A 3W7OA 3B04A 3W83A 2B7OA 2ZA1A 3O07A 3PBYA 2C3ZA 3UWWA 1SFJA 3MHGA 6ALDA 1VZWA 4BWLA 3PY2A 3TV8A 1OFQA 1QPRA 1FY6A 4LVBA 3B03A 3QF0A 1HUVA 2Y63A 4S1FA 4GJ1A 2J27A 4BR1A 4O28A 5J5DA 2ZRUA 3PUOA 1LOSA 3SJ3A 3W3OA 2ZFAA 2OX1A 1ME7A 3STGA 3LCIA 3CT7A 3QH2A 4DO6A 1DKWA 1H1ZA 3C3NA 3GDKA 1RZMA 3MP3A 3LTSA 4FNUA 5LGXA 5LZLA 1YLVA 5G1TA 4YWIA 1KBIA 4O50A 2EAWA 3E0IA 1TTJA 1OK6A 2NXIA 3C2RA 3GKAA 3NR0A 2WKJA 4IPIA 3S42A 3BG3A 3EWBX 2YFNA 3NQVA 4LV9A 2C13A 1LRQA 1VYPX 5HR7A 1LROA 5AN7A 2FTPA 3LRKA 3M5YA 1SR9A 1R46A 2HS8A 3W72A 5HQEA 1R2TA 3CQ0A 2QF7A 1K8YA 1ML1A 1DJNA 2ZA3A 5LNSA 4UNKA 3FS2A 1VPXA 3LERA 3AO0A 5FEZA 2V30A 3NL3A 1WXJA 1H7PA 4BI5A 2RHGA 4DBEA 2DU2A 4BWLC 4ADTA 3C2EA 3W7RA 2G97A 1B4KA 1MEWA 3NGJA 4ML9A 4UC5A 3L0NA 4EOUA 3W7PA 5HNRA 3W85A 4MY8A 3W2MA 1VQTA 3UXDA 1EEPA 3QSRA 3G24A 1U5JA 2A7RA 1TTQA 2ZZ4A 3MYOA 3O6DA 2VC6A 4K7YA 1I2OA 1G4EA 3JS3A 2FB2A 2C19A 3WK1A 5LNRA 1B9BA 3IVUA 4JR5A 5AB3A 2A5HA 4O1DA 4UR8A 2DZWA 2B7PA 2D73A 3G0XA 4ONVA 4RZ4A 3NPWA 3VNDA 4AVFA 2E6DA 5FEPA 1KV8A 1X6UA 2LLEA 3L21A 2X1RA 3W70A 1SW0A 1WDWA 3SIZA 2H8ZA 2PRLA 2Y88A 3LCLA 5DCDA 2V2DA 3ABOA 5C5YA 4DXVA 2E5DA 1T99A 1ME9A 1SO3A 4Q32A 1FWRA 2QJGA 4XZ9A 1WA3A 2EF9A 3UPWA 4ZQNA 3P81A 1UUOA 3PAJA 3TUUA 3EEGA 3C56A 5FF4A 2QEZA 3LBCA 3NNTA 2ATSA 3HPZA 1F6KA 4HNVA 4I7WA 3LRMA 2H3DA 1GZGA 4N6EA 3G18A 3DFQA 3HG5A 3LTYA 4TO8A 4O4VA 1W56A 2QCEA 3T55A 3S1VA 3T7VA 2DZUA 5F1UA 2R8WA 1HG3A 2RDWA 1TV7A 2J9ZA 4NXSA 1XKYA 2EHHA 3O6CA 5KSWA 4YXGA 4QAIA 4FIRA 5FEWA 2RDTA 1H5YA 3BG9A 2W0UA 5IBXA 1S5VA 2I1OA 3LGEA 3DI1A 3UXAA 5C54A 4GRSA 1ZHAA 1WBJA 3G0SA 3ABSA 3IEBA 1SZEA 1VR6A 1WX0A 3W75A 1Z42A 2VELA 3W7DA 2ZDRA 4OBTA 4GUFA 1KTCA 1ZJIA 3GLCA 4PODA 5EY5A 4RV8A 3T4CA 4P61A 2ZA2A 1FCVA 5TBOA 2ZBTA 3KHJA 2BLEA 2NX3A 3ZWSA 4H6KA 5MHBA 1D3HA 1Y0EA 1OJXA 3EWWA 4UIOA 3QZEA 1YXCA 5U4NA 2Z0IA 3SGZA 2F84A 3W7QA 2A7NA 3PBVA 2YX0A 3ANYA 2ZZ7A 4LS1A 1PIIA 1GPWA 3QSTA 1JR1A 1IXOA 3TQVA 1XBZA 4ZQRA 1SO6A 2ALDA 3G1HA 2ZZ5A 3TROA 1XXXA 3O6YX 3P5YA 4NNAA 1K7XA 3RK8A 4MFDA 2CZEA 1VC4A 3P67A 4CNPA 4AWSA 4TX9A 1QPOA 2NXGA 4K38A 5CZTA 4UMAA 4DF1A 4EVZA 1OFDA 4HNUA 4JTSA 2NWSA 3GVGA 1WOAA 3UNDA 1EWDA 4JY9A 1PV8A 2X1TA 1PHQA 2DZVA 1EA0A 4QISA 2V5BA 3NYZA 3W1XA 3DAQA 4RZ5A 4FX7A 4E38A 1AW2A 5IBXC 3P61A 3TJLA 4JDBA 3CHVA 2CZDA 1GQNA 4DF2A 1NF7A 1M7OA 4CCCA 1RV8A 4FHAA 3FEMA 2JGQA 1VLIA 2X2GA 1BEUA 3NQAA 1I8JA 1GEQA 2C0AA 3BVJA 5HWJA 3ZWTA 4GUIA 3G1SA 1A5BA 3PSVA 2X1UA 1TJRA 1AK5A 4Z0JA 4M19A 2R14A 3SI9A 3Q94A 4WXYA 4O0KA 4Z1AA 1LM1A 3TIMA 4S2CA 3Q2DA 1YDVA 4N6FA 2NUWA 3RU6A 5EMUA 2JKAA 1K03A 2V81A 4LW7A 4MY1A 3QPYA 4AB4A 3IIVA 2Y7EA 3PVFA 4HSNA 1EIXA 1TPC1 1SSGA 2O7QA 5KZMA 4O17A 1GTEA 1GYLA 2VEPA 1VCFA 3ATYA 1H7WA 1ZAIA 3W7GA 4MIMA 1LP6A 3PM6A 2GVJA 2NUYA 2UV8G 3P5ZA 4MFEA 3MI2A 1SW3A 4FIQA 3LHZA 4DELA 4DO4A 1XUUA 2ZZ6A 2R94A 3NQ8A 4JDYA 2E09A 3A5VA 4DPPA 3NEVA 1E51A 2Y61A 4P2VA 5AHFA 3C6CA 1GTHA 3S9YA 1JRBA 5D32A 3B8DA 1W3NA 4YLWA 1LOLA 5DBUA 3W2JA 4ZQPA 1F73A 1FWWA 4PCFA 1HL2A 4ICNA 1TPVA 5FF2A 3STEA 4BFAA 4UMBA 1UCWA 2FPVA 5BNKA 1F74A 2YZRA 4BK9A 3CM4A 1N7KA 3KOFA 1X1OA 4HNNA 1H7XA 3W07A 3TC6A 1ICPA 3USBA 4UFKA 5LGZA 3G8RA 4Y9AA 2BZNA 3DFTA 3BW2A 4GXMA 1Q6LA 4MKNA 2DP3A 3V75A 4ZL1A 2RFGA 1YADA 1NEYA 1LBMA 2A0NA 5DY2A 4RX0A 4XUGA 3HJZA 4N4QA 4IMEA 3S5NA 3LXAA 5C55A 1XL9A 2R91A 2CLLA 4WUIA 1LCOA 3M44A 3G3DA 2QR6A 3NQFA 5BOOA 4FNRA 1O60A 2BXVA 5D30A 4CQ8A 1ICSA 3GDMA 4QITA 5F2MA 1WAUA 1G4PA 4D2JA 2QCNA 5C6MA 3HG3A 4JTTA 4LUJA 3W7HA 2NZLA 4YCOA 1H62A 2J9YA 2EPHA 4NNCA 4LNYA 3QPZA 4PEKA 2C18A 3LHTA 3ZS4A 4NX0A 1SUXA 1TYGA 1SPQA 4AF0B 4N9BA 2WNNA 1P0NA 4N4PA 5KINA 4POCA 3L66A 5KTLA 1OX6A 1L6WA 2BTMA 1XDMA 3KXQA 4X22A 3O05A 4RZ6A 1AL7A 3LCWA 3GX9A 1P0KA 3KRZA 3QW4B 3A23A 2FB3A 3W71A 4N9CA 1Z41A 3W2NA 4ADUA 3NPXA 1P4CA 4M7SA 3UZ5A 5EL1A 5FI8A 5HWNA 4DPQA 3OA3A 1JULA 2WO5A 3ATZA 4N9DA 3LCXA 4JD4A 3MYPA 3PS7A 1A5AA 3H55A 5G4WA 3DFNA 1G4SA 2DJXA 3WJWA 3GXNA 2DZPA 2Y85A 3Q37A 2H3BA 4HPJA 1LZOA 2IQTA 5C2XA 3NM3A 4JTLA 2DORA 4XQ6A 3O63A 3UD6A 1SW7A 4NJKA 3F1QA 5SWUA 3TX9A 3EB2A 1T96A 5I3IA 3PUEA 3W1UA 1I2RA 1XBXA 4AHOA 4FNSA 4WY0F 1RQEA 3TJXA 4IMFA 1YXDA 3I65A 4GC4A 3W74A 3NQCA 5AFDA 4UFMA 3BPWA 3W1QA 2E68A 3DU0A 4KWVA 4IJBA 4OV4A 4JN6A 3DENA 2FPYA 3BGJA 3NO5A 3W7EA 1TTPA 3G1VA 1N55A 4M7TA 2YXGA 4FB7A 4AXKA 1KFCA 3STFA 1S3HA 5HULA 1M5WA 1IIGA 4O13A 7TIMA 3W6YA 2Q8LA 1O5XA 3EXRA 2YYUA 3HF3A 3FYPA 5U7SA 3E02A 3UYCA 2HTMA 4O11A 3BLIA 2ZTJA 3A24A 4LVAA 4U4MA 3S8HA 2Z2UA 1FCBA 1O95A 1O94A 4NJHA 2BX7A 1XBVA 1OK4A 3P8JA 4QSHA 1VS1A 3MBFA 4LWWA 1FDYA 1F6PA 1Z48A 3M47A 4CCDA 4JTFA 1OF8A 3AJXA 3T78A 1P1XA 1W0MA 4WXZA 4FF7A 3ZR4A 3W22A 1FWNA 3U8GA 1GG0A 5H91A 3LCHA 5K9XA 3MWAA 1QO2A 5D2XA 3R12A 5TQLA 3NQ7A 1DORA 1P5BA 4XBKA 2KZHA 3LHWA 5DCBA 3IVSA 2ZRVA 1ALDA 2WJZA 3GYEA 4IGHA 1F5ZA 4LV4A 3TC7A 1H60A 4AHQA 4FNQA 1JQXA 3W88A 3M7WA 2VEIA 2TYSA 4CNNA 4UTWC 1LBLA 2J6XA 4QJ1A 3BLFA 3KVMA 2GJNA 4LRSA 5AHEA 1YTDA 3H54A 3BLEA 3MHFA 5D02A 1D3GA 2Z6IA 5KMYA 2P0OA 2QCCA 3FFSA 4M6QA 1OX4B 1Q45A 5AHIA 3RMJA 3G0UA 3O15A 3MJYA 1L6YA 2PURA 3C61A 4HIBA 1ZAJA 3DBPA 1I2PA 4K36A 5H2ZA 2W79A 4IPJA 1W5QA 2J9XA 3C0JA 4JYFA 5G5IA 3MP5A 3HGRA 2H90A 5I3HA 5K2ZA 3QMTA 4PFMA 1H1YA 1AW1A 4ORMA 1HFBA 3RFAA 2WSRA 1PE1A 2B0MA 5CZJA 1F76A 1ME8A 1NVMA 1GT8A 3FOKA 1WYIA 3W73A 1H7NA 1EP3A 3GDTA 4LC6A 4CQ9A 1UJPA 1R2SA 1UB3A 4L4LA 1H7RA 4Z08A 3NA8A 3EWXA 5I3FA 5K9CA 3N14A 1GVQA 2WV8A 3IGSA 4LOCA 5E1QA 4XKYB 3IV3A 2VFDA 1MXSA 1O4UA 2C14A 4MPQA 3BG5A 1CW2A 3W1RA 4GUGA 1DBTA 4X9SA 4OGZA 3IGXA 4E2DA 1ZALA 4CQAA 1VJIA 2QCGA 3CWOX 1TPEA 2FQIA 4UTTA 4UCGA 2A2IA 4N02A 4JICA 1OX5A 2Q3OA 3DXIA 1EUNA 4GUHA 4AWUA 3CEUA 3W7JA 1VRDA 1FDJA 1QMLA 3CB8A 5HMSA 3LRLA 4QM1A 1OFEA 2DZSA 2C16A 1EB3A 5AYYA 1TTIA 3WFAA 1OG0A 5I3KA 5F2LA 4AF0A 1DQXA 3PB2A 1Q3NA 3BK0A 1K02A 2E5BA 3KAOA 4I7UA 1J5TA 3C2VA 3N2XA 2YDAA 3NPVA 3QQ1A 4O1CA 3DFOA 2TSYA 4JS3A 2ISWA 1Z44A 5HR6A 4NJJA 4LT9A 2A7PA 2XFWA 4CCEA 2OZ0A 4MZYA 1A5SA 5K3VA 3BW4A 4UNLA 5EYWA 3FKKA 4O10A 4RKAA 4FNPA 3LHYA 3TU9A 1TPDA 3WK2A 3P60A 3LHVA 4AEOA 1TQXA 1UBSA 2OT1A 4MJZA 4NJGA 1FBAA 1QAPA 2RKXA 2YFOA 4N2YA 1TJPA 3DH7A 1XUZA 4CNOA 4Z1CA 4UTTC 3OIXA 1UASA 2B7QA 4LTSA 4XTDA 4A29A 3QW3A 3WK0A 5K7JA 3IIPA 4W9TA 4LVDA 2A21A 2VEKA 1VCGA 5D05A 1GYNA 5L9FA 1DOSA 1X8FA 3O16A 3VKJA 3W86A 1RR2A 4LUIA 3TK7A 3TNOA 3LDVA 1SO4A 3HG2A 3FJ6A 4NQ1A 2BSLA 1LLZA 1X1ZA 3W7NA 1JCMP 5CPLA 3I7RA 2CU0A 3TH6A 5D04C 1QPQA 3DFSA 5F2IA 2G5WA 4JXCA 2X16A 4K8HA 3TA6A 4O53A 4MYXA 3W7CA 1TSIA 3L5LA 1YPFA 4JYDA 4Q4KA 1CX9A 1WBHA 3GIYA 4LS0A 3HIJA 4R53A 2WNQA 2DJLA 3K30A 3M5XA 2FLIA 5E93A 3JR2A 1H63A 4WZHA 4EIVA 4UTLA 3S0CA 3CTLA 2E77A 1OYBA 2NXHA 2CLEA 3CPRA 2OMAA 2E1DA 3LI0A 1W3TA 1JCXA 3IIOA 2NUXA 3LCFA 1FDZA 3EWUA 5AHNA 1WOBA 4B5NA 5G1YA 1A53A 1LYXA 3PG8A 1T8XA 2Y89A 3EWZA 5LNUA 1M7PA 2QCMA 1KFJA 1MZHA 4LU0A 4X2RA 4JTUA 2QUVA 2E6AA 1YDNA 2YCEA 1G7VA 2TPSA 4FX6M 3HQ1A 3W1NA 3TE9A 1ZAHA 3QRHA 4OT7A 3GNNA 1OYAA 4HPXA 1VHCA 3GAYA 2YYTA 2X1SA 4Y90A 4FEZA 3NL6A 1XDLA 3LV5A 4JIPA 1OYCA 1IXQA 4RK8A 3GB6A 1L6SA 1YXYA 3GNDA 3TSMA 3TMLA 4X3ZA 1EP2A 4MLRA 4N9EA 5HINA 3M43A 3S5OA 3N19B 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5J5R A;  3H53 A;  4C1N A;  3VD7 A;  3R10 A;  3CC1 A;  3R2G A;  2PWD A;  1JDA A;  1XJB A;  2ABB A;  3QC3 A;  3A9I A;  2JFE X;  3W7O A;  4ZQC A;  3SW6 A;  3RAO A;  3PBY A;  1SFJ A;  3MHG A;  3NWR A;  1FFQ A;  3PTQ A;  4J3W A;  6ALD A;  4P8X A;  4BWL A;  1FY6 A;  5HOS A;  3B03 A;  3A47 A;  3R7M A;  3RCM A;  3PUO A;  1E6P A;  4NYY A;  1LOS A;  1RAK A;  1W6T A;  2OEL A;  3M0J A;  3MY9 A;  1XRS A;  3STG A;  1MUW A;  3QH2 A;  1EA9 C;  2OQH A;  1E73 M;  4HU8 A;  3M4H A;  1DKW A;  3C3N A;  3GDK A;  1YLV A;  4WKH A;  5G1T A;  3AIE A;  1KBI A;  4EXB A;  4DYJ A;  2NXI A;  2P53 A;  3C2R A;  3HA1 A;  3VUP A;  2CBJ A;  3S42 A;  1ZGD A;  1V6T A;  4F40 A;  5AN7 A;  4C6B A;  3DC0 A;  1VIW A;  3TN6 A;  3LRK A;  2VWS A;  3M5Y A;  1HKK A;  3AI0 A;  1R46 A;  3W72 A;  4QCE A;  3I6E A;  1R2T A;  3CV6 A;  4C5Z A;  4LUT A;  1ML1 A;  1DJN A;  4E5T A;  3UXL A;  4OOU A;  4QEE A;  5M03 A;  3LER A;  3MS8 A;  1O1Z A;  4LNC A;  3IUD A;  1OT1 A;  4C65 A;  3T42 A;  3M0K A;  1WXJ A;  1H7P A;  3CXO A;  4CKQ A;  4DBE A;  1W8G A; 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