4XZB | Genus

Total Genus 128

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	128
sequence length	312
structure length	312
Chain Sequence	ERTPVEENGRLQVVGTALLNQHNKPFQLRGISTHGLQWFGQFANKDAFQTLRDDWKANVVRLAMYTDPNANGYIAQPEWLKAKVKEGVQAALDLGMYVIIDWHILNDNDPNLYKEQAKRFFAEMAREYGKYPNVIYEIANEPNGNDVTWEEKIRPYADEVIRTIRSIDRDNLIIVGTGTWSQDVDDVASDPLPYKNIMYAVHFYSGTHTQWLRDRVDAALQAGTPVFVSEWGTSDASGDGGPYLEEAEKWIEFLNERGISWVNWSLCDKNEASAALRPGADPHGGWGDDHLSDSGRFIKAKLIEALEHHHHH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of endo-glucanase GsCelA P1 at 1.62 Angstroms rcsb
molecule keywords	CelA
molecule tags	Hydrolase
source organism	Geobacillus sp. 70pc53
total genus	128
structure length	312
sequence length	312
ec nomenclature	ec 3.1.2.4: 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase.
pdb deposition date	2015-02-04

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4xzbA00

5D9OA 4CGTA 1V3HA 1V6VA 4E8DA 3WH6A 3WNPA 2X8RA 4MB5A 3BAKA 4GZEA 3MMDA 3AHVA 2W67A 1FOBA 1UKOA 2PWDA 3BXWA 4MTVA 1W3HA 1DP0A 3M7SA 3T08A 1KQZA 1KCLA 1ODUA 3SCTA 3THCA 1E4NA 3THDA 1OGGA 2FHBA 1GHSA 2BFGA 2CKRA 2E3ZA 3WF0A 1CXEA 3II1A 2JALA 2O9PA 2WKGA 1VJZA 1JZ5A 3CZGA 3CMGA 3PZTA 1CYGA 2WKLA 3W53A 4CCEA 3CUGA 3UR7A 3SCNA 1GOWA 2G41A 2Y2WA 3VVGA 4QLLA 1UKQA 2YL9A 1XD0A 1QW8A 4NZCA 1MVYA 1AQHA 4MDPA 4OOZA 4DUXA 2QMKA 1UUQA 1UWSA 1ESWA 5IFPA 1CTNA 1CGXA 1O7AA 1NM9A 4W5ZA 3OBAA 4WF7A 1W3JA 3T0DA 4PN2A 3AHXA 4QCFA 2CYGA 2Y5EA 4TUFA 3DYMA 3AZSA 5M5DA 4BS0A 2FHFA 3KZSA 4DWSD 6A3HA 3AMLA 3WENA 3HU7A 4AEFA 4DM1A 4JZ5A 1SYTA 1ITXA 1TZ7A 3CZJA 2ZXAA 4GI8A 1UA3A 5I0DA 1J12A 3ZO9A 2J7HA 3AI0A 3W4RA 1JIBA 1OGBA 2O9TA 2A3BA 1UWIA 1H11A 5EFDA 1AQMA 5ECUA 3WUFA 2X0HA 2CIPA 1UD3A 4RE2A 2WANA 1GQIA 1BQCA 4UZUA 4R5EA 2J8GA 1RP9A 3VD4A 1MFVA 2D23A 4GIAA 4MDOA 2WMFA 2VX6A 3PTQA 1HN1A 5JUVA 2YA0A 2MANA 5M17A 5A8QA 4HMEA 3S2CA 1J11A 1JDAA 2J7DA 1BGGA 2BS9A 3PZVA 4CU7A 1E1FA 2ZXBA 3ZMRA 2WPGA 3WMSA 4Z2LA 3AIQA 3ZR5A 1X1NA 2WW5A 1S46A 1C90A 1E6QM 3AXXA 5ABHA 1FH9A 4KMQA 2UY5A 1WCGA 1VAHA 3FW6A 1EO5A 2Y8VA 4P7RA 4D1JA 1E4LA 3VX0A 5E0FA 3IK2A 3U5UA 5A3HA 5A8PA 4Z2HA 4CVWA 3PZQA 3AHZA 2Z1KA 2GUYA 1L8NA 3RPMA 3T0AA 4CU6A 3A47A 5BROA 1U30A 3VNZA 1V0LA 2BXZA 1B31A 1BVZA 5CQ1A 2CBUA 1PZ3A 4DUWA 3SUTA 4CD6A 2XVGA 2EPOA 2YL5A 2X2YA 5AYIA 4BQ5A 1A3HA 1OIFA 4J3VA 4WKHA 3WDHA 1E6ZA 1UR8A 1EQPA 4M80A 2ZX8A 1W2VA 3ARSA 3VDCA 1XSJA 4UFMA 3GNRA 4J3SA 4UFKA 3A4XA 2D1ZA 1GZJA 3A4WA 1E5JA 1FFQA 4OUEA 2O9OA 1E1EA 3I3EA 4PSPA 4CD7A 3BH4A 4AZ7A 1GOQA 1R8LA 2E0PA 4PMQA 4OJYA 2DEPA 4EAMA 4LYRA 3FHAA 2BNJA 1E5NA 1HL9A 1C7TA 1HKMA 5GNXA 3CLWA 1R86A 1KFWA 3TTOA 2ZICA 4WSKA 4EKJA 4A3HA 3GYCA 3VMOA 3WNNA 3T0BA 2V5DA 4PBGA 4PTXA 2XIBA 1B3VA 1H41A 3GM8A 1GJWA 4URIA 3KL5A 2VNCA 1UD6A 5IDIA 3QR3A 5JBFA 3W6MA 3VDAA 4IPNB 1HKJA 1M53A 2D0FA 1W3LA 5A95A 4FLQA 4N42A 2D22A 3LPFA 2VVSA 1JG9A 4F9JA 1HJQA 2DPEA 2TAAA 2YL8A 4UZSA 5A69A 2E8YA 2UY2A 3POHA 2BY1A 2VJXA 1UH2A 4UQCA 4CKQA 1I75A 4AXNA 2GDVA 1US3A 1FP8A 3SCPA 1YHTA 2WMJA 3WDQA 1GVIA 7TAAA 1JD7A 2QPSA 3AIUA 1W9PA 3ARZA 2VX4A 3AJ7A 4GO9A 1B3WA 2G4FA 4BCEA 4AMCA 1V02E 3B9DA 1ZL1A 5ABEA 1JYWA 2O92A 4BQ4A 1E9LA 1B30A 2F8QA 2G3JA 3DYPA 1RPKA 3RM8A 5FCZA 1OT1A 2DH2A 3CUFA 3SUVA 3SCWA 2DQXA 3TA9A 2ZUMA 4B9YA 1CGUA 3ARUA 3SEPA 2WBGA 4PMRA 2VRKA 1XRVA 4RE3A 1GOIA 2ZUSA 3MS8A 3SCSA 3GDBA 3CH9A 4AEEA 3PN8A 3K4AA 3SIMA 4FLRA 1JI1A 1QNOA 1BG4A 4P7NA 4AW7A 2V3GA 4GQQA 4PUEA 1FFRA 1LL4A 4M82A 5JIPA 3M07A 1E72M 1E6SM 3WFLA 4MJ4A 2F2HA 3WBEA 3K4DA 4AD0A 1J0ZA 1JGIA 1JZ2A 2XWDA 3WUEA 1V6UA 1QI4A 1MW0A 2WCAA 3FN9A 3VGBA 3AHTA 5CSYA 3G6MA 2FDMA 2J62A 2A3HA 1LG1A 3PZNA 3WFZA 1GONA 4GZIA 4JKMA 5EB8A 1CEOA 1GVYA 4B3KA 1EIBA 5A6BD 2JFEX 3W6LA 1BYAA 1CGYA 2WM0A 4JAWA 1W1TA 1K9EA 2V5CA 2WMIB 3EDFA 3WD4A 1ISXA 1JFHA 4JL1A 2VZUA 4PMOA 1CGVA 1UD2A 4JCMA 3SCUA 1V3IA 3VGDA 1HKKA 2EPLX 4CD4A 4A4AA 5BWFA 3MUZ1 3WEMA 2CKSA 1QI2A 4AYSA 2VO5A 1EA9C 2EPKX 3LPOA 2PBOA 2VMFA 4JCLA 3RDKA 3BAWA 3IAPA 3AS0A 4PMUA 4AZCB 4D71A 3SCVA 4D6EA 3PTMA 5HPOA 1MW3A 4P8XA 4ZEPA 3WQ8A 3VDBA 3CBWA 3CZKA 2XUCA 1ISVA 2ZUUA 5ABGA 1JXKA 3UG5A 1JI2A 4HA1A 3VIHA 5KEZA 4JKLA 2XJ7A 2EPMX 2OSXA 3F4VA 3GNOA 2BVYA 4PMVA 2E40A 5E6ZA 5E9AA 4W8LA 4M81A 1PBGA 1TFVA 2CERA 2OYLA 3AIWA 3AZTA 1D3CA 1HF6A 2C8NA 2JE8A 1HX0A 2WHJA 2DSKA 1ISWA 1TMQA 1NWRA 2BY3A 2ZX6A 2XGIA 1QPKA 1M04A 1VFFA 1QBAA 2WWDA 4P8UA 2GSJA 1ISYA 3EDJA 2X09A 1ZBVA 1NARA 1OT2A 5BRPA 4M29A 3NSMA 1VF8A 1E0XA 4TVDA 2YA1A 1U2YA 1UQZA 4EANA 3TP4A 3IANA 5D9MA 2V38A 1NP0A 4F66A 3VD7A 1U33A 2D3NA 1V03A 3ZJKA 1LWJA 4D6FA 1UH3A 3L4UA 4AY1A 1O6IA 4AZHA 3QHMA 3BCDA 4ATLA 5BXRA 1HVXA 3RILA 4AISA 3WBAA 2XM1A 4HPHA 2ZWZA 1R7AA 1E43A 4V2XA 2D20A 1CLXA 3PHAA 1VFUA 4Q7NA 2WSKA 3SCQA 3EMCA 8CGTA 2PB1A 4OBSA 2DDXA 3SCRA 4ATDA 1OD0A 3KWXA 7A3HA 4UFLA 1NOUA 4C7GA 1LG2A 1JYXA 5FKYA 1EOMA 1G1YA 4UQDA 3IJ8A 1BTCA 1BF2A 2J7FA 3MSGA 6TAAA 2ZUVA 1UWQA 4HPGA 4UTFA 2RGLA 2VQUA 3WDPP 5CPSA 4XB3A 3KEHA 2J8FA 1WZKA 1UR4A 5GQBA 4MB1A 4AZCA 1LJYA 5A6AA 3ECQA 2Z1SA 3MO4A 2VRQA 4PMNA 1JZ7A 2W62A 1EOKA 1XC6A 4ZE4A 2OWWA 4FMVA 3VINA 3O2LA 2EBNA 3IJ9A 4QDMA 5E6YA 3TTYA 4NRSA 3U57A 2VT0A 2J7BA 1UZ4A 2UY3A 3J7HA 2VQTA 1LL6A 3GTNA 1W9XA 3VGGA 4AD2A 2VR4A 5CGMA 1NQ6A 4AZGA 4P7QA 2NT1A 2DT1A 2VZOA 1LF1A 2Y24A 4KRUA 4WLCA 1BVNP 4XV0A 1KB3A 5BXPA 1OINA 4UFJA 4V27A 2OSYA 1WZMA 3N9KA 1MWOA 3GH5A 4ZFMA 1N82A 3VPLA 4U33A 4GINA 3W25A 3WNLA 2PWFA 3W28A 4R27A 3K1DA 2OLHA 3VOCA 1PX3A 5BCAA 3IJ7A 5I24A 4ZE5A 4DUVA 1ZBWA 1G01A 4ACYA 4H04A 2VI0A 4J3XA 1E4IA 4W8AA 1K9DA 4A3YA 3UG4A 5F7UA 3ZJ6A 3A4AA 3DC0A 3W37A 3GXDA 1HJXA 2W91A 2J4GA 3O9NA 4DWSB 4RE4A 3T09A 4S3JA 1SMDA 3AISA 3B8SA 5DT5A 3AXIA 2CITA 3WKZA 2WYSA 1DHKA 1JAEA 3A6OA 3K46A 2XVKA 2QMJA 4OBRA 2XVLA 3W29A 1KGXA 4B15A 3AIVA 3WDJA 1FHDA 4HU0A 5A6MA 5A6KA 2NW0A 2XFRA 2EXOA 2FH6A 4P7OA 3VD9A 1H0IA 1JF5A 2Q8XA 3RO8A 3T2QA 1QI5A 1ZB5A 1MQRA 1ISZA 2IUZA 4M56A 5BXTA 3AYSA 1J0IA 2ZOXA 1V0MA 4CUCA 3NSXA 4HOZA 4OIFA 4CD5A 1QW9A 1CWYA 2EQDA 3CUJA 2WVVB 3UR8A 1TR1A 5AC4A 1QI3A 4WK9A 4XUYA 4D6JA 1OBAA 2CCRA 4GQRA 4Q22A 4AD3A 4PYSA 1R7OA 2WHLA 4YPJA 4D6CA 1QNSA 2YLLA 2WHKA 2WLYA 5I6SA 4CN6A 1EQCA 3EMZA 4UQEA 4E2OA 3GXIA 4Z2JA 3KL3A 2J47A 3APGA 5E70A 4GXPA 1PIFA 3JUGA 1WZLA 1EDGA 3ARTA 3QOKA 1EDTA 2WVSA 1V6YA 1XH1A 4M24A 2UY4A 3VIOA 3F5KA 3WMBA 1DWFM 1JNEA 1V0NA 1Q6CA 1Q6DA 3T2PA 1XD1A 3N15A 5A2BA 5A2CA 1BSIA 3OGSA 1VEMA 2VRJA 3RJYA 5CPTA 1GOOA 3VNYA 1JYNA 3VGHA 3E1F1 2XFFA 1P6WA 2WMHA 4XZWA 1I1WA 1HP5A 1GQKA 4P7LA 1WDSA 2XVNA 2YBTA 3VMPA 4KGJA 4OKDA 1E6RA 4IISA 4J27A 1VBUA 1WPCA 2WXDM 4MNLA 4U5IA 1UWTA 1E4MM 1UOKA 3OLDA 1J0HA 2JF7A 3CZEA 3LMYA 5TD4A 1AQ0A 1OM0A 2GVYA 4C7FA 4UQ9A 1V6WA 1BYCA 3MSDA 2XPKA 1BAGA 1IZJA 4PCTA 1Q6EA 1C8XA 1UKSA 2G8ZA 1W1YA 2W92A 4F79A 3EMQA 1BYDA 4NF7A 2VCCA 1QI0A 5EFFA 1NWUA 3TTQA 5A94A 4AZ5A 4MB3A 1JDDA 2EJ1A 3AMDA 4ZXOA 2OWCA 4WKFA 3ZT7A 3QGVA 1RP8A 4H41A 3BLKA 1ITCA 3CZLA 2YA2A 1ZJBA 1W91A 3GH4A 3AIEA 4PSRA 1B90A 3ZOAA 2VX5A 4W87A 5CSUA 1WDPA 4W86A 1FH7A 5FOOA 4FF5A 1BFNA 1OCQA 1BPLB 1CGTA 4W7VA 4TX8A 1TUXA 3WN6A 3NIYA 1FP9A 3CUHA 3VX1A 1XHGA 1E6XM 4J3TA 1UG6A 4JHOA 1VB9A 1JZ3A 1UR9A 4FK9A 4IPLA 4WKAA 4W85A 3MMWA 2GFTA 2YDQA 1UR0A 5A8NA 2BHYA 1QVBA 1VIWA 8A3HA 4CN1A 3OGVA 1E56A 2VTFA 4Z2IA 1OGSA 3VIIA 1UA7A 3EDDA 1XH0A 1H49A 1XGZA 1TA3B 2B31A 3DECA 1UD5A 3SURA 4UOQA 2HVMA 2ZXQA 2YBUA 1OD8A 1H3GA 3L4WA 2OYMA 2XFYA 3OA5A 3FY1A 2E8ZA 2YDSA 1WO2A 1ZBKA 3CHDA 4EK7A 4QP0A 3UCQA 5HBFA 3S6TA 1V02A 3BMWA 1DWJM 3AS3A 3FXYA 5JBEA 5IXEA 2YL6A 3PZOA 2WZEA 1EH9A 5LA0A 3NYDA 1VEPA 1FA2A 2EEXA 3NCOA 2QF8A 4RL3A 4MJ2A 2E9LA 1XSKA 3I3BA 3U5YA 1C8YA 1C8QA 4AD5A 4W5UA 2JEPA 3ALFA 3MU7A 3QOMA 3N13A 4GZJA 3AMCA 1KR1A 3WH7A 5EMYA 5HXMA 1H0GA 5D4YA 2WBKA 1DWAM 3LPPA 4W88A 4NSBA 3L4TA 1OB0A 4JIEA 5E0CA 2Y8KA 1YQ2A 3AIBA 3OZPA 2GK1B 3GXFA 1GOKA 1KGUA 1J0KA 3MUY1 1PJ9A 2OYKA 2A3AA 2DIJA 3VTRA 2FGZA 2A3CA 3L2LA 2PF0A 1J9YA 5D8WA 1V3JA 1NOFA 3ZSSA 4NI3A 1KQYA 2FHCA 4OOUA 1WDRA 4YHGA 1ODZA 1W9BM 3ARXA 1VRXA 3NDZA 3TOPA 2AOSA 4CCCA 1JYVA 4ATWA 4CU8A 1NWTA 1K9TA 2XM2A 3GZAA 3BLPX 1QHOA 2DH3A 2DT3A 2C7FA 3L4XA 4QLKA 2CXGA 2WLZA 5I23A 1E71M 1E55A 3NDYA 5JBDA 3M46A 3FAXA 2ESCA 4QFUA 3K8MA 2QV4A 1V3LA 5ABFB 3EYPA 4CN4A 1KXQA 1FH8A 4D72A 3MMUA 4QAWA 1JDCA 2GDUA 3MUIA 3PTKA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2WC3 A;  4HZ6 A;  1WZA A;  4J3W A;  2IXU A;  1V3K A;  4JFT A;  4MB4 A;  2G3I A;  1CEN A;  4PMD A;  5IFT A;  4UCF A;  5KZ6 A;  5I5R A;  1Z32 X;  2PBG A;  2PWH A;  4C7D A;  3WY1 A;  3TON A;  3ZT5 A;  4K68 A;  3ZR6 A;  5FIP A;  3WQW A;  1HJW A;  1NH6 A;  4D6D A;  1GOR A;  1ZU8 A;  5AYB A;  2J7C A;  3N17 A;  2DGA A;  1XCX A;  2CHN A;  5LYR A;  2CBV A;  2BVD A;  1V0K A;  2JIW A;  2WMG A;  3RCN A;  5A6B A;  1QHP A;  2J7E A;  3ZST A;  4H7V A;  1E15 A;  3L2M A;  2XGB A;  4U3C A;  3AIR A;  3SUW A;  2NT0 A;  1AMY A;  2W4X A;  1E40 A;  3ARP A;  5DF0 A;  2QPU A;  4PRW A;  1GOM A;  2ZE0 A;  1PAM A;  4WJX A;  1ZBC A;  4HMC A;  2XTK A;  1QNP A;  3MKK A;  1EDQ A;  1RD6 A;  2WMK A;  3GH7 A;  1JF6 A;  1H4P A;  1W9U A;  1JXJ A;  4GI9 A;  3EBV A;  5DFA A;  3ZM8 A;  2WZI A;  4Y7E A;  1B3Y A;  1BLI A;  2OWX A;  2WB5 A;  1EO7 A;  4U2Z A;  5FD0 A;  4U31 A;  4PMY A;  3UET A;  1VFM A;  1KR0 A;  1B2Y A;  3FND A;  3ALG A;  2DSU A;  3N12 A;  3WQ6 A;  2GK1 A;  3GBE A;  2BVT A;  1D2K A;  4TXE A;  1NP2 A;  1PIG A;  1W9D M;  3OLI A;  3OLE A;  3ZIZ A;  1C7S A;  2XWE A;  4DM2 A;  1I1X A;  4HA3 A;  5A6J A;  3W27 A;  4MNK A;  5LA2 A;  3AQU A;  1CEC A;  1XSI A;  2CNC A;  2DT0 A;  3AZR A;  3CHF A;  2WVU A;  3AFB A;  3VD3 A;  4M8U A;  3U7V A;  4UOZ A;  4W89 A;  2X0Y A;  1H1N A;  3D3A A;  1BHG A;  3VMN A;  4S3K A;  1JL8 A;  2VZS A;  4FLO A;  1CGW A;  1TCM A;  3MAN A;  2JF6 A;  4PCS A;  3N1A A;  3MV0 1;  3VKK A;  3WQ4 A;  1B0I A;  4U2Y A;  2VR5 A;  3HJE A;  4GPN A;  1QOX A;  1E3Z A;  5CLT A;  1IT0 A;  3DHU A;  5BRQ A;  3ARQ A;  1UWR A;  1CZ1 A;  2J77 A;  4AD4 A;  1UKT A;  1VBR A;  2FGL A;  2G3M A;  3W82 A;  3W81 A;  1F4A A;  1HJV A;  5I79 A;  2CPU A;  3MV1 1;  4J7R A;  1KWG A;  3AHY A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4XZBA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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