1LOSA

Crystal structure of orotidine monophosphate decarboxylase mutant deltar203a complexed with 6-azaump
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
216
structure length
216
Chain Sequence
SRRVDVMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGDPGETLRFADAIIVGASIYLADNPAAAAAGIIESI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus str. delta h
publication title Crystal structures of inhibitor complexes reveal an alternate binding mode in orotidine-5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords orotidine monophosphate decarboxylase
total genus 80
structure length 216
sequence length 216
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2002-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1losA00
3W22A 1F73A 5F2GA 1JQVA 3LERA 2E5BA 4AWUA 4L4LA 3HG4A 2ZZ3A 3LI1A 2GJLA 3PG9A 4EOUA 3JR2A 5BOOA 3MJYA 4E38A 4Z1BA 4MFEA 4DPQA 2XN2A 1TTIA 3W07A 2FJKA 1ZNNA 4Q4KA 1FUYA 4HSNA 3C6CA 1SZEA 5F2MA 2ABAA 1QCWA 3MBDA 3IVTA 1VYPX 4AAJA 1U83A 1GPWA 4OGZA 1HL2A 2QCGA 2ZRUA 1UB3A 3EEGA 1JCYA 3EX3A 4QISA 2Q3OA 4HNNA 4BWLC 3MMTA 3ZFHA 3HMJG 4UXDA 1VYRA 1W3NA 4GNJA 3M44A 1QPNA 1SZFA 3C61A 3G0SA 4CCEA 1TPDA 2C16A 3NR0A 1TQJA 4QJ1A 8TIMA 4RX0A 1W0MA 1NF0A 4GE8A 4UNKA 4DBEA 3WJXA 3E9AA 2AQWA 4BF9A 2E6DA 4MJZA 2Y7DA 1T96A 3LLFA 2FFCA 3WJZA 4OQVA 1R2RA 3GDRA 3MUXA 1FBAA 1GTEA 2CZDA 1XI3A 1G67A 5D03A 1SSGA 3W1LA 4N4PA 4UTLA 5D32A 1KTBA 1OJXA 1LP6A 3DHFA 5F2LA 3MWAA 4DF1A 2NX9A 3NPUA 3S5ZA 1TV8A 2ZBTA 1GT8A 5LGZA 3GAKA 4RK8A 5G1TA 2QCNA 1KLYA 3LCWA 2QCEA 1L6SA 3P74A 4YL2A 4BFAA 4LS2A 2VFIA 1PS9A 2RH9A 4OU1A 2QCDB 5L6UA 5H2ZA 2B0MA 5HWMA 1T99A 4HIBA 4FNSA 1JUKA 1HG3A 3W1MA 3N19B 1R47A 1T8XA 3R2GA 4NUWA 2ZA3A 1H1YA 3PBUA 1O5KA 3QQ0A 4GBUA 1VRDA 5EKYA 3Q2DA 3TH6A 4JS3A 4ADTA 4W9TA 3E49A 4LVAA 1VJIA 4UTHA 5K4XA 1YPIA 3SIZA 1DQWA 1C8VA 3SGZA 3P60A 3TU9A 3ATYA 1XM3A 1X1ZA 4X9SA 2ZDRA 4MKNA 1YDNA 2H3BA 3QMSA 4AHQA 3TE9A 1GVRA 4A2RA 3FYPA 3R89A 5I3KA 3QFEA 3V1PA 1VGAA 3U8GA 4JTKA 4CCDA 1NSJA 1YXYA 1Z48A 4JIQA 4B5NA 1XKYA 4Z1CA 4O1DA 1W3IA 5HJLA 2C13A 3IEBA 1ZFJA 3DFQA 1HFBA 5KSWA 1WBHA 3UPWA 3B0UX 1ADOA 1WOAA 3BW3A 3LTPA 3G8EA 1X6UA 3T40A 5AYZA 5FF2A 1LM1A 1K02A 2Y61A 1RQHA 4K7VA 1SFJA 1XC4A 1AK5A 1TRDA 2W79A 1AG1O 3L0GA 4R33A 4R34A 2QDGA 2X1RA 1EB3A 5FF7A 3S0CA 1EIXA 1TTQA 1TMHA 4WY0B 1ZJIA 5K9DA 1F6PA 5AC8A 3L66A 5FF4A 1UCWA 2VEMA 3A5FA 1QO5A 4UTTC 4EVZA 5KZMA 2BXVA 5AYXA 3NL2A 4NX5A 4KFOA 1SQ7A 3CWOX 1KBJA 1F74A 3SZ8A 1O4UA 2E5DA 4MYXA 3P82A 2Z1BA 4LRTA 4PODA 3TW7A 3ZWTA 1UUOA 2I9EA 2I14A 5AC7A 2XN0A 2ZRXA 3HGOA 4FHAA 4DXVA 4YCOA 4LWWA 3F4WA 1I2NA 1B4EA 4O52A 3TA6A 3SFKA 3O06A 4MY8A 2GVLA 3TUUA 2ABBA 5HUOA 2YDAA 3G1AA 4JXCA 2J9XA 3LTYA 2WPBA 4I7VA 1PCKA 3OHIA 4ZQMA 1H7NA 2X2GA 1R30A 3M41A 1TPH1 2Z0IA 4ADUA 4AWSA 4PCFA 2WKJA 5KITA 5I3HA 3P84A 1KTNA 3KHJA 5HR6A 2PC4A 3NQ7A 1DL3A 1LBLA 3GZ3A 2E6YA 4DO6A 1PV8A 4I9AA 1W31A 3DFOA 1W3TA 1H5YA 2V2CA 1LZOA 4CQ8A 2VEIA 4NZJA 5G1YA 1QAPA 1TPB1 2OT1A 4JR5A 1A5BA 1UBSA 3UWZA 3OVRA 1VLIA 2J9YA 1EUAA 1KM3A 3BG9A 4FNQA 1Q3NA 3W72A 1J2WA 4LOCA 3SY5A 1LRTA 3RU6A 3WFAA 1DJQA 2QCLA 3NPXA 4E2DA 4JTHA 4GWEA 2NV2A 5IBXA 1K3UA 1S5VA 2FB2A 2RHGA 3C2RA 1FXQA 2ATMA 3UY8A 3VE9A 2I1OA 2B7PA 2O7SA 4IWWA 2ZCGA 4ZQCA 4A21A 1KM1A 2QJIA 4AF0B 4KFPA 3DU0A 4BI6A 1D3GA 1GZGA 3R5EA 3WK2A 2ZZ2A 4JYDA 3NGJA 1Q45A 3HGJA 3NAVA 3QW4B 3SJ3A 1EP1A 1XCFA 2YPIA 3PUDA 3W2NA 3PF3A 2HSAA 4WOQA 1Q6QA 5K4ZA 1WAUA 1BTMA 4PL1A 2V82A 1LBFA 3PSVA 1QNVA 2BX7A 1MO0A 4JTSA 4JDYA 4TMBA 2XFWA 1PE1A 2QCFA 1OX4B 2JBMA 3A9IA 3M9YA 2CLIA 2R91A 3G1YA 1U5JA 2NX1A 5LGXA 1KFCA 1MXSA 2A21A 2OJPA 3CWNA 5F4SA 1RQBA 1W5QA 3GKFA 4GUIA 5CPOA 3W1RA 3W83A 3C0JA 4UFMA 3PG8A 3MHUA 2NWSA 2C18A 1IIGA 2VOMA 3G1FA 4QM1A 1R2SA 4WZHA 3MHGA 1F05A 1VQTA 3UYCA 2ZZ6A 1QFEA 1TV7A 5BNKA 2RFGA 3LHWA 5LNWA 2J27A 4H4IA 1JUEA 1S5WA 4PA8A 3RLUA 4X22A 3QMRA 2CZEA 4AXKA 4RLIA 3R12A 3GXPA 4YXGA 1ZENA 4GC4A 3FFSA 1PL9A 4N9CA 4TU1A 3LXAA 1DJNA 2HS8A 3W6YA 3EX1A 1HUVA 3TAOA 4JYEA 1FWSA 5E93A 1EA0A 4MPQA 1A50A 5EY5A 1VS1A 1DOSA 4JTJA 3TDFA 2QEZA 1DKWA 1SO3A 2NXGA 1PIIA 1OFQA 1ME7A 4EF8A 5BMXA 3DFTA 2YCEA 3TQVA 6ALDA 2FQIA 1W5OA 4MIMA 3KRUA 3T7VA 1OYBA 4CCCA 1B4KA 4HNTA 5HQEA 4KWWA 1IXPA 3JRKA 4ZVJA 3MP4A 4QNEA 4LNYA 1EP3A 4DO5A 5HWJA 1OYAA 1RZMA 2HMCA 5MHBA 3MP5A 3H55A 1TV5A 3TXVA 3W3OA 3EWYA 4O1CA 1OFDA 3EXSA 2OX1A 1CX9A 1SW0A 3CC1A 4CNNA 3PUOA 3PVFA 3C4UA 2QR6A 2EPHA 1OABA 4M7SA 2A0NA 4N9DA 4Z0SA 1P1XA 3W7HA 3G22A 2NUYA 1K8ZA 5KZDA 4O19A 4J9JA 3A24A 3VCRA 1GQNA 1SW3A 4O17A 3QPYA 2WNQA 1SO4A 3FJ6A 3EWUA 1P0NA 1H1ZA 4IMCA 3TROA 3TSBA 3LHTA 1ZHAA 4JD4A 1BKSA 5BMWA 4TR9A 4NJJA 1AMKA 3DI0A 3B4UA 3LCXA 4CNPA 1JUBA 3MW7A 2BSLA 4CQ9A 1GG1A 4XUGA 3M7WA 1THFD 3EX4A 3TFXA 4RKAA 2W0UA 3BVJA 4NJGA 2J9ZA 1K7XA 1Z42A 1LLZA 1TPVA 3BK0A 4BWLA 1H7PA 3HB9A 3P5YA 3P80A 3CEUA 3ATZA 3TQ0A 2Y89A 3KRZA 1GJPA 4FX7A 1DHPA 4YCPA 3W2UA 1GG0A 5BW6A 1KFEA 4Y6GA 5AHEA 3EX6A 3W1UA 1IXNA 1H7XA 3GNDA 4LU0A 4E0CA 4HKPA 3T78A 3M6YA 3PBVA 1EPXA 3PR2A 4GJ1A 2G96A 3BLFA 2ISVA 4HT3A 7TIMA 1FWWA 1WA3A 4M7TA 3W76A 2V5LA 3CQ0A 4XTDA 1LBMA 2Y7EA 3LTSA 5K2ZA 3TSDA 2J24A 1M7PA 2WSRA 3ELFA 4IMGA 4MY9A 1FWRA 1TPWA 4UFJA 4RXGA 1P5BA 3TMLA 4NQ1A 4X2RA 3EWBX 3LB0A 3LLDA 3OEXA 3W88A 4AHOA 4O57A 1IIHA 3HPXA 3LCLA 5FI8A 1DVJA 2Y63A 2Y6ZA 5E0KA 1QO2A 4IMFA 5TIMA 3VKJA 2VFGA 1MEIA 5EPDA 1VYSX 2C0AA 3ZWSA 1XBXA 3UWQA 1C29A 1GYNA 4ORIA 2V8ZA 3KFTA 3PUEA 4P61A 2OMAA 3NQGA 1D9EA 3M5ZA 2QUVA 3W87A 3TMQA 5FF3A 3TCEA 5F2IA 3RMJA 3CEPA 3KVJA 2QAFA 2P1FA 5CSRA 4HPJA 1A5CA 4O54A 1VHNA 4O8RA 4O1AA 3NL6A 3W7PA 1NF7A 4N4QA 1YYAA 3O16A 3SECA 4IX2A 1WQ5A 2C6QA 3HBLA 3NZRA 5DCDA 3ABOA 4MY1A 5KINA 2JKAA 4MLJA 3DH7A 5FF0A 3VI2A 5D04C 1TQXA 3S1VA 5LHFA 4EIVA 3GVGA 4WY0F 3TFCA 1TSIA 4DBDA 1JVNA 2EGZA 2C1HA 4XQ6A 3C52A 3KVKA 2AGKA 2OCZA 4PEKA 3G18A 5J5RA 1GOXA 2GUUA 4JGDA 4JTEA 2JGYA 1FCBA 3HG3A 3B04A 3DFNA 3LOTA 2FPVA 4O50A 2DZUA 3FA5A 4QIUA 3C2EA 1XBYA 1CI1A 4IJBA 2E6FA 2ZZ5A 4Z1DA 5L9FA 4UTTA 4Q32A 2ZZ7A 4LVBA 3GR8A 3KVLA 4RZ5A 1M7OA 4ORMA 3G0UA 1KTCA 3GX9A 3GDTA 2ZYFA 2QF7A 2WJZA 1UUMA 3CLMA 3LCGA 1OFRA 3QW3A 1VZWA 3UD6A 1LCOA 4Z0JA 4AWTA 5FEWA 5K9XA 5DY2A 3P67A 2A85A 3NO5A 1AW5A 2H90A 4RV8A 1FY6A 3ABQA 1RR2A 3PBWA 2Z2UA 3RF9A 3LBMA 4DELA 4WX2A 5LZLA 2NZLA 4NNAA 5FEPA 1PHQA 3BV4A 3NL5A 1XUUA 2KZHA 4OE7A 1KV5A 4MZ1A 1JRCA 5HNRA 2JKEA 2Y7FA 4LUIA 4PC8A 1OX6A 3PM6A 2YXGA 1BWKA 1D3HA 3BG5A 1TCDA 4HNVA 3A22A 5CPMA 4RCXA 1SUXA 1AL7A 1JCJA 2G5WA 4UUIA 2CFFA 4Y90A 2V0TA 2YFOA 3IVUA 4WXZA 4GUJA 2JK2A 4A22A 1PCWA 1KM4A 2GOUA 1W5MA 4K36A 3QF0A 3LHZA 4M6VA 3QYQA 4Z08A 1VPXA 5AYYA 5FESA 3I65A 4K39A 4QSHA 1ZAJA 3PS7A 2V81A 2W6RA 3Q37A 4XBKA 3EXRA 2VFFA 4MOZA 4QQ3A 1KM2A 3MBFA 5C54A 1LDCA 4JY8A 2YZRA 3PWAA 4AVFA 1W5PA 4GUHA 2V2HA 3D0CA 2DZVA 2RKXA 2E6AA 1TTPA 1W37A 4LUJA 3UXAA 1ICQA 2FDSA 3P8IA 3UNDA 3W7KA 4IPIA 3F1QA 4NJHA 1P4CA 5DBTA 3G8RA 2ZZ4A 3G0XA 1I8JA 2LLEA 2PE4A 5G2IA 3FOKA 2WSYA 4FB7A 1FQ0A 1QOQA 2Q8LA 2WNNA 1QOPA 4JX4A 1NVMA 2GVGA 1TJRA 1QMLA 3EKLA 4UIOA 1JULA 3CPRA 3KRSA 2F84A 4M6PA 2A6LA 3L68A 4IXHA 2FPTA 1OFEA 3NQDA 1ZCOA 1I45A 3FKRA 4LVDA 2QCCA 4K6AA 1I2PA 4FX6M 2NV1A 3KOFA 3N9SA 5AN7A 4UMAA 3W9ZA 3W1XA 4BI7A 2EHHA 5CKSA 3MYOA 2R94A 1DV7A 5CG7A 1XL9A 3MI2A 4ADSA 4TMCA 3NQEA 3LX9A 3BLEA 1F6KA 3L2IA 3TAKA 4WD0A 3W7MA 4DPPA 4LS0A 4Y96A 1FWNA 4DO4A 3OVQA 5H91A 3FKKA 3HOJA 2ZA2A 1XDLA 1KM0A 4E2BA 3R8RA 4A3UA 5CZTA 5G5IA 3NYZA 4K8HA 1TO3A 1G7UA 1RQEA 5DY3A 4JTUA 3E96A 5G4EA 2WO5A 3W71A 1EWDA 3EX2A 2ZFAA 4AMAA 2HS6A 1BWLA 2E68A 4D2JA 1LRQA 3CU2A 4O10A 1VLWA 3TC6A 3L5LA 3IGXA 1WV2A 1MSSA 3K30A 2NX3A 4UFLA 3WK1A 3S6DA 4XKYB 1TPEA 2CLEA 2P0OA 3NQFA 2FIQA 3W73A 5C55A 1EWEA 3W1NA 1YDVA 2B4GA 5D2YA 2YGYA 4X3ZA 2AAMA 3EWZA 4FXRA 1VR6A 3NA8A 4AEOA 4N9BA 4YWIA 1F5ZA 3L5AA 1N7KA 3A5VA 3W1AA 4DF2A 2QCDA 4IMEA 1EX5A 4A29A 4ZQOA 3QRHA 4AHPA 2C3ZA 3EWXA 4M19A 1FX6A 3HG2A 2X1TA 3RLVA 1W8SA 3DENA 4O0KA 1KW1A 4JTGA 2TPSA 1SO5A 3LRKA 5AOUA 5LNVA 1X1OA 1I2QA 4UMBA 4NT0A 4PTNA 2E5CA 3GNNA 1K7EA 4NVTA 1FDZA 1YXCA 5IM51 1X8FA 3N34A 1NAL1 4LT9A 3E12A 3NQ8A 2V2DA 2JGQA 4N2YA 5E1QA 1GYLA 3ANYA 1YDOA 5G4WA 3HQ1A 5D02A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3W24 A;  5CJN A;  3RU8 X;  4TXE A;  3TYU A;  3DFY A;  1F73 A;  4FOK A;  5F2G A;  1JQV A;  3WEM A;  1B31 A;  5HNN A;  1OWQ A;  5DAN A;  2GJL A;  4EOU A;  4NIL A;  3WQ5 A;  2BNJ A;  5BOO A;  1PTA A;  2VNC A;  4MFE A;  1TWW A;  2CC0 A;  4RNJ A;  4HA1 A;  1TTI A;  2HBX A;  1UZ1 A;  1ZNN A;  4IPL A;  5DRC A;  1BLI A;  3A64 A;  4PN2 A;  1FUY A;  2EEX A;  4HSN A;  1ZL1 A;  1QCW A;  3MBD A;  3DEQ A;  5AC5 A;  1R6W A;  1TZZ A;  5M1T A;  4IQD A;  1BGA A;  1XRS A;  2FJU B;  4QAW A;  4E6M A;  2Q3O A;  1PKY A;  4BWL C;  3MMT A;  1UWA A;  3B4Y A;  3HMJ G;  4GNJ A;  3UZW A;  4RE4 A;  4D1J A;  4D8Z A;  3EOE A;  1TQJ A;  8TIM A;  3WQP A;  1W0M A;  4QX4 A;  1AFS A;  4UNK A;  2G50 A;  1XIF A;  3SRH A;  4JKM A;  4BF9 A;  3OW1 A;  3LLF A;  2FFC A;  3F4V A;  3MZN A;  3GDR A;  4BCE A;  5FAJ A;  1FBA A;  4AVO A;  2PAJ A;  3OHM B;  4HU0 A;  4JFV A;  4UTL A;  4YVV A;  1WZL A;  3DHF A;  4DJF D;  4DF1 A;  3APG A;  1AA1 B;  4LYQ A;  4FMV A;  1TX0 A;  1AQ0 A;  3AHT A;  2VX6 A;  5LGZ A;  4HA0 A;  1CNV A;  2Z7K A;  1OEP A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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