3ABRA

Crystal structure of ethanolamine ammonia-lyase from escherichia coli complexed with cn-cbl (substrate-free form)
Total Genus 194
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
194
sequence length
453
structure length
453
Chain Sequence
MKLKTTLFGNVYQFKDVKEVLAKANELRSGDVLAGVAAASSQERVAAKQVLSEMTVADIRNNPVIAYEDDCVTRLIQDDVNETAYNQIKNWSISELREYVLSDETSVDDIAFTRKGLTSEVVAAVAKICSNADLIYGAKKMPVIKKANTTIGIPGTFSARLQPNDTRDDVQSIAAQIYEGLSFGVGDAVIGVNPVTDDVENLSRVLDTIYGVIDKFNIPTQGCVLAHVTTQIEAIRRGAPGGLIFQSICGSEKGLKEFGVELAMLDEARAVGAEFNRIAGENCLYFETGQGSALSAGANFGADQVTMEARNYGLARHYDPFIVNTVVGFIGPEYLYNDRQIIRAGLEDHFMGKLSGISMGCDCCYTNHADADQNLNENLMILLATAGCNYIMGMPLGDDIMLNYQTTAFHDTATVRQLLNLRPSPEFERWLESMGIMANGRLTKRAGDPSLFF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
publication title Crystal structures of ethanolamine ammonia-lyase complexed with coenzyme B12 analogs and substrates.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ethanolamine ammonia-lyase heavy chain
total genus 194
structure length 453
sequence length 453
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.3.1.7: Ethanolamine ammonia-lyase.
pdb deposition date 2009-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06751 EutB Ethanolamine ammonia lyase large subunit (EutB)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.220.70 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Annexin V; domain 1 lyase 3abrA02
2.30.170.30 Mainly Beta Roll Ribosomal Protein L24e; Chain: T; ethanolamine ammonia-lyase heavy chain domain like 3abrA01
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3abrA03
2RDTA 4OV9A 3HGJA 4DPPA 2YW3A 4O4VA 5G4EA 1OYBA 1OYCA 3DKJA 3SFKA 1D9EA 4OWGA 2I1OA 1GJPA 2TRSA 3ABSA 2BXVA 3W7LA 4O57A 3C2FA 3PM6A 4FIQA 3PBWA 2H90A 3S5YA 4WQ6A 3VE9A 3W7CA 2QJHA 3LV5A 5F1VA 3O63A 4ALDA 1F73A 2C14A 1H7RA 2D73A 3BPWA 1GVRA 3EEGA 3A22A 1XBVA 1XCFA 1QNVA 3NPWA 4MLJA 3P84A 2C3ZA 1YDVA 4XWUA 1YXYA 1SZNA 1EUNA 3ANYA 1TQJA 4CQAA 5K4ZA 1JRBA 4K39A 3QPYA 3W1LA 4OU1A 4XUGA 1K7FA 3N9SA 3G24A 2Z0IA 4UR8A 4WJEA 3A24A 1LROA 2CZFA 4BWLA 3LXBA 2ZZ5A 2F84A 2I9EA 4M5PA 2V9DA 4OHQA 3P67A 5LGXA 2WNZA 1GTHA 3IGSA 2DJXA 5K2ZA 4DO4A 2C6QA 5ABTA 3NQAA 2H3DA 5HULA 2QKFA 1OFPA 4ADUA 3QSTA 4K38A 2PRMA 4FNUA 2Q8ZA 3SI9A 5DCBA 5CPNA 2FQIA 2JKPA 4PCFA 3TJLA 2J24A 2E6AA 1EEPA 4ZQRA 3MMTA 3W83A 2QF7A 3HG3A 5KSWA 3WJZA 2ZFAA 4O14A 3LCGA 1LOQA 4JX6A 2XN0A 4O1CA 3A5FA 3MP5A 3NQ6A 1VYRA 3QW4B 3LCLA 5HMSA 3M5YA 4RLIA 1I2QA 3EWWA 5D05A 5AHLA 2YR1A 2YW4A 3HQ1A 3C6CA 1QPQA 2OT0A 2ZA1A 5AYYA 1F5ZA 1FUYA 2CWNA 5C55A 3M41A 4XKYA 3W88A 4JTHA 4DPQA 4OQVA 1KM6A 2V2HA 1VR6A 1YDNA 3W3OA 1H63A 1OFBA 4LV4A 2Y62A 2Y88A 1JCYA 5CGQA 3RMJA 3VI2A 4LRTA 1OF8A 3OVRA 2V5LA 5GVJA 3TW7A 4FF7A 1IF2A 1SW3A 3NAVA 3O05A 2NV1A 1SO6A 1K8YA 3BVJA 1A53A 3L0KA 4K6AA 4C1LA 1IXQA 4YXGA 4NZJA 3U6WA 2OX1A 3S9YA 3QW3A 3EX1A 1QDSA 1N7KA 2NXGA 1B9BA 3NZRA 2HS6A 1SZEA 1MSSA 4GNJA 4LU0A 3NXFA 1P1XA 3VCRA 3C3NA 3STGA 4Y9AA 3N2MA 3NGJA 3HPZA 5AOUA 4CNPA 2VEPA 3PB2A 4P61A 5HWJA 1RQBA 2I14A 1L2UA 2QR6A 3E49A 2FPTA 5K9XA 4AWUA 2YCEA 3W2KA 1TV5A 3IIZA 1H50A 2ZRVA 1UJPA 2HTMA 1B4EA 4UMCA 3B03A 4H3DA 4Q33A 3GVGA 4POCA 1QOPA 3SR7A 3QRHA 4UTTA 4O10A 3GYEA 2ISSA 3WJYA 1K02A 3CC1A 1ZAHA 1TB3A 5D2VA 1QCWA 5CPMA 2YX0A 4UTWC 4WY0A 4JTIA 2WQPA 1UUMA 1SR9A 3G3MA 4UUIA 5DLCA 2YPIA 3B0PA 2CZ5A 4U28A 3O16A 3L67A 3LV6A 1OX5A 1PE1A 2H8ZA 4O0KA 2QDHA 1G69A 3UXAA 1K3UA 3EWZA 4JDBA 2NXHA 5D2YA 1GVOA 3GR8A 2CLKA 3M0ZA 3P7YA 2PRLA 3KFTA 3W76A 3DHFA 3NQ8A 3IRDA 4FIRA 4NX5A 2R94A 3LHWA 4S1FA 4OE7A 4PL1A 1G7VA 4K37A 4JD4A 4NNBA 1TPDA 4FX8A 4ZQCA 3KVKA 2VFDA 3KXQA 5AC7A 4MY9A 2ZA3A 2G95A 4NZFA 1LLZA 2YFOA 3GK0A 3G1YA 1WOAA 1TPFA 4A21A 1G4TA 2X1TA 3GZ3A 3DFPA 3M1ZA 3G1VA 5T26A 3ATZA 3F4WA 2NV2A 3TQ0A 4JYFA 2FJKA 1WDWA 2QCLA 4UTMA 3JRKA 4PH6A 3P5ZA 1LRQA 4JYEA 4OT7A 4R34A 5FEXA 4FNPA 4UMBA 3NQCA 3ELFA 3W1AA 2P0OA 1OK6A 4NJHA 3TAOA 3W73A 3SGZA 1ALDA 3Q58A 5G1YA 4PEKA 5I3FA 3HJZA 1PCWA 3W7NA 2Y7GA 2CLEA 3M47A 5DY2A 4QNWA 1G6CA 5AHFA 5KZMA 2VKZG 5BRBA 2NUYA 1QPRA 2V2CA 2FPVA 3MO7A 3N34A 5H2ZA 1OG0A 1CX9A 4GC4A 3HBLA 1ONRA 2JK2A 5FEPA 5G4WA 3FIGA 4Y96A 3PB0A 4CCEA 4NT0A 4LS2A 2DZXA 2E1DA 4M6VA 4K7VA 2V0TA 3IV3A 3UY7A 3S8HA 1EWEA 1R2SA 3N3MA 5HR6A 3CWNA 3DENA 1RZMA 5D33A 4MZ1A 1X8FA 3Q2DA 1ZHAA 3W1NA 3MI2A 5HWNA 3LGEA 3KRSA 1TTJA 1YXCA 2V82A 3GLCA 4ZZ9A 4NQ1A 4ZL1A 4KWVA 1XBZA 3LDVA 1V5XA 3NQDA 1EPXA 1K8ZA 1HTIA 4LNYA 1AMKA 3TMQA 2C16A 4QIUA 5CKSA 1C8VA 3TQVA 1ML1A 5E93A 3QQ0A 2Y63A 3QSRA 2X16A 1QO2A 3FS2A 5C54A 1IIHA 1SO3A 2QUUA 3O6DA 1S3HA 1G7UA 4Y90A 4MY8A 1G4PA 4JS3A 1VLWA 3NM3A 4FXRA 1OK4A 3ABQA 1WAUA 3A23A 5DCEA 3FLUA 1WXJA 5K9DA 2A85A 1JR1A 3W1QA 8TIMA 3GB6A 1AL8A 2FPYA 2ZCGA 4UTKA 3R8RA 3P80A 1EB3A 2X1SA 3N19B 3MW7A 1QR7A 1ZY9A 1LTDA 3P62A 3UWQA 2ZDRA 1BWLA 1XBYA 3LTYA 1PS9A 3O15A 3L65A 1TYGA 4O1BA 1A5SA 4AXKA 4EF8A 2NLIA 2DORA 1FCVA 1W5MA 1C9DA 1IXNA 1DL3A 3LTPA 4N4PA 2VENA 3U2OA 3W74A 1Z41A 2C1HA 1SW0A 3C56A 5CZTA 3NM1A 4RXGA 3CPRA 5HQEA 1MXSA 4TIMA 5D32A 6TIMA 4FNTA 4JIQA 4I7UA 3GKFA 3BLFA 2GJNA 5K7JA 2A6NA 2GVLA 4AMAA 4IX2A 3E12A 1HFBA 3DI0A 1N55A 3G3DA 3G1XA 1DVJA 1WOBA 3NL6A 3TUUA 1SSGA 1G4EA 1H7NA 1SZFA 3RLVA 3G1SA 4Z0JA 3QFEA 1F05A 1KBIA 3E96A 4Q32A 3H54A 2X30A 3QH2A 1BKSA 5FF2A 4ADTA 3NQ2A 2E6FA 7TIMA 3DH7A 4JY8A 4WXYA 3IIVA 4S2BA 1XXXA 3TDFA 5EYWA 4FXSA 2B7NA 4D2JA 4J9JA 1HUVA 2E6DA 2QCNA 2QAFA 4RZ5A 3IIOA 1FWSA 3BW3A 2WPBA 1W0MA 4RR4A 3M44A 3IVSA 3P74A 3W7GA 1H5YA 2ATSA 3NNTA 4DF1A 2ZZ6A 4LUIA 1QFEA 2PURA 3T55A 3Q37A 2BTMA 3STFA 2WSRA 1ZJIA 2Y7DA 1HG3A 3BV4A 1OFRA 3C61A 2QEZA 4LW7A 3YPIA 3FOKA 1FDZA 3DU0A 5HUOA 4IUOA 1LP6A 1XM3A 3DFOA 1WYIA 1JCNA 4CCCA 4BI6A 4QM1A 2ABBA 1FXPA 4UC5A 3S1VA 4O16A 1P4CA 4JDYA 3O07A 1XC4A 3PG9A 4CCDA 1EP1A 5KITA 3FYOA 1VRDA 3G1FA 4WD0A 3HO8A 4RJEA 4PTNA 1QPOA 1DJQA 1GOXA 2WV8A 5LNSA 1U83A 2W0UA 2E5CA 1CI1A 3TROA 3BLIA 3KAOA 5U4NA 2QCDA 1OYAA 3THAA 4IMCA 3W7HA 1KFKA 1KM4A 1KFJA 3HGRA 4ORIA 1JCJA 4JNMA 3HMJG 3T7VA 3HG4A 1F74A 2VFIA 2C18A 1A5CA 1LBFA 4GUHA 3OVPA 2NWRA 4HPXA 2ZRZA 4O19A 5AHEA 1H1ZA 3LHTA 1A5BA 2DZTA 1LZOA 1GEQA 1JVNA 2NX9A 3MI6A 2C13A 3UWYA 2QCEA 5LGZA 5I3IA 3IIXA 4JGDA 1VZWA 3V1PA 1KTNA 2JBMA 3UPWA 1WBHA 4KFPA 2YYUA 3NQGA 5K3VA 4GUJA 3B04A 3HGSA 1ZAJA 1Q6OA 1TCDA 1EA0A 1B57A 3M6YA 3RU6A 1H7WA 3IEBA 1ICSA 2FB2A 1AW1A 2PC4A 5AC8A 4LWWA 1QMLA 1DORA 1TREA 4FNQA 1EUAA 2WKJA 5CZJA 1KLYA 4GRSA 3UQNA 3WFAA 4DF2A 3UNDA 3GAYA 5DCDA 4MJMA 1AG1O 1RPXA 4HNTA 1H7XA 4AEOA 5F2GA 3WK2A 4A3UA 3W87A 1M7OA 3W07A 2DZVA 3TSBA 3NL5A 4E0CA 4O15A 2W79A 3C2OA 4M7TA 4UFMA 3BLEA 4LOCA 4HNUA 1Y0EA 1GYLA 3C4UA 4OBTA 1G67A 3MP3A 1VPXA 3W1TA 1LLWA 4TR9A 4CLMA 5AYZA 2WSQA 1MEWA 4LRSA 1FDYA 4GXMA 5CSRA 1KLZA 1I45A 3A9IA 1GPWA 3PR2A 3O6CA 1QWGA 2YYTA 4O4WA 2FIQA 3H55A 1EX5A 5G2WA 1Q6QA 4M6PA 3QEZA 1RVGA 2ZRWA 3KVLA 2NZLA 4I9AA 4AWTA 2ZRXA 3LRMA 1Q45A 4IXHA 2Q8LA 5FF4A 2YSWA 3TSMA 3DI1A 4O53A 1VGAA 5F4XA 5CG7A 5BW6A 4XQ6A 1VS1A 4RKAA 3MYOA 3GX9A 2OJPA 2NX1A 4NVTA 3FKKA 2B7OA 4HNNA 2DZPA 4IPIA 1D3GA 1QPNA 3A21A 4ZQMA 4XBSA 2QCFA 4W9TA 3WJWA 3EWXA 3VE7A 2QCGA 4RCXA 1M6JA 3AJXA 1GWJA 4DEFA 1FBAA 1NSJA 5EPDA 4I7VA 2RDUA 2QJIA 3W7QA 3W84A 2RKXA 3TKFA 4UTHA 2A1YA 4QAIA 4A22A 2EKCA 1PIIA 3G1AA 2QDGA 2RFGA 2DZSA 3QF0A 4KWWA 3DFTA 3NR0A 1OVDA 2VFGA 1GTEA 3W6YA 3USBA 1KTCA 3TMLA 3LERA 3DFSA 2GJLA 1NEYA 2PRHA 1JRCA 4N2YA 3GKAA 3DFNA 1SPQA 3G1HA 3QQ1A 5KINA 3O1NA 3W71A 1XDLA 3NYZA 5AHMA 3NQVA 5HNRA 3KRZA 3LX9A 4IWWA 3NZ1A 2QUTA 5AHIA 2H6RA 1BEUA 3CB8A 2A0NA 3EX2A 1WBJA 3B06A 4HIBA 1TTIA 3TAKA 1AW5A 5EL1A 3TE9A 4X9SA 5I3GA 3HPSA 3TNOA 2FLIA 2Y6ZA 3G18A 1LRTA 5D2XA 4JYDA 4N9CA 3C2RA 3JR2A 1T0OA 2EF9A 4R53A 1TMHA 3VNDA 1W5OA 1FCQA 4UTTC 4AF0B 1A5AA 3R89A 3W7EA 2E77A 1E51A 5AYXA 3W23A 1BTMA 2C0AA 4QQ3A 4WXZA 4LVFA 2BX7A 2DJLA 1XDMA 1R2RA 3FKRA 3EWYA 4UNLA 1JCLA 1LBLA 1YYAA 2A7PA 3M16A 4AWSA 3VKJA 2JGQA 5DXYA 1SQ7A 1KV8A 3R13A 4BFAA 1I2PA 3B4UA 4ICNA 1FCBA 1OFQA 3TXZA 3PC0A 4H6KA 1PVNA 5TIMA 4QJ1A 3INPA 1S5TA 3W2JA 5K9CA 4WY0F 4HT3A 3CIXA 1L6SA 3CIWA 1O94A 1AK5A 3LTSA 1YPFA 1UUOA 4N4QA 3S5ZA 3C2VA 5FEZA 3QMTA 2CLIA 4K7YA 2NUWA 1ZNNA 1F6KA 4PA8A 2H3BA 2QAPA 1ICQA 5HWMA 1O60A 3W2UA 2CFFA 1ZAIA 3WK0A 1W5PA 5E0KA 2J9YA 3EXSA 4LVAA 4LTSA 4MY1A 3ABRA 1R2TA 2IQTA 1T8XA 4KFNA 2ISWA 1V7YA 5G5IA 5SWUA 4JTUA 1K8XA 3FA5A 1YDOA 1TPC1 4RZ6A 3G22A 3OEXA 3MI3A 4N9DA 2ZZ7A 4JX4A 3TV8A 1LOLA 3B0UX 4M6QA 1FWRA 4ZQOA 3OBKA 3MUXA 1VYPX 1WX0A 1TJRA 2ATMA 3IVUA 3PWAA 4A29A 1LBMA 1P0NA 3M5VA 3FFSA 4AHQA 3L66A 3NG3A 1DHPA 2E09A 4P2VA 4E38A 2CZEA 3EXTA 4YL2A 3MBFA 2GVGA 3GIYA 5BMXA 4MIMA 5F4WA 3QPZA 2NX3A 3MHFA 1L9WA 1Z42A 3LCXA 4JIPA 2ZRYA 3EB2A 3LRLA 4GUGA 1O5KA 5FESA 3L5LA 2AAMA 4MFEA 3GDRA 3T4CA 4NXSA 1W5QA 5F2IA 5D2WA 5FEWA 1J5TA 3CEUA 1SFJA 4MZ8A 4NJGA 2DP3A 1OX4B 1EP2A 2ZZ3A 3G1DA 3DGRA 2TPSA 3ZS4A 2J9XA 3LCHA 3T40A 1VCVA 4ZMGA 3W7PA 4BF9A 4EVZA 2GUUA 2V2DA 2TYSA 1RD5A 4O0ZA 1J4EA 1W8SA 2B4GA 2EGZA 4Y8FA 1O5XA 1FWWA 3L68A 1UBSA 1WA3A 5EA9A 3L9CA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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