3GNNA

Crystal structure of nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase from burkholderi pseudomallei
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
292
structure length
266
Chain Sequence
TIDAVSPLFADISREYGAAFDAAIARNVADALAEDVGSGLVPDGAPRRARVIVREDAVLCGVPWFDAVVRAVDPSIEVDWRHREGDRMSADSTVCELRGPARALLTAERNALNFLQLLSGVASATRQYVDRIADTRARILDTRKTLPGLRLAQKYAVRVGGGANQGVGEALDAAFALNVPVQIEVETLDQLRTALAHGARSVLLDNFTLDMMRDAVRVTEGRAVLEVSGGVNFDTVRAIAETGVDRISIGALTKDVRATDYSMRIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Burkholderia pseudomallei
publication title Crystal structure of nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase from Burkholderi pseudomallei
rcsb
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
total genus 91
structure length 266
sequence length 292
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2009-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3gnnA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 3gnnA01
1NF7A 2RFGA 3WJWA 4O4VA 3L0KA 1TV8A 3NPXA 4K36A 1OK4A 3UWUA 4WOZA 4A2RA 3EWWA 1RQHA 2VXNA 3W7GA 4MLRA 1LZOA 4ORIA 3E49A 1Q3NA 3PBVA 4LTSA 1J2WA 1QO2A 3HO8A 3A24A 4FX7A 5HMSA 2NZLA 3O1NA 4LY8A 1EIXA 3JS3A 4KWWA 3N2XA 5HJLA 1VQTA 3DENA 4XBKA 3WJYA 2QUUA 3NXFA 4Z0SA 2Y62A 2HMCA 3HGSA 5CSSA 4UMBA 3P7YA 1DQWA 2OCZA 3UNDA 5AC6A 3C4UA 3LOTA 3RK8A 4QSHA 3C61A 3KVJA 2FLIA 2W6RA 3ABRA 1TYGA 1VYPX 2C3ZA 3P61A 4NXSA 2G95A 4N4PA 2QAFA 1Z42A 4FX6M 2ZRZA 4CCDA 3W23A 4K8EA 2VOMA 1OFAA 3W07A 4B5NA 2JBMA 3W7IA 2Z6JA 4O11A 3GB6A 1HFBA 3PUEA 1DORA 4ZL1A 1OYAA 4DELA 3PC0A 4NJIA 5FF2A 1VJIA 4FXSA 5KZEA 4OV4A 5D04C 5BW6A 3D0CA 2WOQA 2QCEA 3G18A 1VZWA 3W71A 3IGXA 3G1XA 1UCWA 2NX1A 2AQWA 3T7VA 3N19B 2YFNA 3LTSA 4NNAA 4O10A 1QPQA 4BI7A 3C2FA 4GNJA 2FB2A 3KFTA 5D37A 5EPDA 1SZNA 4UFHA 2YW4A 3LI1A 2WSQA 3W7PA 4YWIA 2Y88A 3O6DA 3TQ0A 3O05A 1ME8A 3F4NA 1GVSA 5H2ZA 3S5YA 3L65A 1KLYA 1PHQA 2QDHA 1HUVA 4J9JA 4NT0A 1ZNNA 1SPQA 4O1DA 3QC3A 2ZRVA 1EP2A 5D09A 2Y7GA 3GLCA 4A29A 5F1UA 3AO0A 5KINA 1OYCA 1FDZA 1G7UA 4FHAA 3SSJA 1FWSA 1G6CA 3UZJA 1FXQA 3TX9A 1ICQA 2GQAA 3C3NA 1W5QA 4O1AA 4JEQA 1OHLA 1H62A 3UXAA 3W70A 1FCVA 1EWDA 3W2JA 4AVFA 1KM1A 4JTUA 4XKYB 3P62A 1PV8A 1TB3A 3G1VA 5AYXA 4Y96A 5DELA 3QM3A 3KXQA 4DO4A 5F2GA 2H8ZA 1YPFA 4RXGA 3LCHA 1EA0A 5FESA 3U8GA 3ABOA 3W7NA 4YLWA 5K9CA 3G0SA 3P67A 4LUJA 2ZA1A 1I2NA 4ZQNA 3PBUA 2V82A 3DI1A 3HG2A 1F05A 3I7RA 1K7XA 1QPOA 3B0VC 4L4MA 1F6KA 1VCFA 1VYRA 3G0XA 2QCDB 3M5YA 1KTCA 3SI9A 2FPTA 3FIGA 1KFBA 3NA8A 3TFCA 2GUUA 1K03A 3LLDA 3DKJA 3EWUA 4QQ3A 3NVTA 3LHZA 3S5ZA 4AF0B 5FF3A 2QCDA 3UWZA 1JCMP 2H3BA 3IV3A 1SO5A 1GG0A 4LRTA 4ML9A 4NJGA 1MSSA 1QNVA 5LNRA 3SJ3A 2ISVA 2B4GA 2G5WA 4PH6A 3W1NA 3TJXA 4N9CA 1QCWA 1SO4A 5K4XA 1L6YA 3G8RA 1VLWA 4BFAA 4QISA 3KVLA 3W1RA 2G97A 3G1HA 5D03A 1Q6RA 3TQKA 3JRKA 1DJNA 3BG5A 2DJLA 3LCIA 4IX0A 3M41A 3B06A 1KFEA 2QCLA 3OBKA 1KFLA 3M7WA 2E68A 3MP3A 3LHUA 2QJHA 3RLVA 3TK7A 4IOTA 2E6FA 4QM1A 3LERA 1QOPA 1ONRA 2DZPA 3W1MA 3TJLA 1Q6OA 4NNBA 1RD5A 3L5MA 2VKZG 3LCFA 3OVPA 4BI6A 4DO5A 2ZTKA 4RZ4A 1VCVA 4S1FA 2ZA2A 4CQ9A 4N2YA 3BV4A 3USBA 4K37A 3W7HA 2X1RA 4JYFA 3Q37A 2CZ5A 4GC4A 1MXSA 3WK1A 3UYCA 2WSRA 1B4KA 2TYSA 5G5IA 4OBTA 4UTTA 3UZ5A 2OT0A 3CQ0A 3DFTA 5HWJA 3SGZA 1ZENA 3LLFA 3QEZA 1R46A 1MEIA 2ZZ4A 5K2ZA 4GUGA 1KV8A 4HPXA 2NWRA 4DQWA 2ZZ3A 2A0NA 2ZFAA 1KTBA 1KM4A 2OX1A 4HPJA 3P8JA 2C19A 4JTTA 1QOQA 4JTHA 3QF0A 4L4LA 4WZHA 5DLCA 4Z0JA 3K30A 1L9WA 3GZ3A 3VE7A 1QPNA 4MYXA 3R5EA 3RLUA 4HN4A 3SFKA 1YLVA 3UXDA 4P61A 4EOUA 3PY2A 5CPOA 3LBMA 3GKAA 1PL9A 4UTWA 3W73A 4BF9A 4N6EA 2BSLA 1OK6A 3AJXA 3NQ8A 3TDFA 1QMLA 2E6DA 3UPWA 2B7PA 2FIQA 1K3UA 1UASA 5K9XA 3P5ZA 2ZRWA 3GIYA 3LRMA 4AMAA 2QCNA 3PUOA 4JXCA 5KMYA 2B7NA 1XBXA 1WDWA 1KM0A 3VKJA 3NR0A 4I7VA 3OA3A 3LXBA 2J9XA 1OF8A 4M6QA 4UTUA 1FDJA 4E0CA 1FWNA 3FKKA 1TREA 1X7FA 1BKSA 1TTQA 3BG9A 3PVFA 4PTNA 1Q45A 3T44A 1A5SA 2YYTA 1WX0A 1TPUA 4UCGA 3CEPA 3SW6A 4ADTA 1B9BA 3NM1A 3PULA 4JIPA 2GQ9A 3G1FA 4R33A 1H7RA 3LTYA 4QAIA 1QAPA 1VGAA 5AFDA 3DXIA 4CQ8A 4O1BA 3LHTA 4R34A 2Y89A 3NNTA 1HO1A 1O5KA 5AHNA 5LZLA 3GVGA 4IMFA 4M6PA 4N9EA 1VPXA 3BW2A 3G1DA 1YTEA 4JTIA 1P4CA 2V0TA 4MUZA 3MW7A 3CPRA 3UY7A 1NVMA 2FTPA 4O1CA 1H50A 3C6CA 2NUWA 2VENA 3FFSA 3NQ7A 3Q58A 5E0KA 5A5WA 4YCOA 1S3HA 3TXVA 2ABBA 4UFIA 1JCJA 1GVFA 1W54A 3U2OA 4TO8A 1H63A 2EAWA 3M16A 5HNRA 1L6SA 2BLEA 1SZGA 1KM3A 1NFBA 5LNWA 2A4AA 3W2KA 1CI1A 1CX9A 1GG1A 3GXTA 4IGHA 1K8ZA 4LS0A 1BWLA 4N9BA 4ZVJA 2A6NA 3W7KA 1YTDA 2ALDA 3LXAA 1YDVA 1AMKA 1DJQA 1H7WA 3PM6A 4XTIA 2HS8A 1VRDA 2W0UA 2RDUA 4UTKA 1EP3A 3KHJA 4LNYA 2YSWA 4FNRA 1WBJA 3QMSA 1AK5A 5K4ZA 3ZFHA 4GUFA 5HWMA 2OJPA 3A21A 4PEKA 5CZ0A 1MEHA 2DORA 4NJKA 4GUJA 4LVAA 4O16A 3O8AA 2NV2A 2YPIA 5LSMA 3BVJA 1GJPA 2X16A 3NQDA 3HB9A 4KFPA 4JICA 5L6UA 3DFPA 4IMEA 4WXZA 3NQGA 3TMQA 2PE4A 2QCHA 5DY2A 3NGJA 3LBCA 5E1QA 2J27A 3KRSA 1ICPA 4QIUA 2YR1A 1JUBA 1PCWA 1XKYA 3TROA 1EUNA 2WKJA 1PCKA 3RU6A 1DL3A 2WV8A 2QF7A 2ZZ6A 2V2DA 1LLWA 1VR6A 4CQAA 2CFFA 4WY0F 1BTMA 4FO4A 5EKYA 4YMZA 2CZEA 2RKXA 5IBXC 2IQTA 1OFPA 3TC7A 2NV1A 2Z6IA 4WUIA 3G3DA 4MZ8A 3NPWA 1K7EA 1Z41A 2V5LA 5C6MA 1G69A 4DBDA 1K02A 3B0PA 1EEPA 1K8YA 2H90A 2YX0A 3W86A 1YYAA 3LGEA 4JS3A 3BLIA 3DBPA 5D2TA 3MI3A 4O0ZA 3IGSA 4MY8A 2CLFA 4JTSA 3EB2A 3FA5A 4M7SA 2C6QA 2YCEA 1DOSA 4FNUA 4FNQA 4HKPA 1XI3A 1ZFJA 4IUOA 3HGJA 4ONVA 3M1ZA 4PL1A 4R7JA 4GFSA 4YCPA 3M9YA 5C5YA 2J88A 3S6DA 5DY3A 4S2BA 3WJXA 4A2SA 4M7TA 4UR7A 2YGYA 3L66A 4Z1BA 4OGZA 4ZZ9A 4WJEA 2A2IA 4JNMA 4FNSA 1LBLA 3UWQA 1TTPA 3WK0A 3LI0A 3VNDA 4DEFA 3THQA 5AN7A 3P81A 4O54A 1X1ZA 1HO4A 2Q3OA 5FF0A 3UY8A 3GAYA 4IMGA 3MJYA 3UD6A 1GTHA 3YPIA 5EL1A 4RZ5A 5FEZA 1RV8A 4QITA 1OFBA 1PIIA 5BMXA 3W2LA 3CWNA 1A5AA 2O7SA 2H3DA 3W7MA 3ZR4A 3IIXA 2PRLA 3S1XA 1SO3A 2A1YA 2A85A 2H6RA 3VE9A 4POCA 3BG3A 4N4QA 3A22A 4UUIA 1YDNA 4JIQA 3ZWTA 3MHUA 1G4TA 3DH7A 1ME7A 4UC5A 1TQJA 3W87A 4NQ1A 2GOUA 3NOEA 5F1VA 4JTFA 5EMUA 1GYLA 3GDLA 3CIXA 3DFOA 3NQMA 4XUGA 3W22A 5EY5A 1SSGA 3R13A 4MIMA 4GBUA 4GUHA 1WQ5A 4MPQA 1SSDA 3TSMA 3NPVA 3LDVA 1F2JA 3W83A 4MJZA 2Y70A 3N9RA 3QJAA 4K38A 5CKSA 1LOQA 2LLEA 1UUOA 3HPXA 4P2VA 4O8RA 1QWGA 2ZRXA 3BGJA 3W1PA 2HTMA 1N55A 1S5VA 4IMDA 1SW0A 3W74A 1GTEA 1R2RA 4UMCA 4XQ6A 4BI5A 2V30A 4IXHA 1N7KA 3GDTA 4UIOA 3UQNA 1M7PA 1JUKA 1Q6QA 3EWXA 3IRDA 1EUAA 1RR2A 4TR9A 5D2VA 5LGZA 1OX4B 4OWGA 3SECA 2X2GA 2WNNA 3HGRA 4ADSA 3WJZA 1XBYA 2WNQA 2A7RA 4UFKA 4FIRA 5AC8A 4AB4A 3W1AA 1TPVA 1OX4A 3P5YA 3W72A 4Z1AA 3OHIA 4E2DA 3IVUA 4AHQA 5D02A 5DCDA 4JX5A 3W7JA 2E5CA 5ABTA 5CPNA 3OIXA 4TIMA 3WK3A 2V2CA 5J5RA 4Y90A 4QNWA 1OFQA 2VEPA 1N8FA 1KFCA 1VHCA 4DF2A 5FF7A 2WPBA 3L5LA 3GYEA 3N3MA 3O6CA 3QFEA 1FWRA 3HPZA 1W5MA 3P8IA 2ZZ2A 3SIZA 3ABQA 1I2QA 1Z44A 2VFDA 2FFCA 3LTPA 4OU1A 2Q8LA 3EX1A 3LRLA 1JQXA 1L6WA 2A5HA 1SZFA 3DZ1A 3CU2A 1I4NA 2XFWA 1FWWA 1H7XA 2Q8ZA 1QPRA 1GPWA 4W9TA 4ZMGA 4PC8A 3IVSA 1YXDA 2C0AA 2E6AA 1YXYA 1O5XA 3NL5A 4R53A 3M0ZA 1KM5A 4CNOA 2CU0A 1RQBA 2GVJA 1L2UA 4CCCA 4UFLA 1X1OA 3L21A 5FEXA 4UR8A 1I8JA 1A5CA 2NXIA 6TIMA 2ZDRA 2W79A 3F4WA 3I68A 1LRNA 3GDMA 2ZA3A 2Z0IA 1WA3A 2F7FA 4LRSA 3MHGA 2DP3A 3B04A 1RQEA 2YW3A 3HG5A 4ZQOA 3GAKA 3LXCA 5CPLA 3T40A 1KBIA 2UV8G 3CLMA 1Y0EA 2B0MA 4QJ1A 4NX5A 3INPA 4C1KA 3C56A 3A23A 3BGGA 3M6YA 3NZ1A 4K7VA 2ATSA 4RK8A 1ZALA 3L68A 4N9DA 3TNOA 1ZAJA 2Y7DA 3M5VA 3W2NA 1JULA 1KV5A 5MHBA 3DFSA 5AYZA 4RKAA 3N9SA 1PVNA 4JX4A 1ZCOA 1O95A 4BK9A 2C18A 3QPYA 4LV4A 4UTLA 1O60A 1UJPA 3B05A 1JCLA 4IXXA 1JCNA 1DQXA 3MBFA 3UWYA 2DU2A 1T96A 1OJXA 2BX7A 4FNTA 1C29A 4MJMA 4PODA 1GVQA 3L67A 2V5BA 3NPUA 3MWAA 4KWVA 1ADOA 3Q94A 5LNSA 2D73A 1GEQA 4FXRA 3DI0A 3BW3A 1F76A 3C2RA 4RCXA 4KFOA 2J6XA 1F5ZA 3OVRA 1TTJA 4D2JA 1OG0A 3I65A 1AW1A 3PB0A 1J5TA 2BTMA 3L0NA 1JRBA 1SW3A 3GNDA 2VFGA 1EPXA 3CIWA 2BXVA 3S1UA 4AWUA 1V7YA 3NAVA 3QW3A 3O07A 2Y7EA 3GR8A 1VS1A 3GNNA 4RR4A 1TPWA 4OQVA 3SGUA 4NU7A 2Y6ZA 3EWYA 3O15A 5FEPA 3HGOA 3O6YX 4NUWA 5KSWA 2DZWA 3ATZA 1RVGA 5D2YA 2VFHA 3VCRA 1EP1A 2EF9A 1UB3A 2ZQ0A 2ZRUA 3WFAA 2P1FA 3IEBA 3C2OA 2VC6A 3L0GA 3UWWA 4UTHA 1RZMA 1X6UA 1B57A 1IXPA 1H60A 5L9FA 4G1KA 2JKPA 2JKAA 4AWSA 3C2VA 4K8HA 3EX2A 2QUVA 1MEWA 2WO5A 3OVQA 1ZJIA 4DO6A 4OE7A 5DCBA 3UWVA 1HTIA 5EYWA 4GJ1A 2GJNA 4O12A 4U4MA 4A21A 3GR7A 4JX6A 4TU1A 4TX9A 4O50A 4JTKA 4UTTC 1DVJA 3TSBA 3W1QA 4MVAA 2WQPA 3P80A 2ATMA 2ZYFA 1T0OA 2O7QA 4JR5A 2E1DA 1O4UA 4EWND 1ZAHA 2EKCA 2CZDA 4PL2A 1JR1A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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