3W87 | Genus

Total Genus 104

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	104
sequence length	314
structure length	314
Chain Sequence	SMCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with SH-1-103 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
total genus	104
structure length	314
sequence length	314
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-03-12

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w87A02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w87A01

1PIIA 2H3BA 2WPBA 3V75A 1PE1A 1VCVA 1EX5A 1WXJA 4JTTA 1BWLA 1UCWA 4Z0SA 1JQVA 3B05A 3S6DA 4LVDA 3UZJA 4PA8A 4WOQA 3A5VA 2BTMA 2Y6ZA 3FOKA 4HHPA 1E51A 4RJEA 3S5OA 3NPVA 4ADSA 2RFGA 2NX9A 1SFJA 1S5VA 4MPQA 4WOZA 3EWBX 4RZ6A 3TR2A 4IQLA 4WXZA 4ZL1A 4AF0A 1QPRA 4MY1A 4WX2A 2OMAA 4BI5A 3NQ6A 3DI1A 3O1NA 1VS1A 5LHFA 5FF4A 2X16A 3N3MA 3VE9A 2QCEA 1NEYA 2VOMA 2QCHA 2ZRYA 1IXQA 4NZFA 1GTHA 1QR7A 3R8RA 2CLKA 4IXXA 4LS1A 2CLMA 1DQXA 4O1DA 4DEFA 2W79A 4ZQOA 1H1YA 3HG3A 4JYDA 4ONVA 3W22A 2VELA 3JS3A 3DFQA 1OFDA 1BEUA 3CWNA 1OYBA 4QNEA 3CPRA 2CW6A 3EEGA 4UTTC 1TIMA 2Y62A 4UFIA 1MEIA 4MJZA 4BWLC 3M43A 1K02A 1W54A 1NFBA 1T8XA 3QSTA 4EWND 1OK4A 3NQCA 2CLFA 2AGKA 3NQGA 4R34A 2NUYA 1TO3A 5D2TA 1O60A 3W9ZA 3UD6A 4KFNA 4MUZA 3W7NA 1J2WA 3IGSA 4JXCA 3UWUA 1SW3A 2AAMA 1TB3A 1BTMA 4S2BA 2BWGA 3LXAA 3N9RA 4QNWA 4JY9A 3NL3A 1ICSA 4PTNA 3LOTA 1OX6A 3R13A 1TCDA 3SI9A 3B0PA 2ZA2A 3EX2A 3W85A 3W7MA 3L2IA 2ABAA 5I3IA 4MZ1A 1K7EA 3E02A 4FNQA 4KFOA 2ZZ7A 1HO4A 5G2HA 2X1UA 3MP3A 1FCQA 3LCWA 3L68A 2PCQA 3BV4A 4UMAA 2JKEA 5F2MA 3W7PA 2OT1A 2O7QA 2WNZA 5K9CA 2CLOA 3HGJA 5HR6A 1N7KA 1VLWA 5K4XA 3KRZA 3A21A 5C54A 4K36A 2FPVA 5AC8A 3SGZA 1AW5A 1QO5A 3N19B 3NPXA 1YYAA 5CPMA 1RPXA 2Q8LA 2A1YA 2QUVA 3PUEA 1RQEA 2TYSA 1G4PA 1EUNA 1KLZA 3EX3A 5I3JA 4YCPA 4ZQMA 1GYNA 3E12A 5L6UA 3MBFA 4TX9A 2C3ZA 3NZRA 3W7LA 2J88A 3KVLA 5KZDA 1W5OA 3W72A 2J6XA 1HTIA 3CM4A 3ZWTA 4QJ1A 4C1KA 5LZLA 4JTGA 4JTSA 4OHQA 2W0UA 1IGSA 2VFEA 5CZJA 4DF2A 3SFKA 3TSDA 4OWGA 3IIXA 1V5XA 1Q3NA 1OG0A 4K8HA 4X22A 2DORA 2ZRXA 4PC8A 1W56A 2VXNA 3GNNA 1K7FA 4HKPA 4L4MA 4OBTA 5G1YA 2E09A 1I4NA 4O17A 2F84A 4QAIA 1GWJA 1H7NA 3W1MA 4RZ4A 3PB2A 4BI6A 4XBSA 1RD5A 4Y9AA 5C2XA 1QDSA 3WJZA 3C52A 4X2RA 4O14A 3E49A 3G1AA 4IGHA 5TQLA 4IMDA 4JTUA 1Z48A 5K4ZA 1QO2A 1NSJA 1N55A 2FDSA 3LI0A 4O57A 2GQ9A 3PR2A 3BLEA 3T55A 1VLIA 1W8SA 3TDFA 1F76A 1SZEA 1OK6A 2LLEA 5FF2A 4JYFA 5AHMA 5BNKA 3W7RA 3C3NA 1Q6OA 1WV2A 3NG3A 4WQ6A 1VYSX 3EXRA 3QMTA 2V2DA 1ZJIA 4N02A 3EWYA 4WZHA 1LCOA 3QPYA 3N9SA 3UWQA 3PSWA 1TPFA 3HMJG 2VFIA 1KM2A 1ZALA 3TK7A 3TAKA 1LRTA 1P1XA 2YW4A 3OVQA 3DHDA 2VENA 4NX0A 3RFAA 3VNDA 1XDLA 1KFKA 3M7WA 1C9DA 3PBWA 3VI2A 2J9XA 5AHLA 1FWRA 2NZLA 3ABQA 3P62A 4O0ZA 2YPIA 5FF7A 4DBEA 2ZTKA 4Q4KA 1KLYA 2QUUA 4BWLA 1FCBA 3LV6A 3LBCA 3LHZA 4M7SA 3R12A 1D3HA 1JUBA 2E5DA 4LVAA 2A6NA 5K7JA 2Q3OA 3L5AA 3NXFA 5AHIA 4WD0A 3W7GA 3EXTA 1X8FA 3P80A 3INPA 4O1BA 4L4LA 3VCRA 4QQ3A 3NAVA 3PB0A 3NA8A 6ALDA 3QEZA 2NLIA 5AHFA 5E0KA 3F1QA 1TYGA 1FUYA 1RR2A 4Z1AA 2AQWA 1TSIA 3TJLA 3LHVA 1VHCA 1YDOA 1A5BA 2A6LA 5LNSA 3W7OA 5I3FA 1N8FA 4N9CA 3MI3A 1H51A 1W1ZA 4EVZA 4JNMA 4ZVJA 3TE9A 3FKRA 3C2VA 4DO6A 1H7OA 2E1DA 4LTSA 4JTJA 1F6PA 6TIMA 1Z44A 3QQ0A 1W3IA 4IUOA 4NVTA 3GXPA 4W9TA 3UY7A 1K8ZA 5DY2A 3L5MA 1KTCA 4LUJA 4O50A 1EEPA 1XDMA 1YPIA 1B57A 3RU6A 3O6YX 2WV8A 5F2LA 3L65A 4AXKA 1W3TA 4JTLA 3E0IA 1UUMA 4X9SA 2JBMA 2V81A 4Z1CA 5CZ0A 4MZ8A 3GXTA 2TRSA 4MY9A 4N6FA 5TIMA 3TSMA 2C6QA 5D2WA 3SZ8A 2P10A 1W5MA 2ABBA 4OQVA 1DV7A 2R94A 2Y89A 1KFBA 3W2MA 5KZEA 3WJYA 4UFMA 5K9DA 3GKAA 1MXSA 3NZ1A 1KM6A 2DZVA 1NF7A 3ZFHA 4ADTA 3TC6A 2G96A 3EWXA 3W2UA 1PV8A 1GVSA 3HGRA 4R33A 1UB3A 3A23A 3W1NA 5I3HA 4O4VA 1T0OA 4Z1BA 3PS7A 5EBUA 1G7UA 2JKAA 3U8GA 2X1TA 1QPQA 1LRQA 1TPVA 4O52A 1TTIA 4J9JA 2E5BA 1LBLA 1FWWA 5D33A 3NOEA 4I7WA 3QM3A 4MVAA 1GTEA 4XTIA 4JTIA 3LX9A 3TU9A 4K7VA 4N4PA 3KHJA 1LYXA 3W70A 1BWKA 3W2LA 3UXDA 4FNSA 5HNRA 4N2YA 3EWUA 3I7QA 5EYWA 2ZRUA 3RMJA 1TV8A 1YDVA 3TC7A 3EX6A 4A22A 3NEVA 4BK9A 3QC3A 3GZ3A 1SW0A 2ZDRA 4AAJA 3BG3A 1BKSA 5DLCA 1O4UA 4JIQA 5CPLA 5CPOA 4N9EA 5U4NA 5EY5A 3STGA 3EX1A 2QUTA 4NNAA 1LOLA 3S5NA 2DU2A 4CCEA 3PY2A 1LTDA 3WK3A 4IMEA 1ZAIA 1OFAA 5LNVA 4K39A 1RZMA 3P60A 3TMLA 2GVGA 4ZZ9A 3KOFA 5EPDA 3TMQA 3AJXA 5T26A 1A50A 5CSRA 1JQXA 3W7EA 5U7SA 1EIXA 3C0JA 5BRBA 3P67A 3UQNA 1GZGA 1LBMA 5MHBA 1W5PA 1EP3A 1LP6A 2WNNA 4NXSA 4OGZA 1KTBA 1P0NA 3DI0A 2R14A 3M16A 4PL2A 3CWOX 3ZWSA 1YTEA 4MIMA 2HMCA 3LXBA 3E9AA 3W83A 2BX7A 2BXVA 1KBJA 3S42A 2GJLA 1JCYA 2CLIA 5I3KA 3DGRA 3T40A 1L6WA 2BSLA 2W6RA 2F7FA 1VPXA 3DAQA 1RVGA 3CQ0A 3OVPA 1FWNA 1I2QA 3HG5A 3TXZA 4NNBA 4LVFA 1YLVA 4DXVA 1Q6LA 1DQWA 4LVGA 1A5CA 3KX6A 4TR9A 2FPYA 3BLFA 4LW7A 4OT7A 1KFLA 5D05A 5H91A 3G0XA 1GG1A 4AHQA 3DENA 1MEHA 2YFOA 3W7IA 2Q3RA 5CZSA 1R46A 4GC4A 3UWZA 1D3GA 1ADOA 1A5AA 4MJMA 1KBIA 4UFLA 1H7RA 1F05A 5AYYA 1SPQA 2C0AA 1M6JA 1B9BA 3BG9A 1L6YA 4CCCA 2XN0A 1A53A 2EF9A 3EB2A 3BW2A 3GX9A 1YADA 3A5FA 4WXYA 4U4MA 5E93A 2V9DA 3LGEA 2WQPA 1WOAA 3B06A 2C15A 1SZFA 3GIYA 5D02A 4LC8A 4KFPA 4HPXA 4O54A 4EIVA 4AWTA 3BO9A 1DVJA 5K3VA 5EA9A 3FS2A 4DBDA 2PC4A 2CFFA 4WY0F 3QMRA 4ADUA 1WAUA 3W7KA 3C56A 1OYCA 3HG2A 3TV8A 2Y88A 3HPZA 4QM1A 1S5TA 2NWSA 1K8XA 3SIZA 3W84A 1XCFA 3O06A 2B7OA 1FX6A 4NJHA 2NXIA 3HQ1A 3S1WA 4OE7A 2YSWA 3JR2A 4IX0A 4O11A 3DZ1A 3M6YA 5L9FA 1AG1O 3CLMA 4Y8FA 3L0GA 4LWWA 4XUGA 1GEQA 1VYPX 3FYPA 1XFBA 3A9IA 3IVTA 2E77A 2WO5A 5C6MA 2J9YA 4NU7A 5HR7A 1VH7A 1I8JA 3MW7A 1XL9A 4BFAA 1WOBA 4FXSA 1G4SA 3WK0A 4X3ZA 2JGQA 4AHPA 3P8IA 2ZYFA 4HNUA 8TIMA 5G4EA 3CTLA 5KSWA 1ZNNA 3BGJA 1FDYA 2H8XA 3BW3A 1CW2A 1KFJA 1DL3A 5HWMA 2XFWA 4UFJA 2RDWA 3NM3A 4UXDA 2YX0A 1JCJA 2A4AA 4ORIA 1GVQA 2VC6A 1R2RA 2YCEA 1K8YA 1A5SA 3NPUA 4PFMA 4XTDA 5AHNA 2NUXA 3GDTA 1K3UA 3W2NA 4XKYA 2B7QA 5LGZA 2E6YA 1TPB1 3W3OA 3PAJA 2X30A 1IXPA 2Q8ZA 3B0VC 5DCDA 3ABSA 3W1TA 5D2VA 1VJIA 5D32A 1U83A 4M7TA 3G18A 3FLUA 3ELFA 4UCGA 3LTYA 1KM3A 1PVNA 3JRKA 3OVRA 2P1FA 2VEPA 1XBXA 3M1ZA 3NGJA 3OA3A 5C55A 3UWYA 4JDBA 1KW1A 2CZFA 1OF6A 2V5BA 5TBOA 4IPIA 1RQBA 2B7PA 1THFD 1GPWA 2VEIA 3FFSA 4AVFA 4PH6A 2E68A 1QOQA 4QITA 4N9DA 1GT8A 2C13A 3GK0A 3R2GA 3M9YA 1QPOA 2FTPA 1SQ7A 4O12A 3W1XA 3Q58A 1H61A 1KM4A 2A7RA 4I9AA 3QMSA 2CLEA 2B4GA 3G24A 1LROA 3G0SA 4UTLA 1QWGA 4I7VA 4GNJA 4GUIA 1JRCA 4HNVA 3O6CA 3BGGA 1WBJA 2YYTA 3W7CA 3MYPA 1PHWA 2ZRWA 3W1AA 4TIMA 3O8AA 3W7DA 1KM1A 3LHYA 3R5EA 2QDGA 2V0TA 1JJKA 3W71A 1AK5A 2A0NA 1G7VA 5D37A 3W7HA 3TJXA 5J5RA 4JN6A 3SY5A 3PUDA 5A5WA 2QCGA 1JRBA 2G97A 4GXMA 4AH7A 2YZRA 1TPUA 1Q6RA 4O19A 2R91A 1TPC1 4N4QA 4BI7A 4O1AA 2C16A 1GOXA 3PF3A 1EB3A 2ISWA 3GNDA 1QCWA 2YDAA 1IIHA 3GB6A 4NZJA 3N2XA 1HUVA 1JCMP 4UFHA 4UTJA 4H4IA 4LV4A 2WNQA 3I7SA 4FX8A 3TKFA 1SU5A 1JCLA 4DF0A 4IMGA 1OFOA 3O6DA 2FB3A 1L9WA 3NM1A 4O18A 3F4WA 1VCGA 4RX0A 2RKXA 2V8ZA 3I6RA 4CCDA 1ALDA 3TCEA 1CX9A 3C61A 2CZDA 3LHWA 4KWVA 5J5DA 2PRLA 3GDMA 1VYRA 2ZRVA 2NUWA 1LDCA 3CIWA 3WJSA 4EOUA 3CHVA 2TMDA 4DO4A 4ZQRA 4IX2A 1LORA 4UTTA 2A85A 3EWZA 1K7XA 1JR1A 4GUFA 3NQVA 1J4EA 4RCXA 2EAWA 4JTKA 1EPXA 1M7OA 2Y70A 3NQ8A 5BOOA 1JCNA 3C2FA 3H53A 3HPSA 2OT0A 4Y96A 1J5TA 2EHHA 2QCNA 1KA9F 1QPNA 3U2OA 4FX7A 1OX4B 5FESA 2EGZA 2DJXA 3CT7A 4M6VA 1H7PA 2PRHA 5FEWA 1OVDA 3BG5A 2JGYA 4MZYA 3KRSA 3P81A 4PL1A 1LOQA 3DU0A 3Q94A 4FNTA 5EL1A 3KVKA 3SJ3A 2GVJA 3QYQA 2Y7EA 3CEPA 2I14A 1SSDA 2DZTA 1TMHA 3LDVA 4LV9A 4NJJA 4LNYA 3MHFA 5KMYA 3KRUA 4KKXA 3LTPA 1G4TA 4FEZA 4RXFA 1LM1A 1TTJA 3I65A 3T44A 3EKLA 3M44A 3NQ7A 3TAOA 4AHOA 1P4CA 4O53A 4NUWA 4MYAA 5AC7A 1JUKA 3WK2A 5LNRA 4CLMA 3B0UX 5FEXA 4JS3A 2Z2UA 3L21A 1ZFJA 3LBMA 3L67A 4K37A 4DF1A 5F1VA 1KFCA 2UV8G 3G1YA 4M6PA 2FIQA 1HO1A 4LS2A 2WSYA 1DHPA 1O95A 3HIJA 3MO7A 2RDTA 5DY3A 1IIGA 2ZFAA 4LVBA 2V2HA 3MUXA 1P0KA 4S1FA 1OFPA 2X1SA 2A5HA 3UWWA 2XN2A 4PODA 3MI2A 2ZZ5A 3LV5A 2I1OA 4LY8A 1ZAHA 5FEPA 5K2ZA 4GRSA 4LUIA 3QSRA 1VCFA 4DELA 4LOCA 3GDLA 4FO4A 3PSVA 3SW6A 1B4KA 3PG9A 3BARA 1ICPA 3HF3A 2X2GA 3GDRA 4IWWA 4GE8A 4YCOA 2ZRZA 3LCGA 3PULA 3RNDA 2QF7A 5CG7A 1SZNA 4P2VA 4RV8A 3S1UA 1LZOA 1FCVA 5LNUA 2C18A 1I2RA 5D09A 3RLUA 1LOSA 2I9EA 4LT9A 1OABA 3A24A 3GLCA 3M5XA 4B5NA 3BPWA 1U5JA 1K03A 1I45A 3T78A 3I7RA 4A3UA 2GQAA 2NXHA 4CNNA 4A2RA 4K38A 1FXPA 1FCUA 2QCLA 3STCA 3USBA 2NV2A 5KZMA 3C4UA 1OJXA 1DORA 5FF3A 1H63A 4QISA 2H90A 1F2JA 2V2CA 3SGUA 1XUUA 1OX4A 3C6CA 5F4WA 2ATSA 1JVNA 4JTHA 3SECA 3NL6A 2WOQA 1OHLA 5BMXA 1M5WA 3OHIA 1AL8A 4E38A 3DH7A 4IMCA 1JULA 2C19A 1F5ZA 3G1DA 4AWSA 1LBFA 1MZHA 2HTMA 4ML9A 3G8RA 2A7NA 2A2IA 2J27A 7TIMA 4I7UA 2J24A 3LB0A 1OYAA 1PCWA 3D0CA 3MP4A 1TJPA 3DFSA 3QW3A 3P82A 3PG8A 2DJLA 4Z1DA 1R47A 5EMUA 3HB9A 1ZENA 2HSAA 1TPEA 4QSHA 3RF9A 5D2XA 3CIXA 2FQIA 4DPPA 2D73A 1Q45A 2A7PA 3TQKA 1WBHA 2QR6A 1G69A 1GQNA 2Z1BA 2RDUA 1ME7A 5DCEA 3THAA 2HS8A 3WFAA 3W1LA 3UZ5A 1LLZA 5F4XA 3DFNA 3HOJA 2QCCA 1EP1A 4JICA 1YXDA 4AWUA 5AB3A 2O7SA 2NWRA 1NAL1 2ZBTA 2GUUA 3CU2A 4ALDA 3G1FA 5LNWA 4RK8A 3W74A 4HN4A 4IXHA 4JGDA 5E1QA 3OBKA 5HUPA 1TPH1 2NX3A 3NYZA 4JEQA 4DPQA 4NNCA 4TO8A 5KTLA 3IIPA 1W5NA 1TQXA 4M6QA 2FPTA 2ZA1A 5FI8A 3S1XA 3LLFA 2KZHA 2YW3A 1HL2A 3HO8A 3M0ZA 2EPHA 1F73A 3GR8A 3DKLA 1L6SA 3NQAA 1H60A 4HSOA 4RKAA 3OEXA 3FYOA 3TFCA 4UUIA 4UR7A 3HBLA 1VC4A 3NQDA 5FEZA 2OJPA 4HPJA 1O5KA 3O05A 4AEOA 4GBUA 4U28A 4HIBA 3G1SA 3NQFA 3GDKA 2J9ZA 3TW6A 2C1HA 1I2PA 1ZHAA 2FLIA 1W31A 4GJ1A 4DO5A 4PEKA 2QEZA 4JYEA 3F4NA 2DZXA 3G8EA 3L9CA 3W07A 5AN7A 3QRHA 4AB4A 3DFTA 2WSQA 2TSYA 2PE4A 3KXQA 4IOTA 1AW1A 1ZCOA 1WX0A 4UTHA 1P5BA 4JTFA 5HINA 1C29A 4JD4A 2OCZA 1OFQA 1V7YA 1QMLA 4MY8A 3OG3A 3KFTA 4NT0A 3EXSA 2QAPA 2Y7DA 4GFSA 3N73A 2GJNA 4K8EA 3QZEA 3PC0A 3B4UA 4EF8A 3MP5A 2ISSA 1B3OA 5I3GA 4C1LA 5AYZA 4UIOA 1UBSA 1S3HA 3S0CA 3NQMA 4HNTA 3TQ0A 3EKZA 2DZPA 2Z0IA 3G3DA 5G5IA 5F2GA 3LCIA 1VQTA 2ZCGA 4Z08A 4NQ1A 4H3DA 3S5YA 4CQAA 2CU0A 3UWVA 3SSJA 1EUAA 3S5ZA 2V82A 3HGOA 5KINA 4CNOA 5AHEA 3BLIA 3NL5A 3PBYA 4NJGA 4ICNA 5EKYA 3UPBA 1EWEA 4IMFA 2CLHA 1CI1A 3ABRA 4Q32A 1R30A 4FNRA 4OU1A 3N2MA 1KFEA 1ML1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3W87A

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