4XUYA

Crystal structure of an endo-beta-1,4-xylanase (glycoside hydrolase family 10/gh10) enzyme from aspergillus niger
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
EASVSIDTKFKAHGKKYLGNIGDQYTLTKNSKTPAIIKADFGALTPENSMKWDATEPSRGQFSFSGSDYLVNFAQSNNKLIRGHTLVWHSQLPSWVQSITDKNTLIEVMKNHITTVMQHYKGKIYAWDVVNEIFNEDGSLRDSVFYKVIGEDYVRIAFETARAADPNAKLYINDYNLDSASYPKLTGMVSHVKKWIAAGIPIDGIGSQTHLSAGGGAGISGALNALAGAGTKEIAVTELDIAGASSTDYVEVVEACLNQPKCIGITVWGVADPDSWRSSSTPLLFDSNYNPKPAYTAIANAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus niger
publication title Crystal structure of an endo-beta-1,4-xylanase (glycoside hydrolase family 10/GH10) enzyme from Aspergillus niger
rcsb
molecule keywords Probable endo-1,4-beta-xylanase C
total genus 123
structure length 302
sequence length 302
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2015-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4xuyA00
3IJ7A 3ZT7A 5BRQA 3CZEA 3AHYA 3A4XA 3CZGA 3UR8A 2BFGA 1GOWA 5A6BD 4PTMA 2YL8A 5KZ6A 1BGGA 3W6MA 1W2VA 3BAKA 1E71M 3AHZA 1M53A 3VPLA 2PF0A 5CGTA 3MSGA 2YDQA 1E6QM 4PMYA 5HOSA 1H11A 4LYRA 4XB3A 2OWCA 3ZIZA 4TOQA 1UR2A 2A3BA 1ISXA 4WSKA 2VOTA 1E43A 4UQAA 2BY1A 1QBAA 1LLOA 4HMEA 1GPFA 4JCLA 1HP5A 3ZOAA 2V5DA 1QHZA 5BXRA 3WNOA 1R85A 3M07A 4OUEA 2BY0A 1EGZA 4W7UA 3SCQA 5DO8A 1US2A 1JZ8A 1K9FA 2ZX6A 3U5YA 4UNIA 3RCNA 5GQBA 4BZYA 4JKKA 1QHOA 1UKQA 1IT0A 3S2CA 2NT0A 3RJXA 3WFZA 3PZNA 2HVMA 4CKQA 4PUDA 1JNDA 3KZSA 3W38A 3FAXA 3GH5A 1JDCA 2WZIA 4P7RA 4AIEA 1B9ZA 4H04A 4UFHA 1CXEA 3WY1A 2X05A 3AQUA 3OZOA 4MB1A 3HJEA 4HU0A 2J74A 4JFVA 1K9EA 2XHYA 1NWUA 4WJXA 3W37A 2PWEA 3VD7A 5E6YA 4M56A 1XSJA 1UD4A 4HPHA 3TA9A 1BFNA 1BSIA 1BVNP 3EDDA 2D1ZA 3CLWA 1CPUA 1JG9A 4W89A 1KR1A 5I2UA 2WCAA 1QI4A 1EDQA 4D1IA 2AAAA 1B30A 1KCLA 3W81A 1VAHA 4IM4A 2JEPA 2YBUA 5D9NA 3AICA 3WDRA 1UWIA 3WEMA 1OM0A 4LGXA 4E2OA 4R27A 3BMVA 5IFPA 2XIIA 1HIZA 3U57A 4UFIA 1BG9A 3BAJA 1V3HA 2A3EA 3VIHA 5BWFA 2XUCA 1E6PA 3AMKA 1PPIA 3WL0A 3FY1A 4DM1A 1ZS2A 1K9DA 2CCRA 5E0CA 3CMGA 4AD5A 3E1F1 1U2YA 2VVSA 2YDRA 4UZSA 4MNJA 1C7SA 1GOIA 2DT1A 3SURA 1VFMA 3CMJA 1UA3A 1Q6DA 4OJYA 3GNRA 3MS8A 3SCUA 2C0HA 3WL1A 5I3DA 3AZTA 4PBGA 3SCTA 3ALFA 2XM2A 3QGVA 3GNPA 1G1YA 5HNNA 2VZSA 4J3WA 3OG2A 3MUIA 5ECUA 4AXNA 3MV01 1UH4A 1ZB5A 4C7FA 2BXYA 1W1TA 2Y8VA 3NYDA 4LQ1A 5KEZA 1V6WA 3LPGA 2FGLA 4TXEA 4PEEA 3IANA 3FN9A 2GVYA 4ACZA 4AWEA 2D22A 1VJSA 4W8AA 1B3XA 2ZUUA 4AZ5A 3VM5A 4J7RA 1VFUA 2BVYA 1TG7A 4U2ZA 1W9VA 4HU8A 2YKKA 2WSPA 2WK2A 4LYQA 4WKFA 4IUGA 3VUPA 3MUAA 2IXVA 3CZKA 4PN2A 2PBOA 3RM4A 2JF7A 1B90A 3MANA 3EDEA 3WQWA 4UFMA 1E5NA 1XH2A 6CGTA 4BS0A 5CLTA 3HU7A 5C8BB 4QCFA 3A6OA 2E3ZA 3CBWA 2FDMA 1EH9A 4QDMA 5A6AA 4A3HA 3MV11 4JFWA 5D9OA 4HOWA 4CUCA 3PZIA 3RDKA 1X6LA 3BSHA 1RD6A 3F5LA 1VFOA 3VOCA 3CZLA 3M7SA 3VU2A 5A95A 4D71A 3WNPA 1SR0A 1KQYA 4AD2A 1WZAA 3ZQ9A 5I5RA 3MMDA 1EQCA 2CESA 1MWOA 1VBRA 1KQZA 3EBVA 2DT0A 5FD0A 2FHFA 1BYDA 1XD0A 2WYSA 1MW1A 3K8KA 1CBGA 4HOXA 2VRJA 1YHTA 2D23A 3WD0A 1DWAM 2CXGA 4RE4A 3VIMA 1KXHA 3AHTA 3MO4A 1HKJA 2WVUA 3ARZA 1DWGM 1JZ7A 1C8QA 2UY5A 3BAWA 2GJRA 2DSWA 3VDHA 5IHRA 1J0JA 4H7VA 3CH9A 7TAAA 1UD5A 5CXPA 3PZTA 1ZJBA 1R7OA 1E6RA 3AIWA 4XUYA 1NH6A 1TFVA 5D8ZA 4W8LA 5E6ZA 5I23A 5D9PA 1MQRA 4JKMA 1KB3A 1W3LA 3EMCA 3AFBA 1C8XA 4XZWA 3EMQA 1AMYA 2Q8XA 3TTYA 4ZENA 2E8ZA 1CZ1A 1OB0A 1UQYA 1W32A 4JFUA 4AZCB 3ARSA 3I3DA 4W5ZA 3W24A 3ZR6A 3ZSSA 5EFFA 2UWFA 1H1NA 4ATLA 4HMCA 2Y2WA 4TVUA 4BCEA 3ARVA 1GHSA 2CBUA 4JZ5A 1ZU8A 1LG2A 3MKKA 4FLSA 3RIKA 4NRRA 1HN1A 1KGUA 2XSBA 3OBAA 3VD3A 3O9NA 3VILA 2WMIA 2WCSA 1E0VA 2WMJA 2J7FA 1XCWA 4MNKA 1L8NA 1OGSA 4DWSD 4NF7A 2ZWZA 2E9MA 1EDGA 3N9KA 3WF3A 3SUTA 1E4NA 5A8NA 3VIPA 4X9YA 1OBAA 1M04A 4ZXOA 3WD4A 4E8CA 1B3ZA 4DM2A 1U33A 1LWJA 2V3EA 2CPUA 3GYCA 1ECEA 1KWGA 3AJ7A 5C70A 1ZBVA 4C7DA 1JIBA 3F5JA 5BXSA 3MMWA 1UWUA 2VRKA 3W29A 1K6AA 1MFVA 3ARUA 4D6CA 1Q6EA 4PMDA 1JFXA 1QW9A 4M29A 2WVVA 4AEEA 1CTNA 2X09A 3POHA 1KGWA 1UHVA 3TTQA 3PTMA 1UH3A 5JBEA 3L4VA 3IK2A 4QCEA 4AZ6A 1I75A 4BQ5A 1EO7A 3GM8A 1JXJA 4KWUA 2VR5A 2WC4A 2E40A 3CHCA 3FW6A 4PYSA 4U5IA 3TOPA 2X8RA 4KH2A 4PMUA 3W25A 2J7EA 2XJ7A 2XG9A 2X1IA 3T2OA 1NQ6A 1VF8A 1C90A 3BSGA 3WUFA 3ZM8A 3AYSA 1AQ0A 3LPOA 4GQQA 2O92A 5CG0A 1CGUA 1E56A 2J79A 1GJWA 1HX0A 3WEZA 4P8VA 2GDUA 7A3HA 4W8BA 1QI3A 2ZUMA 1KWKA 1GVIA 2Y24A 3N12A 3D5HA 3ARQA 3ECQA 1B2YA 4W7VA 1GOOA 2VJXA 3RMEA 2C7FA 2DH3A 2OYMA 4P7NA 3OLEA 1PAMA 4R5EA 4ZFMA 1E1FA 2DEPA 2OLHA 3B9AA 3PZMA 1EXPA 1WO2A 3AXHA 2VCAA 4XX6A 1UR4A 1QNQA 3UESA 3HN3A 3WBAA 2WBKA 3BLKA 4PTVA 2GJXA 3AIQA 3NSXA 1V6XA 3APGA 1ISWA 1HXJA 3K46A 3VDBA 4MAZA 4HPGA 4WK9A 5A6SA 1UYQA 1Q6GA 2XTKA 4JAWA 3EDJA 5AYIA 3MUZ1 2CETA 2OSXA 2W5FA 1UWSA 4H8HA 2VVNA 1X6NA 3FHAA 3U7VA 2D3NA 3AS1A 1JGIA 1GQIA 2W4XA 1W9PA 1NP0A 3WUGA 5A8PA 1UZ4A 2GUYA 1DEDA 2J7CA 3OGSA 1W3JA 3VD9A 2V5CA 2GK1B 2NW0A 1GHRA 1CWYA 1EHNA 2YOCA 4Z2HA 3VIOA 5D9MA 3N18A 5DMYA 3I3EA 3BMWA 3F4VA 1ESWA 3WUEA 5DEZA 2AOSA 4J3UA 2W91A 5AYBA 2BHUA 3B8SA 3MUY1 4MTVA 1EO5A 2WPGA 3CUFA 1NOUA 4WSJA 2J8FA 3WD2A 4AZ7A 1J0KA 3QHOA 4QLLA 3VO0A 2J7GA 1WDRA 1F4HA 2ZICA 5D4YA 3OGVA 3J7HA 1UR0A 2DQXA 4PCTA 4CD4A 3AMDA 2DT2A 4MJ4A 4OKDA 2BXZA 4KRUA 4NI3A 3QOMA 5LA2A 4UTFA 3VTRA 3WF1A 1ISVA 4BQ2A 1US3A 2D0HA 1JYNA 3VKKA 1CDGA 4ML4A 1TA3A 4D1JA 3WSUA 5A8MA 4DWSB 2RGLA 1UKOA 1W3KA 2BVTA 1WZLA 5ABHA 3PN8A 2DGAA 2JFEX 3POCA 3ZO9A 1RP9A 2XVKA 4DUWA 2E8YA 3MSDA 4Z2IA 1AVAA 1ISYA 2EQDA 4QP0A 2EPNA 3VX1A 4CD8A 1BYAA 1VB9A 2WC3A 1KBBA 4EK7A 1EDTA 3SUWA 3RPMA 5BROA 2UY2A 2VZUA 1SMAA 3K1DA 1J0IA 1V0MA 4TTGA 1ZBKA 3PZGA 1E72M 4JFTA 3M6DA 5FIPA 1ITXA 1JF6A 1PIFA 4M81A 4BF7A 4D6DA 2O9TA 3ARRA 2WVSA 3BH4A 3WN6A 1E73M 1MFUA 3WMSA 2EPOA 1GW1A 3WNMA 1EOKA 1TVPA 3OB8A 3GH4A 4JIEA 4F9DA 1J9YA 3OLGA 3KE0A 4CGTA 3SCWA 3FHQA 1UWTA 1GOKA 1VEOA 2VZVA 1W91A 3MU7A 1E9LA 5A8QA 3VMNA 3T2QA 4GINA 2J7DA 4CVWA 1OD0A 4Z2KA 1H4PA 5JIPA 6TAAA 4M82A 2ZUTA 5CPSA 5ABFB 4J28A 4RL3A 1R86A 2QV4A 1VRXA 1WPCA 4J27A 3SUVA 4GI6A 4W88A 5A8OA 2WHMA 1V6VA 2VL4A 1ITCA 7CGTA 1ZBCA 2GSJA 3DHUA 2PWGA 2D20A 2E0PA 2DIJA 2WZEA 3WBEA 3CUIA 1VFFA 4LXFA 5E70A 3B9DA 2CEQA 3FXYA 4RE3A 4MNMA 4HMDA 4FLRA 1UKTA 4D6JA 1CXFA 4FF5A 3DYOA 2ZUWA 3FNDA 2YL5A 2OYLA 1GORA 1PX3A 4GI9A 4F9JA 5FL1A 2G3NA 2JF6A 1UR1A 3HMCA 3WELA 2PWFA 4GZIA 2XIBA 3WKZA 3GTNA 4NSBA 2WM0A 2W61A 4CN4A 1V08A 4UQCA 1WZKA 3TP4A 1E3ZA 5ABFA 5CSUA 4PRWA 1WZMA 3TTSA 1JNEA 3SCNA 2G41A 4AD0A 4KRTA 4CCCA 1C7TA 5LA0A 3CUJA 1JYWA 2HISA 3UG3A 5AC4A 2EXOA 3AIUA 4MDOA 3CO4A 4UQDA 1MXGA 2J78A 4GXPA 4ZXLA 1BF2A 1V6YA 5BCAA 1CYGA 3B9EA 4W93A 2CERA 1UUQA 2W67A 2J7BA 3ARTA 3K8MA 4OBRA 4GIAA 3UETA 2CYGA 5E0FA 3WENA 3T0DA 1KCKA 8A3HA 2WB5A 1IZJA 1LL4A 1XC6A 4OBSA 2EJ1A 1GOQA 4LYPA 8CGTA 1XYFA 5CPQA 3VIFA 1JZ3A 3GNOA 2J77A 5ABGA 3QHNA 1BQCA 1NOWA 4A3YA 3RJYA 2YA0A 4YPJA 1HT6A 1W9UA 1E6NA 1V6UA 4ZE5A 2WVTA 3ZR5A 1BLIA 2PB1A 4B9YA 1RP8A 1BAGA 1UQZA 2WCGA 5A2CA 2FH6A 4W85A 1BPLB 1DWHM 1QOXA 1B31A 3VIGA 1PX4A 3W27A 2J7HA 4D6IA 5CJ5A 1J0YA 3WQ4A 4GO9A 1E3XA 2DIEA 5DT5A 1HL8A 4U3AA 3AOFA 4DUVA 1CXLA 3VVGA 3WD1A 2W63A 2YA2A 1WE5A 1DTUA 3WFLA 1FHDA 1LG1A 2QMKA 1J0HA 1QNPA 4A4AA 5FOOA 5CQ1A 1DP0A 4D6GA 3OZPA 5A2BA 2WBGA 5I6SA 1K9TA 2QLYA 4AMCA 4GZJA 4TX6A 4FLOA 4PMRA 1QNOA 5A6BA 2WMGA 3VIKA 1V02E 4TVCA 3VDCA 2YIHA 1NM9A 1OCQA 3VNYA 3AISA 5FCZA 2ZXQA 2QPUA 4DWSC 2J75A 2QHAA 4KMQA 1H0GA 5C71A 4KGJA 4M24A 1VJZA 3CHFA 1QBBA 5GNZA 3PTKA 3RILA 2MANA 2VMFA 3WH5A 2VCCA 3WUBA 4E4PA 2PWHA 4KGLA 4EE9A 3PZQA 3SUSA 1OIFA 1V3JA 2YA1A 3S6TA 2YDSA 4J3TA 3K4DA 1W9XA 2EO7A 3WDIA 1KFWA 1MQPA 1NOFA 4RE2A 3VMOA 1XSKA 3W26A 3VX0A 1JAKA 3FAWA 3VNZA 2OSYA 1KGXA 5A3HA 2F61A 1LF1A 4B15A 2DPEA 2WMHA 2XVGA 2OSWA 1E6XM 1JZ6A 2GFTA 1GJUA 1UH2A 1ZJAA 1RPKA 1B3VA 1FH9A 3AIVA 4LX4A 2PC8A 3DC0A 2JALA 4YHGA 1QHPA 1CLVA 4UZUA 1J11A 2GJPA 1XRVA 1EHAA 1GOMA 2G4FA 3WMBA 3AZRA 2WHJA 1G9HA 3AIEA 1R8LA 1SFSA 2PBGA 4CVUA 2CNCA 5EB8A 2WLZA 4IPNB 3ALGA 3GBDA 3CZ8A 5A6MA 5I77A 2VO5A 1UR9A 4UFKA 5BXPA 2V3FA 1L0PA 3BCFA 4N42A 2Y5EA 4UCFA 4B3KA 2VX7A 2G8ZA 1D2KA 4AZCA 2VTFA 3CUGA 3GZAA 2G3JA 2ZWYA 5CGMA 3WF4A 2Y8KA 2EPKX 2VR4A 1JI2A 1HJXA 4X0NA 4TVDA 4GI8A 1TUXA 2VZTA 2WC7A 4QAWA 1C8YA 3AMCA 1KXQA 6A3HA 3VINA 5HPOA 2WMKA 1H2JA 3WH8A 3WNLA 1TMQA 4AW7A 1MYRA 5F7UA 4JHOA 3VIIA 1VEPA 2J47A 3DHPA 1RH9A 4DUXA 5IXEA 2XGIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3IJ7 A;  3ZT7 A;  5BRQ A;  3CZE A;  3AHY A;  3A4X A;  3CZG A;  3UR8 A;  2BFG A;  1GOW A;  5A6B D;  4PTM A;  2YL8 A;  5KZ6 A;  1BGG A;  3W6M A;  1W2V A;  3BAK A;  1E71 M;  3AHZ A;  1M53 A;  3VPL A;  2PF0 A;  5CGT A;  3MSG A;  2YDQ A;  1E6Q M;  4PMY A;  5HOS A;  1H11 A;  4LYR A;  4XB3 A;  2OWC A;  3ZIZ A;  4TOQ A;  1UR2 A;  2A3B A;  1ISX A;  4WSK A;  2VOT A;  1E43 A;  4UQA A;  2BY1 A;  1QBA A;  1LLO A;  4HME A;  1GPF A;  4JCL A;  1HP5 A;  3ZOA A;  2V5D A;  1QHZ A;  5BXR A;  3WNO A;  1R85 A;  3M07 A;  4OUE A;  2BY0 A;  1EGZ A;  4W7U A;  3SCQ A;  5DO8 A;  1US2 A;  1JZ8 A;  1K9F A;  2ZX6 A;  3U5Y A;  4UNI A;  3RCN A;  5GQB A;  4BZY A;  4JKK A;  1QHO A;  1UKQ A;  1IT0 A;  3S2C A;  2NT0 A;  3RJX A;  3WFZ A;  3PZN A;  2HVM A;  4CKQ A;  4PUD A;  1JND A;  3KZS A;  3W38 A;  3FAX A;  3GH5 A;  1JDC A;  2WZI A;  4P7R A;  4AIE A;  1B9Z A;  4H04 A;  4UFH A;  1CXE A;  3WY1 A;  2X05 A;  3AQU A;  3OZO A;  4MB1 A;  3HJE A;  4HU0 A;  2J74 A;  4JFV A;  1K9E A;  2XHY A;  1NWU A;  4WJX A;  3W37 A;  2PWE A;  3VD7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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