1G01A

Alkaline cellulase k catalytic domain
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
357
structure length
357
Chain Sequence
PAGMQAVKSPSEAGALQLVELNGQLTLAGEDGTPVQLRGMSTHGLQWFGEIVNENAFVALSNDWGSNMIRLAMYIGENGYATNPEVKDLVYEGIELAFEHDMYVIVDWHVHAPGDPRADVYSGAYDFFEEIADHYKDHPKNHYIIWELANEPSPNNNGGPGLTNDEKGWEAVKEYAEPIVEMLREKGDNMILVGNPNWSQRPDLSADNPIDAENIMYSVHFYTGSHGASHIGYPEGTPSSERSNVMANVRYALDNGVAVFATEWGTSQANGDGGPYFDEADVWLNFLNKHNISWANWSLTNKNEISGAFTPFELGRTDATDLDPGANQVWAPEELSLSGEYVRARIKGIEYTPIDRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus sp.
publication title Crystal structure of alkaline cellulase K: insight into the alkaline adaptation of an industrial enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE
total genus 126
structure length 357
sequence length 357
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2000-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1g01A00
1JL8A 4WF7A 3GXIA 3N1AA 4FLOA 2WSPA 3M07A 5A3HA 3SUSA 1Q6EA 3MU7A 3MKKA 1ZL1A 3VILA 3MMDA 3RMEA 3ARWA 1QI3A 2Y8VA 5IFTA 3L4VA 2VX6A 1HP4A 4BCEA 1KQZA 3VPLA 1KQYA 1GVIA 2WC3A 4KRUA 1SMAA 1HJXA 2CITA 1DWIM 3AHVA 4GXPA 3RIKA 5A95A 4AZHA 4UQBA 2XYLA 1W91A 2CBIA 1GQKA 1OINA 5D8ZA 2EO7A 1JI1A 5JBDA 4HA3A 3QHMA 4GQQA 3CO4A 3D3AA 3GXFA 4GI8A 1JNDA 3GH4A 3OB8A 1ITCA 2XFFA 3WL0A 1I75A 3MO4A 3ARXA 4UOZA 1EH9A 3OLEA 1BQCA 3GBEA 2BS9A 3FW6A 5ABHA 1J9YA 2PI6A 4OBRA 4HMCA 4M8UA 2E3ZA 3FN9A 3VGGA 1XHGA 2WKGA 1E0VA 4AZ5A 4PMNA 1E6RA 3PHAA 4V28A 3PZUA 5CSUA 1H11A 3NDZA 4J3XA 1DWFM 4GZJA 4UQCA 1RP8A 5M03A 3POCA 4ZENA 4U5KA 3T09A 4W7VA 1AQ0A 4ZEPA 4QCFA 2PBOA 3F5KA 1V03A 2E40A 1XCWA 3CZEA 4CU8A 3NJ3A 2JFEX 4WK9A 1C8XA 1W3HA 1QBBA 4A3YA 4MAVA 1V02E 2RGLA 2VX7A 3WNNA 1TE1A 1UD8A 2BVDA 1EQCA 1E1EA 1CXEA 5AYIA 1EO5A 2O92A 2ZICA 1UD4A 2DT0A 1ODUA 4UFHA 1W9DM 2E4TA 1WDPA 4JKMA 3PZMA 4RE2A 2XVGA 3VO0A 1L8NA 3PZQA 3BCDA 2W4XA 3ZSSA 1US3A 4HZ7A 3EMQA 4KGLA 1YHTA 2FDMA 1LG2A 1H3GA 3KZSA 3AOFA 3G6MA 4JKLA 3QGVA 1NOUA 1I1XA 1OGSA 1QI5A 4LX4A 4TVUA 3ZIZA 4XX6A 2XHYA 1TR1A 1E71M 3EDFA 2YL8A 4WKFA 3WUFA 1OD8A 4H8UA 2A3AA 2GDUA 4MDPA 3DYPA 1UQYA 2ZX7A 3WD0A 2XIBA 3NCOA 1CGWA 3BAJA 4RE4A 4S3KA 3ZR5A 1HJUA 5CQ1A 5GPRA 3GNOA 5DMYA 3WMSA 1UKOA 1MQPA 2CETA 4IPNB 5GNZA 5A2CA 1B30A 2D22A 4P8VA 4BQ4A 1OWQA 1CENA 1R7OA 1R8LA 2JEQA 5LYRA 4U3AA 1TVNA 4HPHA 3DYMA 1EA9C 1VAHA 1WZLA 2A3EA 3GDBA 3AQUA 4UFKA 2C0HA 1XYFA 4GI6A 4AD2A 2XWDA 1C3FA 3UG4A 1ECEA 5A1AA 5CLWA 5A6BA 2PB1A 3WD2A 1E6XM 4LYRA 3ZO9A 3WNPA 1XSJA 3WUEA 2WB5A 3B9EA 1MFUA 1J10A 3GH7A 3NUKA 4PMVA 4CVWA 1E6SM 1ISYA 1O7AA 5IDIA 4GIAA 2W62A 4CGTA 1NP2A 1GQJA 1E72M 1C92A 3WF2A 3WF1A 5BWFA 3AXHA 4BA0A 2EPNA 3MS8A 3TP4A 2OWWA 3KWXA 5C8BB 3U7VA 4XZBA 2WHMA 1AMYA 2DSKA 2W61A 4WKAA 4B9YA 5A2AA 2RGMA 1B3XA 3CZGA 3MUIA 2WYSA 1JZ8A 4PTXA 4PMZA 5CPSA 4UTFA 2OSYA 2BY1A 4ACZA 5BXPA 2ZX5A 4UZSA 3D5HA 5CGTA 3F5LA 1HX0A 1K6AA 2Q8XA 1WZMA 3VX0A 3T0DA 1UR2A 1R86A 4AZBA 2CBJA 2PWEA 2ZXBA 2JALA 3EMZA 2W5FA 4BF7A 2X0YA 3BH4A 1JDCA 1MXDA 3SIMA 5D4YA 1DWGM 2WPGA 1OM0A 2V5DA 3L4TA 2VZTA 5A6KA 4D6JA 1JZ6A 3EDJA 1E5NA 3AZRA 4MNLA 3CUJA 3CTTA 2V3GA 4CCCA 1HJQA 1YQ2A 2V38A 2YDSA 3AZTA 4XUYA 5HPCA 3DC0A 1HJWA 3BMVA 2XIIA 2CHNA 4UZUA 2VCBA 3EDKA 1M7XA 2E9MA 4URIA 4AMCA 2O9PA 2YL9A 5C70A 5EBAA 3VD5A 1PIGA 4JFWA 4IUGA 2B31A 4QLKA 2ZX6A 1TUXA 2GDVA 3DHUA 2VR5A 5HXMA 2PWHA 1QI2A 5CG0A 3TTSA 1UD3A 1Y7VA 3M6DA 1KGWA 2V3FA 5JIWA 4UR9A 5CSYA 2YLAA 3AMLA 3WF4A 1CTNA 1BPLB 2WLZA 1MW0A 4GO8A 1XGZA 4PUEA 4KRTA 2GVYA 4A3HA 1BGGA 1GJUA 1DWAM 2J78A 1SMDA 3UR8A 3RILA 1W9XA 4PCTA 3WFLA 4PTWA 4CD6A 3ARZA 1O6IA 4Z2KA 3PN8A 3LPFA 4AZCB 2WVUA 3AIUA 4JCMA 4M1RA 3WDJA 1VJZA 2UY3A 1XH2A 1JF6A 1JFXA 3SCRA 5CGMA 1HP5A 4WKHA 2JF6A 3F4VA 2NT1A 1XC6A 4LPCA 2F8QA 3K4AA 3ZT5A 3WD4A 3GNRA 2J74A 2FGLA 1RP9A 3M7SA 2QPUA 1H2JA 4B16A 3CUGA 2XPKA 2XM2A 3AIWA 1J0ZA 4BZYA 5M5DA 3WD1A 1NQ6A 4W87A 2DIEA 1ZBVA 1RPKA 2GUYA 2QMJA 1CXKA 1PX8A 3MANA 1HL9A 2Y8KA 5AC5A 2VNCA 2WVVB 3FHAA 2J79A 1QOXA 1DHKA 3T0BA 4PMUA 4UOQA 3AXIA 3EMCA 1L0PA 3K8LA 4AWEA 1KXTA 2WVSA 2WBKA 4UFIA 1VEMA 3AMKA 3VIHA 4P7QA 3NYDA 2PF0A 1Q6CA 2D23A 2HVMA 1KBBA 4NRRA 5I0DA 2UY5A 4HOWA 5I23A 2YOCA 3BAYA 3IANA 1NOWA 3AS0A 4OOZA 1K9EA 5FKYA 2NT0A 2EJ1A 2X2YA 7TAAA 4IISA 1OSEA 1C93A 2GJXA 3W38A 3A4XA 4X9YA 2DIJA 1E0XA 1PX4A 1QW9A 3RDKA 3I3BA 2NSXA 1ZB5A 4DWSD 4UQAA 2BHUA 3WF3A 1TVPA 3WQ4A 2ZXDA 5EMYA 2OLHA 4EK7A 1EXPA 2WBGA 5CPQA 1HT6A 3IAPA 1DEDA 4DUXA 3OZOA 4R27A 4TTUA 1EDGA 4IPLA 5D9PA 4V27A 4AIEA 4M29A 2YLLA 1AQMA 2VQTA 2G3MA 1PBGA 3BC9A 2J77A 5FD0A 1K9TA 1LF1A 2YIHA 1K9FA 1XD1A 2VZSA 2Y2WA 3U5YA 5BCAA 4JKKA 1J0YA 1QHPA 3KL0A 4D6EA 2JIEA 6TAAA 3L4ZA 4X0VA 1U2YA 1X6NA 1GUVA 3NSNA 2VCCA 1V3IA 3OZPA 2MANA 3WDQA 3ZQ9A 1UR9A 1JXKA 5IFPA 1B3ZA 2ZWYA 3WL1A 4RE3A 1FHLA 4M56A 6CGTA 1NWUA 2G41A 3WUBA 2J7BA 2BVTA 3VD7A 3WNMA 2QLYA 4U3CA 5LA2A 2CESA 1HJVA 3A47A 2F2HA 2XTKA 3PZ9A 3LPGA 3ARQA 1CLXA 3AXXA 2D20A 2C7FA 1GOWA 3KL3A 4ZXLA 1EDTA 1SFSA 1HKJA 5CPTA 2NW0A 3SUWA 2VC9A 2WWDA 2G4FA 1CNVA 3N9KA 2V3EA 2A3HA 3VIGA 1K9DA 4RL3A 2G3JA 3W26A 2OYMA 1HXJA 5FL0A 2VRQA 4W7WA 4W93A 4ATLA 3M46A 4R5EA 2GSJA 3VNYA 1GCYA 5I24A 2J7HA 1MW1A 4CCEA 3FAXA 3AJ7A 4JAWA 4D1JA 4JZ5A 1DWJM 3AMGA 1VFUA 4AZGA 1B0IA 1TA3B 1M04A 1KXQA 3W37A 3WH7A 3RM9A 4AIUA 1HJSA 3CBWA 1H0IA 1QHZA 1TZ7A 1V02A 3OGRA 1C91A 2XVKA 2OWXA 5A8NA 1HNYA 1UWIA 4S3JA 3BSHA 1HF6A 1B31A 3ZR6A 1KR1A 4TOQA 5C71A 1M03A 2ZX8A 3VIOA 3BAWA 3WNLA 1QNSA 1GOIA 1QPKA 3ECQA 3OGSA 1Q4NX 1UKPA 3WELA 3N13A 4BS0A 4PMOA 1PZ3A 2J47A 3VGHA 1OBAA 3AIQA 1EQPA 1FH7A 3AIBA 4J3WA 3RCNA 3EYPA 3WQWA 1GJWA 2GFTA 1CGUA 5A6JA 1V08A 2CYGA 3KL5A 1G94A 1E43A 1JXJA 3ZJKA 3WKZA 3THDA 2XGBA 2VX4A 2YBTA 4UFLA 1ZU8A 2J25A 3CMGA 5I6SA 2DGAA 2VVSA 4W85A 2AAAA 3POHA 3LPOA 3WEMA 3AISA 2CBUA 4QDMA 3MUZ1 4JFTA 1VFMA 3MUY1 1QI0A 5DFAA 2HISA 4D71A 4GZIA 1DP0A 1IV8A 4D6FA 5ABFA 3IJ9A 5CZKA 4PTVA 5GQBA 3ZOAA 4P7OA 3ARVA 1X1NA 1B2YA 4AD3A 2WHKA 1KFWA 3BSGA 1ISXA 1WP6A 3SCSA 2VX5A 2PBGA 3SCQA 5HPOA 1VJSA 3SUUA 3F5JA 5I79A 1CEOA 2CBVA 2CKRA 2WZIA 4MB3A 1E56A 4PMXA 1W3KA 3BAKA 1JD9A 2DH3A 3LPPA 5DT7A 4KWUA 1W1YA 3NDYA 4A4AA 3RPMA 2J75A 2WM0A 4NSBA 1GOKA 1CGXA 1BYCA 3AIVA 1JG9A 1PAMA 4UQDA 1B9ZA 2QHAA 3UEQA 4TX6A 4AEEA 3AICA 2VZOA 5F7UA 3AS1A 2XVNA 3QOKA 1IT0A 3O2LA 3W27A 4AXNA 4NF7A 1MQQA 3AIEA 1UWUA 3MUAA 1LQ0A 1ZJBA 1WZKA 4NI3A 1FP8A 3HMCA 3A6OA 4LGXA 3HJEA 3T2QA 1QNOA 4NRSA 2DH2A 1JZ3A 1CZ1A 2EBNA 3VDBA 5E6YA 3CMJA 3ALFA 4W86A 3BGAA 2CIPA 1E55A 4B9ZA 3BAXA 2BY3A 2YJQA 5I2UA 1VENA 1QBAA 2XVLA 2ZXQA 3PZOA 2E9BA 4AISA 1JYXA 3UG5A 4ZXOA 5M17A 1UWTA 3AIRA 4PEEA 1NARA 2YDRA 1WB0A 4W5UA 3SCTA 1GOQA 3RO8A 2BY2A 4AC1X 1A3HA 1QVBA 5DEZA 5BRQA 4W84A 2GK1B 4H41A 5I78A 3CUFA 5LA0A 3WF0A 4U2YA 4ATWA 2VTFA 1E9LA 5LA1A 3CZLA 3FHQA 4GKLA 3L2LA 2A3BA 4J27A 1G0CA 3VIJA 1C8QA 1PPIA 4U31A 5AC4A 3W4RA 4HTYA 3WQ6A 4KMQA 1ZBKA 5A8MA 4KGJA 3AHXA 1VF8A 1VEOA 4F66A 1UUQA 1CBGA 4Z2LA 9CGTA 3O6AA 2DQXA 3DYOA 5I77A 3AMDA 1GNXA 2FHFA 2X0HA 3VU2A 2VRKA 3VKKA 3QHNA 3A4AA 4H2CA 4GI9A 4W5ZA 4CKQA 4LYQA 4YN5A 2QPSA 4P7LA 5JBFA 3AS2A 4D6HA 5IHRA 1CWYA 4PUDA 4YHGA 1HVXA 5IHSA 2YA1A 3CHFA 5D9MA 5GNXA 1JDAA 1JI2A 4MAZA 1MYRA 1H0GA 4OJYA 3S2CA 3AS3A 1UWRA 2WWCA 2W92A 2WW5A 1EOMA 1CDGA 1NWRA 2ZWZA 1UR8A 5KZ6A 4HP5A 1HKIA 4DWSB 4PSRA 1XH1A 4B3KA 1E4IA 1GQLA 1B90A 4OKDA 4EKJA 4PN2A 1JZ5A 3CHDA 3OGVA 1W1TA 4CD8A 4WLCA 2VI0A 1JZ7A 1EHNA 1V6XA 1JIBA 3CZKA 4IM4A 2DEPA 4BQ5A 3GM8A 5FOOA 1OCQA 3OLDA 4ACZB 1UA7A 3TTYA 2C8NA 3W6MA 1HKKA 4HU0A 3CLWA 5A94A 5FIPA 2CNCA 4AZCA 1BSIA 2WHLA 2GJRA 4MPKA 1E40A 2OYLA 2WC7A 3WH9A 2PWFA 4EAMA 1VFFA 3LMYA 5EFFA 1WNOA 1WDRA 3CZJA 3PTMA 3WFZA 4E4PA 3AFBA 1JAEA 1BFNA 2AOSA 3L2MA 1S46A 4HZ6A 8CGTA 1IZKA 2VMFA 5JBEA 1CGVA 2WCGA 3VTRA 3ARPA 1UKSA 4OIFA 1FOBA 1H1NA 2YBUA 1ZJAA 2DSUA 2O9OA 3APGA 4P8WA 3VD3A 4HA1A 4MB4A 1RD6A 1EHAA 1F4AA 2VVNA 5DT5A 3U5UA 4JFSA 3VGFA 4DUVA 3VD4A 3W81A 3VD9A 3UG3A 2BXYA 1CYGA 4N42A 1UKTA 5E6ZA 2J4GA 5M3WA 3W29A 2DDXA 1M53A 3K8KA 4JFUA 1KB3A 3SCUA 2CCRA 3ZJ6A 4YPJA 2WMIA 2DSZA 1A47A 1NH6A 3EBVA 4J3UA 3T0AA 3ARSA 4HMDA 4UOJA 4XV0A 3JUGA 1B1YA 2BY0A 2JF7A 3VIPA 3AHTA 1CIUA 4AIOA 4OBSA 1VFOA 1V0MA 4JL1A 3VX1A 2ZIDA 4U2ZA 3CUIA 1KXVA 5HBFA 1CPUA 4LXFA 2WZHA 4QAWA 4F9JA 1WAWA 4L4OA 3GTNA 4GINA 5HDRA 3GYCA 1E3ZA 4KH2A 3RM4A 3FY1A 3MV11 4QLLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1JL8 A;  4WF7 A;  3GXI A;  3N1A A;  4FLO A;  2WSP A;  3M07 A;  5A3H A;  3SUS A;  1Q6E A;  3MU7 A;  3MKK A;  1ZL1 A;  3VIL A;  3MMD A;  3RME A;  3ARW A;  1QI3 A;  2Y8V A;  5IFT A;  3L4V A;  2VX6 A;  1HP4 A;  4BCE A;  1KQZ A;  3VPL A;  1KQY A;  1GVI A;  2WC3 A;  4KRU A;  1SMA A;  1HJX A;  2CIT A;  1DWI M;  3AHV A;  4GXP A;  3RIK A;  5A95 A;  4AZH A;  4UQB A;  2XYL A;  1W91 A;  2CBI A;  1GQK A;  1OIN A;  5D8Z A;  2EO7 A;  1JI1 A;  5JBD A;  4HA3 A;  3QHM A;  4GQQ A;  3CO4 A;  3D3A A;  3GXF A;  4GI8 A;  1JND A;  3GH4 A;  3OB8 A;  1ITC A;  2XFF A;  3WL0 A;  1I75 A;  3MO4 A;  3ARX A;  4UOZ A;  1EH9 A;  3OLE A;  1BQC A;  3GBE A;  2BS9 A;  3FW6 A;  5ABH A;  1J9Y A;  2PI6 A;  4OBR A;  4HMC A;  4M8U A;  2E3Z A;  3FN9 A;  3VGG A;  1XHG A;  2WKG A;  1E0V A;  4AZ5 A;  4PMN A;  1E6R A;  3PHA A;  4V28 A;  3PZU A;  5CSU A;  1H11 A;  3NDZ A;  4J3X A;  1DWF M;  4GZJ A;  4UQC A;  1RP8 A;  5M03 A;  3POC A;  4ZEN A;  4U5K A;  3T09 A;  4W7V A;  1AQ0 A;  4ZEP A;  4QCF A;  2PBO A;  3F5K A;  1V03 A;  2E40 A;  1XCW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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