1VYPX

Structure of pentaerythritol tetranitrate reductase w102f mutant and complexed with picric acid
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
EKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLFHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFYGGGAEGYTDYPSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Atomic Resolution Structures and Solution Behavior of Enzyme-Substrate Complexes of Enterobacter Cloacae Pb2 Pentaerythritol Tetranitrate Reductase: Multiple Conformational States and Implications for the Mechanism of Nitroaromatic Explosive Degradation
pubmed doi rcsb
molecule keywords PENTAERYTHRITOL TETRANITRATE REDUCTASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Enterobacter cloacae
total genus 136
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1vypX00
1UUMA 5DLCA 4BI7A 1JUBA 4O14A 3O1NA 3B06A 3UPBA 5K4XA 3L9CA 3NPXA 3SGUA 3QSRA 3B04A 2UV8G 1F74A 3C3NA 3IIVA 1OVDA 5G1TA 4DO6A 3G8EA 1FY6A 2ZRZA 5BOOA 2Y88A 3OVPA 2OT0A 3STFA 3GX9A 1H7RA 1EIXA 4ZVJA 5LNUA 3IV3A 4JN6A 3LHUA 3SIZA 3KHJA 5EPDA 5HWJA 3MI3A 2G97A 3W7KA 4LC6A 5CKSA 2VEIA 2QAPA 3M9YA 2NV2A 4FNQA 1TV5A 5KINA 3WK2A 1QAPA 1CW2A 1WA3A 3H54A 5FF4A 4YMZA 3BW3A 2RKXA 2FPYA 1VJIA 4C1KA 4AHPA 3WJSA 3DFQA 3E96A 1R30A 4PODA 1WOBA 3O8AA 2IQTA 1W0MA 1ZENA 3HBLA 4RJEA 3W7JA 1H7OA 1OFAA 3P67A 1XBYA 3EX4A 2Y89A 4ORMA 4BK9A 2P1FA 3TQVA 2QF7A 4JTLA 4I7VA 1K8ZA 3ABOA 3NO5A 3GAYA 4EF8A 1LROA 4UUIA 3PB0A 3L0NA 2ZTKA 1OFDA 1DJNA 1ICPA 3SI9A 4K8HA 1O5KA 2DZWA 1ZJIA 7TIMA 3O05A 5AHFA 1W3NA 3TSMA 2JGYA 1TTJA 3LHVA 3L21A 2E5DA 4BR1A 1UJPA 2BTMA 3TJLA 3OVQA 2VELA 1F73A 3RFAA 4GUGA 4Z1DA 4WD0A 3GXNA 5L9FA 5CSRA 3LBMA 4MY9A 3PB2A 1DOSA 3CIXA 4QAIA 1KM6A 5AHMA 4NNCA 1W5OA 4X2RA 4X22A 4R53A 4R7JA 3GK0A 1HUVA 1TRDA 3HJZA 1IXPA 1AW5A 3G1DA 3G1VA 2X16A 4NUWA 3KVMA 1SW7A 1KFBA 1VLWA 5G4EA 1XFBA 2J6XA 3ANYA 4S2CA 2CLKA 1GG0A 1IGSA 1XCFA 4MKNA 4Z1BA 5FESA 2V5BA 2RFGA 4N9CA 3LOTA 4KFPA 3GR8A 5I3JA 3W23A 4Z08A 1KFCA 2XN0A 2PRHA 1JQVA 3TV8A 4UMBA 3DH7A 2AGKA 2WSYA 3M6YA 4IGHA 4M5PA 4Y90A 2WNNA 3STCA 2CU0A 1FUYA 4OT7A 4OHQA 1CI1A 4O10A 4JYFA 3P60A 4K6AA 4N9BA 5DY2A 3NPUA 4AEOA 4WXZA 3MP5A 5D2TA 4UMCA 2VFEA 5BMXA 3KRZA 1UASA 2XN1A 1P0KA 3W1TA 1MEHA 2A2IA 1XDMA 4FNPA 1HTIA 3NEVA 2C1HA 2DP3A 5FF7A 2R91A 3S5NA 3ZFHA 3EWUA 2YX0A 2CLHA 3PR2A 5K4ZA 4FX6M 3LTYA 2A6LA 3JRKA 4MFEA 1GEQA 1BWLA 3CC1A 3TAKA 4RX0A 5CSSA 2A7NA 3DFTA 4PA8A 3P5ZA 4TU1A 4DPPA 3ABRA 1OX6A 3ATYA 5D2WA 1KA9F 3PG8A 3FYPA 3NR0A 1N8FA 1KM0A 4GC4A 1L9WA 4HPJA 1A5BA 2A7RA 5AN7A 3LRKA 2V2DA 3FEMA 3A24A 2CLEA 3O07A 2FB3A 3DGRA 3BK0A 3S9YA 2NXIA 4LV9A 3TR2A 1M6JA 1MEIA 2YZRA 3QJAA 4MYXA 3SFKA 5AYZA 1H60A 3DZ1A 4LRSA 2QR6A 3KX6A 5D02A 3NAVA 1FCQA 1KV8A 2GOUA 5E0KA 4HPXA 1TPC1 3M44A 3M0ZA 5I3FA 4O11A 4B5NA 5CPOA 5CPLA 3ZWSA 4K36A 5D03A 1TPWA 1W5NA 3UYCA 1LYXA 2WJZA 4IPJA 4DF2A 1H50A 2V9DA 4YLWA 3A23A 2Y62A 3P82A 5HUPA 5HWNA 5FI8A 4AF0B 4LS0A 3N19B 3S5OA 2GPTA 5K9CA 3PBWA 4UTJA 4CQ9A 5DCBA 4JEQA 5CZ0A 2J9XA 4M19A 1ME7A 1D3HA 1IXQA 4YCPA 5D30A 2W79A 2H6RA 3KXQA 3WJWA 5LNVA 3W76A 3UQNA 3ZWTA 4ADSA 1LDCA 3NA8A 1QO5A 1ZAJA 2ZZ4A 2EKCA 4L4MA 5FEWA 1EP1A 2BXVA 5AB3A 3CLMA 5D09A 1KM1A 1BTMA 1LBFA 4LWWA 1H62A 1B4EA 4ONVA 2J9ZA 1JJKA 4RZ4A 3BG9A 5BNKA 1TSIA 1YPIA 4WY0A 2RHGA 1W5MA 4O4VA 1EEPA 1W31A 1QPRA 4CCDA 3LXCA 4LVBA 3LTSA 2ATSA 2Q8ZA 3LLDA 1FWSA 4UFLA 4AVFA 1K7EA 1DBTA 3BG5A 3N2XA 2OZ0A 1IIHA 4UFJA 2OCZA 4O19A 3MP4A 3NQCA 1OX4A 3S1WA 1GJPA 3LHTA 3MJYA 1AW1A 4O28A 1JVNA 4CNOA 1FWWA 3RLUA 3LCWA 1YXCA 3BARA 3A21A 5TIMA 1L2UA 1S5VA 3LX9A 4Z1CA 3TDFA 2ABBA 3S1UA 3CIWA 1RQEA 3SZ8A 4ZQOA 3GR7A 3BW2A 3R8RA 2WV8A 4QNEA 2WOQA 1C8VA 5C2XA 1F7BA 3GKAA 1GVOA 1TPDA 4P2VA 4UTTC 2VFHA 3NXFA 1ZY9A 3P62A 2NLIA 2YYTA 4BI6A 4O52A 4PC8A 4JTFA 2BSLA 4GWEA 3TQKA 2ZA3A 2F84A 1SUXA 2CLOA 1FWTA 3TE9A 3BV4A 1H1YA 1Z44A 2ISVA 3IEBA 4YL2A 5HQEA 1G7VA 4IMDA 1G6CA 4NJKA 5D2VA 4FXRA 4A22A 3WK1A 2GVGA 3C8FA 1OX5A 4IOTA 3QRHA 2CFFA 3SSJA 3SGZA 1GOXA 1THFD 4ZL1A 3W2LA 3QW4B 4ICNA 1H7XA 3M47A 4BI5A 1EPXA 1Q6QA 3VFLA 3EKZA 3W7EA 1SSGA 1ME8A 3R2GA 4ZQMA 2Y6ZA 4LUIA 3C2RA 3L0KA 4QNWA 3D0CA 1TTPA 2J27A 2Y85A 3LTPA 2E77A 1DQXA 1SO5A 4EF9A 3TU9A 4EIVA 4OE7A 3W72A 1FBAA 5HMSA 4ZQPA 3FJLA 1EX5A 3CHVA 3L5LA 3NM3A 4C1LA 1WQ5A 2EHHA 1VYRA 3TXVA 4HNUA 4EOUA 1OFEA 1YADA 4HSOA 2ZQ0A 4OQVA 3LERA 1GVFA 4XKYA 4FNRA 3WJZA 2OT1A 2FPVA 3W7NA 1A5SA 4LW7A 3W1NA 2V5LA 5AHEA 2ABAA 5HNRA 4RV8A 2QEZA 4HHPA 2CWNA 1LORA 3IRDA 3W2NA 2NXGA 5F4WA 2YPIA 3LHWA 1ZCOA 1ZALA 1OK6A 3LB0A 1O95A 4TMBA 3C61A 5F4XA 4ZQNA 1TMHA 2C16A 2NUXA 4HKPA 1OFRA 4O1AA 4QITA 1LM1A 5LNSA 4WQ6A 2EF9A 2TSYA 4LU0A 1VHCA 1G4PA 3DU0A 2DZUA 3W7LA 4RCXA 4JTUA 4MIMA 5EL1A 3W7RA 3O15A 4Y9AA 3NQ6A 5KZDA 3W7QA 5DY3A 2CZEA 3W85A 1NVMA 4UTWA 1TV8A 4JR5A 5T26A 3W2JA 1XUUA 4QQ3A 4MLRA 4O8RA 2ZBTA 3LGEA 3CT7A 4NX5A 1EUAA 4UNLA 4UFMA 4X9SA 1E51A 2QCHA 2X1SA 4RXFA 4LT9A 1I8JA 1ADOA 1W8SA 1Q45A 1VC4A 3HGRA 4Q33A 4BWLC 1EWDA 2W6RA 2VKZG 4JTIA 1I2OA 3THQA 4UCGA 1DV7A 1SO3A 2Y7FA 1TQXA 3NPWA 3C56A 3PUDA 3EWWA 3TAOA 3UWVA 1R46A 4A29A 3HG4A 5KTLA 3S6DA 5F2IA 3DHDA 1RD5A 5BMWA 4XUGA 1VHNA 1OF6A 5D32A 3P7YA 4NXSA 1LBLA 3QPZA 2WNZA 4XWUA 1FDZA 2PURA 4JS3A 3MW7A 4NZJA 5G2HA 1OG0A 4M7SA 1GT8A 2PE4A 3KOFA 3SY5A 5LHEA 3IVUA 2B7PA 3W1XA 2YFNA 1WDWA 4TMCA 4UTKA 4IMCA 3O6CA 5D38A 1GVSA 1OYAA 4S1FA 3T4CA 1TJRA 1GVQA 4Y6GA 2NV1A 1OFBA 2VEMA 2BZNA 3KRUA 3I7RA 4I7UA 3DENA 4UTWC 3UWZA 1MO0A 2QUUA 2TMDA 3W73A 2ZDRA 2Y63A 3PBYA 1LZOA 2NX1A 3W2KA 1HO1A 3DBPA 4W9TA 2OJPA 1YLVA 2FPTA 1LOSA 3EEGA 1ME9A 1DVJA 3TW7A 3C2VA 3PULA 3P61A 3NOEA 4NU7A 3FYOA 1OFOA 1EUNA 3BLIA 4LNYA 2QDGA 1TQJA 3BVJA 1PCKA 4PL1A 5U4NA 4UXDA 4KFNA 1W1ZA 4YCOA 1B4KA 1VCVA 4JD4A 1A5AA 2ZZ1A 1ZAHA 5F4SA 3B4UA 2NX3A 3M5YA 1KTNA 5TBOA 3DFNA 3GYEA 1UUOA 5J5DA 2G5WA 3EXSA 1O5XA 3M5XA 1YDNA 3T78A 4JNMA 1Z41A 4O12A 1T96A 3TUUA 4CQAA 4IXXA 4FIRA 1FWRA 1XDLA 2Q3OA 5G2WA 2YR1A 3QF0A 5BRBA 5I3HA 2WQPA 4JTGA 5DXYA 4JDYA 5K3VA 2QCCA 4FXSA 5LZLA 2Y61A 4A2SA 3FLUA 2YDAA 3I68A 4RZ6A 1GTHA 5FEPA 1IIGA 3DI1A 3H55A 3LCGA 4LUJA 3GB6A 4RR4A 1ZAIA 3LLFA 4JTSA 1KTBA 5CZSA 1QOQA 3WJYA 4QM1A 3ZR4A 3L68A 4NNBA 2QCNA 5KSWA 2VEKA 4XBKA 3E0IA 1B57A 5K9XA 3IGUA 3BG3A 4MJMA 2H90A 1XL9A 1K7XA 3HG5A 3GDLA 2VENA 3GIYA 4N02A 4UFHA 1BEUA 4MVAA 4KFOA 5CGQA 5DCEA 3WJXA 2VOMA 4O53A 3QC3A 5DCDA 4M6QA 1LCOA 4FIQA 1OJXA 4O1DA 1Q6LA 3STGA 4GRSA 1TPEA 3GLCA 4GXMA 5KZMA 1FX6A 1JRBA 2C0AA 4GBUA 3A22A 3W7MA 4AB4A 3M7WA 3UZJA 5D37A 3A5VA 4GUHA 3OA3A 1KFLA 3B05A 2VEPA 1OYCA 3G1YA 4QIUA 5D05A 1JULA 2C6QA 5D2YA 3R12A 1I45A 4PTNA 4UTLA 1X7FA 3S5YA 4FNUA 1HO4A 3LV6A 4QSHA 2H8XA 5FF2A 3G22A 2QDHA 1D9EA 2RH9A 4XZ9A 3EB2A 3KVJA 4ZQRA 1QOPA 1WX0A 3TCEA 2NXHA 1WXJA 1KFJA 5HJLA 3NQ2A 3M41A 4O57A 1VYSX 3LXBA 2I1OA 2V30A 1K03A 2A1YA 2ZZ2A 4H3DA 3G0SA 3O6DA 2DZXA 2V82A 4LS1A 5L6UA 2A7PA 2RDWA 4XQ6A 3KVLA 1I4NA 1ZHAA 2ZZ5A 3MI6A 1DJQA 3W7IA 1KV5A 1LRQA 1YXDA 1R2SA 2B7NA 3ATZA 3GZ3A 3YPIA 5HULA 1JCYA 3USBA 4JYDA 3N73A 2JK2A 1DQWA 1MXSA 2ZRYA 1QPOA 2QCFA 2C3ZA 1AW2A 2X2GA 5H91A 1W3IA 2CZDA 4HN4A 3L5AA 4J9JA 3UWWA 3P84A 1WYIA 2A5HA 2ISSA 3LI1A 1G4EA 4YWIA 5CPNA 1V5XA 3F03K 5G1YA 2ZA2A 2X1RA 4UTUA 1K7FA 2GQ8A 2ATMA 1MSSA 1TPVA 4FX7A 3VE7A 3BO9A 3V1PA 1Z42A 3IVTA 3L0GA 1AL8A 3G0XA 3QMRA 3LI0A 3RNDA 3QYQA 1EB3A 2Z2UA 3AO0A 1OK4A 2V81A 4DPQA 3W22A 1H61A 4L4LA 2YYUA 3R89A 2Y70A 4N6FA 2HS8A 3NQEA 5K2ZA 1VZWA 3INPA 4MZ1A 4OGZA 3UXAA 3GNDA 1OHLA 1KM4A 4K37A 5I3IA 3HPZA 4UTTA 1Q6OA 4WXYA 3LHYA 1AL7A 3QMTA 4MZ8A 3KVKA 4MUZA 4PH6A 3GNNA 4AF0A 2E6FA 4JIQA 5H2ZA 6TIMA 3GVGA 1DL3A 3NL3A 4MZYA 1VH7A 4NVTA 3OIXA 5SWUA 3CTLA 2FQIA 1TTQA 3FA5A 5EY5A 3W88A 4O0ZA 5K7JA 3H53A 1TYGA 3W07A 5CG7A 1F6PA 3EX2A 4RKAA 4ORIA 4HSNA 3PBVA 4GUFA 2A4AA 5EA9A 1HG3A 3EX6A 2E68A 1SQ7A 1VPXA 3MMTA 3W2UA 2ZRWA 5DBTA 4ALDA 1UCWA 4DBDA 3PSVA 2LLEA 1K02A 3A5FA 2Z6JA 1Y0EA 4I9AA 3L66A 3L65A 4E2BA 2JKEA 5AYYA 2DORA 3W2MA 4NNAA 3N9SA 5A5WA 1RQBA 2G95A 1I2PA 4NZFA 2R14A 3E12A 1SW3A 2BX7A 5DN1A 5FF0A 1QPNA 3NQMA 2I14A 2QCDB 2C13A 1F76A 1W37A 3HB9A 1WBHA 2QCGA 2FB2A 2P0OA 1QPQA 3IIXA 1N55A 2VXNA 4MPQA 2DZVA 3G0UA 3HGOA 1KFKA 1M7OA 2B7OA 4LC8A 5EMUA 5IM51 4WJEA 4YXGA 1QDSA 3WK3A 1KBJA 1VQTA 3O06A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1NJJ A;  4H1Z A;  1JUB A;  3UPB A;  3O1N A;  1EX1 A;  2X2Y A;  4DBS A;  1P0D A;  5K4X A;  3L9C A;  4HZ7 A;  1J0J A;  4AEF A;  3AZS A;  1UQY A;  2C79 A;  4GYJ A;  3BAI A;  2BS9 A;  3II1 A;  4PBE A;  1WP6 A;  1MUC A;  1OVD A;  1UKT A;  1FY6 A;  4Q8T A;  1S2W A;  2Y88 A;  2OT0 A;  3WG6 A;  1PO9 A;  3STF A;  3GX9 A;  3VX0 A;  4S3E A;  3IV3 A;  4JN6 A;  4D6E A;  5EPD A;  3MI3 A;  1KKR A;  1Q4W A;  3W7K A;  4LC6 A;  2VEI A;  3GH5 A;  3WK2 A;  3SFW A;  1CW2 A;  1WA3 A;  1MMF A;  1GKR A;  3ZVI A;  2FPY A;  3S3G A;  3E96 A;  4C6K A;  4POD A;  4EP8 C;  1WOB A;  3O8A A;  3OU8 A;  1W0M A;  4E4P A;  3HBL A;  2PD9 A;  2Y89 A;  2PMQ A;  1W1V A;  1XIF A;  1FHU A;  2VVN A;  2WHJ A;  4BK9 A;  3SUR A;  2QF7 A;  4JTL A;  4M8U A;  2XFY A;  3ABO A;  2EJ1 A;  1HF6 A;  4IMA A;  1MFV A;  4TTU A;  1XHG A;  2PDY A;  1KBL A;  1E9Z B;  4WKH A;  1DJN A;  1J0Y A;  1ICP A;  2WW5 A;  4K8H A;  2W92 A;  3ZMR A;  5AHF A;  3TSM A;  4F0L A;  3ME3 A;  5MKG A;  2OEJ A;  2ZUS A;  4BR1 A;  4ZTX A;  1XRT A;  4HOX A;  3TJL A;  1V6Y A; 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