4RX0A

Crystal structure of plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenase bound with inhibitor dsm265
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
376
structure length
367
Chain Sequence
YNPEFFLYDIFLKFCLKYIDGEICHDLFLLLGKYNILPYDTSNDSIYACTNIKHLDFINPFGVAAGFDKNGVCIDSILKLGFSFIEIGTITPRGQTGNAKPRIFRDVESRSIINSCGFNNMGCDKVTENLILFRKRQEEDKLLSKHIVGVSIGKNKDTVNIVDDLKYCINKIGRYADYIAINVSSPEAGKLKNIILSVKEEIDNLEKNNIMNDEFLWFNTTKKKPLVFVKLAPDLNQEQKKEIADVLLETNIDGMIISNTTTQINDIKSFENKKGGVSGAKLKDISTKFICEMYNYTNKQIPIIASGGIFSGLDALEKIEAGASVCQLYSCLVFNGMKSAVQIKRELNHLLYQRGYYNLKEAIGRKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Plasmodium falciparum
publication title A long-duration dihydroorotate dehydrogenase inhibitor (DSM265) for prevention and treatment of malaria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
total genus 132
structure length 367
sequence length 376
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2014-12-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4rx0A00
5AOUA 4AVFA 1KBIA 3L5AA 2R91A 2YW3A 3PB0A 2C13A 4O18A 1CW2A 2DORA 3IIPA 3NM3A 4E2DA 3HG2A 3LCGA 2BLEA 2GVGA 3QMRA 2O7SA 4M19A 1GPWA 3FJ6A 2ZRVA 3HOJA 3EWBX 3LHUA 2FB3A 3CWOX 1TYGA 3M5ZA 1GT8A 4U28A 4OGZA 2OJPA 1R2TA 3P82A 1EPXA 3KVJA 1KFCA 1M5WA 2CLEA 2OZ0A 3M5XA 4LV4A 3FFSA 2XN2A 3E9AA 4GXMA 5D05A 3W7QA 3SZ8A 3ZR4A 2V9DA 3VE7A 5BW6A 3UZJA 1OF8A 2Q8LA 4OV4A 3GYEA 3DI0A 1YTDA 4IMDA 1Q6RA 4E38A 3H55A 5BNKA 3GKFA 3QH2A 2DP3A 2TMDA 4ORIA 4FHAA 3U2OA 1SZGA 4NVTA 5CZTA 4TIMA 2C3ZA 4LY8A 4N9DA 1ZAIA 4B5NA 3QZEA 1WA3A 2VFHA 3NPVA 1LZOA 4R53A 3IVTA 3LHWA 2ZRZA 4UNKA 4DO6A 5I3KA 4FO4A 4HSNA 5K4XA 2AGKA 5G1TA 3NL6A 1SQ7A 4NZFA 1JUBA 4QIUA 1OFDA 4RZ5A 4OWGA 5HWJA 2NV2A 2WPBA 3RLVA 1VYRA 3W7OA 3Q2DA 1JULA 1VZWA 3TXVA 1OVDA 4O52A 2ZRXA 1MZHA 3QQ1A 2E5CA 3LBMA 1OYAA 1TPUA 4UC5A 4M6VA 3K30A 3H53A 3HGJA 2A85A 3W1UA 4I7UA 1YXDA 5AYXA 1TREA 4CCEA 3NNTA 1K02A 4RJEA 1YADA 2CLLA 3PBWA 3NQDA 5EYWA 4R7JA 3KRSA 4HNNA 3UWWA 3W72A 2YFOA 1XI3A 3NG3A 3KAOA 1JUEA 3NQ6A 4S1FA 3A5VA 5HUOA 1EP2A 4IGHA 2FFCA 2QCHA 3NDOA 4LNYA 4RCXA 5F4XA 4GUGA 1ML1A 1MEHA 3L66A 4UFJA 4CNNA 2HS8A 1G4TA 2ATMA 2QAFA 3FS2A 1MEIA 2QCFA 2WSQA 4TO8A 4O10A 3CM4A 1T0OA 4PFMA 1FCUA 3LI1A 1ONRA 1IXQA 5AC8A 3W73A 3P81A 1SSGA 1W5NA 4FIRA 4X2RA 2XN1A 2DZPA 1KTCA 1SO3A 5G4WA 3N2XA 1W0MA 4BWLC 2QCNA 4WJEA 3M5YA 5LNUA 1AK5A 2Y70A 4UR7A 4UCGA 1JQVA 3I7QA 3BLEA 4QNWA 3G1FA 3LTPA 2PRLA 3UQNA 1SW7A 2E68A 1OFQA 2B7PA 4LRTA 3NO5A 5CPOA 3ABSA 2ZA1A 4MYAA 4DEFA 2OT1A 4JYDA 1OHLA 4IOTA 3DBPA 4UTTC 3GIYA 4L4LA 1OX4A 2ZBTA 3G1SA 1EX5A 3BG3A 3TR2A 3CPRA 1TMHA 4IJBA 2QCEA 2D73A 2X1UA 4JX5A 4XZ9A 3LERA 5K9CA 1GVOA 1H63A 3W1PA 1WDWA 3MWAA 1H7PA 1TPB1 4QQ3A 4DBDA 3TE9A 3VE9A 3QF0A 5T26A 1QWGA 4YCPA 2YFNA 3O15A 4JEQA 4K36A 1PHWA 3W7GA 3YPIA 1KFKA 1OFEA 2V8ZA 1X7FA 1TV8A 3DU0A 3G24A 3EX1A 1H61A 3OIXA 2Y88A 5LNVA 2RKXA 3NQ2A 4XBSA 3KOFA 3N14A 1AW2A 1M6JA 4OE7A 1Q3NA 1PE1A 1ME8A 2F7FA 4XTDA 3THAA 1KTNA 4O53A 3W22A 1QOPA 1R47A 4QISA 1A53A 3P67A 4ZL1A 2GQ9A 3TQKA 1KM4A 1W3NA 2PCQA 3L0KA 4JTGA 4IXHA 1HO4A 4NJGA 4MJMA 3W85A 3LXAA 4Q32A 4HPJA 5G2IA 4LOCA 3TJLA 2ZRWA 4AWUA 1Q6OA 4DPQA 4NJIA 3WFAA 2ZA3A 1XBVA 4AHOA 1AMKA 1B4KA 3NQMA 3IV3A 2ZTJA 4WY0F 4Y96A 4JX6A 2JBMA 3GDLA 1NVMA 1LORA 5LHFA 2P0OA 4FIQA 1QPRA 3AO0A 1F74A 2QJHA 2QUVA 4XKYB 3DKJA 1LM1A 3DFQA 4UUIA 2QJGA 3QEZA 1XBZA 4O0ZA 2YSWA 1EEPA 1M7PA 3A21A 2W0UA 4LVAA 1TTIA 3G18A 1FY6A 3GDMA 5HQEA 1S5VA 3WK0A 4LS1A 4MZ1A 4K37A 1N55A 3W9ZA 3O6CA 4O15A 3FLUA 4Q4KA 4UTIA 2V2DA 2Z6JA 2B7QA 4RKAA 3LRLA 4AEOA 1JCLA 5D2TA 5CPMA 4GUJA 1IXOA 2B7NA 3HPZA 4HN4A 1PIIA 4LVGA 4JYEA 3RF9A 3TA6A 3CIXA 4OHQA 2WNNA 1CX9A 3W1AA 4GJ1A 1G7UA 3S1WA 2TYSA 1YTKA 3QM3A 2OMAA 1TQXA 3NZ1A 1SZFA 1KBJA 2QCGA 3DZ1A 3UNDA 5D2YA 1LBFA 3CT7A 5G2WA 1VCGA 3HPXA 3O8AA 3C8FA 4JTUA 4M5PA 4MFEA 3W2UA 4DO5A 5FF2A 2YW4A 4RR4A 3L68A 2E6AA 1LRTA 3GAYA 2FDSA 3IGSA 1GVRA 1DHPA 3W7DA 5HWMA 2YPIA 4NX5A 3DAQA 3O05A 1NSJA 1QPOA 1DL3A 3KRUA 4YCOA 2ZZ2A 1ZHAA 3SW6A 4JDBA 5HULA 5KSWA 3Q94A 1RVGA 1BEUA 1QOQA 3DXIA 4IPIA 2H8ZA 3LCXA 3M5VA 4HT3A 4JTFA 2CLMA 4MY8A 5L9FA 3QPYA 1F05A 3GXTA 2CLHA 1Q6LA 3E49A 2Z2UA 1W8SA 3W1RA 1R2RA 2Y63A 1LLWA 1L6YA 4XTIA 3S0CA 5I3FA 3RFAA 3M43A 4RXFA 4WOQA 1OK6A 1SO4A 2YYUA 3W7NA 5DCBA 5HR7A 3C2RA 1H1YA 3BPWA 2E1DA 2BSLA 3W7IA 3A22A 1LCOA 4ZMGA 1TRDA 5EPDA 3L67A 3UPWA 1FCVA 1D9EA 5C5YA 2CU0A 4O4VA 2X1TA 4GNJA 2DZTA 3P74A 5G5IA 2DU2A 3EWZA 5AC6A 1GG1A 1F6PA 1LOQA 3F03K 4LW7A 1XL9A 3T78A 4UXDA 3NXFA 1H7OA 1UASA 5CZ0A 5F4SA 1SW3A 2Y7FA 1X6UA 4PL1A 3M47A 3LOTA 2JGYA 8TIMA 1G69A 2A2IA 3E0IA 3W7HA 3HO8A 3N9RA 3GAKA 4CQ9A 5G2HA 1UUOA 2ZZ7A 4KKXA 4IMGA 1I2OA 4IMFA 3H54A 1Z42A 4FNTA 1Q45A 2CLFA 5AHLA 5L6UA 4CLMA 4O1BA 3TW6A 1HFBA 3ANYA 2DJLA 1VCFA 4QJ1A 4DBEA 1OF6A 4TX9A 3C52A 4QITA 3IIOA 3G0XA 1FWRA 4GUIA 2FQIA 4I7WA 4C1KA 3L0NA 2X1SA 4A2SA 1VGAA 1ZENA 3G3MA 2DZSA 3G1AA 4WY0A 3LLFA 3TU9A 1VR6A 3W84A 3A23A 1ALDA 1S5WA 5LSMA 5IBXA 3I65A 3GKAA 5H91A 5AHNA 5LNWA 4FF7A 4PL2A 2LLEA 1K3UA 3B8DA 2ZFAA 4MLRA 3UYCA 1UBSA 1SUXA 1OABA 3GVGA 1JRCA 3CIWA 4OBTA 4BF9A 4RX0A 3R13A 4MVAA 4N02A 3NQFA 5SWUA 3CQ0A 1L9WA 4LV9A 4RZ6A 1FBAA 1AG1O 4N4QA 3UXAA 3RNDA 3QSRA 1RPXA 4N9EA 2ZRYA 3CB8A 4ZQMA 4MYXA 1WQ5A 3O07A 1JCXA 4H6KA 3NYZA 5CZSA 4JDYA 1TTQA 3FKKA 3STFA 3KFTA 2G96A 4UMCA 3EKLA 4LC6A 3W2JA 3B0UX 1VC4A 2B0MA 4Y9AA 1IIGA 2Z0IA 3C2FA 1XM3A 2I14A 2VXNA 5K2ZA 1XKYA 4MY9A 3NPXA 4X3ZA 4NNCA 4IMEA 5AN7A 4ALDA 5FEPA 1G4EA 2VC6A 4JD4A 5DN1A 1OX5A 4IXXA 3MI2A 1X1OA 2P1FA 5D38A 3W23A 3CEPA 3KVKA 4UNLA 3T7VA 1HTIA 3EWWA 3M9YA 2J9ZA 4IWWA 4UTWA 1IIHA 3B06A 4R34A 3CWNA 2VFDA 1NFBA 1NF7A 3QMTA 3KHJA 4AF0B 3B03A 4HHPA 4QAIA 1U83A 3TMLA 2HS6A 4P2VA 1FQ0A 4U4MA 5D30A 5D32A 4NQ1A 3DENA 4IX2A 4UTUA 4LT9A 1TPWA 4Y6GA 1OFBA 1RQHA 1LYXA 2WO5A 1JQXA 1XDLA 4O16A 4WQ6A 3P62A 3G0SA 1GTHA 1OFRA 4CCDA 1GQNA 2FPVA 2H3BA 2ZA2A 4LWWA 2A7RA 4ORMA 2V81A 1G67A 4XKYA 3ZFHA 5DCEA 5HR6A 3PUDA 4RLIA 1ZFJA 2VEPA 1AW1A 2E5DA 5FF7A 2WJZA 4M7TA 1FCQA 3TSDA 3ABOA 3NQEA 4XUGA 1KM2A 3HGRA 4FB7A 2Z1BA 2OT0A 4MLJA 1F5ZA 3W1QA 2ALDA 1TSIA 3PUEA 5HWNA 2GQAA 4CQ8A 1TPFA 3DKLA 5TBOA 1GYLA 3UWUA 1F2JA 5AC7A 3DH7A 3FYPA 1FWWA 3PVFA 2JGQA 4MJZA 1YPFA 1W31A 1TPVA 1TTJA 4PEKA 2FB2A 4RV8A 2QCMA 2QCDB 2FTPA 3BO9A 3EX2A 3TXZA 2VELA 3GZ3A 1LOSA 1KM1A 1MO0A 4A29A 2GVJA 1IGSA 2G97A 4K8HA 3SI9A 3PWAA 2BTMA 4O13A 1TPEA 2O7QA 5H2ZA 3DFPA 5HNRA 3QFEA 5D37A 3TFXA 4OQVA 3BW4A 1PL9A 5K9DA 3DFTA 3PSVA 3PY2A 3N73A 3NR0A 1OK4A 1BTMA 1PHQA 4ML9A 5BRBA 1IF2A 1RQBA 2FPTA 3DHFA 1YYAA 2C16A 1A5BA 3HGSA 3GDRA 3SIZA 2Y61A 1KM3A 2TSYA 1TJRA 2FIQA 2GJNA 4R33A 5K4ZA 1KFJA 3W7RA 3EB2A 1C29A 5EMUA 5CZJA 3TFCA 1E51A 1LROA 3A9IA 5D2VA 4KWWA 4K39A 3W74A 5D2WA 3LRKA 3OBKA 1DKWA 3LCHA 3KX6A 3FYOA 5EA9A 1PVNA 3G8EA 2V5BA 4ZZ9A 3EX6A 1FWTA 1K03A 1XBXA 3B05A 3SGZA 3G1YA 2X2GA 2CLOA 1YPIA 4A21A 1H5YA 2R8WA 2VEIA 1VS1A 3PR2A 5F1UA 4N6FA 3STGA 2EGZA 4HKPA 2ZZ6A 3BV4A 4GWEA 5DCDA 1KM0A 3IGUA 3N19B 3LV5A 2QR6A 3UPBA 3UY7A 3V1PA 2GJLA 4Z0SA 1OJXA 3OVQA 1SPQA 1TPDA 2Y7DA 2CLIA 2RDUA 4LS0A 3W7LA 3TUUA 4ZQNA 3TQVA 1J5TA 4UIOA 3S9YA 1DJNA 1N7KA 3ZS4A 4I7VA 1T8XA 2CZEA 4UFIA 3INPA 1G7VA 4WX2A 2J9XA 4BWLA 5C54A 4DXVA 3ZWSA 3SSJA 1O5XA 1YTEA 5D09A 1M7OA 3QPZA 4UTHA 1RV8A 1C9DA 1FDJA 4AWSA 4JTIA 4IQLA 1EUNA 5FI8A 1EUAA 1XDMA 3PBUA 2FJKA 1SFLA 3MP5A 3HG4A 5DY2A 4LTSA 3M7WA 1H7WA 3EWYA 2PRMA 2EPHA 5C2XA 4EF9A 1HL2A 2VFFA 1TV7A 4BI7A 3MO7A 4UTTA 4FX8A 3HBLA 3W83A 1GEQA 4WUIA 3NAVA 3EXTA 3W70A 2A6NA 1NF0A 4O12A 2Q8ZA 1P1XA 1I4NA 3LTYA 3G1XA 3NQ8A 3LI0A 4DF0A 1KV8A 1TPC1 3HG5A 3FKRA 2A7PA 5F2GA 1G6CA 2VEMA 5G4EA 3WJSA 3KXQA 2DZVA 4AMAA 2ZZ1A 3B04A 3HB9A 3RU6A 2DZXA 4LRSA 3HPSA 2NX1A 1B9BA 1GVQA 4O8RA 1OYBA 3LHZA 1TIMA 3V75A 3P5YA 1SSDA 3O16A 3O6YX 1WX0A 3P61A 4UFHA 2NUYA 1TTPA 4EF8A 1LLZA 2OX1A 3W7MA 3BW2A 1LBMA 4M6QA 4P61A 3P7YA 3OHIA 3EX3A 1KFEA 3QYQA 2ABBA 3NPUA 4UTMA 4BR1A 2EAWA 1JVNA 1H7RA 3USBA 4MZ8A 1I8JA 3ATZA 1JR1A 3W75A 2AAMA 2PE4A 1JJKA 1QFEA 4PH6A 4WXZA 5E1QA 1L6WA 2YR1A 5I3HA 3MYPA 1SFJA 3T55A 1YXYA 4JIQA 4DELA 4ADTA 5LGXA 3PUOA 3PULA 1C8VA 2HTMA 4UMBA 2HMCA 3QC3A 4JTTA 3B0VC 4LS2A 4W9TA 4FNUA 2VOMA 3R5EA 4PC8A 3W7EA 4JTSA 3FIGA 4O1DA 3P8JA 1BWKA 1PCKA 1XCFA 1MEWA 2J88A 2CZFA 3MBDA 4UFLA 1TPH1 1JUKA 4NUWA 1BKSA 2XFWA 4ICNA 3S1VA 5CPNA 1MSSA 1XUUA 2YX0A 5AHEA 2CZ5A 3MP3A 4TMCA 4DF2A 1UCWA 3HGOA 5D04C 2Y7GA 4D2JA 4FEZA 4Q33A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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