1H11A

2-deoxy-2-fluro-b-d-cellotriosyl/enzyme intermediate complex of the endoglucanase cel5a from bacillus agaradhearans at 1.08 angstrom resolution
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
300
structure length
300
Chain Sequence
SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus agaradhaerens
publication title Direct Experimental Observation of the Hydrogen-Bonding Network of a Glycosidase Along its Reaction Coordinate Revealed by Atomic Resolution Analyses of Endoglucanase Cel5A
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE 5A
total genus 116
structure length 300
sequence length 300
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2002-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1h11A00
3AYSA 2PWEA 4HZ8A 4JFTA 4UOZA 1EGZA 3IK2A 2V5DA 1KQYA 1GVYA 4W8LA 3IANA 3U5YA 1QHPA 3D3AA 4PMZA 2XYLA 3L4UA 2PF0A 1CXIA 2DH2A 2BXYA 1LL6A 2CETA 2WPGA 5D9MA 2QMJA 1EOKA 2YA1A 1GOKA 4F66A 2QMKA 2DT1A 3ARVA 3GNOA 1TE1A 4BQ3A 1UR8A 4WIWA 1E0WA 4K68A 3L4YA 4GINA 4NRSA 5CQ1A 4FLQA 3QR3A 4CD4A 1W9XA 3MV11 1V02A 2XPKA 4AZ6A 1B2YA 3O9NA 3WH5A 1HKIA 2CXGA 2WVTA 1JDDA 3RJYA 1GPFA 4CVUA 3MUZ1 4JKMA 2WAGA 1PPIA 2DGAA 1PZ3A 2VVNA 1GOIA 1XRVA 1XYZA 3EMCA 4E8DA 1ISYA 3VIHA 1PIFA 1H49A 1JD9A 4RE2A 2CESA 5FL0A 1B30A 1LWHA 4M8UA 4HZ6A 1KCKA 5I23A 1FFRA 2Y2WA 4JHZA 3VGEA 3EDKA 3K8MA 2W63A 1JIBA 3QOKA 1WDQA 5EBAA 4Z2LA 1V3KA 4OKDA 4HU0A 1I1WA 3BCDA 1AMYA 1VRXA 4UFKA 2W92A 1S46A 4ZE4A 1GQIA 5AY7A 1V3JA 3L2LA 1HJSA 3GXMA 2E9MA 4KRUA 4CD5A 4XZBA 4LYRA 2DEPA 1QVBA 3S6TA 5CPQA 2CITA 2YL6A 1BF2A 2DPEA 3NDZA 1V3MA 1W2VA 5TD4A 4DUWA 3IJ8A 2VCBA 1V3LA 3LPOA 4BS0A 1C91A 2QPUA 3SCWA 2PWFA 3GNPA 2E9LA 1IZKA 2J74A 3ALFA 4QLKA 5CXPA 4CCEA 5A6AA 3WF4A 2VTFA 3WF1A 4FLSA 5A2CA 1HJQA 4KWUA 4PMQA 2D0FA 4X0VA 2D0GA 2J25A 4AZIA 4OUEA 1E6NA 4JFVA 3NIYA 4M56A 2J77A 4JL1A 1KBKA 1NM9A 2BV9A 2EJ1A 1BGAA 1R85A 4GIAA 1JL8A 2WMIA 1EO5A 1I1XA 3TONA 1WDSA 5I78A 4PCTA 4H8UA 5E6YA 1B3WA 4IUGA 1G94A 2PI6A 4W87A 5EB8A 2CCRA 5BYWA 5M5DA 4DM1A 2O92A 4TTUA 4UZSA 4GZEA 1WP6A 4MADA 3WH8A 2ZX5A 2G4FA 1CPUA 1VFUA 2VC9A 2WHKA 3ARTA 1C8YA 2Z1KA 1W3LA 2J62A 1ISXA 1FH9A 2FH6A 4D6GA 4Z2JA 1MW2A 1J01A 2C0HA 3PTQA 1MQPA 1CXHA 1KXHA 1A47A 2BS9A 1F4AA 4Y7EA 1EXPA 3NSMA 4TX8A 1KXQA 1HVQA 5ABEA 1YHTA 4MTVA 1PX4A 3G6MA 1MFUA 4IM4A 4HMCA 1QNSA 2AMGA 3N12A 4EANA 1E6SM 2ZWZA 2VX4A 3RIKA 2J7EA 2JEPA 3W27A 3WQ8A 1KR0A 3WQ4A 5EMYA 3UG4A 2ZXBA 2EPOA 4R5EA 1XV8A 1MW1A 5CG0A 5F7UA 1CIUA 1BVZA 2VL4A 3S2CA 5BXTA 4JFSA 4PMYA 5FKYA 3EMZA 1OD8A 3ZT5A 3CUFA 1UWIA 2EXOA 5A2AA 1B1YA 1DWJM 4HU8A 2VX5A 4UOQA 1W32A 2A3HA 3AROA 1WO2A 3BAWA 5A69A 4PN2A 1HT6A 3DHUA 1EOMA 1UR9A 2D0HA 4ACZA 2VX6A 3MUY1 3WMSA 1JFXA 3AS3A 1Q4NX 5I0DA 3PZVA 3WH6A 4AIUA 4CN1A 2WC3A 4OBSA 2X2YA 4FLOA 4HTYA 1CDGA 1WKYA 3SUVA 3SCRA 1Q6DA 1RP8A 4JCLA 4UFMA 2CBIA 2WKGA 1V6WA 1ZBKA 3PZMA 3VM5A 4WKFA 4CU6A 2E40A 1JZ2A 3WF2A 1AQ0A 3CZLA 4LQ1A 3SCQA 3EDFA 1ISVA 3OZPA 4QCEA 3O6AA 3VIGA 4KH2A 4H8VA 2XGIA 1XYFA 2G3NA 3J7HA 2DT3A 3ZOAA 4BCEA 3MSGA 4AIOA 3RMEA 5A94A 5FIPA 1NP2A 3HN3A 4P8UA 1LG2A 2VZUA 3WNMA 3WIJA 1UR1A 3CZJA 5E0FA 2JE8A 1A3HA 2ZX6A 1E56A 3WD3A 1OGGA 2QHAA 4PTMA 3UERA 4LYQA 3PHAA 1XH0A 3K1DA 1ECEA 4DUVA 1HJUA 4AEEA 4PTXA 2W91A 1WDPA 3MU7A 1UWQA 3VVGA 1JI1A 4MB4A 4AYSA 2X05A 4HPHA 2DIEA 2VMFA 2VOTA 2J7DA 1H2JA 1XSKA 3VMOA 5CJ5A 1ZBCA 4V27A 4MB5A 3LPGA 4IPNB 1G0CA 3BH4A 2OYKA 5A6JA 4PRWA 2YDRA 3W6MA 3SCTA 3N18A 3UG3A 1E43A 3MMUA 3I3BA 1G9HA 3CIVA 2D1ZA 3NYDA 2XWEA 3EBVA 5HBFA 4RL3A 5D9NA 2VCAA 4MNLA 3VM7A 1UKTA 4AD0A 1QNPA 3W24A 4W8BA 3VGDA 2F61A 2J7BA 2YA0A 3FN9A 1JNDA 4M80A 2VR4A 2W67A 3POCA 2DH3A 4UFJA 3GM8A 3GH5A 1VB9A 4GO8A 2G8ZA 1JYNA 1IZJA 2PBOA 1UKSA 2O9TA 2C8NA 4E2OA 3ARUA 3FXYA 4QLLA 1L8NA 3NDYA 2OWCA 4A3YA 1JFHA 4OJYA 2YKKA 4V2XA 3CLWA 4H2CA 5A6BD 2WMGA 1WPCA 4WK9A 3VIPA 2VZSA 3HJEA 2XM1A 4NZCA 4CD8A 3N13A 5BXSA 3KL5A 4W8AA 3VIIA 3U57A 3UR8A 3ZSSA 3VGBA 1C8XA 1XCXA 1VFOA 1KR1A 3QGVA 5DT7A 4CVWA 4GXPA 3SCOA 1GUVA 4AD5A 5JBFA 4MDPA 5BXPA 4P7OA 5GPRA 3AXXA 2BNJA 3VIJA 1VJZA 4QDMA 3AIUA 3WD1A 2G41A 1JZ5A 2YIHA 1CBGA 2YL8A 1C8QA 1NP0A 2WVSA 4NRRA 2GDVA 5I24A 4EAMA 1L0PA 3SCNA 1Q6EA 2ZUTA 1H5VA 4HA4A 1CGUA 5E0CA 4AZBA 1UG6A 4IISA 3T0AA 1EQPA 1C90A 2VJXA 1E6PA 1EDQA 4AC1X 6A3HA 1RH9A 3CO4A 3WF3A 4AEFA 4CD6A 4L4OA 2A3CA 4GQQA 2Y8VA 1DHKA 3PZOA 2GVYA 3VX0A 1E6ZA 1WDRA 4ZE5A 5JBDA 1M53A 5ABHA 1E70M 1GQLA 3F4VA 1VEOA 4ATLA 1UUQA 1KB3A 1K9EA 4ATWA 1ISZA 1HP5A 1XSIA 1KGWA 1HKKA 4CKQA 2JFEX 3HMCA 3OLEA 2QF8A 3ZMRA 4KGJA 4AD3A 1CENA 5A8MA 1NWSA 4TTGA 3RJXA 2NW0A 5DO8A 3VD9A 2QV4A 1M7XA 3L4WA 3BAKA 2WCGA 4Q22A 4C7DA 2CIPA 2CYGA 3WFLA 1V0KA 1SMAA 2YOCA 5E6ZA 4M24A 5E9AA 1I75A 1QBBA 2VVSA 2XM2A 1H0GA 1LLOA 4W88A 1C7SA 1Q6FA 3N11A 2W66A 3VTRA 1JYWA 2CKSA 3CUGA 5CLWA 1UYQA 2UY3A 1FHDA 4P7QA 2VZOA 2BY0A 1NWUA 3RPMA 4PMUA 1CGTA 3PZGA 2DT0A 4OZOA 3WH7A 1MVYA 3SUTA 1GHRA 1E55A 4X0NA 2J7GA 3UR7A 3AIBA 1TZ7A 1O7AA 2UY4A 3VUPA 3O2LA 1PJ9A 4W7UA 1GOWA 5AYBA 4AIEA 3AFBA 4XV0A 3U7BA 5HXMA 4BQ4A 3KL3A 5GNZA 1BQCA 3DYOA 4D6HA 2BFGA 1JXKA 4PEEA 1G01A 1V6VA 4MPKA 3W38A 1E6QM 3ZM8A 3BCFA 4U33A 1BG9A 3ARXA 4H04A 1CWYA 1E71M 1V08A 1BYDA 2J7FA 2JIWA 2XSBA 3RM9A 3WDRA 4J28A 3MMWA 4PUEA 1KXTA 4QAWA 1BYBA 2CERA 2YBUA 3AS0A 1TVPA 3WDQA 1ZB5A 1B3XA 3VDAA 5CZKA 5I2UA 5A8OA 5CSYA 3CHFA 4PMNA 1MQQA 1C7TA 4F79A 4AY1A 2RGLA 3WMBA 3AIWA 3U7VA 3I3DA 3N04A 3DYPA 1C3FA 2ZUNA 1GJWA 1V6XA 1M03A 3GBDA 2XFYA 3A4AA 4PMDA 2EPMX 1EIBA 3HU7A 4MJ2A 2WMHA 2W62A 3VINA 3CPUA 1J18A 3WDPP 3AHYA 2YJQA 5IDIA 2D3NA 1OCQA 2CBUA 4HP5A 3ARPA 1DWHM 4UQAA 3MUIA 1OWQA 4GI6A 3N15A 3WQWA 2WHMA 4FMVA 2WBGA 2EPNA 3T2OA 5JIWA 5DMYA 2ZWYA 5M3WA 4GI9A 4R27A 3ZJ6A 3ARSA 3L4TA 1Q6CA 1P6WA 3FAXA 1WNOA 2DQXA 1QI2A 3OLDA 4OOZA 1W91A 1WZLA 4YHGA 3W4RA 2Y4SA 1E1EA 3AIVA 3BAXA 1CGYA 1WE5A 1NWRA 3WL0A 4Q7NA 1PEZA 3WNKA 4GO9A 2G3MA 3AJ7A 3WUBA 4TOQA 4A4AA 1CXKA 1V6UA 3MKKA 2YLLA 1BPLB 5FD0A 1EQCA 1VEMA 2D3LA 3WUGA 3IAPA 3W6LA 4U5KA 2ZUMA 1RD6A 4P8WA 3AIQA 2GJRA 4UTFA 2PWDA 2FDMA 1MXGA 4KMQA 2EO7A 3L4ZA 1J11A 4B16A 2FHFA 1E3ZA 1W1TA 4OOUA 1WCGA 1UR0A 2A3BA 1V0LA 3ZJ8A 2ZUVA 2V5CA 2XG9A 2VR5A 4F9DA 5IXEA 2OYLA 1JZ4A 1KQZA 4J3WA 3VD7A 1OSEA 3TA9A 1VFMA 1ZBWA 2WBKA 2VQUA 5ECUA 1J0KA 2D20A 3MMDA 3N17A 2J75A 1QBAA 5HOSA 2XUCA 3AZTA 2WSKA 3WKZA 1JF5A 1UR2A 1AQMA 4W5ZA 1NOWA 2ZX8A 3K46A 4AWEA 2OWWA 2VCCA 3VIMA 1EDGA 3W29A 4MB1A 3QHMA 3M07A 2DSUA 3SEPA 5BROA 1ZJBA 2PB1A 5BRQA 4M81A 5GQBA 1JDAA 5LYRA 4F8XA 5JIPA 1CGVA 2YL5A 3TTQA 3AICA 4W5UA 3AS1A 4AMCA 3GBEA 5EFFA 1R87A 1ZU8A 4RE4A 4KRTA 2GJPA 1E6RA 2G3JA 4S3JA 1K9FA 4P7NA 1QW9A 1EHAA 2BY2A 1H1NA 1B3ZA 1HX0A 3GTNA 3ECQA 2XVNA 1Y7VA 3T0BA 2VRKA 4TUFA 2XHYA 5A1AA 3VGHA 4RE3A 2YL9A 1JZ3A 1BGGA 5HPCA 2J4GA 4JL2A 1J0YA 1W1PA 1E6XM 2J47A 1M01A 1PX3A 1HXJA 4J3XA 1BLIA 3PN8A 2XJ7A 3GXIA 4MNJA 1KXVA 1XCWA 2DDXA 2XGBA 3ZT6A 3BGAA 4BQ5A 1FP8A 3UCQA 3CUIA 5A3HA 1DWGM 4AZ5A 2W61A 1GNXA 3APGA 3MV01 4PMOA 2X09A 3WBEA 4FF5A 3UESA 1XD0A 4MAZA 1TR1A 2Q8XA 3ARZA 2J79A 1H11A 1CGXA 1E72M 3VO0A 2Y5EA 1SFSA 5D4YA 1BAGA 3GYCA 5A2BA 3PZUA 3WN6A 2TAAA 3UEQA 1EHNA 5CSUA 1B31A 1ITCA 2DSWA 2ZXDA 1W9BM 2X8RA 1TMQA 5IFPA 4NSBA 2WKLA 5D8ZA 2WYSA 1M04A 4E8CA 4QCFA 5E70A 2CKRA 2WVUA 5I79A 5D8WA 3W25A 3QHOA 3WSUA 1IV8A 1CTNA 4JIEA 2QLYA 3WQVA 2RGMA 1E1FA 3WDJA 2J7CA 1MW3A 1UKPA 1LJYA 3SUUA 1GOMA 5HNNA 4D6FA 1E0VA 5DT5A 3VMNA 1J0JA 4J3SA 1ODUA 3EYPA 5JUVA 3WENA 3A6OA 3WQ5A 3AYRA 1GJUA 3BSHA 4NF7A 4URIA 2GDUA 1WAWA 3CHCA 1BVNP 4X9YA 4A3HA 4HA3A 1JDCA 4UFLA 3AMDA 2G3IA 2GUYA 3ARRA 5LA1A 5FL1A 1QI0A 1UQYA 1J0IA 3ZO9A 4GPNA 5D9OA 3WEOA 3AHTA 1CXEA 1FH7A 2EQDA 3OZOA 2WSPA 3II1A 1BFNA 1HP4A 2WLYA 3MO4A 3ZSTA 1R86A 3KEHA 3WBAA 1G1YA 4AW7A 3POHA 2BHZA 2Y24A 4HPGA 3WQ6A 1CXFA 1UD5A 4JCMA 3TOPA 4CU7A 4U3AA 3PZNA 4BA0A 1HNYA 2GSJA 1E4IA 2OSXA 1UR4A 1JYVA 3CZEA 2E4TA 3M7SA 2OSWA 3W82A 2YA2A 1E15A 3A47A 4WLCA 4AD4A 1BTCA 1NOFA 3VNYA 3VD5A 2ESCA 5A6BA 1O6IA 5I6SA 4PYSA 2WZHA 1HJVA 3W81A 3GNRA 1JF6A 1XD1A 1J10A 1JG9A 2XFRA 1OM0A 4PCSA 3RO8A 1NWTA 2WCSA 4ZFMA 4HMEA 2FHCA 1XSJA 1JI2A 3F5LA 1E4MM 3PZQA 4CU8A 2WVVB 4BQ2A 4JKKA 1OT1A 1AVAA 1Q6GA 1MYRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AYS A;  2PWE A;  4HZ8 A;  4JFT A;  4UOZ A;  1EGZ A;  3IK2 A;  2V5D A;  1KQY A;  1GVY A;  4W8L A;  3IAN A;  3U5Y A;  1QHP A;  3D3A A;  4PMZ A;  2XYL A;  3L4U A;  2PF0 A;  1CXI A;  2DH2 A;  2BXY A;  1LL6 A;  2CET A;  2WPG A;  5D9M A;  2QMJ A;  1EOK A;  2YA1 A;  1GOK A;  4F66 A;  2QMK A;  2DT1 A;  3ARV A;  3GNO A;  1TE1 A;  4BQ3 A;  1UR8 A;  4WIW A;  1E0W A;  4K68 A;  3L4Y A;  4GIN A;  4NRS A;  5CQ1 A;  4FLQ A;  3QR3 A;  4CD4 A;  1W9X A;  3MV1 1;  1V02 A;  2XPK A;  4AZ6 A;  1B2Y A;  3O9N A;  3WH5 A;  1HKI A;  2CXG A;  2WVT A;  1JDD A;  3RJY A;  1GPF A;  4CVU A;  3MUZ 1;  4JKM A;  2WAG A;  1PPI A;  2DGA A;  1PZ3 A;  2VVN A;  1GOI A;  1XRV A;  1XYZ A;  3EMC A;  4E8D A;  1ISY A;  3VIH A;  1PIF A;  1H49 A;  1JD9 A;  4RE2 A;  2CES A;  5FL0 A;  1B30 A;  1LWH A;  4M8U A;  4HZ6 A;  1KCK A;  5I23 A;  1FFR A;  2Y2W A;  4JHZ A;  3VGE A;  3EDK A;  3K8M A;  2W63 A;  1JIB A;  3QOK A;  1WDQ A;  5EBA A;  4Z2L A;  1V3K A;  4OKD A;  4HU0 A;  1I1W A;  3BCD A;  1AMY A;  1VRX A;  4UFK A;  2W92 A;  1S46 A;  4ZE4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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