3UR7A

Higher-density crystal structure of potato endo-1,3-beta-glucanase
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
321
structure length
316
Chain Sequence
QPIGVCYGKIANNLPSDQDVIKLYNANNIKKMRIYYPHTNVFNALKGSNIEIILDVPNQDLEALANPSNANGWVQDNIRNHFPDVKFKYIAVGNEVDPGRESGKYARFVGPAMENIYNALSSAGLQNQIKVSTSTYSGLLTNTYPPRDSIFREEYKSFINPIIGFLARHNLPLLANIYPYFGHIDNTNAVPLSYALFNQQRRNDTGYQNLFDALVDSMYFATEKLGGQNIEIIVSESGWPSEGHPAATLKNARTYYTNLINHVKRGAGTPKKPGKTIETYLFAMFDENEKKGEASEKHFGLFNPDQRPKYQLNFNH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Solanum tuberosum
publication title Two high-resolution structures of potato endo-1,3-beta-glucanase reveal subdomain flexibility with implications for substrate binding
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase
total genus 113
structure length 316
sequence length 321
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.39: Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase.
pdb deposition date 2011-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00332 Glyco_hydro_17 Glycosyl hydrolases family 17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ur7A00
4MPKA 2YL5A 2J74A 4J7RA 3K4DA 3SCUA 1IZKA 1JDAA 1XH1A 3AHZA 4HA3A 2G3NA 1QW8A 2ZOXA 1Z32X 4NRSA 2GUYA 4AD3A 2ZICA 5JUVA 3AHYA 1JAEA 4AD1A 2QMKA 2WZEA 3U7VA 5CSUA 4EANA 4NZCA 1VENA 2UY5A 2ZUSA 3WD0A 3SCSA 2NT0A 4H2CA 1OINA 3NDYA 4EK7A 4W8LA 3VX0A 2QLYA 3SUSA 3SCRA 4JKMA 4P7LA 3W53A 2PF0A 2W4XA 3AYRA 1XSIA 3AMGA 1DWJM 5A69A 1MXGA 4GINA 4X0VA 3CUGA 2OWWA 2DSVA 2Y24A 1QHPA 8CGTA 4MJ2A 1MVYA 2AOSA 5BRPA 3WFLA 2OYMA 3CZJA 1PAMA 3WQ5A 3ARPA 1QBAA 1VFUA 4AD5A 3VGEA 1QI2A 2WMHA 3VILA 4WKAA 4UCFA 1NM9A 4FMVA 1EOKA 3I3BA 2W91A 1KBKA 1E0WA 4DWSB 1UR8A 1C92A 1DWIM 3BGAA 3ZQ9A 1JZ8A 1EHNA 3BSGA 5I79A 1B3WA 4HP5A 1GW1A 3W27A 3W37A 1W1PA 3W28A 1ZJBA 1KCLA 4UZUA 4M8UA 2WHMA 3PZVA 3CHEA 2ZX7A 3GBDA 2YIHA 5E6ZA 2CHOA 4YHEA 2PWDA 4CD7A 5A2BA 3WNLA 2FH8A 3WH9A 1NWRA 7TAAA 4D6CA 5GNZA 4PMOA 5I0DA 3IJ8A 3LPPA 3IAQA 4U2ZA 5BXRA 1H0GA 2E8ZA 2D0HA 2J62A 2ZXAA 1ZBWA 2D20A 1PJ9A 4E2OA 4TXEA 3EMQA 3WBEA 1UZ4A 3CZKA 1CGTA 3G6MA 2AMGA 4L4PA 3VUPA 2OSYA 5A8OA 3WD1A 3CHFA 4JIEA 5I77A 4M81A 3SURA 1C91A 2XFYA 2ZUNA 3B8SA 2GJXB 3N1AA 2DSUA 1J0JA 4JFVA 3QGVA 4KH2A 1KCKA 2V3GA 3VMOA 4Z2LA 2YLAA 2YL9A 4PSPA 2ZXBA 2J7BA 2W61A 4FLSA 3WEMA 1UH2A 1OWQA 3RILA 4FLOA 4PTVA 2XM1A 3UG4A 4N0RA 1CENA 3VM5A 4UOZA 1N82A 1RH9A 3NCOA 2E9BA 5M5DA 1F4AA 1M03A 1LL6A 1UKOA 1ISVA 3QHOA 3VDCA 1JZ4A 1K9TA 2WANA 3WBAA 1JZ2A 1XCWA 4UQ9A 2ESCA 1OT2A 1OBAA 3WUEA 1OGGA 1WDSA 3D3AA 3ARXA 3PZUA 3CGTA 2WVVB 1EXPA 3PZ9A 2V3EA 1PEZA 1BAGA 1XGZA 4MNJA 1MFVA 4A4AA 1L0PA 1VJZA 3M46A 1P6WA 3BAJA 1H09A 2V3FA 3VIGA 3WQWA 3LMYA 2V5DA 2CETA 5E6YA 5GNXA 5CGMA 4AZGA 3TTOA 1PX3A 4V2XA 3OGRA 1CLXA 3WDRA 2VZTA 4DUXA 2WZHA 3CHCA 3T08A 4W86A 2VQTA 2GK1A 1DWAM 2C7FA 2WWCA 5GNYA 2D22A 1J0HA 4HPGA 3TTSA 1RPKA 1W1YA 5A6BA 3BLKA 4QAWA 1MQPA 1BYCA 1W1TA 2W66A 3E1F1 3N17A 3W26A 3T2PA 3BCFA 4W5ZA 4HMEA 4F9DA 7A3HA 6A3HA 4OZOA 1GQLA 3SCTA 3AZSA 4HOXA 3AS2A 1V6UA 1Q6EA 2WCGA 1UWRA 4HU8A 1US2A 3CZGA 2GDUA 3AIUA 4B3KA 1QI0A 3K46A 2O9RA 1KWGA 3O6AA 3PTQA 1J9YA 1VIWA 2OLHA 1W3JA 4UR9A 2NSXA 1PIGA 1MYRA 4CCDA 4PMYA 1MWOA 2W92A 3UESA 1CYGA 1UOKA 2WK2A 3BMWA 2ZE0A 3BAXA 4PEEA 1V6XA 4U5KA 5AYIA 1C8QA 2PWGA 1SR0A 6CGTA 3AMCA 1UWTA 3NYDA 4F9JA 3AZRA 4C7DA 3VIPA 5D8ZA 3PZQA 5A6LA 4ZEPA 1WCGA 3U5UA 4V28A 5I5RA 1OIMA 1W3LA 4QCFA 3L2MA 1XHGA 4BS0A 3RM9A 4ZENA 4CVWA 1G5AA 2EEXA 2VVSA 5A8NA 4J3SA 1XD1A 4Z2HA 4MAVA 1E15A 4GQRA 3ZSTA 5BROA 3DC0A 4AD4A 3MO4A 4CKQA 1J11A 2VOTA 2J7DA 3T2OA 1GOOA 4GI6A 5CXPA 3RM4A 5AY7A 2DT3A 1G9HA 3BSHA 4AC1X 1S46A 3PZNA 4LGXA 1WPCA 4YHGA 3VIJA 2PBGA 3BLPX 4AYSA 2VRKA 1KB3A 2EPLX 2A3AA 5CQ1A 5HDRA 4ACZA 2EQDA 3S2CA 4HTYA 3GBEA 5FL0A 1V3HA 3OLDA 2OSWA 1QI5A 1TUXA 5JBFA 5EMYA 4GZJA 5I23A 3SCNA 1MQQA 1H0IA 1E1EA 3DYOA 4AIOA 1E0XA 4Q22A 3FHAA 3GXMA 5HNNA 4K68A 2FHFA 1HKIA 4EAMA 1QHZA 1FHDA 4TVUA 1BTCA 5A8QA 4RE3A 2BNJA 2FHBA 4D1IA 4ZFMA 2EO7A 2G8ZA 4H41A 1EQPA 3THDA 3FW6A 3I3EA 1LLOA 1WNOA 5EBAA 3AROA 4Z2JA 3PZMA 2G4FA 3FY1A 4BQ3A 3WMSA 3VIHA 1R7AA 2XVNA 4XUYA 2VC9A 5FL1A 2F8QA 4KMQA 1QNRA 3VD3A 2WM0A 4MNLA 1MXDA 4MNMA 1J12A 1E6RA 1CPUA 4HOWA 4R27A 2DIJA 4W8AA 3VDBA 2ZUVA 4OJYA 3WUBA 1Q6CA 4W87A 1VAHA 1E6QM 2X2YA 2ZUUA 2XFRA 3CUIA 4W8BA 2ZX9A 4PUDA 2DGAA 3WKZA 4N42A 2D3NA 3WH8A 3WENA 4BQ2A 1LL7A 3TOPA 4V27A 2BY0A 1XYZA 1CZ1A 1BG9A 1C8YA 2GDVA 3VO0A 4H8UA 2XVPA 4ATWA 3VGBA 3T0AA 3DYMA 1CXLA 1UR2A 1HJVA 3EBVA 2RGLA 2CBUA 4JFUA 1QPKA 1K9EA 1HX0A 2XVGA 1HKJA 1LJYA 1OT1A 4HZ6A 1J0IA 1V3KA 1E5NA 3BH4A 4AIUA 1OB0A 1GUVA 1ZJAA 3HJEA 1G94A 5CLWA 5C8BB 1HF6A 2JEPA 1SMDA 4WKFA 1W2VA 3WY1A 4AXNA 5M17A 5A6KA 1A47A 4D6EA 5A2AA 1EH9A 4P8XA 5E0FA 1J0YA 1LF1A 2ZUWA 1CXFA 1US3A 1HJWA 2ZXQA 1IT0A 4HA1A 3WEOA 3K4AA 4S3KA 3W81A 2QHAA 3G6LA 1DP0A 1HN1A 2CIPA 3WL1A 2ZX8A 1GOIA 2JFEX 1JZ3A 2UY4A 2XFFA 2JF7A 3LPFA 1E56A 4M82A 1UR1A 2J8FA 2HVMA 1M04A 4JFSA 4QLLA 4U3AA 1E4LA 2PBOA 3CH9A 5ECUA 4TOQA 1VFOA 1L8NA 3GZAA 3AFBA 1O7AA 1EHAA 2XHYA 1IZJA 1ISWA 1C93A 1UH3A 3AIVA 4JAWA 1BG4A 1BLIA 5IDIA 3VU2A 3WUFA 2BHYA 4URIA 3T09A 4QDMA 2D1ZA 1EOMA 4XB3A 2PB1A 4CCCA 1K6AA 5CPSA 2XYLA 3T2QA 4Y7EA 5HPCA 2PI6A 2BXZA 3CTTA 4LPCA 1WE5A 3AS3A 4ZXLA 1TZ7A 3WD4A 3BXWA 2DSZA 4JKLA 1AQMA 2PWEA 2XVLA 2BFGA 5EFFA 3GNRA 5ABGA 3MMWA 3W25A 1E6PA 2VO5A 1OGSA 3AISA 3GTNA 4GO8A 2WCSA 1UR0A 1V3MA 1X1NA 4MAZA 3FAXA 4W88A 1CGYA 4FLQA 3L4TA 4HU0A 4TTGA 2J78A 4GI8A 2X09A 4Z2GA 3WDIA 1PZ2A 3QHNA 1PZ3A 4JHZA 3WNOA 3F5LA 4U3CA 3O9NA 3THCA 3VIMA 2VX7A 2O9OA 2WHJA 2G3MA 1AVAA 1K9FA 1C90A 2WC3A 1QNSA 1MW2A 2YLLA 3CMJA 1V02A 2BXYA 1LG2A 3ZMRA 3W38A 5CG0A 2VMFA 4AWEA 8A3HA 4P7OA 1VFMA 5C71A 4B3LA 2WMJA 3T0DA 2PC8A 4FK9A 4M24A 1YHTA 3HMCA 4F79A 1W3HA 3OIHA 2GK1B 4U33A 3WDQA 3CZEA 1VBUA 2BV9A 2XSAA 3NSNA 2J7GA 1OIFA 2VCAA 4DUWA 4IPNB 4Q7NA 3M6DA 4D6JA 4ATDA 4GXPA 4WLCA 1E40A 4CD8A 3GXFA 3RMEA 5M03A 1ITXA 3MUZ1 4AZCA 4M29A 1QVBA 1HIZA 2WLYA 2AAAA 1UD2A 3VGGA 3CZ8A 4Z2KA 5FKYA 2ZWYA 1KFWA 2WNWA 3L4YA 4JHOA 4TVDA 3BAIA 1JZ7A 5DFAA 1WAWA 2WWDA 1CBGA 1E6ZA 3A6OA 3I3DA 1HP5A 3ZT5A 1WDRA 4D72A 1V0LA 2DSKA 3EDEA 4D6IA 1FA2A 5EB8A 4CCEA 1FH9A 3W29A 4HMDA 4P8UA 3RM8A 3BC9A 3IK2A 1TVNA 4J3UA 1UR4A 1OSEA 1W3KA 2A3HA 1EO7A 1QW9A 2GVYA 1B3VA 3VNZA 4LQ1A 4GKLA 4L4OA 4W85A 5AC4A 1ZBCA 4UFLA 1JNDA 4F8XA 2C0HA 2WMIB 3MKKA 1FFRA 2BY3A 4CD4A 4QCEA 2DT0A 4FF5A 4RL3A 3VIFA 2XJ7A 2ZX6A 2HISA 1QI3A 5D4YA 3S6TA 1H2JA 2D0FA 4DWSC 4U5IA 5A94A 1HJSA 1UWQA 4XZWA 1Q6GA 2PWHA 1JZ6A 2J7CA 1M7XA 2F2HA 3ZT7A 3AICA 4B16A 1W9PA 2CPUA 2YA1A 2VRQA 1CGWA 3AI0A 2Q8XA 1CGVA 4PUEA 3IANA 3N15A 3GXDA 1UKSA 3FN9A 4GIAA 3VIIA 3MUIA 1JI1A 4PTMA 1D2KA 4UOJA 1ZB5A 4PSRA 5DO8A 4BCEA 3N13A 1CDGA 1UKPA 4BQ4A 5JBEA 3GYCA 3N9KA 4ACZB 3WDHA 4W5UA 3VMPA 4OBRA 3MV01 4JL2A 4MADA 3ZJ7A 3AS1A 1ECEA 1CXEA 2WMGA 3NIYA 1HJXA 1M01A 4JCLA 1GZJA 1V02E 2X05A 2JALA 2XPKA 3TONA 4R5EA 1V6YA 1NP0A 4LYRA 1V3JA 3VNYA 2JEQA 1KXQA 3UR8A 1JYVA 2VX5A 1JYXA 1FH7A 3F5KA 1UR9A 3IJ7A 2FDMA 3CLWA 3WMBA 3GDBA 1E5JA 1QOXA 3CIVA 1OGBA 2VURA 4PTWA 1UKQA 3KWXA 4U2YA 1GQJA 1MFUA 2V38A 1V3LA 3WFZA 3L2LA 4CN6A 1WDQA 3LPOA 2GJRA 3ECQA 1NWTA 3RJXA 4YPJA 4XZBA 1I1XA 4B9ZA 5CZKA 5KZ6A 3KL0A 1BYDA 1CGXA 4JFTA 3PN8A 3RDKA 2VQUA 1W9DM 1W9UA 1LL4A 2VZVA 1NQ6A 7CGTA 1UQZA 3L4VA 5A1AA 5A3HA 1V0KA 4JZ5A 3VPLA 4M80A 4QFUA 1UHVA 4PCTA 3WF4A 1PBGA 3DYPA 4BZYA 3WL0A 5A6SA 2WMFA 1BHGA 3WQ4A 4BQ5A 5CLTA 2D0GA 1WP6A 1J01A 4OOZA 5A6JA 4ACYA 2YDQA 4AZ6A 4GPNA 1CIUA 1DWFM 4B15A 4C7GA 3ZSSA 1JL8A 2WMIA 5A6AA 1GJWA 2DEPA 1E3ZA 4NSBA 1BPLB 3SCWA 3APGA 4UQBA 1M53A 3OZOA 1R7OA 4X9YA 1NWUA 2Z1SA 4HMCA 4A3HA 4OBSA 2CKRA 1XSJA 3WNMA 5BYWA 3WDPP 2VNCA 4PN2A 1E55A 1D3CA 4UFIA 5D9NA 1J18A 1E71M 1H5VA 1GOQA 4WJXA 1DWGM 2CXGA 3KE0A 1GJUA 2WZIA 1E1FA 1Q6DA 1CXIA 1Y7VA 2X0HA 2VT0A 1OD0A 3O2LA 1WB0A 1KGUA 4PRWA 4WSKA 3W24A 4CU8A 3U5YA 4D6HA 2V5CA 2VL4A 1RD6A 1VEMA 1B0IA 3AIBA 1FP9A 2WB5A 2XGIA 1MQRA 1NH6A 1V03A 3K8MA 5IHRA 1W9XA 1VB9A 4HZ7A 2Y5EA 3QR3A 1B90A 1XV8A 2JF6A 3AZTA 3B9EA 2A3CA 1JD7A 4UQCA 1J0KA 2DIEA 2WHKA 3BAYA 5BRQA 3SCOA 1JDDA 1HJQA 4UQAA 1GOMA 4W7WA 4AEFA 1E9LA 1I1WA 3DHPA 3VVGA 4OIFA 1C8XA 5JIPA 4GZEA 3WNNA 5IFTA 2OYLA 4PMDA 2A3BA 3KL3A 4TX6A 3MU7A 2DPEA 3OLEA 4E4PA 3WELA 3WQ8A 3QOKA 1F4HA 4PMQA 3F5JA 3AOFA 5AC5A 5BCAA 1KBBA 2CCRA 5I2UA 1XYFA 2W5FA 1HVXA 1EA9C 1KXTA 2BHZA 3GM8A 2BVYA 4F66A 4GI9A 1HT6A 4IM4A 3A4WA 1OCQA 2DT2A 3GH5A 4A3YA 3BMVA 4OUEA 4CU6A 1KQZA 5M3WA 2DQXA 2CBVA 1GCYA 3WH7A 2VRJA 2G3IA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4MPK A;  2YL5 A;  2J74 A;  4J7R A;  3K4D A;  3SCU A;  1IZK A;  1JDA A;  1XH1 A;  3AHZ A;  4HA3 A;  2G3N A;  1QW8 A;  2ZOX A;  1Z32 X;  4NRS A;  2GUY A;  4AD3 A;  2ZIC A;  5JUV A;  3AHY A;  1JAE A;  4AD1 A;  2QMK A;  2WZE A;  3U7V A;  5CSU A;  4EAN A;  4NZC A;  1VEN A;  2UY5 A;  2ZUS A;  3WD0 A;  3SCS A;  2NT0 A;  4H2C A;  1OIN A;  3NDY A;  4EK7 A;  4W8L A;  3VX0 A;  2QLY A;  3SUS A;  3SCR A;  4JKM A;  4P7L A;  3W53 A;  2PF0 A;  2W4X A;  3AYR A;  1XSI A;  3AMG A;  1DWJ M;  5A69 A;  1MXG A;  4GIN A;  4X0V A;  3CUG A;  2OWW A;  2DSV A;  2Y24 A;  1QHP A;  8CGT A;  4MJ2 A;  1MVY A;  2AOS A;  5BRP A;  3WFL A;  2OYM A;  3CZJ A;  1PAM A;  3WQ5 A;  3ARP A;  1QBA A;  1VFU A;  4AD5 A;  3VGE A;  1QI2 A;  2WMH A;  3VIL A;  4WKA A;  4UCF A;  1NM9 A;  4FMV A;  1EOK A;  3I3B A;  2W91 A;  1KBK A;  1E0W A;  4DWS B;  1UR8 A;  1C92 A;  1DWI M;  3BGA A;  3ZQ9 A;  1JZ8 A;  1EHN A;  3BSG A;  5I79 A;  1B3W A;  4HP5 A;  1GW1 A;  3W27 A;  3W37 A;  1W1P A;  3W28 A;  1ZJB A;  1KCL A;  4UZU A;  4M8U A;  2WHM A;  3PZV A;  3CHE A;  2ZX7 A;  3GBD A;  2YIH A;  5E6Z A;  2CHO A;  4YHE A;  2PWD A;  4CD7 A;  5A2B A;  3WNL A;  2FH8 A;  3WH9 A;  1NWR A;  7TAA A;  4D6C A;  5GNZ A;  4PMO A;  5I0D A;  3IJ8 A;  3LPP A;  3IAQ A;  4U2Z A;  5BXR A;  1H0G A;  2E8Z A;  2D0H A;  2J62 A;  2ZXA A;  1ZBW A;  2D20 A;  1PJ9 A;  4E2O A;  4TXE A;  3EMQ A;  3WBE A;  1UZ4 A;  3CZK A;  1CGT A;  3G6M A;  2AMG A;  4L4P A;  3VUP A;  2OSY A;  5A8O A;  3WD1 A;  3CHF A;  4JIE A;  5I77 A;  4M81 A;  3SUR A;  1C91 A;  2XFY A;  2ZUN A;  3B8S A;  2GJX B;  3N1A A;  2DSU A;  1J0J A;  4JFV A;  3QGV A;  4KH2 A;  1KCK A;  2V3G A;  3VMO A;  4Z2L A;  2YLA A;  2YL9 A;  4PSP A;  2ZXB A;  2J7B A;  2W61 A;  4FLS A;  3WEM A;  1UH2 A;  1OWQ A;  3RIL A;  4FLO A;  4PTV A;  2XM1 A;  3UG4 A;  4N0R A;  1CEN A;  3VM5 A;  4UOZ A;  1N82 A;  1RH9 A;  3NCO A;  2E9B A;  5M5D A;  1F4A A;  1M03 A;  1LL6 A;  1UKO A;  1ISV A;  3QHO A;  3VDC A;  1JZ4 A;  1K9T A;  2WAN A;  3WBA A;  1JZ2 A;  1XCW A;  4UQ9 A;  2ESC A;  1OT2 A;  1OBA A;  3WUE A;  1OGG A;  1WDS A;  3D3A A;  3ARX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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