5ECUA

The unliganded structure of caldicellulosiruptor saccharolyticus gh5
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
350
structure length
350
Chain Sequence
TAYEKDKYPHLIGNSLVKKPSVAGRLQIIKQNGRRILADQNGEPIQLRGMSTHGLQWFPQIINNNAFAALANDWGCNVIRLAMYIGEGGYATNPQVKDKVIEGIKLAIQNDMYVIVDWHVLNPGDPNAEIYKGAKDFFKEIAQKFPNDFHIIYELCNEPNPTDPGVTNDEAGWKKVKAYAEPIIKMLRQMGNENIIIIGSPNWSQRPDFAIKDPIADDKVMYSVHFYTGTHKVDGYVFENMKMAIEAGVPVFVTEWGTSEASGDGGPYLDEADKWLEYLNANNISWVNWSLTNKNETSGAFVPYISGVSQATDLDLGSDQKWDISELSISGEYVRSRIKGIPYQPIERTL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Caldicellulosiruptor saccharolyticus
publication title The structure of Caldicellulosiruptor saccharolyticus GH5
rcsb
molecule keywords Cellulase
total genus 132
structure length 350
sequence length 350
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2015-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
A PF03424 CBM_17_28 Carbohydrate binding domain (family 17/28)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5ecuA00
3IAPA 3RM4A 5A6SA 1IZKA 4M80A 3ARPA 2J77A 3SUUA 5ABFB 3BH4A 1C91A 2WLYA 3OLDA 4H8HA 1FH8A 3K46A 1GOQA 1ESWA 1FH9A 4HPGA 4MPKA 3DYOA 4J3VA 2VVSA 3OIHA 4YHEA 5AY7A 1GPFA 5A6BA 5A1AA 3CUGA 4BCEA 1CXIA 2EQDA 4XB3A 4EE9A 2BNJA 1UWUA 1WDRA 2EXOA 3MO4A 2OSYA 1VJZA 4D6DA 1B2YA 2UY2A 4KH2A 2PWGA 2VO5A 2OWCA 3J7HA 2OYMA 2QPUA 4GIAA 2CERA 2ZUTA 2JE8A 3CUHA 3PHAA 4JL2A 4Z2JA 3L4ZA 1UWTA 2JF6A 2WXDM 5CLTA 3CPUA 1W91A 1Q6EA 3BCFA 3AZSA 3NJ3A 3DHUA 1UYQA 2PWHA 2XJ7A 4U5IA 2GSJA 3EDFA 1FA2A 1BLIA 1H0GA 4UFMA 1SYTA 4TX8A 2AOSA 5I6SA 4NRRA 3ARWA 2J8FA 1SR0A 2YDQA 4JKLA 3AROA 2WK2A 5E0CA 1BAGA 2EEXA 3AIVA 3RO8A 2QLYA 4MB5A 4J3UA 5BRPA 1WE5A 3GZAA 4M8UA 2Y4SA 3DECA 1PPIA 3RILA 4B3LA 4W84A 1HN1A 1H49A 3MV01 3IJ8A 1HL9A 1V3LA 1GOWA 4MAVA 1JI1A 1OCQA 2VRJA 3OLGA 3TTQA 4AISA 1XV8A 1W2VA 5A8PA 5I79A 1ZBCA 4OIFA 2XSAA 3K8KA 1UH3A 2XFFA 1ISWA 1NP2A 1QNRA 1UR4A 3L4WA 4OOUA 3ZJ7A 2EPLX 2DGAA 5TD4A 2QMKA 3NSNA 3WD4A 2YL8A 1LLOA 5D9PA 5M5DA 2JFEX 2ZUNA 2XGIA 2CIPA 5A6JA 1VENA 3TTSA 3A4AA 5ABFA 1UR2A 3FHQA 1DHKA 1BGGA 1V0LA 1KR0A 2DT3A 3K4DA 5DEZA 2DIJA 1B3YA 3ARZA 4EANA 2OWWA 3ARXA 2WPGA 2GUYA 2VT0A 2V3DA 5GNZA 1V0NA 2WVUA 3AIWA 2O9PA 2WWDA 3AICA 3WKZA 2E8ZA 3A3HA 3B9AA 1BYDA 1MW2A 2WNWA 4X0NA 4N0RA 4B9YA 1CECA 1VB9A 2WM0A 1GVIA 1AQHA 3ZT6A 1W9XA 4P7NA 3T2QA 4UFJA 2BY1A 2CCRA 3RCNA 2XSBA 3WUEA 4P7OA 4ZXLA 1XH2A 1UHVA 4PTVA 1VAHA 2J7HA 3N15A 1ISYA 5HPCA 2X1IA 3AHZA 4BQ2A 3UR8A 1U30A 2W67A 2DSKA 3AI0A 3MSDA 2PB1A 1PAMA 1ZS2A 3I3BA 8CGTA 1R87A 2FGZA 3PBGA 5DMYA 2D2OA 1UD4A 3VD5A 1KGWA 4GXPA 3CLWA 5BCAA 1NWRA 1KQYA 3BMWA 2DT1A 3DYMA 1QHZA 3WQ6A 5F7UA 1UR1A 2RGMA 2CHNA 1W3JA 1CTNA 1NH6A 1JXJA 2PWDA 2XPKA 4D6HA 3AIBA 1C93A 3KEHA 1E1FA 4CN4A 1EH9A 4TTUA 2PWFA 4PTMA 2FHCA 2ZX8A 1RP9A 1TMQA 3VM5A 3PTQA 4FMVA 2BHZA 4WLCA 1O7AA 4B16A 4MADA 1ZU8A 4XX6A 4QCFA 3VOCA 2EPNA 4NRSA 5E9AA 3GYCA 1BFNA 3VGHA 3T0DA 2WB5A 1A47A 1JZ4A 1WDSA 1PX4A 3ZMRA 2ZWYA 4WK9A 4EKJA 2NT1A 2J25A 1E55A 4AWEA 3VKKA 4BQ4A 3VILA 3AMKA 1JDAA 1GUVA 3VIGA 4NI3A 3VGBA 4ATWA 1UKSA 1XRVA 7A3HA 1E5JA 3QOKA 3VNZA 4CU8A 4NF7A 4UFLA 4YPJA 2CXGA 1DWJM 1CPUA 2CETA 2ZX6A 1V6XA 5HXMA 4JFWA 1E73M 1OT2A 1HJQA 2EBNA 1TUXA 2FH6A 2AMGA 4CD8A 2BY3A 4WKHA 1UD6A 2D22A 4MTVA 2VX7A 4P8XA 1UWSA 3AJ7A 3BAJA 3VIFA 3BCDA 2IUZA 3WNOA 3AISA 3PZ9A 2CPUA 4DUVA 3QGVA 1H11A 1BPLB 2DEPA 4B15A 4LYQA 2D23A 5I24A 1UZ4A 5LYRA 1BYCA 3W82A 1B3ZA 2D0GA 1GQKA 3D5HA 3AHXA 3LMYA 3WMSA 1LG2A 3VU2A 1CXLA 1R86A 2YA0A 1VFOA 4HA4A 4KWUA 3ALFA 1PX3A 2CHOA 1IZJA 4XV0A 4F9JA 4AZIA 1P6WA 1GOMA 1OGGA 3CZEA 1JF5A 5A6LA 3BSGA 3WD3A 4HPHA 4UTFA 4OKDA 4W89A 1E70M 4QDMA 1FP9A 2WYSA 2D3LA 3PN8A 1HKMA 1EOMA 4F66A 1V6WA 3ZM8A 2Q8XA 4M81A 1D7FA 2Y5EA 3RDKA 3WDJA 3NYDA 1V3KA 2WZHA 1ISZA 1GOOA 3AYRA 4V27A 5KZ6A 3FAWA 2ZUVA 3RM8A 3NCOA 3UCQA 1V6UA 5A8MA 1HKJA 1JNDA 2DSZA 2BS9A 1CGUA 5IDIA 2F8QA 1GJWA 4JAWA 3N17A 4PMNA 3SCPA 3SCVA 2YBUA 2NW0A 4OJYA 2A3EA 4Q22A 2WSKA 2BXYA 3AMCA 3TTOA 3WD1A 1OWQA 1VIWA 1CWYA 1ZBVA 2YOCA 2XIBA 3UG4A 1MXDA 1Z32X 2ZIDA 3WEOA 1WDPA 2UY3A 3UG5A 4F8XA 4WKFA 4D6CA 1BVNP 3WMCA 1LG1A 3NSXA 3MU7A 4W85A 1AVAA 4MDPA 4ML4A 5CGTA 5JBEA 4HOXA 4PTWA 2G8ZA 3OGRA 2W5FA 2W61A 1HNYA 7TAAA 2WKLA 2D20A 3FY1A 1E4LA 1QNQA 1GCYA 4DWSC 1QPKA 3VMOA 3U57A 2BHYA 4IM4A 3AHYA 1W9UA 1EDGA 4Q7NA 1J10A 1KXHA 4A3HA 1NOFA 3WDIA 5A8QA 2XWEA 1XCXA 3AIUA 1L8NA 1Q4NX 3GNRA 4AC1X 1KCKA 4CKQA 3OLIA 3N13A 4J28A 1DP0A 1QHPA 3WBEA 1TA3B 2YLLA 3T0AA 1PX8A 5JIWA 5C70A 1C8YA 1W1VA 1W9DM 2X2YA 5M3WA 3RM9A 4D6GA 3MS8A 1EA9C 2DH2A 1AQ0A 1H09A 2VL4A 2V38A 1UKOA 2D3NA 2VURA 5DO8A 2WVVB 1ZB5A 2WMJA 3VIJA 5CSYA 1ITCA 5A2BA 3HU7A 3WF3A 3L4VA 1OM0A 5A6KA 3AXXA 3W0KA 3WENA 2O92A 1OBAA 4D71A 1KCLA 1V3IA 3AS3A 2X0YA 2J7EA 1JNEA 1WZLA 2YL6A 3PZGA 1CGTA 4U2ZA 1CXEA 1NWUA 1KB3A 1TZ7A 1UKPA 4R27A 1UG6A 5DT7A 3SUVA 1QHOA 3CO4A 3N12A 4AD4A 1GQLA 1EQPA 4AEEA 1OINA 2VX6A 1UKTA 4QLKA 3D3AA 1E6PA 2VOTA 2PF0A 4E8DA 2XVKA 2WANA 3IJ9A 1IV8A 1GORA 1J9YA 1GNXA 2WMHA 3PZIA 1HP5A 5CPQA 4GZIA 5AC5A 1E0VA 2WAGA 1MFVA 1QI3A 1UWRA 1UUQA 3GH4A 2WWCA 4M1RA 5M03A 1W9VA 2BVTA 9CGTA 3U5YA 3W26A 4EAMA 3VNYA 5BRQA 1U33A 3W38A 4PMZA 3MV11 5FL1A 2JEPA 4J7RA 5CPTA 1SFSA 3AS2A 3A47A 4DWSB 4JFTA 3W29A 2TAAA 4GO9A 1FHLA 2VR4A 4JL1A 1UWIA 5IHSA 1JZ6A 4ZENA 4S3KA 3VX0A 5I5RA 1PEZA 1JYVA 2Y8KA 5GPRA 1E6XM 2CEQA 1TA3A 2CNCA 3AMDA 4PEEA 1JZ7A 1KGUA 4PMVA 2WCGA 3AMLA 1WP6A 5KEZA 1R7OA 1E1EA 4D1IA 2WBKA 5AYIA 3F5KA 1V08A 2WVVA 4AIUA 3AHTA 3WDRA 3POHA 3N9KA 1BYAA 3GNPA 1XD1A 2DQXA 3AXIA 1NQ6A 3GNOA 1U2YA 1KBBA 1LJYA 2JF7A 1SMDA 1Q6DA 1EO5A 1W9BM 3RMEA 1O6IA 2Y24A 4AZ5A 1K9EA 2DT0A 1US3A 4HTYA 3T2OA 1I1WA 1QVBA 3E1F1 3ZT5A 3AQUA 2XVNA 1V3HA 3WF1A 1JYWA 2E4TA 3SCNA 1G01A 3I3DA 1ITXA 2WC3A 3CZJA 3VIMA 3ZSTA 1VRXA 1WAWA 3QHOA 1RH9A 4D72A 3BAWA 5E6ZA 1B30A 2GJXB 1BG4A 4MB4A 3T09A 4W7VA 3GTNA 4UR9A 5DF0A 4JCMA 3EMCA 3CIVA 2PC8A 3AZTA 3NDZA 1EIBA 6CGTA 1VFFA 1UR0A 1GOKA 3NSMA 5HPOA 2VMFA 4M24A 3DYPA 1XSJA 1MFUA 1UR9A 4DUXA 2D0FA 5FD0A 2B31A 3ALGA 1OB0A 3BLKA 1DWFM 1YHTA 2VRKA 3WNLA 3SCOA 1G1YA 5EMYA 1JL8A 4J27A 2FDMA 1HKIA 4HOZA 5CGMA 1HT6A 2RGLA 3WUBA 4C7FA 3AHVA 3WDQA 3T08A 3W53A 1MQPA 4U3AA 4AMCA 1JD9A 1HJXA 2QV4A 2VZOA 4DWSA 2E9LA 3BAYA 1FOBA 1CYGA 3IK2A 2XM2A 1JYNA 2VCBA 1C92A 1XYZA 2XG9A 2ZE0A 4JFVA 5A8NA 1PZ3A 2J7BA 8A3HA 3EDDA 3VVGA 4HA3A 5BWFA 3QR3A 4U31A 2OYLA 3IJ7A 1J0IA 4RE4A 1QI4A 2X09A 3LPGA 2WLZA 3GBEA 1PBGA 2CBVA 2GVYA 3ARSA 3VUPA 3CHFA 3OG2A 1LF1A 1MW3A 3IANA 2WBGA 1E72M 4LYPA 5BYWA 3WH6A 1B1YA 4OBSA 1HJWA 4W5UA 1MW1A 4PN2A 3M46A 1WCGA 4V28A 5IFPA 2XVPA 1W3HA 1RD6A 3PZOA 1BYBA 1PIFA 2OWXA 2ZUUA 5EBAA 2DSVA 1WZKA 4OOZA 2WMIB 4TTGA 4GQRA 2V5CA 4HOWA 2XTKA 4UQDA 2BXZA 4FLSA 3VGGA 2WMKA 2G41A 3CUJA 2VCAA 3U5UA 2C8NA 2GJXA 2DH3A 1J0JA 1J18A 3VIPA 5ABHA 3VGEA 3DC0A 1HP4A 2BY2A 3VD4A 5A94A 4UQBA 2J78A 5BXTA 1QBBA 2XHYA 1MQQA 5LA1A 1LWHA 3HMCA 1JXKA 4CD7A 5CJ5A 5BROA 3AS0A 3WL1A 1KXQA 4ZEPA 4S3JA 2J75A 1CXHA 4F79A 3PZUA 3AIEA 4HZ8A 3AOFA 1B9ZA 3VX1A 4QAWA 2WZEA 2E3ZA 4MB3A 3ZIZA 3S6TA 1OD0A 4NZCA 5AC4A 1KFWA 4U5KA 1CEOA 3SCQA 2E8YA 4UQCA 4CN1A 2YA1A 5JBFA 3CZGA 1LWJA 1GJUA 2D0HA 3BC9A 2Y8VA 5DT5A 1L0PA 1SMAA 2C7FA 1QNOA 1UD2A 5A6MA 2YL5A 1UZ1A 1NWSA 4AD5A 4AXNA 2X0HA 4LPCA 1E3XA 3PZQA 4HP5A 4MDOA 2A3BA 2CESA 3VIIA 4P7LA 3WF0A 1G5AA 2QF8A 3MUIA 5FIPA 1E4NA 2CBUA 3VDAA 1W1PA 1TVNA 5A6BD 1MVYA 1TE1A 2XVGA 4EK7A 1LQ0A 4IUGA 4QCEA 4PYSA 3KL3A 2W91A 1E0XA 1I1XA 5BXPA 4PMQA 1UH2A 3AYSA 1VBRA 3ZO9A 2FGLA 2ZX5A 4UQEA 3MSGA 4RL3A 1HL8A 4D6EA 5ABGA 3OGVA 4JZ5A 4M29A 3TA9A 3ZOAA 4W7WA 1JG9A 1W32A 4CGTA 2VX4A 1JZ8A 2NSXA 1PJ9A 1J12A 3CBWA 2GDUA 2V3FA 1DWIM 3GBDA 5GQBA 3APGA 3VD3A 3I3EA 3W6LA 3O6AA 4CU7A 3WDPP 4CN6A 4TVCA 4HZ6A 3SUTA 2XGBA 1EOKA 5I77A 3TONA 5GNXA 1TVPA 1QI0A 1PZ2A 4AZHA 4PRWA 1QBAA 2ZX9A 3QHNA 1BVZA 1XHGA 2WMGA 1QI5A 3GXMA 5GNYA 1JF6A 4FF5A 3VGDA 3N1AA 3ZR6A 2F2HA 3WEMA 5AYBA 4FK9A 4CD6A 4OZOA 1K9TA 2VRQA 1NWTA 1E6ZA 3LPPA 3W4RA 3KWXA 1W3KA 2FHFA 5A3HA 3WFLA 4PCSA 5CXPA 1J0YA 2CKSA 1H4PA 4LX4A 4P7QA 4GZEA 6TAAA 1V02E 1J0KA 1J0HA 3CMGA 1KQZA 5ABEA 4U33A 1QW9A 1H41A 3MUY1 4MAZA 2J4GA 4WJXA 2W62A 3GXIA 4UFKA 1CIUA 2J7DA 1DWGM 1QNPA 3K8MA 4PCTA 4GQQA 1E0WA 3ZT7A 3ZR5A 4ZXOA 2VJXA 1CNVA 3VDHA 1CZ1A 1CXKA 4H8UA 1V6YA 4CVWA 2W66A 2ZXDA 3EYPA 3W6MA 1HXJA 2YKKA 2OSXA 4ZE5A 3EDJA 2HVMA 2OLHA 1VJSA 3SCRA 4AD0A 3SCUA 4AZBA 1V6VA 5BXRA 1VF8A 4B3KA 1M01A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3IAP A;  3RM4 A;  5A6S A;  1IZK A;  4M80 A;  3ARP A;  2J77 A;  3SUU A;  5ABF B;  3BH4 A;  1C91 A;  2WLY A;  3OLD A;  4H8H A;  1FH8 A;  3K46 A;  1GOQ A;  1ESW A;  1FH9 A;  4HPG A;  4MPK A;  3DYO A;  4J3V A;  2VVS A;  3OIH A;  4YHE A;  5AY7 A;  1GPF A;  5A6B A;  5A1A A;  3CUG A;  4BCE A;  1CXI A;  2EQD A;  4XB3 A;  4EE9 A;  2BNJ A;  1UWU A;  1WDR A;  2EXO A;  3MO4 A;  2OSY A;  1VJZ A;  4D6D A;  1B2Y A;  2UY2 A;  4KH2 A;  2PWG A;  2VO5 A;  2OWC A;  3J7H A;  2OYM A;  2QPU A;  4GIA A;  2CER A;  2ZUT A;  2JE8 A;  3CUH A;  3PHA A;  4JL2 A;  4Z2J A;  3L4Z A;  1UWT A;  2JF6 A;  2WXD M;  5CLT A;  3CPU A;  1W91 A;  1Q6E A;  3BCF A;  3AZS A;  3NJ3 A;  3DHU A;  1UYQ A;  2PWH A;  2XJ7 A;  4U5I A;  2GSJ A;  3EDF A;  1FA2 A;  1BLI A;  1H0G A;  4UFM A;  1SYT A;  4TX8 A;  2AOS A;  5I6S A;  4NRR A;  3ARW A;  2J8F A;  1SR0 A;  2YDQ A;  4JKL A;  3ARO A;  2WK2 A;  5E0C A;  1BAG A;  2EEX A;  3AIV A;  3RO8 A;  2QLY A;  4MB5 A;  4J3U A;  5BRP A;  1WE5 A;  3GZA A;  4M8U A;  2Y4S A;  3DEC A;  1PPI A;  3RIL A;  4B3L A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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