1XFBA

Human brain fructose 1,6-(bis)phosphate aldolase (c isozyme)
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
342
structure length
342
Chain Sequence
HSYPALSAEQKKELSDIALRIVAPGKGILAADESVGSMAKRLSQIGVENTEENRRLYRQVLFSADDRVKKCIGGVIFFHETLYQKDDNGVPFVRTIQDKGIVVGIKVDKGVVPLAGTDGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKISERTPSALAILENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACPIKYTPEEIAMATVTALRRTVPPAVPGVTFLSGGQSEEEASFNLNAINRCPLPRPWALTFSYGRALQASALNAWRGQRDNAGAATEEFIKRAEVNGLAAQGKYE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
publication title Structure of human brain fructose 1,6-(bis)phosphate aldolase: linking isozyme structure with function
pubmed doi rcsb
molecule keywords Aldolase C
total genus 135
structure length 342
sequence length 342
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2004-09-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1xfbA00
1ICSA 1KFBA 4WY0A 4MPQA 2FJKA 3ABSA 3NEVA 1SSGA 4RCXA 4MJZA 5C6MA 1F76A 2ZTJA 1MO0A 2V2DA 1OFQA 2ABAA 3NR0A 1FX6A 5DN1A 4M6QA 1P0KA 2QUTA 1H7XA 3LV6A 1CI1A 3USBA 3W2KA 1TPEA 3HPXA 4N6EA 4FB7A 1TTQA 3GDRA 3PUOA 5FI8A 4IMDA 3MYOA 1AW1A 3TAOA 3O1NA 3G1YA 2Z6JA 4TX9A 3W1RA 1NFBA 3CHVA 3EX3A 1AL8A 3MO7A 3W85A 2E77A 3OEXA 4NVTA 1XBVA 3WJWA 2E5BA 2NWRA 3IVUA 2NXIA 4UTLA 5H91A 4XTIA 2G97A 3NQEA 3W2UA 3N2MA 3W74A 4ZZ9A 2WSQA 5AC6A 2TPSA 2DJLA 3GXNA 1AW5A 4IQLA 1XKYA 3HMJG 1J5TA 4UXDA 3S5ZA 2P1FA 5A5WA 2E6DA 3PAJA 3NQGA 5F1VA 3DXIA 4UTTC 5AHMA 3O6YX 1A5AA 5D2YA 2Q3OA 1LBMA 2NXHA 2OMAA 3P80A 3MI3A 4RLIA 3UNDA 4O28A 3HGJA 4I7WA 4RX0A 1TRIA 3FEMA 3W1UA 6ALDA 1RQEA 3T40A 5F2GA 2GQ9A 3LGEA 2EPHA 1O94A 1A50A 2W6RA 3FIGA 3NO5A 4XKYB 3HGSA 1GTHA 4K7VA 1EB3A 1F73A 4RZ6A 2FIQA 3PVFA 1SZNA 4M5PA 1G4SA 3GAYA 5KITA 5ABTA 2V0TA 1W37A 3UYCA 3LHZA 2WKJA 1ALDA 3GZ3A 5AOUA 2Y85A 4QITA 3GK0A 5F2LA 1O60A 4MY9A 3STFA 5AC7A 5FEPA 1SZFA 2VEPA 1P0NA 2NWSA 3O16A 4U4MA 2DZTA 1KBIA 2ZRXA 3NQMA 5D33A 3GNDA 1LLWA 3W2NA 4LV9A 3N19B 3NPVA 4OT7A 4DELA 4N9DA 1VRDA 3L66A 3W86A 1WOBA 4JTTA 1VYRA 4Y9AA 5MHBA 1LOLA 4LY8A 3M5YA 3HJZA 1GYLA 5FF4A 1OF6A 3B05A 4MLRA 3UQNA 1DL3A 2NXGA 5KINA 3W7RA 4WOQA 2TRSA 1JCLA 4FNPA 4UTUA 3TC7A 2GPTA 3LHWA 3EWWA 4IX0A 4FIRA 4O11A 2I1OA 3HQ1A 4Q32A 1X6UA 4WQ6A 2A7RA 2GJNA 3W07A 4EIVA 2WNQA 5F1UA 1PCWA 2B7PA 3W1LA 3TQ0A 4JD4A 3DHDA 3MUXA 3VNDA 2V2HA 4XKYA 4O18A 3N9SA 5CPOA 4HSOA 3T55A 2ZA3A 4GRSA 3TJLA 1K3UA 4GFSA 2ISVA 1H1ZA 4KKXA 4GE8A 2X30A 2QDGA 4RK8A 5AN7A 2FPVA 3W71A 1X8FA 3ZS4A 1VZWA 4OE7A 3PUEA 4NJGA 3O06A 4LUJA 3EXSA 2V9DA 1ME8A 1X1ZA 2A6LA 3GB6A 4X9SA 4ML9A 1LP6A 2A85A 1W3IA 1M6JA 3PULA 4OGZA 4CNPA 3DHFA 6TIMA 1RR2A 3M5VA 4AHPA 4Y96A 2CLMA 2PC4A 1T99A 3QQ0A 4GUJA 4BR1A 4GUGA 3HIJA 2J24A 2Q8ZA 3UWUA 3CC1A 3RFAA 4XBKA 3A21A 1PL9A 2CLFA 5K4XA 2ZYFA 4UMAA 2WV8A 1FWSA 3V1PA 3KX6A 1JUEA 1FXQA 2G5WA 2GVLA 3EWUA 4O1AA 1TO3A 3GX9A 4ZQMA 4IMFA 5DY2A 4HNVA 3O15A 3GAKA 3C2VA 5E0KA 1S5TA 4O52A 2LLEA 3G0SA 3CT7A 2RKXA 1W5PA 5FF3A 1V7YA 4UTKA 4O50A 4GUIA 2NV1A 1KLZA 3QFEA 1C8VA 3NL3A 2Y63A 4MY1A 2QCDB 3F1QA 4NNAA 4LC6A 4UMBA 3SFKA 3ATYA 3QRHA 5D02A 4JGDA 3IGXA 1KFCA 3WJYA 4TO8A 4IJBA 1OG0A 3L2IA 4Q4KA 4CCDA 4JTGA 3ABQA 3OG3A 3P61A 3PSVA 1QO5A 3EB2A 3MHGA 1EX5A 4GWEA 3IGUA 3W1MA 3MHFA 4CCCA 4MJMA 1VLWA 4UFIA 3BW2A 1IGSA 1RQHA 4P61A 4JTFA 2V30A 4KFOA 3E49A 1NF7A 1YTEA 1NEYA 1VCFA 5LZLA 3TDFA 3WK0A 3A24A 3W7OA 1QCWA 1W3NA 4CLMA 1LCOA 2B7OA 3LERA 4ZQPA 2RHGA 5I3GA 3W7HA 3B0PA 2QCMA 1FQ0A 2V5LA 2QUUA 2J9YA 4JTIA 4UTIA 1TV7A 2NX3A 1VGAA 5LGZA 1U83A 1DV7A 4MKNA 4Y8FA 3LI0A 3TXVA 4UFJA 4RKAA 3OBKA 4X22A 4S1FA 5DY3A 5AC8A 5HWNA 4UR8A 3CWOX 1TQXA 3L0GA 3QPYA 4NQ1A 3W76A 4TR9A 5CKSA 1WX0A 1YDVA 1LRQA 3A23A 2B7QA 4MY8A 2OX1A 3FA5A 3TROA 1EUAA 4QISA 2EGZA 1B4EA 2E09A 4NX0A 3G8EA 3PBWA 4JTEA 3EX1A 4YMZA 1MEWA 3G0XA 2NX1A 4JX4A 4R7JA 3BLFA 2XN2A 2CW6A 3L9CA 3I65A 5TQLA 2J88A 4EF9A 4Z1AA 5HINA 1XDLA 1T8XA 1KBJA 2QCDA 3R5EA 2Z6IA 4IGHA 1HUVA 3PUDA 3HB9A 1KFKA 1DJNA 1QPQA 2AGKA 5EYWA 3NG3A 2JKPA 3SZ8A 2Y7DA 1KTNA 1TIMA 5BMXA 2Y61A 3NXFA 1XI3A 3LXCA 4AWTA 3OVPA 5D05A 3BG3A 4YWIA 3O8AA 5KZEA 1UBSA 5IM51 1W1ZA 1SPQA 4FNTA 3HGRA 3QF0A 5D30A 2RDTA 5D09A 3W83A 1O95A 4QNEA 4NNCA 4CQ8A 4JTUA 1ADOA 4ZQOA 2Y7EA 2YFNA 1JULA 3NM3A 4OQVA 5D37A 5K9XA 3BPWA 4UTHA 4WD0A 1JUKA 3CWNA 2ZZ5A 1H51A 3CEUA 5BMWA 1RV8A 1WOAA 4LWWA 4M6VA 3G1DA 3LHUA 4N4PA 3NQ2A 2GUUA 3WK1A 4HPXA 4N4QA 1L2UA 4O14A 5EBUA 4DF1A 3PG8A 3QMSA 1VJIA 4JYDA 1F7BA 1WA3A 2OT1A 3LXBA 5HJLA 2RDUA 3NNTA 5AHIA 2YYTA 1WAUA 1F6KA 1X1OA 3ELFA 4A2RA 2CU0A 1P5BA 5BOOA 2QR6A 2QKFA 2WSYA 1DJQA 5C5YA 4N9BA 4O4WA 5AHEA 3ANYA 5C2XA 4ZQCA 3G1AA 2F84A 5AFDA 2VELA 1EEPA 1NF0A 5KZMA 3KVLA 2FPTA 1FDYA 3GKAA 4K36A 4HNNA 2XN0A 1W5MA 1OYAA 2ATSA 1R46A 1BEUA 2EHHA 4NZFA 3T78A 3SI9A 3NQFA 3P7YA 3TSBA 5FF0A 3L65A 1G6CA 4A29A 3G8RA 1A5BA 3UPWA 3FFSA 1PS9A 2C0AA 4LVDA 1I2QA 3B03A 3S1VA 1OFBA 3FJLA 5DLCA 3OVQA 4PODA 3O63A 2DU2A 1QMLA 3NL6A 4PH6A 4DO5A 4O57A 4POCA 2D73A 5TIMA 2VENA 2A1YA 2C14A 1LM1A 5SWUA 2ZZ6A 4GUFA 4QIUA 3JRKA 1SO4A 2UV8G 1YPIA 1S5WA 3EX6A 5AHNA 3MW7A 1SO6A 1LBLA 1P1XA 3C2FA 3C61A 5I3FA 3LTYA 5CPNA 1WXJA 5K9DA 2V82A 3LV5A 1TJRA 1KV8A 1KTCA 1O5XA 4AXKA 2AAMA 3TE9A 5D2VA 4FNQA 1GYNA 3W7LA 4LVAA 5L6UA 3LCLA 4PFMA 3I6RA 4LVFA 1H7OA 2OT0A 4K37A 3E02A 4O1CA 4QQ3A 3FS2A 4FF7A 4DEFA 2YDAA 3N34A 8TIMA 1QPRA 3C3NA 5I3KA 4NUWA 1KV5A 2E68A 3I68A 4QJ1A 3SECA 3GDLA 4NJHA 3KVMA 1IXPA 1UUMA 3BG5A 3W1NA 3G0UA 2A0NA 4PL1A 3SGZA 3NGJA 4N02A 3BARA 4JEQA 1C9DA 1TPVA 3PR2A 5G1TA 4LOCA 2X1RA 3GVGA 5FEZA 1XUUA 2QUVA 3B8DA 3G24A 4LTSA 1WBHA 1XBZA 3S8HA 1FCQA 3INPA 2C13A 3BK0A 1IXNA 4MZ8A 1JQVA 4O16A 2R8WA 3G1SA 4CQAA 3LCXA 3H55A 2YGYA 3TMQA 4NXKA 3Q58A 1HL2A 3O6CA 1FCVA 1H7RA 4JX5A 2DP3A 1OFDA 2I9EA 3LCHA 1PVNA 5CZSA 3SY5A 2QAFA 3TR2A 4QNWA 1VLIA 2YZRA 4GUHA 2P10A 4MYXA 3LHTA 2ZFAA 2YR1A 4DBEA 2OCZA 1A5SA 3M43A 1HO4A 2DZUA 3N14A 3EKZA 1JQXA 3DFOA 1O5KA 1WV2A 2QCEA 5AB3A 3HG2A 3RLUA 3E96A 4QM1A 5F4XA 3TSDA 4DO6A 5F4WA 5IBXA 1VYSX 1FUYA 1G7UA 4H4IA 3L0KA 1TQJA 3S0CA 4PEKA 3TH6A 4FNSA 5G5IA 3QM3A 5G2HA 4DQWA 4JNMA 1Z42A 1ZCOA 3W72A 2A7NA 3K30A 2OJPA 1T96A 4O4VA 4NJJA 2HSAA 4S2BA 2O7QA 2JK2A 1GTEA 2YYUA 3TA6A 3TFXA 4BWLC 1JCMP 3UPBA 5AHFA 4DPPA 2A2IA 2CZFA 1SU5A 1VH7A 1TJPA 4HPJA 4XZ9A 3PC0A 4ZVJA 3WJZA 1JCYA 1GOXA 1J4EA 1ME9A 3QMRA 4UFHA 2ZRVA 4OV9A 1TYGA 2VKZG 2VFDA 5J5DA 2HTMA 3P8JA 1LROA 2R14A 5DBTA 3V75A 3PBVA 3TQVA 1KM1A 3KVKA 4UTWA 4JICA 3FJ6A 2O7SA 2JKAA 2A6NA 4Z1BA 3DFTA 4HKPA 1WYIA 3RNDA 1N55A 2DZWA 4JTLA 4FO4A 1VPXA 5LNUA 4UFMA 3LHYA 3CIXA 1K8XA 4R34A 4KWVA 4R53A 3S6DA 3W1TA 3S5YA 2YPIA 1H61A 1U5JA 1A53A 3LLDA 2YXGA 1GG1A 1F05A 5FF7A 4IXHA 2H8ZA 3S9YA 4JTKA 3PB0A 1IXQA 4RR4A 2PCQA 1JUBA 3B0UX 1OHLA 3M0ZA 1PCKA 4M7SA 1K8YA 4AAJA 5K2ZA 3THQA 1H5YA 1G4EA 3LCGA 2BTMA 1VC4A 2ZQ0A 4O54A 1RVGA 3CM4A 2J27A 1B57A 3BGGA 3TIMA 5CPLA 3UXAA 1FDJA 5D32A 1THFD 2WOQA 2H3BA 4YXGA 3I7SA 4ZQNA 3LOTA 1JRCA 2CLOA 1G4PA 1VQTA 1W5QA 1NSJA 1Z41A 4UCGA 1TB3A 2QJIA 1PIIA 5G4EA 5U7SA 1TPFA 4I7UA 3W7KA 3LCWA 1XC4A 2ZA1A 3W7NA 4JTJA 3S42A 1NVMA 1TCDA 2J9ZA 3HGOA 3SIZA 3BV4A 4JYEA 3HOJA 4JDYA 1Q6RA 2WSRA 4UTJA 3SJ3A 3KVJA 1I2OA 1YYAA 3PM6A 1H62A 3TC6A 1AL7A 1JJKA 1Q3NA 3L67A 2PRMA 3G18A 4FX7A 5CSSA 1VCGA 2ZTKA 1N7KA 4DBDA 4GBUA 3DKLA 1DVJA 2CLHA 5LGXA 3SW6A 1TPUA 4WX2A 5E1QA 2C1HA 1ML1A 2Z1BA 5CG7A 1OF8A 1VCVA 1L9WA 3P84A 2BXVA 1G7VA 2E6YA 4RZ4A 1SFJA 3IRDA 4C1KA 2Z2UA 4FHAA 4DF2A 3UY7A 4MUZA 2C16A 4NX5A 3BW3A 3WK2A 1XL9A 3SGUA 2Z0IA 3E12A 3H53A 1Q45A 4O15A 2VC6A 3NDOA 3LM7A 4NNBA 3VI2A 3B06A 3NQAA 1I8JA 1KFEA 1Z44A 3IIVA 1TPC1 2GVGA 3H54A 1GVOA 3NL2A 3HF3A 4H3DA 5CZ0A 4C1LA 4H6KA 1RD5A 2OZ0A 5KSWA 2JGYA 1I2NA 3DAQA 1EWEA 3M41A 3NQCA 3DGRA 3W2MA 4K8HA 4MLJA 4HNUA 1HFBA 2X1TA 3MBFA 3N9RA 4AMAA 2BLEA 1ONRA 4PCFA 5KMYA 4UTMA 1BWKA 3P5YA 1AW2A 2DZSA 4G1KA 3VE9A 5LKYA 3HG3A 3QSTA 3P62A 3M6YA 2VEKA 4X3ZA 1HO1A 4IUOA 4BI7A 5LNVA 2QCGA 2NZLA 2CLIA 3UY8A 5KZDA 3W1PA 3BLEA 3L5MA 3C0JA 1TREA 2R94A 3QPZA 1QWGA 1F2JA 1HTIA 3P8IA 2FPYA 4ORIA 4YL2A 4WOZA 4JTHA 3TJXA 1ME7A 1JCJA 5FEWA 3W7EA 5BRBA 3LDVA 4A2SA 3QYQA 3HBLA 1GZGA 1LYXA 3T44A 4O13A 3W75A 5AYYA 1D3GA 2CLKA 1YXDA 3S1WA 1LBFA 4BI6A 1H7WA 4ADSA 4UUIA 5F2MA 2BWGA 4EF8A 2QAPA 3MP5A 4X2RA 1SR9A 3MP3A 4TMCA 1SQ7A 1JCNA 2FQIA 2CWNA 3A5VA 1TTJA 1DKWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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