1XFBA

Human brain fructose 1,6-(bis)phosphate aldolase (c isozyme)
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
342
structure length
342
Chain Sequence
HSYPALSAEQKKELSDIALRIVAPGKGILAADESVGSMAKRLSQIGVENTEENRRLYRQVLFSADDRVKKCIGGVIFFHETLYQKDDNGVPFVRTIQDKGIVVGIKVDKGVVPLAGTDGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKISERTPSALAILENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACPIKYTPEEIAMATVTALRRTVPPAVPGVTFLSGGQSEEEASFNLNAINRCPLPRPWALTFSYGRALQASALNAWRGQRDNAGAATEEFIKRAEVNGLAAQGKYE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of human brain fructose 1,6-(bis)phosphate aldolase: linking isozyme structure with function
pubmed doi rcsb
molecule keywords Aldolase C
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 135
structure length 342
sequence length 342
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2004-09-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1xfbA00
2C1HA 5AFDA 3U2OA 5L6UA 3L5LA 1KM2A 3FIGA 4A2SA 2ZTJA 4LVGA 3M44A 1GTEA 3GVGA 2B4GA 3KFTA 3MP5A 5CSSA 5D2YA 3W7JA 3DHDA 3KRZA 1OX4A 4FNTA 2PCQA 4Y6GA 1L6SA 3C2OA 3GB6A 3LXCA 3TMQA 3PB0A 1MZHA 3PM6A 1R2RA 1KTCA 4TMBA 2WNZA 2Q3RA 1IIHA 1VH7A 3IIXA 3G22A 3TJXA 1SFLA 1SZFA 1Z44A 4MUZA 3WJXA 2KZHA 3E12A 4Q32A 4ADSA 1OYBA 4A2RA 3R12A 3U6WA 3O1NA 2QCEA 3E02A 5BMWA 1KW1A 2GQ8A 2ALDA 4IGHA 2HTMA 5DBTA 4JR5A 4HHPA 4TX9A 1T8XA 1GG1A 4MIMA 2H8XA 1ML1A 3GDTA 3NZRA 1JCLA 3CIXA 5HUPA 2VFIA 4X2RA 5EKYA 4FIRA 3NO5A 3HG4A 3BLEA 4DO5A 5TBOA 3EKLA 2P0OA 3DFQA 2YX0A 5J5RA 1HUVA 4O1CA 4M6QA 2ZFAA 1SQ7A 1EIXA 5DXXA 4LW7A 2NZLA 4Z08A 3N9SA 2V81A 1HO1A 4MFDA 1G4SA 4OV4A 3R89A 4RCXA 1YXCA 1SU5A 1DQWA 3LRMA 5AC7A 1H50A 4HIBA 3G1XA 4UTHA 2YGYA 3HGSA 1GYNA 4ZQPA 2EGZA 3MO7A 2TRSA 3NEVA 3O63A 3LX9A 3G8EA 2W6RA 4IUOA 3CEPA 1VR6A 3M9YA 4GBUA 4ICNA 3K30A 4UTIA 1EUAA 3B05A 1G4PA 3OG3A 4O4VA 1IIGA 3LGEA 3PULA 4E38A 4RR4A 1KFCA 3T4CA 4Z0JA 3WJWA 1JUBA 3TXVA 1FWRA 4AF0A 3S8HA 3TXZA 4NQ1A 3W7KA 3DFSA 1DJNA 4X9SA 1TV7A 3G3DA 3W7RA 1P1XA 1V7YA 3NPWA 4EWND 4DXVA 4NVTA 1GVSA 3NL2A 3OHIA 4DF1A 4JY8A 4LOCA 3W1UA 1EX5A 3UQNA 4EF9A 2ZQ0A 2XN2A 5CPNA 1VC4A 2PRLA 4NUWA 4JYDA 4XWUA 1PHQA 1KV8A 5CGQA 2A7RA 1UASA 3G24A 2GJNA 4C1LA 1FCUA 5SWUA 1R2SA 4CLMA 2QAPA 4JY9A 2EPHA 4N6EA 5EMUA 3TC7A 1YXYA 5DCDA 3MYOA 4MY8A 3ATYA 3HPSA 4ZVJA 5BNKA 3W72A 1WOBA 3C2EA 3ABSA 3UXAA 5C6MA 1ZAJA 4Y8FA 3W1AA 4NX5A 2X1RA 3LDVA 2CWNA 1SPQA 5CZJA 4C1KA 1WYIA 4LC8A 2ZRYA 1MEHA 4ZQMA 4ZQCA 4FXSA 3QEZA 4UR8A 4WUIA 3PBUA 1SSDA 1SUXA 2EF9A 3QQ1A 1HG3A 2FJKA 2QUUA 2Y7EA 4UTTA 1TJPA 3P60A 3W2UA 4YCOA 3I65A 2YDAA 4S2BA 2JGYA 5D2XA 1J5TA 1ZHAA 1H5YA 5LNVA 3O07A 4IX0A 2JK2A 3P8IA 4WY0B 1FQ0A 1WA3A 3I6RA 4CQ9A 4GUFA 1OFRA 4OHQA 3GYEA 3C6CA 3DXIA 3WFAA 4UC5A 1ADOA 3HO8A 2C14A 3MI2A 2DORA 1WOAA 1YYAA 1JCNA 3FKRA 2GUUA 2RDTA 3MW7A 4QQ3A 3CEUA 3IIVA 3P74A 1LM1A 3NZ1A 1KFEA 1TMHA 2QCHA 1WX0A 3W83A 2G5WA 3EWWA 4A21A 2ZRUA 1ZJIA 3W2JA 1F6KA 1RZMA 2F7FA 1YDNA 4MOZA 3VE7A 3WJZA 5F2GA 3G3MA 4LTSA 1W5MA 3NQMA 3KAOA 2ZZ5A 5G2HA 3L66A 2VENA 5CKSA 4K8EA 3QMRA 1GOXA 2YFOA 1H7OA 3PSVA 3LCGA 3EWUA 2V82A 2GQAA 3ABOA 4HKPA 1M7OA 3QQ0A 2BXVA 3S42A 4PA8A 3Q58A 1A50A 1CX9A 1W5QA 1XFBA 3RLVA 1Q6RA 1F5ZA 1W3TA 2V2DA 1HFBA 5G5IA 4DQWA 4Z1CA 1Z42A 1VYPX 3QPYA 2JKPA 3LHZA 1XUUA 5K4ZA 4S2CA 5HNRA 4ADUA 3PY2A 4YCPA 3C2VA 3PBVA 3CPRA 4LUIA 1TTPA 1YDVA 3CQ0A 3QF0A 2VKZG 1SFJA 2CLKA 3LBMA 1ZNNA 1EEPA 1ZALA 1UCWA 3R2GA 2E6FA 1O95A 4E2BA 3HGJA 1ICSA 2A5HA 2Y6ZA 1I2NA 2QJGA 3IIOA 1ZY9A 3MWAA 4ORIA 2ISWA 4O12A 4LVDA 5G4WA 4XUGA 1WQ5A 1S5WA 5BOOA 1R2TA 2JKAA 1U83A 5EY5A 3MUXA 3NDOA 3QW4B 1M5WA 4H4IA 1JQVA 5I3IA 3LOTA 1J2WA 3NQ8A 2CFFA 2Y70A 1TIMA 2NX1A 1LLWA 3TFXA 2E6AA 5CG7A 2Y62A 1OFPA 5AC6A 3LI0A 4LS0A 5FF3A 2BWGA 5AN7A 1IXQA 1FDYA 1KBJA 4A29A 1VYSX 1TSIA 5LNSA 8TIMA 4BI7A 3TDFA 3O06A 3PC0A 4HT3A 1Q45A 4FNSA 4UNLA 4O28A 4DEFA 2ZA2A 2JGQA 4M7SA 3GR7A 1XDLA 4DPPA 4D2JA 1UUMA 4JTGA 1OK6A 3A23A 2Y61A 1EP3A 3N19B 4K39A 3W22A 2GOUA 2G96A 3NQ6A 3IV3A 1AL8A 2Y7GA 3TV8A 4Q33A 2YSWA 4QIUA 3LHTA 4MJMA 3W1PA 3FFSA 3MYPA 4K38A 1JCXA 3S1VA 3W7OA 2YCEA 4BI6A 3QSRA 2C13A 2QCMA 1LBFA 3HB9A 3HG3A 3FA5A 3G1VA 4NJIA 2EHHA 3OVPA 3FYPA 4OV9A 1QR7A 4M5PA 4RX0A 1G7VA 3QSTA 4MZ1A 4I7UA 5D32A 3W6YA 2F84A 2XN1A 5DCEA 3W3OA 5F2LA 1ALDA 4J9JA 1M7PA 3PUOA 3TQ0A 5ABTA 1XUZA 3TW6A 2Y85A 1KBIA 4AB4A 5HR7A 3QFEA 1PS9A 1GYLA 4OT7A 4TO8A 3SW6A 4XKYB 2NXIA 4LU0A 4JTTA 4YMZA 1BKSA 1JQXA 1W8SA 3NM3A 1X7FA 3CM4A 5K9DA 5A5WA 1QCWA 3DZ1A 3LHWA 3YPIA 4U28A 2BX7A 2YW3A 1G6CA 1Q6QA 2HS8A 4PEKA 1K8ZA 3W1TA 2J24A 2YR1A 3CWOX 3A22A 4L4LA 4FEZA 2X2GA 5CZ0A 2JKEA 4ZMGA 2RKXA 3TFCA 3NQCA 2A7PA 3P62A 3Q2DA 4UFJA 1QO5A 1NFBA 1N7KA 4MY1A 3FYOA 4QITA 4OU1A 4R7JA 1IXNA 3S5NA 4QNEA 2X1SA 1EP2A 4CQ8A 3IIPA 3NR0A 4QNWA 2V9DA 1F73A 5LNUA 4Y90A 1NF0A 4POCA 3HPXA 3SGUA 5K7JA 3L65A 2QUVA 2VFHA 1YXDA 3QRHA 4N2YA 2PURA 2UV8G 3NQDA 1OYAA 3W07A 3NQVA 4DF2A 2P10A 2RFGA 5F1UA 3LERA 4JIPA 3TC6A 4UTWA 1FWSA 2QDGA 1H62A 1QWGA 4JTSA 3HIJA 1CW2A 1W54A 2WSQA 4IXHA 2B7NA 1I2RA 3L5AA 1SR9A 4HN4A 3LCWA 2DJXA 4JN6A 3N9RA 1FXPA 1SO5A 1A5AA 4O1DA 5F1VA 1L6YA 2QCDA 5BW6A 4EF8A 4NT0A 4ZQRA 4FHAA 3RFAA 1LP6A 1AG1O 1IGSA 2OT0A 4MYXA 3P81A 3WK1A 4HPJA 2YW4A 1X8FA 2H3DA 1LBLA 5KTLA 4LWWA 3S5OA 4ZL1A 2C6QA 4LUJA 3LB0A 1YTDA 4NJKA 2QAFA 3L0GA 4R34A 3W1LA 4KKXA 3M1ZA 1GJPA 2WJZA 3WJYA 3L0NA 4JTFA 4ZZ9A 4AWTA 3QC3A 3LXBA 2ZZ3A 3LCXA 1NSJA 3A21A 2RDWA 4DF0A 1P5BA 4UTKA 4UMBA 1RR2A 4MJZA 4MLRA 1EB3A 1KM3A 1N8FA 1GVRA 2PE4A 4N9CA 3JS3A 2Y88A 5DELA 4PL1A 5U7SA 4Z1AA 4UXDA 2I9EA 3L67A 1VYRA 5AB3A 3FOKA 3UY8A 1QOQA 3NL6A 2QCFA 3SECA 1VZWA 2E77A 4LRSA 3PB2A 1K02A 5DCBA 2W79A 4A22A 3RMJA 1C29A 4QAIA 2RDUA 4FNQA 4IMDA 3S1UA 4WXYA 4P2VA 1W3IA 3O8AA 4JIQA 4KWVA 3MHFA 1UUOA 2HMCA 3EX3A 1JR1A 3EXTA 4DO6A 1DL3A 1TPDA 4E0CA 4N9BA 5LHEA 5A8GA 3BLFA 2Z6IA 4O53A 5L9FA 5C54A 4W9TA 4AHQA 1XL9A 5CPLA 3O6YX 3F03K 5G2IA 3DKLA 3PBYA 3S5ZA 1QPRA 3I7SA 2H8ZA 3W87A 1B4KA 4I7WA 3IVSA 1LCOA 3NL3A 1QPNA 4O13A 1O94A 2ZYFA 2OMAA 1DJQA 4UUIA 3PUDA 4K37A 3KRUA 1TTJA 5FF4A 4GUJA 4LVBA 2TSYA 1RPXA 3PWAA 1GZGA 2ABAA 4DELA 1K7XA 1O4UA 5F4SA 1I2OA 1VJIA 3LCHA 4M19A 4HPXA 3TSDA 1JRBA 1RV8A 1H51A 1G7UA 3LLFA 2WOQA 3TAOA 1KV5A 1CI1A 2ZZ2A 5HWMA 2QEZA 4JD4A 3N2XA 4XTIA 4GUIA 3NQGA 1H1YA 3W1XA 1LOLA 2GQ9A 2E5BA 5K2ZA 2FB2A 4BK9A 1SW0A 3BVJA 4YLWA 2VFGA 3UY7A 1UB3A 3P61A 4BI5A 4WOZA 1JCMP 3MHUA 4RKAA 3VKJA 1DBTA 3EWXA 1GEQA 3VCRA 4FX6M 2TYSA 1GPWA 2ZZ4A 5HQEA 3W84A 3BPWA 3UYCA 4YL2A 4O10A 2QR6A 3F4NA 2PC4A 1ZENA 1DV7A 1JUEA 3CHVA 5F2IA 4UTTC 2WKJA 3W85A 3JR2A 3QMSA 3O6DA 1OX5A 3LCIA 4H6KA 1OFQA 4YWIA 3EWZA 1H7XA 3THAA 2R14A 2ATSA 4RJEA 2PRMA 2R91A 3FJLA 1A5BA 2GPTA 5LSMA 1EWDA 1FXQA 3NPUA 5I3FA 3PF3A 3F4WA 4IMCA 1FDJA 2B7PA 1O60A 4QSHA 3W86A 3W7QA 1D9EA 3B0UX 1QFEA 4O0ZA 3P67A 2FPTA 2E5DA 1VCFA 1LLZA 4OBTA 1T96A 2Q3OA 3DI1A 1D3GA 1F05A 3QM3A 2VFDA 1YDOA 4UNKA 4AXKA 1TRDA 3IVUA 1R46A 5FEWA 1NVMA 4UFHA 1K8XA 3KVLA 3S6DA 1W31A 3TJLA 3C52A 1F76A 1LRNA 3QH2A 3UD6A 5E1QA 3T55A 5EBUA 3EX6A 3WK3A 3IRDA 3C2RA 2VC6A 4FXRA 4N9EA 4CCCA 3EWYA 1O5XA 1FWNA 1OFAA 3DFPA 4UFMA 1TRIA 4HNNA 2FDSA 2E6DA 3DAQA 2A2IA 4CQAA 4BR1A 3BARA 4GE8A 4N9DA 2FLIA 1OF6A 2E1DA 5FEXA 1XCFA 3UZJA 2AQWA 1PHWA 1ZAIA 3KXQA 1VLWA 4KFOA 3CTLA 4R53A 3W2KA 3T7VA 3USBA 2NUXA 5MHBA 2GVGA 4Q4KA 2D73A 5HINA 5KINA 4LRTA 3TW7A 4EIVA 3TA6A 5HR6A 5D04C 4HNTA 1MEIA 4AEOA 3GXNA 3M16A 2DJLA 4BWLA 4S1FA 2A6LA 1TTQA 2DZXA 3PUEA 4JTIA 4KFNA 1TPEA 3STCA 1PL9A 2WO5A 2FQIA 1MEWA 1Z41A 5KZDA 2ZRVA 1SW7A 1XBZA 2NV2A 2WSRA 4K7YA 3H54A 1QOPA 1KFJA 3LBCA 1LOSA 3O6CA 4O11A 2C19A 3M41A 3E96A 3EXRA 1SZNA 2DZVA 4IPJA 3GXPA 3W7LA 5LNWA 3HMJG 1DVJA 3P8JA 3QZEA 1PIIA 5HUOA 3MBFA 3LXAA 3B06A 1QDSA 4MVAA 1A5SA 4WOQA 1AK5A 1L9WA 3HF3A 4CCDA 1LBMA 2QCLA 3KVKA 3QPZA 3BW3A 4AHPA 3LTYA 1JCJA 5IBXA 1AW1A 4OGZA 3ELFA 3W88A 3B0PA 4WY0F 1GVOA 2X16A 3P80A 2NUYA 3HOJA 1FUYA 1H63A 3M47A 1Q6OA 1T99A 4E2DA 1W0MA 1GT8A 1S5VA 3BG5A 3KRSA 1N55A 4K7VA 5HULA 3W7MA 5FEZA 2A6NA 5AHEA 2E6YA 3CWNA 1ICPA 3MJYA 4N02A 4UIOA 5AHIA 3IIZA 4N4PA 3MHGA 3RU6A 4LVFA 1A53A 2BSLA 1OYCA 5CZTA 3W73A 2H3BA 4O15A 1L2UA 2J9ZA 1TQXA 1W3NA 3NQAA 3SR7A 1FX6A 1HO4A 3TAKA 4WY0A 3SSJA 5H2ZA 4NNBA 3DGRA 1OFOA 2CLIA 3O15A 2CLOA 4JTJA 5KZEA 3W71A 3GAKA 3C0JA 3N14A 2CLHA 1B9BA 4UR7A 4RZ4A 5I3KA 1IXOA 1SO6A 5BMXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2W92 A;  3L5L A;  5HJY A;  2ZTJ A;  3A4J A;  3M44 A;  2B4G A;  3KFT A;  3MP5 A;  5CSS A;  1UIP A;  3W7J A;  4PRR A;  3R0U A;  2ACU A;  2PCQ A;  4C6F A;  1LL4 A;  3LXC A;  4NIL A;  5LA1 A;  3PM6 A;  1CTN A;  4W84 A;  4INF A;  3IIX A;  3G22 A;  4I6V A;  1Z44 A;  2D1Z A;  3M64 A;  1BVN P;  1RBA A;  1OYB A;  2WMF A;  4IUG A;  2J7F A;  1E4L A;  5BMW A;  4UTF A;  2HTM A;  5D9M A;  5DBT A;  4QRN A;  2H8X A;  3GDT A;  2AQV A;  3I4E A;  3WQ5 A;  6XIA A;  1RBL A;  2VMF A;  4GNV A;  1IWB A;  1TA3 A;  3BIC A;  4X2R A;  3NO5 A;  2PDX A;  3BLE A;  1ITC A;  3F7J A;  1E73 M;  1B90 A;  1F61 A;  1VFF A;  3DFQ A;  4AX7 A;  4WDT A;  3ITX A;  2ZFA A;  1V79 A;  1EIX A;  4H2H A;  5EFD A;  2DQX A;  2PP0 A;  3SY1 A;  1QU4 A;  2NZL A;  2CXG A;  4AD3 A;  2V81 A;  3S46 A;  4PCP A;  3HV8 A;  4MFD A;  2NQJ A;  5AKQ A;  3UWE A;  4RCX A;  3EPM A;  1QRQ A;  1DQU A;  3AHY A;  1HP5 A;  3WEN A;  3WN6 A;  4A6G A;  1GYN A;  4QP0 A;  4IUO A;  3WNN A;  3CEP A;  3VNL A;  3M9Y A;  4GBU A;  4ICN A;  1XIB A;  3BOF A;  4QDM A;  3ONB A; 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