3W73 | Genus

Total Genus 105

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	105
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-4-129 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	105
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-02-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w73A02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w73A01

2FPVA 2BX7A 5KZEA 1M7OA 3G0SA 4ALDA 3TQKA 2VFFA 5I3KA 3P61A 3BW2A 3TSDA 3HOJA 4UTIA 1MXSA 2E68A 3OVQA 4XKYB 1YYAA 2Y63A 1ME9A 1SUXA 3S6DA 4ZQMA 3TH6A 2FB2A 5LGXA 2FIQA 1H1YA 5DY2A 1FWRA 4FNSA 5G5IA 1OFPA 3NQFA 2QUVA 3CB8A 3INPA 5DLCA 4N9BA 4MZ1A 3STFA 1SZNA 3P5YA 2I1OA 1FCVA 3LGEA 3Q37A 5F2GA 1L6WA 2B7PA 4ZQPA 2XN0A 3B4UA 1KTCA 3DI1A 4UTWA 1QO5A 2YYUA 3TK7A 1QCWA 3PB0A 3NQAA 1W31A 4AMAA 5AB3A 2RKXA 1TQXA 2C3ZA 5D03A 2E77A 4JS3A 3U8GA 3W7EA 5HNRA 3G1YA 5KTLA 3W75A 3PR2A 1JCXA 3W2JA 3W83A 1P1XA 1RVGA 2QCCA 1YXYA 1G7UA 3W2MA 3SGZA 3CHVA 1KA9F 2WSQA 1OX4B 4LS0A 3B06A 1KV5A 1X1OA 4QITA 3BGJA 4IGHA 5TBOA 3B8DA 3EXSA 5DN1A 4IOTA 3WJXA 2DORA 4BI6A 5FEXA 1JVNA 4MJZA 4TR9A 3VCRA 2A6LA 4C1LA 5LHFA 1Q6RA 1H7OA 1G4TA 1W5QA 4MY8A 4WUIA 4XKYA 4MYAA 4QSHA 4N4QA 1XBXA 5AFDA 1TPDA 1YLVA 1XBZA 2AQWA 3K30A 4GUGA 3M43A 2J9YA 4LW7A 1TYGA 2C18A 3NPVA 3ZFHA 3M6YA 1XFBA 2Q3RA 2WNNA 3DFNA 2VEMA 1GYLA 2C6QA 4O14A 1NF7A 3H54A 1YTKA 1QPNA 4XBSA 1LZOA 4UFJA 2ZZ5A 1P4CA 5CPOA 3DGRA 1VLIA 3NQ6A 5EKYA 4K7VA 2QUUA 2V30A 4R34A 3ANYA 1FCQA 2VFIA 4IWWA 1YPFA 5G2WA 3GXTA 3GR7A 3GX9A 3W76A 2ZRUA 3W1AA 5DBTA 2A85A 1HL2A 3QW3A 4M7SA 1G7VA 4NJKA 2PRHA 1JJKA 3W74A 3ABOA 1OX4A 3UD6A 2H6RA 1T99A 1W3IA 1Y0EA 2RDTA 4AHOA 4DBEA 5L9FA 3SSJA 3NL6A 2VXNA 5EY5A 1P5BA 1XBYA 2CLKA 3T78A 3VE7A 1ME7A 1OFRA 4JX6A 5I3IA 3NQGA 5AHFA 3G0UA 3M9YA 2ZDRA 3BO9A 4Z1CA 4O1AA 3P82A 3G8EA 1YADA 1YXCA 4TMCA 1F7BA 1EPXA 1GQNA 3MWAA 3ATYA 3QW4B 2ABAA 3NQ8A 3PG9A 3GDTA 2QDHA 3GB6A 1UUOA 3O16A 4EF9A 4JDYA 4K37A 4JY9A 4KKXA 4LRSA 1I2NA 3QM3A 3TSBA 4UFIA 1JULA 1EP1A 3GZ3A 3SGUA 1GVQA 4O0ZA 6ALDA 2ZA2A 4BF9A 2F7FA 3PUDA 3RNDA 3TQVA 2E6AA 3SFKA 1SO5A 1VQTA 1MEWA 3EKLA 3NO5A 5H91A 3W7CA 5DXXA 1ZAIA 3BARA 4H3DA 3ZS4A 2C13A 4DELA 3M47A 2Z6IA 3CPRA 4CCDA 1B9BA 1XDLA 4M19A 4NXSA 3W7JA 4LV9A 2VKZG 2P10A 4UTWC 1H7PA 1FY6A 4AHQA 4JN6A 5I3HA 3S1UA 3OEXA 5K2ZA 1MEIA 5FF7A 2EHHA 2NV2A 2Y89A 3P7YA 3DKLA 1WBJA 4TX9A 2PE4A 3T7VA 4EF8A 4BWLA 4JTGA 5LNSA 4XWUA 4WD0A 1TQJA 1MZHA 3CQ0A 3TU9A 1KFEA 4UNLA 1BKSA 3C6CA 4XUGA 4EVZA 2ISWA 3C52A 2W0UA 1H60A 2BSLA 2HS8A 3SY5A 2KZHA 5HWNA 3UY7A 1BEUA 2DZVA 2OT1A 3W6YA 5MHBA 1ALDA 2GQ8A 1R47A 2ZCGA 4O13A 3ATZA 4UUIA 2YW3A 2NWSA 2C15A 1TPB1 2DU2A 3STEA 2VFDA 3S5YA 1LRQA 4M6PA 4NJIA 2V2HA 5F2MA 1W1ZA 4ZMGA 1VYRA 3PBWA 4AF0A 1O94A 3TNOA 3UYCA 2X1UA 5LGZA 2J27A 3MBDA 1TV5A 2V9DA 3ABSA 1JCLA 1XUUA 4Z0SA 1JCMP 1LP6A 3LCGA 3WJSA 2JGYA 4CQ9A 4OV4A 1G4PA 1EP3A 3M41A 5E1QA 4XBKA 2B7NA 2QCGA 3GAYA 1KBJA 4CNPA 3L0KA 4Z1AA 3NYZA 1RQEA 1A5CA 5IBXA 3FKKA 4OBTA 4Y96A 2E6DA 3HG5A 5FF4A 1SZFA 4PL2A 2ATMA 3Q2DA 1AL8A 5DCEA 4PH6A 3LCHA 3E96A 1XUZA 3W7QA 1C8VA 1YDNA 3TE9A 1PS9A 1LTDA 4IX2A 4FNQA 3UPWA 3PG8A 4HPXA 2JBMA 5F2IA 1IGSA 5BNKA 2E6FA 1G69A 2VFEA 3LBMA 2TMDA 1TPC1 1FCBA 3TROA 2GQ9A 2CLMA 3L2IA 4O17A 4N4PA 3BPWA 3LXBA 3PBVA 4QQ3A 4LY8A 3EWYA 2H3DA 2B0MA 1D3HA 2GOUA 4CNNA 3W86A 3LM7A 3DENA 3GDKA 1GPWA 5FI8A 2BLEA 5AN7A 2OX1A 4JTEA 5EYWA 2CU0A 4UFKA 3NGJA 3ZR4A 4UMCA 1PCWA 5K7JA 3VNDA 1W37A 3IIVA 4HKPA 5AOUA 2F84A 1ZY9A 5KZDA 3W88A 3QC3A 2J9ZA 3I65A 4UNKA 1TTIA 4CLMA 2HSAA 5D33A 1E51A 3LB0A 4UTUA 4MOZA 1OFAA 1VYPX 1F76A 1JQVA 2V81A 3LV5A 4JYFA 3A24A 3EXRA 1L9WA 1F05A 3WJYA 4A3UA 5AHNA 3TJLA 3QJAA 4NUWA 1VRDA 2FB3A 3EX4A 4GWEA 1GYNA 4NT0A 4HNUA 3MUXA 3W3OA 5ABTA 4JX5A 3R89A 3S5NA 3NEVA 4FO4A 3LRMA 3LHZA 1IXPA 2QCMA 1J2WA 1JR1A 3NQ7A 3EX2A 1SZGA 4O28A 5FEZA 3CWNA 2QCDA 1VS1A 2NV1A 4JTFA 2FLIA 3IIXA 4RLIA 2RFGA 3UWVA 5G4EA 1AG1O 1ZNNA 2HS6A 1H51A 5I3GA 5D32A 4MZ8A 4GNJA 2VENA 2Y7FA 5HR7A 3W2KA 4XTIA 3DFSA 5IM51 3HG4A 3RK8A 5LKYA 4Y8FA 5D2VA 2AGKA 3C2OA 3HBLA 5BW6A 2GPTA 2VELA 5CPLA 4RV8A 3DH7A 3IVSA 2BWGA 1W3TA 3MW7A 3THAA 2DZPA 4I7UA 1UJPA 3U2OA 2A7NA 1FCUA 3AO0A 2QF7A 1VHNA 2CLOA 2YDAA 5EPDA 2GJNA 4Z0JA 5U4NA 3EB2A 3G1HA 1SSDA 1LRNA 3NQDA 3QPZA 4IUOA 3B0VC 2ZA3A 3TKFA 3DZ1A 4BWLC 3TMLA 3QFEA 1EIXA 3VFLA 3M16A 1A53A 2H3BA 2BTMA 1QPQA 3PAJA 2ALDA 2ZA1A 1OFQA 3HMJG 2FFCA 4KWVA 5EL1A 3SI9A 4LNYA 3E0IA 1H50A 3TV8A 4I7VA 2C0AA 1LOQA 3KVMA 1JUKA 2FQIA 1I8JA 4ONVA 4UR8A 4L4MA 1B57A 1LLWA 2JK2A 2GVJA 2W79A 1TB3A 3S5ZA 2QAPA 3OBKA 1SZEA 5HUPA 1XCFA 3QSRA 1EEPA 2Q8LA 1TREA 1HUVA 4B5NA 5BMWA 1FUYA 4HIBA 4R7JA 2TPSA 1ZFJA 2DZUA 1FXPA 5AYXA 4ADUA 3TMQA 5I3FA 4WOZA 1JRBA 2RHGA 2QDGA 5FF3A 1O95A 1OYAA 4JGDA 1VCVA 4NZJA 2WO5A 5F4SA 1H7NA 4UIOA 4UCGA 1KM2A 3W7RA 4KWWA 4H4IA 1F74A 1PIIA 1U5JA 2YR1A 3G24A 4I9AA 4KFPA 1HTIA 5T26A 3JS3A 2O7QA 2Z6JA 2G96A 2ZZ7A 2ATSA 1CX9A 5DCDA 1DV7A 2PCQA 4WJEA 1WBHA 3UY8A 1QO2A 3CIXA 1TTQA 4HNNA 1GTHA 3W1LA 4NJHA 1TRIA 4A2SA 3JR2A 1QOPA 4FX7A 3BGGA 1M5WA 4DO5A 3W2NA 3P5ZA 3OIXA 4Z08A 1OFOA 3PUOA 3TW6A 4RCXA 3UWQA 3RU6A 3QMRA 3S5OA 1KV8A 4DF1A 2GQAA 4DPQA 2IQTA 4N2YA 3LI1A 4BI7A 3LCIA 5AC6A 1WV2A 4JTLA 1I2QA 4RK8A 2WKJA 3W7PA 4WOQA 1DQXA 3L9CA 1O60A 3QQ0A 2ZZ2A 3CLMA 5CSRA 4RXFA 4AWUA 3WJWA 1AW2A 2Z1BA 1G4SA 4M7TA 4IPJA 4P61A 4WXYA 1WX0A 4NNCA 3SECA 2ZTKA 1QDSA 3GKAA 4MLRA 1YDVA 2PRMA 5K3VA 5D2WA 3UPBA 1P0NA 4LT9A 3PB2A 3S1WA 3L5MA 3LHUA 1Q6LA 1YPIA 1X8FA 1ZAHA 3A9IA 3H55A 1SO4A 2VEIA 3GXNA 3IVUA 1JCYA 3GR8A 3G1XA 2WPBA 3W2UA 5TQLA 5BMXA 3TFXA 2JKAA 4GXMA 3PSVA 2GVGA 4YWIA 3OA3A 3LXCA 4UC5A 3NQCA 3V1PA 1N7KA 3E12A 1DBTA 1GWJA 2E5BA 3G1AA 4MLJA 3L67A 3TFCA 2YPIA 1F73A 4RX0A 3O05A 4JXCA 3HQ1A 4MUZA 4NJJA 3G18A 1G6CA 1VHCA 3HF3A 4FIRA 1K8YA 5DCBA 2NXGA 2Y70A 1TV8A 2C1HA 3IV3A 1C29A 4MJMA 2VFGA 1DHPA 5HULA 3E02A 3NZRA 2ZQ0A 4Y6GA 1K8ZA 3P8IA 4A22A 5D09A 1ADOA 4K7YA 3Q94A 4Y90A 3D0CA 1KLZA 1PV8A 3KAOA 3TC6A 2B7QA 3QF0A 5CGQA 4BR1A 1NFBA 3GXPA 3QEZA 3LCLA 1TO3A 3HGRA 3M5ZA 2WSRA 3LLDA 4FNRA 3TAOA 4PL1A 1XM3A 3KRZA 4O54A 3QMTA 2I9EA 1DJNA 2OT0A 3LCWA 3S42A 1GZGA 4RJEA 1FDJA 1FQ0A 2GUUA 4NJGA 4X3ZA 2C16A 4YLWA 5FF0A 5HWMA 1F2JA 2CWNA 3S9YA 1F5ZA 1RD5A 1QWGA 1W8SA 1OFEA 1I4NA 4JICA 1EP2A 1O5KA 4NX5A 2I14A 2GJLA 4JIPA 1J5TA 1N8FA 4TU1A 1FXQA 3S1XA 3P74A 1OX6A 4PA8A 3HGOA 1EX5A 1M6JA 2JGQA 5KMYA 1CW2A 5BOOA 1TMHA 4K8EA 1L6YA 4E2DA 3IGSA 4E0CA 4EOUA 4UTLA 3FJ6A 1OG0A 1LLZA 5BRBA 5CKSA 3P80A 4ORIA 4QJ1A 3IIOA 4TMBA 3G1FA 1D3GA 4TIMA 2RH9A 3GVGA 3MP3A 3Q58A 4CNOA 1KM4A 3PBYA 1XBVA 1KW1A 4AVFA 5G2HA 4KFOA 1RR2A 4FNPA 1Q45A 1XKYA 1DVJA 5A8GA 4O11A 1KM3A 2PURA 1IXQA 3GNNA 4LVAA 3IVTA 1K7FA 3L66A 1LORA 4ZQOA 2E5DA 4JX4A 2X16A 3SZ8A 1OFDA 2ZZ1A 2Y7DA 2ZYFA 4MKNA 3C4UA 1FWNA 3UWZA 1AL7A 1W3NA 3KRSA 2V0TA 1THFD 3LHYA 1EB3A 1GJPA 2CLLA 2VFHA 2PC4A 2V5BA 4OV9A 3EX3A 1H62A 3IRDA 1ICSA 5F1UA 1LROA 2CW6A 3USBA 1UUMA 3EXTA 3NPXA 3M44A 4O12A 1VC4A 3L65A 3IGXA 4LWWA 3W22A 1DL3A 1L6SA 1HO1A 1YTDA 4GE8A 3G1VA 1IXOA 3DU0A 4IMGA 5D30A 5HINA 2VOMA 5FESA 4O0KA 2C19A 2PRLA 3C61A 2ZZ6A 2H90A 3NOEA 1R2RA 1LDCA 2WNZA 4I7WA 1M7PA 1WQ5A 3EWXA 1I2OA 3TQ0A 4GC4A 2X2GA 3KVKA 1D9EA 2G95A 3LRLA 5FEWA 3G3DA 4BK9A 1FWTA 4FXSA 1UBSA 5C2XA 2J24A 4WZHA 2CZDA 3C8FA 3DFQA 1K8XA 1OF6A 5D02A 2YW4A 1B4EA 5F1VA 3HGJA 3EEGA 5SWUA 2E1DA 3O6DA 1VLWA 3N2XA 4K39A 4YL2A 4FEZA 3LTYA 4IQLA 4NQ1A 2TYSA 3FOKA 1ME8A 1XL9A 4RKAA 4ZQRA 3PF3A 5GVJA 4OWGA 4D2JA 3MO7A 1PE1A 1F6KA 3FS2A 4Z1DA 1VCGA 3ABRA 3YPIA 4LS1A 4HN4A 1AW1A 1GT8A 2V5LA 3M5YA 5HWJA 3NQVA 2R94A 1KTNA 3C0JA 1QPOA 3BVJA 2NUWA 2NX1A 1GOXA 1VR6A 2E6YA 3IIZA 2AAMA 2QKFA 4R53A 6TIMA 5LNWA 4W9TA 5LNVA 4CQAA 1GVSA 4GUIA 3JRKA 1TPWA 1WDWA 2P1FA 1KTBA 4MFEA 1H63A 3G8RA 1KLYA 4BFAA 4A29A 3OG3A 1MSSA 4LRTA 1I2RA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3W73A

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