3BK0 | Genus

Total Genus 94

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	94
sequence length	257
structure length	257
Chain Sequence	KELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal Structure of Human Orotidine 5'-monophosphate Decarboxylase Complexed with 5-CN-UMP rcsb
molecule keywords	Uridine 5'-monophosphate synthase
molecule tags	Lyase
source organism	Homo sapiens
total genus	94
structure length	257
sequence length	257
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2007-12-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00215	OMPdecase	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3bk0A00

2NV2A 1TCDA 2ZZ6A 3I65A 5AYZA 2WJZA 2RKXA 1JULA 4XKYA 4AXKA 2QCCA 5D32A 2B7OA 4HSOA 1B9BA 2Z0IA 1A5SA 5AYXA 4O17A 4DPPA 5CPNA 3L0KA 2JGYA 3T55A 3JR2A 4FNPA 1LRQA 3UWUA 2EF9A 3W1TA 5T26A 3LTSA 2YYTA 3MP4A 3O63A 5GVJA 1HO4A 2ISVA 5FF7A 1QAPA 4Z1CA 3B4UA 2FLIA 3HGSA 3W74A 3DFNA 3IV3A 1YDOA 1OX4A 1IXNA 2B4GA 1GG0A 1JVNA 3O15A 3ANYA 3NAVA 3VFLA 3PS7A 4S2BA 5BRBA 1F2JA 5D38A 4S1FA 4I9AA 3NQ6A 3PSVA 4UMBA 3R13A 1G67A 3MW7A 1ME7A 4GUGA 3FJ6A 2FB2A 4O0ZA 2ABAA 3HB9A 4ZL1A 1AMKA 2NXHA 3DFTA 4PODA 4ADTA 1LOLA 1UCWA 3G8EA 1FWWA 2ATSA 4C1LA 2V2DA 1G4SA 1VR6A 4X22A 1IGSA 5CZTA 2DP3A 4LVBA 4PTNA 1JCMP 2JGQA 1OFRA 1TJPA 5G1TA 1D9EA 3HO8A 5LHFA 2C19A 1DOSA 5F2MA 5EYWA 5AC8A 5FESA 1LLZA 3M5YA 3W75A 3MWAA 4UNLA 3FOKA 3FFSA 1S5VA 1O5KA 2VFDA 2V9DA 2OCZA 3GDKA 3TDFA 3B06A 4DEFA 3QPYA 5C5YA 4U4MA 3FYPA 3Q58A 1EUNA 1DQWA 1GPWA 3C2VA 4TIMA 2NUXA 3N73A 2Q3RA 4ADSA 5HWMA 1QOQA 4M7SA 4LVFA 2QKFA 1SPQA 1TPDA 1KV8A 1JRBA 1OX6A 2GJNA 2CZDA 4GUIA 3T78A 5FF0A 1WAUA 2P0OA 1H7WA 3BARA 4K7VA 3PBWA 1QOPA 4ZQPA 3L21A 4LC6A 3TSMA 1XUUA 4QITA 5A5WA 3W84A 4UMCA 3CQ0A 4NJHA 3NPWA 4UCGA 1TO3A 4EIVA 5HUOA 5H2ZA 2E09A 3INPA 3PG9A 5BMXA 1X6UA 1VC4A 5D2WA 4QAIA 4XBKA 4E2BA 1H7RA 1YDNA 1UUOA 4EF9A 3LV5A 3EKLA 4UTUA 5HWJA 2VFGA 4N02A 2EHHA 4IMFA 3DXIA 3N2MA 1KM1A 3W22A 4RXGA 1K03A 4DQWA 1VYRA 3GAKA 4K6AA 3L2IA 3TSBA 3MI2A 4JIQA 3STCA 2W79A 3BW3A 3ATYA 3UPBA 4FIQA 1QDSA 3MMTA 3IVUA 3KX6A 5HINA 3LOTA 1YDVA 1VLWA 4CLMA 3G22A 3MBDA 2CZEA 1WXJA 1XBZA 1RV8A 3PULA 1F05A 1OJXA 1NF7A 1OVDA 1LRTA 2ISWA 1HUVA 3S42A 1ICPA 4UTWC 4ALDA 3A21A 4RJEA 4IPIA 1MO0A 3Q2DA 5I3GA 3A24A 3TJXA 4XWUA 4IXHA 2A85A 1Z48A 1XBYA 1YTEA 3LRKA 5EL1A 1XBXA 3FEMA 1VS1A 5I3KA 1EIXA 3VNDA 1I2OA 4OBTA 3W3OA 5H91A 3ABRA 3HOJA 3MYPA 1OYCA 3IIOA 3IIPA 1JR1A 4MPQA 2CZ5A 3KVLA 1BKSA 2CLMA 3A5VA 3BPWA 1GQNA 1SO4A 3OIXA 2C14A 1MSSA 2A6LA 4MY8A 1HFBA 3GK0A 3W87A 3B0UX 1SUXA 2V81A 4MYXA 1XM3A 2C18A 3E12A 3OVQA 5G4EA 5U4NA 3UD6A 2Y70A 1R2TA 3ABQA 2V2HA 3TV8A 3NGJA 4AEOA 4LUJA 1W54A 4NX0A 4P2VA 3QQ0A 4O57A 3S5ZA 4LRSA 1W5OA 3F03K 3S5YA 4NXSA 2A6NA 5FEPA 3HQ1A 4HHPA 2VENA 3W1QA 2B7NA 3DHFA 3F1QA 4JS3A 4XZ9A 3DFOA 1NSJA 2VELA 1OX5A 3M5ZA 2V8ZA 1KM6A 4O1CA 2RDUA 2V82A 1SU5A 4XTDA 3MI3A 1P5BA 3T4CA 4IOTA 1GVOA 2JK2A 4JTTA 4O16A 1LCOA 5DCDA 5AHIA 4A2SA 4JYEA 1IF2A 4PFMA 4GUJA 4P61A 1KFBA 3WFAA 2ABBA 3I7QA 3W85A 4Y90A 3LBMA 4TX9A 1XFBA 2DU2A 3VE7A 3TFXA 5C6MA 2BX7A 3W7HA 4ZQCA 1FWSA 4MVAA 3BO9A 3GXTA 1T0OA 3P60A 1W3TA 1C9DA 3PWAA 4ZQNA 5CKSA 4A3UA 1TPUA 3TCEA 3W1LA 5HUPA 4HSNA 2FFCA 2PCQA 3G1FA 3IRDA 3PUDA 3DHDA 3W71A 5F1VA 3QRHA 2TPSA 5DCEA 2NLIA 1W3NA 4POCA 5DLCA 3MO7A 4LRTA 3BGJA 1QMLA 4LC8A 2OT1A 3W86A 2YFNA 1YPFA 3B05A 3P8IA 4O28A 4NUWA 4UXDA 3TXZA 5BNKA 4ZVJA 5HNRA 3EX2A 2OX1A 2FPVA 4FNUA 4I7UA 3W9ZA 4RK8A 1ZAIA 1SR9A 1TQXA 1NFBA 4Z1DA 4O14A 5AHNA 1TPFA 4NJGA 1W5QA 3LXCA 2X1SA 5AHLA 3KRSA 1N7KA 1BTMA 1EP3A 4GE8A 4ZQRA 4AHOA 3IGUA 1L2UA 2ATMA 4JY9A 5DXYA 4FB7A 1FDZA 4IWWA 1RQEA 2Z1BA 3KVJA 4UTLA 2VFHA 2DZWA 3H55A 3C2OA 1HL2A 3TMLA 2YZRA 5K4ZA 5AHMA 2Z2UA 1FWTA 3QPZA 3A9IA 3UWYA 3HPSA 1JRCA 1Q6OA 1YXYA 4FXSA 1XDLA 3B0PA 1WOBA 4RLIA 1FX6A 4BI7A 2H8ZA 3BLEA 3P8JA 2FDSA 1QPQA 3FYOA 2VFEA 5K3VA 3NA8A 1Z41A 2OT0A 2GQ8A 1RQHA 2UV8G 2GVGA 2KZHA 3CLMA 3UNDA 2YGYA 2Y62A 2QCGA 3M0ZA 5K9XA 1FUYA 1W37A 5K7JA 5KZDA 3B04A 3PAJA 4UTIA 5KITA 4GNJA 3M5XA 3TK7A 3DFQA 1UB3A 1OFEA 1ADOA 1U5JA 2ZQ0A 1ICQA 3S6DA 3TQ0A 4WY0F 4K8EA 3SGZA 1LOQA 1KM2A 4IMCA 2QDHA 3M9YA 1S5WA 3CM4A 3GXNA 2ZDRA 2FJKA 4Q4KA 2QR6A 3QH2A 1TTQA 1OF8A 2QCLA 3W7CA 3KRZA 5CPMA 2NX3A 1SFJA 3BVJA 4Z0JA 3O6YX 5G5IA 1Z42A 4MLRA 2QUVA 2X16A 1SW0A 3E9AA 2X1UA 1W3IA 4JNMA 1WA3A 3LM7A 1Z44A 4H3DA 3GIYA 5CZSA 3W7LA 1VJIA 2QCEA 1H50A 4OGZA 3TQKA 5CPLA 4X3ZA 4AF0A 3QF0A 2X2GA 5DN1A 3IIVA 3CTLA 3I7RA 3TU9A 4N9DA 5C54A 4EWND 4H6KA 1ME8A 3MUXA 3OBKA 3EWBX 5KSWA 3CIXA 3EWXA 2QCDB 3KHJA 2E5BA 1WDWA 2RFGA 3UY8A 1I2PA 4N4PA 5DY3A 5E1QA 2ZFAA 3S5OA 1G69A 1EWDA 2RHGA 3TC6A 1UJPA 1ZENA 2GVLA 4FF7A 4IMGA 3HGRA 3P7YA 2YSWA 3UWZA 1JCJA 3L66A 3NM1A 4HNUA 2NWSA 1VLIA 3W1NA 2BXVA 3NL2A 3G1YA 1W1ZA 4TR9A 4FEZA 3NG3A 5EBUA 4AVFA 2NZLA 5EA9A 4FX6M 2E68A 1KM3A 5HWNA 2Q8LA 3JS3A 1LBFA 4GJ1A 4JXCA 3TW6A 3O6DA 1GTHA 4JTLA 4W9TA 1SZFA 3C2FA 3EXRA 2C0AA 1VQTA 2QEZA 2BWGA 4DF2A 1TTJA 1YLVA 4NU7A 4O54A 5FF4A 2CLHA 4LW7A 3THAA 3UXAA 3LCFA 2W0UA 1V7YA 4MZ1A 4NNCA 5BMWA 1VGAA 3QSRA 2O7SA 3IIZA 1B4EA 2H3DA 4LV9A 3LCHA 5CGQA 1A50A 3U6WA 2V5LA 1H7PA 1AK5A 3NQGA 4JDBA 2R8WA 3GVGA 4DXVA 5J5RA 5K4XA 3CC1A 1OK4A 1J2WA 4Y8FA 2PURA 4GUHA 2FQIA 4JD4A 3S1UA 1FDYA 1WBHA 3P5YA 4OV4A 3LLFA 4WUIA 1V5XA 2BLEA 1E51A 1TPB1 1R46A 3TIMA 2WQPA 3O1NA 4JTHA 2E6YA 3C2EA 2P10A 4RCXA 4BWLA 3KOFA 3W2UA 4WXYA 5D2XA 4K7YA 3P5ZA 3EX1A 1KM4A 2ZA1A 3QSTA 3ZR4A 1AW2A 3U8GA 4AWSA 4FX7A 3RNDA 3R8RA 4PC8A 2I1OA 3TMQA 3CU2A 1VH7A 3W7PA 1PCWA 1B57A 5SWUA 2A7RA 3VE9A 3W7JA 3WJXA 1JJKA 1LBLA 4S2CA 3DKJA 1VZWA 3UQNA 3UXDA 1EWEA 5LSMA 1DV7A 3A23A 3LBCA 3CPRA 4YCOA 4IMEA 5E93A 4IMDA 1PV8A 3BLFA 3DBPA 3RFAA 1LP6A 1LROA 2X1TA 5J5DA 3SJ3A 2JKPA 4QNWA 3BW4A 4AWTA 4A29A 2YW3A 1L9WA 2CLEA 5TQLA 5LNSA 4YMZA 2ZRYA 1EA0A 1JCXA 5L6UA 1KM0A 2QAPA 4LWWA 5C55A 1ZFJA 1WQ5A 3GR8A 4R53A 4K39A 1WBJA 3GDLA 2ZZ4A 1KLYA 2C1HA 2DZXA 3G3DA 2QUUA 2EAWA 4KWWA 3QC3A 4NZJA 4NJJA 1H62A 3WK2A 1SO6A 5AC7A 3THQA 1LDCA 1W8SA 4ORMA 4K38A 1PIIA 4KFNA 5EPDA 1H5YA 2ZTJA 3LCGA 5BOOA 1G4PA 3IIXA 3NQVA 3L0NA 3P81A 3BG5A 1DORA 4FNRA 2QDGA 3QYQA 2DZTA 2YYUA 2BZNA 1WX0A 3Q94A 3WJSA 1XL9A 2XN0A 3SGUA 3PR2A 2BTMA 1NAL1 1I2NA 3P61A 3FKKA 1VHNA 1ZCOA 3MBFA 4WY0B 1QCWA 5I3FA 4EOUA 2NV1A 4JYFA 1F73A 3OVRA 4GXMA 3D0CA 3LXAA 4Z08A 3N3MA 3PBUA 3HG4A 4KKXA 3M1ZA 3P80A 2QCDA 4HPXA 2Z6IA 4HIBA 4PEKA 1SSGA 1TV5A 1OG0A 3DI1A 4HNTA 3LRLA 2WSYA 3NZRA 4CNOA 5FEXA 1QPOA 3NPXA 3HMJG 3O8AA 3TW7A 4ORIA 1BWLA 1OFQA 1ZHAA 3BG9A 4M19A 3BG3A 2A4AA 5D02A 3U2OA 1AL7A 1I8JA 5AN7A 1DL3A 3P84A 4MZ8A 4WOZA 5F4XA 3NL6A 4O1AA 5CG7A 1RVGA 2FPYA 1RZMA 4PL2A 2VEPA 1ZNNA 3W2JA 2WO5A 2OZ0A 4AHQA 3M6YA 4Q33A 4JTEA 5IM51 2ZA2A 3KFTA 3RF9A 3W2NA 1GVSA 1DJNA 5F2LA 1ZAHA 2PRHA 5AFDA 3G1DA 2VFFA 3PF3A 1THFD 3NR0A 3L68A 2ZZ5A 3O16A 4CCCA 2V0TA 4A22A 1JQVA 1OFAA 5AHFA 4O1DA 3CWOX 1MXSA 3NPUA 4NNBA 4FHAA 1D3GA 2C6QA 5G2HA 2G5WA 4UIOA 4LNYA 1GZGA 3EWUA 3G0SA 2E77A 4K37A 3G1SA 3P67A 2Y7GA 1K7XA 1SW7A 4MIMA 2HTMA 3C6CA 3DENA 4Y9AA 3NPVA 4Z0SA 4AH7A 3G1HA 1H7XA 2WV8A 3UZ5A 5AB3A 3FKRA 4U28A 4D2JA 2OJPA 1OABA 3EXTA 4JN6A 4ONVA 4QNEA 2Y88A 2DORA 4QSHA 5D2TA 3TUUA 2Y6ZA 3FIGA 1SO5A 1A5AA 1FXQA 1H63A 3W7QA 1TRDA 2OMAA 1EX5A 2PE4A 5CPOA 3T7VA 1K3UA 1OFPA 5DBUA 1TYGA 3E0IA 3OA3A 4PA8A 3RU6A 3S1XA 4GRSA 3P62A 3W2MA 4RKAA 5K9DA 1QFEA 5EKYA 5F4WA 4BWLC 4MFDA 4IPJA 2J27A 3Q37A 1RPXA 2A2IA 4NVTA 4UFHA 3VKJA 2P1FA 1VPXA 1GJPA 1LM1A 3W7MA 1M5WA 3NM3A 4LS1A 1QPRA 3P82A 1VYPX 1SW3A 1LRNA 4CQAA 1FQ0A 1XBVA 3GZ3A 3NQDA 5C2XA 3K30A 4M5PA 3VI2A 4KWVA 3IGSA 1CX9A 2JKEA 3LCIA 4N4QA 1M6JA 2DZSA 4CCDA 1ZJIA 3M43A 4DF1A 3W7RA 4MUZA 2BSLA 3WK1A 4H4IA 3F4WA 4J9JA 4UTKA 3CB8A 3L65A 2Y7DA 4UFLA 3SR7A 1FBAA 1F7BA 3N9RA 2PC4A 4FX8A 2RH9A 4AMAA 3LERA 4WOQA 2QJIA 1OF6A 2X30A 1QWGA 2C13A 4DPQA 1SFLA 1JQXA 4UR7A 4WY0A 3DZ1A 3VCRA 3GNDA 2DZUA 3TFCA 1ML1A 1TV7A 3FS2A 4IUOA 4L4LA 2DZPA 3W73A 3TNOA 2CLOA 4QJ1A 5G2WA 1LZOA 2YX0A 4N9CA 1QPNA 4L4MA 3W7GA 3R2GA 2CLIA 3PUEA 5MHBA 4OQVA 3W23A 2R94A 4EF8A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3BK0A

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