1E4LA

Crystal structure of the inactive mutant monocot (maize zmglu1) beta-glucosidase zm glu191asp
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
490
structure length
490
Chain Sequence
MLSPSEIPQRDWFPSDFTFGAATSAYQIEGAWNEDGKGESNWDHFCHNHPERILDGSNSDIGANSYHMYKTDVRLLKEMGMDAYRFSISWPRILPKGTKEGGINPDGIKYYRNLINLLLENGIEPYVTIFHWDVPQALEEKYGGFLDKSHKSIVEDYTYFAKVCFDNFGDKVKNWLTFNDPQTFTSFSYGTGVFAPGRCSPGLDCAYPTGNSLVEPYTAGHNILLAHAEAVDLYNKHYKRDDTRIGLAFDVMGRVPYGTSFLDKQAEERSWDINLGWFLEPVVRGDYPFSMRSLARERLPFFKDEQKEKLAGSYNMLGLNYYTSRFSKNIDISPNYSPVLNTDDAYASQEVNGPDGKPIGPPMGNPWIYMYPEGLKDLLMIMKNKYGNPPIYITENGIGDVDTKETPLPMEAALNDYKRLDYIQRHIATLKESIDLGSNVQGYFAWSLLDNFEWFAGFTERYGIVYVDRNNNCTRYMKESAKWLKEFNTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Zea mays
publication title The Mechanism of Substrate (Aglycone) Specificity in Beta -Glucosidases is Revealed by Crystal Structures of Mutant Maize Beta -Glucosidase-Dimboa, -Dimboaglc, and -Dhurrin Complexes
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE, CHLOROPLASTIC
total genus 192
structure length 490
sequence length 490
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2000-07-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e4lA00
1JZ6A 2VZTA 3VD5A 2PBOA 3GZAA 3SCNA 4JHOA 2GJXA 2ZWYA 1OT1A 3TP4A 3F5LA 1JNDA 4HZ6A 3AHZA 3EDDA 4NI3A 4UOQA 1TMQA 1BGAA 5ABFA 3AI0A 3W53A 4S3KA 4BQ2A 4D6GA 4BZYA 4D6IA 1W9UA 2VOTA 3LMYA 4DWSB 1BAGA 1JZ8A 3GM8A 2V38A 1UR4A 3MMUA 1EHAA 3DECA 3MU7A 5CGMA 5M3WA 3OBAA 1GOKA 1MW3A 2WHKA 5I5RA 1E6ZA 3MSDA 3EMQA 3OIHA 1GOQA 4X9YA 3GXFA 3GH4A 2W61A 1OWQA 1WAWA 4AXNA 3ZOAA 3WD3A 3CUHA 1Q6DA 4PMZA 3CHCA 3G6MA 2CBVA 4J28A 1AQ0A 1H49A 2F8QA 1B0IA 1VENA 3AIWA 1PIFA 1CXIA 1Q6CA 1UKQA 2WHMA 4ACYA 1TVNA 1BYCA 1TR1A 2EEXA 2YL6A 3GXIA 2BY2A 1DWAM 4GO9A 5ECUA 1SMDA 4MNMA 4DUXA 1QNRA 2D2OA 3B9AA 2X05A 5D8WA 5DMYA 2CBJA 4W8LA 3CIVA 2WVSA 3AXXA 2VR4A 2GK1B 3OZPA 2WMFA 4W5ZA 3UEQA 1BVNP 4J3VA 2VR5A 5A69A 1CLXA 2ZIDA 3MUIA 5FIPA 1QOXA 2WK2A 3ZJ7A 3ZT6A 1G9HA 1FFRA 4Z2HA 3N11A 1EOMA 1UD6A 2IXUA 3I3EA 1E70M 4GZIA 1ECEA 3VIGA 3POHA 5FKYA 1ZB5A 1PPIA 2WCAA 4WKFA 2W62A 3WEOA 1B3WA 3RM4A 2D20A 4H04A 3WQ6A 5C8BB 4MAVA 1B3ZA 5ABGA 2NW0A 1W9DM 3UERA 1J0KA 1WP6A 3WDJA 3SUVA 1JGIA 2DSUA 1DP0A 2VRKA 5C70A 1UH4A 4XV0A 3APGA 2XSAA 1OIFA 1XH2A 2FDMA 1FH7A 2QMKA 1V02E 4LYQA 1KR1A 2CERA 5DF0A 5A6BD 4GQRA 1M01A 1JG9A 2XM1A 2V3FA 3FXYA 2WMIA 2XFFA 3PZOA 4PMYA 2Y2WA 2E0PA 2UY4A 3T0DA 2D3LA 2E3ZA 5IFPA 3BCFA 2BHZA 1GJWA 1US3A 1Z32X 4IPLA 3GH7A 1ZJAA 4CN1A 1HIZA 3AMCA 3AIVA 4MJ2A 1UH3A 1KFWA 3POCA 6A3HA 2CHNA 1CYGA 4AMCA 1MW0A 2ZX6A 5HPCA 2W63A 5CPSA 5LYRA 3D5HA 3O6AA 1MWOA 2W5FA 2JALA 3K8MA 2Y8VA 1UKTA 4RE4A 1ODZA 4AWEA 1W32A 1JZ2A 2WVVB 1MYRA 1KQZA 3WDIA 2XM2A 2XWDA 5IDIA 2ZUTA 2PWDA 3EDJA 3TA9A 4AD2A 1IZJA 1X1NA 1O7AA 1XGZA 1FH9A 4M29A 2YLAA 4UQ9A 1HKMA 1BG4A 1G94A 3WUBA 1W9BM 4YHGA 2D0FA 4D1IA 1O6IA 1FFQA 1XYFA 2X2YA 3WH7A 3HU7A 1E0WA 3MKKA 3BAYA 5I78A 2A3EA 5JIWA 2GSJA 4AZHA 3NJ3A 1UD3A 3BXWA 3GXDA 3VMPA 3AZSA 3ZIZA 2YL5A 2CYGA 2FH6A 3SCVA 1JFHA 3L4YA 2E9MA 3ARVA 4GKLA 1AMYA 4DM2A 1EH9A 3OGSA 3QOMA 1CECA 2ESCA 2BVYA 1V3JA 2YA2A 4V2XA 3WFLA 4OOUA 4MDPA 1BYBA 3WDQA 3ZO9A 5EMYA 4L4OA 2Y24A 2NSXA 3EDFA 2ZUNA 5HDRA 2CEQA 1UKSA 4JFTA 3UETA 4UQDA 3W26A 1R86A 1NWUA 4Z2JA 1VEOA 4PMRA 2VMFA 4HA4A 4BS0A 3CMJA 3CPUA 1WPCA 3PHAA 2WMGA 1VRXA 1K9TA 4M80A 1VEPA 3VILA 5HBFA 3ZSSA 3DYMA 1AQHA 2JIEA 3WL0A 3VVGA 3EDKA 3AHVA 5A6JA 1KWGA 4FLRA 3WY1A 2EBNA 3AMGA 1JDDA 4AZGA 2WSPA 1L0PA 3WMSA 1BYDA 5A6AA 1BVZA 1J0HA 4ZFMA 2C0HA 3A47A 2ZX9A 5GNYA 1GNXA 1W3HA 5BWFA 5A8PA 3K4DA 5CQ1A 1XSJA 1CGTA 4D6DA 2DPEA 2VX4A 3WD0A 1DWFM 3M46A 1QI2A 2D22A 1UR8A 4XUYA 1JF6A 4P8WA 5CPQA 5A6MA 4UFJA 1YQ2A 2GFTA 2HISA 4PBGA 2UY3A 3OB8A 1R87A 1E3ZA 1M53A 1UKPA 2XSBA 1HN1A 3A4AA 3W29A 1J0YA 1GONA 2VZOA 3CZKA 1KWKA 5CZKA 5HOSA 1UHVA 4PCTA 2ZE0A 1V02A 1VB9A 2WYSA 5A1AA 2X8RA 1W3JA 1IT0A 2CKRA 4W7UA 4JKKA 1FHLA 2V3DA 2ZUWA 4AY1A 4UFIA 8A3HA 5KZ6A 3FHQA 4CUCA 1JYNA 3SCWA 1V0KA 3BAWA 2F61A 3AIBA 3WEMA 3CHFA 3CTTA 3WSUA 1V6YA 1L8NA 2VQTA 5CG0A 1K6AA 4E4PA 3LPPA 4H2CA 4D1JA 7TAAA 3TOPA 3RO8A 1ISXA 1RP9A 4FLQA 1OCQA 4M56A 1E72M 1C90A 1W9PA 1PJ9A 2W92A 3WUFA 2IXVA 4HOWA 3CZEA 1V6WA 4HMCA 3MUZ1 1UKOA 2VRJA 3VD3A 1UD2A 2DGAA 4QLKA 3OLEA 1W3KA 5CLTA 4KGJA 4BQ3A 2EPNA 1VBRA 4QLJA 1D3CA 3T2PA 3M07A 2WWCA 1JZ5A 4CD7A 1E6QM 4JCLA 3O9NA 3W24A 2YBTA 3MUAA 4PCSA 4U3AA 2DSZA 1E5NA 3SUTA 2E9LA 1NOUA 4F66A 5ABHA 5D9PA 2C7FA 1GQIA 1MVYA 2OSXA 4Z2KA 4TTUA 2ZWZA 4F79A 1B31A 2RGMA 5JBEA 4BQ5A 4TOQA 3SIMA 2WLYA 2XVGA 3GYCA 4TVDA 1WDRA 4QCFA 2BXZA 1WNOA 4X0VA 2CBIA 4AD1A 1EQCA 2WKLA 4J3UA 1Q6FA 1BQCA 4ZXOA 4M24A 3T0AA 4Z2GA 1GORA 1B30A 3WQ5A 4D72A 3BLKA 1I75A 5AC5A 4J7RA 4KRUA 3MV11 4JFUA 5BXTA 2XYLA 4PMXA 1FOBA 3UR8A 4TVCA 1JYVA 5A2CA 3VNZA 1H3GA 1V6XA 3DC0A 3MV01 1XCXA 1B9ZA 4Y7EA 4H8UA 3WFZA 1WDSA 4MDOA 4GI9A 1TUXA 1V3KA 3MMDA 1GOIA 1QW8A 4ZEPA 4PTWA 1ZS2A 5GNZA 2PI6A 4ZENA 2J7DA 2YA0A 5I24A 2NT0A 4Z2IA 3PZQA 5A8MA 1R8LA 4OJYA 5AYBA 2YBUA 3N15A 3NDYA 4MTVA 2J62A 3AICA 4CD8A 1NWSA 4OZOA 2WCGA 2AAAA 1H0IA 4EKJA 4GPNA 4WKHA 1ISZA 2XTKA 3SCSA 1GJUA 5JIPA 4U31A 3K46A 2WANA 2ZXDA 1KGWA 4OBSA 3VPLA 2VTFA 3F4VA 1GHRA 4TVUA 1DWHM 3EMCA 4URIA 5E0FA 4W93A 3VUPA 2WKGA 5DFAA 3OGVA 3SCOA 1KQYA 1JAEA 4CCCA 2FGLA 4B3KA 1UR9A 1CXLA 2D0HA 3BAIA 1W2PA 3N1AA 2PC8A 4U2ZA 3TTOA 2OWXA 3AYSA 4C7DA 4GI8A 1CXHA 4BQ4A 5A2AA 1UOKA 4NRRA 4ACZA 1EGZA 3UESA 4JL2A 4X0NA 4P7RA 3AIRA 5D9NA 4R27A 2EJ1A 1EOKA 2G8ZA 1RH9A 4PMVA 3OLIA 2G3JA 1VBUA 3L4WA 4PMNA 3N18A 3PBGA 3TTQA 1N82A 3VM7A 1E43A 5E70A 3SCPA 3AYRA 5EFFA 4B16A 4XZBA 1JD9A 3N12A 1KCKA 4BA0A 1GCYA 2Z1SA 4OOZA 3AIQA 1UA3A 3CZ8A 6CGTA 2E4TA 4QDMA 3AROA 5LA1A 1LWJA 2AOSA 3QR3A 3WDHA 1KXQA 3N9KA 4W88A 2ZUMA 2GDVA 2WPGA 2XGBA 2XVKA 1CLVA 3L4UA 5JBFA 2FHCA 2YDSA 1JNEA 2G4FA 1KXVA 2JIWA 4J3XA 4PMUA 2J74A 3VNYA 4UZUA 3MS8A 1YHTA 3ZJKA 2OSYA 2J7HA 4AD0A 4N42A 2OSWA 5EB8A 1CXKA 1E9LA 1TA3A 3MANA 4HU0A 3AS0A 3B9EA 2CESA 5HPOA 1LL7A 3BSGA 1ZBWA 2EQDA 3RPMA 5CJ5A 2ZXAA 1QNQA 1JDAA 1UD4A 3NSMA 1B1YA 1ISYA 1CGYA 1HVXA 4JFWA 1DWGM 3FN9A 2J7GA 3ARPA 3K4AA 2VVSA 2O9OA 2W91A 3AXIA 2XPKA 3N17A 3WENA 2UY5A 4UQEA 2XFRA 5LA2A 1WDQA 1ZBCA 3MMWA 1ITXA 5CXPA 5CSYA 1QI5A 1KR0A 1JI1A 4TXEA 2XG9A 2OYLA 3WF0A 3M6DA 4YPJA 3MSGA 2F2HA 1W1PA 2DH3A 4HMDA 4UCFA 3BMVA 2XVNA 1UH2A 1D7FA 4M8UA 1UA7A 4AD3A 2HVMA 1H5VA 3T2QA 3GH5A 2BFGA 4Q7NA 4AIEA 4JL1A 5M5DA 3WNLA 3VIFA 4HTYA 3AJ7A 2ZXQA 1BPLB 3RM8A 2V5CA 3W0KA 1E1EA 3AS1A 2CBUA 3BGAA 3VGEA 1PBGA 2E9BA 2EO7A 2OYKA 3RDKA 7CGTA 3QHNA 3WQ4A 3W28A 5AYIA 4W7WA 1K9DA 3VDBA 2DEPA 4D71A 1M03A 1W9XA 2XHYA 2OWCA 3VX0A 1C93A 5EBAA 2WCSA 3VGDA 3K1DA 3AZTA 3WF3A 3NSNA 3ZSTA 2WHJA 4K68A 2VZVA 2Z1KA 3SCRA 2OWWA 1WZLA 4B9ZA 4NZCA 4FK9A 4AZ6A 2VNCA 2X1IA 4DM1A 4IUGA 2QV4A 2YOCA 3NIYA 2VQUA 3BSHA 4PUEA 3L4XA 4FMVA 2VCBA 4JFVA 3KE0A 4GIAA 1NP0A 1QNOA 4E8DA 1UWRA 3AXHA 5FL1A 1LF1A 1GVIA 1UWQA 4MB4A 5ABFB 2JFEX 1IZKA 4JFSA 2DSWA 4UNIA 3VIMA 1UWIA 2J7CA 3AMDA 3VGHA 1HP5A 2VRQA 3WH8A 2YKKA 2D24A 3U57A 5BRQA 5A94A 1WB0A 1RD6A 1PX4A 1JYWA 5AC4A 1NWRA 5E6ZA 1E71M 3CGTA 5GQBA 2BY0A 1GOOA 5CSUA 1WE5A 2OLHA 5IHSA 4P8UA 4OIFA 2NT1A 1DTUA 2TAAA 1E0VA 4W85A 3W37A 3ZM8A 1WO2A 2EXOA 2DIJA 1XD1A 3CHEA 4JZ5A 4LGXA 1CENA 3F5JA 4GI6A 4CVWA 3UR7A 4EANA 1LL4A 2JF6A 4UQAA 3L2LA 3T08A 1EDTA 1KXTA 1QI4A 4PYSA 1OINA 3KL0A 1J0IA 1G0CA 1KBBA 4ATWA 1QI3A 3AHYA 1JL8A 1JXJA 3RJXA 3A4XA 3SCUA 5GNXA 1H1NA 4IM4A 2QPUA 1HJVA 4CN6A 4Q22A 4F8XA 2BHUA 4FLOA 3VDCA 1US2A 4WK9A 2GUYA 4LPCA 4OBRA 3T0BA 1GPFA 5BYWA 4UZSA 3CH9A 3U7VA 1E6XM 2VO5A 1CGXA 2OYMA 4JIEA 2W4XA 3LPGA 4LXFA 4KMQA 4ML4A 2CIPA 3O2LA 4OUEA 3W38A 2VX5A 4D6CA 1OD8A 4HA1A 3RJYA 3GDBA 2QMJA 4LX4A 4HPHA 2YIHA 1BLIA 3U5YA 3IK2A 2VC9A 1V6UA 2D3NA 3BLPX 4AC1X 5F7UA 2BV9A 3N04A 4S3JA 4CU7A 1G1YA 1FP8A 4P7LA 4PMQA 1H4PA 4UOJA 5A6BA 3UG3A 2AMGA 3KL3A 5ABEA 2GDUA 2VZSA 2YDRA 5JBDA 3WMCA 4NSBA 1TG7A 2WAGA 2YL8A 3AIUA 3DYPA 3F5KA 4XZWA 3ARYA 1QHZA 4Z2LA 1HT6A 4WIWA 3CZLA 1PIGA 1HXJA 1H0GA 4WJXA 3VDHA 3FNDA 4B15A 4WSJA 5D8ZA 4DWSA 3L4ZA 1KCLA 4FF5A 1CXEA 5CGTA 1B90A 5DT5A 4GZEA 1BYAA 3WQVA 3ZJ8A 2WLZA 3VIJA 2EPMX 1W91A 1H11A 1GQJA 2VZUA 4P7QA 1V0NA 1C92A 7A3HA 1NOWA 1CEOA 2V3EA 1HJXA 1OB0A 3A4WA 1GUVA 2WMIB 9CGTA 4F9JA 1W3LA 2E8ZA 2VVNA 3L2MA 4W86A 4AZCB 4HOXA 3TTSA 3RM9A 5BRPA 1H41A 1EDQA 3ZR5A 4CCEA 3PZUA 3GBEA 2Y8KA 3PTMA 3S6TA 1KBKA 1EDGA 2BXYA 1VFUA 1GOWA 2WMHA 1XH0A 2ZUVA 4MADA 1JIBA 4AEEA 3VX1A 5E6YA 5A6KA 1HKJA 1PAMA 2VJXA 1JZ4A 2J75A 3AS3A 1UQYA 1ODUA 4OKDA 4NRSA 3DYOA 1E4IA 1J18A 4N0RA 2PF0A 3ARUA 4DUWA 5E0CA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1JZ6 A;  2VZT A;  3VD5 A;  2PBO A;  3GZA A;  3SCN A;  4JHO A;  2GJX A;  2ZWY A;  1OT1 A;  3TP4 A;  3F5L A;  1JND A;  4HZ6 A;  3AHZ A;  3EDD A;  4NI3 A;  4UOQ A;  1TMQ A;  1BGA A;  5ABF A;  3AI0 A;  3W53 A;  4S3K A;  4BQ2 A;  4D6G A;  4BZY A;  4D6I A;  1W9U A;  2VOT A;  3LMY A;  4DWS B;  1BAG A;  1JZ8 A;  3GM8 A;  2V38 A;  1UR4 A;  3MMU A;  1EHA A;  3DEC A;  3MU7 A;  5CGM A;  5M3W A;  3OBA A;  1GOK A;  1MW3 A;  2WHK A;  5I5R A;  1E6Z A;  3MSD A;  3EMQ A;  3OIH A;  1GOQ A;  4X9Y A;  3GXF A;  3GH4 A;  2W61 A;  1OWQ A;  1WAW A;  4AXN A;  3ZOA A;  3WD3 A;  3CUH A;  1Q6D A;  4PMZ A;  3CHC A;  3G6M A;  2CBV A;  4J28 A;  1AQ0 A;  1H49 A;  2F8Q A;  1B0I A;  1VEN A;  3AIW A;  1PIF A;  1CXI A;  1Q6C A;  1UKQ A;  2WHM A;  4ACY A;  1TVN A;  1BYC A;  1TR1 A;  2EEX A;  2YL6 A;  3GXI A;  2BY2 A;  1DWA M;  4GO9 A;  5ECU A;  1SMD A;  4MNM A;  4DUX A;  1QNR A;  2D2O A;  3B9A A;  2X05 A;  5D8W A;  5DMY A;  2CBJ A;  4W8L A;  3CIV A;  2WVS A;  3AXX A;  2VR4 A;  2GK1 B;  3OZP A;  2WMF A;  4W5Z A;  3UEQ A;  1BVN P; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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