2E40A

Crystal structure of intracellular family 1 beta-glucosidase bgl1a from the basidiomycete phanerochaete chrysosporium in complex with gluconolactone
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
459
structure length
459
Chain Sequence
AKLPKSFVWGYATAAYQIEGSPDKDGREPSIWDTFCKAPGKIADGSSGDVATDSYNRWREDVQLLKSYGVKAYRFSLSWSRIIPKGGRSDPVNGAGIKHYRTLIEELVKEGITPFVTLYHWDLPQALDDRYGGWLNKEEAIQDFTNYAKLCFESFGDLVQNWITFNEPWVISVMGYGNGIFAPGHVSNTEPWIVSHHIILAHAHAVKLYRDEFKEKQGGQIGITLDSHWLIPYDDTDASKEATLRAMEFKLGRFANPIYKGEYPPRIKKILGDRLPEFTPEEIELVKGSSDFFGLNTYTTHLVQDGGSDELAGFVKTGHTRADGTQLGTQSDMGWLQTYGPGFRWLLNYLWKAYDKPVYVTENGFPVKGENDLPVEQAVDDTDRQAYYRDYTEALLQAVTEDGADVRGYFGWSLLDNFEWAEGYKVRFGVTHVDYETQKRTPKKSAEFLSRWFKEHIEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Phanerochaete chrysosporium
publication title Crystal structure of intracellular family 1 beta-glucosidase BGL1A from the basidiomycete Phanerochaete chrysosporium
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase
total genus 190
structure length 459
sequence length 459
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2006-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2e40A00
1GOKA 3CIVA 3AMLA 2YL6A 4XB3A 1LG2A 9CGTA 1W91A 5M5DA 4AEEA 2J7HA 4JAWA 1J11A 1TVPA 3EMQA 1QBBA 3ARYA 3ARVA 5C70A 2PWEA 2ZX6A 4X9YA 4D1IA 1TA3A 1B3ZA 2XFRA 2CCRA 4W5ZA 2YDQA 3FY1A 4C7GA 3MUAA 1C8YA 4PRWA 4NSBA 3VM5A 1LL7A 1E1EA 4KGLA 1XRVA 3VDCA 5D9PA 5D8WA 1MFUA 4M24A 3WL0A 5JBFA 4PMYA 3S2CA 1F4AA 1LL4A 2PC8A 2RGLA 4M29A 4HZ8A 2ZOXA 5I77A 1CXKA 4HTYA 1UWTA 3FW6A 2BY0A 3ARSA 1QBAA 1Q6GA 3ZSTA 1DWAM 2G3NA 2J4GA 2CKSA 3SUVA 1ISYA 3W0KA 2WMJA 1DP0A 5E6YA 1H3GA 5CXPA 1BGGA 1UH2A 3VO0A 4JHOA 1LJYA 2EPMX 3OIHA 4UFHA 4AC1X 3EMCA 4J7RA 4M8UA 2CERA 3FXYA 4HMCA 3BC9A 4U33A 1K6AA 3WH7A 3N17A 4JCLA 3F5KA 2GUYA 1J18A 1W9VA 5AYIA 3WH8A 2X1IA 2JE8A 2J7DA 2YDSA 5AYBA 2WNWA 3VX0A 3UR7A 4EANA 2DQXA 1QW9A 4D6JA 1FOBA 4LPCA 1JXJA 4MNKA 1J0ZA 3EBVA 3ARPA 3WUGA 3O6AA 1TMQA 3WDQA 4ACYA 2J77A 3EDFA 1KXVA 3AROA 2ZXQA 4H04A 5I24A 1J12A 2BV9A 4GZJA 3N13A 4FLRA 3HN3A 1CGVA 3N18A 3OA5A 1TCMA 2YL5A 4W7VA 4JFVA 1E4IA 5A8NA 3VD4A 2VCBA 3IK2A 3N1AA 4LYQA 2XVLA 2UY4A 4HPGA 2CEQA 3PN8A 3WD3A 1W1YA 3B9AA 5I0DA 1VEPA 3UERA 1IZJA 1KR0A 1ESWA 2VQTA 4CKQA 1A47A 3TTSA 4D72A 5AC4A 3TONA 2GSJA 1V3LA 4PTMA 3PZQA 1WDRA 4WKAA 3WY1A 3RIKA 1LLOA 2XIBA 1CGUA 4OJYA 2D2OA 3WMBA 3GBDA 1RP9A 4C7DA 2PBOA 3FAWA 3KE0A 1VIWA 1V0LA 1WP6A 2EXOA 4D1JA 3AYSA 3ZIZA 5CJ5A 6A3HA 1E56A 3HMCA 1TZ7A 2YL9A 2QPSA 4RE4A 3OG2A 1HT6A 4U3AA 2VCCA 2F8QA 4F9DA 2J79A 1UKQA 2WMHA 3VPLA 2BS9A 2Q8XA 1QI3A 4D6DA 1EOMA 4UQ9A 1W3KA 1FH9A 4BZYA 5GPRA 3W37A 1GQJA 3F4VA 2VR4A 4AIOA 4AEFA 4JFTA 3WQ5A 1UWQA 1EDGA 1E9LA 1UH3A 5CLWA 1JXKA 4QDMA 1TVNA 1EO5A 3PZOA 1BQCA 1PEZA 3GH4A 4KMQA 2ZX9A 1UWRA 1HL9A 3KEHA 5ECUA 4BQ5A 2IXVA 1R8LA 2MANA 1BF2A 2WB5A 2FGLA 3U5UA 3N11A 1KB3A 3RILA 3T08A 2XIIA 3SCUA 3M46A 1M04A 1WZKA 3LPFA 4Y7EA 1V02E 4CN1A 1J9YA 1US3A 5E70A 3CUJA 3MSDA 1UD4A 1G0CA 3ECQA 2Y5EA 5A2CA 4M56A 5E09A 3W81A 1MQQA 4LXFA 5C8BB 2J78A 4U5KA 2UY2A 1CGXA 1TFVA 1XSJA 4W5UA 3OBAA 2W4XA 1FH8A 1E4MM 3VINA 1DWFM 7TAAA 3WSUA 4W84A 5IFTA 1XV8A 3GNOA 3WEMA 1B30A 4WK9A 2YIHA 2BFGA 2PBGA 3O2LA 1US2A 4ATDA 1W1PA 1TA3B 3ZR5A 1C8XA 4HU0A 3I3EA 4P7QA 4X0NA 5GQBA 2JF7A 2QMJA 5BRPA 3PZNA 4HOXA 1KXTA 1QI2A 3WBEA 5BRQA 4H41A 1SMDA 3WD4A 4B3LA 1HNYA 1UHVA 1GQLA 3TTYA 4HA1A 1BG4A 2GJXA 4HMDA 5CSYA 1R7OA 5ABEA 5HDRA 4HP5A 1Q6FA 5DO8A 3IJ7A 2DT3A 5ABFA 2CETA 3WD1A 2WC4A 1HKIA 3M6DA 1MQPA 1VENA 1ZBWA 3AHXA 1SR0A 5JUVA 1OINA 1C8QA 3W53A 4H8VA 4KH2A 5A8PA 4XUYA 1H1NA 2DT1A 2ZWZA 4PMOA 3L4VA 5DF0A 1BYAA 4GI9A 3O9NA 1VBRA 1L0PA 4LYPA 4WF7A 2FH8A 1NH6A 4P7OA 2BNJA 2OWXA 4FK9A 4MAZA 1MW0A 1WO2A 2YKKA 4TTGA 1EHAA 5CPTA 4AZBA 1TE1A 2J25A 1LQ0A 2B31A 4TVDA 2EPKX 1GJUA 1E6XM 5A6JA 2VX7A 2YLAA 3AIVA 1GHRA 4A3YA 3WENA 4M1RA 5BXSA 1JYXA 1ODZA 1UD6A 3MU7A 3GXFA 3NDYA 3CHEA 3RJYA 6TAAA 3BSHA 1XH0A 1NARA 1JIBA 3GNRA 2J47A 3NDZA 3SCSA 1XHGA 1ISWA 5FL1A 2WVSA 3PZVA 1J01A 1DWJM 1CZ1A 4PEEA 1I1XA 3WF3A 1UYQA 4M80A 4CCDA 5HXMA 3WUFA 2WCAA 1CEOA 4MADA 3CBWA 2IUZA 3WF0A 4HOWA 1HJUA 1GHSA 1UUQA 3VD5A 3L4UA 3WIJA 5BXTA 3NCOA 1FA2A 3VD9A 2C0HA 2E4TA 1GPFA 4A3HA 3U7BA 2JIEA 2VL4A 1QNRA 2CYGA 4B16A 2XM2A 1V03A 1B3YA 2WMGA 3WF4A 3RCNA 4TOQA 1HJVA 3AFBA 3DHUA 3K8LA 3PZ9A 1W1TA 1OGSA 1D3CA 4CD4A 3VD7A 2HISA 3WH5A 2BXZA 2D3NA 2V38A 5M17A 5I79A 2BY1A 1Y7VA 3EMZA 3ALFA 3SUWA 1MWOA 1GOIA 1QHZA 1G5AA 2G3IA 3SCWA 3IAQA 3VOCA 2WSPA 1MYRA 2XVKA 1JZ6A 4AZ6A 1H2JA 1X6NA 4D6FA 3VIPA 2WHLA 1UD5A 4WIWA 3OZOA 1E73M 4DUWA 3AIEA 4V28A 1EO7A 2WWCA 2G3JA 4RE2A 4L4OA 4JZ5A 1UD3A 4D6HA 1E72M 3BLPX 3E1F1 4GI8A 3AIRA 4MAVA 5CPSA 4M81A 5A2AA 2WWDA 2AOSA 5A2BA 1HN1A 3T2OA 3MANA 2AMGA 1DHKA 1HJQA 1HKKA 1BTCA 4UQBA 3TA9A 5A6BA 2Z1SA 1WCGA 2WVUA 1B90A 2OSXA 4GKLA 4UZSA 4PTWA 1KCKA 4B15A 3WEOA 1WDSA 4AZIA 3SCTA 3MUIA 1V3JA 3T09A 4ZXLA 3G6MA 4AISA 1UQZA 1EXPA 2A3BA 2Y8KA 1MW3A 1W2VA 3WDIA 1V3HA 1XGZA 1JAKA 1GVIA 1ZBVA 4OKDA 1B3VA 2D22A 2WMIA 1PX3A 4GQQA 4UQEA 2GDUA 1HJWA 1V02A 1FP9A 1TUXA 1VB9A 2PWFA 3ARTA 1HKMA 3DHPA 4AZ5A 2W63A 3GXIA 1WB0A 2A3CA 1HXJA 2J74A 1CXFA 5BXPA 1E3XA 1RP8A 1E4NA 5IFPA 1CXLA 2AAAA 5E0CA 4PSRA 1HIZA 4YHGA 1VFUA 4CCEA 4OOZA 3PZMA 1VF8A 1UZ1A 2VVNA 1UQYA 2DIJA 4BCEA 2WVTA 4Z2HA 3WDPP 3MMDA 2GVYA 5D4YA 3OGRA 2ZUWA 3QR3A 3MSGA 3ZQ9A 3IJ8A 2WW5A 1PZ3A 2J7CA 3WD0A 3M7SA 2CITA 4ZE4A 3AOFA 2V3FA 2JFEX 2JEQA 4W8BA 4OUEA 4J3VA 2E9LA 1IZKA 4HU8A 1FHDA 3SUSA 4YHEA 2VRQA 3VGDA 5ABHA 4P8UA 2XTKA 1DWGM 4PUDA 2VZVA 2G8ZA 1JF5A 1ISVA 2VX5A 2GJXB 1E6SM 5I2UA 5DEZA 2QF8A 1B1YA 1J0JA 5ABFB 3JUGA 5BROA 4L4PA 3NIYA 3U5YA 4JFSA 4TVUA 3CHDA 3HU7A 3BMVA 4URIA 5A1AA 1V6UA 1JNEA 3LMYA 3DECA 1OD8A 1VAHA 1NQ6A 3W82A 2IXUA 4UNIA 1XD0A 4DWSC 1G1YA 3PZIA 1VEMA 3L4WA 1WPCA 4CVWA 2XVGA 4TXEA 2WZIA 3W27A 3L2MA 1LWJA 1H0IA 2OLHA 3VX1A 3WF2A 1JGIA 1J10A 4EE9A 1ITXA 3UCQA 4PSPA 2VJXA 3UG5A 3A4WA 1K9TA 4ATWA 2WSKA 4D6IA 1NM9A 4IM4A 4D6CA 4DWSA 3FHAA 5BWFA 3A47A 1E43A 1UOKA 1E5JA 4J3XA 2J8FA 3CLWA 3OLDA 3SUTA 4BQ4A 3AXIA 5JIPA 1OBAA 3T2QA 3VVGA 2YA1A 3UETA 1JZ4A 2BVTA 1BHGA 3WNLA 1CXEA 2XSBA 3AMGA 1EOKA 3ARUA 1XSIA 3VIJA 3RO8A 4ZENA 3PHAA 2XHYA 4QLJA 1B2YA 5A6KA 5DFAA 4V2XA 3ZOAA 1ZU8A 2CHOA 2XSAA 3MKKA 4AWEA 4J3TA 1Q4NX 2DGAA 2YJQA 2VQUA 1V3IA 1K9DA 3W26A 4LGXA 1JZ7A 3QOMA 1QVBA 1G94A 3AISA 1LF1A 3GM8A 3AI0A 3QHOA 1OCQA 4Q7NA 2A3AA 1E0VA 1ITCA 4W85A 3VGGA 3TOPA 3AZSA 4CUCA 2CBJA 4N42A 2PB1A 3RJXA 4JIEA 4DM1A 1E3ZA 1MVYA 5BYWA 2J62A 1HP4A 1ZB5A 4NRSA 1JZ5A 1R7AA 3NSXA 4LYRA 3CHFA 1BPLB 3KL0A 4JL2A 3T0DA 4K68A 1B3XA 4J3WA 3ARZA 2VTFA 1EQPA 3K8MA 4KGJA 3SURA 3W4RA 1BAGA 2XM1A 4UFLA 2DT2A 2X0HA 3OLIA 1MW1A 1UKOA 1WDQA 5D8ZA 3L4TA 3IANA 1UG6A 1UR9A 2V3EA 1WAWA 4UCFA 3WKZA 3W6MA 3BCFA 1GQIA 2Y2WA 5IHSA 3AJ7A 1DWIM 2YA2A 3MV01 3TTOA 4JFWA 1GOMA 2ZWYA 5A6MA 4PUEA 4XZWA 3WDRA 1VJSA 3BAJA 3DC0A 4AY1A 1XH2A 4AMCA 4E8DA 1JFHA 4QLKA 5DT5A 2BVDA 3PTKA 3CUIA 5C71A 3CUFA 3APGA 2XYLA 5E0FA 3RMEA 1AMYA 2WMIB 3QHMA 2CIPA 1H11A 3NYDA 3FN9A 3DYOA 2OYLA 4IPNB 3II1A 1R87A 4PMRA 1E6NA 3A4XA 4TTUA 1QHPA 3B8SA 2FH6A 3FNDA 4C7FA 2VZOA 2F61A 4R27A 1NOUA 1V0NA 1U33A 1K9FA 2CKRA 2J7FA 4V27A 1BYBA 1SFSA 1JNDA 2D0HA 4P8XA 3CZ8A 4QCEA 4QCFA 2OWCA 4NI3A 4E2OA 2QV4A 4HMEA 2BHZA 2YBUA 1HJSA 1W9PA 2X8RA 1GOOA 3UG4A 2X05A 4UTFA 3ARWA 4FLSA 4NZCA 1E15A 3WMSA 4FMVA 8CGTA 1NWTA 4H8UA 4XX6A 4HOZA 1RD6A 3BAIA 3ZT5A 5CZKA 3CGTA 3L2LA 3W25A 1OWQA 1GW1A 5CPQA 2ZIDA 4MB3A 2W61A 4IUGA 3AS0A 2WCSA 1M01A 1HVXA 1GOQA 3T0AA 5GNZA 3EDEA 3W24A 1HJXA 3AMDA 1G9HA 4MB1A 1BVNP 2EPOA 3SIMA 3GYCA 4ZEPA 3SEPA 1H0GA 2DSKA 5EFDA 2EO7A 1JZ3A 1ZBCA 3UR8A 4H7VA 4F8XA 3CH9A 1GZJA 3POCA 3W38A 1HF6A 4AZGA 4UOQA 3T2PA 2XVNA 3BXWA 1ODUA 4AD4A 1XCXA 4AD1A 1WZAA 1E71M 4P8VA 4PMUA 5BCAA 3BH4A 3SCVA 3ZMRA 3WFZA 1FHLA 3AHVA 1PJ9A 1CPUA 1QI5A 1FFQA 1Q6CA 4PN2A 3CZJA 1CYGA 1CBGA 2VURA 4ZFMA 4CD7A 2CBUA 1MXDA 3CZLA 3VIMA 3PTQA 2UY3A 1JYVA 1D2KA 4AZCB 3AYRA 4DWSB 1JAEA 1IT0A 3AS2A 3UG3A 4AIEA 2YL8A 3TTQA 4XV0A 4PMVA 1CGWA 1E55A 1UA3A 1XYFA 4HA4A 5LA2A 7CGTA 2YA0A 4F9JA 5KEZA 2W92A 3WNPA 1IV8A 1CLVA 4UR9A 1LL6A 3AZTA 1KWGA 1OB0A 2DPEA 3RPMA 2CESA 5FOOA 2EPLX 2D3LA 1W9XA 4TX8A 1R85A 4CU8A 1XC6A 2ZXAA 5M3WA 1C90A 1CNVA 5A6BD 2EJ1A 2Y4SA 3PZTA 3RM4A 1JL8A 1E6ZA 3VGHA 5JBDA 4MTVA 1CTNA 3N9KA 1MW2A 2ZUUA 4IISA 3GH5A 2YOCA 1V6WA 4MDOA 4AD2A 1JYNA 2PWGA 2X2YA 1CENA 2E40A 5AY7A 2FHBA 3J7HA 3WNMA 3K46A 4JHZA 2QPUA 4OZOA 3POHA 1H09A 2WANA 2DSWA 1UR1A 3VIIA 4W88A 4HZ6A 4OBSA 1Z32X 3NSMA 2ZX5A 4UZUA 2VI0A 2VR5A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GOK A;  3CIV A;  3AML A;  2YL6 A;  4XB3 A;  1LG2 A;  9CGT A;  1W91 A;  5M5D A;  4AEE A;  2J7H A;  4JAW A;  1J11 A;  1TVP A;  3EMQ A;  1QBB A;  3ARY A;  3ARV A;  5C70 A;  2PWE A;  2ZX6 A;  4X9Y A;  4D1I A;  1TA3 A;  1B3Z A;  2XFR A;  2CCR A;  4W5Z A;  2YDQ A;  3FY1 A;  4C7G A;  3MUA A;  1C8Y A;  4PRW A;  4NSB A;  3VM5 A;  1LL7 A;  1E1E A;  4KGL A;  1XRV A;  3VDC A;  5D9P A;  5D8W A;  1MFU A;  4M24 A;  3WL0 A;  5JBF A;  4PMY A;  3S2C A;  1F4A A;  1LL4 A;  2PC8 A;  2RGL A;  4M29 A;  4HZ8 A;  2ZOX A;  5I77 A;  1CXK A;  4HTY A;  1UWT A;  3FW6 A;  2BY0 A;  3ARS A;  1QBA A;  1Q6G A;  3ZST A;  1DWA M;  2G3N A;  2J4G A;  2CKS A;  3SUV A;  1ISY A;  3W0K A;  2WMJ A;  1DP0 A;  5E6Y A;  1H3G A;  5CXP A;  1BGG A;  1UH2 A;  3VO0 A;  4JHO A;  1LJY A;  2EPM X;  3OIH A;  4UFH A;  4AC1 X;  3EMC A;  4J7R A;  4M8U A;  2CER A;  3FXY A;  4HMC A;  3BC9 A;  4U33 A;  1K6A A;  3WH7 A;  3N17 A;  4JCL A;  3F5K A;  2GUY A;  1J18 A;  1W9V A;  5AYI A;  3WH8 A;  2X1I A;  2JE8 A;  2J7D A;  2YDS A;  5AYB A;  2WNW A;  3VX0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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