1LROA

Aquifex aeolicus kdo8p synthase h185g mutant in complex with pep and cadmium
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
263
structure length
259
Chain Sequence
EKFLVIAGPCAIESEELLLKVGEEIKRLSEKFKEVEFVFKSSFDKANRSSIHSFRGHGLEYGVKALRKVKEEFGLKITTDIHESWQAEPVAEVADIIQIPAFLCRQTDLLLAAAKTGRAVNVKKGQFLAPWDTKNVVEKLKFGGAKEIYLTERGTTFGYNNLVVDFRSLPIMKQWAKVIYDATGSVQLPGGLGGMREFIFPLIRAAVAVGCDGVFMETHPEPEKALSDASTQLPLSQLEGIIEAILEIREVASKYYETI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Function of His185 in Aquifex aeolicus 3-Deoxy-D-manno-octulosonate 8-Phosphate Synthase
pubmed doi rcsb
molecule keywords KDO-8-phosphate synthetase
molecule tags Lyase
source organism Aquifex aeolicus
total genus 90
structure length 259
sequence length 263
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.55: 3-deoxy-8-phosphooctulonate synthase.
pdb deposition date 2002-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00793 DAHP_synth_1 DAHP synthetase I family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1lroA00
1K8XA 4M5PA 4DO6A 3UPBA 3WJXA 3MI2A 3SGZA 2B7NA 1TV7A 2CLHA 5DXXA 1LYXA 1TPWA 2I1OA 4AHPA 4O52A 1CI1A 3JRKA 4NX5A 2NUYA 5LSMA 1GVRA 3PSVA 1ZAIA 3NO5A 3G0SA 4UC5A 3IVSA 1VYPX 3IIVA 3M1ZA 5AHFA 4QAIA 3M7WA 2ZYFA 2I14A 1OFAA 2JKPA 2YR1A 4E38A 1G67A 5HJLA 1TQJA 1KFJA 3E02A 1KLYA 5EL1A 4UFKA 4UIOA 3HG2A 5DCBA 5G1YA 1WV2A 1UJPA 3I7QA 1H50A 4UTTA 4UUIA 4TR9A 1SFLA 2E5BA 2XN0A 2I9EA 5CSRA 1I2NA 5E0KA 4XQ6A 4WUIA 5SWUA 3UQNA 5F2LA 5TBOA 3HQ1A 3S1WA 5HMSA 4AF0A 4H6KA 3GAYA 3C2VA 1AL8A 3GDKA 4UMCA 1JUKA 3S5OA 3YPIA 4HSOA 3RNDA 2C16A 1FX6A 3KVJA 4PODA 1HG3A 3PBYA 4RKAA 3TC6A 1ZJIA 4O19A 2W79A 5G1TA 1EWDA 4PL1A 1EP1A 2IQTA 3E12A 3LRLA 3W1XA 4GUIA 1EX5A 5KSWA 3LB0A 1TQXA 3CWOX 1GG0A 4ZQMA 5AB3A 3W85A 3CIWA 4LS1A 3N2XA 1RPXA 2E6YA 1AMKA 3NQ2A 4OBTA 4O28A 3DFTA 1HO1A 4KKXA 4AVFA 4A22A 3NQEA 3W70A 2X1RA 4LOCA 1SW0A 5AYZA 3BPWA 2PRHA 1WBHA 2NX1A 3EX4A 2EKCA 1XBVA 1KTNA 1GYLA 5BW6A 4L4LA 1RD5A 2RHGA 2J9YA 1L6WA 2Y62A 4N9DA 2FIQA 4DEFA 1DOSA 4FIQA 1ML1A 1TIMA 3LHTA 3NPWA 4O0KA 4DPQA 4U28A 1JJKA 1OX4A 3PWAA 2QUVA 1ZALA 1IXNA 3M5VA 4LVBA 1H7NA 4E0CA 4O1AA 4Y90A 3OVPA 3R12A 1SSGA 4B5NA 4AWUA 4OV9A 4Y8FA 4IMGA 4JTLA 5DY2A 1FWTA 3PG8A 3IV3A 3HG5A 2XN1A 3MHUA 1GZGA 2ZTJA 5D03A 4XKYB 3N3MA 1UBSA 3W7LA 4JTIA 1DJQA 1Z44A 3HGOA 2ZZ1A 4DF2A 1KM4A 5FF2A 3GYEA 4FNQA 5D2VA 1Z42A 2V5LA 4WXYA 4IXHA 3S9YA 5D04C 4UMBA 3IIOA 5CPLA 1YDNA 3TXVA 3FEMA 2Y7DA 3BVJA 1EUAA 2WJZA 2Z1BA 3UD6A 4LW7A 4UR8A 4EF8A 2H6RA 1VGAA 2P0OA 4IWWA 3W75A 3UWZA 2JBMA 2QCDB 4TMBA 3BARA 4NUWA 2WKJA 3FKRA 2ZZ4A 3TX9A 3HOJA 4RZ6A 4IGHA 1OYCA 3KRSA 3NQ6A 1IXOA 2AAMA 4AHOA 4RR4A 1I2QA 3MP5A 5A8GA 2CZ5A 3B05A 1SSDA 3EKLA 3AO0A 1KBIA 4OQVA 1VCGA 1NSJA 2CLMA 3GDTA 4O54A 1P0NA 5U4NA 4MYAA 1HUVA 3L9CA 5DBUA 4NU7A 3W7GA 4MPQA 1KM6A 3P5ZA 1GVSA 2ISWA 3ZFHA 2JKAA 3NPXA 1BEUA 2TYSA 1FWNA 4UNKA 3W9ZA 1W0MA 4MY1A 3W73A 3NPVA 3NQDA 5LHEA 1WXJA 3R13A 4WOQA 1G6CA 3F1QA 4NX0A 1JULA 3BG5A 3GX9A 4O50A 3QFEA 2X1SA 2V81A 1QFEA 3CEPA 2H90A 1SO6A 4FNSA 2ZA3A 4R33A 1YDOA 3C3NA 5AHMA 1R47A 4JX6A 1KTCA 3RMJA 3UYCA 5HINA 4DO5A 4O4WA 2A85A 3LHZA 3EXRA 4HIBA 4LVAA 4UTHA 2QCHA 3W1QA 2NXGA 1KM3A 3QYQA 4JYFA 4XTDA 2NXIA 1WBJA 2ZDRA 5EPDA 1NAL1 4XZ9A 1V7YA 2CFFA 4Q32A 4DBEA 1LBMA 1JCXA 5HUPA 1QR7A 4R34A 5G2HA 5A5WA 4UXDA 2YSWA 4UTWC 3W7OA 3OVQA 1OFPA 1YTEA 3QH2A 1WA3A 4A21A 3WK2A 1SR9A 5HWJA 1PL9A 1LRQA 1W56A 3E0IA 1PV8A 1WOBA 2VFEA 3HG4A 5F4SA 3ATZA 3NA8A 2PCQA 1VHCA 1WYIA 2DZUA 2VEMA 1DJNA 1ME9A 3B0PA 3W7PA 1HL2A 1H7XA 1OJXA 1EB3A 3MYPA 4EIVA 6TIMA 4UTUA 4MUZA 2GQ8A 1L9WA 3P67A 1KM5A 2VENA 3LCXA 4MY8A 4WXZA 3W7IA 3TDFA 5G2WA 4N9BA 3A24A 1QPNA 2ATMA 3EWUA 1S5TA 1XC4A 1QPRA 2ZRXA 1B4KA 1QPOA 1G4PA 5T26A 1SZFA 3UWYA 1MEWA 3NQCA 4LT9A 4OHQA 4RXFA 3TJXA 5F2GA 2VFDA 3WJZA 2V9DA 3G1VA 2V2HA 1GWJA 1H63A 3UWUA 2HSAA 1MSSA 1X1OA 4UNLA 3W7CA 5D37A 4ZQPA 2Z2UA 3DZ1A 1FWSA 4IX0A 2AQWA 2GQAA 2HTMA 3NPUA 4HNUA 1B4EA 5H2ZA 1SFJA 5BRBA 3T78A 1VPXA 2QJGA 4PFMA 3C61A 2QR6A 3P82A 2ZRWA 3EWBX 3E9AA 3HGJA 1K3UA 4BI7A 3N2MA 3WK0A 3I65A 2QCGA 1GT8A 3PM6A 1GVFA 2CLEA 4LRTA 1T0OA 3ZR4A 3ABOA 2Y63A 3TSDA 4C1LA 3THAA 3NXFA 5HWNA 4JY9A 3FYPA 5G5IA 3NZRA 3NM3A 3QF0A 1ZHAA 4MVAA 1LORA 4I7UA 1XDLA 3RK8A 3L0KA 1W5QA 3NYZA 4Z0JA 4TMCA 4FB7A 1OX6A 2UV8G 2FPTA 2FLIA 3GDLA 1TV5A 2C3ZA 3LRKA 3PB0A 3LXAA 1K02A 3W71A 3MO7A 1QAPA 2H8XA 3GAKA 1ONRA 3NL3A 1XI3A 2PURA 1TJPA 1R46A 5GVJA 3Q94A 2GVJA 4KWVA 2QUTA 2EAWA 2TSYA 5DXYA 3BW2A 1VJIA 3OHIA 4QIUA 3IVUA 8TIMA 1EPXA 2R14A 2WO5A 4R7JA 2A4AA 5KINA 3EX3A 1FWWA 1IIGA 2C19A 3G1YA 4PEKA 3G3MA 3V1PA 3PF3A 3ABSA 4O1BA 4E2BA 3IIPA 3N9RA 5EY5A 3M44A 2NWSA 3W3OA 5CZTA 1XDMA 1YTKA 4XKYA 2E6AA 3BLFA 2DZSA 1G4EA 5K4XA 1ADOA 2CLLA 3QJAA 3KVKA 1I45A 4BK9A 4EVZA 1H1ZA 2Y85A 3H53A 2ZRZA 4HKPA 4P61A 5K9XA 1LZOA 4MJMA 1MXSA 3C2FA 4UTTC 3IGSA 1VLIA 1AL7A 4JTFA 3TFCA 3TV8A 3W1RA 3S5YA 1SQ7A 1QMLA 3GNDA 1XBZA 3TKFA 2G5WA 3USBA 3LHYA 5HR7A 1A50A 4XWUA 4ZZ9A 3PVFA 4N4PA 3DXIA 3NQAA 4LUIA 3CPRA 3A22A 2WNZA 3HIJA 2C13A 3ZWTA 3Q58A 1H7RA 4N02A 2Q8LA 1WDWA 3GNNA 5FEXA 1K7FA 4BWLA 4ADTA 4G1KA 4LV4A 4O17A 2TPSA 3MUXA 3TSBA 2VEPA 1X6UA 4QISA 2VKZG 4AMAA 3HPXA 1YXCA 5G4EA 3C52A 4X22A 3OEXA 1W5NA 1DQWA 1ZCOA 3TMLA 1KA9F 3PUDA 3W1AA 4A2RA 1QO2A 3QMSA 1A5AA 1SPQA 2YXGA 1X8FA 1LP6A 3NL6A 2BX7A 3FS2A 4X9SA 3E49A 1BWKA 4UFMA 1DVJA 2GVGA 1H62A 2OJPA 5AHLA 4DPPA 5CKSA 1A53A 2DZPA 2V82A 1VR6A 3O05A 1PE1A 1SUXA 3O8AA 4DBDA 4LS2A 5BMXA 2DP3A 3BGJA 5KZDA 3UY7A 4KFOA 1EIXA 5K7JA 1O5XA 2A21A 4QNWA 2Y89A 3GXNA 3LXCA 3MHGA 1LTDA 4ORMA 4GFSA 2QJHA 3MMTA 1OFBA 5C6MA 1ZNNA 3M9YA 4UFIA 2R94A 1A5CA 3PR2A 3A5FA 4JDBA 2C14A 3R8RA 2OZ0A 1QOPA 3O16A 1TYGA 4LU0A 5AC6A 2KZHA 1VCFA 4GXMA 4CCDA 1PS9A 1W3TA 3WJYA 2J24A 3T55A 4FHAA 1QNVA 3NEVA 4LC6A 3CC1A 1ME7A 4LY8A 4IUOA 4FIRA 2A1YA 3DKLA 2E09A 4L4MA 4WY0F 3VI2A 4X3ZA 3NG3A 2ABBA 3W1UA 1OHLA 1G69A 3JR2A 4JTUA 3W2UA 1TPC1 2A7RA 1Q45A 3KOFA 3LV5A 3OA3A 3QMTA 4QM1A 2E1DA 4FNRA 4JTJA 3MI6A 5E93A 2ZA1A 3BV4A 3DAQA 3DH7A 5J5DA 2ZZ5A 2J9XA 1OYAA 3NQMA 3KRZA 1O5KA 1YDVA 1TO3A 5D30A 3LERA 2G95A 1Q6OA 3IIXA 2NX3A 5CSSA 3W76A 3G0UA 1UB3A 4RCXA 1HO4A 3V75A 1JRBA 3WFAA 3RLUA 3G1FA 3M41A 3LLFA 2BZNA 4QSHA 1XFBA 2B7PA 4WD0A 5HQEA 1RVGA 1W31A 3NQ8A 3INPA 5KZEA 1GJPA 2YFNA 3W72A 2OT1A 1O94A 3TFXA 1IXPA 1W8SA 3W7EA 2CLKA 4K7YA 1TTJA 2XN2A 1VCVA 4IJBA 5CGQA 5D32A 1KLZA 3IRDA 3FYOA 4PCFA 1DL3A 1GG1A 1O60A 2O7QA 4MZ8A 5DLCA 3W2LA 4BF9A 1EWEA 5D02A 3OIXA 2BLEA 2FB3A 4MZYA 3QPYA 2Y7EA 3SSJA 3ABRA 3L21A 4K7VA 3OG3A 4AXKA 3I7SA 3P8JA 3L2IA 4O12A 2YYUA 1KV8A 1J2WA 2E5DA 4DXVA 1W37A 3W7RA 2WOQA 2VFGA 1WAUA 4FNUA 1FCUA 3EWZA 3DBPA 1Q6RA 3PBVA 2B4GA 3WJWA 2X1TA 1HFBA 3W7NA 5F4WA 1Z41A 3W2KA 2FFCA 4N2YA 4JY8A 2BTMA 4OV4A 2B0MA 4NNCA 1ZENA 1DHPA 3W2MA 1MO0A 4O16A 2HS8A 5AHNA 4CCCA 4YCOA 3W74A 3F4WA 2H3DA 2QUUA 3EXSA 4LVDA 4HT3A 4OGZA 4IPIA 3R2GA 3QZEA 4NNAA 3RLVA 3W1NA 4PC8A 4UTIA 1N7KA 1U5JA 1ZAHA 2CZEA 2D73A 3TC7A 3NQVA 2WNNA 2ZZ6A 5DN1A 5AHEA 5IM51 4Z0SA 3TK7A 1OFEA 4ONVA 3STFA 4M7SA 3UPWA 4K6AA 1TSIA 4JTHA 3SZ8A 4Z1BA 4QITA 3STEA 2YGYA 4Z1AA 1SZEA 1TTPA 2A2IA 3W87A 2WSYA 2RDWA 1GQNA 1XBYA 4KFNA 2QDGA 1KM2A 3L5LA 3HGSA 4RJEA 4ADUA 1PIIA 2WSRA 2QAFA 4MYXA 4HPXA 1MEIA 2Q3RA 4KFPA 4AB4A 1G7UA 4FX8A 3NZ1A 3UZ5A 2Y61A 3LCWA 5F4XA 1C29A 3A9IA 3BGGA 3DFPA 4CNNA 1YPFA 1D3GA 4P2VA 2ZRUA 3S1VA 3C4UA 1DKWA 2ZRVA 2A5HA 3S42A 3TNOA 3PUEA 4HNTA 1T8XA 4GBUA 1ICSA 3FIGA 4JXCA 3C6CA 5EMUA 1O95A 3L65A 3MW7A 5LKYA 4GC4A 3SFKA 1CX9A 4DELA 3C2RA 3FLUA 3S0CA 1GVQA 4GUHA 4JIPA 5FESA 2A7PA 3M6YA 4Z1DA 3QW3A 3CB8A 4QQ3A 2VELA 3ATYA 4N9EA 2G96A 4NJIA 1QOQA 4UTMA 4GUJA 2QCCA 3W7JA 3BW3A 3HF3A 3O06A 4JTKA 1XUZA 3EWYA 4O15A 4Y96A 3KRUA 3LCHA 5C5YA 3MHFA 3W86A 3M16A 3HJZA 3VE9A 1TRDA 5G2IA 4M6VA 3IIZA 3G0XA 4R53A 2F84A 4LC8A 1FWRA 3MI3A 1OX5A 4N6EA 2QJIA 2YCEA 1SO4A 3MJYA 3H55A 5ABTA 1H7OA 3PG9A 3G1DA 3C56A 3SGUA 5CPMA 1WX0A 4RZ5A 3MBFA 3TCEA 3GKAA 1AG1O 3CIXA 5BOOA 1F76A 4UTJA 4E2DA 3UXAA 3TAOA 5DCDA 4ICNA 1OK4A 2YW3A 4IX2A 4I7WA 4IQLA 4QNEA 3DHFA 3R89A 3TSMA 3W1TA 3QEZA 3ELFA 3GXPA 3OBKA 4JICA 1XKYA 2NUWA 3O6CA 1P0KA 2DJXA 2GPTA 4K38A 4NVTA 3DKJA 3LCLA 3PAJA 1IGSA 1A5BA 4GRSA 1BWLA 1R30A 1BKSA 5C54A 2QAPA 1S3HA 4CQ9A 3MBDA 4HHPA 3VKJA 3LTPA 3U8GA 3C2OA 3PS7A 3HGRA 3P80A 5HWMA 1SW3A 2PRMA 4XUGA 2C6QA 1W5PA 2JGYA 4MLRA 4RX0A 4EWND 1LOLA 3DHDA 3GIYA 5K9CA 3P5YA 1H7WA 1K7XA 1U83A 2B7QA 2GJLA 4JTEA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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