1K8ZA

Crystal structure of the tryptophan synthase beta-ser178pro mutant complexed with n-[1h-indol-3-yl-acetyl]glycine acid
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
268
structure length
257
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSALPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
publication title Crystal structure of the beta Ser178--> Pro mutant of tryptophan synthase. A "knock-out" allosteric enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
total genus 98
structure length 257
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2001-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1k8zA00
4WJEA 2BLEA 4YCOA 4O8RA 3W1AA 1H63A 2QCDB 1FWTA 2BXVA 3T55A 3E02A 1GJPA 3G3DA 5AHEA 5HWNA 1D3GA 3VE7A 5LKYA 4R53A 1T0OA 4NNBA 4Y96A 1XFBA 4HPXA 3B8DA 4LUIA 4LVFA 5DLCA 1G69A 2J88A 4NJKA 2B0MA 1YXYA 1OFQA 2NZLA 3P60A 3UZJA 1OX4B 3W1XA 3FIGA 1GTHA 4HHPA 3FLUA 1QO2A 3EX1A 3OEXA 4GC4A 1EUAA 1Q6QA 2QEZA 3U8GA 1ZAJA 3IRDA 4EVZA 3MWAA 5F2GA 4I7UA 4IMFA 3N9SA 2A6LA 2GPTA 1PVNA 1P4CA 2UV8G 4JIQA 3LHYA 4TX9A 2VEMA 4O4WA 3O15A 4JEQA 3W1PA 3OHIA 3NQ2A 2CZDA 4XBKA 1XUZA 4NVTA 5I3JA 4JTHA 1L6SA 5G4EA 2NX3A 3TQKA 3LCFA 3DAQA 2WNQA 2TSYA 2VEPA 5K2ZA 1GVRA 3IV3A 2YYTA 3HGRA 1JCYA 1NF7A 3GX9A 5LGXA 3QEZA 4RJEA 3TV8A 3O8AA 2FDSA 1O5XA 3NA8A 3TIMA 2E5CA 3W6YA 4MZ1A 1P5BA 4RLIA 1GOXA 1VPXA 1KM4A 1H51A 4BWLA 2JK2A 3C2EA 4UTKA 2Y7FA 1W3TA 2C19A 3QMTA 3NQAA 1WA3A 4XKYA 3F4NA 3ABRA 3LRLA 3W2NA 3FS2A 3S1UA 3GR8A 3W9ZA 5KTLA 2CLOA 3EEGA 1W5PA 1ZAIA 3W1MA 3W74A 1VR6A 1TCDA 2YZRA 2CWNA 4J9JA 5FF2A 4N6FA 5K4XA 3O1NA 1IXOA 4NNAA 2EHHA 4ZQPA 1Z48A 5FF4A 3IIXA 3M5YA 2VEIA 3EWUA 3W7JA 3W1LA 5HNRA 3MP3A 1JR1A 1F7BA 4FNQA 2D73A 4O16A 1DQWA 2V2CA 5KZDA 1T96A 4DO4A 1N7KA 2JGQA 3STFA 1J5TA 3W7KA 5BMXA 4IXXA 4OHQA 1A53A 3BG5A 4QM1A 3G1FA 1IGSA 2V0TA 4RCXA 3CB8A 4AHOA 3CU2A 4YMZA 5C55A 2IQTA 3B0VC 3GDRA 3L9CA 3C2FA 4BR1A 2DJLA 2NX9A 2JGYA 3O6DA 2Z1BA 3QM3A 1SO3A 1EB3A 3WK2A 1TPC1 6ALDA 5I3IA 4YL2A 4OBTA 3ZS4A 4W9TA 3QQ1A 4HSNA 1NEYA 3A23A 3UQNA 1W0MA 3TJXA 1H1YA 3W1RA 4FNTA 5DN1A 5CZSA 1XCFA 4MZ8A 1XDMA 1TJPA 1KM1A 3WJWA 3HPZA 1LZOA 1QMLA 1AL8A 2CLHA 2VKZG 1RVGA 1DKWA 2B7NA 2NXIA 5G2HA 1TTJA 1DQXA 1PHQA 2C15A 3G8RA 4N02A 3PR2A 5LGZA 3BLFA 5F4SA 5HUOA 1KW1A 5KSWA 5D30A 3W86A 4DF2A 2J27A 2YGYA 2YR1A 2NLIA 4S2BA 2QUUA 3QMSA 3E96A 3LDVA 1DL3A 5FEWA 4LOCA 5U4NA 3I7QA 2I9EA 3R2GA 1GT8A 4NJJA 2QDGA 1P0KA 3UWVA 1E51A 1KTCA 4FNSA 3W70A 1YDVA 4WXZA 4JTGA 1TPDA 4UTLA 3EX2A 4PODA 1PE1A 1L6YA 2PRLA 3M47A 3W3OA 1AW5A 3TW7A 2XN0A 5T26A 4O13A 1FBAA 3QF0A 3LM7A 4N4PA 1KFCA 4JDBA 4AF0B 3FYPA 4O18A 3NZ1A 2HSAA 4DO5A 2WQPA 1PCWA 1CX9A 3NL3A 3SY5A 4S2CA 4UTWC 1FCVA 2ABAA 3EXSA 3KVMA 1IIGA 1B3OA 2ISWA 5CPNA 1Q6LA 1KBJA 2GVGA 3LXAA 1XBVA 4HT3A 3W88A 4LW7A 2RDWA 4UTUA 4IGHA 4FO4A 2ZRYA 1R2RA 2FQIA 3BW2A 3HBLA 4MFDA 3P61A 5DCBA 3NPXA 1W3IA 2A2IA 3BGJA 4WZHA 4EIVA 1O4UA 3G1DA 3P81A 3VCRA 1JQVA 1Q6RA 4X3ZA 2FPVA 3UWQA 5HR6A 1CW2A 1RQBA 4MOZA 3M9YA 3W22A 4JTLA 2J24A 1WOBA 3L5MA 3TMLA 2PE4A 3IIPA 3STGA 4FHAA 4LV4A 4BI5A 5D38A 2Y88A 3QYQA 1ME9A 1NF0A 3FJLA 1YDOA 5CZ0A 3U2OA 4IPIA 2O7SA 3CC1A 3W7GA 3NO5A 1S3HA 5J5RA 1B57A 4R34A 1T8XA 1UB3A 4N2YA 5AHIA 4MYXA 3W2UA 3CEPA 2AAMA 1X1OA 3GAKA 4N9CA 1WBHA 3EKZA 1VYRA 1I4NA 2ZZ5A 5AB3A 1X6UA 2NWRA 1XUUA 3TAKA 5C6MA 2WSRA 3ZR4A 4KFPA 3D0CA 1H61A 1ZY9A 3UY7A 1S5TA 3NQDA 3CTLA 1YYAA 4NZFA 1TPEA 3NL2A 4YLWA 2HTMA 3PF3A 1GZGA 3S9YA 2WNNA 3WJYA 3W1TA 1GEQA 1GG1A 4NU7A 4CQAA 4WY0B 3KVLA 3S1XA 3CPRA 3GK0A 3ZWSA 4O53A 4JDYA 1EWDA 4WD0A 4PL2A 4QISA 3SECA 4JTSA 1LLWA 3NZRA 1OK4A 3QPZA 4X9SA 3BPWA 1AL7A 4UTTA 4AMAA 3EKLA 4R33A 1GVOA 4N9EA 3PM6A 4O0KA 4DF1A 2BWGA 1TPWA 5HMSA 4M7TA 3G1HA 4FIRA 2Y7EA 3DENA 1TPB1 3F4WA 1TV7A 1WQ5A 1OF8A 4MPQA 4PA8A 3S5YA 3W72A 1I2NA 2ZZ3A 3PY2A 1HFBA 2X16A 3KRZA 4UFKA 1YTKA 2I1OA 3EX6A 2VFIA 1SZNA 1H7PA 4ALDA 2Y63A 3USBA 3NQFA 3KHJA 4N9DA 1XC4A 4ONVA 2I14A 2ZRUA 3G1AA 3MJYA 1TTIA 2CZEA 3T40A 5LHFA 2ZZ1A 4ZQCA 3R12A 5HUPA 3L65A 2Y6ZA 1OX6A 4O1BA 1O5KA 2VC6A 2CLIA 3QJAA 4RK8A 5AC7A 3ATZA 1PHWA 1TMHA 5G1TA 1GQNA 4DF0A 2QUVA 2PC4A 2OJPA 3L67A 1RQHA 3LHTA 1R30A 3TJLA 3O63A 1SR9A 3NM3A 3DH7A 2ZRVA 1WX0A 3GDTA 1GVSA 5D2XA 3LBCA 2R94A 4LVBA 1C29A 4O1CA 1I8JA 4UFJA 4BFAA 3G3MA 5CSRA 4K8HA 1JRBA 3FOKA 4OT7A 1HTIA 4HPJA 3LLFA 2ZZ2A 4JD4A 4ORMA 5CPMA 1Z41A 1F6KA 2WO5A 1LYXA 4HSOA 1JRCA 4JGDA 2B7QA 3K30A 1ZAHA 3S42A 3B04A 2CW6A 2DU2A 1GVQA 1V7YA 4IJBA 5TQLA 4X2RA 3LXCA 4PEKA 3STEA 3DKLA 2Q8LA 1RV8A 3PB2A 2P10A 4EWND 1SSDA 3WFAA 4PFMA 2ZA3A 1DORA 5TBOA 2Y89A 4PCFA 3W1NA 3Q94A 2ZRXA 3C8FA 4KWWA 1B9BA 5BMWA 2ATSA 3G1SA 3GAYA 5CZTA 3WK3A 3EWYA 3PS7A 3IGUA 4N9BA 1RZMA 1ZNNA 1OHLA 2NUWA 3FA5A 3O6CA 2PRHA 3OIXA 4UR8A 2J9XA 2A7PA 5H91A 4LNYA 4GWEA 1KM2A 2X1UA 4IMEA 4UCGA 3WK1A 1FCBA 2Y7GA 5LNVA 3OBKA 1MO0A 3PB0A 4BF9A 1FDZA 4XZ9A 1YLVA 1SUXA 1BTMA 2CU0A 3MBDA 3GVGA 3TK7A 3NYZA 4WOQA 4NJIA 2BX7A 1SO4A 1TB3A 2Y85A 2QAPA 5LHEA 1FQ0A 3IVUA 3UNDA 1SZEA 1H50A 4TU1A 5K4ZA 3N3MA 1WYIA 2TPSA 3W2JA 1LRNA 4FB7A 2YSWA 2YFOA 3L68A 3EWBX 4LTSA 1FCQA 3DGRA 4N6EA 3LCHA 2WNZA 3TKFA 2VFHA 1JVNA 1W5NA 3IVTA 2QCMA 2DZXA 2VFDA 1EEPA 4WX2A 1QAPA 2CLKA 3NGJA 4O57A 3HIJA 1I2QA 3IIVA 4E2DA 1ZJIA 4WUIA 4AWUA 3TSBA 2NV1A 2EF9A 3W7MA 2G97A 1DOSA 5IBXC 3P8JA 1YXDA 3RK8A 3LCWA 4JN6A 1W1ZA 3FJ6A 1THFD 5EY5A 2ZZ4A 3JRKA 4QNEA 2R91A 2A7RA 4Q32A 4MY9A 3N2MA 1M6JA 3NPVA 1HO1A 3MI6A 1F76A 4GUJA 4ZVJA 2Z0IA 3TMQA 2GUUA 1XI3A 3PG8A 1VYSX 1W5OA 3SZ8A 3B0PA 1P0NA 3C52A 1ADOA 3EX3A 3GKAA 4XTDA 4WY0A 3ABQA 4GXMA 3T78A 5U7SA 3HPXA 1ICSA 4UFMA 5BNKA 3P80A 2B7PA 3THQA 3NQVA 4ICNA 5CG7A 3E9AA 3NR0A 1FXPA 2PURA 1DJQA 3F1QA 4O0ZA 3EXTA 3GXTA 3CLMA 3HGJA 1O60A 4HNUA 3KXQA 3GDLA 3NVTA 4MJMA 3LRKA 1JULA 4GBUA 1F73A 3M16A 3W1UA 3TFCA 4WXYA 5EYWA 5BW6A 2OCZA 3LTPA 2C6QA 4M6PA 4UMBA 5D03A 4KKXA 3CIWA 3HO8A 2FPYA 1GTEA 3UD6A 3LHUA 4A3UA 2H8ZA 4O12A 2H90A 3YPIA 4Z1AA 4O15A 1EPXA 2GQ8A 3DU0A 5D2WA 1R2TA 3V1PA 2WOQA 1TTPA 4JTJA 2NXGA 3NQCA 2CFFA 2DZPA 3KOFA 1TPVA 3C4UA 3PAJA 4LRTA 1Q6OA 2OT0A 1I2PA 4DO6A 4ZQRA 3GZ3A 3TX9A 4HNVA 1KV5A 4AB4A 3EX4A 4KFOA 4QQ3A 1MEHA 4CLMA 1OX5A 4WOZA 4R7JA 3C6CA 3RF9A 3LX9A 5DXYA 3P5ZA 2QR6A 3QZEA 4OWGA 2X1SA 3M5XA 1EWEA 2XN1A 1BWLA 3TA6A 3CEUA 3HG5A 4NUWA 2YYUA 3HQ1A 3P5YA 3NQEA 4CQ9A 3N34A 3NPWA 2QDHA 3N19B 3S0CA 2FIQA 2E68A 2Y7DA 3TXVA 3N73A 2ZA2A 5CGQA 4XUGA 1UUMA 2TMDA 5MHBA 1SW3A 5I3FA 2V2HA 2JBMA 3L5AA 2HMCA 3DI0A 1F2JA 1R2SA 2EAWA 3W7RA 2VENA 5HWJA 4QJ1A 1B4EA 3W7LA 1TRDA 3NL5A 4NX5A 5I3HA 3S5OA 4FX6M 3GDKA 4FF7A 2B4GA 5K9CA 1KM0A 3A9IA 3T4CA 4QITA 2PCQA 3LV6A 4O14A 3R89A 3BV4A 4M19A 3RU6A 4JX6A 3G1VA 4P2VA 2R14A 1EA0A 4MLRA 1LORA 1HO4A 1M5WA 2ZDRA 1LOLA 3CWNA 5ABTA 4FX7A 3QFEA 3W7EA 5E1QA 5FF0A 4RZ6A 4JTUA 4FXSA 3THAA 3OVRA 1W5MA 4IMGA 3IIZA 3BG3A 1GG0A 2A0NA 3NEVA 3QPYA 1N55A 2EPHA 1H7OA 4N4QA 1KM6A 2QJGA 4JNMA 4MUZA 3NQ8A 2QCCA 2B7OA 3OVQA 1AW2A 4MLJA 3Q58A 6TIMA 4BK9A 1HG3A 5GVJA 2QCFA 2VFEA 4ZQMA 2ZQ0A 5AOUA 1EX5A 4RR4A 4HN4A 1OABA 1SU5A 1OYBA 3F03K 4CQ8A 3BARA 1K3UA 4QSHA 5F4WA 3ABSA 3DFQA 1TRIA 2DZWA 3PBYA 1W37A 5EL1A 1NSJA 3PBUA 3A21A 3WJSA 5DY2A 1K8XA 3DHDA 2DZUA 2A5HA 3VFLA 5AHFA 4HNTA 1JUKA 1IF2A 3L66A 1SZGA 1O94A 4E0CA 3MP5A 5IM51 5EMUA 1QR7A 4S1FA 1PCKA 5LZLA 3BW3A 3LHZA 1VZWA 3OG3A 2OX1A 3TQVA 4FNUA 5EA9A 3B0UX 3MUXA 4OV9A 3W7OA 3RFAA 4M6QA 1ICPA 1TO3A 2ZBTA 3W84A 3N9RA 3W7QA 1H60A 3L0KA 2Y62A 3QSRA 3TXZA 3Q37A 4AWTA 2V9DA 2RDUA 1SQ7A 4JY8A 3GNDA 3T7VA 3WJZA 4K37A 1FX6A 4MKNA 2E6AA 4ML9A 5AYZA 3MBFA 4QIUA 3P74A 3CIXA 3UWUA 5LNRA 8TIMA 2GJNA 1I2OA 1JCLA 2Q8ZA 3B03A 5G2WA 3W75A 2X2GA 2WSYA 4PH6A 3TC7A 3DFOA 4Y6GA 3TSMA 1KM3A 1NVMA 1OFBA 2JKAA 4DBDA 3UWWA 1F05A 1YPIA 2P0OA 3HGOA 1BWKA 1QOPA 1VHNA 2ZRZA 4YCPA 4LUJA 2FFCA 3E0IA 4D2JA 3WK0A 1QPQA 1QDSA 1VQTA 3H54A 4A22A 1LDCA 3SFKA 1VHCA 4ZMGA 2P1FA 4Z0JA 2YX0A 3CWOX 4C1KA 4Y8FA 3S6DA 3C2OA 1TYGA 4POCA 1TPUA 1ZALA 3GXPA 1RPXA 2ZZ6A 1TSIA 3GR7A 2E5BA 2F7FA 2Y61A 3ATYA 4AEOA 3NQMA 3QQ0A 1OYAA 2V8ZA 1QO5A 1C9DA 4LC6A 3UWZA 3UZ5A 1ZFJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2VRJ A;  2WJE A;  4S3A A;  3ITX A;  1FWT A;  1CXF A;  5AHE A;  5HAT A;  4NNB A;  4V15 A;  1XFB A;  1C90 A;  4TXE A;  2VGG A;  1YIX A;  5DLC A;  3ABX A;  1US3 A;  2J88 A;  4NJK A;  3H2A A;  3Q65 A;  4IIE A;  4W7V A;  1G01 A;  4RV3 A;  4KIR A;  3FIG A;  3UBP C;  1GTH A;  3ZZ1 A;  1Q4W A;  3F4D A;  2CIT A;  1ZAJ A;  2XPK A;  3IRD A;  4IFK A;  2NLY A;  3MWA A;  5C9R A;  2A6L A;  1YE6 A;  1RJP A;  1YW1 A;  4DLM A;  2GPT A;  2DVT A;  1PVN A;  4FLS A;  1P4C A;  2ZKM X;  4QLK A;  2D3N A;  4XBK A;  3OHM B;  1PKM A;  2EPO A;  2BY3 A;  2QXW A;  4NVT A;  1KQZ A;  3EOL A;  5CLT A;  5G4E A;  3TQK A;  3DAQ A;  4Y8E A;  2TSY A;  2VEP A;  2R24 A;  1ONE A;  2XIQ A;  2WZH A;  3IV3 A;  2DVU A;  2PGF A;  2YYT A;  1E6X M;  3CQI A;  3GX9 A;  4LAM A;  1JYV A;  3L23 A;  3O8A A;  2E5C A;  2WVV B;  2YCL A;  3W6Y A;  2J7E A;  3LPO A;  4DZ5 A;  3VZX A;  3V36 A;  2JK2 A;  4UTK A;  3I6E A;  4XK2 A;  3MVI A;  3VM5 A;  1UD3 A;  5JXQ A;  3NQA A;  1TUF A;  2UY3 A;  3BCF A;  3ABR A;  3QV8 A;  3S1U A;  3W9Z A;  3HV8 A;  3QY7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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