3TFCA

1.95 angstrom crystal structure of a bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase (aroa) from listeria monocytogenes egd-e in complex with phosphoenolpyruvate
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
348
structure length
343
Chain Sequence
LRTQVDQLNIDLLELISKRANLVQEIGKIKLRFDPLREREMLNTILAANEGPFEDSTVQKLFKEIFKAGLELQEEDHSKALLVSRKNKKEDTIVTVKGLPIGNGEPVFVFGPCSVESYEQVAAVAESIKAKGLKLIRGGAFKPRTSPYDFQGLGLEGLKILKRVSDEYGLGVISEIVTPADIEVALDYVDVIQIGARNMQNFELLKAAGRVDKPILLKRGLSATIEEFIGAAEYIMSQGNGKIILCERGIRTYEKATRNTLDISAVPILKKETHLPVMVDVTHSTGRKDLLLPCAKAALAIEADGVMAEVHPDPAVALSDSAQQMDIPEFEEFWNAILASNLV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/isomerase
source organism Listeria monocytogenes
publication title Structural analysis of a 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase with an N-terminal chorismate mutase-like regulatory domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase
total genus 121
structure length 343
sequence length 348
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00793 DAHP_synth_1 DAHP synthetase I family
A PF01817 CM_2 Chorismate mutase type II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.59.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Chorismate Mutase Domain, subunit A Chorismate mutase 3tfcA01
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3tfcA02
2VFHA 1L6SA 2Y6ZA 1R46A 1HTIA 3A21A 4AHOA 1WBHA 2YFNA 2QF7A 3H55A 4AXKA 1KLZA 1MEHA 4UTIA 3PC0A 4JTIA 1EA0A 2QR6A 3V75A 3W70A 1MO0A 2C13A 1AMKA 1SO6A 1TYGA 3TJLA 3IIVA 5K9DA 4PL2A 2WSYA 3MO7A 5EYWA 3M9YA 1SO4A 3N34A 2D8EA 1KM0A 4L4MA 3MBDA 3S5NA 1XDLA 2J9YA 4JTHA 4E2BA 5HWMA 4UTJA 4JNMA 1VRDA 4PTNA 2G95A 5D38A 4MFEA 2YPIA 1VLIA 3KHJA 1ZAHA 3UPBA 2DZUA 1RV8A 2CLFA 1OVDA 4D2JA 4AWTA 3EX6A 3RLVA 1VS1A 2NUYA 3F4NA 4NT0A 1KFKA 1T8XA 1RZMA 3SZ8A 2OX1A 4J9JA 3P61A 3P81A 4JTEA 3EWWA 4QSHA 2DZSA 2WKJA 3NNTA 4MY9A 2G5WA 3CC1A 1SZNA 3BW4A 1OF6A 1VYSX 1H7OA 1KBIA 3W2LA 4MIMA 1JCXA 3TIMA 5IBXA 3EWZA 2VFIA 1YDVA 2TMDA 2B7NA 3O06A 4ALDA 1TTJA 5H2ZA 1SU5A 2P1FA 2GJLA 4LW7A 5A5WA 1GOXA 3LRKA 3SY5A 1TO3A 2AAMA 4PEKA 3C52A 2FB3A 3G1YA 5CKSA 2ZRWA 2YGYA 4MUZA 3RETA 2B7QA 2CLMA 2FB2A 2QJHA 4XKYA 1W0MA 3TW7A 4IX2A 5AHNA 3C2FA 3NQ8A 3W1QA 4KFNA 2HSAA 3TFXA 3DFQA 3G0SA 2FLIA 2C15A 2DORA 2EHHA 3QRHA 2ZRXA 4WY0A 3T7VA 2A4AA 2YXGA 5FF2A 3LRLA 3PSWA 4WXYA 3W7IA 2VXNA 3MJYA 2PRMA 4RZ5A 4GRSA 4EF9A 1G4PA 4CNNA 5TIMA 1CX9A 2BZNA 4PH6A 2F7FA 2QAPA 4MFDA 1K7XA 1KBJA 2V81A 3CIWA 5H91A 5G2HA 1FDJA 3UYCA 4O50A 1QWGA 5LKYA 2YYUA 1TJPA 2GVLA 1J4EA 1VCGA 4O11A 1G67A 3PY2A 3W7KA 5D04C 3O6CA 3SR7A 2YDAA 1YLVA 1AG1O 5HWNA 1B57A 3FLUA 4NNBA 3HIJA 2CLIA 1XDMA 3KRSA 3HGJA 3TSMA 4ZVJA 3UWVA 3QSRA 1YTDA 2A7NA 3UQNA 1EP2A 1X7FA 4TR9A 4JXCA 4QNEA 2FTPA 4XWUA 3BLIA 2E5DA 5DY3A 1N55A 5CGQA 5I3HA 3VFLA 4XBSA 3P84A 3PF3A 1OFEA 4R34A 2LLEA 1ICSA 3NA8A 3N9RA 5DBTA 4FO4A 1EWEA 2VEPA 1BKSA 1D9EA 4IQLA 3GR8A 1TV8A 2RKXA 1GVRA 3GZ3A 2PRLA 2B7OA 1Z44A 1PV8A 3A5FA 5KSWA 4UR7A 1X6UA 2BTMA 1QAPA 1GYNA 1WOAA 2QUUA 3LOTA 3RNDA 2JKPA 3C61A 1JCNA 1G4SA 1XI3A 3L5LA 4AB4A 4UFLA 3CT7A 2ZZ2A 4L4LA 1I2RA 2JGQA 5K9XA 4B5NA 3FYOA 3G1DA 3PAJA 3MWAA 2ABAA 5L9FA 2NZLA 5TBOA 3ATZA 2QCMA 3W71A 5AB3A 3N14A 3MP5A 3U2OA 1FXQA 4Z1AA 1Z41A 1K7FA 3USBA 5FEZA 3HGRA 2WJZA 4TMBA 4MY1A 1N8FA 1E51A 4RXFA 3EX2A 4IMGA 4LVDA 1DVJA 4FIQA 4UFIA 1OFRA 5G2IA 1R2TA 1SZFA 2G96A 2YW3A 4FB7A 5AFDA 5D05A 3DHFA 2WNQA 3LBCA 1L6YA 3QEZA 3NOEA 4RR4A 5FF4A 1TB3A 2WQPA 2TPSA 4YXGA 4N6EA 4HNTA 5AN7A 3G3MA 4N9EA 3W1PA 1VQTA 3GAKA 2VEIA 4UNKA 5EL1A 4ADTA 1QMLA 3FJLA 4LUJA 3FOKA 1OYAA 4RJEA 1LYXA 1W3NA 4AMAA 5BMXA 1LBLA 1Q6LA 3HGSA 3ZFHA 3ZWTA 1YTEA 2DZVA 2XN1A 3W7RA 2YCEA 1C9DA 2VFGA 3L21A 4RLIA 3P8IA 1GTHA 3HBLA 2J9ZA 4FEZA 4LC6A 4EVZA 3W7CA 2ZQ0A 1FUYA 3QPYA 1OK4A 1GG0A 3H54A 3THAA 2E09A 3CWNA 1D3GA 2JBMA 4PL1A 4O8RA 3PULA 1NF0A 4OBTA 1ZCOA 3O8AA 4IMDA 2ABBA 1OFDA 3W7HA 1SW7A 4FNRA 4N6FA 2W0UA 1TTQA 1JRCA 3TFCA 2H9CA 4Y6GA 4OHQA 1AW5A 3G8EA 1HFBA 2A6NA 3LCWA 1PL9A 3G22A 3NR0A 2CWNA 3I7QA 3TQVA 5LNRA 5AHLA 3KRUA 5F2GA 2E6DA 3QPZA 5CZTA 1FQ0A 1SSGA 5CPOA 4XUGA 5G4EA 2C0AA 3LDVA 1SFLA 2FPTA 5EA9A 3A9IA 2X1UA 4FF7A 4X22A 1SW0A 1H51A 2VEKA 5LGXA 3GDLA 3BPWA 4BWLC 2ZA3A 3MP4A 3EXSA 5D2XA 5FEPA 3M47A 3UWYA 1FXPA 1Q6OA 4Z0JA 4GFSA 2I9EA 1KFBA 4JX4A 1FWWA 3CQ0A 3RMIA 4ZQMA 3A5VA 3INPA 3W2JA 5K4ZA 1BWLA 1GTEA 3A23A 3B03A 1VHCA 2W6RA 3MI2A 3TDFA 1IIGA 1OF8A 3DU0A 3HF3A 3RFAA 4A22A 3L68A 3NAVA 2XN2A 1I2QA 3NQEA 1H60A 3NYZA 2RDWA 4CQ8A 1IXNA 4PA8A 3M7WA 2Z6JA 4UXDA 4M19A 3L65A 5ABTA 4NUWA 4OU1A 3I68A 3PG8A 4GUIA 5EMUA 4U28A 1T0OA 2V82A 3H53A 3NQVA 1LRTA 1FY6A 3W85A 1VR6A 5F1UA 4BI6A 4EIVA 4IJBA 3JR2A 2QCEA 1XBYA 1H1ZA 1JJKA 1KFJA 3NPXA 3HGWA 5D03A 4O4WA 3KOFA 1IIHA 1GPWA 5E0KA 1TPWA 3UZJA 2NXIA 5HNRA 4YCOA 3REMA 4Z1BA 4IXXA 3W74A 3EWXA 1LORA 3KAOA 4K8EA 5CPLA 4O17A 3TQ0A 4KKXA 1IF2A 1EUNA 3RU6A 5FF3A 3M5VA 3WJZA 3L0NA 3GXTA 3HPZA 4FHAA 5CZJA 4MKNA 1LM1A 4ORMA 5D33A 2C16A 5BNKA 1O5KA 3NL6A 1A5AA 4MLJA 1P0KA 5AHEA 1I2PA 3N2MA 2OZ0A 1ZAIA 4LRSA 1RPXA 5HUPA 3GK0A 3ATYA 3S5OA 2JKEA 5AOUA 3TKFA 5LHFA 4JX5A 3DFPA 4LVBA 4LNYA 3LCLA 1LOQA 5DELA 3NQDA 5E1QA 3RLUA 1DORA 2F84A 4HHPA 3MP3A 4NJJA 1UUMA 3W7JA 3R5EA 3MMTA 5DXYA 3ZR4A 2X30A 1MEIA 5FI8A 3KVJA 4GJ1A 1DOSA 2Y7EA 4JDYA 1JRBA 3IIXA 2QCCA 3FEMA 4EOUA 2J6XA 5I3IA 4DF1A 1I45A 3LXCA 3TE9A 3HPSA 1DBTA 4JTFA 1YPFA 4JY9A 4NJHA 1FBAA 1QOPA 2RFGA 2WNZA 1K3UA 1TTPA 5KITA 1AW1A 4RXGA 1V7YA 3DFTA 4OQVA 3EX1A 4HNNA 3MHUA 3PUDA 1JR1A 4O53A 1FX6A 2W79A 3EEGA 4O52A 4PC8A 1KFCA 4O14A 3F03K 1LRNA 5F2LA 4DELA 5G5IA 2C1HA 3LM7A 3NM1A 2E5BA 1OX5A 1KW1A 3TNOA 4QIUA 4JTKA 5K3VA 5IBXC 2QCLA 3CU2A 4E2DA 1Q3NA 3QMRA 5LHEA 3MHGA 3S1XA 3U8GA 1KV5A 3UNDA 1ECMA 3BG3A 1JCMP 3WFAA 1FCBA 2D8DA 3RK8A 4P61A 5EPDA 3DI0A 1W31A 3GB6A 4MVAA 1OHLA 1WDWA 5TQLA 3FJ6A 1MSSA 4YL2A 1GG1A 3GNDA 4LUIA 3S6DA 3N3MA 5BRBA 3W76A 1LROA 2E6FA 3G3DA 1LOLA 2QCDB 4RZ4A 4IPIA 4MJMA 3E9AA 2XFWA 3ABQA 3B04A 4JDBA 2V0TA 3LERA 1KM1A 1TRDA 3NQ6A 2GPTA 5I3KA 3QQ0A 4N9DA 1TTIA 3BK0A 1HUVA 4NQ1A 3CIXA 4OV4A 2OCZA 1THFD 1F74A 1OYBA 1UASA 2TYSA 4Z08A 3QW4B 3W7DA 2VEMA 1QFEA 1K02A 3TMLA 4A2SA 4NX5A 1GQNA 1RR2A 1YTKA 2CZDA 4NXSA 4TX9A 5AYYA 1SFJA 1UBSA 3M16A 3S5YA 3W7NA 1KM5A 2ZRUA 2TSYA 5L6UA 3SGZA 2GTVX 3IVUA 1OABA 2BWGA 3TX9A 3W2UA 2A0NA 4NX0A 3LI0A 4JD4A 1QPNA 1TPH1 3FIGA 4I7VA 1DKWA 1DQXA 1SR9A 1QO5A 3E0IA 1R30A 4E38A 2I1OA 2ZA1A 3W2MA 2P10A 4MY8A 4DQWA 2EF9A 3GXPA 4JY8A 2CLKA 1UB3A 3NQ7A 1EX5A 2UV8G 1WXJA 5LNSA 5T26A 1T96A 1OX4A 3LCFA 3NO5A 2NWRA 3W87A 3DXIA 1XUZA 3GDMA 2QJGA 4WQ6A 3TA6A 1S5TA 3PVFA 3PS7A 4K36A 1JCJA 3O6YX 4UMCA 4I7WA 4DO6A 3OVQA 2AQWA 4FXSA 3B06A 4DXVA 2H90A 3NPUA 3SIZA 2C18A 1Q6QA 2J27A 3QZEA 3PSVA 5CG7A 2H9DA 5J5RA 4MPQA 3GX9A 1S3HA 1O60A 3E49A 1TPDA 4H4IA 4NJGA 2CZ5A 4LVAA 2ZFAA 4R53A 2Q3OA 2ZYFA 3W7GA 2QBVA 3C2OA 3BLFA 1F2JA 2R91A 3GAYA 1YBZA 1FWSA 1GZGA 3TROA 4G1KA 3G0UA 4Z0SA 1XC4A 5CSRA 5LNUA 3IIZA 3DH7A 3HPXA 3G1VA 4AF0A 4XQ6A 3NQ2A 3I7RA 2BLEA 5DLCA 3V1PA 1DV7A 3QW3A 3HOJA 4O28A 4MOZA 2DJLA 2ZZ4A 3L0GA 3EWBX 2BX7A 4O16A 4R33A 3IGSA 3BARA 2Z1BA 2CLEA 4O18A 4JTTA 4M7TA 3TU9A 3FYPA 4FNUA 3QF0A 2O7QA 3LHYA 2A21A 2VFEA 4IWWA 3FFSA 1QR7A 4WOQA 1DHPA 4FNQA 1LLZA 4GXMA 1EIXA 2NLIA 1I2OA 2OT0A 4MZYA 3HB9A 3BO9A 4K7VA 2IQTA 2H8ZA 4HSOA 4UFMA 4PCFA 5AHIA 1U83A 4HNUA 5LZLA 1RQHA 4UTTA 1V5XA 3M44A 1H7XA 1C29A 1OFOA 3P60A 3M0ZA 2HS8A 3KVKA 5D2VA 3C6CA 3R12A 2Q3RA 4UTMA 1CI1A 3S42A 4Y9AA 1W37A 2C14A 5AHFA 4CQAA 1FCVA 2FPYA 1PVNA 4KFOA 4S2CA 4M6VA 2O7SA 1X1ZA 2J24A 4FX6M 2E6AA 2QDGA 3QSTA 3AO0A 4RV8A 3R2GA 1QOQA 1F6PA 2A6LA 4HN4A 4UUIA 1F05A 5KMYA 4QAIA 3C56A 1NEYA 3O15A 3M1ZA 3TH6A 3N2XA 3QMTA 1YXDA 1K03A 3L0KA 5F4SA 3TR2A 3W9ZA 3ABOA 3L5AA 3HG2A 3LHVA 5D2TA 1EPXA 3W7QA 3UPWA 1WOBA 3IGXA 1ME9A 3BVJA 1T99A 1H7PA 1XBVA 3STCA 4K37A 5U4NA 2E6YA 3N19B 4JIQA 1M7PA 1BEUA 3LV6A 3GR7A 5LNVA 1H7RA 1K8YA 4XKYB 1Y0EA 1IXQA 4O0KA 1LZOA 2YX0A 3GKFA 4N4QA 3ZS4A 4LOCA 2CZFA 2E68A 4BI5A 1EB3A 4FXRA 2ZDRA 4WY0B 3S1WA 1VYRA 3HMJG 2E1DA 1H50A 1RD5A 3GDKA 4CCCA 2GQAA 7TIMA 1TV5A 3L5MA 4OGZA 1TCDA 1TIMA 1JCLA 1QCWA 2E5CA 1KM4A 4M6PA 4O54A 4ORIA 4X9SA 3W7PA 3NQCA 4M6QA 4N02A 2VC6A 1XUUA 4JTGA 3CTLA 3IV3A 4POCA 1KA9F 3SJ3A 4UTWA 4YMZA 4GUJA 2Y7FA 3GDRA 3N9SA 5IM51 1XKYA 3PBUA 1IXOA 3IGUA 3M43A 1FDZA 3CHVA 2QDHA 3W75A 1GVQA 1CW2A 3TAOA 1HO1A 1ML1A 4O15A 1Q6RA 4QNWA 3WJSA 5C54A 3NEVA 3P74A 1ICPA 4AVFA 4K39A 3U6WA 3W86A 4ZMGA 1OFAA 3IVSA 5K7JA 1M6JA 4JS3A 3C8FA 3M41A 3VE9A 3MI6A 3NQGA 3MBFA 3P82A 1JQVA 1RQEA 4O1BA 3T40A 1GWJA 1XBXA 3R13A 2H3DA 2X1SA 1G4EA 2ZRYA 1IGSA 1K8ZA 1ONRA 4K8HA 1VGAA 4RK8A 5CZ0A 5HR7A 4AAJA 4NXKA 2QCHA 5D37A 4AHPA 4ZQCA 1MZHA 1YDOA 3TC6A 5D09A 1VYPX 3T44A 1LCOA 4JX6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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