3LOTA

Crystal structure of protein of unknown function (np_070038.1) from archaeoglobus fulgidus at 1.89 a resolution
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
310
structure length
310
Chain Sequence
DDVVIVTCAITGAIHTPSMSPYLPVTPDQIVEEAVKAAEAGAGMVHIHARDPKDGRPTTDVEVFRYICREIKKQSDVVINVTTGGGGTLGIPVEERAKVVPALKPEIATFNMGSMNFAIHPLLKKYKEFKYDWEPEYLEMTRDIVFRNTFKDLEALSRIFKENDTKPELECYDIGQIYNTAFMFHEGYLEPPLRLQFIHGILGGIGTAVEDVLFMKQTADRLIGRENYTWSLVGAGRFQMPLGTLAVIMGGDVRVGLEDSLYIERGKLAKSNAEQVEKMVRIVKELGKRPATPDEVREILGLKGKERVNF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of PROTEIN OF UNKNOWN FUNCTION (NP_070038.1) from ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS at 1.89 A resolution
rcsb
molecule keywords uncharacterized protein
molecule tags Structure genomics, unknown function
source organism Archaeoglobus fulgidus
total genus 107
structure length 310
sequence length 310
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05853 BKACE beta-keto acid cleavage enzyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3lotA00
5CZTA 1OFEA 1TPC1 4JTEA 3EWBX 4EOUA 1Z41A 1JQVA 2V81A 3LV5A 3W7IA 4MZ8A 1BEUA 4CQ9A 4MY1A 1GPWA 2FPYA 4LV4A 2B7PA 1G7UA 5HQEA 2G96A 1I2OA 3O6CA 3FA5A 3IV3A 1TRDA 4L4MA 2FPTA 4GUFA 1L6SA 1FUYA 2QAFA 3T78A 1CI1A 2GQAA 2RH9A 1WQ5A 1S5TA 5EBUA 5FEPA 2FB3A 1D3GA 4R34A 2QCMA 3NQGA 1G6CA 4LS2A 2QEZA 2I1OA 2HSAA 3BGGA 4FF7A 3DKJA 4R33A 4JTTA 2YFOA 5FF7A 4MVAA 1XCFA 1K8ZA 4LRTA 4UFKA 4LOCA 3GZ3A 1W54A 4JR5A 2V5BA 3S42A 3LLFA 4S2CA 2NXIA 4MY8A 5AHLA 2Y89A 1C8VA 1JRCA 1FWWA 2A6NA 1PCWA 1FX6A 1YXDA 1VCGA 2CLHA 3EWWA 4RZ4A 3E96A 1TRIA 3M9YA 4XKYA 3W7KA 5U7SA 3P82A 3IGUA 4ZQNA 3A5FA 1UB3A 3S5NA 4MFDA 2ZA3A 3PB0A 5LSMA 4JD4A 2XFWA 2FTPA 4NXKA 4WXZA 2ZTKA 3SR7A 4MKNA 4MLRA 4PODA 3QW4B 5FF4A 1V7YA 4JY9A 1DV7A 3I7SA 1L9WA 3NQVA 1WAUA 4UMCA 3W7PA 2F84A 3CQ0A 2NUWA 5HNRA 5HINA 2VFFA 3C3NA 2TRSA 1HUVA 3UZ5A 3NQDA 3P81A 3TNOA 3B0UX 3ATYA 3QF0A 1KM5A 2YW4A 3ZR4A 1VZWA 3JR2A 4I7UA 1RQHA 2EHHA 3W7CA 4N6EA 5GVJA 1MXSA 1TCDA 1ICSA 1SO4A 1QPNA 4UTMA 2C18A 1ZJIA 5BMXA 4UTHA 4OBTA 3CEUA 4O0ZA 4DO6A 2I9EA 4JIQA 4K37A 4M7TA 4ORMA 3M16A 3YPIA 3PR2A 2O7SA 4GJ1A 3GX9A 1OFRA 1YADA 2DZWA 1T8XA 2VEKA 1VH7A 3DGRA 1H61A 3OA3A 4LWWA 1G4SA 2NUXA 4ONVA 1PV8A 4OV4A 3WK3A 2H8XA 2E5BA 4BR1A 2VFIA 3BARA 1DKWA 2NX1A 3WK1A 1LP6A 1HL2A 1KTBA 3P62A 3RLUA 5KZMA 3F4NA 2GJNA 5DBUA 4HPJA 4UTJA 3C56A 4EWND 5BRBA 1EUAA 3QQ1A 2QUTA 5DCEA 2GOUA 5IBXC 3HG5A 5AB3A 2QCGA 4PA8A 3KRUA 4DO4A 5D05A 3UWWA 2QCLA 1PIIA 2QCHA 4Q32A 2GPTA 4UTIA 4MYAA 4O17A 1TPDA 1XM3A 4UMAA 5J5DA 5D2WA 1X1OA 1S5VA 2DZUA 5FEXA 3EX3A 1YTKA 3LXAA 1CX9A 5K9XA 3JRKA 1OFDA 2QJHA 1KM1A 4ML9A 1F6PA 3W2NA 4ALDA 3MHFA 4JNMA 1W5PA 4S2BA 4O50A 2Y62A 1KM4A 2C15A 4O53A 3W7QA 4O1AA 3B0VC 2GJLA 4FNSA 4Z0JA 3UPBA 4JTGA 4U28A 2Z2UA 5K4XA 1TO3A 4ZQPA 4O28A 3TSBA 3T40A 1L6WA 1U5JA 3SI9A 1TPWA 1XBXA 2VELA 4QISA 4GUGA 5G2IA 3W85A 3C6CA 3VI2A 2E5DA 3EXSA 3TMQA 3BG5A 3QFEA 1H62A 4O52A 2GUUA 5CPOA 3TU9A 4QJ1A 3FOKA 4Q33A 2ISWA 4FIQA 1OABA 1IXPA 4Y9AA 2VFDA 3WK0A 3LCGA 2EGZA 5KZDA 1Q3NA 3A9IA 2CLKA 3KHJA 4N4QA 1ZY9A 3NXFA 5CSSA 4FEZA 3BW4A 3T55A 3GAKA 1H60A 5FF2A 1EP3A 2NWRA 3N19B 3DBPA 2LLEA 5MHBA 3GLCA 4BI7A 2A5HA 2DZXA 1RR2A 5LHFA 1B57A 2NXGA 4N2YA 3TA6A 4JTFA 3MP3A 2TMDA 4BWLA 4R53A 5E1QA 3LV6A 3RNDA 1W37A 1K8YA 4HHPA 5AYZA 3G3DA 1VPXA 2CLOA 4IPJA 2QCDB 4GXMA 3W1NA 4IX2A 1S5WA 3LI1A 3FKRA 3M0ZA 5K2ZA 1GVRA 5DCDA 3R13A 1OF8A 3P61A 1WDWA 3LCHA 2DZPA 4JYEA 1U83A 3TQVA 3BPWA 4HPXA 3QYQA 2YCEA 3PC0A 4MYXA 3TE9A 2CLFA 1DL3A 4LRSA 4FHAA 2WOQA 3S0CA 4OQVA 5FEWA 4HNTA 1R46A 3EEGA 3RF9A 2A7NA 3TJXA 4U4MA 1D9EA 4FB7A 1W56A 1F7BA 4IPIA 4BFAA 3DFNA 1ALDA 2PCQA 3OEXA 4FXSA 3MBDA 1JCXA 3TMLA 4JDYA 2BZNA 1KV8A 4LW7A 1TTPA 4O4WA 3TAOA 1SW3A 2H3DA 1I2RA 3P67A 3M5XA 5DY2A 2C16A 4WD0A 3AJXA 1J5TA 1HTIA 2Y7DA 5CZSA 3NZ1A 2WNNA 3TJLA 3C4UA 3N9RA 1VJIA 4YMZA 2QF7A 4MY9A 1SZEA 1ME7A 3IGSA 4O16A 2NV1A 1NF7A 4E0CA 3A22A 2E6DA 1Q6LA 3LHTA 4WXYA 4M19A 3QSTA 1YTEA 1VLIA 2XN0A 4ZL1A 1X7FA 2ZTJA 1H7PA 3HG3A 4JGDA 1TPH1 4AHOA 1SR9A 1ZAHA 1BKSA 1HG3A 2VEIA 1EP2A 3NR0A 3E49A 3L0NA 4JYFA 3NYZA 3F4WA 3TAKA 1KLZA 2BX7A 2R14A 1GG0A 4IGHA 1Y0EA 5DXXA 2Q8ZA 3UWQA 4EIVA 1OJXA 1YDOA 3USBA 1AL7A 3PULA 4LVGA 3SIZA 4O12A 5LGZA 5BMWA 5G2HA 5LNSA 2PURA 2FIQA 3DAQA 4IX0A 4IJBA 4LVAA 3W2KA 1M5WA 3KOFA 1Q6RA 3W07A 1L6YA 3ABOA 3KRSA 4GC4A 1OVDA 3NNTA 1RQEA 3HO8A 5D02A 3CHVA 3NGJA 2GQ8A 1F6KA 2FDSA 4FXRA 6TIMA 3MP4A 5FI8A 3DENA 2NX3A 3UXDA 2CW6A 4JTKA 4UNLA 3W75A 4IMCA 3I68A 3DFPA 4TU1A 2CZFA 1FCBA 4TX9A 3P74A 2ZZ6A 3AO0A 4XKYB 3W23A 4YWIA 4ZQMA 2EKCA 3B05A 3VCRA 5EL1A 2BSLA 3W71A 2CWNA 4B5NA 3S1XA 5HR7A 4BI5A 4NNBA 1PHQA 4H3DA 3TW6A 3ZWSA 1IF2A 2C1HA 4PH6A 3PG9A 1RV8A 5LNUA 2VEMA 3TC6A 2Z6JA 4JDBA 1PHWA 1LORA 2VXNA 1QMLA 3NOEA 2A21A 2ZZ3A 1KFCA 2OMAA 4ADTA 1RPXA 2NLIA 4OGZA 1O94A 2J9XA 3SJ3A 5BNKA 2IQTA 3SGZA 3DU0A 2Q3OA 3Q37A 3G0SA 1SO6A 5D38A 1DJQA 4MZ1A 4FNQA 2QCNA 2HS6A 4K7YA 2ZBTA 2P1FA 1RD5A 1IXNA 1EEPA 3G24A 3CT7A 2V2CA 3M5VA 3SY5A 3VFLA 2YR1A 2Q8LA 4NXSA 3EWXA 4LVBA 2V2DA 5H91A 3HMJG 5F2IA 4FO4A 3RFAA 3B03A 1ADOA 4HNVA 1VC4A 3HPZA 3P80A 2RFGA 5F1VA 2J9YA 3W2JA 1OFPA 1K02A 3NDOA 2EF9A 2DORA 3GKAA 3NPXA 3SGUA 1GQNA 5AHFA 1SU5A 1FBAA 4NZJA 1LOQA 1I2NA 1H51A 2YXGA 4UTWC 5G5IA 3MJYA 4JIPA 1V5XA 2E77A 2QJIA 4EF9A 4FX8A 2QCEA 2J24A 3PB2A 2E6YA 2FQIA 4KFNA 4ZMGA 2B7QA 4A21A 4N9DA 1NF0A 3PUEA 4QQ3A 3BK0A 3W6YA 4Z0SA 4HNNA 3W7JA 3BVJA 5F1UA 3W1TA 4AAJA 3FIGA 4WOZA 2NUYA 2RHGA 2VFGA 2V30A 4HNUA 4NJJA 4HIBA 4MPQA 5HJLA 1SZNA 3O15A 3ELFA 1TIMA 2WQPA 1FCVA 2CZ5A 1WYIA 2HMCA 5CPLA 1GVSA 3QJAA 1GVQA 4UFMA 5DXYA 1I2PA 5D2XA 1SZGA 3TX9A 4AB4A 3IIXA 5AHIA 3HG2A 4ZQOA 3C8FA 1JUKA 3W1QA 1F5ZA 3GXNA 5AHMA 3FLUA 1YXCA 1MEWA 3L66A 5K7JA 2WJZA 3TH6A 5BOOA 5HMSA 3MW7A 3G1FA 3THAA 2UV8G 4GUJA 3RU6A 2C6QA 2Q3RA 3T4CA 4AVFA 4J9JA 4OHQA 3PY2A 4NQ1A 1BWKA 5LKYA 2G95A 4K8HA 4I7WA 1TV5A 2ZA2A 3STCA 2Y6ZA 3NG3A 1VGAA 3NQAA 1YTDA 4TMBA 1IIGA 1LYXA 2PRLA 3S8HA 4CCCA 1OFBA 3W7EA 4CNPA 4JXCA 3TXVA 2TSYA 4UTTC 2VEPA 1K7EA 3IVTA 3EX1A 1SFLA 1UASA 1UCWA 4GBUA 5D09A 3DKLA 2WV8A 4UFIA 4CNOA 3LI0A 3G1AA 1EIXA 3R5EA 2DZTA 4LY8A 5L9FA 2OCZA 4WOQA 1XDLA 4DEFA 5G4WA 1JCJA 4OV9A 4OT7A 3G1YA 3NM1A 3EXRA 2E5CA 4UCGA 3CIXA 4AMAA 3MHGA 1I45A 5D30A 1KM2A 4P2VA 4MFEA 3PS7A 3W1AA 4Y90A 3FJ6A 3OVPA 1A5CA 3S5OA 5LNWA 4M6PA 1PS9A 1I2QA 4O1BA 3W7RA 4FX6M 4AWTA 1GYLA 2C14A 3HPXA 5F4WA 4CQ8A 3LGEA 5IBXA 3TCEA 4A22A 3N73A 3IVSA 3TXZA 2VENA 1K8XA 2NWSA 1TYGA 4LS1A 3NQCA 3A23A 4WX2A 4I9AA 1EA0A 3W9ZA 3KVKA 4IOTA 5KTLA 2R91A 4ADSA 5A5WA 1R2RA 3P84A 1ZAJA 4AF0A 3GNDA 4LUJA 1SSDA 3QPYA 4NJKA 3LCWA 1FDYA 3KVMA 2A6LA 4IMFA 3SFKA 4NU7A 1H7WA 5K4ZA 4PCFA 1DORA 3G8EA 2QDGA 3TSMA 3FS2A 3C2RA 5CGQA 3NVTA 1O5XA 4E38A 1EPXA 4TO8A 4O4VA 1KTCA 3KVJA 3LB0A 1KFEA 3LHUA 2V9DA 3TW7A 1H7XA 3W7OA 5HUPA 4I7VA 4O14A 8TIMA 2VC6A 4KWVA 2RDWA 1DBTA 1H50A 3INPA 4RX0A 3QQ0A 5F2GA 4UTLA 1JRBA 3CTLA 3EWUA 5I3FA 3NQ6A 2A7PA 3BG3A 4A2SA 3GDMA 1TPUA 2OT0A 5SWUA 1Z44A 3O16A 4YLWA 3NQEA 3W2UA 3LDVA 1JCMP 3NM3A 1KFLA 3B8DA 5G4EA 2A7RA 1ZFJA 5I3HA 1GT8A 5H2ZA 1SO5A 3T7VA 5CPNA 1OK4A 4AHQA 3EKLA 3BLIA 2QCCA 1A5BA 3S5ZA 3W84A 3THQA 3DI1A 2B4GA 1R2TA 4QNEA 1GJPA 3C52A 2XN2A 3N34A 3CU2A 3A24A 4LVDA 1TQJA 1DVJA 1ICPA 5D32A 3UD6A 1ZCOA 1XBVA 3ABSA 1GTEA 2QDHA 1JUBA 4GWEA 4DBDA 3LXBA 4JX4A 1W0MA 1VRDA 1K03A 1KFJA 1VS1A 3P7YA 1B9BA 2ZRUA 2QUUA 1KBIA 3PBWA 4K38A 3S5YA 5LZLA 1VHNA 2C0AA 4UIOA 4Z1AA 5KITA 2BWGA 4KKXA 4N4PA 2ZRXA 3WJXA 3LCLA 1XL9A 3U6WA 2PRHA 3UY8A 1VLWA 3MI6A 4H6KA 1KM3A 3UXAA 3M5ZA 3M5YA 1ZALA 2Z1BA 5D33A 1AW5A 1TQXA 4N9EA 1OFQA 3UPWA 1OYCA 3MMTA 2Z0IA 4XWUA 2J27A 2JGQA 4DPQA 2DU2A 3G3MA 3TKFA 3S6DA 3V75A 1ME9A 3CC1A 5IM51 1KM0A 4M6QA 5D2TA 1Z42A 5AHEA 2JK2A 2HTMA 1VYSX 3LHZA 3KFTA 1D3HA 3PF3A 1EP1A 3TV8A 3W7LA 3QPZA 5D2VA 3L68A 3R12A 5D03A 5HR6A 3TQ0A 3NPVA 1UUMA 4UNKA 1R47A 3B4UA 1A50A 3LHVA 5LNRA 1JUEA 5HWMA 2YFNA 1FCUA 1G4TA 1XC4A 3L65A 4CCEA 3M7WA 1N7KA 1AW2A 3L2IA 4AHPA 4M6VA 1FXQA 5EKYA 2E68A 2WSYA 3H55A 3TSDA 1LLWA 1PE1A 5D04C 1NVMA 4RXGA 3M43A 4RKAA 1TPFA 3GR7A 3TFXA 2Y70A 4LC8A 3HB9A 1KTNA 3P60A 2KZHA 3BLEA 3O63A 5LGXA 1SW7A 3GDKA 3NAVA 4E2BA 1C29A 4R7JA 1WOAA 3NL3A 4NJHA 1QPQA 4GE8A 1AMKA 3OVRA 4X2RA 5HWJA 4BI6A 4GUHA 5DLCA 5HWNA 4OWGA 2NV2A 1MO0A 4HKPA 3W1UA 1PCKA 1F76A 5I3GA 2WNQA 4NJIA 2ZRZA 3W74A 1GEQA 1WA3A 1TREA 4DO5A 5K9CA 2ZRYA 3PSVA 5A8GA 2JGYA 1TPB1 2CLMA 3LOTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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