1NAR | Genus

Total Genus 102

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	102
sequence length	289
structure length	289
Chain Sequence	PKPIFREYIGVKPNSTTLHDFPTEIINTETLEFHYILGFAIESYYESGKGTGTFEESWDVELFGPEKVKNLKRRHPEVKVVISIGGRGVNTPFDPAEENVWVSNAKESLKLIIQKYSDDSGNLIDGIDIHYEHIRSDEPFATLMGQLITELKKDDDLNINVVSIAPSENNSSHYQKLYNAKKDYINWVDYQFSNQQKPVSTDDAFVEIFKSLEKDYHPHKVLPGFSTDPLDTKHNKITRDIFIGGCTRLVQTFSLPGVFFWNANDSVIPKRDGDKPFIVELTLQQLLAA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Plant seed protein
source organism	Vicia narbonensis
publication title	Crystal structure of narbonin at 1.8 A resolution. pubmed doi rcsb
molecule keywords	NARBONIN
total genus	102
structure length	289
sequence length	289
ec nomenclature
pdb deposition date	1993-09-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00704	Glyco_hydro_18	Glycosyl hydrolases family 18

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1narA00

3CHEA 1J0KA 3WQ6A 1HN1A 3ARPA 2XM1A 3UETA 1C91A 1S46A 3AMCA 5FKYA 3MSGA 4B15A 4FLRA 3WF0A 3WMCA 3RCNA 2VRKA 4KMQA 4R5EA 5BXPA 1WZKA 3UG5A 1VFUA 2DH2A 5GQBA 1DEDA 2J79A 4R27A 1V0NA 3MO4A 3L4XA 4PYSA 4DUVA 2A3HA 2QPUA 3WH9A 3FW6A 1XCXA 3QR3A 1QI4A 1EHNA 2J62A 2UY2A 2WZIA 2XTKA 1QHZA 3A4WA 1CXLA 3MUIA 2D0GA 2DT1A 2VCAA 3QHNA 1Q6FA 1G01A 4GZIA 1E4NA 2NT0A 1DWFM 3NDYA 1H5VA 2XVPA 2ZXAA 1DWJM 1G94A 3VIKA 4AXNA 1US2A 2G3MA 1J0IA 3EDFA 2EXOA 1OINA 2WHMA 4AEEA 2C7FA 3PZUA 1ECEA 1HX0A 2E9LA 2Y8KA 3WD2A 3WDJA 1HJWA 3CMJA 3VIOA 3OA5A 1J11A 1CLXA 2VRJA 2DSWA 1OWQA 2GJXB 1UD3A 1NWSA 1US3A 5AC4A 1GW1A 1KB3A 3VIIA 1QBAA 3T0AA 2X8RA 5GPRA 3QOMA 2VRQA 3ALFA 4UQDA 1D7FA 1NH6A 1KGWA 3SURA 1W3KA 3ZJ8A 4BQ3A 4UOQA 4PSPA 4HZ8A 1TFVA 2WZHA 4ZXOA 3WDPP 1E1EA 3WL0A 2C8NA 4ZE5A 3E1F1 3CUFA 3VGGA 2WVUA 1BG4A 5A6BD 3T0DA 2W67A 1NOFA 3VIJA 3ARSA 3FN9A 4ATDA 4B3KA 3AHZA 3AMDA 4AD0A 5CSUA 4LYQA 3A3HA 4CCEA 2BXYA 1GOQA 4DWSB 3CMGA 5TD4A 4P7LA 1MXGA 1JD7A 3WF4A 4ZENA 2JFEX 5JBFA 3MV11 2W92A 2V3GA 2WK2A 4MPKA 4Y7EA 1MYRA 1E0WA 4UOZA 3CHDA 4P8WA 4HA4A 1KR0A 3OG2A 1RD6A 1GHSA 1ISZA 2RGMA 2FHCA 1GOOA 1PJ9A 4PTXA 3ECQA 3CZGA 5BRPA 1UWSA 3GNOA 4P8UA 2PWGA 4H2CA 2AAAA 3NSMA 4JFUA 5FOOA 5M3WA 1JYXA 4GZJA 3AICA 4TTUA 3CUGA 1Q6EA 1UH2A 4HZ7A 5GNYA 1CGWA 5IXEA 2WMKA 4HA3A 1W3HA 4M81A 4JFSA 1QW9A 2CEQA 3AHXA 1WZMA 4AISA 2FH8A 2VZSA 1LF1A 2JIEA 3DC0A 1H4PA 1UA7A 1UKTA 1E72M 1ZB5A 3PHAA 2ZUMA 4M56A 1BTCA 1NWRA 1KWKA 2GJRA 2OWCA 4J3XA 1TVPA 2VQUA 4B16A 1BHGA 1R86A 1WDSA 1JYVA 4P7QA 4RE2A 1JZ7A 4TXEA 1UR9A 4DWSD 3WDHA 2J7EA 4X0NA 2YKKA 4B3LA 1E9LA 1GUVA 2WCSA 4W93A 5HPOA 1ODZA 1JYNA 2PWFA 3TP4A 1CGXA 2UWFA 1R87A 5LYRA 2QMKA 1QVBA 1V6YA 5E9AA 1HJXA 1J01A 1E4MM 4V28A 4U3CA 5HXMA 3KL5A 4MAZA 1MQRA 1E5JA 3BAXA 5BXSA 2UY4A 2ZX9A 3ZIZA 2J75A 2J8FA 1E0VA 2F61A 3AZSA 3WD0A 3WF2A 2YIHA 4BQ4A 3NIYA 3GNRA 4M1RA 3MMDA 4J28A 3W28A 3AS1A 2XIBA 2WBGA 1JAKA 1V02A 5D9PA 4CD7A 2WC4A 1QI3A 4F9JA 2EPLX 3RPMA 1QI2A 2WZEA 1R85A 5I3DA 2CCRA 4HOZA 5IHSA 5EB8A 3A4AA 1JZ2A 3WEOA 1KXQA 4FLOA 1E0XA 2E4TA 5BYWA 1C93A 2E9BA 4HU0A 3W37A 3N17A 2DDXA 3LPPA 1HVXA 1V3MA 1WE5A 3AYSA 1GPFA 4IISA 3WNMA 3FHQA 3RIKA 1CBGA 2ZUVA 1BLIA 3CLWA 3UEQA 1NP0A 5A8PA 5E09A 2VURA 4PCSA 2WLZA 1LQ0A 4J3UA 3EYPA 1G5AA 2CERA 4YHGA 4FMVA 1DWHM 5A3HA 1WDQA 2CKRA 1ZJBA 3W53A 3BH4A 4AIUA 2DGAA 4S3KA 1ZBKA 3QGVA 3BAKA 3ZT5A 5I0DA 4WKFA 1BYAA 4JFWA 2WMGA 4JFTA 2VNCA 1QHOA 3WH8A 3U5YA 4UQ9A 2JEPA 2VR5A 3ZOAA 2TAAA 3B9EA 3VMOA 2XFYA 2OSYA 4P8VA 4CVUA 4XZWA 2OSXA 4AY1A 3WMBA 3KL3A 8CGTA 1KXTA 2G3IA 1BPLB 1LWHA 3BLPX 1LL6A 4MNKA 4AEFA 1Y7VA 2J7GA 3VIMA 3QHOA 5CSYA 1WAWA 5CQ1A 1TUXA 3AMKA 3PZ9A 2WSPA 4D6GA 3IJ7A 4CCCA 3M07A 2WSKA 3ARTA 2G8ZA 2DEPA 2Q8XA 3MS8A 2NSXA 3W0KA 2CHOA 1W9BM 1DHKA 1OIFA 1UH3A 4HOXA 1QPKA 3ARZA 1WKYA 2WMIB 1KCLA 1FHDA 2DH3A 3L4UA 1W1VA 3GNPA 1HF6A 1MQQA 4WKAA 1VBRA 4RL3A 3VM7A 1V0MA 3VUPA 1H2JA 3PTMA 2WHKA 5F7UA 3DHUA 5E0CA 1BQCA 4GZEA 1W32A 3PZNA 1K9FA 4ZFMA 4ACYA 4CU8A 5DT7A 2WMHA 4AZ7A 2WCAA 1PIGA 1W1PA 2OYKA 3A6OA 3RM9A 1VB9A 1J0ZA 1VJZA 2J7CA 2BHZA 4JKKA 4KWUA 1SYTA 4CCDA 2EO7A 1OCQA 1VEPA 3GXMA 4LQ1A 2ZOXA 3S2CA 3VDBA 5I6SA 4PMOA 3BC9A 4JL1A 3UCQA 1Q6GA 2ZX7A 4HA1A 3VPLA 2D0HA 4U3AA 2V3EA 2ZX6A 1EOMA 1TA3A 5A6SA 4V27A 4PUDA 1CDGA 1FH8A 3GBDA 2OLHA 3AZRA 3ARUA 3NUKA 1JFXA 1NOWA 2BY2A 4QLLA 1QBBA 5DFAA 1WDRA 1UWTA 3PZVA 5JUVA 2GVYA 3GYCA 4W86A 5KZ6A 2O9PA 1SR0A 3N13A 1W2PA 3WFLA 3VIFA 1GQLA 4CD6A 1XH2A 5ABFB 1W9DM 1B3ZA 3BAYA 4YPJA 5EFDA 1OGSA 1VEMA 1CXEA 3VD5A 1V0LA 4CUCA 4UZUA 1OD0A 1WZLA 4GIAA 3BLKA 2X1IA 1HJQA 2CBVA 1HL8A 4JKMA 1XGZA 4PMQA 4MB5A 3AS3A 1UQZA 1E6XM 1U2YA 2XFRA 3RDKA 3O6AA 3T0BA 3UERA 2ZUWA 3OLDA 1MFVA 1W2VA 3WQWA 2D3NA 4ZXLA 5C8BB 5A6BA 2GJPA 2NT1A 5AC5A 3ARVA 1EGZA 4AIOA 2YDSA 1Q6CA 3BSGA 1UKPA 4AZGA 3ARYA 1B2YA 2NW0A 3N15A 1CLVA 3ZSSA 1WZAA 4D72A 1PEZA 2ZWZA 2WWDA 2IUZA 1UKSA 3WEMA 2QLYA 2DQXA 3BMVA 1JG9A 3WD3A 1CENA 2G41A 5D9NA 2XWDA 2VZVA 5A8QA 2VZOA 2GJXA 2DT3A 6CGTA 1C8YA 3FY1A 1MXDA 3ALGA 3VGHA 1UR1A 3SUWA 3VD3A 2VX6A 4U2YA 3WD1A 4QLKA 1LL4A 4AWEA 3RM4A 3VDAA 5ABGA 2EJ1A 4PMVA 4D1IA 4XB3A 1XCWA 2J8GA 2PWHA 4H04A 3WSUA 2XVGA 1E43A 4C7DA 4UTFA 4HMDA 2BVDA 1QI5A 3WKZA 1JXKA 4JCLA 1GJUA 1CEOA 3K4DA 2WHJA 4JL2A 4MNLA 1FFRA 4OBRA 4JZ5A 1VBUA 3K8MA 4H7VA 1NWTA 1Q4NX 4J3VA 1B3WA 3SEPA 3W6MA 3VM5A 1UHVA 3AIEA 4HU8A 4LGXA 2QMJA 4DWSC 4C7GA 4LPCA 3DYPA 4HMEA 1GJWA 4CD8A 5CXPA 3NCOA 4DWSA 2VX4A 1UQYA 4AW7A 1B90A 2XVNA 5CG0A 3L2LA 3L4TA 3FAWA 1Z32X 4QCFA 3SCUA 3OBAA 1W91A 3W24A 4MADA 2J7HA 1VEOA 3CPUA 1P6WA 4H41A 1GVYA 5HBFA 6A3HA 3CZ8A 4W84A 4J3SA 3K4AA 1MVYA 5E6YA 1FH9A 2DT2A 4UQAA 7A3HA 4OOUA 1UYQA 4PRWA 2OYMA 2A3AA 5A94A 4DUWA 3VDHA 2VO5A 2V38A 3VD4A 3VNYA 2BFGA 3VGFA 1W9VA 4P7OA 4UFLA 4A3HA 3N04A 3OGVA 2W5FA 3L4YA 1K9DA 1ZS2A 3PZMA 3F5JA 1DTUA 2IXUA 1VF8A 3JUGA 1PX4A 4LX4A 3GTNA 4M80A 4BA0A 2VCCA 2BY1A 2WC3A 2JF7A 3B9AA 1FA2A 1QNPA 1EDQA 1ISXA 1KCKA 5CLWA 1ZJAA 4N0RA 4W5ZA 4K68A 4MAVA 4MJ4A 3CH9A 1NP2A 3AIQA 2YL9A 1HJUA 1UWQA 1ESWA 3KWXA 3WUEA 1F4HA 1LWJA 2QPSA 1DWGM 2DPEA 2VQTA 4PTVA 4P8XA 1GZJA 5CZKA 1E6QM 1JI2A 1EQPA 1HKIA 4BF7A 1OSEA 1GCYA 5D9OA 2D22A 1SMDA 3ZR5A 4B9YA 1J10A 1EHAA 5I2UA 1JZ3A 3VOCA 2JALA 3WQ4A 1EA9C 3G6LA 5A6MA 2ZX5A 3A4XA 4OOZA 3TOPA 2VVNA 3PZIA 3RJXA 2GDUA 3SCSA 1V6VA 1CXFA 3EDDA 2QV4A 3ZQ9A 1BVNP 1GVIA 1RH9A 4HPGA 2O9OA 3WNOA 1ISYA 1KQYA 2CESA 1BGGA 2D1ZA 2XIIA 1V02E 4NI3A 3SCPA 1V0KA 4TTGA 1V03A 2V3FA 3EBVA 5I5RA 1BYCA 3TTSA 2XYLA 1I1WA 2B31A 4TVDA 1QNOA 2YL6A 3SUSA 1A47A 3WD4A 1M04A 5D8ZA 4GQQA 3RJYA 1MW0A 1F4AA 3TTYA 5JBEA 2WVVB 4GI6A 1H3GA 3LPOA 3CIVA 2J78A 4JCMA 3WH5A 3CZJA 3HN3A 2GDVA 1X1NA 3BAIA 1FP9A 2QHAA 4IPLA 3ZR6A 3IJ8A 4MTVA 2CHNA 1QNRA 4CKQA 3ZMRA 4AZCB 1K9TA 4TVUA 1B3XA 3WENA 1AQ0A 2WAGA 3MUZ1 3D5HA 1B0IA 2CBIA 3TTQA 4ATWA 1JD9A 3CZLA 4NRRA 4UNIA 5BXTA 3AMLA 4GO8A 1E4IA 4Z2IA 4D6FA 1O7AA 1W9XA 4OUEA 4UFHA 3ZT6A 2XG9A 3WFZA 3UR8A 1OIMA 1KWGA 1ZL1A 1H1NA 1HJVA 4U2ZA 2Z1SA 2VX5A 1JXJA 2WW5A 3BSHA 4WIWA 2MANA 3GH5A 4J27A 3WL1A 3WF3A 1TCMA 4AMCA 2BY0A 4U5KA 3WMSA 1V3HA 2ZXBA 1I1XA 1KBKA 2FHFA 4QLJA 1K9EA 2GFTA 5C70A 4B9ZA 9CGTA 3ARWA 3OB8A 1E70M 2YLLA 1KR1A 2YBUA 3HU7A 4OKDA 3CO4A 3OGSA 1UD6A 3NJ3A 4HMCA 3MMWA 3T2PA 4XV0A 3OIHA 2XFFA 1NQ6A 3F5LA 3VGEA 4F8XA 4EKJA 2PWEA 2WVSA 2YA2A 1V3LA 5E6ZA 2ZIDA 2J7FA 5DMYA 5ECUA 5A8NA 3RM8A 4ZEPA 3WQ5A 1B3VA 2W61A 4UOJA 4MDPA 4HP5A 4PMXA 2EPOA 2ZE0A 3AXHA 3T09A 1UG6A 3ZSTA 1FFQA 1VFMA 3HJEA 5EFFA 1QNQA 3VGBA 1KXVA 2CXGA 5JIWA 3W82A 5CPTA 4W8AA 1BAGA 4MB3A 1W9UA 3VD7A 5FL1A 3U7BA 3L4ZA 4WLCA 4WSKA 4WF7A 2JIWA 5LA1A 4CU6A 1EO5A 4PSRA 1KGUA 1NOUA 3WQVA 3VD9A 1UKOA 3DYOA 1HJSA 4QCEA 7CGTA 4GI9A 1EOKA 4W7VA 3W81A 2WXDM 4OIFA 3WNLA 3T2OA 2FH6A 1JI1A 4W5UA 2VT0A 3LPFA 1M7XA 5AYIA 1XSKA 2EPNA 3ZJKA 3POHA 4GQRA 2ZWYA 4UQCA 5A8OA 2G3JA 5DF0A 1OD8A 4EANA 5A1AA 5CPSA 4D6JA 3B9DA 1WP6A 1OGBA 3CUJA 2IXVA 1CECA 1U33A 1H49A 4PMDA 4FLQA 1EDTA 1JZ8A 1IZJA 1PZ2A 5A6AA 5BWFA 1G0CA 2A3BA 1MWOA 1EIBA 3K1DA 4YN5A 3MKKA 1JF5A 2ZX8A 4XX6A 2E8ZA 2EQDA 5HDRA 5HPCA 2WLYA 3AXIA 3BGAA 3PZQA 3QHMA 2WWCA 1DWIM 5EBAA 3VMNA 1XRVA 1RPKA 3O9NA 4AIEA 4Z2JA 4FK9A 1AMYA 2XWEA 5C71A 2EPMX 3TONA 1JYWA 1PX3A 3ARXA 1U30A 1BF2A 5DO8A 4D71A 1XD0A 1CXIA 3CHFA 3AYRA 2Y2WA 2J7DA 1CGUA 3UR7A 5AYBA 5I77A 5I24A 2GUYA 3UG4A 4W8LA 3W26A 3M6DA 3OZPA 1V3IA 1PPIA 1MW2A 3AIBA 4Q22A 3LPGA 4LXFA 3GZAA 2RGLA 5E0FA 3CZEA 1UR4A 3PTQA 1XSJA 3RILA 1BGAA 3IJ9A 4YHEA 1W9PA 1UWRA 1VFOA 4OZOA 2FGLA 3EMCA 1WCGA 2C0HA 3W29A 5HOSA 1WO2A 2D20A 1UR2A 1UKQA 1B9ZA 2VX7A 4F9DA 3O2LA 3AHVA 2ZUUA 4X9YA 1ZBVA 4AZ6A 1G1YA 4NRSA 2DT0A 2ZUSA 1OB0A 2OSWA 1SMAA 2PBGA 3F5KA 5FD0A 3SCNA 4F66A 2CBJA 1HT6A 3VDCA 2CKSA 3ARRA 1XSIA 4MB1A 1UD4A 4M82A 1GONA 1MFUA 2CPUA 2WMFA 4HZ6A 2BHUA 3AS2A 1ZBWA 4W7UA 3CBWA 4D6IA 3U5UA 3BMWA 1C8QA 4E4PA 4UR9A 5I23A 5IDIA 3AS0A 2J25A 1TG7A 5I79A 3GH7A 3I3EA 1LLOA 5IFTA 2PB1A 4AYSA 4AZBA 2YL5A 1J18A 1LL7A 3GDBA 2GK1B 3K8KA 2PWDA 3PZTA 1JDDA 4N42A 1OM0A 2XGBA 5A2BA 1UWIA 2FGZA 4ACZB 4W89A 4D6CA 1OT2A 4P7RA 4J3WA 5A6LA 2WMJA 2CYGA 4AD3A 5EMYA 5BROA 1CIUA 1HIZA 3PTKA 2W66A 3AIRA 4AZHA 1JNDA 4UFIA 2BHYA 1QHPA 2WBKA 1BYDA 1RP9A 3VVGA 8A3HA 2CITA 1LG2A 4NSBA 2F8QA 3SUUA 2X0HA 1TZ7A 3VIPA 4W87A 4HPHA 3KEHA 1QW8A 2BVYA 4PMRA 1W3JA 3FAXA 1FP8A 3RO8A 4UQEA 1UA3A 1EDGA 2YL8A 2XVLA 5HNNA 4TVCA 1TE1A 2A3CA 1I75A 1BG9A 4AD2A 1R7AA 2D3LA 4OJYA 3ZO9A 2ZUNA 4CD5A 3I3BA 3WNPA 1M53A 3WNKA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1GOI A;  4X0V A;  2YBT A;  2JE8 A;  1UZ4 A;  1B1Y A;  2PI6 A;  1MQP A;  4M24 A;  4NZC A;  1E71 M;  5A95 A;  2OWX A;  2CBU A;  1CGV A;  4UFK A;  2VI0 A;  1HKJ A;  1WB0 A;  5M17 A;  3ARQ A;  4V2X A;  2ESC A;  4BCE A;  1W3L A;  3N9K A;  4HOW A;  5CGT A;  4W7W A;  4H8U A;  3AFB A;  2YDQ A;  3CHC A;  5A6J A;  3AXX A;  3WEZ A;  4D6H A;  3SUT A;  1IV8 A;  3WUF A;  4DM2 A;  2HIS A;  3WBE A;  2GSJ A;  1VRX A;  4XUY A;  4D1J A;  2AOS A;  1M01 A;  4UFM A;  2BVT A;  1GOM A;  3MMU A;  3SIM A;  3VIH A;  3W38 A;  2WHL A;  3UES A;  1JIB A;  1E6N A;  1E3X A;  4PTW A;  1CTN A;  4PEE A;  1JZ4 A;  1X6N A;  4UCF A;  4PBG A;  1TA3 B;  1MW3 A;  3WDI A;  1UOK A;  4UFJ A;  4U33 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3R2G A;  1PTD A;  5LGZ A;  4XD3 A;  3M43 A;  1A5L C;  3W74 A;  2VXN A;  3MSG A;  3R25 A;  4LF1 A;  3I4K A;  3WK2 A;  2FZB A;  1EBG A;  1M9H A;  4KMQ A;  4C5Y A;  3UG5 A;  3TYD A;  1RHC A;  1H7R A;  1VFU A;  2F2K A;  4ECL A;  2J79 A;  3EPM A;  3V5C A;  3JR2 A;  1X1Z A;  1BQG A;  3JZU A;  4GY1 A;  3QR3 A;  1QI4 A;  2NLI A;  1SW0 A;  3PAJ A;  2YW3 A;  2VD9 A;  3QZA A;  4QIT A;  3ZLG A;  4DJD A;  1SJB A;  3VOJ A;  3G1D A;  1OK6 A;  5FF7 A;  4WEV X;  2D0G A;  1A5K C;  2Z29 A;  4A05 A;  1F76 A;  4G5D A;  1E4N A;  1MEH A;  2NT0 A;  4NYU A;  1JCM P;  3ZWT A;  5CEW A;  1U83 A;  1G94 A;  3PBM A;  4YTU A;  3W7G A;  4LAU A;  2AAM A;  2OQL A;  4Z0S A;  1IEV A;  4ERG A;  4CCZ A;  3SRD A;  3RG6 A;  3RHG A;  3H8A A;  1HX0 A;  1RSC A;  2E9L A;  1VPY A;  4QSF A;  1J11 A;  2CLH A;  1Q6L A;  3ABO A;  3GTH A;  5FA5 A;  1UD3 A;  1US3 A;  4LV9 A;  3ZVH A;  1GW1 A;  1KB3 A;  3VII A;  2HPM A;  5DRI A;  5DRC A;  5GPR A;  3QOM A;  3W2U A;  1O12 A;  4YCO A;  3ALF A;  3Q94 A;  4UQD A;  3NL6 A;  1NH6 A;  4L56 A;  3O6D A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1NARA

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Chord Diagram

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