3PZGA

I222 crystal form of the hyperthermostable endo-1,4-beta-d-mannanase from thermotoga petrophila rku-1
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
357
structure length
357
Chain Sequence
FRFIGSNNYYMHYKSNRMIDSVLESARDMGIKVLRIWGFLDGESYCRDKNTYMHPEPGVFGVPEGISNAQNGFERLDYTIAKAKELGIKLIIVLVNNWDDFGGMNQYVRWFGGTHHDDFYRDERIKEEYKKYVSFLINHVNVYTGVPYREEPTIMAWELANELRCETDKSGNTLVEWVKEMSSYIKSLDPNHLVAVGDEGFFSNYEGFKPYGGEAEWAYNGWSGVDWKKLLSIETVDFGTFHLYPSHWGVSPENYAQWGAKWIEDHIKIAKEIGKPVVLEEYGIPKSAPVNRTAIYRLWNDLVYDLGGDGAMFWMLAGIGEGSDRDERGYYPDYDGFRIVNDDSPEAELIREYAKLF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga petrophila
publication title Structural characterization of a novel hyperthermostable endo-1,4-beta-D-mannanase from Thermotoga petrophila RKU-1
rcsb
molecule keywords Mannan endo-1,4-beta-mannosidase. Glycosyl Hydrolase family
total genus 155
structure length 357
sequence length 357
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2010-12-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3pzgA00
3WNNA 1XV8A 1JD7A 5AYIA 2J25A 2E9BA 4UQEA 3EDJA 2OLHA 1J12A 2J74A 2ZX7A 4U3CA 1TMQA 2Y8KA 3VGHA 1BVNP 3DYOA 1W3LA 3EDFA 6TAAA 2W66A 2PC8A 5CSUA 4PMNA 4W88A 1TA3B 2BHUA 4UFHA 1B30A 3UCQA 4ZFMA 2VJXA 3A4AA 3ARSA 1EXPA 1QW8A 1YQ2A 2W67A 3GYCA 2VCAA 2JALA 3NSXA 2VMFA 2FGZA 3O2LA 1B3ZA 2JIWA 3OZOA 2E8ZA 3AIRA 3THDA 3VIMA 3WNOA 2BNJA 2BFGA 4EANA 3AZRA 3WQ8A 2XM2A 4AC1X 3LMYA 1MQQA 3NCOA 2DSVA 3L4XA 1E43A 3MUIA 2Z1SA 1F4AA 1E6XM 3A4XA 2X0HA 5EBAA 1E1EA 4E2OA 1CGTA 1UH2A 3U5UA 1UD3A 3RM4A 5F7UA 5A6BA 1XSIA 2WSKA 1VFOA 3NSMA 3RILA 4JZ5A 2GJXB 1SR0A 3WDJA 1ISZA 2VZSA 1WZMA 4HZ7A 2GJXA 2BY1A 1OT1A 4PMRA 2O9RA 1QBBA 1VFFA 2WCGA 4J3XA 1VEPA 1KXHA 3L2MA 3CH9A 1G9HA 1TFVA 3GNPA 2BHYA 3WN6A 1WPCA 1J0IA 2UY5A 2D0FA 2CBJA 4L4OA 1E9LA 3AICA 5DO8A 5HPOA 5A8QA 2OSXA 3MSGA 2VVSA 3AXHA 3PZVA 5DT7A 2WZHA 3AMDA 1E6RA 1JF5A 4J3UA 4CCEA 1CWYA 2VZOA 5FCZA 2JEQA 2PBOA 2VC9A 1V3IA 3N04A 1BYAA 4HU0A 3PTKA 2PWDA 5LA1A 5IXEA 3GXMA 1GZJA 4MAZA 3CGTA 4CD7A 4BQ5A 2V3FA 2WMJA 4Z2HA 4CCCA 1KGUA 1QW9A 3VIGA 4PUDA 2GFTA 3VMPA 3UG4A 3AIBA 1TVNA 3PTQA 5GNZA 2VTFA 1KBBA 3MV01 2V5CA 1V08A 2BXZA 4V2XA 2FGLA 5A8OA 1GNXA 1W2PA 3HJEA 3W24A 2A3BA 2J4GA 1E70M 4J28A 4W89A 3GBEA 4D1IA 8CGTA 4PMQA 2D23A 1ZBCA 4XB3A 3AS3A 2BVDA 4UCFA 2CKRA 2EQDA 1Z32X 4AD2A 4RE2A 1TR1A 2X8RA 1GONA 1HIZA 5CG0A 3GH5A 4GI6A 4MB5A 4P8XA 2ZXDA 4QCEA 4JCLA 4OOZA 3RPMA 1AQHA 2D3NA 3PZQA 1CLVA 3CLWA 1CXFA 1W9XA 4LQ1A 4TVUA 1ISVA 1XCXA 1H41A 4AIEA 2DDXA 5ABHA 2VR5A 2XIIA 2VO5A 2QPUA 4U5IA 1EHNA 3WNMA 4JFTA 2A3HA 4HMCA 4MB4A 2WHMA 4NF7A 2YLAA 2WKLA 1IT0A 1NP0A 4GZEA 2ZUMA 2VRJA 1RPKA 4CD8A 4C7DA 3VGBA 4OBSA 2GJRA 2WVVB 1FH9A 3AMKA 4JFVA 3VNYA 3VDBA 2HVMA 3S6TA 2WVVA 3K8KA 2XPKA 1QI5A 3WL0A 3WUBA 1W1TA 3AI0A 1I75A 4D6IA 1CPUA 1RP9A 3VD7A 2DT1A 3II1A 1VB9A 4UNIA 2D20A 2J7DA 2GVYA 5EFFA 4UFMA 1V3MA 2J7HA 3VIKA 1NOFA 2CITA 3B9AA 1MQPA 1BAGA 4L4PA 3SCTA 1PPIA 2WLYA 5I6SA 3A4WA 3U7VA 2YLLA 2DIEA 5A2AA 3W0KA 4KGLA 4JCMA 3EDKA 2CEQA 3TONA 4W7VA 1ESWA 4U2YA 1O6IA 1XD1A 1JDDA 1KXVA 3VO0A 1XD0A 4M1RA 2DH3A 1HP5A 1FA2A 2YDRA 2ZICA 1J0HA 1E5NA 1UOKA 3BAYA 4U33A 1UG6A 1XH2A 2A3EA 3VTRA 4LXFA 3T08A 2XVNA 4U31A 4GI9A 3AYSA 3AISA 4D1JA 3KL5A 3BAWA 2NT0A 5M03A 4B15A 6CGTA 4UQAA 3UESA 4CVUA 1KQZA 1PBGA 3IJ8A 3EDEA 2GK1B 5I5RA 4EAMA 2J79A 4W5UA 1CZ1A 5E0CA 1JNEA 1KCKA 3DYMA 2GK1A 3WF0A 1J18A 1NH6A 1DHKA 2VT0A 2DPEA 4MDOA 4PTWA 3BLKA 4XV0A 5IHRA 1UWIA 4MJ2A 4ZXLA 4NRSA 1BQCA 1R8LA 4BQ2A 2VL4A 4IISA 3WF1A 3FN9A 3AXIA 1DEDA 2E9LA 1GHSA 3AHVA 4TVDA 4P7RA 1K9DA 3WH6A 3WELA 1HJWA 1C8QA 1KQYA 1W3KA 4PRWA 4Z2JA 1B2YA 2YJQA 1KXTA 2JE8A 1ZBVA 3ARRA 3CZLA 5AC4A 4PMZA 4W7WA 1CTNA 2XGIA 4MTVA 4GZIA 4FMVA 2FDMA 1B0IA 1W2VA 2YA1A 3IJ7A 1JFHA 3WF4A 3ZJ6A 3PBGA 4JL2A 4MDPA 1FFRA 1BSIA 1VJSA 2CIPA 1M04A 4EKJA 4GZJA 4AD1A 2GSJA 4WSJA 1XHGA 1QNRA 3IAQA 4KH2A 2OWXA 1W9DM 3UETA 2DGAA 4GQQA 5ECUA 1HN1A 4JHOA 3N17A 3EYPA 3VU2A 2BHZA 1ODZA 4XUYA 1EGZA 2QF8A 5IFTA 3ZT7A 3F5JA 3SCUA 2VCBA 2XHYA 1BG4A 4H8HA 4PMOA 4UOQA 1JZ3A 3CHCA 3MANA 1XYZA 5A8NA 2ZXQA 5GPRA 4U3AA 1GJUA 3CZGA 4MAVA 4MB3A 2X09A 4UOZA 3ZO9A 1VENA 2VR4A 2XSBA 3OGSA 1HJVA 4MB1A 1QNPA 1H2JA 2QHAA 1FP9A 2CKSA 2OWCA 1D7FA 3PZGA 3N12A 1SYTA 1H5VA 1PAMA 4FLRA 3LPOA 3FNDA 3TTQA 5LA0A 1QNSA 2J78A 2O9TA 4UQDA 2D24A 1HVXA 2X0YA 2D3LA 3THCA 1R7AA 1NWUA 4CD6A 1VIWA 4JAWA 3AMGA 3WIJA 4AD3A 4MPKA 4LGXA 5I78A 3FAXA 4ZE5A 5ABFB 2ESCA 1WB0A 3WH9A 4W8BA 3OG2A 3WKZA 3GNRA 5I24A 3AJ7A 4DWSC 5ABFA 3AIWA 4J3WA 1JYVA 3SEPA 1B9ZA 2DQXA 4QCFA 3QHNA 2D1ZA 3OLEA 3WQ6A 4LX4A 4MNJA 4AZ7A 2EPKX 2OSWA 3BXWA 3ARUA 3B9EA 5M5DA 4QFUA 1BHGA 1OIFA 2WANA 2XIBA 3N13A 5A6LA 5A6BD 5HOSA 5JIWA 4YHGA 3CHEA 3B8SA 3MMDA 2GDVA 1JI2A 4CU8A 2UWFA 1AQMA 4A4AA 4UQ9A 4M29A 3G6LA 4WKFA 1E73M 4CKQA 1C92A 2WNWA 4UZUA 2J7FA 1TVPA 1V6XA 4JFSA 3BCDA 1MQRA 1WKYA 1UD2A 1DTUA 2QMJA 1UR8A 4GINA 5BCAA 4HZ8A 3CMJA 1QI2A 3QHMA 1J0YA 3ARTA 2NSXA 3W37A 5CJ5A 2G3IA 4F9DA 4V27A 3UEQA 5FL1A 3AOFA 2XTKA 5BXTA 1E4NA 3N9KA 1JZ6A 2WZEA 4HMDA 1KR0A 2D22A 1GOMA 3ZT6A 1PEZA 1FP8A 3ZR6A 4AEEA 3CTTA 3SUSA 1OWQA 4BF7A 3NYDA 1US2A 1JAKA 1GHRA 3WNKA 4BS0A 3UG5A 1JG9A 1P6WA 1LG2A 2VCCA 4RE3A 1CGWA 3WDRA 1K6AA 1HJXA 1QNQA 3UERA 1K9TA 3WMCA 4PTMA 1NWSA 2G3NA 1I1XA 1W9BM 2FH8A 1OIMA 5A2BA 4WKHA 1E40A 1UKSA 1QNOA 2PWGA 2V3DA 4D6HA 4D6EA 2WPGA 3ARVA 1UQYA 5ABEA 1VAHA 1B3WA 2CBVA 1E6SM 4AXNA 4URIA 3FHAA 2YBTA 3OBAA 3ZT5A 2ZUWA 1EQPA 5AY7A 1PX4A 1E6PA 2CYGA 2J8FA 1TCMA 1US3A 3AQUA 2VURA 5M3WA 5A1AA 1PX8A 2VOTA 5JIPA 2PWFA 1WZLA 2XUCA 2ZX6A 1UUQA 5I23A 1LL4A 3M6DA 1JYNA 2J77A 1Q6GA 1LL7A 2FH6A 3AXXA 1NOWA 3T0DA 2WBGA 3AFBA 3ZQ9A 3HN3A 4E4PA 2Y2WA 1W3JA 2B31A 1CGUA 5A8MA 4D6CA 1JD9A 1MVYA 1E56A 4JKLA 3PZOA 2JFEX 2VZTA 5EFDA 2ZUUA 4OZOA 5C70A 1NARA 1CXHA 4PN2A 3UG3A 1ZJAA 1FOBA 3L4UA 8A3HA 5FD0A 2G3JA 1BFNA 3AHZA 4CD5A 3BAJA 5FOOA 3ARWA 3VIPA 4B3KA 2GDUA 3WD1A 3QR3A 3S2CA 1HX0A 2CPUA 1C90A 1PX3A 3AIQA 1MW1A 1WDQA 1Q6EA 5E70A 4PBGA 1UKTA 2WVTA 2CBIA 1V02A 3J7HA 2YA2A 5A6JA 3W6LA 1UH4A 4AISA 1CXKA 3LPGA 1X6NA 1V3HA 5A6AA 4KRUA 1GCYA 3ZJ8A 4W5ZA 2XM1A 2WCAA 4TX6A 5D9OA 3ECQA 5BRPA 3HU7A 5BXRA 1DWFM 1XYFA 3VIHA 1HXJA 1NM9A 2UY2A 3ARQA 1M01A 5CSYA 3WD4A 2F8QA 1R87A 5CLTA 3CHFA 2W63A 3WEMA 2F2HA 1QI3A 3ALGA 3QOKA 2FHBA 2JEPA 1QHZA 2OWWA 3WQ5A 4D6GA 4F9JA 3EMCA 5AYBA 2WB5A 4LYPA 1UYQA 5A8PA 1AMYA 3CZKA 5FL0A 1DWIM 3OLGA 4QDMA 1W9PA 4W85A 3WFZA 3WD3A 4HOXA 2A3AA 4AWEA 2CESA 5FIPA 5D9MA 1HJUA 1BGGA 4MNMA 2BV9A 3MSDA 4H04A 1CEOA 1N82A 4JKMA 1VJZA 1I1WA 2WHJA 2D0HA 4XZWA 1UH3A 3AROA 3WF2A 1LG1A 3RMEA 2YL8A 4CVWA 1HKMA 2NW0A 3W28A 1JF6A 1WO2A 3T2PA 1E5JA 1EA9C 4N0RA 1J0JA 2AMGA 2ZXAA 7A3HA 3ARZA 1UZ1A 1C93A 4PCSA 2EPNA 3NDZA 1ZBWA 3DECA 1B31A 1E0VA 1QVBA 3BAIA 4M8UA 5A2CA 1E0WA 4D6DA 2F61A 1CDGA 3PZTA 1KR1A 1CXEA 1M7XA 3SUUA 3IANA 3M07A 2E40A 4AW7A 4NRRA 3K1DA 2CXGA 2ZE0A 4PMXA 2CHOA 1NWRA 2AOSA 3AHYA 2RGMA 3BH4A 4D72A 2ZWZA 4KRTA 2EJ1A 1B3XA 1IZKA 1OB0A 4MNLA 3FW6A 1UWQA 3TTOA 3VM5A 3WY1A 4C7FA 3BSHA 3SIMA 3GXDA 2GJPA 2WZIA 1EH9A 4OBRA 5CPSA 4NI3A 3BCFA 3TA9A 4F8XA 3WENA 1DWHM 2EPLX 3MS8A 1B1YA 1E4IA 2ZWYA 4X0NA 2YL6A 1BGAA 1KXQA 1E71M 1V6WA 4NSBA 3A6OA 2WXDM 1H11A 2WLZA 5JUVA 1MFVA 4PTXA 3ZJKA 2IXUA 4DM1A 1WP6A 3VNZA 1CXIA 3QHOA 5DMYA 2EO7A 3N15A 1JXJA 2D2OA 1Q6DA 4OJYA 3ARPA 3PZMA 1V0KA 3WNLA 1UZ4A 1MXGA 5A95A 2CETA 4PYSA 2WHKA 4C7GA 2EXOA 1BLIA 4MNKA 3MU7A 1QI0A 2PWHA 3CUFA 1PZ2A 1LWHA 1JXKA 2WC4A 3GM8A 1WDSA 4AZ5A 1E72M 1E4LA 1OGBA 1DWJM 3WDHA 1XRVA 1C7SA 1CYGA 4A3HA 3I3DA 1V0NA 2J62A 3AYRA 5E6YA 2E8YA 5GQBA 1E6ZA 2A3CA 3N18A 3TP4A 1UKOA 4QP0A 4FF5A 4HA4A 3VD5A 3CMGA 4HA3A 4PCTA 1XSKA 1V3KA 3W82A 4KMQA 4P7OA 4IUGA 2YL5A 4OOUA 3JUGA 3OB8A 3EMQA 2C8NA 2TAAA 1GPFA 2XFFA 3VDAA 4A3YA 3K46A 2CCRA 2ZX8A 1UA3A 1W9VA 4QLLA 1ISWA 3E1F1 3U7BA 4Q22A 2ZX9A 4M82A 4WJXA 5BXPA 3VILA 4TXEA 1FHDA 1QHPA 1OSEA 2WSPA 1GOOA 1K9EA 1R86A 3WF3A 3RIKA 5IHSA 4PMDA 4PTVA 3AIUA 3T09A 3T0AA 4W7UA 3HMCA 1H0GA 1D2KA 3QGVA 1DP0A 4HZ6A 1V6VA 4ML4A 4E8DA 2VQUA 3U5YA 2Z1KA 2G41A 4XZBA 5BRQA 5E9AA 2WVUA 2WM0A 3GDBA 5JBDA 2XSAA 1NQ6A 2XWDA 3WD2A 5CZKA 2VX7A 4D71A 1CECA 3VKKA 3UR7A 3ARXA 4TVCA 1HP4A 1BPLB 1H4PA 1KWGA 4ZEPA 2ZUVA 1U33A 2YL9A 1ISXA 1ZL1A 3CZ8A 3KL0A 5I0DA 1HJSA 3SCOA 5CQ1A 1WCGA 3WMSA 2XFRA 1J9YA 1G5AA 2OYMA 3L4TA 1TZ7A 4AD4A 3W25A 5I77A 4P7LA 3VMNA 4DM2A 5CPTA 3TTYA 2AAAA 3W53A 5CGTA 2VX6A 3AS0A 1ZS2A 1OT2A 3AHTA 4EE9A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3WNN A;  1XV8 A;  1JD7 A;  5AYI A;  2J25 A;  2E9B A;  4UQE A;  3EDJ A;  2OLH A;  1J12 A;  2J74 A;  2ZX7 A;  4U3C A;  1TMQ A;  2Y8K A;  3VGH A;  1BVN P;  3DYO A;  1W3L A;  3EDF A;  6TAA A;  2W66 A;  2PC8 A;  5CSU A;  4PMN A;  4W88 A;  1TA3 B;  2BHU A;  4UFH A;  1B30 A;  3UCQ A;  4ZFM A;  2VJX A;  3A4A A;  3ARS A;  1EXP A;  1QW8 A;  1YQ2 A;  2W67 A;  3GYC A;  2VCA A;  2JAL A;  3NSX A;  2VMF A;  2FGZ A;  3O2L A;  1B3Z A;  2JIW A;  3OZO A;  2E8Z A;  3AIR A;  3THD A;  3VIM A;  3WNO A;  2BNJ A;  2BFG A;  4EAN A;  3AZR A;  3WQ8 A;  2XM2 A;  4AC1 X;  3LMY A;  1MQQ A;  3NCO A;  2DSV A;  3L4X A;  1E43 A;  3MUI A;  2Z1S A;  1F4A A;  1E6X M;  3A4X A;  2X0H A;  5EBA A;  1E1E A;  4E2O A;  1CGT A;  1UH2 A;  3U5U A;  1UD3 A;  3RM4 A;  5F7U A;  5A6B A;  1XSI A;  2WSK A;  1VFO A;  3NSM A;  3RIL A;  4JZ5 A;  2GJX B;  1SR0 A;  3WDJ A;  1ISZ A;  2VZS A;  1WZM A;  4HZ7 A;  2GJX A;  2BY1 A;  1OT1 A;  4PMR A;  2O9R A;  1QBB A;  1VFF A;  2WCG A;  4J3X A;  1VEP A;  1KXH A;  3L2M A;  3CH9 A;  1G9H A;  1TFV A;  3GNP A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3WNN A;  1XV8 A;  1JD7 A;  5AYI A;  2J25 A;  2E9B A;  4UQE A;  3EDJ A;  2OLH A;  1J12 A;  2J74 A;  2ZX7 A;  4U3C A;  1TMQ A;  2Y8K A;  3VGH A;  1BVN P;  3DYO A;  1W3L A;  3EDF A;  6TAA A;  2W66 A;  2PC8 A;  5CSU A;  4PMN A;  4W88 A;  1TA3 B;  2BHU A;  4UFH A;  1B30 A;  3UCQ A;  4ZFM A;  2VJX A;  3A4A A;  3ARS A;  1EXP A;  1QW8 A;  1YQ2 A;  2W67 A;  3GYC A;  2VCA A;  2JAL A;  3NSX A;  2VMF A;  2FGZ A;  3O2L A;  1B3Z A;  2JIW A;  3OZO A;  2E8Z A;  3AIR A;  3THD A;  3VIM A;  3WNO A;  2BNJ A;  2BFG A;  4EAN A;  3AZR A;  3WQ8 A;  2XM2 A;  4AC1 X;  3LMY A;  1MQQ A;  3NCO A;  2DSV A;  3L4X A;  1E43 A;  3MUI A;  2Z1S A;  1F4A A;  1E6X M;  3A4X A;  2X0H A;  5EBA A;  1E1E A;  4E2O A;  1CGT A;  1UH2 A;  3U5U A;  1UD3 A;  3RM4 A;  5F7U A;  5A6B A;  1XSI A;  2WSK A;  1VFO A;  3NSM A;  3RIL A;  4JZ5 A;  2GJX B;  1SR0 A;  3WDJ A;  1ISZ A;  2VZS A;  1WZM A;  4HZ7 A;  2GJX A;  2BY1 A;  1OT1 A;  4PMR A;  2O9R A;  1QBB A;  1VFF A;  2WCG A;  4J3X A;  1VEP A;  1KXH A;  3L2M A;  3CH9 A;  1G9H A;  1TFV A;  3GNP A; 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