4N9CA

Fragment-based design of 3-aminopyridine-derived amides as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (nampt)
Total Genus 171
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
479
structure length
469
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Fragment-based design of 3-aminopyridine-derived amides as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT).
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus 171
structure length 469
sequence length 479
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2013-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4n9cA02
3P80A 4NZJA 4HSNA 4NXSA 4UR8A 2ZTKA 3NL3A 1OK6A 2EGZA 3SIZA 1QO5A 1RD5A 3TC7A 2NWRA 1G7VA 3PBWA 1IIGA 4LNYA 1QOPA 2AAMA 3UYCA 1I2OA 1H5YA 3STEA 1KBJA 1KTBA 1BEUA 3KX6A 3A23A 3M6YA 3TFXA 2C15A 2A5HA 1SW3A 1FXPA 2QDHA 4EOUA 4IOTA 1OX4B 1GQNA 3NPWA 4UFMA 1K7EA 4JY8A 1W0MA 2WQPA 1G7UA 5MHBA 1FWTA 4UTUA 3CEUA 3LRLA 4UMBA 4N9CA 5FEXA 1EEPA 3LI0A 4RJEA 1OYBA 4YLWA 4DEFA 5CSRA 2RFGA 3MMTA 2B7NA 3QMSA 2HS6A 3C3NA 1OFQA 4NNAA 1G67A 3NZRA 4M7SA 2G95A 3IRDA 4AVFA 2OZ0A 2X16A 5U4NA 3R89A 3UPWA 5L6UA 1TJRA 3TIMA 1T0OA 4IX2A 3QW4B 4JY9A 1JQXA 2OT0A 3P82A 8TIMA 3KAOA 4Z1DA 3NR0A 3O8AA 2FIQA 2GVJA 4JX6A 1UUMA 2B0MA 1H62A 1KM5A 3LTPA 5D02A 4O14A 2VEMA 4XKYB 1BTMA 2D73A 3G1DA 4D2JA 3NAVA 2F7FA 1EUAA 3W2LA 3O6CA 4NJKA 3TA6A 1HFBA 1XCFA 1SZFA 1Z42A 1G4PA 1XBVA 3DFSA 3H55A 5HJLA 2O7QA 1J2WA 1YLVA 2E5CA 2A6NA 3CC1A 3NQ8A 5BRBA 3TKFA 4UTTA 3B03A 1RQEA 2ZDRA 4JTHA 3TMLA 1H60A 2QCDB 3MI2A 5EKYA 3NO5A 3LV6A 1VJIA 3WJYA 2B7QA 1GTEA 3NNTA 4MPQA 1TQJA 2CLLA 4Z1CA 1VHNA 2Y70A 4X2RA 3QQ0A 1DJQA 4JTGA 3P67A 3O07A 1WBJA 2ZRYA 1O4UA 3W1UA 3WK0A 2WNQA 3QPYA 3B4UA 1TPB1 4B5NA 4XTDA 5DXXA 5KZEA 1PL9A 4YCOA 5LNRA 4L4LA 4P2VA 1LCOA 5G2HA 2ZQ0A 1A5AA 5G1TA 1NAL1 3W9ZA 3S9YA 1FCUA 3LXCA 4BWLA 3PR2A 2AGKA 3VE9A 1LBLA 2V5LA 3FYPA 1VPXA 4FIQA 1KM2A 3STGA 4LY8A 3WK3A 4DO6A 2R91A 1JCNA 3SFKA 3A21A 3DKLA 5FESA 1DV7A 3VE7A 1RQHA 1L6YA 4ZQCA 3KVJA 4TX9A 3W7RA 4XZ9A 5C54A 1IXPA 3EXSA 4TU1A 4FHAA 3BVJA 4FB7A 2CZ5A 3W2UA 1ZALA 3WK2A 3NEVA 1SO4A 4WJEA 4YMZA 3VKJA 4KFPA 2LLEA 4FNSA 4K6AA 4HNTA 1GVSA 3KRSA 7TIMA 1P0NA 4FX6M 1MEWA 1R47A 4MIMA 1JVNA 3Q2DA 6TIMA 2VKZG 3P81A 5BOOA 3LHZA 1PVNA 1GG0A 3M47A 4NX5A 1W3IA 5LNVA 2Y88A 3N9RA 2C18A 3HPXA 4NUWA 2YYTA 3RMJA 5IBXA 1P5BA 3PF3A 4Y6GA 3MO7A 2QCGA 3N2XA 3W7KA 4N2YA 3NYZA 3G0SA 3HBLA 2J9YA 3NL5A 4K38A 3S6DA 4FNQA 5DY2A 5AYXA 3NGJA 3W22A 1JULA 5IM51 4QSHA 5G5IA 5HINA 3KHJA 1G4EA 1N8FA 1QDSA 3OBKA 2JBMA 1T96A 1VCVA 1JR1A 1B9BA 3MBFA 3G8EA 3OVRA 2DZTA 4BI7A 4LRSA 3LTYA 4L4MA 2Y6ZA 1PHQA 4XBKA 3BG3A 4LUJA 1VYPX 2P1FA 1CI1A 1MEHA 4O28A 1LM1A 3M0ZA 1ZY9A 4IMDA 2WNZA 4CCDA 1GWJA 3TX9A 3S1UA 3LM7A 2ZZ2A 4IMEA 1TSIA 5LHFA 3LLFA 4O54A 1GG1A 4ZQPA 4AHPA 1RPXA 3LHWA 5K2ZA 1J5TA 2QJHA 3TR2A 2OJPA 1BWLA 1TPFA 3DXIA 3G1XA 3SSJA 1JCLA 2V5BA 1A53A 3M43A 3NZ1A 5KZMA 4MZ1A 3W7HA 3UWWA 2H8XA 3ZR4A 4HSOA 4PCFA 1TPEA 5BMXA 2GQ9A 5LNSA 5LNUA 5G4EA 3ANYA 2GQAA 3W74A 1TQXA 1KFJA 3RFAA 4JTFA 5F2LA 2V0TA 3TXVA 3CM4A 1SZEA 3N19B 3WFAA 4TMBA 4O4WA 4O10A 4IXXA 4WY0A 3NG3A 3ZS4A 5D2XA 2ZCGA 3U6WA 3CB8A 1LYXA 1B57A 5SWUA 2BXVA 3NPVA 1WOBA 4IWWA 1VS1A 3EEGA 1H7XA 4IQLA 4RK8A 3D0CA 2GUUA 4FO4A 4FX7A 2Q3RA 3E12A 4FX8A 4O52A 3TV8A 1DQXA 1OFEA 2VEKA 1H7NA 5KZDA 3PSWA 2RHGA 1AG1O 1KFEA 4JX5A 4C1LA 2HSAA 4N9EA 3I7QA 3TAKA 3CTLA 3PC0A 3P8IA 4GUJA 1W56A 4A29A 3U2OA 3UWZA 2YFNA 2EHHA 3STCA 2TYSA 1MO0A 3OVQA 2EKCA 2QCHA 3VFLA 3W83A 3LCFA 5HMSA 2QCCA 3IIXA 1A5BA 3FS2A 5C2XA 3I7RA 3WJWA 2G97A 1OVDA 1LBFA 3QC3A 3NQ7A 3ZFHA 3G1VA 1L6SA 3N2MA 1TO3A 1OFAA 2ABAA 5BNKA 2YX0A 4ZQNA 3LHUA 1K02A 3EKZA 2NUXA 3QQ1A 4PC8A 3EB2A 4HN4A 4WY0F 2NX9A 4JR5A 1QMLA 3W76A 5I3FA 1W5QA 2V82A 3GLCA 4DBEA 3P84A 2C3ZA 1I2RA 4UMCA 3C56A 2A2IA 3B0PA 3F03K 2GJNA 3M16A 1QNVA 3SGZA 3W73A 2C13A 3GNNA 3EWYA 5D03A 3PULA 2QCLA 1PHWA 1FQ0A 1F6KA 1OFBA 4O1BA 4M19A 2ZZ7A 4H4IA 1GVFA 4O19A 2XN1A 4ORMA 2CLHA 1KW1A 2ZRVA 2ZRWA 3G1YA 5LSMA 4P61A 1IF2A 3N3MA 1C9DA 4AH7A 1X8FA 3KRZA 2BSLA 2NX1A 1Z44A 1W31A 4ZQMA 2BLEA 4UTHA 4JICA 2EAWA 1THFD 2ZA1A 1ZHAA 3CWOX 2YSWA 5K9DA 3OG3A 3QF0A 1XM3A 4JTTA 2QF7A 1TV7A 1K7FA 4AWTA 3GXPA 3TQVA 5C6MA 4K8EA 4QIUA 3PUOA 3P5ZA 3O05A 3Q37A 3QRHA 3P5YA 3QSRA 4NX0A 4E38A 3B06A 1PIIA 1SQ7A 4ORIA 1VLWA 1MEIA 3M1ZA 3MHUA 3DU0A 2V2HA 4RZ4A 5FEZA 3QW3A 5AHFA 3W1RA 3FEMA 1NEYA 5CPLA 3G24A 3A22A 4LV9A 2VFHA 4GRSA 3SI9A 1W5PA 4S2BA 1O5KA 2A21A 2HS8A 1P0KA 4WXZA 1OFRA 2Z0IA 4DO5A 1XKYA 5BW6A 3W84A 5CZTA 5AN7A 3R5EA 3EWZA 3GNDA 4H6KA 1LROA 3LX9A 1F6PA 4HNUA 3F4NA 1EUNA 1GYNA 1M5WA 1DOSA 3JRKA 2OMAA 1H7OA 1T99A 4A3UA 1G69A 4Y90A 3WJXA 3GDKA 4UTJA 3NQVA 2AQWA 2J27A 4K37A 1DKWA 2TSYA 1BWKA 4PEKA 1EX5A 1CX9A 4K7VA 3KFTA 4UMAA 5I3JA 4FEZA 4RKAA 1TPUA 5CPMA 4MKNA 4N02A 4MJMA 3P61A 2A7RA 4S2CA 3DENA 1ME7A 2C16A 3S5YA 1DBTA 1XC4A 1Z41A 3W2NA 2A7NA 1Z48A 3G0UA 3PG9A 3TUUA 3W7NA 2PRLA 5LHEA 1H51A 2YYUA 4NJJA 4UFJA 2P0OA 2GJLA 5ABTA 4UNLA 3IIVA 2A0NA 2J6XA 1NFBA 3NQCA 4LW7A 3TW6A 3WJZA 4Y8FA 3I7SA 2WPBA 1UUOA 5H2ZA 3ELFA 1P4CA 4QAIA 3E0IA 2C0AA 1QPOA 3MBDA 1O5XA 1UASA 2ZZ3A 3W7GA 3WJSA 1JRCA 3P62A 1O95A 4MFEA 3O6DA 3HGSA 1XXXA 3NQDA 3IEBA 5D05A 1LP6A 5D04C 5G2IA 2R94A 1PV8A 2FPYA 2ABBA 5AYYA 3W3OA 1H61A 1X1OA 3MP5A 3QJAA 4BF9A 3UY7A 2JK2A 3QEZA 1WYIA 3P8JA 1OF8A 2QCDA 3T78A 3S1XA 4JTSA 1K8XA 4NXKA 4NNCA 2RH9A 5BMWA 3DAQA 4PODA 3W7LA 2CLOA 1SSGA 5EPDA 3KVMA 2BZNA 2FTPA 5DXYA 1FWNA 2F84A 3HGOA 3E49A 1QAPA 3L5MA 1OABA 3DFTA 2PRHA 1YTDA 3N73A 2RDTA 3LCHA 1LORA 3BPWA 1K03A 2R14A 3NPXA 4UFLA 2V30A 4FNTA 4NU7A 1KM1A 3B0UX 4O1DA 4GUFA 1W5NA 3W72A 3HG3A 3W85A 3C52A 5AHNA 4ZL1A 1AL8A 3G3DA 3M5YA 1KM4A 1TCDA 1OFOA 1ZJIA 4NT0A 1IXNA 1AK5A 1GOXA 2QEZA 2E6FA 4WUIA 4GNJA 2ZYFA 1F2JA 3PUEA 1EP2A 3DFQA 2Z1BA 2ZA2A 4E0CA 1SZNA 5D37A 3C0JA 3C2RA 3W7MA 2E68A 4RCXA 4MYAA 4O53A 4POCA 4ONVA 2XN2A 5L9FA 4UTTC 1RR2A 3UQNA 1SZGA 1B3OA 1VHCA 3LV5A 3L65A 4A21A 3G22A 2J24A 2CLEA 3W7QA 3NQFA 4UTWA 1ZAIA 3M5ZA 2YFOA 5TBOA 3LCXA 3GDMA 1M6JA 1VR6A 2ISSA 2DZWA 3W75A 1IIHA 3GXTA 3P74A 4PTNA 5E93A 3M7WA 2ZRUA 1Q6RA 1OFPA 2Q8LA 4WZHA 2EF9A 4O15A 1DJNA 4X3ZA 4ZQRA 1F5ZA 3LLDA 4J9JA 2PE4A 2VEIA 3A9IA 3B04A 3H53A 2DP3A 5HNRA 5FF0A 3C6CA 4MZ8A 4EF8A 1KFCA 3NVTA 3PB2A 4WXYA 1W5OA 1ALDA 4BWLC 1TPH1 2W6RA 3S5OA 1PCWA 3CWNA 1VGAA 2A1YA 3OEXA 1GPWA 3EXTA 4S1FA 2QUUA 3L5LA 4YCPA 4FXRA 2WNNA 3RF9A 1SO6A 4HKPA 3W1AA 1W8SA 3S1VA 1P1XA 3G1AA 3UWUA 2QAPA 3DFPA 4CNPA 3ZWTA 3R12A 1ICPA 1TRDA 4E2BA 5E1QA 1WAUA 4MLRA 4RZ5A 1N7KA 2DJXA 4DF0A 3DKJA 1FWWA 2A85A 4AF0A 2C19A 4LU0A 3TJXA 1VQTA 4Y96A 4UC5A 4NZFA 1M7OA 1RV8A 3GB6A 2FPTA 3R2GA 4Q4KA 1WDWA 2J9XA 1QFEA 1D3GA 4I7VA 1EPXA 5G1YA 1U5JA 3BG5A 4MJZA 4O18A 3SECA 4UIOA 1RQBA 3MW7A 3SJ3A 4Z0JA 4Z1AA 3HGJA 5IBXC 3M5XA 1K8ZA 3IGUA 5KTLA 2GVLA 1F7BA 1FBAA 5CZ0A 3MHGA 4IX0A 2YW3A 2TPSA 1GVOA 3FKKA 3IIOA 3FYOA 3NL6A 5FI8A 1ML1A 4DBDA 3GXNA 4BR1A 2Y63A 3NA8A 4RR4A 4QJ1A 2YW4A 5HQEA 4QM1A 1TB3A 1AW1A 4DXVA 4QITA 3W6YA 1NSJA 2ALDA 1GVRA 5AFDA 4JN6A 3SY5A 2CZFA 4O12A 1SFLA 3UZJA 3W2MA 4U28A 4M6QA 3LHTA 4IGHA 4IJBA 5J5DA 4LS1A 5DCBA 1TPVA 3TFCA 4ZVJA 4N6FA 3GKAA 3W70A 2YZRA 1S5TA 2X1SA 4M6VA 3UXDA 5H91A 3DI0A 1JCJA 4E2DA 3IVTA 3LB0A 1F76A 4O8RA 4JTJA 1G4SA 1FDJA 5D2YA 4XTIA 1OG0A 1KFBA 3TSDA 3MI6A 4ZZ9A 3HJZA 2YXGA 2XFWA 3KOFA 5F1VA 5FF2A 3W7IA 3O63A 4FIRA 4PL2A 4UR7A 1T8XA 4AB4A 1LZOA 4LVFA 2FB3A 3QMTA 1G6CA 4JIPA 2WKJA 1EWDA 2OT1A 4EVZA 4TMCA 2JKPA 4NVTA 3W7EA 1I45A 1Q45A 4M6PA 2CWNA 3FOKA 1WXJA 3HB9A 4IMGA 3EKLA 3QYQA 3PWAA 5DBTA 3BGGA 5AC6A 3MHFA 2JGYA 3RLVA 5KINA 3GDTA 5I3HA 2E6YA 5LGXA 3C2EA 4Q32A 3GIYA 1QO2A 3CHVA 3W86A 2ZZ5A 4FNRA 4IUOA 4AEOA 3LOTA 3RU6A 3PBYA 2DZSA 2V81A 3HF3A 2E77A 1OF6A 3NM3A 4GBUA 3S42A 3INPA 2QJIA 5DCEA 3LERA 2NLIA 4ICNA 3PAJA 3EX3A 2VENA 4MOZA 1AW5A 3K30A 2ATMA 3EX4A 3CU2A 1NF7A 3LCIA 3GAYA 1W37A 1MSSA 1Q6OA 2E6AA 4O0ZA 1HL2A 1WX0A 1SW7A 2JGQA 4JTEA 2O7SA 3W1PA 3C61A 5FEPA 2DZVA 3VCRA 3LHYA 1Q6QA 2NUWA 3HMJG 5EMUA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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