3I7SA

Dihydrodipicolinate synthase mutant - k161a - with the substrate pyruvate bound in the active site.
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
292
structure length
292
Chain Sequence
MFTGSIVAIVTPMDEKGNVCRASLKKLIDYHVASGTSAIVSVGTTGESATLNHDEHADVVMMTLDLADGRIPVIAGTGANATAEAISLTQRFNDSGIVGCLTVTPYYNRPSQEGLYQHFKAIAEHTDLPQILYNVPSRTGCDLLPETVGRLAKVKNIIGIREATGNLTRVNQIKELVSDDFVLLSGDDASALDFMQLGGHGVISVTANVAARDMAQMCKLAAEGHFAEARVINQRLMPLHNKLFVEPNPIPVKWACKELGLVATDTLRLPMTPITDSGRETVRAALKHAGLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli k-12
publication title How essential is the 'essential' active-site lysine in dihydrodipicolinate synthase?
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dihydrodipicolinate synthase
total genus 107
structure length 292
sequence length 292
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.3.3.7: 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase.
pdb deposition date 2009-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3i7sA00
1DOSA 1G4EA 2YFOA 3RF9A 4FO4A 2A0NA 2ZRVA 3STGA 1PCWA 2FTPA 2W0UA 1BWKA 3NQ8A 4N9CA 2J9ZA 4N2YA 1SZNA 4LW7A 4HPXA 5MHBA 1TQXA 3QRHA 3QYQA 5CPMA 2YZRA 3W2KA 3G24A 2ZQ0A 1OK6A 4NJHA 3LRKA 2A1YA 1TIMA 3GXTA 1P1XA 3MWAA 3S1WA 2WNQA 3SFKA 1KBIA 2DP3A 1B57A 3UPWA 4ZQPA 1JCLA 2CZEA 1ZFJA 1OJXA 1Q3NA 3LRMA 4CQ8A 1A5AA 3ABQA 4WD0A 1GTHA 4AVFA 1SO4A 1MEIA 3HPXA 3EB2A 3PULA 3PBYA 4IX2A 3TC6A 3PB2A 2ZRZA 1R2RA 1EP2A 2ZTJA 4HNTA 2C6QA 4B5NA 2RDWA 4X3ZA 2BXVA 1WOBA 2ISWA 4UMCA 2XFWA 5LKYA 3P81A 5DBUA 1JCJA 4UC5A 3GDRA 1P0NA 3QMTA 1KBJA 1OK4A 4ZQCA 1Q6QA 5F2LA 1TPB1 4CQAA 4JS3A 1XKYA 1NF0A 3C2VA 3QFEA 4NJJA 5D03A 2HSAA 3KVMA 3QJAA 1CX9A 5K2ZA 4LTSA 4WUIA 5E93A 3M5VA 1XBVA 2GQ8A 1LLZA 4O52A 3R5EA 2JGYA 5KZEA 3P82A 2V81A 4LNYA 1WQ5A 4MFDA 5DCEA 2C18A 4NQ1A 4FXSA 4BWLA 3P74A 1ICQA 1K02A 4WY0A 1THFD 2P1FA 3DFSA 4JGDA 4OGZA 3S5YA 3UWZA 5D2WA 1OFRA 2Y62A 5DLCA 4XUGA 4ADSA 4RCXA 3DI0A 4EF8A 3JRKA 4EIVA 2EGZA 4OQVA 5H2ZA 1AW1A 1K7EA 1A5SA 1B9BA 1DHPA 3WK1A 4Q32A 2B7OA 5EMUA 4GJ1A 2NZLA 3CT7A 3HPZA 1SPQA 5KSWA 3QPYA 5HMSA 1HO1A 3R89A 3DZ1A 1FWSA 2CLLA 1OFOA 3B0UX 3DKLA 1W5PA 1OFPA 3IGXA 4UTWC 1TCDA 2YYTA 4N4QA 2PC4A 3Q94A 2YYUA 3M7WA 3N73A 3ZWSA 1O5KA 3S1XA 2UV8G 4DQWA 2OT1A 3WJXA 2J88A 2G97A 4M5PA 4MJMA 4JDBA 3PF3A 4ORMA 4XKYB 3UXDA 4JTUA 1QOPA 1VC4A 2Q8ZA 3S6DA 2A7NA 4FIRA 3W86A 2EF9A 3C2FA 1EIXA 2VEKA 4GBUA 3SSJA 1RZMA 2TSYA 2Y7EA 4IPJA 5HUPA 1IF2A 4E2DA 1SU5A 3O8AA 2DZPA 2ABBA 3T55A 5HJLA 3PB0A 3P7YA 3BPWA 3ZFHA 1GYNA 3W1AA 4UR8A 2PRMA 4QITA 1G69A 2P10A 3MMTA 3TXVA 3W1RA 3C52A 1LOQA 4YCPA 3L65A 3GLCA 1H7OA 3C6CA 3EKZA 4LRSA 1KA9F 3G1XA 3MHUA 4JIQA 2WNNA 3G1YA 4NNBA 1PVNA 2BTMA 3TAKA 1JJKA 3WJZA 4JICA 5KTLA 3GR7A 2DZSA 4G1KA 3EWZA 1W1ZA 3F4NA 5AOUA 1Q6LA 4ALDA 1LDCA 2V2DA 4PEKA 1OG0A 4BI6A 3NPWA 2YDAA 3NXFA 5DELA 5I3GA 2FB2A 2ZRWA 2Y63A 3MP5A 1BKSA 3B8DA 4TMCA 1TYGA 2GUUA 5I3JA 1KLZA 3JS3A 2WKJA 1M7OA 2QCMA 4QIUA 3W2LA 1P0KA 2BZNA 1VR6A 3T7VA 3M5XA 1K7XA 4GE8A 1FDZA 1SFLA 4BI5A 5C54A 2E6YA 3HGSA 3FS2A 1YXYA 2GVGA 3L66A 4TU1A 3PBVA 3G1DA 1SZEA 4E38A 4Y90A 1LRQA 4OHQA 3G1HA 1EPXA 4A2SA 1F6PA 4HHPA 1XUUA 3CLMA 3UWVA 3P67A 4AWTA 1DBTA 4HSNA 3W7RA 4KKXA 3G1AA 3F4WA 2CLIA 3KVJA 3GXPA 5HWMA 4MFEA 4Y9AA 3PWAA 3LCHA 1HL2A 4ONVA 3W1UA 3KOFA 4RLIA 2C3ZA 4GUGA 3A22A 3L21A 2OT0A 1K8YA 3GNDA 3A9IA 1TPEA 4A29A 4XBKA 4JTFA 3HOJA 5LZLA 3MYOA 2PCQA 1W31A 3F03K 3W73A 2F7FA 4MIMA 2QCEA 2ZA1A 2F84A 1YLVA 4FNQA 1XC4A 5K3VA 2E6FA 1BWLA 2E6AA 5D04C 4R34A 4CCDA 3QW3A 5G1YA 4I7VA 2J27A 1E51A 1XXXA 3LBMA 3G22A 2FFCA 1FY6A 2VFIA 3KVLA 3GNNA 1FX6A 2V5LA 3W23A 3EKLA 2CFFA 1GT8A 4LV4A 1MSSA 3O63A 3W1NA 3LGEA 4E0CA 1X6UA 3CHVA 2CLMA 3PY2A 4GUIA 2QCDA 3I68A 2BLEA 2E77A 3SIZA 4Y8FA 3L0NA 1YTEA 3W7IA 3CU2A 4LOCA 3VI2A 4DEFA 5HULA 3DFNA 2CW6A 5CZJA 5CG7A 3I6RA 3EWXA 1KLYA 1R30A 1TPH1 1WOAA 4AHPA 1AMKA 3EWYA 1TPC1 1Z42A 2VFHA 4EOUA 4M7SA 3HB9A 5BMWA 4IMDA 2J24A 5CKSA 4HKPA 3LV6A 3OG3A 3LLFA 5IBXA 5FEXA 5E0KA 4HT3A 3R8RA 3NAVA 4NU7A 3C61A 2H3DA 3PBUA 4RXFA 2HS6A 4K38A 4TMBA 3BW3A 4NJIA 3C0JA 1XBZA 2ZZ6A 1ME9A 2R8WA 4K6AA 4Y6GA 4YMZA 4JEQA 1EX5A 3BGJA 1EP3A 3L68A 3LTYA 3MW7A 3STFA 4E2BA 1JCYA 4XZ9A 3M44A 5AN7A 1N7KA 3QM3A 4OT7A 2JGQA 3NQCA 2YCEA 4DPQA 1G6CA 1K7FA 5AYZA 2CWNA 1WXJA 1XBYA 1KM0A 1ONRA 1A5BA 1SR9A 3NL2A 1SO6A 1SSGA 1FWWA 4LS0A 3CWNA 4CNPA 3W74A 4NZFA 1FWRA 1LORA 3GDKA 2ZTKA 3W83A 2WNZA 1TPWA 3E49A 3W3OA 3VFLA 4RKAA 4IMCA 1EWEA 4JX6A 4FNSA 1SFJA 4GUJA 1QNVA 3FKKA 1PE1A 3ATYA 4MUZA 3NYZA 1G4SA 2NX1A 2QDHA 5I3IA 3QC3A 3EX1A 4OE7A 1C9DA 3E9AA 4IXHA 4BI7A 1GVRA 3R12A 3QF0A 4NX5A 2I1OA 1KFKA 1S3HA 2VXNA 1AW5A 3P62A 1H1YA 3TFCA 4MOZA 4NT0A 2C0AA 2EAWA 5AYYA 5D30A 1FCUA 3NM3A 4MPQA 3GK0A 1UASA 5CZTA 2Q3OA 4M6PA 1W8SA 2JBMA 2RKXA 3LHTA 5BRBA 1DVJA 3IIXA 2ZA2A 3LI1A 1XM3A 1AK5A 3M6YA 3PUOA 2A2IA 2Y70A 2NX3A 1KTNA 2NXGA 2YX0A 4LVFA 2E1DA 2EKCA 4X2RA 4FHAA 2RDUA 1W56A 3FYOA 2Q8LA 3W1TA 4FIQA 1I2OA 3W7OA 2Y7FA 3A5FA 2QDGA 2J9XA 2V2CA 4CLMA 4XQ6A 5LGXA 3HQ1A 1R2TA 2R91A 4O0ZA 3DAQA 2E5BA 3STEA 4DBDA 1H1ZA 1R46A 2ZDRA 4UTUA 2QEZA 3GX9A 3H53A 4UIOA 1TPUA 1U83A 1JQXA 2ZYFA 3LTPA 3OBKA 1H7RA 1EUNA 4GUHA 3NO5A 3C2EA 2GQAA 4UFLA 4DF2A 2QCGA 1I2NA 1D3GA 3BARA 2GVLA 1EA0A 3S5ZA 2ZZ2A 3O6CA 1AL8A 3NNTA 1YADA 1KFJA 2QAFA 4JYFA 4A22A 1VPXA 2DZUA 2A21A 3SECA 4LVDA 4C1LA 1JVNA 3DENA 4O57A 3G3DA 4AAJA 3DFOA 3TJLA 3NQDA 5D2YA 3TK7A 3MP4A 1QPOA 3HJZA 2NXIA 2WO5A 4PODA 3L0KA 2C19A 2I14A 2QJHA 4NNAA 4WXZA 4JY8A 3HIJA 3UWWA 1JUKA 4O28A 1ZAIA 3LXBA 3E12A 2QCFA 3M5ZA 5D32A 3CEPA 2A4AA 3I65A 1U5JA 4PA8A 4Y96A 3W6YA 1J4EA 3TW7A 5FEWA 1G67A 4LVBA 5FEPA 1A50A 3IVTA 2ZCGA 2NXHA 4MYXA 2Z0IA 3ABRA 3HG4A 3B05A 7TIMA 3MYPA 2VENA 1IXPA 1LBLA 2RFGA 4LVGA 1UUOA 5D2XA 4K36A 1TPDA 3OVQA 1SW7A 2DJLA 2CLEA 3S9YA 4AB4A 1XFBA 3M5YA 4MZYA 4WY0F 4P61A 3UXAA 4UFJA 1KTCA 4Z0SA 4ZQMA 5I3KA 3GKAA 4CCEA 2GJNA 1I4NA 1DORA 3E02A 2YGYA 3GR8A 3S0CA 5K7JA 4PCFA 3TV8A 1O5XA 1KM3A 2O7QA 3CEUA 5D05A 2Y6ZA 3HMJG 1WA3A 4RV8A 5AHIA 3TNOA 2NWRA 1H62A 3G1VA 3SZ8A 4TIMA 1H5YA 1TRDA 3L5MA 5HR6A 4AHOA 3L2IA 1F74A 3UWYA 3IV3A 3O6YX 3OIXA 3TC7A 4RR4A 1OF8A 1FDYA 2WJZA 3W2NA 2DZVA 2Z2UA 4A2RA 1KTBA 5HNRA 5LNSA 3O1NA 3IIVA 1FUYA 4P2VA 4IJBA 2G96A 3M43A 3TH6A 4AF0B 2H8ZA 3W72A 1LOSA 1N55A 3NZ1A 4MYAA 5ABTA 5C6MA 1JCNA 4O50A 4WQ6A 1UUMA 5DY3A 5HWJA 1NEYA 1OFAA 4FF7A 3LHVA 1LRNA 4RZ5A 3O16A 8TIMA 2C1HA 4FX7A 3ZR4A 2H90A 5LSMA 3SY5A 1EUAA 4NX0A 5DCDA 3A24A 3QMSA 3U2OA 2RDTA 3UD6A 1GQNA 3P80A 1H51A 1VYRA 4UTTA 4HSOA 4GXMA 4S2CA 3IIPA 3NPVA 2WQPA 2AAMA 1TO3A 3HF3A 3HG3A 1MXSA 4OWGA 3G0SA 4UFKA 5AYXA 1DJQA 2CLKA 1L6YA 5HWNA 3FYPA 1RV8A 5EYWA 3O06A 4PL2A 4O4WA 4O1AA 3PG9A 2ZZ3A 4JTJA 3WJSA 2C13A 3LRLA 4ICNA 4O11A 4FNUA 1VYPX 1I2QA 1XI3A 1DQXA 3CWOX 4TO8A 2EHHA 4GUFA 1B4KA 3TSDA 2QAPA 1OFQA 1W5OA 4LS2A 2V9DA 4FX8A 3SGZA 4DF1A 2QCCA 5DBTA 3VCRA 3M41A 2XN0A 1YYAA 4Z0JA 1VH7A 2OX1A 3TDFA 3C56A 4N9BA 3PSWA 5DXXA 3W1XA 2B7NA 4MJZA 3W7NA 1SSDA 4S1FA 3O07A 4DPPA 3MI2A 3UZJA 1SZGA 1FCQA 3TXZA 2O7SA 3Q58A 1IGSA 3INPA 2LLEA 2KZHA 4QAIA 3TCEA 1KV8A 3LLDA 3DXIA 4RZ4A 1ICPA 5G4EA 1TTIA 2B7PA 2P0OA 2IQTA 3TAOA 3MI6A 1PCKA 1XDLA 2YW4A 3H54A 4NVTA 2CZDA 3W1MA 3TX9A 3KVKA 1HFBA 2BSLA 5TQLA 1VCGA 3WJYA 4C1KA 1QMLA 3CTLA 3FKRA 4LS1A 4O13A 1EB3A 5SWUA 5F2IA 5K4ZA 4U28A 4ZQRA 3TUUA 1PIIA 4CCCA 1GPWA 1ZCOA 3P8JA 1GOXA 1PHWA 3TA6A 3CIXA 3SI9A 4I7UA 3W7GA 1O95A 3CIWA 2V82A 2J6XA 3W7JA 3SJ3A 2CU0A 4MY1A 1YDNA 1Z41A 4DO4A 5LNVA 3CPRA 1SO5A 3LCWA 1IIGA 4BFAA 4WJEA 5U7SA 2XN1A 3B0VC 1FDJA 3MI3A 4Q33A 2QCHA 3PG8A 3W88A 2ALDA 1JQVA 5HINA 4IUOA 5CZ0A 3YPIA 2EPHA 4XTDA 1NVMA 4BF9A 3W2UA 3PM6A 3Q37A 1SW3A 3UY8A 3W84A 2VKZG 4L4MA 1LCOA 1NAL1 3DH7A 3E96A 3GDTA 4LV9A 4BR1A 3W7EA 3WJWA 1O4UA 3P60A 3I7SA 3TKFA 3UPBA 2Y61A 1Q6OA 3W70A 4AWSA 3KRZA 1X1ZA 3NQEA 1OHLA 1RQHA 4N02A 3VE7A 4AHQA 2GJLA 1K03A 5BW6A 2C15A 4HNNA 2E6DA 5E1QA 3LI0A 3F1QA 5D2TA 1TTJA 1VQTA 4OV4A 3LV5A 3LTSA 5C5YA 5LNRA 5H91A 1W37A 3TFXA 2WSQA 2QUTA 3NG3A 4W9TA 1PV8A 1H7PA 4QNWA 3NL6A 1F5ZA 3U8GA 4JTTA 4OBTA 3NL5A 4QISA 2ZBTA 1YTKA 1FWNA 3L67A 3NQFA 5G5IA 2VEIA 2NLIA 1N8FA 1EWDA 1G7VA 3SGUA 1RVGA 1X1OA 1OFEA 3S42A 5K9DA 3MHFA 1S5WA 5LHFA 4JXCA 4UTLA 3PS7A 1TV5A 1OX4B 3FEMA 3DHDA 2ISSA 4RJEA 5I3FA 1JCXA 2ZZ7A 2FJKA 3M1ZA 4WY0B 2VFDA 5F1UA 1P4CA 5CPNA 5K9XA 3W75A 3SR7A 1VRDA 3W7MA 1YPFA 4KFOA 3BK0A 3L5AA 1O60A 3W9ZA 4EF9A 2A6NA 1OX6A 3O6DA 3QZEA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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