1ME7A

Inosine monophosphate dehydrogenase (impdh) from tritrichomonas foetus with rvp and moa bound
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
491
structure length
365
Chain Sequence
AKYYNEPCHTFNEYLLIPGLSTVDCIPSNVNLSTPLVKFQKGQQSEINLKIPLVSAIMQSVSGEKMAIALAREGGISFIFGSQSIESQAAMVHAVKNFKAGFVVSDVCHNELVDSQKRYLVGAGINTRDFRERVPALVEAGADVLCIDSSDGFSEWQKITIGWIREKYGDKVKVGAGNIVDGEGFRYLADAGADFIKIGIGGGSICITREQKGIGRGQATAVIDVVAERNKYFEETGIYIPVCSDGGIVYDYHMTLALAMGADFIMLGRYFARFEESPTRKVTINGSVMKEYWGEGSSRARNWEGVDSYVPYAGKLKDNVEASLNKVKSTMCNCGALTIPQLQSKAKITLVSSVSIVEGGAHDVI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Tritrichomonas foetus
publication title Crystal Structure of Tritrichomonas foetus Inosine Monophosphate Dehydrogenase in Complex with the Inhibitor Ribavirin Monophosphate Reveals a Catalysis-dependent Ion-binding Site
pubmed doi rcsb
molecule keywords INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
total genus 116
structure length 365
sequence length 491
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2002-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1me7A00
5HJLA 3G1HA 5EYWA 5U4NA 3P84A 4YWIA 3UY8A 3PF3A 3TU9A 3RU6A 2WSRA 4RX0A 3SW6A 1OF6A 3S5ZA 4LUJA 2Q8ZA 3UD6A 2CWNA 3G8EA 4FNUA 3NR0A 5E93A 2H90A 1K8XA 3TDFA 3MO7A 3W1NA 3L0GA 1R2SA 1W5QA 1XDLA 4JXCA 1FCQA 4JICA 4PEKA 4NJKA 3I7RA 4MY9A 5MHBA 1XDMA 1OYCA 3G24A 3O6YX 1VPXA 2DZVA 1KW1A 2FPYA 3MP4A 3L0KA 3O6DA 4P2VA 1OX6A 1VYSX 5D03A 4BWLC 3STGA 1W5MA 4IMEA 3WJXA 3FKRA 3BLFA 3EWZA 1FWWA 1K7XA 4BFAA 1UJPA 3DZ1A 4JD4A 3KVLA 3LTSA 4IXXA 3N9SA 2YGYA 1QOQA 3L66A 3M41A 4O54A 1TV5A 2ABBA 4ZQNA 3CLMA 2FLIA 3PG8A 3HG4A 4JR5A 4RR4A 5AHFA 3CEUA 2Y62A 4N4QA 3BGJA 4HNNA 1M7OA 4RZ5A 2H3BA 3E96A 4GUHA 4O52A 2FFCA 1SSDA 4LT9A 3N34A 3W7NA 3LI1A 4DBEA 3DFPA 1DHPA 1EWEA 1K8ZA 4LVBA 2FJKA 5C5YA 1EP1A 4UTHA 1IXNA 2J88A 4EIVA 4LU0A 3AJXA 2XN0A 2ZTJA 1WV2A 1X1OA 1AG1O 2X1RA 5GVJA 3O15A 5CPOA 1H63A 1WDWA 2QJHA 1G4PA 4UTWC 4BK9A 5EMUA 1DJQA 2PCQA 1ICQA 3MWAA 2QCHA 3DHFA 5D2YA 5FF2A 2QCDB 4WQ6A 1O5KA 4ZQCA 3W07A 1QOPA 2EKCA 4RXFA 2PC4A 4LTSA 3NQ2A 2ZRWA 4GE8A 4K6AA 1K03A 5AB3A 4ZMGA 3S8HA 3OVRA 3VE9A 4Q33A 4O0ZA 3HBLA 2QCFA 3HO8A 4ZZ9A 3FJLA 1FCBA 3LHZA 4JDYA 5AN7A 1ALDA 3M43A 2NX9A 3IIXA 2VEIA 4JTLA 1UASA 3PVFA 2E5CA 3NVTA 2CLOA 3STFA 1PCKA 3NNTA 4CCEA 3CWNA 1J2WA 3LI0A 2NV1A 4AXKA 1H1YA 3S5YA 3LHWA 1AW5A 3CU2A 3LTPA 5A8GA 3G18A 5KZMA 4M6QA 1X1ZA 5CZTA 3G1XA 1KV5A 3NL3A 3S42A 3WJSA 4JDBA 3NOEA 2WJZA 3O16A 1XC4A 3NQAA 5K4ZA 1GVQA 1LCOA 3W1UA 4XKYB 1FXQA 1WAUA 4JYDA 3GLCA 3FKKA 1H7XA 1TJRA 1V7YA 4EOUA 2VFIA 2B7QA 4UNKA 4NZJA 2RH9A 1TO3A 1DJNA 3QEZA 4LUIA 1LBLA 1W3TA 5D09A 3B0PA 2NV2A 2BX7A 3OG3A 4RLIA 3KRZA 6ALDA 5BMXA 3Q94A 4NNCA 4O14A 1YTEA 3P62A 5LGZA 2YPIA 2YW4A 1XL9A 3I7QA 4RJEA 2GPTA 4O1DA 4UTKA 2H8ZA 1AK5A 3ABSA 1Q45A 4UFLA 4K38A 4QIUA 1ZNNA 5F4XA 4NNAA 1LRNA 3EX6A 2GJNA 1L6WA 2CLKA 3K30A 3PB2A 3GIYA 1TTQA 2I14A 1JCJA 3GK0A 3QFEA 2ATSA 3SFKA 4HNVA 4TO8A 4PODA 1YDVA 1TCDA 4CQAA 1RQEA 4DQWA 3WFAA 2C18A 1FWSA 3SI9A 1C29A 3E9AA 1F05A 1Z41A 1JR1A 4Z0JA 3W1AA 4R33A 3W7OA 4RKAA 1O95A 3GAYA 2YX0A 5SWUA 4LV9A 1QMLA 1A5CA 2ZZ5A 2VENA 4DXVA 3NQ8A 4MYAA 3NEVA 3WJZA 3G8RA 5FF3A 1TPEA 3MP3A 1BWLA 4S1FA 5H91A 1DQWA 3W7JA 3TQVA 3T78A 2WSYA 4RK8A 1KM5A 3AO0A 2ZRXA 3C2RA 3PUOA 1VZWA 2QCEA 3U6WA 1VRDA 1TJPA 1A50A 4Z1BA 4XKYA 3M1ZA 2NUWA 4JTJA 4C1LA 1K7FA 3W7MA 5D30A 3HQ1A 3W2UA 1OHLA 1MEHA 3T44A 3W2JA 1XBXA 4FHAA 5DY3A 1JULA 3S6DA 4UTMA 1KBIA 4N4PA 1P4CA 1ICSA 2ZRYA 2J27A 2E6AA 1L2UA 2X16A 1IIHA 1LRTA 3QW3A 3HG5A 3MI3A 2C3ZA 2PE4A 1SQ7A 1KM3A 1KM4A 2GOUA 2YCEA 4L4MA 1M6JA 2EPHA 3UY7A 4Y9AA 3W86A 1JCYA 1LRQA 1JCXA 3ZWSA 3P80A 3BG5A 2F7FA 4UFIA 5HNRA 1TPC1 1WXJA 2V2CA 1GTEA 2HS8A 4LS0A 4U4MA 4AF0B 5AC7A 4WXYA 1Q6LA 2DZPA 2A2IA 4OE7A 3S1UA 3LHUA 3UPWA 3TQ0A 1VR6A 1W8SA 3FEMA 1T99A 3UWVA 4IMCA 3SJ3A 3P61A 4IMFA 2JGYA 1F6PA 1MXSA 3C8FA 4LWWA 4HNUA 2E5BA 2Y7GA 3IIZA 2FB2A 1VYRA 2DJLA 4FXRA 4MZ1A 3WK1A 3ZFHA 2QEZA 1OYAA 2W79A 4O1AA 1ZALA 3FOKA 1RV8A 3KOFA 4NZFA 1FWTA 1JRCA 3IVTA 4RZ6A 3SIZA 1O60A 1ONRA 4ORMA 3NZRA 4NJGA 3F4WA 3GKFA 3UYCA 4XWUA 3M47A 1DQXA 3TAKA 5T26A 2NX3A 2TSYA 3E12A 3LXCA 4IOTA 1K7EA 3BARA 3RLVA 5EBUA 2PRMA 4JTGA 1H1ZA 4DO4A 2Y88A 3G1DA 5KZEA 4IGHA 4QM1A 3IIOA 1Z44A 4QQ3A 4IPIA 1B9BA 4YLWA 1VYPX 1HO1A 3PC0A 4O28A 4LY8A 4UR7A 5HWJA 4C1KA 4UTLA 4H4IA 5AHIA 4GC4A 2ZZ6A 1FXPA 5CG7A 3W84A 1O94A 1SZFA 2ALDA 4KWVA 4E0CA 4N9CA 3W88A 3TR2A 1WBJA 5D33A 2FB3A 4JY8A 4LVDA 1NFBA 3IVUA 3N9RA 4RV8A 3GYEA 2YXGA 3TNOA 5C55A 1GQNA 1I2QA 3NGJA 4Z1DA 4XQ6A 3IGSA 2IQTA 3EWXA 4DPPA 2OMAA 4HN4A 3TW6A 4GRSA 1XFBA 3CTLA 1IXPA 3C61A 3B03A 2HMCA 5F2MA 5D32A 4HKPA 4JTFA 3TC6A 4O19A 3IV3A 5D2VA 3W2KA 4KFPA 3QC3A 1A5SA 2G95A 2W0UA 1HO4A 1F2JA 4DELA 5AHMA 1D9EA 3LCHA 3NL6A 4X9SA 5J5RA 3FYOA 1QPOA 4DEFA 4HPJA 4KKXA 1KLYA 3F1QA 3Q2DA 1SZEA 1W5NA 2P10A 1ZAIA 1QNVA 2QUTA 1ZCOA 3CHVA 5G2IA 1J4EA 1KTCA 2VEPA 4AAJA 2RDWA 3A5VA 2RFGA 3L67A 3PUEA 2C19A 2VEMA 4MVAA 4N02A 1ICPA 1VH7A 3QMRA 4UXDA 1IXOA 3W7KA 4O1BA 1C8VA 4YL2A 2ZA1A 1GT8A 4N6FA 1SO4A 5FF4A 1W56A 5AYXA 4AEOA 2NX1A 1F6KA 3W6YA 2ZRUA 1KTBA 3MYPA 2JBMA 3R8RA 1PE1A 1HUVA 1VS1A 1W0MA 3GVGA 3P5YA 4JTHA 4GWEA 2VOMA 1NF7A 5HINA 5TIMA 5LKYA 4FEZA 1YADA 4OV4A 3T40A 5FF7A 1BEUA 2C1HA 3W7CA 1G67A 3MP5A 5F2IA 2ZYFA 3W7GA 5AC6A 3O05A 1FCUA 2OT0A 3BV4A 1OFEA 4FO4A 2G5WA 2TPSA 2QCMA 3RK8A 3STCA 5HWNA 3SSJA 1N8FA 2NZLA 4M5PA 4NQ1A 1JCMP 3LX9A 4QJ1A 3W1QA 4MUZA 3QQ1A 3VKJA 4X3ZA 3JRKA 3A21A 1YPIA 4JYEA 2V81A 4EVZA 2J9XA 2X30A 3ELFA 3BLIA 1TRDA 4UUIA 3RF9A 3A5FA 3W2MA 1TRIA 1F7BA 2FPVA 1K02A 1OK6A 3LHVA 4JYFA 2CLHA 4GJ1A 2WNZA 4S2BA 4UIOA 1W3NA 2Y63A 3HGOA 5AFDA 1OFBA 1LM1A 3CB8A 1RPXA 2R94A 2YDAA 1GJPA 1XBVA 1W37A 2YW3A 3GXPA 1YYAA 1K8YA 1VLIA 2NXGA 4O8RA 3M5XA 1FCVA 3LM7A 1SZGA 2WOQA 3P82A 3EXSA 2G96A 2CLMA 4IWWA 3UPBA 5I3JA 3NQDA 5DY2A 4PTNA 4OGZA 3G1SA 4POCA 3P8JA 2OT1A 2A1YA 3VE7A 5FEPA 4BI7A 4AWTA 2EF9A 2E77A 3LCFA 4ZVJA 3W7HA 3TKFA 2UV8G 1BKSA 1OABA 4IUOA 5HUPA 4TU1A 3SGUA 2OCZA 1WA3A 3P67A 4N9DA 3TE9A 1CI1A 1ZFJA 4JTSA 2BTMA 2JK2A 1H7RA 2V2DA 4JEQA 4K39A 3EX2A 4MLRA 4Y6GA 4MIMA 5CSRA 5K9XA 4ZQOA 2QCCA 1DOSA 3DI0A 2GVGA 4HHPA 4N2YA 3UQNA 3THAA 2PURA 2XN1A 3CC1A 4AMAA 2QCGA 5LNWA 3GDMA 5D38A 1QCWA 2FQIA 4PL1A 3QH2A 3CM4A 4ONVA 3W7IA 1AW2A 3EX3A 3DFTA 3JS3A 5D37A 1IIGA 3B06A 3LCLA 1SO6A 5TQLA 3EXRA 1NSJA 1YLVA 3W87A 3RFAA 3P60A 1KM0A 4O15A 4D2JA 1IGSA 1VQTA 2RKXA 2V5LA 1TPH1 4G1KA 3MI2A 2BSLA 3GB6A 1FQ0A 3QQ0A 3CT7A 1OX5A 3C2EA 4J9JA 3M5VA 1MEIA 2RDUA 2ZZ1A 2NUYA 3TUUA 3W1LA 3KX6A 4FNPA 1TIMA 3NYZA 2QCLA 4GNJA 3LLFA 4ADSA 4NT0A 1HFBA 3R12A 3TSMA 3ZR4A 3ATZA 2ISVA 5AYYA 1M7PA 3LHYA 5L6UA 4UFHA 1EB3A 1PCWA 2JGQA 3E02A 1T96A 4B5NA 1Z42A 2C13A 3WK0A 2X1TA 3L5LA 4K8HA 3LLDA 3W7RA 3EX1A 1JVNA 2GVJA 1KFEA 1UCWA 2DORA 2B7NA 1H7NA 1LBFA 3LV6A 3NQCA 3WJWA 4NXSA 1Q6RA 1TPUA 5LSMA 8TIMA 3OHIA 1XBYA 3QPYA 1UB3A 4MKNA 4PA8A 3UXDA 4KFNA 4IPJA 3TAOA 3QRHA 1WX0A 2QJGA 4ADUA 3NQ6A 3CIXA 5K2ZA 3LXBA 3DXIA 1RD5A 1D3HA 2FIQA 5EPDA 5FF0A 3LERA 3PBUA 5H2ZA 3F03K 4A21A 3TXVA 3EWYA 2Z2UA 1H51A 1DBTA 2I9EA 2DZSA 1FDZA 4TIMA 1L9WA 3CPRA 3KVKA 2LLEA 2Y70A 4PCFA 3LHTA 5G4EA 3N19B 1I2PA 2C15A 2QCDA 3IIVA 1SU5A 1I2OA 1TTIA 4GUGA 2E68A 3GAKA 3HPZA 1R2RA 4OU1A 1LOSA 4CLMA 5KITA 2ZDRA 1WOBA 1KFBA 4UTUA 1KM2A 5KZDA 3S5NA 1JQVA 1GG1A 4HSOA 3KFTA 2ZTKA 4JX4A 4I7WA 4O16A 1YXDA 1QO5A 5CZ0A 1R2TA 3NQFA 1GYNA 5I3KA 5F1UA 4PFMA 1W3IA 4BWLA 2I1OA 2BZNA 3QYQA 5DCBA 5EKYA 1WQ5A 4AHPA 1ZAHA 3SECA 3MI6A 5EA9A 3EXTA 4ORIA 4O13A 3INPA 2V9DA 1ADOA 4DO5A 3U8GA 1G4EA 1EUAA 3LOTA 3Q37A 3NPVA 4YCOA 3OIXA 1OFAA 1R30A 3GNDA 3UZ5A 4AH7A 2WPBA 1LP6A 4M6VA 4A3UA 5BMWA 2WSQA 1WOAA 2AAMA 3DFSA 4WOZA 3BVJA 3M6YA 4NUWA 3R5EA 2WKJA 2VELA 2ZZ3A 4JN6A 2V5BA 2NWSA 1YTDA 2DP3A 3QSTA 3FS2A 1KM6A 1GOXA 4UFKA 3W1RA 4OT7A 4NX5A 1PHWA 4FNQA 2E5DA 3RLUA 2TMDA 1EX5A 3VCRA 3W2NA 3HPSA 3O63A 3GXTA 3W23A 3EKLA 4JTEA 1W5OA 2YR1A 2XN2A 1SSGA 1ZHAA 4FF7A 1BTMA 4ZQMA 3W75A 3HJZA 1VC4A 3DHDA 1OG0A 2VFDA 3MHFA 2EGZA 3G0XA 4WZHA 5DBUA 1QR7A 4UTJA 2E09A 2ZZ4A 2HSAA 2Z6JA 1GYLA 1H7OA 3HG3A 3IRDA 1VCGA 3DAQA 3Q58A 2A85A 3TMQA 5D04C 3W1TA 2F84A 3CEPA 5G1TA 3GR8A 3O8AA 1KA9F 2ZCGA 5D2WA 3HMJG 1OFOA 4BI6A 4K37A 4AB4A 3R2GA 4IXHA 5K3VA 2Y85A 3S0CA 4Q32A 2NXHA 3W7EA 2O7SA 4O57A 3V1PA 3W1XA 4ICNA 2TRSA 1OK4A 2GQ9A 2ZZ2A 3W74A 3S9YA 4BR1A 3GDTA 4FNSA 4A2SA 5DCEA 2V8ZA 4IQLA 3M44A 4UFJA 1LOQA 4FB7A 3UWUA 3G3DA 2EAWA 1AW1A 4FNTA 2QCNA 3TA6A 1P5BA 4O18A 3B4UA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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