5SWUA

Dehydroquinate dehydratase from a. fumigatus arom
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
DSLGTIKKKQHSFFVSLTLPDVRGADQILEQACVGSDAVELRVDLLEDPDSSNGIPTVDFVADQISYLRSRITLPVIFTIRTKGQGGRFPDDAHAEAMQLYRLAVRSGCEFVDLEIAFPDEMLRAVTEMKGYSKIIASHHDPNGELSWANMSWMKYYNRALEYGDVIKLVGVARNLDDNTALRKFKNWAEEAHDVPLIAINMGGNGQLSRILNGFMTPVSHPALPFRAAPGQLSATDIRKGLSLMGEIKKG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Dehydroquinate dehydratase from A. fumigatus AroM
rcsb
molecule keywords Pentafunctional AROM polypeptide
molecule tags Hydrolase
source organism Neosartorya fumigata (strain cea10 / cbs 144.89 / fgsc a1163)
total genus 85
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.1.25: Shikimate dehydrogenase.
pdb deposition date 2016-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5swuA00
1SSDA 2C14A 3MP4A 1AL8A 1RVGA 4K39A 1PCWA 2ISVA 1F5ZA 1TMHA 2E5BA 2Z1BA 5K2ZA 1VS1A 2V5LA 3I68A 3DXIA 1OF6A 1AL7A 4OWGA 3WJYA 4H3DA 2FFCA 2CZ5A 3GXNA 1LRTA 2FB2A 3W2LA 1Z48A 5KZDA 5H2ZA 2RH9A 1NEYA 4O16A 4LY8A 2VXNA 2GVJA 2CLFA 2E6YA 3LHUA 4MZ1A 3SFKA 1KM5A 4KWVA 5KITA 3GZ3A 3BGGA 3KAOA 4NZFA 4YCPA 5A5WA 3R12A 4D2JA 3L67A 1DORA 4QITA 3SIZA 1JUEA 5LNWA 3G1XA 1LLZA 5A8GA 3NM1A 1H60A 5HR7A 3MO7A 1TQXA 2J9XA 4IPJA 1DBTA 5LGXA 3FYPA 5D09A 3LHTA 4JTHA 2ZZ7A 3P80A 1SPQA 3O06A 1XC4A 4ZQOA 1ICQA 3M47A 3TSMA 3UZ5A 4GUJA 2R91A 4LVFA 1AW5A 3B06A 1GEQA 1OHLA 4JTKA 3O6CA 2Y63A 1ALDA 3GXTA 4HT3A 3HPSA 4FNQA 3E02A 2FQIA 4CCCA 3W1AA 3TMLA 1JRCA 4XKYA 3KVKA 1ICPA 3GKFA 2YYTA 3PBYA 1LTDA 5C5YA 3LX9A 3O6YX 4ML9A 2VEMA 1PIIA 4UFMA 3W7LA 4AB4A 2GJNA 2CLIA 1GVSA 1FX6A 5DBTA 1EP2A 2G95A 2VEIA 4GE8A 5BNKA 5LNVA 5LZLA 3F1QA 5D32A 2QCNA 3W70A 3A21A 4FEZA 1BTMA 1XDLA 1W5QA 1CI1A 5C2XA 3P7YA 1X1ZA 1LROA 1YTEA 3PY2A 5AHFA 2AQWA 3FKKA 3V1PA 5I3GA 5E93A 3DH7A 3IVTA 2ZTKA 3LI1A 4OT7A 2KZHA 5G2IA 3W7RA 3G8RA 3LHWA 1A50A 4DBDA 4A2SA 3EEGA 3TSDA 3TJXA 3ANYA 2BWGA 2YW4A 4LV4A 4MLJA 4QQ3A 2RDUA 3P8IA 1ML1A 1VH7A 1G69A 2PE4A 1EWDA 1PCKA 1HO4A 1S5WA 1Q3NA 4TO8A 5HWMA 3C2VA 2LLEA 4OHQA 3S42A 3T4CA 3EWUA 5H91A 3FJ6A 3W1UA 2H8ZA 1JCXA 1PS9A 1OFRA 2PRLA 2XFWA 1YDVA 1OF8A 4XBKA 1YADA 3N9SA 4JTFA 1TV7A 1DVJA 2VEPA 2E09A 3LLDA 5LGZA 3IIXA 1W3NA 1TREA 3N34A 3VNDA 4N9CA 2E1DA 2FPVA 3KHJA 1DKWA 2DZUA 5L6UA 3FJLA 4O0KA 3CIWA 5I3FA 3I65A 4K8EA 4K7YA 1X7FA 1VPXA 1SO5A 2C13A 3CEUA 4JN6A 5HUPA 2GQAA 3HIJA 3BW3A 3L5LA 4FHAA 3EB2A 5LKYA 1O60A 3C4UA 4Y9AA 2JGQA 1EIXA 3B03A 1YPFA 1ADOA 1TPUA 2WQPA 4LS0A 2VC6A 1WOBA 5HJLA 4XKYB 5HWNA 3LCFA 3CU2A 1OX4A 4IUOA 2VFIA 3SI9A 1KLZA 3QF0A 1PVNA 1DL3A 4IMDA 2VFGA 4ONVA 3G1FA 4Y8FA 3TCEA 2TSYA 1CW2A 2ZTJA 3LGEA 1P0NA 5I3KA 3ABQA 3M44A 4HPJA 4JXCA 2WO5A 2QCDB 3BG9A 1KLYA 2YXGA 1SZFA 4WOQA 1ZENA 1WQ5A 3W22A 3GNDA 1BEUA 3A24A 3G1YA 1TYGA 4JDYA 1QFEA 3L0GA 3SZ8A 4ZL1A 3P84A 3W7MA 4QIUA 3E49A 3G3MA 4K37A 4XTIA 2BZNA 2WKJA 3W6YA 2GVLA 1GTEA 4RX0A 4NJGA 2GJLA 4K38A 4GWEA 1NAL1 4Y96A 1G7VA 1AG1O 4LVBA 3M5VA 3ZR4A 3OHIA 2QJGA 2ZYFA 4NVTA 5K9XA 2CZFA 4LS1A 4UTTA 2Y89A 2RDWA 1OYAA 3LV6A 2ZA1A 3UYCA 2VFHA 1FWSA 2YGYA 2X1UA 4O14A 1TPVA 2ZZ4A 1FDZA 5FI8A 1OG0A 3TW7A 4CCEA 3UWUA 4UNLA 3G18A 4IX0A 4GJ1A 1QPRA 3UWVA 3T78A 3L65A 1QOPA 4AVFA 3HMJG 5AHEA 3T7VA 3PULA 1YYAA 2J88A 3DKLA 5D37A 2DZXA 1ZY9A 2BLEA 3A5VA 4CLMA 4RLIA 5BRBA 4M19A 5KTLA 4RJEA 4HIBA 1P5BA 3IGXA 3MHFA 4OU1A 4LVDA 4MJZA 3QPYA 3QQ1A 2BSLA 2BTMA 2B4GA 1TPH1 3RK8A 1RZMA 3UY8A 3QW3A 2ZZ2A 3UXAA 4CNOA 1SO4A 5DCDA 3M1ZA 4KWWA 5T26A 2TRSA 3WK3A 2NXGA 3STFA 1RQEA 2ABAA 3TK7A 4N2YA 4MZYA 1NF7A 2E5CA 1YTKA 1T96A 5DBUA 5CPNA 2ZZ3A 4LV9A 2CLOA 1ME9A 3W85A 4GFSA 3EXSA 1FCBA 3FLUA 1ME8A 5D33A 5CPOA 1OFOA 3W2KA 3DHDA 5HQEA 1L2UA 3BG3A 3TUUA 4NJKA 4IGHA 2BX7A 4MY1A 1IF2A 3H55A 5ABTA 1LRNA 1ZAIA 3WK0A 3LCIA 1OX4B 1W5NA 3L0KA 5G2WA 5CG7A 3SECA 3KVJA 2YFOA 4ADTA 2TPSA 2R8WA 4AWUA 3QMTA 5AC8A 1TTQA 1F05A 2UV8G 5DXYA 3P5YA 3MI3A 4OGZA 2JBMA 3UNDA 5KINA 5J5RA 4LC6A 1DJQA 4TIMA 3PM6A 5AYYA 3STCA 4JTTA 2V30A 2VENA 2JKEA 4JY9A 4PA8A 1FXQA 4DO5A 1V7YA 3NQFA 1L6SA 2YSWA 1TV5A 4IMFA 2Y7GA 1NVMA 1XKYA 3L5MA 1XM3A 2NUXA 4FNRA 4DPPA 3HGSA 4HHPA 1VGAA 4N9DA 3DU0A 2ATSA 2YFNA 1ZALA 4AHOA 3L9CA 5AFDA 1KTNA 3W7HA 2DP3A 3SY5A 2B0MA 3ABOA 3U6WA 1NSJA 4WY0F 1ZAJA 4CQAA 3W2JA 1FWRA 3BPWA 4JGDA 2QUVA 5TBOA 1GVOA 1R2RA 3W72A 2CZDA 2ZRXA 4NUWA 5BOOA 2CZEA 1I2PA 3LBMA 4H4IA 4IJBA 4EOUA 2BXVA 1JULA 3EXTA 5FF3A 5K9DA 4EF9A 2Y61A 5C55A 3CIXA 1CX9A 4JS3A 3W1XA 2Q3OA 3IVSA 1IXQA 2QAFA 3UQNA 4MJMA 1K3UA 3HPZA 1VCGA 4YLWA 4GUIA 4RXFA 5DLCA 1H50A 2QAPA 3PWAA 1HO1A 4WZHA 4BF9A 1M6JA 4BFAA 3STEA 2PURA 3W9ZA 4MLRA 3E0IA 1I2NA 3CTLA 3JS3A 4HSOA 1MEHA 3NZRA 2A7RA 1FWNA 2ZCGA 4RKAA 3A9IA 3NDOA 3PBUA 1VC4A 1F73A 4AF0A 1NF0A 1B3OA 3UXDA 2A1YA 3MUXA 4X22A 5FEZA 4MFEA 1OK6A 4MYAA 3PG9A 3UZJA 1EWEA 4A2RA 4ZVJA 3NA8A 4MOZA 2YZRA 3BLFA 1H7OA 4DPQA 3M16A 4LU0A 1YXDA 4YCOA 3ABSA 2ZZ6A 1OX6A 1SW0A 4FX8A 4UIOA 1YXYA 4ADUA 1HTIA 3CLMA 3OVRA 3PAJA 4ICNA 1PHWA 5EY5A 3STGA 3PBWA 1J5TA 3B0PA 4IWWA 4LS2A 3W7EA 4B5NA 4BWLA 1K03A 5G2HA 3IIOA 3LCWA 1ICSA 1VYSX 1G6CA 3GKAA 4PL1A 5FEXA 3LB0A 3G8EA 5C54A 3BGJA 1I45A 5CGQA 1JRBA 4JYDA 3LHYA 3GX9A 1QNVA 3W76A 5D02A 3NQ6A 1H7XA 2B7PA 4XWUA 4Y6GA 4BR1A 4LUIA 4UMBA 3W2NA 2X1SA 3LTSA 4AXKA 5F2LA 4JICA 4RXGA 2G97A 2ZRWA 2B7NA 2WSQA 2GQ8A 2JK2A 2ZRYA 4FNTA 1D3GA 5U4NA 3IEBA 3QYQA 4GNJA 3MW7A 4NNAA 6ALDA 2GVGA 1XCFA 3HG3A 4N6EA 1U5JA 4MZ8A 2CU0A 5J5DA 4OBTA 1KTBA 3G0SA 5CSSA 1T99A 2FJKA 1IIGA 3P5ZA 1QPNA 3QH2A 3G24A 2Z6JA 5HINA 3EX4A 1FDYA 1B4KA 3TAOA 2DZVA 4DEFA 2XN1A 3DFQA 4C1LA 4MKNA 6TIMA 1GVFA 1KV8A 3Q94A 3C52A 3B8DA 2NXHA 5KZMA 4IXXA 1GQNA 3O15A 2CLHA 2QUTA 4HNNA 1TSIA 2E6DA 3M43A 4N4PA 3W1NA 4JTIA 3O1NA 3L66A 3M5XA 5GVJA 3QFEA 4R7JA 5K3VA 1TPEA 2W6RA 2CLEA 4NU7A 1SU5A 1VLWA 2EKCA 2ZRUA 4JYEA 5F1VA 4ADSA 1ZHAA 1L6YA 3O05A 1HFBA 4FNSA 5K4ZA 3W1LA 3C56A 2P0OA 1ONRA 3QRHA 4YMZA 3Q2DA 1P0KA 3GAYA 4RR4A 3W75A 3UD6A 5FESA 3P61A 4AAJA 2Y88A 3LERA 1F2JA 3G22A 2NXIA 1W56A 1RV8A 4EF8A 4Z08A 2QCLA 4ZQRA 3NQ8A 3EKZA 3VKJA 2ISSA 2NX9A 1JJKA 2Q3RA 3TH6A 1ZCOA 1VR6A 1K8YA 3QEZA 5EPDA 3TC7A 4DQWA 4MVAA 1Q6OA 4E38A 5K7JA 1LBLA 3W7NA 3NPUA 2A0NA 3MYOA 3JRKA 3TE9A 1LDCA 3FIGA 2ZBTA 4NXSA 3NR0A 3SGZA 2V9DA 3HPXA 4HPXA 4GXMA 3D0CA 5AC7A 3GDTA 4MY8A 3DAQA 5K4XA 3MHUA 3TXZA 2DZTA 1GTHA 3KRSA 1ZAHA 2NX3A 1XUUA 4JDBA 5D04C 2RHGA 3RF9A 1THFD 3CEPA 1UASA 1H62A 3LI0A 3BV4A 3PBVA 2J24A 3SJ3A 3R89A 4FXRA 1QR7A 2NWRA 3PVFA 2OCZA 2Q8LA 3A23A 1C8VA 3N3MA 3QMRA 2NWSA 5D2YA 4O4VA 3SGUA 1O5KA 5I3JA 3PR2A 1H7NA 4O1CA 3E96A 3M41A 4UNKA 8TIMA 4QNWA 5AYZA 2OZ0A 1M5WA 2CLLA 3IVUA 2Z0IA 3S1VA 1T0OA 4PL2A 3UWZA 2TMDA 4L4MA 3VE9A 1TV8A 5E0KA 2H6RA 5D2TA 2CLMA 5LHEA 1VCFA 1YLVA 3HG2A 1EUAA 1VZWA 4UMCA 4PCFA 2X30A 4UC5A 3TDFA 3GR7A 2ZA2A 3EWBX 3B0VC 3OVPA 3PF3A 2NUWA 1BKSA 3LRLA 3M7WA 5E1QA 1R30A 1A53A 2AGKA 1XBVA 4H6KA 4R34A 5LSMA 4PC8A 5CSRA 3YPIA 4IMGA 3S1UA 4O13A 3IIVA 3W86A 4UFKA 1WOAA 3MP3A 4Y90A 2RFGA 5EMUA 1W3TA 3GDLA 3PB0A 1VLIA 3HO8A 1VJIA 4UXDA 3A22A 5AOUA 4FF7A 4QNEA 1DQWA 2Q8ZA 4BI5A 3TIMA 3BVJA 3TV8A 3LCXA 4YWIA 3PC0A 4NNBA 1WBHA 5LNSA 5K9CA 1V5XA 3O07A 1KFJA 1TPC1 3I6RA 1AW1A 3NYZA 1JQVA 3NNTA 3W7KA 5I3IA 1DV7A 4HNVA 2JKPA 3QW4B 4FNPA 4O53A 3OG3A 1GG0A 4UTWC 4RCXA 4UR8A 4XZ9A 3W87A 4HNUA 2EPHA 1H61A 1JCJA 3P8JA 3W74A 1JUBA 1OJXA 3DZ1A 1F7BA 1VYRA 1SZEA 2HS6A 4FIRA 5CZTA 4DF2A 3EXRA 3SR7A 3WJZA 2ZRVA 4HN4A 4BI7A 3EX2A 3QC3A 2DU2A 1F6PA 1JR1A 4I7VA 1DQXA 3RLUA 1GVQA 2YCEA 1YPIA 2Y7FA 4M5PA 1XL9A 1EEPA 1XBYA 2YYUA 1IIHA 3H54A 2Y70A 3V75A 4JYFA 1EP3A 3UPWA 1GVRA 4AHQA 2ZZ1A 2TYSA 4FX7A 2PRHA 4U4MA 1XUZA 2C15A 3E9AA 1XBZA 1KA9F 3W1MA 3RFAA 1SO3A 2V2DA 4O17A 2QCGA 3FEMA 1TQJA 1TTPA 4ZQPA 2ZDRA 2WNQA 1UUMA 3PB2A 2V2HA 2R94A 2W0UA 4LT9A 3LOTA 2J27A 2WJZA 4XUGA 1S3HA 3QZEA 3KOFA 4FX6M 4A22A 4ZMGA 4JTSA 2A5HA 4GRSA 3G1VA 2ABBA 1WA3A 2FPTA 3WJSA 4BK9A 3Q37A 1W3IA 1SFJA 3QJAA 2G5WA 4I7UA 5HR6A 2C6QA 3GXPA 3GB6A 2HMCA 4P61A 5IM51 3NAVA 3PUEA 2OJPA 4LC8A 1C29A 1K7EA 3I7QA 3DHFA 3NL5A 4GC4A 4N9EA 5EL1A 1Q6RA 3BARA 3DENA 4W9TA 1LCOA 5TIMA 4NXKA 2P1FA 3M9YA 1EX5A 5D38A 1KM2A 3C2OA 3QPZA 5D2VA 4LTSA 5HMSA 4UCGA 1XBXA 2CWNA 2QF7A 5F4XA 2DZPA 4S2CA 4RK8A 5BMXA 1WBJA 4IMCA 5BMWA 2A6LA 4NX5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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