2VX6A

Cellvibrio japonicus mannanase cjman26c gal1man4-bound form
Total Genus 149
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
149
sequence length
367
structure length
367
Chain Sequence
LPALIDTQATAETRALYRNLAKLRYKHLLFGHEDSLAYGVHWEGDMDRSDVRDVTGANPAVYGWELGGLELGHTANLDAVNFEKMQHWIKAGYSRGGVITISWHVFNPVSGGNSWDKTPAVHELIPGGARHATLKAYLDTFVAFNEGLADVDAQGNKHYPPIIFRPWHEHNGDWFWWGKGHASEQDYIALWRFTVHYLRDEKKLRNLIYAYSPDRSRIDMANFEAGYLYGYPGDAYVDIIGLDNYWDVGHEANTASADEQKAALTASLKQLVQIARSKGKIAALTETGNNRLTIDNFWTERLLGPISADADASEIAYVMVWRNANLAREKSEQFFAPFPGQATADDFKRFYQSEVVLFEDELPPLYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Cellvibrio japonicus
publication title The Cellvibrio Japonicus Mannanase Cjman26C Displays a Unique Exo-Mode of Action that is Conferred by Subtle Changes to the Distal Region of the Active Site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELLVIBRIO JAPONICUS MANNANASE CJMAN26C
total genus 149
structure length 367
sequence length 367
ec nomenclature ec 3.2.1.-:
pdb deposition date 2008-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2vx6A00
4PSPA 1KR0A 4TX6A 3ARUA 3W26A 3VX1A 4ZXLA 1SMDA 4JKKA 1NWUA 4J3VA 4UQEA 1JNDA 1Q6DA 3SEPA 5BROA 4W7UA 1VAHA 1Z32X 2JFEX 1GQLA 1QNQA 1FH9A 3BCFA 4A3YA 3BAIA 2PF0A 3U7VA 3VMOA 2BFGA 5FL1A 2DSVA 4JCLA 4CU7A 1E43A 3WD1A 1KBKA 1VEOA 1BYCA 2WCAA 3T2PA 5HXMA 1H09A 4NRRA 1BYAA 3VIMA 1HX0A 1EXPA 1V6WA 2OYMA 5CSUA 4CD7A 5JBFA 4J27A 3AFBA 1HVQA 4ACYA 2FDMA 3VIOA 4TVUA 2JIWA 4FLSA 1YHTA 1V6UA 4UFMA 4UOQA 3BXWA 9CGTA 2WWCA 4MB5A 5CG0A 5BXPA 4V27A 2W67A 1Q6FA 5E0CA 1VEPA 3VIJA 2PI6A 3HU7A 4J28A 1PX4A 4D6IA 1GOMA 4UOJA 4GINA 2XSAA 5M5DA 1LJYA 1UKQA 4BF7A 3VD9A 1J18A 1JFXA 2XM2A 4OIFA 1MW3A 1KXTA 1QNSA 3WF4A 2WKLA 4W88A 5CQ1A 4ACZA 1QBBA 3W53A 4GO9A 2F8QA 2OYKA 2Y4SA 2JIEA 1J10A 4TTUA 2BHUA 1W3HA 3WQ4A 2VZTA 4AXNA 2CYGA 2BVTA 2YJQA 7TAAA 2WMHA 5BXRA 2VCBA 2FHCA 1QVBA 1E1EA 1C92A 4QLJA 5LA0A 3NDZA 3UESA 2J8GA 2O9RA 4IPLA 3ARQA 4GQRA 3ECQA 3WQ8A 4XUYA 2VX6A 3TA9A 3GBDA 2O9PA 2HISA 1WNOA 3RO8A 1J9YA 1KGWA 3QR3A 1KGUA 1B3VA 1C7SA 3CIVA 1WZMA 3RM9A 5I0DA 1JZ8A 5BRQA 3L4XA 2E9LA 1A3HA 3B9AA 1R8LA 2ZXAA 1UWSA 2A3EA 2ZUWA 4ZFMA 1JYXA 1V3JA 1TFVA 2QF8A 1U30A 3UCQA 3ARXA 4JCMA 1CNVA 3W28A 2E8ZA 4Q7NA 2NSXA 4W8AA 3SCPA 4AD2A 1W2PA 2OWWA 2VRKA 2DEPA 3VD4A 4EKJA 2W91A 4D6DA 2E9MA 4AIUA 2XWEA 2DH2A 4AY1A 1TCMA 1CGWA 3A4WA 3ARPA 1JDAA 1B90A 2VO5A 3VINA 3AMLA 3GM8A 3UERA 4BQ3A 2WK2A 1F4HA 1ZBCA 2VR4A 2FHBA 4L4OA 1R85A 4KRUA 5JUVA 3ARVA 4EAMA 3VKKA 1KWGA 1VJSA 4HZ7A 2YKKA 5GNYA 2J7FA 2UY3A 2V3EA 1MYRA 1PX3A 4KH2A 2G3NA 3BAYA 4B3LA 1JI2A 2XVGA 5D9PA 3AXXA 1E9LA 2D3LA 2W62A 1BFNA 2ZX6A 3SIMA 5IFTA 5CLWA 4IISA 4XZBA 5ABEA 2D2OA 1G94A 4W93A 2VVNA 3RDKA 2WHMA 2WXDM 3O2LA 1JGIA 3SCQA 4CU8A 1C91A 1NWTA 1GOOA 5HNNA 3AIVA 5A6KA 3SUSA 3SUWA 3ZQ9A 4N42A 2J7BA 5A94A 4CCEA 1IV8A 2GJXA 3ZT6A 4CD4A 1E4LA 3PZIA 1UD3A 2XHYA 1I1WA 3AISA 4W5UA 3CHCA 3TTOA 1CXLA 2J7CA 3FHQA 3W37A 4J3WA 2V38A 1GQIA 1XV8A 2CBJA 3OGSA 4H8UA 4DUVA 1AQHA 1ZBVA 3PZNA 5CPSA 3THCA 1KFWA 3IJ7A 2JALA 1KGXA 1IZJA 2UWFA 1CXIA 1JD7A 3KWXA 4CD6A 1GHSA 3TONA 1BYBA 2ZXBA 3LPFA 5BWFA 3OZPA 1UA7A 4Z2HA 1QNRA 2BNJA 1B3XA 1W32A 1V0MA 4QLKA 3ZM8A 2Q8XA 1J0JA 1NP0A 3ZR5A 3BH4A 1GHRA 2XG9A 4ZE5A 1QBAA 3AIEA 1MQQA 3MKKA 1GOQA 1QI5A 1V3IA 3CTTA 4IUGA 1W3LA 3KL0A 2J75A 3B9EA 2BV9A 4JFSA 2WBGA 1J0HA 3I3DA 5BYWA 3CUFA 1JXJA 3G6LA 4WKHA 4KMQA 1Y7VA 3PZ9A 3HMCA 3WUBA 3IJ8A 2PBGA 1GUVA 1XSIA 3CZEA 3BMVA 3U57A 3WD4A 2VZVA 4RE2A 4MB4A 3PTKA 2D3NA 3AZTA 3VMNA 1W9VA 4C7FA 4QCFA 5HPOA 1J12A 3WENA 4N0RA 3GDBA 1XH2A 3NJ3A 2C8NA 1OT2A 2OSWA 2D1ZA 5ABGA 3WEMA 4UFKA 1EHNA 3WQ5A 1PJ9A 3WQWA 4V28A 2BY1A 3A47A 1DP0A 3W38A 1LLOA 1JZ4A 1NP2A 4W87A 2WHJA 3ARTA 1UKPA 1G01A 1W9BM 3M07A 1R7AA 3U5UA 4UFHA 1FP8A 4PMYA 1SMAA 1DWIM 5E9AA 3OLEA 1UH3A 8A3HA 1FH7A 1K6AA 2WMGA 3M6DA 2ZICA 2W66A 3AQUA 3ZT5A 3F4VA 1L0PA 4M56A 1V0LA 4BA0A 1OIMA 4W89A 4Z2LA 2WW5A 1MXGA 2VUYA 3PZTA 1KXQA 4QDMA 2WVTA 2WKGA 5IHRA 1SR0A 2X8RA 4M82A 1KWKA 2D23A 3ZIZA 3GTNA 1VIWA 3ARRA 1UR2A 3DECA 5IXEA 4AZ6A 5CJ5A 5FL0A 5I5RA 3CZJA 1AQMA 1JZ2A 2JEPA 1V6XA 2WHLA 2WBKA 2RGMA 2WZHA 4ZE4A 1MW0A 4QLLA 1UWIA 4PN2A 1VFOA 5GNXA 1C93A 4DM2A 4UQCA 2GK1B 5GQBA 2PC8A 5HBFA 3SURA 3VGGA 2A3AA 4QFUA 4CKQA 5A8PA 1J0ZA 1JI1A 1VFFA 4HZ8A 2WMFA 3KL3A 5BXSA 3WDJA 2JF6A 1C90A 4OZOA 2BXZA 1HKIA 1W2VA 1TZ7A 4PBGA 3BLPX 4MAVA 1AMYA 4Q22A 4AISA 4XB3A 3OA5A 4TVDA 3MO4A 1D2KA 3A6OA 4DWSB 1QI2A 4XX6A 5IHSA 3J7HA 3QOMA 1GONA 1TVNA 3MU7A 1CXFA 3AS0A 3EDKA 3CZGA 4KGJA 1UUQA 4JHZA 4FF5A 3WNMA 1JZ7A 2WVVB 2YIHA 2UY2A 4LPCA 5A6MA 1XH1A 4P7OA 1K9EA 1W9PA 1MW1A 5A6AA 2ZXDA 3L4YA 4CN6A 4P7NA 3EDFA 2DIEA 3VUPA 2DIJA 5CZKA 2CXGA 2VX7A 4DWSD 2ZUNA 3BC9A 4PMZA 2YBUA 3PZGA 3TP4A 3ZOAA 3WH7A 3PZUA 1O6IA 1J0YA 4H2CA 2WMIB 4QAWA 1P6WA 4HMCA 2DSKA 3M46A 2C7FA 1HJQA 1BSIA 3FN9A 4DUXA 2E3ZA 1GQKA 2VR5A 4H8VA 1UD5A 3VGDA 1QW8A 2WPGA 1TMQA 4UFJA 3MS8A 4HU8A 3TOPA 1KCLA 1NQ6A 4BQ4A 3NYDA 1V02A 1WO2A 3RJXA 1CPUA 1LG2A 3SUUA 2QMKA 1KB3A 1QI3A 3KZSA 3GXDA 5A69A 1E6RA 1CXHA 2OWXA 1I75A 1KQYA 3AOFA 4GXPA 4J3TA 1B3ZA 3L4TA 4HPHA 4V2XA 2J62A 1HJUA 1J0KA 2XWDA 3TTYA 1H11A 4Z2GA 2PWHA 2D22A 3BAJA 3K8KA 4AC1X 4AZIA 2G41A 1OIFA 1VENA 3NDYA 3AHTA 3I3BA 4BZYA 3AHVA 3WH5A 1QHPA 1DHKA 3GYCA 3IK2A 5CPQA 4RE3A 4OUEA 1H1NA 2VVSA 2VURA 5DFAA 2VX5A 1QHZA 2EPOA 1GNXA 1WDSA 4AEFA 2Y5EA 2EQDA 3WDHA 1HF6A 3L2LA 4AW7A 5KEZA 1LF1A 2YOCA 1OGSA 1WKYA 4MTVA 4X0NA 4KWUA 4UFIA 4D6FA 1J0IA 2NT1A 1NOWA 4JKLA 2WC7A 3VPLA 1HIZA 2WYSA 5CPTA 1XCXA 2CHOA 3MUIA 3FNDA 2BS9A 6TAAA 4C7GA 4RE4A 3SCOA 1E3XA 5FD0A 3S2CA 3II1A 3THDA 4UNIA 1Q4NX 4GIAA 1H2JA 3CZ8A 1JAKA 3VGHA 4ATDA 3CBWA 4U3AA 3ZO9A 3CHDA 4XZWA 1OGBA 4E2OA 3AIRA 1I1XA 4Z2IA 3WBEA 4JKMA 4AYSA 5HDRA 3L4UA 1BG9A 1EH9A 4DWSC 1E5NA 1FHDA 1Q6CA 3N15A 4UTFA 1XYZA 4UQAA 1BHGA 2QMJA 4GZEA 1W9XA 2ZUVA 3BCDA 4GI9A 4AIOA 4JL2A 1LWJA 4GPNA 4PTVA 1E56A 5DT7A 1JZ5A 1VFUA 1UR4A 4Y7EA 2YL5A 2DT2A 3CUIA 5ECUA 4H41A 2CESA 5A6LA 3ARZA 1C3FA 1TUXA 1DWJM 4GZIA 4D6CA 2VX4A 4DWSA 1UKTA 2CBVA 1B2YA 3CH9A 5E70A 4AD5A 5IFPA 3VGBA 2OWCA 3N1AA 3OIHA 1UKSA 4LX4A 4PMDA 1RD6A 4MJ2A 2WVVA 3VD5A 5I78A 5LA1A 5JIPA 3PZVA 2CETA 2CNCA 4URIA 1EOMA 5TD4A 3CZLA 2D0HA 3U5YA 4MB3A 1MWOA 4MDPA 1KXHA 1TA3A 2VQTA 3WQVA 3K8LA 2YLAA 3KEHA 4U5IA 3MMDA 3AJ7A 4J3UA 5I23A 4PTMA 3IANA 5A8OA 1H0IA 4B15A 2A3BA 1Q6GA 3W27A 1R86A 1CECA 1E5JA 3PTMA 5BRPA 4E8CA 5AY7A 3BMWA 1UZ4A 1OD8A 5EB8A 3EDEA 2GFTA 1GOWA 2YL9A 2RGLA 3GBEA 3F5LA 4B9ZA 4AZGA 1OCQA 4PMVA 1YQ2A 1E4IA 5I3DA 4ATWA 2WC4A 4E8DA 1B3YA 5ABFB 1RH9A 1GPFA 1KBBA 4GQQA 3SCTA 4D6JA 4W8BA 1QPKA 4P8XA 1XYFA 5I77A 1KR1A 1CXEA 1ZBKA 1E71M 3QOKA 2V5DA 3UG4A 3DYPA 2HVMA 2PWGA 2Y2WA 2ZOXA 3VO0A 1GW1A 4KGLA 1JL8A 1NOFA 1JF5A 4BCEA 5I2UA 4UR9A 5GPRA 1XCWA 5A6SA 5E0FA 4P7QA 1C8XA 1FH8A 3MUAA 3OLDA 3VIGA 4EE9A 4WSKA 3UR8A 3N11A 1WAWA 2BY3A 4ML4A 2VMFA 2ZIDA 4L4PA 1EQCA 2ZX7A 3WEOA 2X0YA 1H3GA 5A1AA 2YDSA 2X2YA 3W6LA 3ARWA 3SCWA 1CEOA 1WPCA 2VJXA 1K9TA 1PIGA 2X05A 3AMGA 2YLLA 1CGXA 1GOKA 3WFLA 2CKSA 2ZUUA 1HL8A 5I24A 1MQRA 1LG1A 1OM0A 2GDUA 3G6MA 3WNNA 4PMXA 2IXVA 3CMGA 4S3JA 4XV0A 3WD3A 1ITXA 4P8VA 4WKFA 3E1F1 2W4XA 1G0CA 4X9YA 3AS3A 1W1VA 1OB0A 1E4NA 1BGAA 1G1YA 1PEZA 1TR1A 1TG7A 3RCNA 3U7BA 4AD4A 5AYIA 1OSEA 1E4MM 4ZENA 3W29A 3M7SA 4M24A 4OBSA 1CWYA 3UETA 2J25A 1M04A 1PPIA 5LYRA 1IZKA 1W9DM 3SCVA 3GZAA 2AOSA 1GORA 3RMEA 5DO8A 4WLCA 4LGXA 1JYNA 1V6YA 4LYRA 2DSWA 3WKZA 1WZKA 1L8NA 3AXIA 2PWFA 3RPMA 3VD3A 1JIBA 2FGLA 3F5JA 2BHYA 1EQPA 4U5KA 1QNPA 1EO5A 3D3AA 4NRSA 2DT1A 4H8HA 3VIPA 3A3HA 4HP5A 1ZU8A 2VCAA 2WSPA 3HN3A 4M8UA 3W4RA 3AROA 5A6JA 3KL5A 1QHOA 3VGEA 4A4AA 4HU0A 2UY5A 1JZ6A 2VRJA 2ZUMA 3POCA 3SCSA 2G3IA 1QNOA 2VOTA 1CENA 1VRXA 3GH7A 2WC3A 1E3ZA 6A3HA 5I79A 3EBVA 3WF3A 4PMOA 4NI3A 1E55A 3W24A 2CPUA 2FHFA 2A3CA 4B9YA 4MNJA 2WCGA 1F4AA 1ESWA 3K4DA 3CHFA 4F9DA 2G4FA 2E9BA 4X0VA 5FOOA 2C0HA 1FA2A 4D71A 1CXKA 1S46A 3QGVA 1GZJA 3VNYA 3OZOA 3NSMA 1GVYA 1GVIA 3GXIA 3DYMA 4GO8A 1JYWA 4E4PA 1BYDA 5D8WA 3T2OA 2D20A 3AIWA 2EPLX 4D1JA 1H49A 2ZX5A 4TXEA 2GJPA 3ZJKA 1UZ1A 3CMJA 4UQDA 2J79A 4H7VA 2CHNA 3UR7A 1AQ0A 5ABFA 1KCKA 2OSXA 1QI4A 4D6EA 3FY1A 1HT6A 4D1IA 4M81A 3BSHA 1JG9A 2W92A 3GH5A 1CDGA 1MFUA 2VZSA 1DTUA 3ALGA 2TAAA 2YDQA 4BS0A 4CU6A 4CCCA 4FMVA 1BVZA 4F79A 1W3JA 2G8ZA 2WLZA 4UFLA 5BXTA 1JDCA 3W0KA 3B8SA 3DHUA 1D3CA 2IUZA 1CBGA 5CSYA 4ACZB 1EIBA 2DDXA 7A3HA 3FXYA 1MXDA 1W3KA 3UG3A 3L4VA 3CPUA 3N17A 5AC4A 2WANA 3VIHA 4CGTA 1XH0A 3FHAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4PSP A;  1KR0 A;  4TX6 A;  3ARU A;  3W26 A;  3VX1 A;  4ZXL A;  1SMD A;  4JKK A;  1NWU A;  4J3V A;  4UQE A;  1JND A;  1Q6D A;  3SEP A;  5BRO A;  4W7U A;  1VAH A;  1Z32 X;  2JFE X;  1GQL A;  1QNQ A;  1FH9 A;  3BCF A;  4A3Y A;  3BAI A;  2PF0 A;  3U7V A;  3VMO A;  2BFG A;  5FL1 A;  2DSV A;  4JCL A;  4CU7 A;  1E43 A;  3WD1 A;  1KBK A;  1VEO A;  1BYC A;  2WCA A;  3T2P A;  5HXM A;  1H09 A;  4NRR A;  1BYA A;  3VIM A;  1HX0 A;  1EXP A;  1V6W A;  2OYM A;  5CSU A;  4CD7 A;  5JBF A;  4J27 A;  3AFB A;  1HVQ A;  4ACY A;  2FDM A;  3VIO A;  4TVU A;  2JIW A;  4FLS A;  1YHT A;  1V6U A;  4UFM A;  4UOQ A;  3BXW A;  9CGT A;  2WWC A;  4MB5 A;  5CG0 A;  5BXP A;  4V27 A;  2W67 A;  1Q6F A;  5E0C A;  1VEP A;  3VIJ A;  2PI6 A;  3HU7 A;  4J28 A;  1PX4 A;  4D6I A;  1GOM A;  4UOJ A;  4GIN A;  2XSA A;  5M5D A;  1LJY A;  1UKQ A;  4BF7 A;  3VD9 A;  1J18 A;  1JFX A;  2XM2 A;  4OIF A;  1MW3 A;  1KXT A;  1QNS A;  3WF4 A;  2WKL A;  4W88 A;  5CQ1 A;  4ACZ A;  1QBB A;  3W53 A;  4GO9 A;  2F8Q A;  2OYK A;  2Y4S A;  2JIE A;  1J10 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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