1MEWA

Inosine monophosphate dehydrogenase (impdh) from tritrichomonas foetus with xmp and nad bound
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
482
structure length
344
Chain Sequence
AKYYNEPCHTFNEYLLIPGLSTVDCIPSNVNLSTPLVKFQKGQQSEINLKIPLVSAIMQSVSGEKMAIALAREGGISFIFGSQSIESQAAMVHAVKNFKAHNELVDSQKRYLVGAGINTRDFRERVPALVEAGADVLCIDSSDGFSEWQKITIGWIREKYGDKVKVGAGNIVDGEGFRYLADAGADFIKIGIGGGSREQKGIGRGQATAVIDVVAERNKYFEETGIYIPVCSDGGIVYDYHMTLALAMGADFIMLGRYFARFEESPTRKVTINGSVMKEYWGEGSSRARNWEGVDSYVPYAGKLKDNVEASLNKVKSTMCNCGALTIPQLQSKAKITLVSSVSI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Tritrichomonas foetus Inosine Monophosphate Dehydrogenase in Complex with Substrate, Cofactor and Analogs: A Structural Basis for the Random-in Ordered-out Kinetic Mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Tritrichomonas foetus
total genus 111
structure length 344
sequence length 482
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2002-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1mewA00
4I7VA 2VC6A 5DCDA 1G69A 1KW1A 1OK4A 1FWTA 3NQGA 1QPNA 2ISVA 1THFD 2ABAA 3TV8A 2C15A 4NJGA 3FEMA 4CQ9A 2RDUA 2WSYA 3E96A 1LROA 3VKJA 4O15A 4ZQCA 1KBJA 3E49A 3OVRA 3GYEA 2GVGA 1KM5A 2VENA 1QOQA 2YDAA 5KITA 3LXBA 3P74A 4GXMA 3MHFA 5C55A 4M19A 4DBEA 4KWVA 4P2VA 3SECA 1UASA 2ISWA 4HNVA 5LNWA 1TB3A 2RDTA 1JCXA 5BOOA 1CW2A 2CU0A 4FO4A 3MI2A 3R8RA 1DQXA 1VRDA 1V5XA 4NJKA 1GVOA 3H53A 4QNEA 5F4WA 1JRCA 4RR4A 1D9EA 3MYOA 1TYGA 3IEBA 3M9YA 1LOQA 3M44A 4NX0A 1MXSA 3L66A 4NJJA 2QAFA 4EF9A 1FCBA 1JULA 3QF0A 3W76A 2YW3A 2QCGA 1PV8A 1FUYA 4LV4A 3G0XA 3P82A 1AMKA 4WY0F 3ZR4A 4JTHA 4RK8A 1OJXA 1Q6RA 5D37A 3TMQA 4TMCA 4XZ9A 4E2DA 3BPWA 2E6YA 4TX9A 4X9SA 1RV8A 1ZHAA 3FKKA 1OX5A 2ZRUA 4KFPA 4FNQA 4JDYA 4H3DA 4K8HA 4MY1A 3GNNA 3W1TA 4AAJA 3W84A 2NV1A 1XBYA 3GZ3A 3LRKA 3NO5A 3Q37A 3TK7A 3UWUA 2VFGA 1T0OA 2WQPA 3NYZA 1VHNA 2E09A 3W2MA 4L4LA 5CZSA 3DFQA 2J9XA 4X2RA 2FPTA 3HG3A 2Q3RA 5HINA 1TSIA 1WBHA 4KWWA 3NQ7A 5I3HA 3W7IA 4NU7A 4AHQA 3L65A 3CEUA 3TROA 3W1NA 1VC4A 2OMAA 1NAL1 1TCDA 2WKJA 1UB3A 2C13A 4BI5A 2F84A 1UUOA 4I7WA 1KV5A 2ZTJA 5K4ZA 1KM2A 1MEHA 1AW2A 3HB9A 4GNJA 4JICA 2A7NA 3T4CA 3EXRA 1OF8A 1GVSA 2Q3OA 4BR1A 1K7FA 3L21A 4ML9A 4U28A 4OE7A 5AN7A 4LRTA 1BTMA 1PIIA 4L4MA 1VS1A 2P1FA 3B03A 4XWUA 4HPXA 3QRHA 3PB2A 2R8WA 3EKLA 5HJLA 4CNOA 1VYRA 5G1TA 1H5YA 4YXGA 1A5AA 1Q6QA 1JCJA 4IMCA 3P80A 3MO7A 4HHPA 1HFBA 4RLIA 3PUDA 1OYBA 1Z48A 1WBJA 4GUFA 4GUJA 3KXQA 5FF4A 5KINA 3R5EA 4O12A 1M7PA 1W5MA 5LZLA 3W07A 3I68A 4LS1A 6ALDA 2DORA 3QPYA 3HIJA 3SGZA 3B0PA 5EMUA 4WY0B 3I7QA 1TPUA 1P1XA 3DFTA 2VOMA 2B0MA 4XQ6A 3T44A 1H7XA 2XFWA 2Y61A 3NQVA 1PHQA 4LOCA 2ZRZA 4UTTA 2ZTKA 3SY5A 1J4EA 3PSVA 2NXHA 3LCWA 3LTYA 4N02A 1HTIA 1O94A 4TO8A 4Z1BA 2D73A 4MFDA 4UR8A 4J9JA 1QMLA 1DKWA 1FWWA 1RQEA 3TW7A 3W7RA 3C2OA 3NQFA 4GC4A 4YLWA 3LCIA 4FNPA 4UMCA 1ZNNA 3NPXA 2BZNA 4K7YA 4C1KA 3TC7A 1C8VA 4AHPA 5G4WA 2V30A 4N9CA 2Y89A 3NVTA 3M16A 3W7CA 2NZLA 5EPDA 2Y7EA 5C5YA 3NQ2A 2NXGA 2JKAA 3DHFA 2RFGA 3BLIA 1WXJA 3KVJA 3L2IA 4IGHA 3SIZA 4UFHA 3B04A 4S2BA 4E38A 5FF3A 5F2IA 2VFDA 5FEZA 1R47A 1UBSA 1KA9F 4JYEA 1PCKA 1AL8A 3S8HA 1SZEA 2DZWA 3OIXA 3PBVA 5GVJA 4LS2A 3EX6A 2DZTA 2VXNA 5AHNA 2ZZ1A 5CGQA 1RPXA 3HGRA 3WJWA 1X8FA 4O54A 1OG0A 3W2UA 2I14A 1XBXA 4MUZA 4ZQNA 3HPXA 3B05A 4UTTC 5CZJA 1DV7A 3PUEA 1GVRA 4JTIA 1SQ7A 1K8YA 1M7OA 4R33A 2QCMA 4UTUA 4O0KA 2CZ5A 3TQVA 2A6LA 2NLIA 2VEKA 5L6UA 3RF9A 3O05A 3TCEA 2E5DA 1KM4A 4NNBA 5EL1A 3MI3A 4DF2A 4MZ1A 5KTLA 4JDBA 3SSJA 3AJXA 4N9BA 4A2RA 2B7NA 3VE9A 1SO4A 3NQDA 1TTQA 3W1QA 2W6RA 1CX9A 1E51A 4MJZA 3W7GA 4CNPA 1WV2A 3QMRA 5CKSA 3W1PA 3WK2A 2Y7GA 4ADUA 4NUWA 4DPQA 3HF3A 2ZZ5A 3DI0A 3P60A 1H50A 4ONVA 1W37A 3LHUA 4NXSA 5D2XA 4IX0A 4M7SA 4UIOA 3HG5A 5F1UA 1LBLA 2WNQA 2QR6A 2Y88A 3BG9A 4DO6A 2C6QA 5I3GA 2A21A 3KVMA 1W5OA 2C1HA 5D2YA 4FNRA 2QCEA 5D05A 1LM1A 3DHDA 3DAQA 3LOTA 1QO2A 2LLEA 3GXPA 1F6PA 1T99A 4O50A 4OV4A 5CPNA 3MHGA 2Z1BA 4O19A 3W1LA 1TTPA 2WV8A 3CIXA 3QW3A 5C54A 3LCFA 4GUIA 1R2TA 5F2LA 3TDFA 2Y85A 5I3KA 5HWMA 3MP5A 3M47A 1IXNA 2QCCA 4LC6A 4UTLA 2X30A 4RJEA 4JS3A 4X3ZA 5K9CA 3UQNA 4LUIA 4DEFA 4R7JA 5LSMA 2QCNA 3FJ6A 4S1FA 3GAKA 3R89A 1FBAA 2XN1A 4OU1A 3DFSA 2ZZ3A 7TIMA 2NV2A 4RXGA 4PL1A 1EP1A 2Y62A 1VLIA 2P10A 3HGOA 1IIHA 4UMBA 3QMSA 3UZJA 4LWWA 2VKZG 1GOXA 4JTLA 3I7SA 1I2QA 4LVFA 1OFPA 4JTGA 2CLMA 3LXAA 2TRSA 2G96A 1YYAA 1WX0A 2GVJA 3M0ZA 1KFCA 1OABA 2G97A 3UWVA 1OYCA 2BTMA 2NWSA 3QW4B 4MFEA 1QPQA 1TPC1 4DXVA 1TPFA 1FWRA 1BKSA 3W1MA 4GRSA 3IIXA 5C6MA 4POCA 3ZS4A 5LNVA 2CZEA 3N2XA 2FDSA 3L0NA 3NL6A 3G8EA 3TNOA 3TAOA 3NA8A 2PRMA 3CWOX 1O95A 1KLYA 2G5WA 3NPWA 3UYCA 1PL9A 4JX5A 4ZQRA 1A53A 1WA3A 3O1NA 2OT0A 4LNYA 4RV8A 4C1LA 3W7DA 3RFAA 1TREA 5G2IA 2YW4A 1TQXA 5LNUA 1WDWA 2QJGA 1OYAA 2V82A 3DBPA 3M7WA 2FIQA 3LTPA 3CTLA 1XDMA 2GOUA 1EP2A 3N3MA 1TPH1 4BFAA 3RLUA 3C52A 4JTTA 4O11A 1OK6A 4XKYB 5HQEA 4BI7A 4NNAA 3UXDA 2GJLA 3STFA 1K03A 4DO4A 3U2OA 4EWND 1I2OA 1H61A 3DKJA 3KRSA 1TPEA 4AF0B 3ABOA 1ZAHA 5TBOA 2F7FA 3G3DA 4PEKA 1F5ZA 4CCDA 1W54A 4UTHA 1EWEA 1RD5A 1L2UA 2KZHA 1K8ZA 3LBMA 3PB0A 4IOTA 2QF7A 5AYZA 1LOSA 2IQTA 1NSJA 3KX6A 3QYQA 3R2GA 4MZYA 1DVJA 3M43A 1GYNA 1QCWA 4O52A 2I1OA 2J9YA 3T7VA 1ME9A 5AHLA 1LLWA 1TRIA 4CNNA 2V2CA 1JRBA 3BGJA 1YTDA 3TAKA 4A29A 1FWNA 2X1RA 3A23A 4FXRA 1B57A 3W2JA 1P0NA 4EOUA 4O57A 2RH9A 3W2KA 1LBFA 1VQTA 1EWDA 2ZFAA 2FTPA 2VFHA 3DFPA 3NZRA 4HKPA 1JQXA 3I7RA 4XTIA 4OGZA 4KKXA 3MWAA 4O28A 2QUTA 4DF1A 3BG3A 1LRNA 4PCFA 1R2RA 1TV7A 2NX3A 1H7PA 3CLMA 1HO4A 3B06A 3LI0A 1XM3A 2DU2A 1QO5A 1VGAA 4UC5A 3N2MA 4XUGA 1YDOA 2AGKA 4RZ4A 5LKYA 3ATYA 5D02A 1X6UA 2HSAA 4HNUA 1SO3A 3IRDA 3C8FA 2VEPA 4O14A 4ORMA 1I2RA 4LV9A 2J27A 4MLRA 1TRDA 1X1OA 5G1YA 5AFDA 2UV8G 1LDCA 5KZMA 2GQAA 4LU0A 4LVBA 5SWUA 2C0AA 2C14A 5FF7A 1YXYA 1NVMA 1PVNA 4LW7A 3NXFA 5FI8A 3S1XA 4YCPA 2TPSA 2OJPA 4LVDA 4QNWA 3NG3A 1F05A 1KFKA 4PH6A 3OA3A 3GAYA 3BG5A 3EWXA 3O6DA 3UWWA 1GPWA 4O0ZA 3N14A 2OCZA 4IXHA 1KLZA 2OZ0A 1YTEA 5D2WA 5FF2A 5LHFA 3QZEA 3S1WA 2V0TA 3O63A 4HN4A 5K7JA 5IM51 5G4EA 1LP6A 3OVQA 1R46A 2Z2UA 5C2XA 5G5IA 5DXYA 3CC1A 3HQ1A 4R34A 1I45A 2Z6IA 1G7UA 4TR9A 1XBZA 2H8XA 3L5AA 3G0SA 3UWZA 3G22A 3DXIA 4Z0JA 3QH2A 4WZHA 3G1FA 3TXVA 3GLCA 1JCYA 3HPSA 1OX4B 1VHCA 4JTKA 2X1SA 3UY7A 4I7UA 1PE1A 2ZZ7A 4FEZA 1MO0A 1B3OA 3P8IA 3V75A 1OFEA 4YWIA 1Q6OA 1WYIA 2BSLA 3C2EA 3M41A 3S42A 2B7PA 3MI6A 1JR1A 1OFOA 3KRZA 4UTIA 5J5RA 5EYWA 3WJYA 4ZVJA 3UZ5A 3LLDA 3BK0A 3MP3A 3FLUA 3L5LA 3G1YA 1DJQA 1J5TA 1K8XA 2QCDB 3EX3A 4LUJA 3AO0A 2Y6ZA 5D03A 3H54A 4OWGA 6TIMA 2R94A 3SI9A 4FIRA 1KM6A 4FX6M 2ZRWA 4O4VA 2R14A 1IXQA 4JEQA 4O1BA 1GQNA 1W8SA 2V8ZA 3NGJA 3TQ0A 3TXZA 2H8ZA 3UY8A 2EF9A 1VYSX 3O15A 4AXKA 3S5ZA 2GQ9A 2WOQA 1BWLA 3BW3A 3G1VA 4JY9A 3KFTA 4RZ5A 1W5QA 5BRBA 1KM0A 3L0KA 4WY0A 3IVTA 5U4NA 3K30A 1NF0A 2FB2A 1G6CA 4IMEA 3WK0A 5BMXA 2VFIA 4IQLA 2QAPA 1D3GA 3EWWA 2RHGA 2YYTA 3W9ZA 1UJPA 3QMTA 5AHIA 2E6DA 5K9XA 5I3FA 4UTWA 4FB7A 1LLZA 4QAIA 1JCNA 2R91A 4ZQOA 1A5BA 3MBDA 2CZDA 3QEZA 1MEWA 1XUZA 3IIOA 4MIMA 1ZAIA 1GTHA 1Z42A 3PG8A 1TPVA 3MBFA 1JVNA 3DENA 2GQ8A 1OVDA 1IXPA 1VR6A 3F4WA 3G1HA 1JUBA 1FWSA 1YLVA 5T26A 3F4NA 3Q2DA 4XBSA 3W7LA 1XUUA 4PA8A 1IGSA 2CZFA 3W7PA 2JGQA 1L6SA 3LERA 4FF7A 1ICQA 4N4QA 3N9RA 2A0NA 3O07A 1GWJA 1RVGA 4UCGA 3GIYA 3NAVA 1KTCA 4HNNA 1EUNA 3VI2A 4OHQA 5BNKA 2PRHA 4OV9A 4N4PA 3WJSA 3W73A 4UTJA 2NX1A 1ME7A 4U4MA 3DKLA 5H91A 3GKAA 3LHTA 3PG9A 2ATSA 3NZ1A 4LY8A 1KM1A 3W71A 1W3NA 4GE8A 2A7PA 1T96A 4UTWC 4CCCA 4JTUA 3NPUA 3OVPA 4NVTA 3ABRA 1G7VA 4N9EA 3TUUA 3W70A 2DZUA 2DZPA 2QJIA 5IBXC 1VLWA 5D04C 5DY2A 3BGGA 3CB8A 3GXTA 3W83A 2EHHA 1F2JA 3WFAA 2X2GA 2Q8LA 3S1UA 1I8JA 1I4NA 4H6KA 5AC6A 3TIMA 1UCWA 5HUOA 1WQ5A 1LBMA 5K3VA 1AW5A 1NF7A 3QSTA 3TQKA 3NL5A 5DBUA 2Y7DA 1Z44A 2J9ZA 4DELA 4KFNA 2NUXA 2DZVA 2PE4A 1GT8A 3R12A 4Y9AA 4FNUA 1SZNA 3OEXA 1L6YA 5EBUA 1YXCA 4JN6A 4FNTA 2DP3A 4PODA 1DL3A 3W86A 2QEZA 2E6AA 4UMAA 3W87A 4YMZA 1SFLA 2ZRVA 1SUXA 4W9TA 3G18A 3VFLA 3E02A 5CPOA 1Q45A 1W1ZA 3W7KA 3WK3A 1ZALA 4MPQA 4A22A 3C56A 3W75A 5LHEA 1S5WA 3D0CA 3E0IA 4CCEA 1FCUA 1N8FA 2CLOA 3MYPA 5BW6A 5KSWA 2P0OA 3UWQA 1YDNA 4JR5A 4BI6A 2A85A 3INPA 3PWAA 3UPWA 1ONRA 1EEPA 1KFJA 1FDZA 1F76A 1VH7A 2QDHA 4Y6GA 3LV6A 1KTBA 1XI3A 4QIUA 4JX6A 3W7EA 3BVJA 3BLFA 1M6JA 5EY5A 3B8DA 3C0JA 4MKNA 2X1TA 4ZZ9A 1EUAA 2G95A 3GX9A 3JRKA 3O8AA 3NM3A 3TFXA 3MP4A 3LB0A 3LX9A 4ZMGA 3V1PA 1VPXA 4M6QA 1KFLA 2ZZ6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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