1MEWA

Inosine monophosphate dehydrogenase (impdh) from tritrichomonas foetus with xmp and nad bound
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
482
structure length
344
Chain Sequence
AKYYNEPCHTFNEYLLIPGLSTVDCIPSNVNLSTPLVKFQKGQQSEINLKIPLVSAIMQSVSGEKMAIALAREGGISFIFGSQSIESQAAMVHAVKNFKAHNELVDSQKRYLVGAGINTRDFRERVPALVEAGADVLCIDSSDGFSEWQKITIGWIREKYGDKVKVGAGNIVDGEGFRYLADAGADFIKIGIGGGSREQKGIGRGQATAVIDVVAERNKYFEETGIYIPVCSDGGIVYDYHMTLALAMGADFIMLGRYFARFEESPTRKVTINGSVMKEYWGEGSSRARNWEGVDSYVPYAGKLKDNVEASLNKVKSTMCNCGALTIPQLQSKAKITLVSSVSI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Tritrichomonas foetus Inosine Monophosphate Dehydrogenase in Complex with Substrate, Cofactor and Analogs: A Structural Basis for the Random-in Ordered-out Kinetic Mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Tritrichomonas foetus
total genus 111
structure length 344
sequence length 482
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2002-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1mewA00
3W2LA 4HSNA 4MKNA 3IVSA 3TU9A 4Q32A 2A85A 3NQEA 2ABBA 1OF8A 1TTJA 5C54A 2PC4A 4GWEA 3KVJA 3QMSA 1X1OA 2NXIA 4JR5A 1JCYA 1FUYA 1YDVA 3LCGA 3SECA 1P4CA 1NEYA 1VQTA 4IQLA 2P1FA 3KVLA 3STGA 1ZALA 1PV8A 4JY9A 3WJSA 4LTSA 2X16A 3SR7A 1R2TA 3DHDA 4HKPA 5FF3A 3STEA 2BLEA 3R8RA 3EKLA 5F2IA 3C2RA 2E6FA 1QO2A 1SSDA 3DI0A 1GWJA 1V5XA 4UTWC 4FX7A 4MOZA 1LRTA 1JRCA 3NM1A 4WY0A 4MY1A 1TQXA 4ALDA 3N9RA 4NT0A 4O12A 2W79A 3NPVA 2NV2A 4JTJA 5EMUA 3EX4A 2YSWA 1SSGA 3UYCA 4O28A 3NXFA 1O94A 3SW6A 3HBLA 1SO4A 1W3IA 3QW4B 2Z6JA 2ALDA 1C8VA 1I45A 4MVAA 3TV8A 3S1XA 3TFXA 2V2HA 1KM1A 2ZA1A 1YDOA 3NL5A 3CU2A 3I7SA 1ZNNA 1FWTA 3INPA 3P61A 1YLVA 3E12A 2C18A 1SZNA 3DU0A 1N55A 1VYRA 3PB2A 5EL1A 3NQ6A 2DJLA 2EHHA 1TB3A 3B05A 4ICNA 5F2MA 3DFPA 1EUAA 1LBFA 5D37A 3S6DA 4HPXA 3HOJA 3GB6A 3CQ0A 3CHVA 2C3ZA 3I65A 3HJZA 4N6EA 2VEMA 3GXTA 4NJKA 3HF3A 4MPQA 3JR2A 1VCGA 1F6PA 2E6DA 1BKSA 3W1XA 5AOUA 5I3HA 1WOAA 5EA9A 5CSRA 3KX6A 5E0KA 4DPQA 3CEPA 4Y96A 1S5WA 5CKSA 4IPJA 2ZRYA 2E5DA 5LZLA 5DCBA 4MZ8A 3TQKA 1F2JA 2Y6ZA 4XZ9A 3W1MA 1FDZA 2JKAA 4HNVA 4MLRA 2RKXA 3MUXA 3NL3A 2J9ZA 4I9AA 3B0VC 2W6RA 4N02A 2OCZA 2FB2A 4GC4A 3QSTA 4QNWA 4A2SA 1KM4A 5CG7A 3UZJA 4LT9A 3P5YA 1W1ZA 4RXFA 3WK3A 3PY2A 1W56A 3UY7A 1GOXA 3RMJA 1FX6A 1UJPA 4BK9A 3MMTA 4LUJA 2A6NA 3UPBA 2VFDA 3NQ8A 4N2YA 4NUWA 5DBUA 4DO4A 1SO3A 3STCA 3BG3A 4JTEA 4PFMA 4JX6A 3GX9A 4JTGA 3KOFA 4ORIA 2ZA3A 1Y0EA 4EVZA 3C2OA 4ZQPA 3C3NA 1SU5A 3IIXA 1KLYA 1OFRA 3G3MA 3S8HA 4E38A 3HPZA 2ZDRA 2E77A 2V9DA 4BWLC 5G5IA 2YCEA 3KRZA 4PODA 4DF0A 1YDNA 2DZSA 3QYQA 1LBLA 2FPTA 4IMGA 1XBZA 1GT8A 4MFEA 3VKJA 4O1CA 4O53A 4GUIA 3P80A 5BNKA 4CNPA 1JCXA 3PB0A 3LM7A 3MWAA 3CLMA 4CCEA 2OMAA 5D30A 3QPYA 5D32A 1IXPA 3N2XA 3W85A 1JUBA 3P62A 3UWVA 4CNOA 3S5YA 4M6VA 2NX9A 2I1OA 3M9YA 3C8FA 6ALDA 2WNQA 4Z1DA 3L68A 2QJIA 4HN4A 3BW2A 1Z41A 4H3DA 4MY9A 3W88A 5KMYA 1WYIA 1DORA 3OA3A 3P82A 5L6UA 1IIGA 3DFQA 3W2UA 2RH9A 3HGJA 5F1VA 1K8XA 3TDFA 2ZZ5A 4UXDA 2FPYA 5LNRA 3D0CA 1JQXA 2WNZA 4WY0F 1FXPA 4RX0A 1PL9A 3G0SA 5CSSA 3HGOA 4RK8A 4JS3A 4AAJA 3B0UX 2H6RA 3VCRA 4WXYA 5U7SA 1SO5A 5IBXA 1TPB1 1W3TA 2CZ5A 4ZVJA 1M7OA 2V2CA 4NX0A 3UNDA 5FEZA 1F05A 3M41A 3NZRA 3UZ5A 3M5XA 1SZGA 4ZQOA 2ZZ1A 4M19A 3NVTA 3O07A 2VFGA 2ZBTA 4X2RA 4YMZA 3BO9A 4S2BA 2JGYA 2Y63A 3HPXA 1LZOA 2BX7A 2TMDA 1JQVA 3I7RA 2ZZ4A 4AF0A 4XBSA 1H62A 2V8ZA 1EP3A 3PBUA 1KV5A 3LRLA 5D05A 4O8RA 1OFPA 1VCFA 1I2QA 1LLZA 3I7QA 5CZJA 4TIMA 3LTSA 3TX9A 1VLIA 1TPDA 2H3BA 2PCQA 3CIXA 5CPMA 3W2NA 1I4NA 1BEUA 1BWLA 2YPIA 2FLIA 1SW3A 4LU0A 2DP3A 2V30A 4YCPA 4EF8A 3NQFA 3EWXA 4UTJA 3WK0A 2Y62A 1F76A 4WQ6A 1W31A 3PSWA 1L9WA 1LDCA 2HMCA 1DL3A 1SR9A 2QCDB 3O05A 1GQNA 1HG3A 4I7WA 1VLWA 2C6QA 2CLHA 1LORA 5C6MA 4R53A 3UQNA 1WOBA 3A22A 4JNMA 5LNSA 3FS2A 4QJ1A 2GVJA 1G4TA 2CLIA 4MYXA 4C1LA 2YX0A 3TKFA 3QPZA 4JGDA 4MIMA 2ZFAA 3B03A 3NQ7A 3V1PA 3DKJA 2DZXA 3G0XA 1VHNA 1TJRA 2QCEA 4AH7A 4RZ4A 2QUVA 1IXOA 2JKPA 4UR8A 3PUEA 4FXRA 3G1XA 4FHAA 1CX9A 1W3NA 3W9ZA 2PURA 2ZRVA 3P60A 4OBTA 2B0MA 2J27A 4UC5A 3HMJG 4ADUA 3H54A 5F2GA 4OV9A 3M5VA 3N14A 3CEUA 1I2PA 3B8DA 5D2VA 1OFBA 1O5KA 4RLIA 5D2WA 1TPH1 1OJXA 3PUOA 4JDBA 3C61A 1Q45A 4RXGA 4P2VA 3L5AA 3MW7A 3PC0A 1QMLA 1WA3A 4XBKA 1SFJA 1H60A 3NQVA 4AEOA 5AFDA 2CFFA 2TYSA 3LHYA 1XUZA 4GUGA 2VFFA 2Y85A 4E2DA 2E68A 1OX5A 2GQ9A 3MYOA 1KFEA 3AO0A 1A5AA 3M0ZA 3TW6A 1T8XA 3PF3A 2HS6A 3EX3A 2YXGA 4PH6A 4I7UA 1W54A 2QAPA 3W07A 2J9XA 2QCNA 1VR6A 3ABQA 3EWWA 4HNUA 3C4UA 4MY8A 1GG1A 5CPNA 3V75A 1AL7A 1L6WA 5AC6A 4AVFA 3R5EA 4DBEA 3IEBA 4L4LA 4ADTA 1QR7A 3G1HA 2DZWA 1SQ7A 4J9JA 4XTDA 2H3DA 4FX6M 3RNDA 1VZWA 2NX1A 3OVQA 4QM1A 4LRSA 1VCVA 3PAJA 1YTDA 4K7VA 1G4SA 3M44A 4FNQA 3W83A 4IXHA 2DZUA 5DBTA 1M6JA 3GDMA 3G1DA 1CW2A 2TPSA 3EX6A 5BMWA 3TXVA 3WK2A 4JYDA 3A21A 3N19B 1HO1A 3O16A 3FEMA 2JGQA 3QEZA 4MZ1A 4NXKA 5AB3A 1GVRA 3NQ2A 5TQLA 3O6DA 1UB3A 1HTIA 4N4QA 2J24A 5AYXA 2YZRA 3BARA 4GJ1A 3TAKA 2QCFA 3S1VA 2H8ZA 4G1KA 3MBDA 2GQAA 3LBCA 3OBKA 1X1ZA 3OEXA 2Z6IA 5DY3A 4IXXA 3LHWA 3P84A 3ABRA 2QUUA 3VI2A 3NNTA 1QNVA 3ATZA 2QCMA 1AMKA 4O4VA 2YR1A 2I14A 4AB4A 4DF1A 1F74A 4DO5A 1DVJA 1LBMA 3ABOA 4O17A 2Q8LA 3DH7A 2FQIA 3GNDA 1O4UA 2O7SA 2QEZA 2NXHA 5EPDA 2ISSA 3PULA 1GYNA 1D9EA 4FIQA 4GNJA 1XBYA 2C0AA 4R34A 5IBXC 3N2MA 3M5ZA 3TJLA 4U4MA 4AXKA 2C16A 5CZSA 4K8HA 4FNRA 2NUYA 3LCWA 1K8YA 3MHUA 2R8WA 4GFSA 3WJZA 3E02A 3F4WA 3UWUA 4AHPA 4GRSA 1FDJA 4TMCA 4Z0JA 1I8JA 1TPUA 4IMEA 3UXAA 4TO8A 4EWND 2ISVA 3N3MA 3UXDA 4UTTC 4O15A 3VNDA 1TIMA 5LHFA 2EPHA 2A7RA 1AW2A 1YPIA 2BXVA 1FWSA 1OX4B 4LVFA 1QDSA 4OU1A 3NQMA 1TSIA 1FXQA 2B7OA 3G18A 4FX8A 3NQGA 3L0GA 1S5VA 3U6WA 3EKZA 1T99A 3W75A 3IGUA 5CZ0A 1FWWA 4JXCA 4IGHA 1YXDA 1NF0A 2YW3A 3HGRA 3P81A 4K39A 4R33A 2C1HA 4RR4A 1EA0A 1SFLA 2GJNA 3S1UA 3E96A 4UTKA 2Z0IA 5AHEA 5AYZA 2P10A 4RCXA 5ABTA 1FQ0A 3QMRA 2PRLA 3W6YA 4LS2A 3HQ1A 2GVGA 2CLEA 4QISA 5AN7A 3W7OA 1QPQA 3W71A 3L0KA 1YYAA 1EP1A 3C0JA 3KVMA 2J88A 1W5PA 1OX6A 3GDLA 3Q37A 1TV7A 2XN0A 4N6FA 4IJBA 3T78A 1KTCA 2BTMA 3KAOA 4UR7A 2G5WA 1ZAJA 2BSLA 3NAVA 4WD0A 5FESA 3UWYA 2DU2A 2X1TA 5FF7A 2ZQ0A 4XQ6A 1OFAA 1ONRA 2X1RA 1W0MA 3NPUA 3Q58A 1H1YA 8TIMA 3LCIA 3G1FA 1NF7A 2WOQA 4JTHA 3DFNA 1P0KA 1XM3A 3O1NA 2QUTA 1OHLA 5GVJA 1EWDA 3HPSA 4AHOA 4E2BA 1PHWA 3P67A 1QPRA 3FOKA 1TQJA 4HHPA 4QNEA 2P0OA 3T4CA 3W70A 1TO3A 4UTHA 1A5CA 2GUUA 2PRMA 3QC3A 4RZ5A 1MXSA 2ZRUA 3G1VA 4JIQA 4FO4A 4ZMGA 4AHQA 1GTEA 4NVTA 4JTUA 3EEGA 1T0OA 4NJHA 3PG8A 2A4AA 3BGGA 3OIXA 4LS1A 3GLCA 5K9XA 2Q3OA 1R30A 4MUZA 3QFEA 2NLIA 3R2GA 4ZQCA 3TE9A 5C2XA 1Q6LA 3S0CA 3L2IA 3IGXA 4KWVA 3CTLA 2J6XA 1QAPA 4CQ8A 4O4WA 3RFAA 3VE7A 3U8GA 2CW6A 2ISWA 4JICA 4YWIA 2FJKA 1KM3A 4WY0B 3W72A 4FF7A 3UD6A 4JIPA 4M7SA 4DPPA 1U83A 2NUWA 4PCFA 3DENA 5IM51 3LHUA 4MJZA 1TV8A 1L6YA 5HWMA 1SPQA 1J4EA 3STFA 5G4EA 3PBVA 5HJLA 4JTIA 4OGZA 4O57A 1S5TA 1KW1A 1KFBA 3DFSA 3S1WA 2OZ0A 1FCQA 1O60A 1XBXA 3A24A 3B4UA 1Q3NA 1K7EA 4UTMA 4FB7A 3FA5A 3T40A 2A6LA 1GVQA 3LLDA 4A22A 1F73A 3WFAA 4A29A 2QCHA 5H91A 4A3UA 2O7QA 2ZCGA 1TYGA 1TTPA 1B4EA 4CCCA 1VPXA 3BV4A 4NNCA 4DBDA 2Y7EA 4S2CA 4NJJA 2Z1BA 1H63A 5C5YA 5FF2A 4N9CA 2JBMA 1WQ5A 3MI2A 1QO5A 3W76A 3MHGA 2Y7DA 1THFD 1ICPA 4OWGA 5K4ZA 4C1KA 3W7LA 4EIVA 2RFGA 3BK0A 3BVJA 2R94A 5CPOA 1FY6A 2VKZG 4W9TA 5HMSA 3DFOA 3UY8A 4X22A 1UUOA 4N9DA 3TJXA 4JY8A 1I2RA 2VENA 4Y6GA 4JTFA 3HG5A 5FEXA 1XC4A 2WV8A 3BPWA 1ZJIA 2YW4A 3GXNA 2RDTA 2BZNA 3L5LA 4H6KA 3IVTA 3LXBA 3G1YA 1H50A 3Q2DA 1LM1A 1VS1A 4XKYA 2D73A 4UTUA 3W2MA 1EWEA 3W7IA 3THQA 4IWWA 2FDSA 5KZEA 3TQVA 3LGEA 3M47A 4Y8FA 2V81A 2PE4A 3EX2A 5HULA 5E93A 1WX0A 3BG9A 2Y70A 2ZZ3A 4IMCA 1KFJA 1RQEA 2QJGA 1ZY9A 4O52A 2Y7FA 3W7MA 3ELFA 1OVDA 3W22A 3PBWA 4GUFA 3W1TA 1G7VA 3R12A 3SJ3A 4EF9A 1JUEA 1PIIA 1G4PA 3WJYA 4UIOA 4N9EA 5I3JA 2XFWA 3M43A 4MLJA 1PHQA 3EWYA 4IUOA 1VHCA 4LUIA 4LC8A 2OJPA 4FNPA 3GKAA 3BW3A 1PCWA 1ME8A 2ZRZA 3BLFA 1F7BA 3L65A 3O63A 2QCCA 3EB2A 1H61A 4PEKA 4EOUA 3FJLA 4UFIA 3T7VA 4M6QA 4NX5A 2E1DA 1E51A 2X30A 3W7JA 5HR6A 5F1UA 4UTWA 3LRMA 3L9CA 3W23A 1ME9A 1M7PA 3F03K 4IOTA 4MJMA 3EXSA 3SIZA 5DELA 5CPLA 3W7NA 1OFQA 3CPRA 1MSSA 3TC7A 1OFDA 4XTIA 1UBSA 3SZ8A 1H7NA 2V82A 4XUGA 4GUJA 3MBFA 4Y9AA 3W73A 4FIRA 2A7NA 2B7QA 1Z44A 3W1LA 1YTEA 4O11A 5LNWA 2F7FA 3L5MA 4LOCA 3LTYA 3TROA 1KBIA 5J5DA 4NU7A 3BGJA 4HSOA 2NXGA 4FXSA 1DBTA 3S5ZA 1JVNA 1WBJA 1GJPA 2JK2A 3EWBX 1ICQA 4WOQA 1DKWA 1I2OA 4S1FA 4NJIA 1PCKA 3FFSA 4KFNA 4O16A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1XXX A;  3W7D A;  4BWL A;  1UUM A;  4R7J A;  4DQW A;  2NV1 A;  1U5J A;  1G7U A;  5FEP A;  7TIM A;  1FWN A;  5HWJ A;  2QCL A;  3ZS4 A;  2ZRW A;  1KV8 A;  1VRD A;  4LWW A;  3G24 A;  3LV5 A;  5G2H A;  4WXZ A;  4BR1 A;  3LBM A;  1F5Z A;  3G1A A;  1B4K A;  5LHE A;  3IIO A;  4PL1 A;  1BWK A;  1MZH A;  1OYB A;  2V2D A;  3N73 A;  5KZM A;  1ML1 A;  4IMF A;  1GYL A;  5DXY A;  4Z1C A;  3LDV A;  2ZA2 A;  3G1S A;  2CLF A;  5D03 A;  4JN6 A;  1TV5 A;  1TPW A;  1TTI A;  3NQA A;  4JYF A;  4ORM A;  1NVM A;  3DAQ A;  1S3H A;  2PRH A;  3HB9 A;  2B7P A;  4UMB A;  4LRT A;  2YFO A;  4OHQ A;  3MO7 A;  2FB3 A;  3HGS A;  5K7J A;  4LV9 A;  2E09 A;  2QDG A;  3UWZ A;  3F4N A;  1G69 A;  1RV8 A;  5AHM A;  2AAM A;  1ZCO A;  3LHT A;  2CU0 A;  3NR0 A;  3IV3 A;  3LX9 A;  3QSR A;  3W2J A;  2NZL A;  1EUN A;  5DY2 A;  3TCE A;  4TR9 A;  1OF6 A;  3TXZ A;  3QM3 A;  5EKY A;  4RKA A;  1SO6 A;  5K9C A;  2EGZ A;  5AC7 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2G3J A;  3VGE A;  4A3Y A;  3IVS A;  3TU9 A;  3NQE A;  3AMG A;  2WC7 A;  4CUC A;  1UA3 A;  1TTJ A;  5C54 A;  3WBX A;  2PC4 A;  3LUT A;  4GWE A;  3QMS A;  5HQM A;  1X1O A;  2NXI A;  3B0Y A;  3VNK A;  1DWF M;  1AD4 A;  4I5R A;  4IQL A;  2PWV A;  3UZX A;  2WKG A;  5DO8 A;  1XRS A;  1XLE A;  4KBX A;  2CHR A;  4KW2 A;  4QBX A;  5FF3 A;  1W17 A;  4GC3 A;  3C0L A;  1S2T A;  1QK2 A;  3LY0 A;  1SSD A;  1M01 A;  1V5X A;  2IMR A;  4FX7 A;  3VDA A;  3R11 A;  1LRT A;  4WY0 A;  4H6E A;  1TQX A;  4UQ9 A;  4ALD A;  4O12 A;  4B5T A;  4JTJ A;  1SSG A;  4PB4 A;  4O28 A;  4RV3 A;  1O94 A;  2Q01 A;  3SW6 A;  2ALD A;  4XVE A;  1I45 A;  4MVA A;  3S1X A;  1KM1 A;  2ZA1 A;  3PTD A;  2PUZ A;  3KCJ A;  3CU2 A;  2NVC A;  1RLC L;  1ZNN A;  1CXL A;  1FWH C;  3L4T A;  3P61 A;  1IZC A;  1F8I A;  1IT7 A;  1JXJ A;  3DU0 A;  3WDR A;  1N55 A;  1VYR A;  3BE7 A;  4TUF A;  3NQ6 A;  3B05 A;  3QR0 A;  4IT1 A;  3WCZ A;  3KL5 A;  2OG9 A;  2R1M A;  3DFP A;  1EUA A;  1QNR A;  3S6D A;  1J0H A;  3GB6 A;  3QR1 A;  4H9U A;  3H2M A;  1XCX A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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