1JCMP

Trpc stability mutant containing an engineered disulphide bridge and in complex with a cdrp-related substrate
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
MQCVLAKIVADKAIWVEARKQQQPLASFQNEVQPSTRHFYDALQGARTAFILECKKASPSKGVIRDDFDPARIAAIYKHYASAISVLTDEKYFQGSFNFLPIVSQIAPQPILCKDFIIDPYQIYLARYYQADACLLMLSVLDDDQYRQLAAVAHSLEMGVLTEVSNEEEQERAIALGAKVVGINNRDLCDLSIDLNRTRELAPKLGHNVTVISESGINTYAQVRELSHFANGFLIGSALMAHDDLHAAVRRVLLGENKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Stabilization of a (betaalpha)8-barrel protein by an engineered disulfide bridge.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INDOLE-3-GLYCEROL-PHOSPHATE SYNTHASE
molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
total genus 90
structure length 259
sequence length 259
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2001-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
P PF00218 IGPS Indole-3-glycerol phosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1jcmP00
4UTIA 3CLMA 4JYFA 2PRLA 1JRBA 3FA5A 3L66A 4AWUA 2FQIA 4XTDA 1CX9A 3NPVA 3FIGA 1T8XA 3O8AA 2XFWA 4IQLA 1DKWA 2FB2A 4U28A 1ME7A 4ZL1A 3M5XA 4WJEA 4UNKA 5D04C 3R8RA 2E77A 1FCQA 1O95A 5DLCA 3UXAA 4A29A 3PBWA 5AC8A 1VJIA 2ZBTA 1ALDA 4AEOA 4ADSA 3M47A 1KTNA 1TPC1 3PSVA 2P1FA 2V5LA 1SZFA 4K37A 2E6AA 4DF2A 4NVTA 3GXNA 4CNNA 5IM51 1OX6A 3L9CA 2ATMA 1SSGA 4N9BA 2R91A 3P84A 4M7TA 2BWGA 1KM5A 1F6KA 3HF3A 5DY2A 2ZZ6A 3W1UA 1FXPA 5LKYA 1XFBA 1JUEA 2BSLA 5DELA 3HG2A 3N9SA 5G2WA 4NXKA 1NF7A 3NQ6A 2AGKA 3OBKA 1L9WA 1G7UA 4UTHA 3HG5A 4UMAA 2JKPA 4ORMA 5EA9A 3N2MA 2BTMA 3B05A 2QCDA 4WD0A 3QMRA 5CG7A 1X6UA 1EA0A 2Z2UA 3OG3A 4UTWA 5BNKA 1CW2A 1OG0A 2Y85A 3PC0A 5H91A 1AL7A 1ICPA 3LI0A 3MWAA 2V2CA 3NPXA 1YTEA 4XZ9A 2ZYFA 1GVOA 1V5XA 1SPQA 4OWGA 3TSBA 4Y8FA 2YYUA 3ATYA 4MVAA 4H3DA 3EXSA 2Q3RA 3RU6A 4NNCA 5K4XA 1PCWA 1S5WA 1R30A 3HGOA 5F4XA 3BVJA 3UYCA 4PC8A 1O5KA 2W6RA 4MUZA 2DZXA 3LBMA 1X7FA 1JCLA 1OX5A 4AXKA 2HTMA 1VHCA 2Q8ZA 3ELFA 3EWZA 1JCYA 1RV8A 1UBSA 2OX1A 2QCDB 3MHFA 3C2VA 1LRQA 5HJLA 2VXNA 2RDUA 3PR2A 4W9TA 1JCXA 4N6FA 3HO8A 4PCFA 2YZRA 2CZFA 3C61A 3KRUA 1JUBA 3EWYA 1TQJA 5LHFA 3EKZA 5BMWA 5FF3A 1K7FA 2Y7GA 3GXPA 2FFCA 2Y70A 2VELA 3W1PA 3GLCA 3W7MA 3PY2A 3ABOA 1LORA 3TU9A 1DV7A 3P7YA 1IIGA 2B7PA 2DZTA 1S5VA 2C0AA 4UR8A 4UFLA 4FEZA 4ADTA 4LNYA 1TV5A 2VEKA 3MP3A 3SECA 3R5EA 3RK8A 2QEZA 3LXCA 1GOXA 3CB8A 1X8FA 1YADA 4LRTA 3DAQA 3TAKA 6TIMA 4K6AA 1N7KA 1VZWA 1WX0A 4OT7A 3M41A 1QR7A 2GQAA 2CLEA 4Z1AA 2QUTA 3GDLA 3DI1A 3G1DA 5HQEA 1ZAIA 2XN0A 1EUNA 3DBPA 1X1OA 5CZSA 1QPQA 3LDVA 1BTMA 2B7NA 1M7OA 2CZ5A 2ATSA 3LRLA 2ZA2A 1YTKA 3VCRA 4IPJA 4ADUA 5I3HA 1BWLA 2F7FA 1A50A 3G1HA 4BI7A 3P74A 5D09A 4NXSA 4CCDA 3A24A 3LHZA 5FF4A 1VGAA 4O13A 4O54A 1Q6RA 1F05A 3MBFA 4OU1A 3W2NA 3OIXA 5D2XA 2CLOA 5F4WA 5C54A 3NQ8A 3TQVA 1H7PA 1EB3A 1G7VA 2Y63A 3CWOX 4A3UA 2TMDA 1QOQA 1O60A 1F5ZA 3GIYA 2ZZ4A 5DN1A 1QMLA 1P5BA 1F76A 3E02A 3NGJA 2WQPA 3DU0A 2TSYA 5J5DA 1ICSA 1L2UA 2H3BA 3LCWA 5AHEA 4IOTA 3TJLA 3SSJA 2ZZ7A 3CWNA 2BZNA 2QCHA 3SFKA 4N9EA 2E6FA 2CW6A 4O19A 1IXQA 2F84A 1R2TA 5D05A 2HS6A 1SO4A 1MZHA 4DQWA 3BLIA 3L0GA 1EP1A 2NUYA 4O15A 3G3MA 1NAL1 1HO4A 4S1FA 4XWUA 4GNJA 1OX4A 3C2EA 3CIWA 3M16A 4JXCA 3C4UA 3LCLA 4GC4A 1K7XA 1G4EA 4ML9A 3HOJA 2PC4A 3P8IA 1B57A 2ZRVA 3NPUA 4UTJA 4DBEA 3LTSA 5FF7A 3SW6A 1P4CA 2Z6IA 3MBDA 1SO6A 1JCNA 3W7CA 1OYCA 3S1XA 3ZFHA 1H5YA 3PF3A 3ANYA 5F2GA 2QKFA 3H53A 3IVUA 1KBJA 3EX3A 3QMTA 4O8RA 3BG5A 3QSRA 4UR7A 3LXAA 3S1WA 3W9ZA 1JQXA 2ZTJA 4L4LA 2RKXA 3SY5A 3W84A 1OX4B 2GUUA 4FX8A 3PUEA 4NQ1A 3M1ZA 3BG3A 4WQ6A 4NX5A 3NZ1A 2J6XA 1OHLA 4TO8A 1K02A 3EX1A 4MLRA 3HQ1A 5F2LA 1KFBA 1G69A 5EYWA 5CSSA 3HPZA 4FNUA 4MFEA 3C3NA 4IGHA 3MUXA 3WFAA 1D3GA 5EL1A 3UWYA 2J9YA 1YXYA 1XL9A 2E6YA 4MKNA 4WX2A 1NF0A 5D30A 6ALDA 3EKLA 3FYOA 1TPUA 3W72A 2NWRA 1FDYA 2QDGA 4UIOA 2Y6ZA 4JEQA 4Z1DA 1WDWA 1QO2A 1TTIA 3H55A 3H54A 4N02A 1QCWA 4HNNA 3NNTA 5LNVA 2V2DA 2NUXA 5CGQA 2AAMA 3N34A 3M5VA 4DXVA 3G1XA 4FIQA 2YW3A 1NSJA 3LCFA 4JTEA 4O1CA 4RZ5A 4ALDA 4GUIA 3C2OA 2QCLA 4QNEA 2C14A 4GUHA 3ABSA 2VKZG 4ZQRA 2QUVA 5KZEA 2YYTA 3PULA 2OMAA 2ZZ5A 4E2DA 4UTKA 4NJKA 2H6RA 4LY8A 1AMKA 1TYGA 4FO4A 2O7QA 3HMJG 3E9AA 5D2YA 1FCVA 4U4MA 4BK9A 4NJGA 5FESA 1FCUA 5CZTA 3TAOA 4FB7A 4NJHA 3W7PA 3LGEA 4Q4KA 1WV2A 2X2GA 5LGXA 2H90A 1HFBA 1ME8A 5AHNA 4CQAA 3QEZA 1W3IA 4H4IA 1QPOA 1OK6A 4MZ1A 5LSMA 1VS1A 4P61A 3W76A 3LERA 1K8XA 3O15A 2VFDA 4IXHA 3LTYA 3NM1A 4JX4A 4QJ1A 3STFA 3EWUA 2UV8G 3VI2A 3W7JA 1W5PA 1NVMA 1EWEA 2QJHA 4EOUA 5F1VA 4DEFA 5EMUA 3L0NA 2V81A 1H7NA 5AN7A 3DHFA 1OFPA 2YFOA 3BARA 2E5BA 4O1DA 1I2PA 2V30A 4ZQMA 1JR1A 2WKJA 2JGYA 1LOSA 3GAYA 1TPDA 1V7YA 4YWIA 3W6YA 3RFAA 3TQKA 3GYEA 4UTLA 5DCEA 1AW2A 1ML1A 3C56A 2CZDA 3HIJA 4NZJA 1HTIA 3TSDA 1I2NA 3PB2A 4JYEA 1LOLA 3KVJA 3KHJA 1GG1A 1EPXA 3RMJA 5U4NA 1VYRA 5AHFA 1N8FA 3W2LA 2V5BA 1H50A 3TQ0A 3KRSA 4FHAA 5C55A 3F03K 3W7EA 3CPRA 2VOMA 1B4KA 2A5HA 3W7OA 1KFLA 1XC4A 4LUIA 1MO0A 4DO4A 3QH2A 2ZRXA 4AAJA 2GVGA 3UY7A 4UFKA 1KTCA 4IMDA 4DO5A 1GEQA 1TRIA 3P5YA 3KAOA 1GG0A 4EF8A 4MIMA 1W56A 3P5ZA 2RHGA 2VC6A 4LOCA 5K3VA 2NZLA 3IGXA 4LVAA 1LBLA 4AHOA 4PODA 2FTPA 3FKKA 3GDKA 3THQA 4O53A 5DCBA 1VQTA 2A7RA 2NX3A 1SW3A 2OT0A 1VRDA 1VR6A 3GZ3A 1GYNA 3A22A 5CPMA 4IPIA 3LTPA 1ZJIA 4I7VA 5D2WA 4L4MA 1EUAA 1EX5A 4MY1A 2I1OA 3W7GA 4YMZA 4DPPA 2ZCGA 3SZ8A 2NXHA 2I14A 1W54A 2NUWA 2JK2A 1WXJA 1A5SA 3T4CA 1DORA 1F7BA 1JRCA 2FLIA 3V75A 4UTWC 1G67A 1OK4A 3GAKA 4O57A 1QPRA 1BEUA 1K7EA 3Q2DA 1DOSA 4N4PA 1XUZA 3GB6A 3S1UA 5MHBA 1HO1A 5LNUA 3WJZA 4JTTA 1R47A 4QIUA 3CQ0A 4O0ZA 2WSYA 4O4WA 1UJPA 3DI0A 1B9BA 3W1AA 1LP6A 2ZA1A 3NQ7A 1YYAA 1UASA 2Z6JA 1TRDA 5LNRA 2CLLA 4CCEA 3FS2A 3QPZA 5BMXA 3P82A 4YL2A 1RQEA 3TKFA 5CPLA 5HR7A 4AH7A 1YTDA 2R94A 1TPB1 3GK0A 1FX6A 4Y90A 3MI6A 1QDSA 3W70A 3PBUA 1SUXA 1OFEA 2GVLA 5TQLA 4ICNA 5LZLA 4FXRA 3TFXA 3Q58A 4Z1BA 1M5WA 3M43A 3M5ZA 2QAPA 1F74A 1OFOA 4TX9A 4O18A 2FJKA 2X16A 3WJYA 1RD5A 2GQ9A 1DBTA 3EX6A 1ZHAA 3NL5A 1XCFA 3W1LA 3STGA 3TCEA 2J24A 3L68A 2V9DA 1K8YA 3C6CA 1KFKA 3DFNA 4UNLA 2H8ZA 2EGZA 1ICQA 4TMBA 1Z42A 2BLEA 2GVJA 2NV1A 1VHNA 3V1PA 3JR2A 5KTLA 5LNWA 1FWNA 2ALDA 5K9XA 2PCQA 1KLYA 3P80A 1J5TA 3PG9A 3W71A 1W5NA 4PL1A 1KV8A 1NEYA 3PSWA 3ABQA 1IGSA 3NR0A 2J9ZA 1D3HA 3SR7A 4BF9A 3FEMA 3SI9A 2WPBA 1H62A 4WOQA 1YPFA 4PH6A 5BW6A 4JR5A 4WXZA 4Y96A 2LLEA 4TU1A 5FEPA 1T96A 5FI8A 5G1YA 5E0KA 1DJQA 3GDTA 3USBA 2OJPA 3G22A 3QW4B 4LS1A 4KKXA 4N2YA 5TBOA 1JCMP 2C15A 2NX1A 2B4GA 2B0MA 2QDHA 3W83A 3I6RA 1LLZA 3L5AA 3N3MA 2QCGA 4NX0A 1PHQA 1F73A 3HGRA 1C29A 3TROA 2QUUA 1J4EA 2IQTA 3NQGA 1TB3A 4NUWA 4XUGA 1FDZA 1AG1O 1KM2A 2BXVA 4WUIA 2NWSA 1U5JA 1W5QA 2CWNA 1A53A 4K7YA 4IMCA 2I9EA 4O4VA 3VKJA 4S2BA 4P2VA 4GFSA 3W7IA 4HHPA 4KFPA 3C2FA 3A5VA 4JDBA 3MI3A 1TPWA 3T78A 4O50A 4M7SA 4DF0A 3U8GA 1Q45A 1H60A 2Q3OA 1W8SA 3DKLA 4UTUA 3A5FA 3LB0A 1M7PA 3TA6A 2OZ0A 1LROA 5I3IA 3CTLA 4JTUA 4MLJA 4LS0A 4O10A 5DBTA 3NQVA 1PCKA 1SW7A 1P0NA 1TPFA 3BLFA 4HNTA 4IMFA 4K7VA 4O16A 4HKPA 1AW5A 3M5YA 4LV4A 5D2TA 1IXOA 3GDRA 4JTFA 4GRSA 3L2IA 2FDSA 1XBYA 3HG4A 3IIVA 3DXIA 5LNSA 1W5MA 3NQCA 4GUFA 1L6YA 5EKYA 3HG3A 3S5NA 2ZZ1A 4ZZ9A 1FWTA 4K36A 3LOTA 3KVMA 4LC6A 4FF7A 4JNMA 1WAUA 3G0XA 1TPEA 2ZRWA 4LTSA 2Y61A 3GVGA 4I7UA 3T55A 3TMQA 3IIOA 1XBZA 2P0OA 3W1XA 1YLVA 5DBUA 3TNOA 5D37A 1WQ5A 3TX9A 1KV5A 4XKYA 5K2ZA 3NL2A 3W73A 1BWKA 1Z44A 3F1QA 5AYXA 1KFEA 5DY3A 2C1HA 1R2RA 4LW7A 3O6YX 1CI1A 5FF2A 3W1MA 5SWUA 2HS8A 4WY0F 3TXZA 2JKEA 4DBDA 2JGQA 2EHHA 3UWUA 4GUJA 4AMAA 1AK5A 1KLZA 1HUVA 3TDFA 4NNAA 5KZDA 1QO5A 4UFIA 3S6DA 4I9AA 1EP2A 4O1BA 1P0KA 2X30A 2NXIA 4M6VA 4IJBA 3NDOA 1LOQA 2NX9A 2QJGA 3T44A 2WNNA 4XKYB 1GZGA 2R14A 1FBAA 2A2IA 3LI1A 1LM1A 1T0OA 1RQHA 2HSAA 3GKFA 4FNQA 1GJPA 1ME9A 1H7XA 1K03A 3NEVA 3Q94A 1PS9A 3P81A 3P67A 3MO7A 1Y0EA 1K8ZA 3G1SA 5E93A 2A85A 1XDLA 1ZNNA 1ZY9A 3ZWSA 4QSHA 2PRMA 5F2IA 4C1LA 2GPTA 4NZFA 1ZALA 5D33A 1VCVA 3UWQA 2WNZA 1XBXA 3BG9A 2WSRA 1T99A 3VFLA 4K8HA 3S42A 3TR2A 5D02A 2GOUA 4MZYA 1H7WA 5CKSA 3M7WA 1WYIA 1SR9A 2A4AA 2E5DA 3EWXA 2QCNA 3UPWA 3FFSA 4JTLA 4OQVA 3S5ZA 1G4TA 3S1VA 1W3TA 1YXDA 3EWBX 2QF7A 3B8DA 5G2HA 4LU0A 1QNVA 1W5OA 2CLKA 3PUOA 3JS3A 2GJNA 3E0IA 1O5XA 4A2SA 2NV2A 4CNPA 2KZHA 2NLIA 1TQXA 1KM0A 1VCGA 3RNDA 4WZHA 3L65A 4MPQA 3W86A 1VLWA 3O1NA 1TJPA 3LCGA 1TPH1 1XI3A 5AB3A 4HNVA 2DZSA 1OJXA 1KM4A 1SZEA 5A8GA 3W74A 3GKAA 2A0NA 2DZUA 3GXTA 1BKSA 4M6QA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3VNK A;  1NFG A;  2FQI A;  3B4Y A;  2ZAD A;  3NPV A;  3FIG A;  1S2T A;  1T8X A;  5FA5 A;  1FFR A;  3S2M A;  3UG3 A;  4XZB A;  3ARZ A;  1CCW B;  1ME7 A;  4BF5 A;  4UNK A;  3R8R A;  1SJA A;  1EO5 A;  2E77 A;  4N42 A;  2FTW A;  1A4M A;  1VJI A;  1ALD A;  2IKI A;  1OZQ A;  1KTN A;  2JIE A;  4O1E A;  4HNL A;  4K37 A;  5FAC A;  3WQO A;  2E9B A;  2E6A A;  2WMG A;  4NVT A;  1ZBW A;  1XLB A;  1UQZ A;  3GXN A;  3ZIZ A;  4M56 A;  3V36 A;  1UR0 A;  3E0L A;  5IM5 1;  3S46 A;  1TWI A;  3EDF A;  3L9C A;  2ATM A;  3R8H A;  4JTR A;  2PZN A;  3EA2 A;  3M46 A;  5DY2 A;  3IK2 A;  3DG3 A;  1FXP A;  1U1H A;  4YVX A;  5G2W A;  1E0U A;  1NF7 A;  3EOL A;  2ASH A;  3EAU A;  1R8L A;  4WKF A;  3U4A A;  4UTH A;  3W29 A;  4K1G A;  3E5B A;  4UMA A;  5D9N A;  1D8W A;  3ITL A;  3EMZ A;  3N2M A;  2BTM A;  2J4G A;  4GYP C;  2QCD A;  3QMR A;  3OG3 A;  1QJW A;  1IQ8 A;  3FXG A;  1U2Y A;  1EGV A;  1UJQ A;  4U3C A;  1YTE A;  1GVO A;  1V5X A;  4Y8F A;  2O9P A;  4KIE A;  3RU6 A;  3OTR A;  3UZY A;  2NW0 A;  1PTG A;  1CIU A;  1CXK A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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