1G4TA

Thiamin phosphate synthase
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
226
structure length
226
Chain Sequence
HGIRMTRISREMMKELLSVYFIMGSNNTKADPVTVVQKALKGGATLYQFREKGGDALTGEARIKFAEKAQAACREAGVPFIVNDDVELALNLKADGIHIGQEDANAKEVRAAIGDMILGVSAHTMSEVKQAEEDGADYVGLGPIYPTETKKDTRAVQGVSLIEAVRRQGISIPIVGIGGITIDNAAPVIQAGADGVSMISAISQAEDPESAARKFREEIQTYKTGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Bacillus subtilis
publication title Structural characterization of the enzyme-substrate, enzyme-intermediate, and enzyme-product complexes of thiamin phosphate synthase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIAMIN PHOSPHATE SYNTHASE
total genus 80
structure length 226
sequence length 226
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2000-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1g4tA00
3W85A 4JYFA 3TFXA 3MI2A 4KFOA 4M5PA 1KM2A 1X6UA 3W1XA 1JQVA 5K9CA 3IGSA 1XC4A 2J6XA 3MI6A 4O13A 2WSYA 3TUUA 1IXNA 1R46A 1K8XA 3NOEA 3ZS4A 2ZRVA 4AMAA 1EPXA 3N19B 4NUWA 2QCMA 2BX7A 4TO8A 1B3OA 3BG9A 4XBSA 4Z1BA 1DJNA 1F6PA 3W9ZA 2PE4A 5A5WA 2YDAA 1ICQA 1LBMA 3FA5A 3UXDA 4UTJA 1NF7A 1FCVA 2YW3A 4L4LA 3MHUA 4IMFA 1I4NA 3EXRA 4K36A 2ZRUA 3L0KA 4TIMA 4AXKA 4IGHA 1P1XA 4UCGA 3MI3A 3P60A 1GZGA 3NQ8A 3W86A 2VFHA 3SGUA 1NVMA 1DQXA 3ATYA 3C2VA 4HIBA 4O1CA 3DI1A 2G95A 3S8HA 3CB8A 5U7SA 3S5OA 5E0KA 1E51A 2E09A 3W6YA 1SR9A 1S5WA 2E6DA 2F84A 2CFFA 2R8WA 4Z1CA 2XN0A 2H8ZA 3QMSA 3L5MA 1QPOA 3NEVA 5G2WA 3LV5A 4I9AA 4E38A 5DCBA 3VNDA 1VS1A 3GXPA 3W73A 3DAQA 1WQ5A 1K7XA 4QM1A 3TQ0A 1UUMA 5D32A 5EKYA 4CNNA 1L6WA 3W70A 1W5NA 3QJAA 2ZRWA 1HL2A 3MW7A 3UWUA 4JYEA 3E49A 2NX3A 1HO4A 5AYZA 3OG3A 4N4PA 1TO3A 3GR7A 3GXTA 1WYIA 3PUDA 3A5VA 3KXQA 3W7OA 1R30A 2X1SA 2W0UA 1KFEA 2XN1A 4JN6A 4K8HA 5HUOA 1YTDA 4AWTA 1PIIA 1Q6QA 4BWLC 3BO9A 3RFAA 1YADA 2BTMA 1LYXA 3UQNA 1YTEA 3NPVA 4S1FA 4O53A 5G5IA 2TRSA 3G0XA 5G4EA 3STGA 3YPIA 3DFSA 1NF0A 3QPYA 3DI0A 1G7UA 1SW3A 5LSMA 4HN4A 5LKYA 3G1XA 1BTMA 2CZDA 4MZ1A 3CIWA 1W5QA 3M5VA 5IBXC 3S5YA 5G1TA 4O1BA 1ML1A 5FF2A 1OK6A 3LCWA 4RZ6A 4DPQA 3BLIA 1VCFA 1A50A 2OX1A 1JCYA 4PTNA 3G24A 3B04A 1JJKA 4OBTA 1N55A 1X7FA 4OT7A 3M41A 2A6LA 5G1YA 1JCXA 4ML9A 2VEPA 2WQPA 2JKAA 3NPXA 5U4NA 5J5RA 4JNMA 1TYGA 1D9EA 1LM1A 4MY8A 4JTLA 2RFGA 3FLUA 5FEPA 3TE9A 3EXTA 3ZR4A 6ALDA 2YZRA 4JS3A 2Z6JA 3TXVA 3DFPA 3BV4A 1YDNA 2DJLA 3TW7A 4MZ8A 2VEKA 2ZTJA 4UTWA 2CLFA 2BZNA 1VZWA 3HMJG 3FIGA 4UNLA 2W6RA 3KVJA 5AHLA 5F4SA 3O07A 1W3IA 4FXSA 2ZZ4A 2WV8A 4O50A 5AB3A 1ZY9A 3RNDA 1XCFA 3KAOA 3C61A 2ISSA 3NL2A 4ADUA 1N7KA 1XBYA 3A24A 5D2WA 4UIOA 3RLVA 3S1UA 2WJZA 1LCOA 4AF0B 3SW6A 1TRDA 5GVJA 3I7SA 4XKYB 4ORMA 4UTMA 3NVTA 5D09A 3TR2A 3OBKA 1QDSA 3FKRA 1XM3A 3B05A 4JIQA 1KA9F 5D2XA 2LLEA 2CWNA 4PFMA 2C19A 1U5JA 5KZMA 3LRLA 4H3DA 3T40A 3W2UA 4LS2A 4RXGA 2A6NA 1Y0EA 4XUGA 2B0MA 4OU1A 3V75A 2R91A 2HS8A 1VLIA 4LUJA 1M6JA 1U83A 3TMLA 5D04C 3D0CA 3PBVA 4GRSA 4HNNA 4POCA 1KTCA 4IXXA 3WFAA 2V2DA 2DZSA 3LRMA 5BMWA 2ZZ2A 3THQA 4QQ3A 2JGYA 1KFCA 3LX9A 1I2RA 4UFJA 2E6AA 4KFPA 1VC4A 4DO6A 6TIMA 2V82A 2B7OA 1WBJA 3LHZA 1FCUA 1KM1A 3PULA 1HO1A 3DFQA 5E93A 3M5XA 4N6FA 2YR1A 2ISWA 2CLIA 5E1QA 3MHFA 2Y88A 2IQTA 1OFEA 2RDUA 3LI0A 3M0ZA 3HGOA 1H62A 3LLDA 4UMAA 4EIVA 4ZQMA 1LRNA 1MEHA 4RJEA 5D03A 1VGAA 1TSIA 1M5WA 2HTMA 4DF1A 5HQEA 2Q8ZA 1KFKA 3NQDA 4JTGA 1Q6LA 4ADSA 3VI2A 2BXVA 2QCLA 1SO3A 2DZWA 1L6SA 3W1PA 5HR7A 3QQ0A 4DPPA 4RZ4A 1K7EA 2ZA3A 5AC6A 3DU0A 4ADTA 3B06A 3CWNA 1ZFJA 1LBFA 2BLEA 4JTJA 2NWRA 2CZEA 2NXGA 1FXPA 1IIGA 3C0JA 1YPIA 4NZFA 3O63A 3OEXA 1PHWA 1DKWA 2VOMA 4YCPA 4P2VA 1EEPA 2QR6A 4OWGA 3W2LA 4A22A 3W2KA 3W75A 2P0OA 2NUWA 1Z44A 1S3HA 2ZTKA 3LHTA 3W72A 4JR5A 5HUPA 4PEKA 3HG2A 3IVUA 5HWMA 4AH7A 3GB6A 3C56A 3U8GA 3NQEA 2R14A 2CLLA 4U4MA 1GPWA 3MP3A 3HPXA 4LS0A 1GVOA 2ATMA 1SSGA 1DORA 2CW6A 1SPQA 5F1UA 2CLOA 5LGZA 3NM1A 1SZEA 4BR1A 4K39A 5D02A 3W88A 1TREA 5HR6A 3U2OA 3G8RA 2RDWA 2C13A 4O4WA 1TTIA 3AJXA 4GUIA 4OGZA 3K30A 4OV9A 4UTTC 4IMGA 3HPZA 2QCHA 2FFCA 3Q58A 1QR7A 4WOZA 2QUVA 4UNKA 2Y61A 3W1TA 1YXYA 2DJXA 2JK2A 4IPIA 1ZAHA 4XTDA 3I7QA 3UWZA 2WNNA 2JBMA 3MBFA 4BI6A 3M44A 4DBDA 1GT8A 1QWGA 4JTIA 1QPQA 3HBLA 5KSWA 2NZLA 3LRKA 3EWZA 1XDMA 3QQ1A 1DV7A 3SY5A 4Y9AA 2E68A 1PVNA 5FEXA 2VFEA 4NJJA 1ZCOA 4IXHA 4N9DA 5K3VA 4LNYA 2RDTA 5DCEA 4JDBA 4PCFA 2CLHA 1B57A 1R47A 5I3IA 2B4GA 4WY0B 4TMBA 1GQNA 1G4EA 4AWSA 1A53A 5C55A 2E77A 3H54A 1VLWA 2G5WA 1VPXA 5DXXA 4N4QA 2RH9A 1W0MA 2ZCGA 2Z1BA 4D2JA 3R2GA 3C2FA 4NVTA 2FIQA 5AN7A 2EPHA 1J5TA 1OG0A 5HWJA 2A5HA 5J5DA 3S1WA 2G97A 2C18A 3QRHA 1L9WA 5F4XA 2XFWA 5HINA 5BMXA 3GDRA 3CHVA 2ZA1A 1CX9A 2GVJA 3M43A 4CQAA 3WK2A 5BOOA 1TPH1 5T26A 1OYBA 3IIPA 3OHIA 4QNEA 4GUJA 4LV4A 4ONVA 2ALDA 1PCKA 3STFA 4IJBA 1MZHA 1KV8A 1YDVA 1DOSA 4Z08A 4NXKA 5CG7A 5AFDA 4DEFA 1F05A 3OVPA 4MJMA 5EYWA 1MSSA 3HQ1A 4IMEA 2VFGA 3GKFA 5K9XA 1K02A 4JTEA 2PCQA 1V7YA 3PC0A 5AYYA 1LROA 3GNDA 4IQLA 2E5DA 3INPA 4JTTA 4EWND 1EX5A 1YPFA 3VE9A 3LCIA 1KM6A 3OVRA 1DQWA 1ZAJA 2QEZA 2H3DA 1CI1A 3EX2A 3E9AA 3DGRA 4HPXA 5CGQA 4KFNA 2GQ8A 5LGXA 3UWWA 1LP6A 3G1VA 2ATSA 3DENA 5DY2A 3IIXA 2EF9A 1NAL1 3B0PA 3TQKA 2E1DA 1QO5A 4HPJA 1C8VA 5CPMA 2QAPA 1H7RA 3M7WA 4LS1A 1B4KA 3UWYA 3DH7A 2OMAA 1P0KA 2KZHA 3G1AA 3STEA 5D2TA 1LDCA 4J9JA 4M7TA 3MUXA 1W3TA 5DLCA 1G7VA 4A2SA 3KFTA 4UFIA 2AAMA 3ABSA 1W5PA 2DP3A 3GXNA 1GTEA 3V1PA 1NEYA 4M19A 2E5CA 1FX6A 1FDYA 2QDHA 5KZDA 2E5BA 1XUZA 3T55A 4O0KA 4JEQA 4UFHA 1F6KA 1P0NA 4YL2A 3SR7A 4HT3A 2ABBA 1FWTA 2ZYFA 1FXQA 3KRSA 4FXRA 1ME8A 4OV4A 3B0UX 4O11A 3M6YA 4IMDA 1PCWA 1OYAA 1W5MA 1WX0A 3DFNA 3P5YA 4IUOA 3O6YX 1G6CA 3P8IA 1JUEA 2C15A 2FB3A 3P81A 4OHQA 1H1ZA 5K4ZA 4GNJA 1T0OA 1JVNA 1LORA 1WA3A 3QF0A 4N02A 3NQCA 4WQ6A 3ZFHA 2ZRXA 4JGDA 3BGJA 1XBXA 1L2UA 4PL2A 3T44A 5H2ZA 3NQFA 3MO7A 3WJYA 2C14A 1ZNNA 1MEWA 1LLZA 2VC6A 3BGGA 2A7NA 3LCGA 5AHNA 3TDFA 1H60A 2DZPA 1JQXA 3GR8A 3USBA 2W79A 4CNPA 3B4UA 4TR9A 3W7RA 3LXBA 4NNBA 1OX4B 1H5YA 1XDLA 1DHPA 4JX6A 4LRSA 3E12A 3HB9A 3PUEA 4UMCA 3QEZA 1PL9A 4X2RA 3M5ZA 4DF0A 4FNPA 1SO5A 3UWQA 3VE7A 4LOCA 4NJIA 1GVQA 4MYXA 3W7LA 1DVJA 4EF9A 1AG1O 4UTKA 1LOLA 3LXCA 1Z48A 2DZVA 2QUTA 2GOUA 5SWUA 3BLEA 2H3BA 1TTQA 1KBIA 2X16A 1RZMA 4O15A 5CKSA 5TIMA 1I45A 1K7FA 3N2MA 5L6UA 3S5ZA 3LCLA 2ABAA 3W1NA 2WOQA 3PSWA 1LLWA 1VCVA 1GG1A 5I3KA 1R2TA 4LC8A 2ZZ6A 4E2BA 2GJNA 3GAYA 2CLEA 1IXQA 1J2WA 3C2EA 3IV3A 1KFBA 3CC1A 4ICNA 4X22A 1SZFA 3NL5A 4QNWA 3CEUA 2V5LA 2WSQA 4I7VA 4FX8A 4X3ZA 1RD5A 2Q8LA 3HGSA 3EXSA 1GYLA 2DZXA 2DZUA 4B5NA 2I1OA 3FYOA 4Y90A 3TX9A 1XI3A 3PG9A 4MVAA 1QPRA 2X1RA 1LOQA 1TV8A 3EB2A 2X1TA 3W71A 2FB2A 2VXNA 4UR7A 4GJ1A 1F5ZA 1FBAA 2WO5A 3P84A 3ATZA 2ZQ0A 2OCZA 3M5YA 4Z1DA 1IXPA 3EWYA 1EP3A 3QH2A 4DXVA 3CPRA 1GVSA 2I9EA 1YTKA 1TPC1 2TPSA 3TSMA 4EOUA 4N2YA 4CCEA 2GVGA 3HIJA 5K7JA 3QMRA 3N73A 1FWWA 1WV2A 1M7PA 3KRUA 3QC3A 1JULA 4JTUA 3Q2DA 3AO0A 3G0UA 3NNTA 3FOKA 3L67A 4QITA 2VFDA 5KINA 4K37A 2OT1A 2GQAA 4JXCA 4RK8A 4CLMA 4MIMA 3W1LA 2FDSA 4UTWC 1T99A 3W2NA 3TA6A 4CQ9A 3P8JA 5CPOA 1B9BA 2ZZ7A 3CM4A 2DORA 3TSDA 1XFBA 3CLMA 5EA9A 4FX7A 1FDJA 1SZGA 1SU5A 4RV8A 3IRDA 3CQ0A 3GDTA 5AHEA 1B4EA 1GEQA 4E2DA 3TJXA 3KX6A 4ZQCA 3RMJA 3LI1A 4NJHA 1KTBA 1ONRA 4HSNA 3HGJA 3QSTA 4AHOA 2GQ9A 4M6PA 2Y7EA 5KMYA 1TPB1 3L21A 3B8DA 3GKAA 1ZAIA 4CCDA 2QAFA 3N3MA 4M7SA 4O17A 2VELA 2AQWA 3ZWTA 1JRBA 4HKPA 4UC5A 4O28A 5AHIA 3BW3A 3NXFA 1TV5A 5I3JA 3S42A 3NQMA 4K7VA 4BFAA 3GZ3A 1N8FA 2E6YA 4K38A 5AYXA 1GWJA 3IEBA 4K6AA 3W83A 4K8EA 5D33A 2EAWA 2PRHA 3TIMA 3LHWA 2TMDA 1F74A 2FPVA 1WOBA 2QCGA 2QCNA 4YLWA 2Y62A 2YPIA 1W8SA 4W9TA 4LUIA 1NSJA 2B7PA 1ZALA 3RK8A 5EPDA 2YW4A 1LBLA 1H7OA 1I2NA 4R7JA 3BW4A 1GG0A 3UXAA 3WK3A 3WJXA 2O7SA 3PG8A 3UYCA 4HNVA 3TXZA 4O4VA 3C8FA 3LCXA 5D38A 3W7JA 1TPEA 1ADOA 3PM6A 4NX5A 1R2SA 1K8ZA 3L9CA 1A5SA 3L65A 5AC8A 2TSYA 5EY5A 3FEMA 4LY8A 1FWNA 3PBWA 3U6WA 3EWBX 1R2RA 3SJ3A 3WK0A 1OVDA 1VYPX 1GYNA 3IGXA 2QCEA 2BSLA 4O19A 4YCOA 2WNZA 2FQIA 3MYPA 4IOTA 3W2JA 1EA0A 3RLUA 3FJLA 4LU0A 1UUOA 3TH6A 3LHVA 4Q33A 4FIRA 1IF2A 3W22A 3TAKA 1YXCA 4O1DA 3W7GA 3F4WA 1AW1A 4O54A 2ZRYA 2YYUA 3KVLA 4XBKA 2R94A 1H1YA 1ALDA 3H55A 1SFJA 4GWEA 4LVFA 1UASA 5D2YA 3MHGA 2CLMA 1KFLA 1OABA 3W7CA 4NX0A 1F7BA 5HULA 3E02A 4DF2A 1LTDA 1SUXA 3QW3A 4JTHA 5I3GA 3NPUA 4RCXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5EMU A;  4WJE A;  3DHF A;  2CU0 A;  5L9F A;  1FUY A;  4IX2 A;  4IWW A;  4ZZ9 A;  4ORI A;  3FJ6 A;  3LHY A;  5HMS A;  4FNU A;  4O0Z A;  3N9R A;  4JTS A;  1VCG A;  4N9B A;  1YLV A;  4WD0 A;  3UZ5 A;  3PY2 A;  2Y7G A;  4ZQO A;  4FNQ A;  3H53 A;  2B7N A;  3TNO A;  3MYO A;  3W7I A;  5FEZ A;  3HF3 A;  4L4M A;  3LBM A;  3UD6 A;  1GVR A;  1TTP A;  1VQT A;  4MKN A;  2ZRZ A;  1FWR A;  3LCF A;  3EX3 A;  1IIH A;  4Z0J A;  2FTP A;  1H7W A;  4RXF A;  4O18 A;  2Y63 A;  3KRZ A;  5H91 A;  1O94 A;  5F2G A;  3FS2 A;  1EP1 A;  4GUH A;  1KV5 A;  2WPB A;  2QCD A;  1XBZ A;  1G4S A;  1WBH A;  3HOJ A;  1W37 A;  3M16 A;  4Z0S A;  3R8R A;  1TPU A;  4JTK A;  1Q3N A;  1H7P A;  2VFI A;  3LOT A;  4MUZ A;  5BW6 A;  2QJI A;  5CZJ A;  4AAJ A;  2Y7F A;  3O6D A;  5EL1 A;  1TJR A;  4AEO A;  1EIX A;  3TMQ A;  3VFL A;  2A2I A;  2GJL A;  4EVZ A;  1QO2 A;  1T8X A;  4HHP A;  2J9Z A;  4NNA A;  1TPW A;  1LRT A;  5FF3 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2G3I A;  4ICM A;  4U5K A;  3MI2 A;  1KR0 A;  1X6U A;  4AZ6 A;  5K9C A;  5AYB A;  1PTD A;  3WH9 A;  4O13 A;  1MWO A;  3KTS A;  2OYK A;  1D7K A;  4ZOB A;  1K8X A;  3NOE A;  3H23 A;  1JNE A;  2QCM A;  2BX7 A;  1R7O A;  2ZXD A;  2XIS A;  5REQ B;  1V8E A;  3QXB A;  1DJN A;  3NZQ A;  3WLN A;  2YDA A;  3FA5 A;  3DFH A;  3Q45 A;  1GQK A;  1FCV A;  3L4U A;  4YHE A;  3VVG A;  3EXR A;  2GJP A;  4K36 A;  2ZRU A;  4TIM A;  1FHV A;  1EZW A;  5D9O A;  3MI3 A;  3NQ8 A;  3W86 A;  1IR1 A;  1XWY A;  3RCY A;  1WXY A;  4GQG A;  5I23 A;  3ATY A;  5I6S A;  4HIB A;  4O1C A;  2XH7 A;  3DI1 A;  4R88 A;  4GD0 A;  1EF2 A;  3FHQ A;  1E6X M;  3QHO A;  3S5O A;  2REQ A;  1E51 A;  5C2G A;  4TUF A;  2HBV A;  3O9N A;  1G94 A;  1E55 A;  4Z1C A;  2XN0 A;  4Q6J A;  3QMS A;  1QPO A;  3NEV A;  2P8C A;  1A3W A;  4XZW A;  5DCB A;  3TP4 A;  3GXP A;  1WQ5 A;  3TQ0 A;  4E4U A;  1UUM A;  5D32 A;  5EKY A;  1EH9 A;  3W70 A;  1W5N A;  4TTU A;  1IEI A;  3CNY A;  4AQL A;  2J8F A;  1TV4 A;  1H09 A;  4DJF D;  1WE5 A;  2PP1 A;  3AIS A;  4JYE A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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