1OK4A

Archaeal fructose 1,6-bisphosphate aldolase covalently bound to the substrate dihydroxyacetone phosphate
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
NLTEKFLRIFARRGKSIILAYDHGIEHGPADFMDNPDSADPEYILRLARDAGFDGVVFQRGIAEKYYDGSVPLILKLNGKTTLYNGEPVSVANCSVEEAVSLGASAVGYTIYPGSGFEWKMFEELARIKRDAVKFDLPLVVWSYPRGGKVVNETAPEIVAYAARIALELGADAMKIKYTGDPKTFSWAVKVAGKVPVLMSGGPKTKTEEDFLKQVEGVLEAGALGIAVGRNVWQRRDALKFARALAELVY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Thermoproteus tenax
publication title Crystal structure of an archaeal class I aldolase and the evolution of (betaalpha)8 barrel proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE CLASS I
total genus 90
structure length 250
sequence length 250
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2003-07-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1ok4A00
1GQNA 1VHCA 1FCVA 3G3MA 1RVGA 1F5ZA 1D3GA 2I14A 3EX2A 1VYPX 3OEXA 5CPMA 1G7UA 2RDWA 1LLZA 3USBA 1UASA 3W7MA 3NNTA 1LORA 4JIQA 4JDYA 3PG8A 3L2IA 4LS2A 5LNWA 1C29A 3W72A 3HPXA 3LHUA 3PBVA 4OQVA 4MY8A 3LXBA 2ZA1A 4FB7A 3AO0A 5FF4A 2CLFA 1SW3A 4JS3A 3T40A 1BWLA 1K02A 2ZZ6A 4LU0A 5I3FA 3THAA 3S42A 4UTTA 4M19A 3PBYA 4OWGA 2PCQA 4ICNA 3LRLA 4OE7A 2QCGA 3LCGA 4JTSA 3C2OA 5G2WA 4TU1A 3UPWA 4YCOA 4L4LA 1SZNA 5AB3A 2E77A 4LUIA 3S1VA 3NYZA 1SR9A 1UCWA 3KX6A 1WXJA 4I7WA 4O12A 2CLEA 1QFEA 4MZ8A 5IBXA 1ZHAA 1J5TA 4NXSA 3W3OA 3IIZA 2CLKA 3EWYA 3LCHA 1XBZA 5CZ0A 2ZZ5A 3BLIA 2CZEA 2A2IA 1TPDA 3W22A 5KSWA 2GVLA 5DY2A 2CLIA 5L6UA 4JN6A 1I45A 3LBMA 4NX0A 2E1DA 3CQ0A 3LDVA 5F2GA 1GPWA 4S2CA 3EXRA 2X1UA 3BARA 1GT8A 4TO8A 1SQ7A 3P62A 3QQ0A 2J24A 3MMTA 3NQMA 4TIMA 3ZR4A 4TMBA 2YFNA 4O0ZA 5D09A 3TFCA 3T78A 3GB6A 4DXVA 1Q6LA 1GJPA 1S3HA 3L0NA 3L67A 1DVJA 3INPA 4CCEA 1KM6A 3SY5A 3W7DA 2DZTA 2H3BA 1PV8A 3STEA 4LT9A 3NO5A 5KZDA 4NU7A 3QC3A 3HGRA 3CM4A 2ZYFA 1SFLA 2DU2A 4NZFA 1RV8A 2XN0A 5BRBA 3IGUA 4UFHA 4MOZA 2ZFAA 1GG0A 3W1AA 1Z42A 4LWWA 3W84A 1UUOA 4QQ3A 4DBDA 5HJLA 3A24A 4WJEA 3W75A 3FJLA 2QJHA 2Y70A 3NQ8A 2NXGA 2ZA3A 1HUVA 3UWWA 3PG9A 1WV2A 3I68A 4WD0A 3STCA 5H91A 2WO5A 4FNPA 1TTJA 1K8ZA 3LCFA 1JCYA 1SW7A 3NAVA 2QR6A 4O14A 1HO1A 3W7CA 5FF2A 3QMTA 3C4UA 1LROA 3LBCA 3IIXA 5LKYA 3QPYA 1G4PA 3HQ1A 1TJPA 4M5PA 1H1YA 3OA3A 2Y62A 4NZJA 1W37A 3HG4A 2X1SA 1OVDA 4O18A 1XCFA 4JY8A 3FIGA 2FLIA 4PTNA 3SI9A 5LHEA 2QEZA 2ZBTA 3HF3A 3N34A 3W2MA 3W7KA 3P60A 4A21A 3NDOA 1H7OA 3SSJA 1GYLA 2P1FA 2VFGA 3W1XA 4ZMGA 4LS1A 4IGHA 1M7OA 2X1TA 3TCEA 1J4EA 2D73A 1PCWA 1SZEA 3NA8A 3W1UA 2Y61A 1TJRA 2WSQA 3E12A 1LOSA 2R94A 3NQDA 5AFDA 1VCVA 3EKLA 2VOMA 5I3GA 3UWYA 1G6CA 3ZWSA 3R2GA 5LGXA 2QDGA 2ZZ2A 4ZQCA 3W2KA 4KFNA 4JYEA 1KM1A 3LHTA 3HG2A 2OCZA 3G1AA 2A7RA 1F7BA 2X16A 2JGQA 3M5VA 1VCGA 3B0VC 4BI7A 4JNMA 1GEQA 5CZSA 4QJ1A 4A2SA 3UQNA 3KVMA 4WY0A 4N4PA 4ADTA 3GNNA 1VJIA 3Q37A 2H90A 2ISSA 1OJXA 4O19A 2WSYA 3M5YA 1TMHA 2FPVA 3P8JA 3GYEA 4NJHA 1F76A 1GOXA 4IXHA 4DPPA 3KFTA 5A5WA 3G1VA 1OFQA 3P8IA 2VFEA 3EX3A 5BW6A 1A5AA 4OHQA 3CC1A 1LBLA 1VCFA 1DJNA 1RPXA 1QPRA 1VHNA 2PRMA 4HSOA 4ORMA 1H5YA 3G1XA 4KWWA 4RK8A 5KZEA 3G1HA 1SFJA 1NSJA 5K9XA 5HR6A 1SZGA 1LZOA 5BMXA 3PUDA 4K8HA 2BLEA 2Z6JA 1ZY9A 4XZ9A 3LV5A 3TAOA 1OFOA 3QSTA 3PF3A 2FIQA 3WK3A 2YYUA 1QO5A 2A85A 5CPNA 1DOSA 4JTFA 1ZAIA 4U28A 3UXDA 3G8RA 1NF7A 4CNOA 3UPBA 4LVGA 3VE7A 5D32A 3LI1A 3STGA 1FWNA 1OF8A 2VFHA 3MP3A 1QNVA 2DZPA 1S5WA 5G4WA 4HN4A 3D0CA 2ZCGA 3S1UA 4XUGA 4XWUA 4UTHA 2WNQA 2YW3A 2BTMA 4Y9AA 1D9EA 5DBTA 4PFMA 3IEBA 5F1VA 4S1FA 2AGKA 1H63A 1ONRA 3FKKA 2RDUA 4JYFA 5CZTA 4MIMA 5LNRA 3DENA 3O16A 2QUUA 5IM51 2QUTA 1O94A 1G7VA 1G69A 4O11A 1KM3A 3H55A 4K38A 1R2TA 3N9SA 2GUUA 4M6VA 4UXDA 4IX2A 4Y96A 1W31A 4MYXA 1I8JA 2ZRZA 5I3HA 3TROA 1YPIA 3TSDA 1GVFA 2Y6ZA 4DQWA 2EPHA 3F4WA 3WJWA 5C54A 5I3IA 1XDMA 1UUMA 3B06A 2ZRYA 4CNNA 4X3ZA 1ME9A 2JK2A 4GUFA 2A0NA 3SZ8A 1CX9A 1JULA 1GG1A 3FA5A 1JR1A 3TMQA 1WYIA 4WX2A 1VS1A 3U2OA 3KRSA 1WDWA 3O6YX 2FFCA 1LDCA 3C8FA 2F84A 5EBUA 1ZNNA 2QUVA 2YZRA 1XUZA 4O28A 3P67A 4YCPA 2J88A 3GR8A 3W1QA 3CB8A 3HBLA 3S1XA 4GUHA 3TUUA 5LGZA 1G4SA 4Z08A 5I3KA 1LRQA 1N8FA 2EF9A 1RQBA 3EKZA 2QCFA 2H8ZA 3PB0A 4XTIA 4YMZA 1L6WA 2GJLA 3VCRA 2G96A 3L68A 4DEFA 3DXIA 3Q94A 3UD6A 4MY1A 4LVAA 3BGGA 1P5BA 4LRTA 1KFCA 4P61A 3K30A 3GZ3A 2VENA 1CW2A 5G1YA 1K8XA 5D02A 2V9DA 3L66A 1JRCA 4IOTA 3HIJA 4NJKA 2C6QA 1YTDA 3SJ3A 4JTKA 1CI1A 2F7FA 1IXNA 1YXDA 3BW2A 4LTSA 1KBJA 3BK0A 4QNEA 1W0MA 4Y6GA 4Q33A 3W2NA 4X22A 4O15A 3T4CA 1KTCA 5K9CA 4FXSA 1O95A 3KOFA 3HMJG 5LNVA 4JY9A 3DI1A 4O4WA 1VH7A 4UMBA 2J9XA 3DKLA 3BGJA 1XXXA 4BI6A 2ZRVA 1QWGA 1T96A 1BEUA 1QPOA 4PODA 4M6PA 4K7YA 2VFIA 3W85A 4FO4A 1SO3A 4JEQA 4MKNA 2Y7GA 3V1PA 3M0ZA 5HINA 3WJXA 2GJNA 4BF9A 1NFBA 2KZHA 4BR1A 4HPJA 4R7JA 4M7SA 4OGZA 3WK0A 4NUWA 1W5MA 2FPYA 4ZQNA 1UBSA 4AF0A 1KM5A 1VRDA 5DXXA 3TQVA 2Y89A 5HNRA 4JTTA 5K3VA 3O15A 2FB2A 2YXGA 5GVJA 5K7JA 4QAIA 4O1CA 3PR2A 2QCEA 5HQEA 1PS9A 1EP2A 1SSDA 5AYYA 3R13A 5E1QA 1JQVA 1OYAA 3YPIA 2BZNA 3PSWA 1AK5A 2PRLA 4RZ5A 3NL5A 3PVFA 1QR7A 3IVTA 1W54A 3LTPA 3CEUA 4UNKA 5D03A 5DCDA 1KBIA 1B3OA 4LC8A 2GVJA 1KFLA 3CU2A 3P81A 2WPBA 1EWEA 2EAWA 4RLIA 2QCDA 1PCKA 4UFIA 2CZ5A 1T8XA 4LVDA 4NJGA 3S5OA 4WXYA 1BWKA 1TPB1 1KTNA 3P80A 4JTJA 3WFAA 3M44A 3O05A 5FI8A 1I2NA 2B7QA 4N6FA 3THQA 2CZFA 2C19A 2FDSA 4Y8FA 3KHJA 3CIXA 3F4NA 4IMFA 1V7YA 3GXTA 4JX4A 2GOUA 1I2RA 4LC6A 5D2XA 2WNNA 4AWSA 2R8WA 3M43A 4NNAA 5FEXA 1OFPA 2Q3OA 3C3NA 5HULA 1PHWA 2YX0A 1O5XA 1HG3A 4PL2A 2Z0IA 1RQEA 4XKYA 2RHGA 1H7WA 4B5NA 3UY7A 4IMEA 4KKXA 2NX9A 1O5KA 4I9AA 5LSMA 3NQCA 3TC6A 1SZFA 4RZ4A 3S5YA 5G5IA 3PC0A 2FJKA 5AHNA 1JCLA 2CU0A 3B05A 4FNRA 4ZQMA 1WBJA 2V8ZA 4NQ1A 4PA8A 3KXQA 1X1ZA 4WQ6A 3GNDA 2E6YA 3I7QA 1ME7A 4S2BA 2TRSA 2CZDA 3C6CA 4GC4A 3GAKA 1J2WA 1DHPA 3ABQA 3O6CA 1N55A 3L21A 4WUIA 2EGZA 1Z41A 3VNDA 3GK0A 1JUBA 3W1PA 5DLCA 1P4CA 4YLWA 1TRIA 4IUOA 4G1KA 4WOZA 1UB3A 1TCDA 3I6RA 3WK2A 4IWWA 2OT1A 1AL8A 4DELA 5TIMA 2DZWA 2Y88A 3PBWA 1Q6RA 5HR7A 2QCLA 3TU9A 1R46A 3TFXA 3AJXA 2OT0A 3QFEA 5K9DA 4MYAA 4YXGA 1YXYA 1F05A 1XKYA 1K8YA 5LHFA 4HNNA 1VQTA 4CQ8A 1YDNA 3NQ6A 3E96A 2YR1A 2H3DA 3SFKA 1TTIA 1IXPA 2BSLA 3LHWA 1WOAA 1FWWA 2VFDA 5KMYA 5FESA 3LV6A 1EEPA 4C1LA 2ZZ4A 1OFRA 3KVKA 2ABAA 4GBUA 1RR2A 4L4MA 5DY3A 2RDTA 4JXCA 1ALDA 3MHGA 4A29A 2ABBA 3OHIA 4GFSA 3L9CA 1XBVA 3ANYA 3QF0A 4UTTC 3EXTA 5FEWA 2QAFA 1ZAHA 3G0SA 3W7EA 4YL2A 4MY9A 4WY0B 1R2RA 3IGXA 4N4QA 3LLFA 4IJBA 1KFJA 2V0TA 5D38A 3NQ2A 1ICSA 4P2VA 2P10A 3CEPA 4O0KA 3VFLA 5AHLA 4RXGA 4FIQA 3NM1A 2XN2A 2QJIA 1RQHA 4UTWA 1I2OA 5CGQA 3KRZA 3GAYA 4O4VA 5IBXC 5BMWA 3ATYA 3M6YA 3UZJA 1ZFJA 4WOQA 1U5JA 3MI3A 4GUIA 3M47A 4ORIA 1TPUA 3A5VA 2CW6A 3O6DA 4O1BA 4H6KA 3MHFA 1MEIA 3EWXA 2V82A 4YWIA 1OFDA 1WAUA 1TB3A 4I7VA 1VR6A 3G18A 2NV2A 3OVRA 2I9EA 3OVPA 5F4WA 3DGRA 3UWZA 1K7XA 3W1MA 5AC8A 4GUJA 4BWLA 2ZTKA 2AQWA 4PH6A 1FXPA 3PSVA 5AN7A 3CTLA 4M7TA 4UUIA 1WX0A 3LXAA 4ZQOA 1KFBA 4JR5A 5EPDA 2E6AA 2YYTA 3GXPA 3WJYA 3VI2A 3W6YA 1H61A 3FLUA 5HUOA 3HG3A 3L5AA 1UJPA 2X30A 4N9BA 3LGEA 3NQGA 1QDSA 1FWTA 3PWAA 3V75A 1W3IA 3T44A 3C56A 3W1TA 2VEMA 1SO6A 4K7VA 1ML1A 1ZENA 2WV8A 2CWNA 3MYOA 4LRSA 2XN1A 3ABSA 4HPXA 3M9YA 1TQJA 1XBYA 3W71A 3LTSA 3IGSA 5CKSA 2DORA 3KVLA 3FYPA 2GQ8A 3TQKA 3TW6A 2Y7FA 1TSIA 5CSSA 3B0UX 1IXOA 4ZL1A 4RXFA 1E51A 4EWND 5FEZA 5K4XA 3LM7A 3NG3A 1OG0A 4UTKA 2NXHA 1GZGA 4TR9A 3PM6A 4QM1A 4LW7A 3N73A 1XL9A 3C0JA 5KITA 4UTWC 4JYDA 3U6WA 1GVRA 3QW3A 4LV4A 5E0KA 3UXAA 3S6DA 2O7QA 3R8RA 2E6FA 3O8AA 4E0CA 1W3NA 4Z1CA 3LI0A 2ZDRA 3P74A 1PL9A 3NL2A 4MLJA 5C5YA 4FEZA 3GKAA 1EA0A 1PIIA 3SR7A 3MUXA 5D37A 1FCQA 1VC4A 1QO2A 3G0UA 4EIVA 3UWQA 1H7NA 2OZ0A 4KFOA 4D2JA 1R30A 2C16A 3NL6A 3S0CA 3N19B 4UFJA 4RKAA 3W76A 1VYRA 3DI0A 1TTQA 1VGAA 2V2DA 4LS0A 1TPVA 5T26A 3PB2A 1ADOA 3LX9A 4IX0A 1KFEA 5C55A 5FF0A 3EEGA 5K4ZA 5DXYA 2E5DA 1B9BA 2OMAA 4A3UA 1EB3A 1PHQA 4NNBA 4XBSA 3QJAA 4EVZA 4E38A 3BVJA 2JKPA 4NJIA 1WA3A 4R33A 2C0AA 1B57A 1LOLA 1IGSA 4AMAA 3FYOA 4O57A 1LTDA 1F74A 4ADSA 2GQ9A 4IMCA 3JR2A 1QPNA 3L0GA 4POCA 3NVTA 1OHLA 2VEIA 1QOPA 5BOOA 4UMAA 1TPFA 3A9IA 4IXXA 4JD4A 3M16A 3G1YA 4OV4A 3EWUA 1H7XA 4HNVA 2TSYA 3CPRA 3H53A 4Q4KA 1OX4A 4CQ9A 4LV9A 2J9ZA 4O50A 4XQ6A 4NVTA 3LOTA 1YTKA 3RK8A 3UYCA 3LB0A 3NR0A 3GIYA 3P84A 3LTYA 3C2VA 2IQTA 3W74A 3WJZA 4GE8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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