2H8Z | Genus

Total Genus 130

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	130
sequence length	359
structure length	359
Chain Sequence	SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGYLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Xenobiotic reductase A in the degradation of quinoline by Pseudomonas putida 86: physiological function, structure and mechanism of 8-hydroxycoumarin reduction. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Xenobiotic reductase A
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas putida
total genus	130
structure length	359
sequence length	359
ec nomenclature
pdb deposition date	2006-06-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2h8zA00

1SUXA 5CGQA 4E0CA 1TV5A 4IMEA 3BO9A 4WOQA 4YMZA 1QCWA 3QSRA 4H3DA 3O6YX 2PRMA 2CZEA 2QCHA 1R2RA 3RLUA 4LT9A 1GWJA 4UFHA 3GAKA 3RU6A 1JJKA 2H8XA 3QMTA 1KTNA 7TIMA 1PE1A 1TPEA 3H55A 4E2DA 2E09A 1TO3A 3LXCA 1CI1A 3ZWTA 1R2SA 2BX7A 1KM1A 3RF9A 4GUHA 4LTSA 1ICSA 4JYFA 2QCFA 2ZTKA 3D0CA 2CLEA 4BWLA 1YPIA 4O53A 1OK6A 1TPVA 3LHUA 4I7UA 3UXDA 4IUOA 4GC4A 4DBEA 3CIWA 4MIMA 4K7YA 4QIUA 3CC1A 3C2RA 4MOZA 4N6EA 1K03A 4NQ1A 3MJYA 2QAFA 3NQGA 1TRIA 5TQLA 4YXGA 1TPDA 3CQ0A 3NL5A 1OF6A 4ALDA 1X8FA 3M7WA 2WNQA 2HS6A 1HG3A 3LXAA 4OQVA 1GEQA 5AHLA 3W75A 3L0NA 4PL2A 4JTKA 1W3TA 3PG9A 1ZAHA 5I3HA 1U83A 2TYSA 1A50A 3W1PA 3WFAA 3BARA 3E96A 2NX3A 3DH7A 4NJJA 4M6VA 2VXNA 3NXFA 1KLYA 2V0TA 1TQXA 4FNQA 1WAUA 1LRNA 3EX6A 1KBIA 5K9CA 2NZLA 2E5CA 5H91A 2FLIA 2XN0A 2EKCA 2FDSA 1L6WA 3M9YA 3SIZA 1QAPA 4KFPA 2P10A 4AWTA 4UTIA 3TKFA 3RMJA 5FEWA 3LCGA 3TUUA 3MWAA 4NZFA 4AXKA 4CNNA 2QJHA 2DZPA 1XBXA 2H8ZA 1LYXA 4QNEA 2RFGA 4Y90A 2OZ0A 3WK2A 1X6UA 3DFOA 1KFLA 4MYAA 3G0UA 3TSBA 3TNOA 1G4PA 1QOQA 1JQVA 3NQ6A 1KM4A 4RZ6A 4A29A 2BLEA 4ORMA 3W84A 1NFBA 2FPVA 4GFSA 3UWYA 2V5LA 2B7QA 1IXQA 3W83A 3H53A 1ZY9A 3S8HA 4KFNA 2BZNA 1FY6A 3U8GA 4AB4A 2OT1A 2GPTA 2ZBTA 4Y8FA 3IEBA 3NEVA 3QPYA 1TSIA 3U2OA 3MMTA 5BMWA 3LTSA 1BTMA 2DJLA 3VKJA 3ABSA 1FQ0A 2C0AA 3NM1A 1V7YA 4YCOA 4DF2A 3FYPA 1ZALA 1N7KA 3FKKA 3W1AA 3GVGA 1SZFA 3ATZA 3DFTA 4BI6A 3GDLA 1TPC1 4GUJA 1H51A 1OX4B 1LROA 4RZ5A 5F2GA 3L9CA 3O1NA 1W31A 2OX1A 2NX9A 3S5YA 4LW7A 4IXHA 1Y0EA 4RJEA 3Q58A 3G18A 1VHCA 2LLEA 3MI6A 3TK7A 4NNAA 5EYWA 3W2KA 2VEMA 1E51A 3GYEA 4ZZ9A 1I45A 2ZDRA 1FWWA 2QUTA 2QUVA 3FA5A 5A5WA 4JY9A 3N14A 3LV6A 1LDCA 4NX5A 2ZZ4A 4LV4A 5K9XA 2B4GA 3N9RA 3W6YA 5LGZA 4RCXA 1EUAA 5BW6A 2QCGA 5DCDA 3LHZA 4FNPA 5K2ZA 5KSWA 3LI1A 1F6KA 1GTEA 5D2TA 5FESA 3MHFA 1JCXA 1KA9F 1WQ5A 3NL2A 2GQ8A 3GKAA 3PY2A 1EWEA 1XFBA 3C6CA 4Z1AA 2OJPA 3HF3A 2ABBA 1TV8A 2DU2A 4W9TA 1YXCA 1L2UA 1XM3A 4R53A 2P0OA 4QQ3A 4FNUA 1G7VA 1GPWA 3TDFA 5KMYA 3B8DA 4JTGA 1H7PA 1OYBA 2X1UA 3BW2A 5IBXA 3N2MA 3W1QA 3O07A 4HSOA 3FEMA 3WK0A 1ICQA 2BSLA 2VFGA 3P74A 1KW1A 1X1OA 3UWUA 2AQWA 4MYXA 3DXIA 1O94A 3JR2A 4IOTA 5KINA 4WD0A 3VNDA 4FXRA 3LCLA 2R14A 2GJNA 4LV9A 3EB2A 3NQDA 4IWWA 4X3ZA 5I3JA 3MYPA 4O1BA 3I68A 1G4EA 3I7RA 3O06A 1Q45A 3LERA 1SW7A 1W56A 1OYCA 1VQTA 4QJ1A 3HG3A 3KVMA 1QO5A 1OYAA 1TRDA 4O57A 3OEXA 1GVQA 1KV8A 3W88A 1J4EA 1AL7A 2YPIA 5D32A 1EA0A 3CWOX 4BF9A 2VFFA 4LVBA 3E0IA 1IGSA 1MXSA 1H60A 3C3NA 5AB3A 3LTYA 1A5AA 1XDLA 2QKFA 1H61A 3OIXA 5EMUA 4ZVJA 1H1ZA 3TH6A 4DPPA 1G7UA 5F2IA 1DORA 4P61A 1VLWA 4A3UA 3O6DA 2Z1BA 4ZQPA 1W3IA 2KZHA 5AYXA 2PE4A 1SPQA 5AN7A 3W2LA 3P82A 4LS2A 1FDZA 4B5NA 5D04C 3HGOA 4O4WA 4GE8A 4GUGA 5T26A 3W7HA 4MLRA 4PTNA 5DBTA 3TSDA 2A0NA 3FYOA 3BW3A 1K7FA 2C19A 4UTWA 4O15A 1R46A 5I3GA 3SY5A 3IVSA 2ZQ0A 4JICA 1XC4A 1XUZA 4G1KA 2NUWA 4ORIA 3TFCA 3NQ7A 4JX6A 3NQFA 1PV8A 4CNOA 1THFD 2HMCA 2VFIA 2PRHA 3PB0A 1RD5A 3BG9A 3LCXA 3PVFA 3W7QA 1KM3A 3L2IA 2J9ZA 2QUUA 3LBCA 2ZZ6A 6ALDA 1HO4A 1U5JA 2C18A 1TB3A 3IVUA 3B4UA 3AO0A 2I14A 1WYIA 2E5BA 3G1YA 2YCEA 2ZRXA 1R2TA 3B03A 2PC4A 1B57A 3C8FA 3QRHA 1VS1A 4JIQA 3UZJA 4EOUA 3BVJA 1KFBA 1PHQA 4FXSA 3W7RA 3M1ZA 5SWUA 1DJNA 4CCCA 1S3HA 3EWXA 2QCCA 1TPUA 2WV8A 2Y6ZA 5EY5A 3BV4A 3HG4A 3KRZA 2UV8G 4TMCA 4AHPA 2A1YA 1EEPA 2ZA2A 2YSWA 2V82A 2VEKA 4JDYA 4UNKA 1GVOA 4LVAA 5D33A 3ZFHA 4TR9A 4MVAA 3OBKA 1HUVA 4OT7A 1RQEA 1GTHA 3C61A 2ALDA 1JCMP 2A6NA 2C15A 4I7WA 4NJGA 4RLIA 3C2EA 3CLMA 3SW6A 3W73A 1S5VA 4FIRA 1H1YA 3LLDA 3LDVA 3P80A 4AF0A 2YFOA 1WDWA 3P8JA 3KVLA 4MUZA 4O1CA 2CLKA 5HUPA 1Z42A 1O5XA 2EF9A 4X2RA 4EWND 4FX7A 2Y7EA 1UASA 4LVGA 3Q37A 1OJXA 4UMCA 4Q4KA 3UWWA 3QSTA 2E6FA 1EWDA 1F76A 4Z0SA 2CLHA 1SSGA 1GVFA 5DCBA 1I2OA 2NWSA 3S5OA 1W5PA 2RDUA 3F03K 4XBSA 4DEFA 2NV1A 3L21A 4LWWA 3OA3A 1H50A 5EA9A 4K7VA 2ISVA 3W2NA 1F2JA 1N55A 1H7XA 5I3KA 2GUUA 3MYOA 5D30A 1PHWA 2TPSA 1NF0A 4WQ6A 3M44A 4CNPA 1G6CA 3LHYA 4Y9AA 1C29A 3QMRA 3M47A 2FB3A 1Q6RA 2QDHA 3G22A 3JS3A 1MO0A 3NL6A 2WO5A 4H6KA 3LB0A 3HQ1A 1NEYA 5DY2A 3DFPA 1LORA 3LCFA 4IX0A 3M41A 1JRCA 2QCDA 4OBTA 5AHIA 3NG3A 3C4UA 5KZMA 4Z1BA 3R8RA 3L0KA 3M5YA 4LRSA 1LBMA 4DELA 2GQ9A 1ZJIA 3PULA 1O60A 5HNRA 5K7JA 3DENA 5CPNA 4K8EA 4XQ6A 5LNVA 1VZWA 3PM6A 3UZ5A 3W7PA 2G5WA 3M5VA 4LY8A 1SZEA 1NVMA 3GDMA 3PB2A 4DO6A 2ZA1A 3W87A 1T8XA 4H4IA 3CIXA 5I3IA 3DBPA 3TJXA 5FEPA 2AAMA 4UTTC 3CEPA 1QWGA 1DBTA 2W0UA 1PVNA 5H2ZA 1FDJA 3TQ0A 2YYTA 3GLCA 4LS1A 3LCWA 1MEHA 5D02A 4GNJA 2HS8A 2X2GA 2G95A 2CLMA 1KFCA 4O10A 2ZFAA 3BLEA 1W3NA 5FEZA 4DO4A 3PUOA 3G1SA 3USBA 1FCBA 4I7VA 4PFMA 4WJEA 4Z1CA 3LRKA 4XKYA 2ISSA 1JCNA 3PUEA 1P0KA 5FEXA 3C0JA 2XN2A 2ZZ7A 4PL1A 2NXIA 4UIOA 4LVFA 5DCEA 1O95A 3LRMA 3PSVA 4BFAA 4EIVA 4JXCA 5HULA 2FJKA 3TW6A 1OFPA 1FCQA 3STEA 1OFOA 4TU1A 2V30A 4O28A 1BKSA 2ATMA 3SGUA 3LHWA 4WY0B 3W1NA 1OFAA 1K8YA 4Z1DA 3TQVA 1W54A 2Y61A 3LGEA 1OFEA 6TIMA 2Z6JA 2Y88A 3DI1A 4JGDA 3PBUA 4MZ1A 1FCVA 3W7EA 3HBLA 3SSJA 1GG0A 4YCPA 1A5BA 2E1DA 3I65A 4BWLC 3CPRA 3VFLA 3GK0A 1SZNA 4MLJA 3G1AA 2H90A 4NJIA 2WJZA 3GNNA 1UJPA 1QFEA 1AMKA 4K36A 3TV8A 1JVNA 2C16A 3A5VA 4HPXA 1YTEA 4O1DA 4M5PA 1DJQA 1AW2A 1W1ZA 3EX4A 4QISA 1JUBA 2Y7FA 3L5AA 1GOXA 1ME7A 4O50A 2Z0IA 1A5SA 1WOBA 3INPA 1EUNA 2WSYA 3YPIA 2YXGA 2V2HA 3ABQA 1EPXA 4NJKA 3THAA 1FDYA 3W71A 1H7WA 1XCFA 3FS2A 3EWWA 5HMSA 3S1XA 3JRKA 4NUWA 1FUYA 3GXNA 5CPLA 3W7GA 3KHJA 5HINA 2TMDA 1KM6A 2RH9A 2G96A 4E38A 1W37A 3GR8A 5EKYA 5D2XA 1LRQA 3GKFA 2J27A 2Y70A 3F1QA 2NX1A 3NQMA 3PR2A 4XZ9A 1VRDA 5G4EA 2VEIA 3STGA 3PBVA 2CLLA 3I7QA 5AYZA 3ZS4A 4Z0JA 1L6SA 4XUGA 3S9YA 3B04A 3CEUA 5TBOA 4BI7A 1QPOA 3W2UA 4MJZA 3STCA 4M19A 3UPBA 3UPWA 3NOEA 4RX0A 2GVGA 4O17A 3LHVA 3QZEA 3W7MA 2YFNA 4TMBA 3NR0A 2DP3A 1RQBA 4NVTA 3A5FA 2DZVA 5FF2A 1KFJA 1F7BA 3TAOA 3W70A 1LLWA 3DGRA 2Q3RA 2WOQA 4N02A 4UFJA 1DL3A 3B0PA 1YYAA 4HNTA 3K30A 1TJPA 5BMXA 1LLZA 3AJXA 1Q6QA 1XUUA 2VFDA 5AHFA 1S5TA 5G2IA 2YX0A 3HJZA 3C56A 1LOSA 2B7PA 1DV7A 2QJIA 4ZQMA 2ZZ2A 4DF1A 3OVRA 2GQAA 2CZDA 3IV3A 3W07A 2YW4A 2H3BA 5E93A 1OG0A 2OMAA 5DXYA 2BTMA 4MY9A 3MO7A 3GAYA 1MEWA 3TC6A 2CLOA 1ZAIA 1M5WA 1W8SA 2J9XA 4JN6A 2VEPA 1KFKA 4QSHA 5FF3A 1UBSA 1VH7A 4UFIA 2QCLA 1B3OA 4XTDA 1QDSA 3VE9A 3SZ8A 5LGXA 5FF4A 1TIMA 4QITA 4O8RA 3MW7A 5C6MA 3ANYA 1JQXA 3CB8A 3EWZA 2W6RA 4FEZA 5CZJA 1VPXA 3G1HA 3UD6A 1B4EA 1XL9A 2DZSA 5LZLA 3TAKA 1VHNA 2GOUA 2X1TA 2WQPA 1EIXA 4X9SA 3NPVA 1B4KA 3WJWA 1ML1A 1QPNA 4UMBA 3FLUA 2X30A 2ZTJA 3LX9A 4QNWA 4ADSA 4DBDA 3TMLA 1YDVA 2CW6A 2Q3OA 3WK3A 2V2DA 3KRSA 5AC7A 2QCEA 3FKRA 1KV5A 2EAWA 4LRTA 5IBXC 4LU0A 4CCEA 1FCUA 1QO2A 3W85A 4UCGA 3PBYA 1VLIA 1R47A 2NV2A 4ML9A 4UUIA 5D2YA 1T96A 2FB2A 5LHFA 1SFJA 3T78A 1UUMA 1PIIA 2D73A 1Z41A 3NQCA 1DKWA 5EL1A 1Q6LA 3EX2A 3QM3A 4LC6A 1I2PA 4JDBA 4TO8A 3DKLA 1SO4A 2I9EA 1LOQA 3QEZA 4MPQA 2C1HA 2NLIA 1H7NA 3W7KA 4JY8A 4HNNA 3EX1A 4BR1A 2IQTA 4NNCA 4FIQA 4O4VA 4E2BA 1K02A 3MBDA 3A23A 3BG3A 3Q2DA 2E5DA 1AL8A 3QC3A 3FJLA 3OVQA 3MHUA 1JCYA 5A8GA 4R7JA 2V2CA 1RPXA 4PCFA 4JEQA 3DFQA 1RV8A 3G1FA 4J9JA 4JTLA 3NQEA 3C2VA 4LC8A 3M5ZA 4P2VA 4RXFA 2V81A 3B0VC 2VELA 1YLVA 1SZGA 5GVJA 3W1TA 4FX8A 4O0ZA 3QFEA 2C6QA 2J88A 3ABOA 1SO5A 4NJHA 4FX6M 3LCIA 4N2YA 1UUOA 4UTWC 1A53A 5KZDA 1TQJA 5F4SA 1TPH1 5DN1A 1G67A 3QMSA 3PG8A 1EB3A 3TXVA 3MP5A 3UWZA 4N4QA 1KTBA 1AW5A 1NF7A 3FFSA 3N9SA 1YADA 3RFAA 1SQ7A 5TIMA 3RLVA 1AK5A 2B7NA 4IQLA 4JTFA 4WUIA 1TPB1 4GUIA 2QJGA 1N8FA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2H8ZA

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