4AWTA

Crystal structure of the reduced shewanella yellow enzyme 1 (sye1) m25l mutant
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
QSLFQPITLGALTLKNRIVMPPLTRSRASQPGDVANHMMAIYYAQRASAGLIVSEGTQISPTAKGYAWTPGIYTPEQIAGWRIVTEAVHAKGCAIFAQLWHVGRVTHPDNIDGQQPISSSTLKAENVKVFVDNGSDEPGFVDVAVPRAMTKADIAQVIADYRQAALNAMEAGFDGIELHAANGYLINQFIDSEANNRSDEYGGSLENRLRFLDEVVAALVDAIGAERVGVRLAPLTTLNGTVDADPILTYTAAAALLNKHRIVYLHIAEVDWDDAPDTPVSFKRALREAYQGVLIYAGRYNAEKAEQAINDGLADMIGFGRPFIANPDLPERLRHGYPLAEHVPATLFGGGEKGLTDYPTYQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Shewanella oneidensis
publication title Modulation of Isoalloxazine Ring Planarity Influences Fmn Electronic Properties in Old Yellow Enzymes
rcsb
molecule keywords SYE1
total genus 140
structure length 363
sequence length 363
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-06-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4awtA00
1G7UA 1FWWA 1MSSA 1T0OA 1TPVA 1ZHAA 4AF0A 3W85A 2QCLA 1DJQA 1YDVA 1R47A 3P7YA 4IMDA 4UCGA 3Q2DA 3VFLA 4O52A 1XUUA 1TV5A 1OFPA 3OG3A 2J6XA 2VEPA 4D2JA 1G4TA 1WOBA 3NYZA 3MYOA 1OFEA 4CCEA 1WV2A 2BX7A 2ZA3A 4QIUA 5J5DA 3L67A 4TMBA 3SIZA 1JULA 3W84A 1XI3A 3U8GA 3NL6A 4RK8A 1SSDA 3L0NA 1BWKA 3NQEA 1T99A 2V2DA 3M0ZA 3RU6A 4DEFA 2CWNA 4KFPA 1XFBA 4NNAA 1FWNA 3HGSA 3W7LA 1A5CA 4CNPA 1YLVA 3I7SA 3NZ1A 3ELFA 2NUYA 1UBSA 3CB8A 5F1VA 3VCRA 1H61A 3ANYA 4Z1CA 5D2TA 1LTDA 1SW0A 3W7RA 2CLFA 3ABSA 2VEMA 3K30A 1SZNA 1G4SA 2ZRUA 1VH7A 3W1QA 1LRQA 3LBCA 4FEZA 4Z08A 3T78A 3G0XA 4UIOA 2DZTA 3CEUA 4O8RA 4IX2A 5HMSA 4FHAA 4MPQA 4XWUA 3P62A 1KW1A 1K7FA 4FX8A 4DBEA 3TAKA 2E68A 3CPRA 4LTSA 2F84A 4XBKA 4WD0A 2QCFA 3GXTA 5H2ZA 4KWVA 5E1QA 3EWYA 4QNEA 5FEWA 3FJLA 4IXHA 3IVTA 3HPXA 2R8WA 3IGUA 2Z1BA 1IF2A 2X1SA 3R89A 3W22A 4OQVA 3N3MA 3DAQA 4EIVA 5TIMA 3G3DA 3S8HA 3CEPA 3C52A 1W3IA 1PHWA 3LTYA 4NX0A 1OX4B 4O4WA 2PC4A 4RKAA 2Y7GA 2QCNA 3C3NA 4UTJA 2OCZA 3LV6A 1ICQA 1OJXA 2QCGA 4UTMA 4O19A 5FEPA 2FB2A 2O7SA 1RQHA 1S5TA 1XBYA 4CCCA 4Z0SA 3N19B 3O16A 4MY9A 1WBJA 5K9XA 4Y96A 3KVLA 4WQ6A 1WX0A 3NPUA 1KFKA 4JS3A 3TCEA 1H1YA 3L21A 3PC0A 3W1RA 3KOFA 1WA3A 5D2WA 4NNBA 1K03A 2H3DA 1MO0A 3MI6A 1KA9F 3HMJG 5BNKA 3EB2A 2J9ZA 1EA0A 3JS3A 1AW1A 1QDSA 2Y70A 2DJLA 3W7HA 2ZRZA 1DHPA 4I7UA 5LNSA 1K8XA 1Z42A 2O7QA 3RMJA 4MKNA 2FPTA 2J88A 2OMAA 4BWLC 3LHUA 2YYUA 1HO4A 1KTBA 2A7PA 2B7PA 4LVDA 3M5XA 2HSAA 2I14A 3KXQA 1V7YA 4RCXA 2JK2A 1H7RA 1KM2A 1O94A 3R13A 2HS6A 4JTUA 3TXVA 1OK4A 4NT0A 1F6KA 4PTNA 4TR9A 3LERA 2V9DA 1PL9A 4RX0A 5A5WA 1XCFA 1YTDA 1B57A 3EKZA 3Q94A 1H7XA 4KFNA 1LYXA 3N2MA 1KTCA 2DZXA 2BXVA 3LI0A 4GBUA 1SFJA 1O5XA 1KM3A 1TTPA 4MYXA 3N14A 3IRDA 3PUDA 1FCQA 2V8ZA 3SGUA 1W3TA 4IMFA 5BMWA 2NV2A 3M5ZA 2ZDRA 1L6WA 2JKEA 3IVSA 3QQ0A 4LOCA 4K37A 3WJSA 5D38A 4WY0F 4NJIA 3BPWA 1TPUA 2P0OA 4IMEA 5AC7A 3LCFA 1NAL1 2C16A 4UUIA 2ZRXA 2Y63A 1L9WA 4TU1A 1VYSX 1TJRA 3EX2A 2VFIA 2D73A 5KMYA 3RNDA 2Z6JA 1BTMA 1OHLA 4JYFA 1S5VA 3G8EA 4FB7A 1SO3A 3QZEA 5LNWA 1YDNA 3B04A 2GVLA 3EXSA 1OFOA 1MZHA 1Q6LA 3W1LA 3G1YA 3NQ2A 3DFQA 3LXBA 1UASA 5FEXA 3MI3A 3HGJA 1TV8A 4AHOA 1PE1A 2NZLA 5EBUA 1B4KA 1DV7A 1RPXA 3EXRA 4K6AA 3ATZA 4PODA 3T55A 3LHZA 4Q32A 2ATSA 4KWWA 1X8FA 5HUPA 4JTSA 3M6YA 3DBPA 4AXKA 4OU1A 4MY8A 4PEKA 1TPC1 2WPBA 3A5VA 1A5AA 1ME7A 1VCFA 2A6NA 4S1FA 2XFWA 3LCHA 4MFEA 1KFCA 4ZQRA 1M6JA 1XM3A 3N2XA 5LNVA 2DZSA 5EKYA 1OX5A 2V0TA 1M5WA 4U4MA 2B7OA 3TJLA 4IMCA 3STGA 3S5ZA 3LRMA 1X7FA 5D2XA 4DXVA 2VFGA 4TIMA 1DOSA 2Y7DA 1OFBA 2DZUA 4O50A 4N4PA 1SZGA 1LLWA 2ZZ5A 3ZR4A 3P5ZA 1GQNA 2YPIA 4BF9A 1F7BA 3TW6A 1PCWA 2VFEA 3NNTA 3NQDA 1ALDA 1VLIA 2OT1A 5K9DA 3TW7A 4R33A 2OZ0A 1TRDA 3DKJA 4KFOA 4GXMA 5DXYA 3NAVA 4DO5A 4H6KA 5G5IA 3L9CA 5DLCA 3QEZA 5D37A 5F4XA 3W2UA 4ADSA 3DFTA 3EX3A 2DP3A 2Q8ZA 4ORMA 3HQ1A 1TYGA 2QKFA 3QH2A 3W88A 5EMUA 2H3BA 4GWEA 1KFLA 3C61A 2J27A 3FOKA 4I9AA 1ZCOA 1OFQA 3W72A 4XBSA 5U4NA 3W6YA 5D03A 1QR7A 4RJEA 3TFXA 1VLWA 3HG5A 4IPJA 5CG7A 1QFEA 4YMZA 4A21A 3NQVA 3QMSA 5I3HA 3P60A 1LM1A 4Y9AA 1O60A 2WV8A 1D9EA 1ZENA 4MZYA 3MI2A 1P5BA 3DI1A 3C8FA 3FFSA 3B4UA 2QR6A 3F03K 3NPXA 3GZ3A 3UYCA 1IXNA 1TTQA 3NR0A 3PM6A 4L4MA 1YXCA 1R30A 3ZS4A 4HNNA 1Q45A 3KHJA 2ZZ7A 3TXZA 2EKCA 5G2IA 1O95A 1TQXA 1AG1O 2R94A 3QMTA 4BWLA 2CW6A 3KRSA 6TIMA 3MHFA 4A3UA 4BI7A 2GQ8A 2OT0A 3W1MA 3C56A 5D04C 3BGGA 2LLEA 1SPQA 1JCMP 3BVJA 1VPXA 4A2RA 3GKFA 1LRNA 2RFGA 1TSIA 5AOUA 3GAKA 1RVGA 1OFAA 3S1UA 4GUHA 1A53A 1NF7A 2H8ZA 3A9IA 2A2IA 3QMRA 1VCGA 2CFFA 1YYAA 2VEKA 3MP5A 2ISWA 5H91A 1SZFA 3HOJA 3W83A 2NV1A 3R8RA 1BWLA 3THQA 3LI1A 2QJGA 3RFAA 1I45A 3N9RA 2ZFAA 3WJYA 1FWRA 3L5LA 4K39A 3HPZA 3W2JA 1QPQA 4J9JA 1TTIA 1W5NA 1LCOA 3ABQA 2A6LA 5DY3A 3CIXA 5AYYA 2W79A 3BARA 1PVNA 3NXFA 4JTHA 5HQEA 3NOEA 2Q8LA 3BV4A 5T26A 3A5FA 3W7DA 1TPH1 1QAPA 3FYOA 4CLMA 5LZLA 3B0PA 4JICA 1IIGA 4AHQA 3E96A 1YADA 3O15A 1VC4A 1YPFA 1Q6OA 3BG5A 4BFAA 1KM1A 4PH6A 3TNOA 1GG0A 3P84A 5K7JA 1GJPA 3MBFA 3TSDA 1GPWA 5AN7A 3TFCA 3W1XA 4XTDA 2I9EA 2ATMA 4M6PA 1RR2A 5GVJA 3UZ5A 3E49A 4JR5A 2ZTKA 3FA5A 2BWGA 3RK8A 4YLWA 1IGSA 4KKXA 1W5PA 2QUUA 7TIMA 3HG3A 3BLFA 3TX9A 5DBUA 3EWBX 3W1AA 4N6EA 3V75A 4LS2A 1EX5A 4IMGA 4FX7A 4WXZA 1W56A 2VC6A 5A8GA 1TPEA 5D2YA 2V2CA 3DFNA 3TDFA 2ZYFA 3GDTA 1SU5A 5D32A 3UWQA 4LS1A 4MLRA 5F4SA 2YX0A 3BLIA 4O53A 2RHGA 4Z1BA 4XTIA 3W7KA 3TROA 4AF0B 4O14A 1L6SA 1H7WA 4UC5A 1YDOA 3GAYA 1XBZA 4DO6A 2EAWA 2E5CA 3OIXA 3B0UX 3CT7A 1DJNA 4ZQPA 1JRCA 3LCIA 4FIRA 1O4UA 1TPWA 1TPDA 1OVDA 2YGYA 1K8YA 1H51A 4CQ8A 3W07A 3NO5A 5FEZA 2QUTA 1PS9A 2X1RA 3DZ1A 3IIPA 2OX1A 3P81A 1XBVA 1K3UA 3G1XA 3SSJA 1MXSA 2YDAA 2BZNA 2Q3RA 4ZQMA 4O0KA 4O54A 3W73A 3W75A 2C3ZA 4NJJA 1FBAA 1QOPA 3DFOA 3CTLA 2J9XA 1G69A 3O6DA 3W7IA 1EIXA 4O1BA 3MP3A 3G1VA 3LGEA 3SR7A 2Y6ZA 1F76A 3MWAA 4Y90A 4JY9A 5AHLA 3T44A 2QCCA 5BW6A 4NJKA 2PURA 3A23A 4LS0A 4RZ5A 1I4NA 1EB3A 1CI1A 2DU2A 3BG9A 2Y88A 1GYNA 1VCVA 5FI8A 2RDTA 3LB0A 2A0NA 4DO4A 4H3DA 2ISVA 5G4WA 4JYDA 3S42A 3R2GA 5HINA 3I7RA 4OBTA 1TV7A 4O16A 3I6RA 2ZZ1A 1LOLA 1DBTA 1ZJIA 1OYAA 3W1PA 3QM3A 1J5TA 1H7OA 3UPWA 2Z0IA 3M43A 1YPIA 1XDMA 4QAIA 3FEMA 2CLLA 3DU0A 5DCEA 4W9TA 5K4XA 1N8FA 3OEXA 3G18A 2A85A 2GVJA 2CZ5A 4FNTA 3TR2A 3W7PA 4XKYB 1N7KA 4XKYA 3GDMA 3W2MA 2CLMA 4OV9A 5EY5A 4FO4A 2CLKA 4MVAA 5LHEA 3USBA 3LCGA 1F74A 4GC4A 5CZSA 1A5SA 2JGQA 4UFIA 2B4GA 4M7SA 3B06A 3R12A 3CLMA 3L0KA 2G95A 4O1AA 4ZMGA 4R34A 3OBKA 5LGXA 4RXGA 3IV3A 1GVQA 1RV8A 4P61A 1C9DA 1EWDA 3IGXA 1FQ0A 4ZVJA 1G4EA 3PBWA 4DBDA 4DF1A 1ICSA 3UZJA 5HWMA 1B9BA 4ML9A 4YXGA 2DORA 3DFPA 2YZRA 3EKLA 4M6VA 4UTKA 4DPPA 3NQCA 2TMDA 3LM7A 3VKJA 4A2SA 2E6DA 3P74A 5F2GA 3W1TA 2QCDB 2QCDA 4HIBA 2J24A 2TPSA 1W54A 1XDLA 3HJZA 4DQWA 4TMCA 1TMHA 5D05A 3KVMA 2P1FA 5BRBA 2BSLA 2NX1A 4HPJA 1F2JA 5CKSA 4GUJA 1R2SA 1GYLA 3W1UA 2E6FA 1K7EA 3EX4A 4O1DA 1FXPA 4QJ1A 4C1KA 2A1YA 4QISA 1DKWA 4K8HA 1IXOA 4WJEA 1LBMA 3LTPA 1SO4A 4WOQA 3C2EA 2Q3OA 3CWOX 4HKPA 4LVFA 2B7NA 1OFRA 4QITA 2VXNA 3STFA 3DFSA 2V82A 1LP6A 2XN0A 3QRHA 3U6WA 4UFLA 1XC4A 1SUXA 3GIYA 3EWZA 3TMLA 4FNPA 3G1AA 4N9EA 5CPOA 1HO1A 1LDCA 4JYEA 1YTEA 4M19A 1M7PA 5D2VA 5AHMA 2VELA 5F2MA 2WQPA 3PY2A 3LXAA 3T7VA 1XUZA 1FUYA 3M7WA 3EWUA 3L2IA 3TA6A 3LRLA 2ZCGA 4HSNA 3NM1A 4Q33A 3UWVA 4ORIA 3GKAA 1Z48A 4NZJA 3UXAA 1KM4A 2V2HA 2TYSA 1JCXA 1W5QA 3LOTA 3PSWA 3O07A 3DHFA 3IIOA 4UTWC 1TO3A 4P2VA 3AO0A 1RD5A 5FF2A 1VR6A 4LU0A 1FXQA 1SQ7A 2PCQA 3W1NA 3LLDA 1IXQA 4GNJA 4JTEA 3OHIA 3H53A 4IWWA 1VQTA 1OX6A 4NXSA 3UPBA 3W71A 4NZFA 4UFMA 3O06A 4NJHA 1FWSA 3C4UA 3DGRA 4N9BA 1LLZA 1Y0EA 5DCBA 3G1HA 4JTLA 1K7XA 3N34A 3PUEA 3TH6A 1J2WA 3C2VA 3L5MA 3LXCA 5CZJA 1Q3NA 2WSYA 5HJLA 1TB3A 1H1ZA 3P61A 3SFKA 5HWNA 2QAFA 3L5AA 4FX6M 2CLOA 4Z1DA 1ME8A 1YXDA 2ZRVA 1OF8A 2P10A 1B3OA 1LOSA 2V5LA 4BI5A 3W7OA 4UMCA 2NWSA 4O10A 3LHWA 4FXRA 2E6YA 3N73A 3LTSA 4FF7A 2Y61A 1NVMA 3THAA 2G97A 3LBMA 3CIWA 4LW7A 5CPMA 4UR7A 1GVRA 2V5BA 3LHYA 3IIXA 1GT8A 4O13A 1QPOA 4BR1A 2PRHA 2QCEA 2PRMA 1JCJA 3MP4A 4HN4A 3EXTA 3O05A 3MO7A 1EPXA 1XKYA 3M41A 1EUAA 3W70A 2NX3A 2V30A 3SW6A 3KRZA 3VE9A 3E0IA 2YW4A 4K7YA 3W2KA 2GJNA 1JRBA 3M1ZA 1LROA 3UWWA 2A21A 3HG4A 3PBYA 1YXYA 1D3HA 2X1UA 3ABRA 3TQ0A 4JTJA 5I3KA 1SO6A 4GE8A 1LRTA 3NL5A 2GQ9A 3C0JA 1SR9A 3VE7A 4IX0A 5LGZA 2OJPA 4AWSA 1M7OA 1AW2A 4FNSA 4JXCA 4K36A 4LUJA 3HGRA 4JTGA 3GDRA 4NUWA 2C18A 3O63A 1EUNA 3M9YA 5AC8A 3HIJA 3LX9A 2CZFA 2KZHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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