3C61 | Genus

Total Genus 106

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	106
sequence length	314
structure length	314
Chain Sequence	TMSLQVDLLNNTFANPFMNAAGVMCSTTEDLVAMTESASGSLVSKSCTPALREGNPTPRYRALPLGSINSMGLPNNGFDFYLAYAAEQHDYGRKPLFLSMSGLSVRENVEMCKRLAAVATEKGVILELNLSCPNVPGKPQVAYDFDAMRQCLTAVSEVYPHSFGVKMPPYFDFAHFDAAAEILNEFPQVQFITCINSIGNGLVIDAETESVVIKPKQGFGGLGGRYVLPTALANVNAFYRRCPGKLIFGCGGVYTGEDAFLHVLAGASMVQVGTALHEEGPAIFERLTAELLDVMAKKGYQTLDEFRGKVRTLD

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Leishmania donovani
publication title	Dihydroorotate dehydrogenase from Leishmania donovani. rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase
total genus	106
structure length	314
sequence length	314
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 1.3.99.11: Transferred entry: 1.3.5.2.
pdb deposition date	2008-02-01

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3c61A02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3c61A01

5KZDA 1L9WA 3O6DA 2RDTA 2FPTA 4PODA 3GAYA 1TTPA 4HPXA 1W3TA 4JYEA 5E1QA 1JJKA 2H3BA 1SPQA 5IBXA 4JY8A 5TQLA 3W86A 2Q8ZA 1DVJA 1LOQA 3LI1A 1YPFA 3O07A 1A50A 5K4XA 3NEVA 4LY8A 1JCNA 3LHVA 3NQDA 3C6CA 1XCFA 3E0IA 1F7BA 3MHFA 1WXJA 2E6FA 1XXXA 1XI3A 4B5NA 4IWWA 1W8SA 4LVBA 1JCYA 3H54A 4ICNA 1AMKA 4A2SA 3W85A 2A85A 4MY9A 3TK7A 1P0NA 1R30A 4HKPA 4N9CA 4FXSA 3E02A 1M7PA 4O57A 2NXGA 1X8FA 5KZMA 2WKJA 3MBDA 5HMSA 5BNKA 3DFSA 4GUIA 1TYGA 2EAWA 5L9FA 1ONRA 1R47A 3EXRA 1TPWA 4UIOA 2ZTKA 1LTDA 4GE8A 1MZHA 3W7MA 4O8RA 2ZZ6A 1RVGA 4ZMGA 2HMCA 4OQVA 3W1RA 4LVFA 5AFDA 1OVDA 4C1LA 5CSSA 3BK0A 1B57A 3GLCA 3GDLA 3ZWTA 1O95A 4MY8A 3TA6A 5U4NA 3P67A 1X1ZA 1GVSA 4PFMA 1C29A 2WSQA 3TSMA 3GR7A 2YCEA 4JX5A 4Z0JA 1TRDA 3SFKA 4JX4A 2OMAA 4NZFA 2ZDRA 3QYQA 4GC4A 1RV8A 5F1VA 5KTLA 2Z1BA 4FNTA 3DU0A 1MXSA 3G1DA 4IJBA 3QPZA 1JQXA 3NG3A 1TPDA 1DOSA 4MUZA 1F76A 5FF4A 2A4AA 4JTHA 1IIGA 3RFAA 3V1PA 4I9AA 5EKYA 2OT1A 1ALDA 3M43A 1OFPA 4AF0B 3TROA 1KV8A 3W70A 1VCFA 2NXIA 4NJKA 3PULA 5EYWA 3SR7A 4XQ6A 1NVMA 3PSWA 4NNCA 1LRQA 2CLEA 3C3NA 4TX9A 5G2HA 5KINA 1JUEA 3IGUA 3SGUA 3BG3A 4HIBA 4WXZA 4H6KA 5D03A 1RQEA 1FDYA 1F6KA 3N9SA 5AHLA 2XN1A 1LYXA 1M5WA 2E6YA 3FIGA 3IIZA 1OFDA 3QSTA 4CCEA 4MJMA 3W7CA 3HPSA 3G3DA 3A5VA 3B0PA 3WK3A 3GXNA 1C9DA 3K30A 1AL7A 3B0UX 1IXOA 3W7GA 3NPVA 1PV8A 1K7EA 2P1FA 5LNUA 3W1PA 2PC4A 3FJLA 3MHGA 3TH6A 1XBXA 5BOOA 1KBIA 1EA0A 2GOUA 1Z42A 5HQEA 5CZSA 2A6LA 1OK4A 1EP2A 5HUOA 4UTLA 4JTEA 5AB3A 3HPZA 4JICA 3L5AA 1DL3A 1XUZA 2JKPA 1BKSA 4XTDA 2ZZ5A 3W7PA 5DCDA 2YFOA 1XBZA 3UWUA 3NQ8A 2V82A 4WY0A 5K9DA 3GKFA 3N3MA 2RHGA 3A21A 3O6CA 3EX4A 1KLZA 3BV4A 3GR8A 4NT0A 3CB8A 1TIMA 1GPWA 2QEZA 3M9YA 3MI6A 3YPIA 1W5MA 1I2NA 3CC1A 1OFBA 2ATMA 4IGHA 3QW3A 1AW5A 4AHQA 2VFIA 1WOAA 2B7OA 5LNVA 3MBFA 4JS3A 2ZZ4A 4RJEA 2E68A 1O5KA 1IXQA 3OBKA 1PCKA 2X1SA 3QZEA 4DPPA 3G1VA 1EX5A 3NQ2A 3NM1A 1VQTA 4Q32A 1NEYA 4K7VA 2XN0A 4WOZA 4ZL1A 4PL1A 5D33A 1VYRA 1SO6A 1G7UA 3N34A 1HL2A 3QC3A 5AC7A 2NLIA 1GG0A 3DKLA 3R2GA 1K3UA 1D3HA 2QCEA 3FYPA 4QQ3A 2GQ8A 4K6AA 5G1TA 5FESA 1FWWA 1Q6LA 4ORIA 3UXDA 3W1LA 1YTEA 4LWWA 3P61A 1HG3A 3TJXA 1OX6A 4IPIA 4Y90A 2JKEA 4HNUA 3UPWA 1W37A 4MZ1A 1EWEA 3O16A 5HNRA 4JDBA 3HG2A 2JGYA 1NF0A 3FYOA 3EKLA 2NUWA 3W9ZA 1ICQA 4E0CA 4RKAA 1SZNA 3BGGA 2ZRYA 1FWRA 1L2UA 3M6YA 3FFSA 4R34A 4LC6A 4PH6A 2QCDB 3EWZA 4MJZA 3NA8A 1OX5A 4JTTA 4LV9A 2YDAA 5E0KA 3DH7A 3IIXA 4LTSA 2E77A 2V2CA 5TBOA 3CU2A 2X16A 3TMLA 3IIOA 3LRLA 3RK8A 3F1QA 1JQVA 1WV2A 1ZENA 1D9EA 3W7LA 4WJEA 1KV5A 2PE4A 3MMTA 1P1XA 1LBFA 2QUVA 3LHZA 3P8IA 1FCUA 3P8JA 2DP3A 3PSVA 4RZ6A 1TQXA 2NWSA 1SUXA 1I2QA 1OYAA 3DFTA 1QOPA 4JDYA 1QCWA 3THAA 2TRSA 1N55A 4CNNA 3P5YA 1XUUA 4E2BA 1D3GA 1JCMP 4MY1A 4DO4A 3TSBA 1SZFA 2QCHA 4LVDA 4QAIA 3S6DA 4FF7A 4DBDA 3P60A 4Z1CA 3UWWA 1UJPA 4R7JA 3GKAA 1QR7A 2ZRUA 1TSIA 1J5TA 1QDSA 3LGEA 2VELA 3C56A 4QIUA 3WK0A 3GDTA 4ADUA 1SZEA 4YWIA 4XTIA 4UFIA 4JTIA 3KAOA 2NWRA 3G1XA 3RU6A 1VLWA 1UASA 3Q2DA 2CZDA 1G67A 2YSWA 1I2OA 2DU2A 4OV4A 3NYZA 3UNDA 4RR4A 1HO1A 3P74A 1T8XA 3HGRA 5HWNA 1BTMA 1K7FA 5IM51 2VFFA 2V0TA 3MI3A 3PBYA 3VI2A 1TTJA 4TR9A 3JS3A 3VCRA 3S5YA 3TC7A 1KLYA 2VKZG 1FUYA 4KKXA 1OYBA 4MYXA 3HO8A 2NX9A 4JYFA 1FBAA 4LC8A 2AGKA 1W5OA 3IVUA 1JR1A 3N73A 3W23A 1Q6RA 3QMRA 1H7WA 5KSWA 5I3GA 1O94A 4YCOA 1BWKA 4O1BA 3I68A 2Y70A 3UWVA 4LW7A 1WA3A 2CLFA 1RPXA 3G1HA 4O12A 1QWGA 1I2RA 4QM1A 3NNTA 3T4CA 3A22A 4UUIA 3BLEA 2H8ZA 3W2KA 4DF1A 4L4LA 5CPMA 1OK6A 3LERA 4FEZA 5DLCA 1XKYA 2Z6JA 1V7YA 5AHEA 2GQ9A 3CEPA 3I7QA 4IXXA 1FWNA 3ELFA 1M6JA 5D2VA 2A2IA 1ZFJA 3DGRA 1KBJA 3BG9A 2CZ5A 1J4EA 1KM5A 2A7NA 3DENA 1VHCA 2C3ZA 2BXVA 3W1TA 3W2LA 2VC6A 4UTMA 4CNPA 2WNZA 2C6QA 1SZGA 3WJZA 1UBSA 4Y8FA 2WSYA 4FHAA 3SZ8A 4BI5A 4ALDA 1GVQA 4RV8A 2Y7GA 2UV8G 3VNDA 2E6DA 2QF7A 4O0KA 3P7YA 1FDZA 3DFOA 5DBUA 2CZFA 2PURA 4K7YA 3ZFHA 4ZQNA 4R33A 2YXGA 3CLMA 2V2HA 1Z41A 3C4UA 4RK8A 2QKFA 3M5XA 3DHFA 3GDKA 4GWEA 4DQWA 2WOQA 1FWSA 1GOXA 1EUAA 5SWUA 3E49A 4HNVA 2HS6A 1RQBA 2ZRXA 3S42A 5D37A 4LS1A 1SQ7A 2A7RA 4UR8A 2YYUA 3B0VC 3PG9A 3LXCA 4Z1AA 4K39A 3BPWA 3EXTA 1EUNA 3AJXA 1FXQA 2RH9A 4UTWA 2B7QA 2FLIA 3M5VA 3G24A 2DZVA 2ZZ7A 1AG1O 1OX4A 4N4QA 3E12A 3T78A 3STGA 4WUIA 4WXYA 2QUTA 1L6WA 2X1TA 2RDUA 5KITA 2CLLA 1CI1A 5HR7A 4PCFA 2ABBA 3C0JA 1SSDA 1XDLA 2X2GA 3LV5A 5EPDA 3RMJA 5CPOA 3PG8A 4N9BA 4ADTA 4LRSA 2Z6IA 3L5LA 2HTMA 1DKWA 3M0ZA 2FJKA 5K9XA 3W2MA 4IMFA 4IOTA 1VHNA 1DQWA 1SSGA 3LCHA 1RD5A 3M47A 4CQ9A 3HBLA 4UFMA 3KXQA 4K8HA 3L65A 3T44A 2GPTA 1ICSA 3C2OA 3LLDA 3O05A 3C61A 5D02A 1TV5A 5AHNA 2QCCA 6TIMA 3W74A 4GBUA 1LROA 4N9DA 4XKYA 4YL2A 2JGQA 1H50A 4R53A 2J9ZA 3TQ0A 4MFDA 4QSHA 5DCBA 5I3JA 5CKSA 1H51A 4XWUA 3NQGA 5IBXC 3KVJA 4UFJA 1VYPX 2QUUA 2EF9A 2C14A 3KRZA 3HGOA 1RR2A 5AYXA 1WX0A 3GDMA 3W2NA 4JN6A 1G4EA 2RKXA 5F1UA 3QM3A 4LOCA 4TU1A 3KOFA 2DJXA 3TQKA 1YTKA 1KM2A 5CSRA 1PS9A 1G6CA 4ML9A 3P62A 2NV2A 1Q6OA 3LLFA 3T7VA 4X2RA 1BWLA 1VYSX 1N8FA 2C0AA 5AHMA 3R13A 4MKNA 1A5BA 2ISSA 3I7RA 4JIQA 1OFOA 1S5VA 2YGYA 4OV9A 2DJLA 3W3OA 2VFHA 2FB3A 3MI2A 3S1WA 2G5WA 3E96A 3TAKA 1TJRA 3H53A 1H60A 2C15A 4MIMA 2F7FA 5F2LA 5AYYA 4WQ6A 2EHHA 3M5YA 4I7UA 3TR2A 1LCOA 5G5IA 3TE9A 1FWTA 2OX1A 1FY6A 3SECA 3EX1A 4O14A 3OVRA 5H91A 1FX6A 2C13A 5LNRA 4Z1BA 1KFLA 4O4VA 3HF3A 3R5EA 1TPH1 1JUBA 1VRDA 2CLHA 4H4IA 1WBHA 1IXNA 1N7KA 1PHQA 2AAMA 4OT7A 1W3NA 3EXSA 5HWJA 5D04C 1XL9A 2QR6A 3U2OA 1XBYA 3LBMA 1WBJA 2CWNA 4I7WA 5LHFA 4UTKA 3EWYA 2H6RA 3LHTA 1C8VA 2WPBA 2HSAA 3UPBA 4O18A 3IGSA 3NQAA 2V8ZA 2E5BA 4M19A 5G4EA 4UNLA 2E6AA 1GJPA 3STEA 2X30A 1GQNA 2A7PA 2FB2A 1TV8A 3AO0A 4WD0A 4DF2A 1JCLA 2PRLA 4LNYA 1H7NA 4N6FA 3TAOA 1FXPA 3R89A 3W2JA 3LRMA 4PTNA 2V5BA 3R8RA 4FNPA 3W84A 1TCDA 1LM1A 3W7EA 2G96A 1SR9A 2GJNA 3NPUA 2B7NA 1VR6A 1YADA 3TKFA 3NAVA 2PRHA 3W72A 3W88A 3DHDA 4Z0SA 2I9EA 3BARA 4FX7A 3MHUA 3P81A 4MYAA 1G4SA 4KFOA 1ZY9A 3P80A 4DO6A 4M6VA 2VEKA 1B4EA 3PAJA 3M7WA 3S5NA 1A53A 3GXTA 4LS2A 3O8AA 2RDWA 2OT0A 3GAKA 3BLIA 4BK9A 3QQ0A 4YCPA 2OCZA 2TMDA 5I3FA 1T0OA 2G97A 4RZ5A 1VCVA 3WK2A 3CIWA 1H62A 1U83A 5C54A 5AYZA 2LLEA 1OFAA 4DELA 4NX0A 2H8XA 3KVKA 1LLZA 3W07A 5FEPA 3Q37A 4J9JA 3O15A 3UZ5A 2ZRWA 3UQNA 2I1OA 3B06A 4BF9A 4HNTA 1SO5A 3FJ6A 3TXZA 2V9DA 1ML1A 1KM6A 1XC4A 4IX0A 5DBTA 2WSRA 3QRHA 2P10A 3C2VA 1I2PA 1EP3A 4FNSA 5LZLA 2BLEA 4RZ4A 3G8RA 4OGZA 3PR2A 4MPQA 1NSJA 2CFFA 2XFWA 5J5DA 3W73A 1QPQA 3FS2A 4U4MA 2ZZ3A 2BWGA 1WQ5A 2Y88A 3INPA 1ZJIA 3W76A 5C5YA 1RQHA 1KM0A 4S1FA 5FEZA 3PBUA 5LNSA 3QEZA 4AXKA 1P4CA 3LCFA 4IMCA 1KFBA 4EWND 3ATYA 3O6YX 3W1NA 3OG3A 1YDOA 4W9TA 5D2YA 5K7JA 3TXVA 3CHVA 3VFLA 5CPNA 4DEFA 3EX3A 1P5BA 3W6YA 1GYNA 2QDHA 4PL2A 4XBKA 1Y0EA 2ZZ1A 2BZNA 3HJZA 5DY2A 3R12A 3NQFA 4Y96A 3EB2A 4I7VA 4LVGA 4JTKA 5F4XA 2ZA2A 4NUWA 4JX6A 4LUIA 4RCXA 3N2MA 3EWBX 1ZCOA 3CQ0A 1UUOA 4IUOA 1R2TA 1O5XA 5FF2A 3NGJA 2ZA3A 5HUPA 1GVFA 3NZ1A 4FNQA 1OHLA 1PCWA 3LCXA 2C1HA 1PHWA 1X1OA 4O13A 1TREA 5J5RA 5LKYA 3A5FA 1EPXA 3LTSA 4WOQA 4WY0B 3WJWA 3HQ1A 3SSJA 3HOJA 2V2DA 4IMGA 4TMBA 2IQTA 2B4GA 2ZA1A 3S5OA 1VCGA 5DELA 3FLUA 1V5XA 2Y7EA 1SW0A 2DORA 2TSYA 4NX5A 3G1AA 3A24A 3IVTA 3NQ7A 1TMHA 1SU5A 4IX2A 4G1KA 4ZZ9A 1LP6A 3IGXA 3W7QA 1IGSA 1LDCA 3L0KA 4O10A 4O19A 1MO0A 4GUHA 3BW4A 4HHPA 2DZXA 3ZR4A 3PC0A 4JTUA 4JTLA 1WYIA 3W7IA 1LBMA 4IQLA 2GVJA 5EBUA 5DXYA 1LRTA 5CZJA 4ZQCA 1K8XA 4BWLA 3NQMA 3OEXA 3Q94A 4JIPA 5C2XA 3PB2A 3TQVA 3NQCA 2V5LA 1ZAJA 4A22A 1TRIA 2J9XA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3C61A

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