4JTUA

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with brequinar analogue
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
TGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) with 057
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 139
structure length 365
sequence length 365
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2013-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4jtuA00
2FPTA 3VNDA 1VYPX 3LXAA 3MUXA 1VHCA 1DKWA 1W37A 2J27A 3I7RA 1QAPA 3F4NA 4ALDA 3NQFA 4XWUA 3M1ZA 3G24A 1AG1O 4WXYA 3HJZA 3LCFA 1OFEA 2OCZA 3WK3A 2Q8ZA 3DAQA 1PHWA 3NL6A 4UFLA 3TROA 4MZ1A 4DO6A 5F2GA 1VQTA 3KRSA 4IX2A 1RPXA 3PSWA 2ZA1A 4NJHA 1H1YA 2GOUA 1KM5A 1OFPA 2V2CA 1H51A 4ZMGA 2HMCA 1F73A 3LXBA 3DFNA 4LS2A 3UXAA 2NZLA 5AHEA 5KZMA 3BV4A 3GIYA 3HGOA 3S5OA 4UIOA 1RVGA 5D2TA 4NU7A 2ATMA 5LGZA 4OV9A 2WNQA 3NR0A 3NO5A 1H7WA 1L2UA 5E1QA 2ZFAA 1VPXA 4MZYA 3TNOA 4YL2A 2Z2UA 2WPBA 3MO7A 4WX2A 1LOQA 5IBXA 3GKAA 2X30A 3IIXA 3GX9A 1W5OA 1KFJA 1WA3A 1S3HA 4WUIA 3ZWSA 4TMBA 2X1RA 1SQ7A 4IMEA 4JD4A 1O4UA 4GUGA 3TMLA 3M41A 2Y88A 3R8RA 3MHGA 4WOZA 3W87A 2R91A 4JX4A 1G69A 4JICA 3VE7A 1Y0EA 3KVMA 5HWMA 3NM3A 5I3IA 3ABSA 3QJAA 2H8ZA 3G3DA 3L67A 3NXFA 3FLUA 1GQNA 4XKYA 3P82A 4E38A 4NZFA 4ZVJA 4O50A 4JTHA 4FX8A 1KA9F 1KM2A 4K8EA 4O11A 5E93A 4MLJA 3TH6A 4MY8A 1N8FA 1SZGA 4ICNA 2QAFA 1OVDA 3DHFA 4O12A 2CZFA 3LCLA 2CZEA 3CB8A 5T26A 1GG1A 3PSVA 3F03K 3LV6A 3QMSA 5FEWA 3ATYA 4MLRA 4RK8A 3P61A 3W76A 3TSMA 5HWJA 1TV7A 4RZ6A 3EKLA 3CHVA 5F4WA 5CZ0A 1L9WA 2EGZA 3THAA 3M16A 5DBUA 1AW1A 4YCPA 4IWWA 3UY7A 1X8FA 1SZEA 3G3MA 3DI1A 3GXTA 1DHPA 3T7VA 3Q58A 1VS1A 4GWEA 3EXSA 4ORIA 1K8YA 4RV8A 3P81A 3HG5A 3S8HA 3SSJA 2E6YA 1TIMA 3W1MA 1ZENA 2YFOA 1SO3A 1C9DA 3W7KA 1BWLA 4M6QA 2YFNA 3O6CA 1D3HA 1Q45A 1G7UA 3A23A 2TMDA 3IGXA 1XFBA 5AHLA 3CQ0A 3CTLA 4AWTA 2OT0A 1H7NA 4TX9A 2DZUA 5A5WA 3TMQA 4AF0B 1H63A 2HSAA 4IMCA 4EF9A 1T99A 2PRHA 3B05A 3OVQA 1B9BA 4PH6A 4PEKA 4UUIA 2GQAA 4BI7A 1TO3A 1WDWA 2WQPA 4LNYA 3S0CA 3Q94A 3NQAA 2E1DA 4UTHA 2C1HA 4UR7A 4HHPA 2W79A 3UWYA 1PL9A 1LORA 1LBLA 4GRSA 2C15A 5K9DA 2ZZ3A 5TIMA 2ZRUA 1YDNA 1RR2A 1R30A 2CLFA 1K7XA 5HR7A 3C61A 1V7YA 1B4KA 1VJIA 3EWYA 1H62A 5K3VA 3STGA 3W1QA 2C6QA 3C2VA 1AMKA 1WX0A 4LC8A 4QSHA 1J4EA 2VEPA 3C2EA 2QCGA 4FIQA 1KTCA 2ZYFA 3B06A 5G5IA 4MYAA 3C52A 3L66A 1M5WA 4FXSA 2PRLA 2Y62A 4QITA 1WQ5A 2RH9A 4R53A 1TPDA 1A5CA 5LNRA 1W31A 4JIPA 4X22A 2VEIA 3F1QA 3MP3A 3G1FA 3NM1A 2JGYA 2I9EA 1VYRA 3CC1A 3MYPA 1GOXA 2JKAA 4RXFA 4WQ6A 5FF7A 4IGHA 1XDMA 2ZQ0A 1XKYA 2WKJA 2JBMA 4JGDA 4FX6M 2XN1A 3HPXA 4MY1A 3PB0A 3SJ3A 3HBLA 3HQ1A 2GUUA 5AHNA 4UMBA 1TPEA 3LOTA 3ZFHA 3EKZA 3LM7A 1G4EA 3OA3A 4FNPA 4UTUA 4TIMA 3TAKA 2DP3A 2FTPA 1GVRA 3GNNA 2Y7EA 3SI9A 2A5HA 4H6KA 5LZLA 3CWNA 4LUJA 3SW6A 2C14A 4DO4A 2FPVA 3PAJA 4ZZ9A 4TU1A 4JTIA 3UWVA 5K2ZA 4EF8A 1VH7A 5CG7A 4CQ8A 1W3TA 3E0IA 1SW3A 5HINA 2JGQA 2V0TA 3HF3A 1FWTA 2QCLA 3W88A 3UZJA 4XTDA 4JTKA 4QNWA 1TB3A 1PVNA 1PCWA 3UPBA 1RZMA 2QCHA 3N14A 1KFBA 1VRDA 1W0MA 3W7NA 1ME9A 3C6CA 1I8JA 3O8AA 4UTWC 5D2XA 5FF0A 2A1YA 1TPC1 4LUIA 3W84A 2V9DA 3BLEA 5G4WA 3UYCA 1KM6A 3BLIA 5K9CA 4N9CA 2YZRA 4JTEA 1X6UA 1HG3A 4IUOA 3BGGA 2A7PA 3M0ZA 2E09A 3M7WA 3RF9A 4Y96A 5CSSA 1H60A 5U7SA 5DXYA 2P1FA 3VKJA 2V8ZA 4S2BA 3P84A 2YCEA 3PY2A 1TPWA 3UWUA 2X2GA 3JRKA 2TSYA 4GJ1A 4OQVA 4JX6A 3W1RA 4KFNA 1I2PA 5KINA 3N9SA 3R5EA 5BRBA 2Z6IA 3GLCA 1JULA 3L0GA 1EUAA 1GEQA 1YPFA 3JS3A 3I6RA 3VFLA 1D9EA 2A21A 2ALDA 1LRNA 4UTLA 1ZNNA 1A5BA 4ZQNA 1EP3A 5D02A 3GAKA 1TTPA 1G7VA 5FF2A 3THQA 1FX6A 4LVDA 1H1ZA 3V1PA 5BW6A 3QYQA 4LV4A 1TYGA 4XZ9A 1O5KA 2WOQA 1ADOA 4ORMA 2DJXA 1FWNA 4JXCA 3W7MA 3W74A 3LRLA 1JUKA 4MJMA 3TA6A 2ZRYA 4WY0B 4H4IA 2QCDA 4BI6A 3PBYA 1X1ZA 1GTEA 1KV8A 1KTNA 3MI2A 1H7XA 1XBVA 3QF0A 3M5ZA 3TXVA 1DQXA 1XM3A 1ZAHA 3VE9A 1OFBA 3KX6A 3EWZA 3TUUA 4WY0F 1QOPA 2CZDA 4Q32A 3W6YA 5D32A 4LTSA 2R94A 3A22A 3USBA 3PM6A 2ZDRA 3CEPA 3GXPA 1UJPA 2C18A 3LHYA 1I2OA 1LBMA 3ANYA 3IVSA 2ZZ5A 2QDHA 4DF0A 4JTTA 3S1UA 3S1WA 4LY8A 1KFCA 3EX3A 5I3JA 4FF7A 3CIWA 3QRHA 2G95A 4CLMA 4LV9A 1O5XA 2CLOA 4PC8A 3W70A 4D2JA 2VFIA 3EX6A 3W71A 4NVTA 1OK6A 3RLUA 1VYSX 2HS8A 1ZCOA 2NV1A 1PV8A 4O13A 3KHJA 3QPZA 5FI8A 4XQ6A 4CNPA 3CWOX 3L21A 4LC6A 1LTDA 4MY9A 2J9XA 2FJKA 3HGRA 3LHTA 2A6NA 4I7UA 4K37A 3EWUA 3M9YA 2WO5A 2V2DA 5EL1A 4ZQMA 1LLZA 3ATZA 1KM4A 3LBMA 3HIJA 3DFPA 1CX9A 3S6DA 2A2IA 3V75A 2EPHA 3QQ0A 2Q8LA 1NSJA 2YSWA 3H55A 3FA5A 1DBTA 3IIVA 2J6XA 2A7NA 2FDSA 3QPYA 2V82A 2NXGA 1A5SA 1OX4B 1HO1A 3NQEA 4IPJA 5DCDA 2F7FA 1LOLA 1RQBA 2JK2A 3B03A 1TTQA 1WV2A 2E5DA 3LCHA 1FXPA 1TPB1 3PR2A 1YTKA 3QSRA 3ZR4A 2DU2A 4O18A 1RD5A 1WBJA 3E49A 1OFQA 1SO5A 3DKLA 3OHIA 3R12A 5FF3A 2WV8A 4LS0A 3C56A 4HT3A 4IMFA 4LRTA 1G4TA 3OVRA 1QNVA 2PURA 5LHEA 2QCCA 2XN2A 3SR7A 2RDWA 1IXPA 4BF9A 2H3BA 1UUMA 3W2UA 1OK4A 1YXDA 3BVJA 1SU5A 3GDLA 1SR9A 4DXVA 4LVBA 4O19A 5GVJA 1C29A 5CKSA 4XBSA 2QCMA 3HGSA 3CU2A 3BPWA 2QKFA 2NX3A 4AEOA 2V81A 8TIMA 3S5NA 3KFTA 2YX0A 4A3UA 4DPQA 1F76A 1F6PA 3MBDA 5HULA 3C3NA 3S1XA 2YR1A 1AL7A 4DBDA 2Y7GA 4ONVA 3LB0A 4JTGA 3VI2A 3C2OA 4CNNA 3NNTA 1MSSA 2Y6ZA 3OBKA 4NQ1A 3RMJA 1F5ZA 5AYYA 1V5XA 3W2LA 1QPOA 3KOFA 3DFTA 3BK0A 2O7SA 3SIZA 4HSNA 1XUZA 1WOBA 3TCEA 1KW1A 1QCWA 3W2MA 3S42A 4WY0A 5J5RA 1LM1A 4MFEA 4Z0JA 3MMTA 4ZQOA 5EMUA 4GUHA 4QJ1A 5FEZA 6TIMA 3DFQA 3G0XA 3G8EA 2ZA3A 4WJEA 5AN7A 4FB7A 5KTLA 2CU0A 2E5BA 4QM1A 4CNOA 3OVPA 1XXXA 4JR5A 3JR2A 4K39A 3UWQA 1TRDA 1U5JA 6ALDA 3BW3A 1KLZA 3W7PA 2OMAA 3PG9A 5LNSA 1LBFA 4N4QA 3NEVA 3TQKA 4DBEA 3O6YX 5KMYA 4JTSA 1SPQA 2E5CA 2V30A 3D0CA 5D03A 4O53A 5AC8A 2C16A 2R14A 1TV5A 3H54A 2PE4A 3I7SA 4O4VA 5KSWA 3HO8A 2E6DA 1R47A 4GBUA 3LBCA 3ELFA 4BWLC 3QM3A 1A53A 2CLKA 3G1XA 4Z1DA 2C13A 3TDFA 3UY8A 4FNRA 4O28A 4X2RA 1JCLA 1R2SA 3WK2A 2PCQA 3W72A 4Y90A 3TSBA 4JNMA 4N9BA 3GR8A 1RQHA 4I7VA 3W73A 1S5TA 3B0PA 4N4PA 4ZQCA 1Z42A 3GXNA 3NAVA 4A21A 1OX4A 2HS6A 5HJLA 2Z1BA 5LHFA 2NXHA 4O8RA 5DY2A 4JYDA 5LKYA 3NYZA 3MHFA 3T55A 4X3ZA 5K4ZA 1FWSA 4ML9A 2VFDA 1WXJA 1JCMP 2H90A 2DORA 2GVGA 3GDMA 1I4NA 1A5AA 5L9FA 3OEXA 4UNKA 5DCEA 1UUOA 4AWSA 1VCGA 1MXSA 1P0NA 2ISVA 1TSIA 5DY3A 4BFAA 1EB3A 5AYXA 1NF7A 1HO4A 2VENA 5EY5A 1YADA 3DFSA 2VFGA 1VLWA 3MI6A 3BW4A 3NQVA 3Q37A 2BSLA 1SFLA 1KFEA 1H61A 2V5BA 1Q6OA 3MI3A 2V5LA 2VELA 4C1LA 3W3OA 3RK8A 4A2SA 3KVJA 4KWVA 2CZ5A 2W0UA 2CLHA 1GYLA 5BMWA 1VCFA 4LS1A 2WJZA 1HFBA 4QQ3A 3LI0A 3L0KA 3CEUA 3PF3A 3PWAA 1NAL1 3EX1A 2Y89A 4Z1CA 5LGXA 3EWWA 4L4LA 1AK5A 3P5YA 3G0UA 3T40A 4FNSA 3TJLA 3TV8A 3BW2A 2CLMA 4CCCA 2BTMA 3PULA 1GTHA 4O4WA 5I3FA 2FB3A 4NXKA 3QZEA 3NPXA 4ZQPA 3KRZA 5F2MA 2CLEA 3FFSA 5ABTA 3WK0A 3B04A 5CGQA 1XC4A 1VGAA 5G2IA 3B4UA 3EWXA 1J2WA 1L6YA 2QCFA 4JS3A 1M7OA 1D3GA 1ME7A 3DZ1A 1ZALA 4Z0SA 3W23A 4BI5A 4AWUA 1KM1A 1B3OA 3WJSA 4M6VA 1QDSA 3HG4A 2YYTA 2FB2A 4UFIA 2VFFA 3IVTA 4CCDA 3NQMA 5BMXA 4ADSA 3QMTA 5D2YA 3IIPA 3W7GA 4RJEA 1I2RA 4I7WA 3UWWA 3TFCA 1G67A 3DGRA 4O57A 5I3KA 2PC4A 3PUDA 4RZ4A 1X1OA 3S1VA 3LERA 4M7TA 5HNRA 5FESA 1EPXA 1H5YA 4M19A 4JX5A 4O0ZA 3B8DA 4RCXA 1VC4A 1OX5A 1G4PA 4RLIA 3KXQA 2NX9A 1OF6A 2QEZA 2TYSA 4K7VA 4UCGA 5KITA 4LOCA 1M7PA 4PL1A 4HKPA 2G96A 4K6AA 3ABRA 3QW3A 3GKFA 3GYEA 4DEFA 4RR4A 1LOSA 3F4WA 1JCYA 4UR8A 3NZ1A 5F2LA 3NL2A 4MYXA 3STFA 1ZAIA 1I45A 2G97A 3OG3A 3GAYA 3P80A 3W2JA 1ZHAA 1Z41A 3LRMA 1WAUA 3RNDA 4OHQA 1TTJA 2EHHA 2JKPA 4P61A 2X16A 1XL9A 1L6SA 2CW6A 1BKSA 3W7OA 1GVQA 1FDZA 1EEPA 2GQ8A 4P2VA 1C8VA 4OGZA 5K9XA 3MP5A 4HN4A 3ZWTA 3MYOA 1DL3A 5G1YA 1THFD 3LI1A 2NUWA 4JDBA 4AHQA 1T96A 4O15A 4IOTA 2NWRA 1FCQA 2BZNA 1TPH1 1GVSA 3QQ1A 4GE8A 3T78A 1BEUA 5TQLA 4L4MA 2ZRXA 4AHOA 3EXTA 4Y9AA 1ZJIA 2EKCA 5LNWA 1WYIA 1FWRA 5CPLA 1P5BA 4MJZA 3FJLA 2D73A 1YTEA 2QCNA 4E2BA 1VCVA 4Q4KA 4JYEA 3FEMA 3SZ8A 2QUVA 3WJWA 4OWGA 1BWKA 3UWZA 1RV8A 4PTNA 4UMCA 1XI3A 4HNNA 2W6RA 1T8XA 3EX4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2FPT A;  1VYP X;  2O4M A;  3MUX A;  2HVM A;  1VHC A;  3WH7 A;  8CGT A;  3I7R A;  3WN6 A;  2XPK A;  4C7D A;  3UGV A;  2GOK A;  4Q8Q A;  4Z2K A;  1XRT A;  2BOE X;  1BYB A;  4DYJ A;  3PPC A;  4I9T A;  4IX2 A;  5F7U A;  3OZY A;  1PPI A;  1RPX A;  3PSW A;  4CD4 A;  2QGY A;  1BVN P;  3VOG A;  1H1Y A;  2GOU A;  3ZYZ A;  1KM5 A;  4PMV A;  1OFP A;  1FWJ C;  4ZMG A;  3BV4 A;  1N8W A;  3S5O A;  4UIO A;  2OOG A;  5XIA A;  2WNQ A;  4PB3 A;  1H7W A;  4J2M A;  2QV5 A;  2PFH A;  2WHK A;  2VP8 A;  3V35 A;  3GE7 A;  3Q65 A;  3SRF A;  3IIX A;  3VX0 A;  4BQ2 A;  1KFJ A;  1H0G A;  2DPE A;  4WUI A;  4S3D A;  3ZWS A;  5DFA A;  4NRR A;  3RO8 A;  5DQP A;  3VAV A;  5M17 A;  2ON3 A;  3PAN A;  1H09 A;  1O4U A;  3GIP A;  3TML A;  1Y8B A;  1NAR A;  3MHG A;  4JX4 A;  1I0B A;  4HYV A;  6REQ A;  3NQB A;  1G69 A;  2VX4 A;  4JIC A;  4QR6 A;  4KEU A;  4HA4 A;  2H8Z A;  3G3D A;  3HZ3 A;  4Y9P A;  1UZ4 A;  3FLU A;  3OIH A;  1VBJ A;  5CAH A;  4E38 A;  3VC6 A;  4WR3 A;  2G0W A;  2CHO A;  4K8E A;  1RPK A;  1N8F A;  5PTD A;  2QAF A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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