1BEUA

Trp synthase (d60n-ipp-ser) with k+
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
268
structure length
253
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLANGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cryocrystallography and microspectrophotometry of a mutant (alpha D60N) tryptophan synthase alpha 2 beta 2 complex reveals allosteric roles of alpha Asp60.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE
molecule tags Carbon-oxygen lyase
source organism Salmonella typhimurium
total genus 98
structure length 253
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 1998-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1beuA00
1GPWA 2NXIA 1GQNA 1WQ5A 2W79A 3ATYA 2XFWA 4JTSA 5G4EA 1YADA 3BW2A 3NOEA 3STEA 2ZCGA 3PUEA 3GYEA 3OEXA 4I7WA 5A8GA 4A2RA 5EYWA 4D2JA 3HJZA 2TYSA 3MO7A 5D37A 4JGDA 4FX8A 3NQGA 4BI7A 2Y7FA 2Y7GA 1JUBA 4UNKA 4AAJA 3M6YA 4M6QA 2YGYA 4ICNA 4CNNA 1ICPA 8TIMA 3EEGA 1I2NA 4U28A 2ZRWA 3NXFA 2Z6IA 1SZNA 2V8ZA 4IPIA 4LNYA 5DXXA 1WA3A 2FDSA 3SGZA 4EIVA 3S8HA 4IJBA 1DKWA 3UWUA 4PL2A 2JKAA 3G18A 3M0ZA 4K7VA 2YZRA 1NF0A 2V2DA 4LS0A 3HB9A 3B03A 3KX6A 3NQ2A 1JCJA 4UMBA 4NVTA 3W1RA 2GJNA 1JUEA 1YTDA 4FEZA 1F6PA 4MFDA 4WXYA 3C56A 2ABBA 3B0PA 4JS3A 3M7WA 4IGHA 3U6WA 2B7NA 2CLOA 3GXPA 2PC4A 3N9SA 3W1NA 4E2BA 1IXQA 5EKYA 1LLZA 3LTPA 1YTEA 1YXCA 4QQ3A 3NQ8A 4H6KA 1M5WA 4K37A 3TW7A 5G2HA 3PVFA 2WNNA 2WKJA 1KM6A 4N2YA 2A6NA 1QAPA 1VZWA 1KFKA 1X8FA 5F4XA 4E38A 2DZWA 4EF8A 3K30A 4JTLA 4NJJA 3UYCA 1K3UA 5A5WA 4Y90A 1SO5A 1I2QA 5TIMA 3LHWA 2ATMA 2CZDA 2E6FA 3I68A 5K9CA 3NL3A 3Q94A 1PVNA 3V1PA 4UTTA 2H8XA 2YPIA 2C15A 1Q6RA 2VENA 3L2IA 3UWQA 5J5RA 5H91A 4M6PA 3NR0A 3O8AA 1H5YA 4MVAA 3NZ1A 4DPPA 2J88A 3VNDA 3DI1A 2ZTKA 3PBWA 4XQ6A 3DHFA 3TKFA 3CIXA 4AWSA 3FYPA 4N9DA 4UNLA 3IGUA 3WJYA 4GUHA 2QDHA 4DO6A 1KFCA 3PG9A 4N9EA 3F4NA 4N4QA 3IIPA 2Y7EA 1AG1O 3CQ0A 1W54A 3LX9A 3F4WA 3PB0A 3LDVA 3G1VA 4ZQOA 1FWNA 1B57A 3SY5A 3BLIA 3G3MA 5DELA 1VCVA 5F1UA 4IX0A 3S5ZA 4FNSA 1MEWA 2NUXA 2NX3A 4TO8A 1JRBA 3VFLA 1OFAA 3UWYA 1EA0A 2HS8A 5HULA 3DHDA 3TIMA 1TTQA 2DZXA 2AGKA 5G5IA 1MZHA 1AMKA 3HGRA 2QUVA 2CLMA 1R30A 3RLUA 1SO4A 4A22A 1J5TA 4YXGA 1IF2A 1DV7A 2XN2A 1LBLA 3E0IA 2JKPA 4L4LA 4UFLA 3RLVA 3ZWSA 1X6UA 3W23A 5EY5A 1L9WA 1S3HA 2YW3A 3C52A 4GJ1A 4WX2A 1VCFA 3TQVA 2JKEA 1PCWA 3GXTA 2WQPA 5AC6A 2G97A 1O60A 4UC5A 3JS3A 1JVNA 5BNKA 5LSMA 2Y63A 3ATZA 5IBXA 3OVQA 5U7SA 4FB7A 1DQXA 3W88A 5AHLA 4LY8A 5CGQA 2EKCA 4N9CA 4Z1AA 2ZZ6A 2OCZA 4UTTC 3PSWA 3SSJA 4RK8A 5K3VA 1TJRA 1GVSA 1IIHA 3W7RA 4LTSA 5TBOA 1NVMA 3ABSA 3ZS4A 5CPNA 3O05A 5LNWA 2GVJA 1QPQA 3NZRA 2JGYA 4LV4A 3PR2A 1OX6A 1HO1A 3W7JA 4O14A 2VFGA 4PC8A 4XBKA 3R13A 3C6CA 2XN0A 3HO8A 3KRSA 5F2GA 3B04A 3W1MA 4R53A 4JTKA 1OFQA 5G2IA 3YPIA 1KTNA 4FNPA 1LM1A 1PE1A 1Q6OA 1PCKA 5KINA 1LLWA 1FCVA 1YYAA 3SECA 4MJMA 2X2GA 4MY9A 3TA6A 4FX7A 4JX5A 2A0NA 4ADTA 1RQBA 3LRMA 4MZYA 4LC6A 3L66A 3LERA 1YDNA 2B7OA 1DOSA 1G4TA 5G2WA 1HL2A 3EWBX 1W3IA 1QDSA 4JIPA 3TFXA 4UFIA 5HINA 3WJXA 3GR8A 1DORA 2YFNA 1TTPA 1TRIA 3NPUA 2ZZ4A 4KWWA 3GAYA 1GZGA 1BEUA 2OJPA 1JCMP 4S2BA 5AHIA 3L5AA 4O12A 3SJ3A 3TJLA 3HGOA 2FFCA 2QUTA 3TXVA 4WOZA 3W72A 1LP6A 4BWLA 1YPFA 1FWSA 2CLFA 1T96A 5FEZA 3P81A 1BKSA 3EX6A 1C8VA 2Q8LA 3NM1A 3BARA 1KM4A 5IBXC 3LXBA 5D05A 4IX2A 3W2NA 4C1LA 3E02A 3B4UA 4UFKA 3NL2A 2VFHA 2E5BA 1V5XA 3W7QA 1FQ0A 5LNSA 3W86A 4MPQA 3HPXA 3LV5A 4HPXA 4O57A 2O7QA 1WBJA 3WK2A 1CI1A 1GWJA 3W7HA 4E0CA 1QOQA 1KFJA 5D33A 2DP3A 2GUUA 1A5CA 1TB3A 3P7YA 3TQ0A 3D0CA 3BPWA 1K8YA 3PUDA 3G1FA 3M5ZA 3N9RA 4UTJA 3GKFA 4NX0A 2ZRUA 3NQVA 1FBAA 1G6CA 2OT1A 2A2IA 4ML9A 4FIRA 4QM1A 4OV4A 3OG3A 4FNQA 1SZEA 3WK1A 1DJQA 2C18A 1H1YA 3SFKA 1GTEA 1XI3A 1XL9A 3G0XA 3GIYA 3M1ZA 3SZ8A 1EB3A 1D3HA 1VLIA 5D04C 5L9FA 2DZSA 3M41A 1EP3A 5AHFA 3GDTA 2A4AA 3G1YA 3CIWA 1UJPA 3A24A 1SR9A 3W87A 2NV1A 1H60A 2ZA3A 2YCEA 4HPJA 1V7YA 5HWMA 3TUUA 4ZVJA 3N73A 5DCBA 5K4ZA 1NEYA 6ALDA 1TPFA 3FKRA 4GUFA 5K7JA 1W5MA 1OYCA 4JTHA 1OFEA 4OV9A 5J5DA 3W22A 1XFBA 4CLMA 4AHOA 3O07A 2ZRVA 4MYAA 4X3ZA 1TPUA 4CCEA 2D73A 1YDVA 1W5PA 3FEMA 5DN1A 3ELFA 4LVBA 4KFPA 3DU0A 3TK7A 1SSDA 1W3TA 1R2TA 5AFDA 3WJWA 1KBIA 3LLFA 4DQWA 1KFLA 1QFEA 3NM3A 4AEOA 5HWNA 3KOFA 4G1KA 2ZRYA 1W56A 3C2OA 2C6QA 2W6RA 3DKJA 2VELA 1ME8A 3W7GA 3OVPA 3N3MA 2Z2UA 5LNRA 4AXKA 3T4CA 3EKZA 2OX1A 2YFOA 1GJPA 4IMCA 4O4WA 5FI8A 1EUNA 1O5KA 2OT0A 3W1AA 3TNOA 5KTLA 1ICSA 5F1VA 5FF7A 3WJSA 3B8DA 1D3GA 5KZDA 5LNVA 3UY7A 3W7NA 4XBSA 1UCWA 1H61A 3MP3A 1K7EA 5LHEA 3RF9A 5CZSA 5DCEA 1RQEA 2H3BA 2WJZA 4JY8A 3G1AA 1EP2A 1LOQA 1KTBA 4WY0A 1TTIA 3NAVA 2FIQA 3QMRA 3QQ1A 1C29A 5KMYA 2NXHA 1H7XA 2ZA1A 2PURA 5I3GA 3W7OA 3NGJA 3TMQA 3TSDA 4FO4A 3R8RA 4UFHA 4JDBA 5CZTA 3L5LA 4GXMA 2X1RA 4Q33A 2CLEA 1H7PA 2E5CA 3MMTA 2HS6A 5AHEA 3LRKA 3BK0A 1G67A 5EL1A 1X1OA 4FNUA 2PRHA 4IQLA 5AN7A 5E93A 1FCUA 3CLMA 1ZCOA 4AF0B 3L67A 5SWUA 1Q45A 2Y89A 3LI0A 2A1YA 3VI2A 2GQ8A 1WBHA 3SGUA 5AYXA 5F4SA 4YWIA 1RPXA 4DXVA 5C6MA 1TPH1 3T40A 4UMCA 4FNRA 4L4MA 2FQIA 3LCWA 3MHGA 4ZQMA 3EWUA 1ZAHA 3G1DA 3MW7A 1OK6A 3QPYA 4PCFA 2E5DA 2V0TA 1HG3A 4CQ8A 4GUIA 4NXKA 3L9CA 4RZ5A 5D02A 2J27A 1KA9F 1OX4B 3NNTA 4UR8A 4A2SA 1TREA 4LS2A 3P84A 4PODA 4QSHA 4QAIA 3C2VA 4OQVA 2OZ0A 4AHPA 3OBKA 4AF0A 1G4EA 3W84A 3P80A 4NJHA 1U5JA 4JYFA 5DY2A 2ZTJA 2EHHA 1X7FA 2GOUA 3LBCA 3UWWA 2EGZA 3CU2A 4ZMGA 1XBYA 3TW6A 4K6AA 5KZEA 4LV9A 3IGSA 1ICQA 3NQCA 1ME7A 5KSWA 3C8FA 3UY8A 3H54A 4E2DA 3W2UA 4IMEA 3LLDA 4YMZA 3EX4A 1XBXA 2Q8ZA 1AL7A 1K7FA 5LGZA 7TIMA 2I9EA 1VLWA 5D2XA 1OX4A 4FIQA 4K8EA 1F7BA 1KM0A 5AOUA 3H55A 1QNVA 1XCFA 3Q58A 4O4VA 2QCDB 1TQXA 4LW7A 3CEPA 2HSAA 2GVGA 4RXFA 1F76A 3MI3A 3C4UA 4R34A 3B06A 1UASA 1KM5A 1SW7A 3UD6A 3QSRA 4JN6A 1PV8A 3LRLA 1QWGA 2CLLA 1W3NA 1KV8A 3IVSA 2QF7A 5D2YA 3T78A 2ISSA 3B0UX 1H51A 3FOKA 5DBUA 1HFBA 3ABOA 1XBZA 1RD5A 3L65A 2ZDRA 5CKSA 3P74A 2CZ5A 4WZHA 5HMSA 4RV8A 3P5YA 4OU1A 3P61A 3MYOA 4HIBA 4NUWA 3GNDA 2B0MA 3P82A 1F6KA 1QPOA 1VYRA 4GRSA 4QJ1A 3W7LA 4HNVA 4KFNA 4NZJA 3Q37A 5FF2A 1O5XA 2ZA2A 3TC7A 5IM51 4NNAA 1YXDA 2X16A 1DHPA 1QO5A 4A29A 4AWUA 3PBVA 3O06A 4M19A 1K03A 1SZGA 2C16A 3S5NA 2FB3A 3TXZA 3G1XA 3OA3A 1LOSA 2QCHA 4ZL1A 4WUIA 5LZLA 5D2VA 3G8EA 4UCGA 3RK8A 2JK2A 2A7NA 2Y7DA 1HO4A 4DELA 5AC8A 3S1WA 1T99A 3A5VA 3NQFA 4ONVA 1XXXA 1YDOA 4LVDA 2E6YA 4I7VA 2JGQA 3LOTA 3FFSA 1QOPA 3LXAA 3HPZA 1E51A 3LCXA 4DO5A 4JIQA 4GBUA 3FLUA 1VYPX 2GQ9A 1FWWA 3A9IA 4MLJA 4X22A 1K02A 4MKNA 2TRSA 1ZHAA 4M7SA 3W07A 4JTGA 1VS1A 5I3KA 5D38A 1G7UA 2ZRXA 4LS1A 4EWND 1B3OA 3LTYA 4M6VA 2Y62A 1XUUA 2V5LA 4Z0JA 4DF1A 4N6FA 3EWWA 5E1QA 1BWLA 3DKLA 1DL3A 1QPRA 3QFEA 4LRTA 4ORIA 2ISVA 3EXTA 3FYOA 4UTLA 3R12A 5BRBA 3BV4A 2OMAA 3HMJG 1NSJA 3PUOA 3FJLA 1VGAA 4RKAA 1LRNA 2RHGA 5AYYA 4MYXA 1P1XA 1I2PA 4JTEA 4X9SA 1YTKA 1KM2A 4YLWA 3GDKA 5C2XA 2QKFA 1Z42A 2X1TA 4IXXA 4YL2A 1GEQA 4UTUA 2WSYA 2YSWA 2VXNA 3P67A 2PE4A 2QAPA 3QQ0A 1TMHA 3BGJA 3OVRA 4JYDA 4UTIA 2V30A 3DXIA 1KTCA 1PS9A 1A5AA 1FCBA 1L6YA 3W2JA 1LROA 3NPWA 5F4WA 1QMLA 1ZJIA 3UXAA 1C9DA 2F7FA 5FEPA 3L5MA 4MY8A 4Z1BA 2B4GA 2W0UA 2C0AA 4P61A 3TAOA 4DF2A 2PRMA 5CPMA 2Y61A 3DAQA 4RZ6A 3UXDA 4NX5A 2WOQA 2VFIA 4JNMA 3GKAA 4O50A 3W83A 1M6JA 4O11A 1BWKA 3TX9A 4NJKA 1WOBA 2QAFA 3DFPA 1TRDA 3EX2A 3L0NA 2B7QA 3HG3A 2R14A 1BTMA 1S5VA 3PULA 3RNDA 4XZ9A 1OG0A 1W31A 1FWRA 3A23A 3DFNA 4MFEA 3TE9A 3HQ1A 1VHCA 1XUZA 3R89A 2H90A 3STCA 1PL9A 2QCCA 2NX9A 3GXNA 4DPQA 1J4EA 1GVFA 4P2VA 5E0KA 4EVZA 5K4XA 1SQ7A 2YXGA 2B7PA 2NUYA 3BG9A 4RXGA 3P62A 3QMTA 4JTJA 4AVFA 1YLVA 2QCNA 3F03K 4RZ4A 4BI6A 1ZNNA 2A6LA 2R8WA 1TPDA 1ZALA 4ORMA 1FUYA 4Z1DA 1DVJA 4BK9A 2EAWA 3PBYA 4J9JA 4R33A 1ONRA 1QR7A 3GDLA 1ZENA 2FPTA 2AAMA 4NNCA 1PHQA 5G4WA 4AHQA 1R2SA 2KZHA 2Q3OA 1VPXA 3QW3A 3W2MA 3LHUA 4NT0A 2E09A 3G22A 1NF7A 2VKZG 4GC4A 1LTDA 2V2CA 2ZQ0A 3TSMA 1I4NA 3QH2A 4XKYB 4H3DA 3W2LA 2ISWA 3EWXA 3O6DA 3L68A 1SFJA 3HIJA 2TMDA 3DZ1A 5HR7A 1GVQA 2X1SA 2BTMA 1FX6A 3M47A 2YX0A 4Z0SA 4O10A 3PF3A 4CNOA 2AQWA 2EPHA 4UFJA 4O54A 2J9YA 4TIMA 2NV2A 2DZPA 3USBA 5DLCA 2E1DA 1TPB1 1R47A 2ZZ2A 3BLFA 3DFOA 1ML1A 3QEZA 3WK0A 3W7IA 2RH9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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