1TV5A

Plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenase with a bound inhibitor
Total Genus 149
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
149
sequence length
409
structure length
371
Chain Sequence
FESYNPEFFLYDIFLKFCLKYIDGEICHDLFLLLGKYNILPYDTSNDSIYACTNIKHLDFINPFGVAAGFDKNGVCIDSILKLGFSFIEIGTITPRGQTGNAKPRIFRDVESRSIINSCGFNNMGCDKVTENLILFRKRQEEDKLLSKHIVGVSIGKNKDTVNIVDDLKYCINKIGRYADYIAINVSSPNTPGLRDNQEAGKLKNIILSVKEEIDNLEFLWFNTTKKKPLVFVKLAPDLNQEQKKEIADVLLETNIDGMIISNTTTQINDIKSFENKKGGVSGAKLKDISTKFICEMYNYTNKQIPIIASGGIFSGLDALEKIEAGASVCQLYSCLVFNGMKSAVQIKRELNHLLYQRGYYNLKEAIGRKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
publication title Structure of Plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenase with a bound inhibitor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase homolog, mitochondrial
total genus 149
structure length 371
sequence length 409
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2004-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1tv5A00
3IEBA 4Q4KA 3N34A 4QISA 3W7DA 3GNNA 4O50A 4RXFA 2FIQA 4K8EA 1PHQA 3QYQA 1W56A 2G97A 3MBFA 1KFEA 1YTDA 2C19A 3UXAA 3ABQA 1L6YA 3QZEA 4NZJA 4RV8A 1NFBA 3OVRA 4UTJA 2DZSA 3PB2A 1V7YA 3B03A 4CCCA 4GUGA 1XBYA 2VFDA 3DI0A 4RCXA 1A53A 1OHLA 2BSLA 2ZRYA 4XQ6A 1XBVA 2E6AA 4LC6A 2YGYA 2QR6A 5FF3A 1THFD 3JR2A 5D05A 3IGSA 2CLOA 3IVUA 1VHCA 4RK8A 3G1DA 3CIWA 3OVQA 4FO4A 3MI2A 4KFPA 2EPHA 1HUVA 3EB2A 4FNRA 3LHYA 2A21A 1O5KA 2Q3RA 2B7QA 3IVTA 3S5YA 4WY0A 2A5HA 4Q33A 5KINA 3F4NA 3PG9A 5LNVA 2JBMA 1D9EA 2ISWA 3B0VC 4A22A 1QNVA 2I9EA 4BI6A 1Q6RA 3W85A 4UC5A 4CNOA 4UXDA 2BX7A 2PRLA 4ALDA 4LVFA 5D30A 2ZQ0A 3S1WA 2G95A 3RNDA 2W6RA 3P60A 2VFEA 3QQ0A 1ML1A 5CZTA 3EWBX 3EXSA 4NX5A 4ZQNA 3L68A 4O15A 4PL2A 4Z1DA 5CZJA 1EP3A 3MP3A 3LTYA 5F4SA 5LNSA 4FX7A 3TH6A 3WK0A 1NVMA 2OX1A 1WOBA 3OG3A 4GJ1A 5HR7A 5AHMA 3W83A 1OFAA 3TJLA 2Z1BA 3LBCA 5DY3A 3TFXA 1GWJA 2X30A 1MZHA 3DENA 3LXCA 1ZJIA 3LBMA 1O5XA 5D2XA 1FWWA 4WY0B 4MY1A 3GYEA 4UTHA 1DV7A 1YDOA 4DPQA 2GOUA 2WOQA 3TXVA 4LV4A 4EWND 3O06A 4JGDA 2B4GA 2HS6A 1VZWA 2YR1A 2E5CA 3PBYA 3DFNA 5LGXA 2ATMA 2VEMA 4FIRA 1P4CA 1Y0EA 3N3MA 3SY5A 4POCA 2BWGA 1WX0A 2JGQA 3UPWA 3Q2DA 4JTLA 5U4NA 4WQ6A 2VFGA 1PCWA 4I7VA 1JJKA 2NXGA 5CKSA 1X7FA 1OJXA 3BGJA 3NDOA 3YPIA 4P61A 4MZYA 3P80A 4UMAA 4PTNA 4UNLA 1GYLA 3LCXA 4UFJA 1OYCA 3LCGA 3S1UA 1KM0A 3UNDA 1LZOA 3O16A 4N6EA 3UXDA 1VGAA 1QDSA 2BZNA 3WJWA 1F5ZA 2YCEA 2QKFA 4XBSA 1TTQA 3CQ0A 3THQA 1QWGA 1M7PA 4DO6A 3I7RA 1L2UA 2C0AA 3MP4A 3NGJA 2E09A 1K03A 4TO8A 1OYAA 3DFSA 4EF9A 4Z0JA 3C4UA 2FPYA 3LHUA 1S3HA 2X1RA 1CI1A 2A1YA 3EEGA 4YXGA 3BO9A 5D09A 4JIPA 3W2LA 3IIXA 1OF8A 3M6YA 4GUFA 1LBLA 4GBUA 3BV4A 4R53A 1LTDA 2DZUA 4S2BA 4RZ5A 5HR6A 3DI1A 4WOZA 1QO5A 1TJRA 1N7KA 2FFCA 5C5YA 4O13A 3O6CA 3OEXA 2HSAA 2VEPA 3I65A 4GWEA 1JUBA 1ICPA 2DZWA 2YDAA 1KTBA 1GOXA 1VHNA 4A21A 1Q6QA 3G1AA 1OF6A 1U5JA 1TV5A 4MY9A 3CU2A 4TU1A 1KM4A 4QITA 4A3UA 4JS3A 4N6FA 4CCEA 4M19A 3PWAA 1IXQA 4NU7A 2H6RA 2QF7A 1T0OA 3G0XA 4IMFA 1XCFA 3LRLA 3FKRA 4EVZA 1OX6A 1DBTA 4NNBA 1WYIA 4XWUA 1KFLA 4I9AA 2FQIA 3W1MA 5KMYA 3EX6A 3W76A 4O57A 2QJGA 1MSSA 3C6CA 5DXXA 3W1LA 5E1QA 3S9YA 4LUJA 3HQ1A 2WKJA 5A5WA 2ZRWA 4JYFA 2I14A 4UFHA 4LRTA 3ZWTA 1KM1A 2CZDA 1KFBA 2RH9A 2WO5A 2VENA 3GDKA 4GFSA 1H62A 1UUOA 3ZR4A 3O6DA 1KTNA 2NWRA 3DGRA 4NXSA 2RDWA 4JTHA 3JRKA 4I7WA 2QCNA 4UFIA 2VELA 1TTJA 3Q94A 4ZL1A 5EPDA 4BWLC 2FB2A 4MLRA 4W9TA 1UJPA 2C6QA 3INPA 2ZTKA 1JULA 2E5BA 3TXZA 1K7FA 3W2UA 5F2GA 1LRNA 3PSWA 1DHPA 1QPNA 3NQ6A 5AYYA 3BW4A 1YDNA 1Q6OA 4UTWC 3BK0A 2RKXA 5I3IA 1DORA 3NQ7A 3W23A 2GVLA 3S5ZA 3CTLA 1RQHA 4OGZA 4O52A 3DFPA 3N14A 2DZPA 4UCGA 5AYXA 2GPTA 3CEUA 5K4XA 4XUGA 3A22A 3LM7A 4LC8A 4DO5A 4K6AA 2Y61A 3NZ1A 5FF0A 1TV8A 3KX6A 4LOCA 5CG7A 5BRBA 2WV8A 3KVMA 3R89A 4MUZA 4AMAA 3M0ZA 3SSJA 5HNRA 3W2NA 1LRTA 2DZTA 3P7YA 2ZZ7A 1G4TA 1RQEA 3LERA 2YYTA 2J9YA 3M7WA 4JX4A 5MHBA 4MLJA 5FF4A 2JKEA 3B0UX 1RVGA 2A4AA 2E5DA 4TR9A 5G2HA 3TK7A 3QW4B 4JTEA 1T99A 5KZDA 3HGOA 4RR4A 1SO3A 3NL5A 4JX6A 4Q32A 3TMQA 4O4VA 5GVJA 3TCEA 1HL2A 3NQMA 1XL9A 1YDVA 3GVGA 4LNYA 4MY8A 2C13A 3KXQA 1GQNA 4CNPA 3DZ1A 4AWUA 1H50A 2PRHA 4JTUA 3IGUA 4AVFA 1F76A 1KV5A 2P10A 5E0KA 5AHEA 1H7RA 4A29A 5IBXA 1FCVA 3N73A 4AH7A 5C2XA 3GLCA 4GNJA 1P5BA 4O54A 4BFAA 2E77A 3EX1A 5G2IA 2CWNA 3ATYA 5K4ZA 4MZ8A 2P0OA 3U2OA 1SW7A 5CGQA 1EUNA 2OJPA 2PC4A 5K9DA 4WD0A 4WXYA 5DY2A 1TPUA 4JX5A 5K2ZA 1RQBA 4IMCA 4LS2A 5H2ZA 1FDZA 1ALDA 1OFPA 5FF7A 3G0UA 3MYOA 4H6KA 4RZ6A 3A5VA 5AHLA 4ADSA 5BMWA 2AAMA 2C1HA 2J24A 2AGKA 3LHWA 4XTDA 3PS7A 1TO3A 4AAJA 1ZAJA 4LRSA 1Z44A 3STEA 1XM3A 4FNPA 1XUUA 4HSOA 3QQ1A 4NJIA 2ZRXA 2PURA 4IX0A 3TX9A 5EMUA 3DBPA 2VFFA 4AWTA 3QJAA 1OFOA 4MJMA 3M5VA 2C18A 3GXTA 3NQDA 1J2WA 1N8FA 3KOFA 3QFEA 1PCKA 5BMXA 3W7QA 3KVLA 3W1TA 3CB8A 1RD5A 2ZA1A 1WDWA 2R8WA 5J5DA 2CZ5A 2C3ZA 1AL7A 3BLEA 4IXHA 4HT3A 4TX9A 2X16A 1W3IA 4KWVA 3RLVA 4OQVA 3WK2A 3B05A 3H53A 1O4UA 5CPLA 3W7IA 5LNUA 2QUUA 2E6DA 1GEQA 4HNVA 3GAYA 4MVAA 5CPMA 3S5NA 2JKPA 4YCOA 2QDGA 2TYSA 5TIMA 4IGHA 5IM51 4PH6A 3C2OA 3OVPA 3NYZA 5KZEA 4BI5A 4JTGA 4Y90A 4OHQA 2AQWA 4RZ4A 1IGSA 3FJLA 2WSRA 3LV5A 5SWUA 3E49A 4O11A 4OE7A 3GDRA 1EWDA 4QSHA 3TR2A 2CLKA 1TQJA 3EWWA 1EA0A 3LCLA 5G1YA 1W8SA 1PV8A 3P67A 3S5OA 3QMRA 3P74A 4PFMA 4K8HA 3U8GA 1RPXA 1VR6A 2BXVA 3L0NA 3LOTA 3NR0A 3W7EA 4O19A 2ZZ4A 3L2IA 1FDJA 1FY6A 3SGZA 3L5LA 1NF0A 1YTEA 3B06A 1EIXA 1OFEA 3W7JA 3LTSA 1JUEA 1C9DA 1VCGA 1ME7A 4O10A 5D2YA 3W1QA 2A6NA 2Y88A 1CW2A 1BKSA 4HHPA 2NXIA 5LZLA 3T40A 5FEXA 2ZA3A 2ZZ2A 3L66A 1C8VA 3NPXA 1UUMA 3TFCA 1H1ZA 1K8XA 2FTPA 1P0KA 4HKPA 3KFTA 3VI2A 3W7MA 1F7BA 4JR5A 1EP1A 2Y89A 3HPSA 3PUEA 3R2GA 1GG1A 3LCIA 4IMEA 4O18A 3VCRA 1OFQA 3N2MA 4QIUA 4P2VA 5EY5A 4JN6A 3ZS4A 4NXKA 4ICNA 4IX2A 1OYBA 2G96A 2GQ8A 1RV8A 3PF3A 5HUPA 3PULA 1W5OA 3E96A 2CLMA 4ZQPA 5E93A 1KA9F 4K37A 2YYUA 3O8AA 4O8RA 5FI8A 4JIQA 5D32A 3KRSA 3SGUA 4HIBA 3M5YA 1A50A 1W0MA 4B5NA 3ZFHA 3GKFA 2H8ZA 2ZFAA 1R2SA 4MKNA 2C14A 1DJNA 4UUIA 2FLIA 3FEMA 4M7SA 5KZMA 2NV2A 4WOQA 5EL1A 1XBXA 5CSSA 3SR7A 6ALDA 1TCDA 3HOJA 4O4WA 1KM2A 3UPBA 1QCWA 1SZEA 2YX0A 3KRUA 1ZY9A 1AW1A 2YFNA 3PUOA 2QCFA 1FWNA 4BR1A 1H7OA 1S5TA 2Y7DA 3DKJA 3LRMA 2XN2A 5DELA 3GXNA 1VCFA 2QCLA 5K7JA 1HO1A 1FQ0A 2W0UA 2QCDA 2IQTA 3E9AA 2WJZA 3TSBA 4KFNA 1GG0A 3P5YA 2A6LA 1KV8A 3LCWA 5CPNA 3Q58A 3GNDA 1XXXA 5L6UA 5BOOA 5G5IA 2Y7EA 2ZRZA 4UR7A 4HNTA 3T78A 2FB3A 3LRKA 2VC6A 2NLIA 3PB0A 4O28A 3P8JA 4O1BA 3TW6A 2JGYA 3EKLA 4ONVA 3W2KA 3W22A 3RK8A 1O60A 1H63A 3O63A 2HS8A 1MO0A 4Z1AA 2XN0A 3G8RA 5I3KA 1KBIA 1LCOA 3C2EA 3FIGA 3G8EA 3UYCA 3MBDA 3P61A 2Y7GA 4AEOA 2NX9A 1MEHA 1FUYA 3UD6A 1DL3A 1LYXA 3EXTA 1IIGA 4IOTA 5G2WA 4TMBA 1RZMA 4UFLA 2RFGA 1IXPA 2VFIA 1F6PA 1IXNA 1TPH1 1VPXA 1UB3A 4AWSA 1BWKA 4ORIA 1FXQA 2Z0IA 1TV7A 3GB6A 3NA8A 2ISVA 1W1ZA 2QCDB 3OA3A 3SZ8A 2OT1A 1TRIA 3M43A 3UY7A 1KBJA 3S8HA 3NQAA 1ZAHA 5DXYA 3KAOA 3W2JA 3M1ZA 3W88A 1LP6A 4GUJA 1TPEA 1E51A 1VLIA 2V30A 1KFCA 1X8FA 2Y70A 2RHGA 5K9XA 3I68A 3P5ZA 1G67A 1HTIA 4BF9A 3NL2A 2VOMA 3NPUA 4JEQA 3P84A 1NF7A 2ZRVA 1WOAA 5K3VA 3G1XA 1BTMA 4FNQA 4O1AA 4G1KA 1TPB1 4GRSA 3L5AA 2ATSA 3G1YA 2RDTA 1ZNNA 4M5PA 3IGXA 3A5FA 4QQ3A 2G5WA 1OABA 4LVGA 3LHVA 3BG9A 5D2WA 2Z6JA 4YLWA 5HWMA 3E0IA 1GYNA 3B4UA 5I3FA 3W71A 2Z6IA 3W7CA 4K39A 2Z2UA 1H7XA 2DJXA 1SFJA 3N2XA 3TAOA 3ZWSA 3B04A 1IF2A 4N9CA 4WJEA 3HMJG 1I2PA 2E6YA 3FJ6A 3T4CA 5EBUA 1ZFJA 1K8YA 2A85A 5J5RA 3W7LA 4DBDA 4JYEA 3W7HA 1FXPA 3VE9A 1YYAA 2TSYA 4AB4A 3FOKA 2JK2A 5KTLA 1H7NA 4X3ZA 3CIXA 3PSVA 4HPXA 3MHFA 4ZZ9A 2A2IA 1ICSA 2VKZG 1JUKA 5C54A 3M47A 1YTKA 3BVJA 3WJYA 5FEZA 5CPOA 1V5XA 1F6KA 2A0NA 3GK0A 4RKAA 2NX3A 3QSRA 1K7EA 3MI3A 4J9JA 4ML9A 1GVOA 5HINA 3PVFA 2DORA 1W5NA 1OFRA 1ZAIA 4FX8A 1LORA 2YPIA 3NM3A 2I1OA 5T26A 5HJLA 4UR8A 4FB7A 3GZ3A 3W07A 1W5MA 2NUYA 2VEIA 3W3OA 4NVTA 3MMTA 5F1UA 1K7XA 2J9ZA 3CHVA 1FWTA 4LW7A 3G24A 1JVNA 2OMAA 1OG0A 5KSWA 4Y96A 3PG8A 4LS1A 3T55A 1BEUA 4A2SA 1HFBA 1SO4A 1L6SA 1M6JA 1OVDA 3UWUA 3E02A 3W7OA 4KWWA 1R30A 3TW7A 3HPXA 4WXZA 4Z0SA 2J27A 3G18A 3W1UA 3LXAA 2FPVA 3C3NA 4ADTA 1W54A 3KRZA 4Y9AA 1TTPA 1G4SA 1ZALA 3C2VA 4FX6M 1G7VA 4RXGA 4N02A 1R46A 4JDBA 2X1UA 3IIOA 1Z41A 5G4WA 4PA8A 3UWZA 1F73A 3MHUA 3LLFA 2PCQA 1M5WA 4FF7A 3SECA 3JS3A 4O1CA 4NQ1A 5F1VA 2YFOA 4XKYA 3V75A 4MZ1A 3NG3A 1FX6A 3MO7A 1O95A 1EP2A 1XC4A 3E12A 5F2IA 4NJKA 4GUIA 5FESA 4O0ZA 3M9YA 1GJPA 3T44A 1QO2A 1SZGA 1AK5A 3W87A 3G3DA 1WV2A 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 4ZVJ A;  1J5T A;  3DFQ A;  3S1X A;  3W1X A;  2H3B A;  3LX9 A;  1GVR A;  4O1D A;  4RX0 A;  4E2D A;  3UQN A;  4LV9 A;  1ZCO A;  4MPQ A;  3WJX A;  1WXJ A;  4M7T A;  4O16 A;  6TIM A;  2Y7F A;  1B4E A;  2V0T A;  2ABA A;  3S1V A;  3QST A;  3W7P A;  3R13 A;  3SW6 A;  3TNO A;  3CEP A;  1VRD A;  3UWY A;  3QW3 A;  3C2R A;  4LWW A;  3STG A;  5F4W A;  1S5W A;  1B57 A;  2TMD A;  4DO4 A;  2EHH A;  3G0S A;  2H3D A;  4R33 A;  4UTU A;  1NSJ A;  5A8G A;  1FDY A;  2NXH A;  1S5V A;  3W6Y A;  1HO4 A;  3AJX A;  3D0C A;  3A24 A;  5LNR A;  1XUZ A;  1WAU A;  1WBH A;  1OX4 B;  4MYA A;  2VFH A;  3IIP A;  4CLM A;  4JTF A;  5HUL A;  3W72 A;  2GVJ A;  3BPW A;  3DFT A;  3TAK A;  1KLY A;  1FCU A;  4JTK A;  3MHG A;  4FNU A;  3W1R A;  3SFK A;  1M7O A;  3NQV A;  5I3G A;  1D3G A;  4ZQM A;  4ZQC A;  2V82 A;  4X2R A;  5D04 C;  4FXR A;  4L4L A;  3P8I A;  1SW3 A;  1O94 A;  4FNT A;  1QPR A;  5TQL A;  3VND A;  4Y8F A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1JFX A;  3GNN A;  4RXF A;  1PHQ A;  1W1B 1;  2G97 A;  3MPG A;  3TWA A;  5IDI A;  3K46 A;  1A4M A;  4IG2 A;  3OVR A;  3GWQ A;  4DB7 A;  3B03 A;  4AIB A;  4CCC A;  4DZ5 A;  1XBY A;  2VFD A;  1A53 A;  2BSL A;  2ZRY A;  4PUE A;  4XSM A;  1JAE A;  3I4K A;  2VDI A;  3QR1 A;  1THF D;  3L2L A;  3IJD A;  2CLO A;  1CCW B;  3IVU A;  1WDS A;  3GXI A;  1Q5M A;  3CIW A;  4Z2I A;  3MI2 A;  2EPH A;  3LHY A;  1TX2 A;  2Q3R A;  3IVT A;  2I17 A;  3N4A A;  5HMD A;  1R87 A;  2GWG A;  1IWP A;  1XH1 A;  3TCS A;  3KS5 A;  2JBM A;  3T9P A;  2QII A;  2ISW A;  3O6A A;  4C7G A;  2FMO A;  4F79 A;  4A22 A;  1QNV A;  2I9E A;  4LBR A;  1XLC A;  4H6Q A;  4DM1 A;  2GWN A;  3VNM A;  1HJW A;  1XPY A;  2W92 A;  5HPC A;  2INZ A;  3E1F 1;  2ZQ0 A;  1ZSX A;  3S1W A;  3U5Y A;  3IV8 A;  1IEX A;  1QI4 A;  3PN8 A;  1ML1 A;  3T0A A;  1BXN A;  3E6E A;  1VPY A;  4IG2 B;  2O56 A;  1UUQ A;  3ISI X;  4QLK A;  4W7W A;  3K4A A;  1Y5W A;  3TH6 A;  2NVA A;  1WOB A;  5AHM A;  1OFA A;  4U2Z A;  1ZL1 A;  5FA5 A;  1TZ9 A;  2X30 A;  1BTC A;  1RCO B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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