1F7BA

Crystal structure analysis of n-acetylneuraminate lyase from haemophilus influenzae: crystal form ii in complex with 4-oxo-sialic acid
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
MRDLKGIFSALLVSFNEDGTINEKGLRQIIRHNIDKMKVDGLYVGGSTGENFMLSTEEKKEIFRIAKDEAKDQIALIAQVGSVNLKEAVELGKYATELGYDCLSAVTPFYYKFSFPEIKHYYDTIIAETGSNMIVYSIPFLTGVNMGIEQFGELYKNPKVLGVKFTAGDFYLLERLKKAYPNHLIWAGFDEMMLPAASLGVDGAIGSTFNVNGVRARQIFELTKAGKLKEALEIQHVTNDLIEGILANGLYLTIKELLKLEGVDAGYCREPMTSKATAEQVAKAKDLKAKFLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Active site modulation in the N-acetylneuraminate lyase sub-family as revealed by the structure of the inhibitor-complexed Haemophilus influenzae enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-ACETYL-NEURAMINATE LYASE
molecule tags Lyase
source organism Haemophilus influenzae
total genus 127
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.1.3.3: N-acetylneuraminate lyase.
pdb deposition date 2000-06-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1f7bA00
5DLCA 4O8RA 2Y85A 1IIHA 4OV4A 1XUZA 3EXRA 3GXPA 2JKEA 2Y63A 2Z6IA 2VEIA 3TQKA 4Y6GA 1OG0A 3CEPA 4LS2A 4UFHA 3TSMA 1W5QA 4JIPA 5EMUA 4H6KA 3INPA 1OFDA 3C3NA 3RFAA 4L4LA 3MBDA 4JYDA 3P82A 4HHPA 2ZQ0A 1ZNNA 3WK0A 2VFHA 2JKPA 2Y88A 3F03K 4O50A 5HQEA 3L5MA 1JCNA 2YR1A 1OK4A 3S0CA 5F4XA 3L5AA 4O4WA 4QM1A 1XBXA 3EX1A 1Z42A 2OT0A 4K36A 1OF6A 4XWUA 3W7MA 1TJPA 3P61A 5C5YA 4JD4A 4P61A 1MEHA 3IRDA 4OBTA 4O10A 1EP3A 3SSJA 2AQWA 1EPXA 1H1YA 2FFCA 1VS1A 4XUGA 3TW6A 4DO5A 5CSSA 3UWUA 4LRTA 1QPNA 4O18A 3B05A 4MZ8A 1G7VA 3CPRA 1TB3A 4GUIA 1FDJA 5AHMA 3LCGA 1QNVA 1AW1A 1F74A 2V81A 3CC1A 5F4SA 3MBFA 2RH9A 1KV5A 1Z48A 4KWVA 3W83A 4LW7A 3YPIA 3W7OA 4JNMA 5E1QA 2NX3A 1PHWA 5U7SA 1B57A 1ME9A 1KM4A 2H3BA 4BWLC 3RLUA 4UMBA 1QR7A 2QDHA 4GNJA 1LDCA 1J4EA 1TTIA 3O8AA 3F1QA 3UWWA 3W7NA 4CNNA 1YYAA 3L65A 3MP3A 3W1AA 2E5BA 2NZLA 1DKWA 2A6LA 2NV2A 4MYAA 3GKFA 5DY2A 2NX1A 3NM1A 4Z1CA 2HTMA 1DJQA 5AHLA 1YLVA 1EP2A 2YFNA 1EIXA 2Y70A 1QPQA 4JGDA 1YTEA 3R5EA 4R33A 4UNLA 5FF0A 4MPQA 3T55A 1R2TA 5DCDA 4GE8A 5K9DA 2RDWA 3F4NA 2W0UA 4A3UA 1F2JA 1RR2A 1NEYA 1GEQA 4E2BA 7TIMA 4GFSA 3CM4A 4OHQA 1PCWA 1ZAJA 1N55A 3EWZA 1N8FA 3M5YA 1KW1A 3LRMA 5G4WA 4A2SA 2E5CA 5F4WA 1PL9A 4MOZA 3W74A 5LHEA 3M1ZA 3GXTA 4JTUA 2VEKA 4WZHA 4AMAA 4LTSA 4ONVA 5LNSA 4NNAA 4M6QA 1VLIA 3M6YA 1W5MA 3M16A 5FEWA 1T0OA 4M6VA 1TIMA 3NXFA 4YCOA 2G96A 2ATMA 3GVGA 5AHIA 4O28A 2E6AA 2QJIA 5FI8A 3LCWA 3O6DA 3TKFA 4DPPA 4H4IA 1YADA 4ZQRA 2V30A 1KFKA 3S5ZA 4P2VA 4YLWA 3DGRA 3W7HA 4KWWA 1RVGA 2XN2A 5D03A 4D2JA 4UTUA 2Q3RA 2DZWA 3P81A 3KFTA 3G1HA 5I3FA 1TRDA 4JTKA 3W2KA 3UPWA 3B8DA 2JKAA 4Z0SA 2YW4A 4RKAA 3HQ1A 2DP3A 2DZVA 5G2HA 1TPFA 1EA0A 5E93A 2Y89A 3TQVA 4XKYA 2VKZG 1L6YA 4XKYB 1QFEA 4OGZA 3LHTA 3GK0A 1AW2A 3PS7A 3P84A 4K8HA 4FNUA 1YXCA 4LWWA 3C8FA 1H63A 3C2FA 2DZUA 3HB9A 4E0CA 4CQ9A 5A8GA 1OFPA 1S5VA 4O1AA 2VEMA 3MHFA 4LOCA 5CPMA 4LU0A 4IGHA 1ZJIA 3NM3A 4N9EA 4O4VA 3ABRA 1ZY9A 2QKFA 4NNBA 3W7GA 1H51A 2AGKA 3DAQA 4AB4A 2GQ8A 2NUXA 3CIWA 4LVFA 4RV8A 1SZFA 4FNQA 1VJIA 1FCBA 2WNZA 4ADSA 2X2GA 5H2ZA 3C56A 2Z0IA 4Q32A 1JCYA 3P5YA 1FWRA 3LTPA 3OIXA 2C14A 2PRMA 3LHWA 3C52A 3W1LA 4LV9A 1FWNA 2RHGA 3S5NA 1SW3A 3NG3A 4NU7A 2PURA 1XL9A 3Q58A 1H60A 3M5XA 4FX6M 3TV8A 3WK2A 1GVSA 2FQIA 3WK3A 4FF7A 4A29A 2E09A 1XXXA 3HPZA 2C6QA 4JN6A 3WJZA 2PE4A 1TPH1 3BW2A 5AB3A 2ISSA 3N73A 3JR2A 2YYUA 4XBKA 3R8RA 4CQ8A 1KM0A 2QEZA 2UV8G 1KLYA 2NXHA 2X30A 2G5WA 3QPYA 4LUJA 4K7VA 2NWRA 1LRQA 2LLEA 4AHOA 1I45A 4CNOA 3TH6A 3GNDA 1KTCA 2VC6A 2XN0A 3TNOA 5L9FA 2V2CA 1SZGA 3CTLA 4JEQA 3M44A 4Y96A 4K6AA 5EYWA 1W3TA 2FLIA 4WY0A 4WY0B 3R2GA 3O16A 2PRLA 4WXZA 1K8XA 4TO8A 4LUIA 3KRSA 4RXFA 5DCBA 1YDNA 1GVQA 3UNDA 4DO6A 1JUBA 4OV9A 1YTDA 2Y7DA 4FB7A 3HF3A 1SQ7A 1VCGA 4Z1DA 5CPLA 4FEZA 3MJYA 3QYQA 2NUYA 1WBJA 3LTSA 4JTIA 1KFEA 2A6NA 3ELFA 3SY5A 4NXSA 1Y0EA 1F6PA 3DU0A 1C8VA 4UTLA 3GYEA 4HNTA 3NGJA 2CLMA 3NDOA 3W7QA 1A53A 2P1FA 1VHNA 1K03A 1L6SA 2ZZ4A 3OHIA 3TXVA 3LCXA 1U5JA 3KVMA 4YCPA 4IMEA 5H91A 4UTTA 1ZCOA 3TFXA 1B4KA 3NQ6A 3TC7A 1GPWA 1Q6RA 3W1RA 3R89A 3W76A 3CT7A 2QCMA 3QW4B 3NYZA 3TR2A 4NJKA 3W2MA 2G95A 1OYCA 3W73A 2ZRZA 4C1KA 3JRKA 4UFKA 3NL2A 3NPUA 3QM3A 2QF7A 2PC4A 3G0UA 4Z1AA 3VFLA 1AL7A 1TMHA 3QZEA 4UTJA 5KINA 4WOQA 1W0MA 4LVAA 2BXVA 1JRBA 3DBPA 4GC4A 3SW6A 3W2UA 3OEXA 1XDLA 3UZ5A 2A7RA 3NL5A 4EIVA 5AC6A 3LBCA 3R12A 1OFEA 1YPFA 2GQAA 2P0OA 1W5NA 3P8IA 3HGRA 1M7OA 1KBIA 3IGXA 3VCRA 1JR1A 5AYYA 1RQBA 3N2MA 1AMKA 3DENA 4Y8FA 5AYXA 4UXDA 4DBEA 4IX0A 4O1CA 1O5XA 2V82A 5K2ZA 1CX9A 2YCEA 1GQNA 5TQLA 3FKRA 4MJMA 3MHUA 2V9DA 4DF0A 1A5SA 3PVFA 3G1DA 4IXXA 4RJEA 2QUVA 3MYOA 4QISA 1DQWA 5D2WA 5I3GA 4O17A 1OX5A 3UWVA 1H1ZA 1W3IA 4FX8A 4PL2A 2YW3A 1OFQA 4WD0A 1SSGA 1X8FA 3A23A 2VFIA 1N7KA 1FQ0A 5D02A 5MHBA 3W70A 1G4TA 3O15A 3EX4A 3BK0A 4ML9A 3TUUA 5DBTA 2YDAA 2H3DA 4HNNA 1B3OA 3P7YA 4EF8A 2OJPA 2Y7GA 4XZ9A 2FIQA 3Q94A 1I8JA 3MO7A 1TTJA 4X2RA 4EOUA 4O14A 3CHVA 1H7OA 1WX0A 4GBUA 5KSWA 3LGEA 1OJXA 4LS0A 3TAKA 4QSHA 3B4UA 1YDVA 4KFNA 3RNDA 1ZHAA 2A2IA 2ZZ6A 2BZNA 3ZR4A 8TIMA 2B7QA 4R53A 2E1DA 4DEFA 3O6CA 4O0ZA 3TU9A 1QPOA 1P5BA 1EEPA 4JY9A 2RDTA 3G18A 4M19A 3O07A 1D3GA 1KFJA 2ZA2A 1K8YA 4RX0A 2NUWA 1X7FA 1ME8A 2DJLA 3A5FA 4O1BA 4O1DA 2Q3OA 3I7RA 4HPJA 1KM2A 1Z41A 4NJHA 1XM3A 4MVAA 4MYXA 4QAIA 3ANYA 1DBTA 5TIMA 1R30A 1WOAA 5HJLA 3P60A 1F76A 3PBVA 1TO3A 2CW6A 4AWTA 3DFQA 3L0KA 2A0NA 1SO6A 3KVKA 3TW7A 2VXNA 1VC4A 1LYXA 2XFWA 4S2BA 5DXYA 2FPVA 3NQ2A 3W7PA 4PEKA 1KFCA 1YPIA 5HUOA 1SPQA 5J5DA 3I65A 3PSVA 5HULA 2E6DA 3STEA 1MSSA 5HR7A 2CLEA 3D0CA 4DF1A 1YTKA 5D2VA 3TXZA 1KA9F 3PSWA 3FJLA 1VYSX 4GJ1A 4EVZA 4MZYA 2Y7FA 2DZTA 2J9YA 2Y62A 1EWDA 1P0KA 3EWYA 2YGYA 3NQGA 1TJRA 3QEZA 3DHDA 2AAMA 1XCFA 5KZEA 5F2LA 5LNUA 4R7JA 4UTWC 1FWSA 4N4PA 4UMCA 1TV7A 5AHEA 4MLJA 2ZTJA 4N9DA 1GJPA 4IXHA 4Z08A 5EBUA 4Z0JA 3IVSA 1SU5A 5FEPA 3LTYA 1G4EA 2Y61A 1FXPA 3B06A 1FXQA 3THQA 2CU0A 1DHPA 3GZ3A 2GVLA 3WJSA 3DFOA 3IEBA 1A50A 4HSNA 3W2LA 1J2WA 4DQWA 1VLWA 3QH2A 1W5PA 3PUEA 4GUJA 2V2HA 4DPQA 1TTQA 1QOQA 3T7VA 4JX6A 2X16A 1SO3A 3IIOA 3G1VA 3A24A 4FNSA 1WXJA 3GLCA 1GVFA 3OA3A 1BKSA 1FDYA 4IWWA 3M47A 4O16A 3A21A 1LP6A 1OK6A 3LERA 4PFMA 3W7RA 4XTDA 1SFJA 2VFFA 4N02A 4UIOA 2EPHA 3THAA 4WUIA 2JK2A 4NUWA 2A4AA 1R2RA 1FY6A 5AHNA 2Q8LA 2DZSA 3B0VC 2QAPA 2CZEA 4FXSA 3WFAA 1Z44A 4IMGA 1W1ZA 3ZWTA 2ZRXA 4K7YA 3RU6A 3PUOA 4LC8A 3LOTA 1T8XA 4X3ZA 5BMXA 4ORMA 1VGAA 4KKXA 4XTIA 4M6PA 4IX2A 3STGA 4NX5A 1EUAA 3C2RA 3PY2A 2TRSA 3BG3A 1SUXA 2GUUA 2FJKA 3MI3A 4EWND 1D9EA 5EL1A 1VHCA 3PC0A 3BG9A 2TYSA 2DJXA 3MI2A 2C0AA 3AO0A 5EPDA 4BWLA 1LZOA 1QO5A 3TROA 3SGUA 1K8ZA 1V7YA 2I9EA 3G8RA 5D37A 1MXSA 2C18A 5CZSA 1TQXA 2FTPA 5CZTA 3VNDA 2DZPA 4NXKA 2V8ZA 1DORA 2X1UA 4O54A 2QCLA 4NZFA 2QJGA 4YXGA 3NVTA 3W7CA 1SW0A 3BW3A 3FEMA 2C13A 1I2OA 2BTMA 1H7WA 2C19A 3Q2DA 4ZVJA 3U8GA 3M9YA 3LM7A 1MEIA 1LORA 3ATZA 1I2PA 3NQDA 3U6WA 1JCLA 3S6DA 5C6MA 3DKJA 2CZDA 4O13A 3LI0A 3QRHA 3GDTA 3IIXA 5E0KA 3TFCA 1WYIA 3V1PA 4ZL1A 2HS8A 1T96A 4RXGA 3BV4A 1FDZA 4G1KA 2R8WA 1NAL1 4O11A 3W7KA 1Q3NA 1XUUA 1GVRA 1NVMA 4WJEA 3FYOA 3IIZA 4JTEA 3MYPA 4IMCA 1TV8A 3LV5A 3NQCA 1EUNA 3TA6A 3BLEA 1T99A 4H3DA 4MLRA 3UWQA 3G8EA 1DVJA 3N9RA 3STFA 1RZMA 1FX6A 3S1VA 4PH6A 3LCFA 4LS1A 3NEVA 1F5ZA 1AK5A 4XQ6A 4PTNA 3NPWA 2WSYA 3VI2A 3TX9A 4AHPA 2YXGA 3EEGA 3BGJA 3E9AA 3K30A 4IPIA 3QSTA 5G4EA 3SJ3A 4IMDA 4KFOA 3QMTA 2TSYA 1Q45A 2WNNA 3TIMA 1UASA 3B0PA 2B0MA 1Q6QA 4Y90A 5FF7A 4HSOA 1TPWA 5DELA 5LNVA 2HMCA 5KZMA 4LVDA 3HOJA 4DF2A 1P4CA 3M0ZA 4AWSA 1FCUA 2ZZ1A 1O95A 5KMYA 2GJLA 1A5CA 4ALDA 3LRLA 1B9BA 4W9TA 3QQ1A 4K38A 3NQMA 2I1OA 5LGXA 4X22A 2NV1A 3KXQA 3NQFA 4AWUA 3PR2A 3KHJA 3NQ7A 2NXIA 1TQJA 1K3UA 3S8HA 1ONRA 4U4MA 1LTDA 1W8SA 1GTHA 2ZRWA 2F84A 1EWEA 5CZ0A 5D05A 4LNYA 3W22A 1K02A 3BLFA 4HPXA 4LVBA 4LV4A 5TBOA 1LRNA 4TMBA 1LLWA 4MFEA 2EGZA 1F73A 1M5WA 5F1VA 3ABSA 3UZJA 3DKLA 5AYZA 3T44A 3LHUA 4MFDA 4ZQCA 4IMFA 3NA8A 5G5IA 1ZALA 1QWGA 1GWJA 2E6FA 1FCVA 4JDYA 2X1SA 4E38A 4YL2A 3IVUA 4FX7A 5HMSA 5C54A 3N9SA 1XBZA 5L6UA 3P67A 1KV8A 1WV2A 2A7PA 2ZA3A 1TYGA 1PIIA 4UTKA 3KOFA 3CU2A 4J9JA 3G1XA 1HG3A 1UCWA 2R94A 5K3VA 3W71A 1BWKA 1H50A 3NPXA 2GVJA 1W5OA 1ZFJA 3KVJA 1KTNA 4I7UA 3IV3A 1SW7A 4M7TA 3TSBA 3A9IA 3DFNA 2ZYFA 3IIVA 4FXRA 4QNWA 2F7FA 3S1XA 4AF0A 3H53A 4OWGA 4AF0B 1WQ5A 1TPC1 1S5TA 4IOTA 1I2NA 3N14A 5LZLA 1ALDA 4DELA 3TE9A 1XBYA 3NQEA 3G0XA 1VH7A 3QFEA 2CLOA 4FIQA 5D33A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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