1F7BA

Crystal structure analysis of n-acetylneuraminate lyase from haemophilus influenzae: crystal form ii in complex with 4-oxo-sialic acid
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
MRDLKGIFSALLVSFNEDGTINEKGLRQIIRHNIDKMKVDGLYVGGSTGENFMLSTEEKKEIFRIAKDEAKDQIALIAQVGSVNLKEAVELGKYATELGYDCLSAVTPFYYKFSFPEIKHYYDTIIAETGSNMIVYSIPFLTGVNMGIEQFGELYKNPKVLGVKFTAGDFYLLERLKKAYPNHLIWAGFDEMMLPAASLGVDGAIGSTFNVNGVRARQIFELTKAGKLKEALEIQHVTNDLIEGILANGLYLTIKELLKLEGVDAGYCREPMTSKATAEQVAKAKDLKAKFLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Haemophilus influenzae
publication title Active site modulation in the N-acetylneuraminate lyase sub-family as revealed by the structure of the inhibitor-complexed Haemophilus influenzae enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-ACETYL-NEURAMINATE LYASE
total genus 127
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.1.3.3: N-acetylneuraminate lyase.
pdb deposition date 2000-06-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1f7bA00
2CZEA 1KM2A 1YPFA 3BW3A 1OJXA 1BWLA 4IXHA 2ZZ6A 1LCOA 5F4WA 1KTCA 3AJXA 4CNNA 1C8VA 1HO4A 5C55A 4N4PA 3P8IA 4PCFA 1PHWA 4PEKA 2HS8A 1FCBA 3NQAA 1TPFA 2X1RA 4UUIA 3NNTA 5HR7A 1XBYA 1C9DA 2X16A 5I3JA 3TCEA 3ABQA 2NX9A 4Z0JA 3LHUA 1PL9A 4WJEA 1MZHA 1XBXA 3W7DA 1A5CA 4IOTA 5E1QA 4Y8FA 1UCWA 1SO5A 3PG8A 3W70A 1F74A 1TV5A 5C6MA 4A2SA 3TQ0A 3ZWSA 4MZYA 3VE9A 2ALDA 4GJ1A 3YPIA 1H7PA 1VHCA 4LVBA 4O4WA 4WZHA 2QUTA 3EX6A 3SY5A 3H55A 4GUHA 3W07A 2CLEA 1KFBA 3OEXA 2RHGA 4RV8A 4JYFA 4FXRA 3GAKA 1KM3A 3C2RA 1G4PA 3HO8A 1LM1A 2W6RA 2QCDA 1R30A 4XTIA 2GQ9A 3HPZA 3W86A 4MLJA 4YMZA 2Z2UA 3TMQA 3QFEA 1OFEA 1EX5A 3FFSA 4UTHA 2EKCA 2DU2A 3DGRA 1QCWA 3B4UA 1YTKA 4O1DA 2FQIA 5K9XA 4HNNA 4BR1A 3NL2A 1GVOA 3C4UA 3NPWA 4FX7A 4C1LA 2TSYA 1FWSA 4HSNA 5KZEA 3NPUA 2V2HA 4JTTA 4UTKA 3GYEA 1QR7A 1GEQA 2E5BA 3EX1A 3EWWA 3UXDA 5FEWA 1W0MA 1ALDA 4UTTA 3QW4B 3L0GA 5D38A 3NQEA 1EEPA 4Y90A 1TPH1 2NXGA 3MMTA 3QH2A 4O28A 2H6RA 5H91A 3NPXA 3W2KA 2Y7GA 2Y61A 5F2MA 2YXGA 2I14A 3TKFA 4NX0A 1WAUA 3G0XA 4ZQOA 2A6LA 4QQ3A 1TTIA 5HQEA 2FPTA 4AHQA 4ONVA 2Y7EA 3HMJG 3O63A 2X30A 3E9AA 4XQ6A 2BWGA 5I3KA 1ML1A 1PS9A 1SZFA 3LHWA 4DEFA 2NUYA 2QCGA 4LS0A 3BLIA 2QDHA 3W71A 3W83A 1OABA 3PSWA 3IIOA 3TJLA 5G4WA 3C6CA 1SUXA 4BF9A 5GVJA 3W23A 2YFOA 4JTFA 3NM1A 3BW2A 2ZZ3A 1OFRA 1WX0A 3DFTA 3O6YX 1H1ZA 1LROA 4K39A 1R47A 3M5XA 4A29A 1SZEA 2C18A 5LGZA 1FWNA 3GAYA 3IV3A 3P82A 5FEXA 1Q6LA 3PS7A 1GTEA 2V0TA 3NXFA 3M6YA 5D04C 5KITA 1GT8A 3NYZA 1KM4A 1F73A 4XKYA 2RDWA 3F4WA 3HBLA 5F1UA 1HG3A 5HUOA 4AVFA 5CPOA 5G5IA 3WFAA 1TPB1 3VCRA 4O12A 1IXQA 4RLIA 3HG5A 3I7RA 1I2NA 3GXNA 3R2GA 2FIQA 2Z6JA 4JGDA 2V2CA 3P60A 2CU0A 3LHTA 5U4NA 2GPTA 1OYCA 4FHAA 1VC4A 4FNPA 3STFA 3EKLA 4UR8A 3A9IA 2PRMA 4YLWA 3QQ0A 2GVJA 4NNBA 2QCCA 1JCMP 3NQ2A 3PUOA 1GG0A 5CKSA 4WQ6A 2C16A 3WJXA 5F1VA 3S1WA 2WSQA 4N6EA 5EBUA 2GJLA 1DQWA 2V81A 1D3GA 3W1PA 1TTPA 1FDZA 1LBFA 2WJZA 5FF4A 4DO5A 1ZJIA 3CWNA 3NO5A 4CLMA 5CZJA 1AW1A 3RMJA 4TMBA 3HB9A 3AO0A 3PSVA 3ZWTA 3W7RA 1MSSA 3U2OA 4WXZA 4LC8A 3M5VA 4UMAA 4XZ9A 1VYPX 3C2EA 3GDRA 5F2IA 1SZNA 3N2MA 3EX4A 2C6QA 1TPEA 2WNNA 2CLOA 2XN0A 3KVKA 4FEZA 3W22A 5CGQA 4MYAA 2WNQA 2C19A 3TXZA 5L6UA 3L66A 3UWUA 4JYDA 3TUUA 1B4EA 2CFFA 3KRUA 4MLRA 2FDSA 2WOQA 3G3MA 5H2ZA 3QM3A 4JNMA 3W1AA 4CNPA 5K4ZA 2O7QA 3BARA 2JGYA 3W7NA 1AMKA 1EP2A 4Z08A 4QJ1A 4UCGA 4R7JA 5AOUA 1JQXA 4EF9A 1XXXA 1XI3A 3C2VA 3OVPA 2FJKA 3DFOA 4LVGA 4JTLA 3USBA 1GJPA 4K7VA 1W5PA 1HTIA 1YXCA 3F1QA 3DFPA 2ZZ1A 1JULA 1TJPA 3R8RA 3KVMA 1OYBA 2C1HA 1YADA 3STGA 1JR1A 1XUUA 4O14A 2V30A 1TREA 5HNRA 5DELA 3UWYA 3QMSA 3RK8A 2KZHA 3C52A 1GPWA 2DZUA 4HKPA 1Z48A 3O8AA 4JTKA 4UFLA 2AAMA 3DXIA 1K02A 2XFWA 5BOOA 1DV7A 2ZA3A 1F5ZA 3W1TA 2EPHA 3MP5A 2Z1BA 1UBSA 3LDVA 1GWJA 3UPWA 1TQJA 2FB3A 2YX0A 5AC8A 1B4KA 2X1UA 2VFDA 2YW4A 3PR2A 4K36A 4DF0A 3DU0A 3QEZA 2ZDRA 1LOQA 1FUYA 3NAVA 3O1NA 4XKYB 2J88A 5AHFA 3NZRA 2VFGA 4GE8A 1ADOA 2AGKA 3W85A 5LGXA 1K7FA 2C13A 1K7XA 2NZLA 3HPSA 4M6QA 2NLIA 6TIMA 3G1YA 4AH7A 5K4XA 3TNOA 2WPBA 3T7VA 4LRTA 1ZCOA 4YXGA 4P61A 2ATSA 2VKZG 3TROA 4A2RA 4PFMA 1P4CA 2I9EA 3VFLA 2DJXA 1ZY9A 1WBJA 5CPLA 4HIBA 3F4NA 2F7FA 2PE4A 2FFCA 1AK5A 3LTPA 1QO5A 4JS3A 3LHZA 1S5VA 1C29A 3SGUA 2B7QA 1LP6A 1VQTA 2V9DA 3NQMA 2R94A 4GUGA 3PBVA 2ISWA 1OVDA 3UWVA 3I68A 3IVSA 3V1PA 2NWRA 3DZ1A 1XDMA 3ABOA 3VKJA 4RKAA 2NUWA 1EP1A 3UD6A 1A5AA 3W1LA 3O07A 2X1SA 1YDOA 5ABTA 3MP3A 1OK4A 3MWAA 3W7IA 4WX2A 3E12A 1KV5A 4UIOA 2A2IA 2QAPA 2CWNA 5CSRA 3QYQA 4UFMA 5KTLA 1YLVA 3C8FA 3CTLA 1B3OA 5KSWA 1DL3A 1LLWA 2Y63A 3ELFA 3N73A 4NX5A 5LHEA 2G96A 3W1NA 1FY6A 3SIZA 3N14A 3P61A 1P0KA 1W37A 1JQVA 2VOMA 3M1ZA 2R14A 4KFOA 4MZ1A 3CHVA 2GQAA 3BGJA 3KRSA 3W1QA 1W3TA 2PURA 3BGGA 2YZRA 4X22A 1ICQA 2C0AA 3LV6A 4DBDA 2A1YA 1JCJA 2ZZ4A 5F4XA 5EL1A 4LRSA 5DLCA 1XDLA 4RZ5A 4IXXA 4ZL1A 4OT7A 1H51A 5AYZA 3FLUA 4R33A 4UFHA 3WJSA 3B03A 1YTEA 1H60A 4WUIA 3PUEA 5HWMA 5T26A 1NVMA 4PL2A 5MHBA 1PIIA 2VELA 4WY0F 1W8SA 1ZAHA 5AYYA 2NXIA 3RF9A 2YW3A 2PC4A 4O52A 4DELA 4O4VA 5LSMA 1G7VA 1Z44A 2RDUA 2TRSA 3C0JA 3C2FA 1KBJA 4ZZ9A 3BG9A 1Q45A 3R12A 3TAOA 1W5NA 4UFJA 3HG2A 3TFXA 2V8ZA 2ZQ0A 2Q3OA 1UASA 1DJQA 1FXPA 1FQ0A 2VFIA 4AAJA 3MYPA 3W6YA 3PWAA 5BRBA 5AHMA 5SWUA 1GQNA 4IX0A 4IWWA 3QJAA 2ZFAA 1FDJA 4M19A 4TO8A 1X8FA 1W3IA 5FF0A 3QRHA 1L6YA 2GJNA 2JBMA 2HSAA 4E38A 4IMEA 1LBMA 3UWZA 3B06A 3L65A 1FXQA 1UB3A 4K37A 3QQ1A 5BNKA 4NT0A 2CLKA 3LXBA 4UNLA 5D30A 3I65A 2OZ0A 3EXRA 4OGZA 1TTJA 1KFJA 4BI7A 5K7JA 2NX3A 2WO5A 4B5NA 4EF8A 1SW3A 3FYOA 4NUWA 4S2CA 4JXCA 3M7WA 3G1VA 5I3GA 4N9BA 4L4LA 1ZALA 1DBTA 1D9EA 2ZRZA 1F76A 4HN4A 3CQ0A 3L9CA 1EB3A 3LM7A 4OE7A 5F2GA 1QOPA 4UMBA 1VH7A 1TPVA 3KXQA 4UTMA 1LDCA 3G8EA 5K9DA 3M41A 4AWSA 2C3ZA 1S5WA 4OQVA 2VXNA 3GR7A 2VENA 2QCHA 3ATZA 1BWKA 4BI5A 2J6XA 1KFEA 1QNVA 4Z1CA 1QPQA 1GVFA 1WQ5A 1H7XA 4OU1A 1G6CA 4IMCA 1KM6A 3STEA 2QJGA 3M47A 2OX1A 1OG0A 4O15A 1VCGA 4JTIA 1FX6A 4UFIA 2QDGA 4FNSA 3IEBA 2DZPA 3DBPA 4NU7A 2RDTA 3A5FA 2Y88A 2EHHA 1XFBA 2OMAA 3W7GA 2P10A 1RZMA 3G1XA 4MYXA 3S9YA 4IUOA 4IGHA 4O57A 5BMWA 1P1XA 4LV9A 1JCLA 1ME9A 1X1OA 4AWUA 5L9FA 1W56A 2E09A 3S1UA 3TV8A 1LTDA 4NNAA 1EUNA 4DO6A 5DCEA 1W5QA 3L68A 3W1MA 3W7EA 3G1AA 1CX9A 4TU1A 3O06A 1LRNA 3S5NA 2E6FA 5LZLA 1BKSA 2QCEA 1TTQA 2HTMA 3QF0A 4TR9A 5F2LA 3TSBA 1FWWA 5K9CA 2H90A 2ZA2A 2GVLA 2YSWA 3E49A 5HUPA 2NV1A 3W84A 2QF7A 3DHDA 1ZENA 2TPSA 3TQVA 4J9JA 3VNDA 4XBSA 3DKJA 3GX9A 3NG3A 2BZNA 3LHYA 3O6DA 1XCFA 2E1DA 1O4UA 1R2TA 4N4QA 2ATMA 4UMCA 2D73A 4YWIA 4CQAA 3PY2A 3DKLA 3TW7A 4O8RA 1W3NA 4H4IA 1AW5A 3MI3A 4LUIA 1N7KA 3V75A 3P81A 1NFBA 3GDTA 3S5ZA 2AQWA 2Y6ZA 3G0SA 4DF2A 4RX0A 4BI6A 2P1FA 5LNWA 2JKEA 3M44A 4K8HA 5CZTA 5E93A 3W1RA 3WK1A 1O95A 3LCFA 1SO6A 4QNEA 4O13A 4I7VA 1A50A 1GVSA 4MIMA 1O94A 3O15A 3LHVA 3S0CA 1XBZA 3W73A 4N02A 3IRDA 3W7MA 4GUJA 1QPNA 3NEVA 1CW2A 1DOSA 3DHFA 3P67A 4MOZA 5F4SA 1EWEA 4ZQPA 5D33A 2VEPA 4OWGA 2Q8ZA 1JJKA 3B0UX 2CLIA 3GB6A 2B7NA 2RKXA 1Q6QA 3BLFA 5TQLA 1B9BA 2DZWA 3HG4A 4BWLC 2QCLA 4DPPA 3C3NA 5TBOA 1F7BA 2YGYA 3PC0A 3Q37A 3NVTA 4JICA 4WD0A 3PM6A 2H3BA 3M43A 3S42A 1L6WA 3OBKA 4LNYA 1QMLA 4KWWA 4KWVA 4E2DA 4YCOA 4ADUA 3WK2A 3W87A 2X2GA 3TDFA 5EA9A 1KFCA 1ZHAA 4K8EA 2FPYA 3DENA 1Z41A 4O0ZA 1OX4A 1FBAA 3IIVA 4NZFA 3DFQA 3THQA 3A5VA 1U5JA 2QCDB 3G8RA 4HT3A 3JRKA 2CLMA 5U7SA 1WA3A 3EWYA 4LY8A 1HUVA 2ISSA 1J4EA 3P80A 3SR7A 3IIXA 3L5AA 3W2JA 2G5WA 4LS1A 4DBEA 3GZ3A 4EVZA 3NQ7A 4ZQNA 3CIXA 3KX6A 1QFEA 3IGUA 4UTWC 2Y85A 4EOUA 3PBWA 2JKAA 3ABSA 2JK2A 5D32A 3A24A 3S1XA 3PG9A 1GYLA 4ORIA 2W0UA 5A5WA 3HG3A 1MEWA 1RVGA 3WK0A 3HGSA 3NQFA 4GNJA 3G24A 1QWGA 3TIMA 2BX7A 3BG5A 3NQVA 1FWTA 1TMHA 3CLMA 3EKZA 1Q3NA 2QKFA 4AHOA 4M6VA 4DQWA 2ZTJA 1J2WA 4O0KA 2DJLA 1J5TA 3EXTA 4WOZA 2A4AA 2O7SA 5DY3A 1TO3A 3IIPA 5I3IA 3LOTA 1H50A 2YDAA 3MBDA 2Y89A 5HWNA 1EA0A 1S5TA 2ZZ7A 4LC6A 4O16A 2B7OA 3C61A 8TIMA 1ME7A 2DZTA 2V82A 1DHPA 4JTSA 1W31A 2WKJA 3BW4A 2VEMA 1JCNA 1XBVA 1AL8A 4LU0A 1L9WA 1PCWA 2NV2A 3F03K 1LRQA 6ALDA 2FLIA 2OT0A 4JTEA 2DZVA 3N2XA 4R53A 3I7SA 2IQTA 3NOEA 1GVRA 1H7NA 2R8WA 4MY1A 4UTTC 3UWWA 4QSHA 4A21A 5AC6A 2FB2A 1I8JA 4MFEA 1QPOA 4MZ8A 4M7TA 1YDVA 3VI2A 1K8ZA 3W1XA 1G67A 3LX9A 4ORMA 2PRHA 2BLEA 1RQHA 4IJBA 3W7QA 4FO4A 1NAL1 3MBFA 3PB0A 4E0CA 1UJPA 3LLFA 3FEMA 2DZSA 2E6YA 1QOQA 3NZ1A 4KFNA 1QAPA 3W2UA 3H53A 2NXHA 4IMFA 4C1KA 1H7OA 5HMSA 4KFPA 1WOAA 2WSYA 1SFLA 3O05A 1YXYA 1N8FA 3DFNA 1AG1O 3STCA 4R34A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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