1EUNA

Structure of 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase from escherichia coli
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
213
structure length
213
Chain Sequence
MKNWKTSAESILTTGPVVPVIVVKKLEHAVPMAKALVAGGVRVLEVTLRTECAVDAIRAIAKEVPEAIVGAGTVLNPQQLAEVTEAGAQFAISPGLTEPLLKAATEGTIPLIPGISTVSELMLGMDYGLKEFKFFPAEANGGVKALQAIAGPFSQVRFCPTGGISPANYRDYLALKSVLCIGGSWLVPADALEAGDYDRITKLAREAVEGAKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Covalent intermediate trapped in 2-keto-3-deoxy-6- phosphogluconate (KDPG) aldolase structure at 1.95-A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords KDPG ALDOLASE
molecule tags Lyase
total genus 70
structure length 213
sequence length 213
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 4.1.2.14: 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate aldolase.
pdb deposition date 2000-04-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01081 Aldolase KDPG and KHG aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1eunA00
4A29A 1VYPX 1SW3A 3E49A 3TXVA 1C8VA 3W7CA 3RNDA 1SSGA 2EHHA 4K36A 4MZYA 2VFIA 1ZALA 3V1PA 1H7NA 5MHBA 3A24A 4JTHA 4AF0A 1Q6QA 1JUEA 1G7UA 3TC6A 4N02A 5CSSA 4HSNA 4Y96A 3W9ZA 5EY5A 1VYSX 3SY5A 3M6YA 3W86A 4Z0SA 3MI2A 4AF0B 2GVLA 1DV7A 2W79A 1LLWA 1ZAJA 4KKXA 3MW7A 2GUUA 4QITA 1AL8A 4I7WA 4FNRA 4IOTA 1G69A 2ZRVA 3TW6A 4NVTA 5CKSA 3CU2A 3GKAA 3W7NA 3UWZA 4FX7A 5T26A 3Q94A 4ZQOA 2RFGA 2C1HA 5D38A 1W37A 4YXGA 5F2IA 3DZ1A 1TJRA 3EEGA 3G3MA 4QAIA 3QPZA 1FCBA 3HO8A 2EPHA 3TE9A 2QF7A 1ZHAA 5LZLA 3PF3A 1H63A 2QDHA 1X7FA 3LTYA 4LY8A 3CWOX 2CU0A 4EF9A 4QM1A 1JULA 1HL2A 3W2LA 4NNBA 3NQFA 4DF2A 1I2NA 2ZA2A 3N14A 5J5RA 3NQVA 3DFSA 3TFXA 5G5IA 1O94A 3MHGA 1A5AA 1ZFJA 2A7PA 4B5NA 4IMCA 4UTWA 3OG3A 3PSWA 3TSBA 1XUZA 3PSVA 3PULA 5C2XA 3UNDA 1H1ZA 1B4KA 3PUEA 3ABRA 3KFTA 1PIIA 3W7RA 5L9FA 1TB3A 5CPMA 5CZ0A 3W6YA 3RLUA 3W7LA 3ZFHA 2QUUA 4UTKA 1TPUA 3P84A 1F05A 5D32A 5KTLA 2X16A 3L5LA 4FIRA 1GVQA 1OX6A 4IXHA 3TCEA 1K7XA 3O6YX 1SZNA 1OK6A 4MY1A 4TMCA 2ZA1A 1SW0A 4LWWA 3N9SA 1KBJA 1PV8A 4CNNA 1N7KA 1W54A 5HR7A 1QCWA 4P61A 3LCIA 2WNNA 4ZZ9A 5HINA 1L6SA 3NDOA 3S1XA 5LNWA 4K38A 3SFKA 2WKJA 2PURA 2RHGA 2YW3A 3QW4B 2JK2A 4OU1A 2QAPA 3IGSA 3T7VA 3TAKA 2ZRUA 3KVLA 4X22A 4ZQMA 1TV5A 4ZQRA 3NQ6A 1A5BA 1H61A 4WY0F 2ZZ5A 5K2ZA 5D02A 1TRDA 4UNLA 4DPPA 4IMGA 2FDSA 2BX7A 1QWGA 3BLEA 1J4EA 2G5WA 2XN0A 1VLWA 3H55A 2C13A 5K9XA 4AHQA 1TJPA 4A3UA 5F4XA 1KTNA 2DZXA 4JYDA 3D0CA 1GG0A 4S1FA 3TV8A 3LLFA 5K3VA 4NT0A 2CLLA 2IQTA 4KWWA 5D2TA 1BEUA 4WY0B 3WK3A 2ZRXA 1O60A 1PL9A 3G1SA 3GB6A 1ZJIA 3QSRA 1RPXA 3QPYA 4ICNA 4RZ6A 4MY8A 1LRQA 5D03A 4EF8A 1TREA 3W7OA 5EBUA 4JNMA 4FXSA 3B06A 4DXVA 4A22A 4AVFA 3S5ZA 2V30A 3F03K 1K02A 5FF0A 4WXZA 2I9EA 3USBA 2C18A 1LOLA 1OFDA 5KMYA 1FCVA 1OFBA 2RDUA 3TAOA 4WD0A 1OHLA 4TO8A 1FUYA 1UUOA 1LP6A 5C5YA 3R13A 2Y7DA 2VEPA 4ADUA 3P5ZA 3LV6A 4XBSA 5I3FA 4NJHA 5KZMA 1W5NA 3L5AA 3B0PA 4CCEA 3EX6A 1SFJA 2AQWA 3HGSA 3G0SA 5HMSA 5CPNA 4GUFA 4PC8A 4JTUA 5CZSA 2VELA 3UY8A 4DF0A 4EOUA 4LS1A 4ADTA 3GZ3A 5LHFA 1T96A 2Y85A 1I2QA 3HG2A 4FO4A 3GR7A 4NXKA 3W1XA 1G4TA 2EF9A 4DBDA 4I7VA 3C3NA 2ZRWA 1SZGA 1LROA 1QPOA 2WNQA 2VFFA 5AHEA 4DQWA 3NOEA 4O0ZA 2H3DA 1GTEA 4JTFA 3LBCA 4OGZA 2XN2A 5D2YA 3THQA 3C2RA 1GT8A 1S5VA 3W1QA 4DO6A 5IBXA 1DJQA 3VE7A 1JCXA 4CQ9A 3MYPA 1PHQA 1B9BA 3DFTA 1XBVA 3SSJA 4MOZA 3C2FA 1FCUA 1L2UA 2Y7EA 1EEPA 4MY9A 1K03A 1MZHA 3LV5A 4QSHA 2E77A 4AMAA 3M9YA 4YMZA 3DU0A 2A2IA 1VCFA 1ZAIA 4ZVJA 3HGRA 2BXVA 5AFDA 2WJZA 3NR0A 4TX9A 3NG3A 3W7PA 3L21A 4JXCA 3S8HA 5FF3A 3TNOA 3CEUA 3G24A 5KZDA 1U83A 3WJYA 3HOJA 4ZQCA 4S2CA 4KWVA 5G1YA 3OHIA 1RZMA 5U4NA 3BV4A 1ICSA 3W1TA 1D3HA 4DPQA 2BSLA 1BTMA 4UTWC 3TQKA 1XCFA 1I4NA 1UJPA 2VOMA 3S9YA 2ZZ1A 3TROA 1A5SA 3IIVA 3BPWA 4HPXA 4JTIA 1VZWA 1H7PA 2Y88A 2TYSA 2NV1A 3EWZA 4Q33A 4N9DA 1VCVA 2Y61A 4O53A 3QF0A 5DLCA 1F73A 1LBFA 3KRSA 3W75A 4K7VA 3E0IA 2ZRYA 3BK0A 5AHLA 4JR5A 3TMLA 4WUIA 3TQVA 2QJIA 4MUZA 1VHCA 1UB3A 4IXXA 3DAQA 1OYCA 3ABQA 4M6PA 4AWSA 3FOKA 4M7SA 1TIMA 1X1OA 2HMCA 1OYAA 3NQ7A 5G2IA 1H51A 3KX6A 1D3GA 3THAA 3FYPA 3W72A 3BLIA 4CNOA 4PL2A 3ATYA 5LGZA 4P2VA 3G18A 1YTDA 4UXDA 3G1YA 4MFEA 4G1KA 2E6DA 2F84A 2NWRA 4Q4KA 3FFSA 4K7YA 4DO4A 2E09A 4E38A 1ZAHA 1R30A 2AGKA 1ADOA 3R8RA 3PBVA 4LVAA 3G22A 3TSMA 2YSWA 2OCZA 7TIMA 1Q45A 4DEFA 3SJ3A 3G1VA 1TTIA 4BWLC 3DFQA 1WBHA 3L65A 4XWUA 4O18A 3P8IA 3S5OA 3N9RA 3UXDA 4GUIA 4AHPA 5SWUA 2WOQA 4JY8A 1AW5A 3PVFA 5LNRA 4JIQA 4RR4A 2DORA 2RDTA 1LLZA 3DHFA 2JKPA 1GVFA 4BI6A 1EX5A 3N34A 1KFLA 1MXSA 1KV5A 1QFEA 5LNSA 4O10A 4A21A 1KM0A 1ML1A 2VEMA 2GPTA 3C6CA 3M5VA 5L6UA 1FX6A 2QEZA 3LRKA 2NX3A 4OBTA 4WXYA 3GAKA 1OX5A 2GVJA 3IVTA 5AHIA 2QCNA 3PS7A 4ORIA 1WX0A 5CGQA 2GVGA 1I8JA 3STEA 4WZHA 2ZZ3A 1TSIA 1KTCA 2ABAA 5EKYA 3CTLA 1RQHA 4QJ1A 2HSAA 4JICA 2J9XA 1LOSA 4XKYA 3NL2A 4CLMA 3K30A 5TIMA 4NX5A 1YDOA 3EX1A 2QCFA 3CHVA 1LBMA 4O13A 4UTIA 1JUBA 1OABA 3L0NA 4O8RA 2E5BA 1SO4A 2CLHA 1YTKA 1FCQA 4U4MA 3EWXA 1OG0A 5H2ZA 3MP4A 2DZTA 5E93A 4XKYB 3WK1A 4M5PA 4LVGA 4UFKA 2CZDA 5EYWA 5D09A 2O7QA 5IBXC 5HULA 1P0KA 3MI6A 1IIHA 1GEQA 2VC6A 2Y70A 3T40A 3M5XA 3GXNA 2J9ZA 4XUGA 3I7RA 4Q32A 4E0CA 4CQ8A 1LRNA 2H90A 1EA0A 1TPVA 1WXJA 4W9TA 3IIPA 3P61A 1JUKA 3IVUA 2CZEA 1WYIA 3NEVA 5BMXA 1IXNA 4WOZA 4FNUA 4Y6GA 5G4EA 1DBTA 2OMAA 1Y0EA 2TMDA 2J27A 4NQ1A 5AHMA 2NXHA 4N2YA 3BW2A 1Q6OA 2A85A 3T55A 1OF6A 4AWUA 2DP3A 1QAPA 3G3DA 4RXGA 4UFHA 1A5CA 3O07A 4BFAA 4CNPA 3C8FA 4Y90A 4JX5A 3UYCA 1C29A 3DBPA 2NZLA 2VENA 5HNRA 5HJLA 2C15A 3QH2A 5HR6A 3O63A 3T4CA 1ZNNA 4X9SA 3EXSA 1R46A 3W7QA 3DI1A 1PVNA 3P80A 2BLEA 3LM7A 2TRSA 3DH7A 4GC4A 1G67A 2CLFA 1OFAA 5KZEA 5LSMA 2I14A 1O5XA 3M16A 3FS2A 3UWQA 5DELA 5HWMA 5AB3A 1DQXA 4M6VA 3NXFA 3QQ0A 4ZMGA 1VS1A 3W83A 4JX6A 5AC7A 2VXNA 3GK0A 3VE9A 4RX0A 5G1TA 2PRHA 3AJXA 4IUOA 4NXSA 1ICPA 1WOBA 5HWJA 1OFPA 4E2BA 3G8EA 3GNNA 1P0NA 2ZTKA 3LHWA 3WJSA 4XZ9A 3I68A 1EIXA 3BG9A 5TBOA 3HPSA 2Z6JA 3PM6A 3WJXA 3WK2A 5C55A 3TMQA 5EPDA 2Z0IA 4JYEA 1YPIA 5DCBA 4FB7A 4JDBA 3OIXA 1TPH1 4O12A 1AW1A 5F4WA 1W3TA 3S5NA 4JTTA 2VFEA 5DXXA 3W1NA 1O5KA 1XDMA 3LCLA 1JQVA 3PC0A 1G4EA 5CPOA 5BOOA 3P60A 1PCWA 1ZY9A 1UBSA 1TPC1 3IV3A 3MJYA 3S1UA 4IMFA 4ONVA 3QJAA 4LV9A 1KLZA 4ML9A 4WQ6A 2B7PA 3O8AA 4IPIA 2H8XA 4JEQA 1L9WA 2V0TA 1KFEA 2GQ9A 3W1LA 4QISA 3LRMA 2VEIA 1GOXA 3NL5A 3UPWA 1OYBA 4RCXA 1IIGA 3P81A 3NVTA 2GQAA 1QPNA 1HO4A 2J9YA 1T99A 2RKXA 5AHNA 3N19B 2CZ5A 4S2BA 1W5QA 1VC4A 3GXTA 1OK4A 1YPFA 5AC6A 5F1VA 3GVGA 1B57A 3LHYA 4N4QA 4TU1A 1WOAA 3L5MA 1KM6A 3A21A 4R33A 3PR2A 4YCPA 2FIQA 4NJJA 2B7NA 1R2TA 2ZZ6A 1LBLA 2ZDRA 5U7SA 1ZCOA 4RKAA 1WV2A 1W0MA 4FXRA 3HGJA 3BARA 4JTSA 4HNNA 4XQ6A 2X1SA 1KV8A 2QUVA 2Y6ZA 3C4UA 1WQ5A 3GLCA 4O52A 5DN1A 4LVBA 5D2XA 1W3IA 3LHZA 1GVOA 2FQIA 2NV2A 3LB0A 3M1ZA 4M19A 4Z1DA 3TH6A 4FF7A 1EWDA 1OX4A 3TIMA 2CLKA 5FESA 3W7IA 3LERA 3MP5A 4L4MA 2QJHA 3VCRA 1W5OA 2X2GA 3VI2A 1KTBA 3L68A 3NPXA 3S1WA 2WSQA 2FJKA 1MEHA 1LORA 3A5VA 4ALDA 5AYXA 5D33A 4PCFA 2ZA3A 4O15A 4O4VA 1QMLA 3O6DA 1SPQA 4QNWA 2TSYA 1OFOA 4IWWA 2CWNA 1Z42A 3P7YA 1YYAA 2CLMA 5FF7A 3CC1A 2ZBTA 3MHFA 4UTLA 2YFNA 3PY2A 1SO6A 2E5CA 3HF3A 1WA3A 2GOUA 1HFBA 3TU9A 3CIWA 3NQ2A 3T44A 4Z1CA 4JTGA 3LHUA 4OQVA 3TKFA 4Y8FA 3DFNA 4AWTA 3P8JA 3W1UA 2FPVA 3LCWA 3C2EA 3NZ1A 3R12A 4O1BA 2H3BA 3GYEA 1QOQA 4RLIA 3UD6A 2GQ8A 1EUNA 3MYOA 3NZRA 3N3MA 4O1DA 1WDWA 4OWGA 4GJ1A 4WOQA 2V2HA 4UUIA 2V5LA 4IPJA 4H3DA 2FLIA 4LC8A 3SGZA 4UTTA 2A6LA 3W1RA 5TQLA 5GVJA 5LNVA 3DKLA 1TPEA 2OZ0A 4EVZA 4I9AA 3NM1A 3OVRA 1KFCA 5F2MA 1RQBA 2R91A 3TC7A 1PS9A 4LRTA 1VLIA 5D2VA 1FDJA 5E1QA 4JY9A 5I3HA 1X6UA 1QO5A 3FKRA 5I3JA 4I7UA 1JQXA 4AXKA 5FEWA 3NGJA 3CQ0A 3CPRA 1GPWA 3TJLA 3B4UA 3TW7A 3QYQA 3HIJA 4WJEA 1DKWA 3UWUA 5LNUA 4GBUA 4EWND 4MZ8A 5CZTA 4Z1AA 3TX9A 4RZ5A 2AAMA 1PHWA 4BF9A 1QO2A 3W85A 2X30A 3E12A 3S42A 3S5YA 3NA8A 3N2MA 4LUIA 1B4EA 4EIVA 1Z44A 3TR2A 1XBZA 1VH7A 4LRSA 1L6YA 3CB8A 3OBKA 2A6NA 3RK8A 1VHNA 3IEBA 4MIMA 3PB0A 2NX9A 4O4WA 4N6FA 4TMBA 1I2OA 2OX1A 3NQGA 3UPBA 1F6PA 1KLYA 1TTPA 1PCKA 3DHDA 1FWRA 3PUOA 1E51A 2Q3RA 4N9BA 2WV8A 4R34A 5D37A 3W76A 3IVSA 3RU6A 3JR2A 2H6RA 4MLJA 4FNQA 2QDGA 2A1YA 1QNVA 3BG5A 4H4IA 2ISSA 1FDZA 2DZPA 4PODA 5BRBA 1NSJA 2F7FA 4MVAA 3DENA 3ZWSA 4LW7A 3JS3A 5D30A 3OA3A 1HG3A 3BLFA 1O95A 1XM3A 4WX2A 3P74A 3MP3A 4NNCA 5LHEA 3DFPA 2J6XA 2QCDA 4O0KA 4GRSA 4AHOA 1FWNA 4IJBA 1CI1A 2E6YA 1YXYA 3INPA 2E6FA 4Z1BA 2PE4A 2Y7FA 5F4SA 1TTJA 3DKJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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