5G1YA

S. enterica hisa mutant d10g, dup13-15,v14:2m, q24l, g102
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
247
structure length
232
Chain Sequence
MIIPALDLIGGTVVRVLRDYGNDPLPRLQDYAAQGAGVLHLVDLTGAKDPAKRQIPLIKTLVAGVNVPVQVGGGVRTEEDVAALLKAGVARVVIASTAVKSPDVVKGWFERFGAQALVLALDVRIDEHGTKQVAVSGWQENSGVSLEQLVETYLPVGLKHVLCTDISTLASNVSLYEEVCARYPQIAFQSSGGIGDIDDIAALRGTGVRGVIVGRALLEGKFTVKEAIQWQN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Isomerase
source organism Salmonella enterica
publication title Structural and functional innovations in the real-time evolution of new ( beta alpha )8 barrel enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SULFATE ION
total genus 80
structure length 232
sequence length 247
ec nomenclature ec 5.3.1.16: 1-(5-phosphoribosyl)-5-
pdb deposition date 2016-04-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00977 His_biosynth Histidine biosynthesis protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5g1yA00
2GQ8A 3JS3A 3LRMA 4DELA 5HINA 5LNRA 3W1AA 2A21A 4CQAA 2OX1A 2IQTA 1DL3A 3W7GA 2ZZ3A 1JVNA 3ANYA 4LVFA 3O05A 2YX0A 2E5DA 1I8JA 2OT1A 3GXPA 4N9CA 4Q33A 2WOQA 3JR2A 4YLWA 2H6RA 3W23A 4A22A 2WV8A 3DH7A 3W1PA 1YXDA 5FEXA 3DKJA 4IMEA 1KLZA 3KRUA 2C3ZA 2PURA 3HGSA 4E38A 4WQ6A 3E02A 3IGSA 3UD6A 4KFPA 5EYWA 3TMQA 1LRTA 1ME8A 3D0CA 4M6PA 4ZL1A 1GVSA 4QISA 4ORMA 1IXPA 1F5ZA 2XN1A 1H7OA 3IVUA 3HGOA 1KFCA 4LW7A 3E49A 4RR4A 3EX4A 1KA9F 1WV2A 4JTUA 1D3HA 1AW2A 1LP6A 1EEPA 2VXNA 1PE1A 1OFPA 2Z2UA 4LS0A 2V2DA 2P10A 1AK5A 2HS8A 4IMFA 1OYBA 2J9YA 2OMAA 2A7NA 5G1TA 5D37A 3I7QA 2B7PA 1TB3A 2R8WA 1IIHA 1TPEA 2JBMA 1TV5A 3L2IA 2ATMA 2VELA 1QAPA 1WQ5A 4DPQA 3TXZA 3TDFA 1A5BA 1K8ZA 5CPNA 4GFSA 3QSTA 4QITA 2GJLA 1H1ZA 1XI3A 4ZQNA 5BNKA 3HF3A 2GVLA 5K4XA 1XC4A 2ZA2A 4MYXA 5AHLA 3A21A 3JRKA 2GJNA 2WNNA 3R89A 3OG3A 3TUUA 3A23A 3PY2A 2XFWA 3EXRA 3LCFA 4NU7A 1D9EA 4NVTA 4YCOA 4MFEA 1OF8A 1I2NA 5DY3A 4Y96A 1IF2A 3LTPA 3KRZA 1LTDA 5AHFA 4IMDA 3UZ5A 1FY6A 1O95A 3B03A 4LRTA 3KVKA 2CLIA 2GUUA 2GPTA 5TIMA 2ALDA 3FJ6A 3SR7A 3B8DA 3BO9A 2NX3A 2P0OA 3C2VA 4OQVA 3LHUA 1YXCA 1AL8A 2B7QA 3TROA 5F2GA 5FEPA 5HWNA 3W7EA 2ZQ0A 4O1DA 2DZXA 5K4ZA 4RX0A 4PH6A 3HQ1A 1HO4A 4LNYA 4R33A 2QCNA 4WUIA 3ABOA 4GWEA 1YTEA 2GVJA 5EMUA 4O14A 4OE7A 2E1DA 3W72A 2RKXA 3FKRA 1WA3A 1DJNA 5KZDA 2A6LA 1GQNA 5CKSA 2DJLA 1DHPA 5MHBA 3K30A 3VKJA 3M44A 4JTEA 4JTIA 1Q6OA 1VC4A 3MP3A 4C1LA 2FB2A 2E6AA 4KWWA 4UIOA 3DKLA 1OYAA 1OFQA 3RLUA 1SUXA 2NXIA 1GG1A 5HULA 3DFOA 3M6YA 1J2WA 1YDVA 1OX4B 4FIRA 1QOPA 8TIMA 4O8RA 3GDRA 1LYXA 4CCCA 4UFIA 4RKAA 3UPBA 1EX5A 4H4IA 3CPRA 3PUDA 4Y9AA 5AC8A 3SECA 4EWND 4JIQA 3Q2DA 1WDWA 3G3MA 1LZOA 1RZMA 3UY8A 4EIVA 3QEZA 1DJQA 1R47A 3LHYA 1K02A 3LHVA 1OFEA 1MXSA 4WY0A 4O54A 1W3NA 5BW6A 4JTKA 2YPIA 4JICA 1L9WA 1K03A 3TV8A 1NAL1 1BWLA 3GX9A 3STEA 4YMZA 1J4EA 3MYOA 1Q3NA 4LVGA 1ZCOA 2QAPA 1X1OA 4ALDA 1HTIA 2PC4A 4MLJA 4PA8A 4O28A 3S5ZA 3MYPA 1QO5A 1ML1A 4DPPA 4N4QA 1KFBA 3IVSA 2QDGA 3SJ3A 1UCWA 4UCGA 5LGZA 4N9EA 3V75A 2VEPA 2NX1A 2TSYA 1BKSA 3CQ0A 3QW4B 2C6QA 5DXXA 5U4NA 1O4UA 1ALDA 1VR6A 4XBSA 3LXBA 1XUUA 4W9TA 5G4EA 3N73A 2Z6JA 3UQNA 1F6PA 3MW7A 2H8ZA 3PSWA 4IMGA 3M16A 4HNNA 3NOEA 1KFLA 3ELFA 4HNVA 1F2JA 1TTPA 1W5QA 4ICNA 1R2SA 3HJZA 4JYDA 1BTMA 3PG9A 4UMCA 2QCDA 4LU0A 3ABQA 1W56A 1UB3A 3L0NA 3BARA 4BF9A 3T55A 3TX9A 4K8EA 4L4MA 3W1RA 1YDOA 3CTLA 1AW1A 4CCDA 3TAOA 5F2MA 1RVGA 3A5VA 3M0ZA 1ADOA 3W7PA 3L66A 3NA8A 5D38A 4EF8A 2B7NA 3NQAA 3UWUA 3W7NA 2OT0A 4CCEA 2KZHA 2HTMA 1PHWA 2CZFA 5I3HA 5LKYA 3WJYA 3A5FA 1TPH1 4RZ5A 1K8XA 2H3DA 3W9ZA 3S8HA 2Y70A 2C19A 3BGJA 2RDWA 3BLFA 1JCXA 3C2EA 1W5NA 4HNUA 1PL9A 3W7RA 3IIVA 4A3UA 1LDCA 2V81A 2NLIA 5DCDA 2ZDRA 4LVAA 1WBHA 4BK9A 4NJGA 3M1ZA 3T4CA 2RDUA 4O50A 1SO6A 1X8FA 2CZDA 2A5HA 3MP5A 5E0KA 4M6VA 2WKJA 3NXFA 3EWWA 3WK1A 1L6YA 1EWEA 1YDNA 1FXQA 1O5XA 2JK2A 2X1UA 3LXCA 5HR6A 2DZTA 4NNBA 4GUFA 4YCPA 3L65A 4I7VA 4AHPA 1G4TA 1PVNA 5ABTA 3LHWA 1K3UA 1NFBA 3QC3A 4FNTA 1P0NA 3B05A 4BWLC 2EF9A 3SZ8A 1ME7A 4TR9A 3PM6A 3C52A 2FFCA 4JDYA 4QAIA 4DF0A 3B04A 4FXRA 3KOFA 2EKCA 3WK2A 4G1KA 3HPZA 2QAFA 1OK4A 4LUIA 1L6WA 3PWAA 3PBVA 3W2NA 4UTLA 4O16A 2QJGA 1YTKA 3QQ1A 3SI9A 4FNQA 1SSGA 1SZFA 2E5CA 3NQFA 3UZJA 1OF6A 4IXXA 2EHHA 5E93A 3OHIA 5DBTA 2VEMA 3TJLA 4UFHA 3TU9A 5D32A 3UXDA 2FB3A 3QJAA 2RH9A 1IXQA 3W07A 3ZWSA 1RV8A 4JTJA 2W79A 3QQ0A 4FNSA 3W2LA 1JULA 3W1QA 3STCA 3NQ8A 4GUIA 5G1YA 4E2DA 4MLRA 3C2OA 3RMJA 1KM6A 4QQ3A 5AHEA 3NVTA 4Z1CA 3I65A 4YXGA 4JY9A 5K9DA 3TH6A 4EVZA 4TMBA 4XBKA 2NWRA 3N2MA 1BEUA 1KM5A 1VRDA 3LERA 2R14A 1JRCA 3N14A 1PCKA 1P0KA 3KVJA 2ZTKA 1VJIA 3P84A 2BTMA 4WY0F 4LY8A 4ZQRA 3LI0A 1ZENA 3UXAA 4K8HA 5BMWA 1AL7A 1L2UA 4WOZA 3O07A 2LLEA 1H50A 5KINA 3GXNA 3BW3A 3W73A 2XN0A 4UTWC 3OIXA 3QM3A 3QPZA 1RD5A 5H2ZA 1UUMA 2CLOA 2Y63A 5CG7A 3WJXA 4NUWA 2V5BA 3GDMA 2D73A 2DP3A 3HG3A 4PTNA 2E6DA 1XKYA 2QCEA 2E77A 3QF0A 1PCWA 3TFXA 3LLDA 1FCBA 2DZPA 4Q32A 3M5VA 5D30A 1CX9A 5G4WA 5HR7A 3DXIA 3G8EA 1YTDA 4A2SA 4NZFA 3O06A 4QM1A 2QUUA 3LB0A 1SO3A 2DORA 5F4XA 5FF0A 1ZALA 2X1RA 5AN7A 3HG5A 2J88A 3BV4A 3S0CA 5C5YA 1Q6LA 3R12A 4FNPA 5DELA 3PG8A 4Z1BA 3W3OA 3MO7A 1XBYA 2DZVA 1WBJA 5A8GA 5HNRA 1GEQA 1UBSA 2QR6A 5U7SA 4X22A 3S5NA 4RZ4A 3ATZA 3MMTA 2V9DA 4JTHA 4FNUA 2VOMA 4NJHA 4Q4KA 4ML9A 4A21A 3ZS4A 3O6YX 5IBXC 3G1XA 1TJRA 3G1FA 4AMAA 2J6XA 3CWOX 2YYUA 5F4WA 2QCMA 4DXVA 1EWDA 1QPQA 4MZ8A 3CEPA 3P67A 1OHLA 2QEZA 2GQAA 1A50A 5FESA 1N7KA 1RQEA 4GE8A 3EWZA 3P61A 5LGXA 1F74A 2AQWA 4E0CA 1TYGA 4OV9A 1TO3A 4JTTA 2HMCA 4O1BA 1KBJA 1MEWA 3A9IA 3STGA 3BW2A 5GVJA 1S5WA 3EX1A 3S1XA 3S5YA 4UFKA 1TV8A 3DHDA 2E09A 3O63A 2WSYA 1F73A 3P5ZA 4WXZA 2YFOA 1DORA 3G1VA 3H55A 3BK0A 3DFNA 4LC8A 1PHQA 4IX0A 4DBDA 3NZ1A 5BOOA 3DENA 4K6AA 4UNKA 2BWGA 5SWUA 4CQ8A 3W7MA 4M7SA 1TQJA 3FOKA 3Q58A 4ORIA 1FCQA 5I3FA 1ZNNA 3N9RA 3LDVA 1QMLA 2I9EA 1WXJA 2J9XA 4TIMA 1OABA 1FXPA 1W1ZA 4OHQA 3BW4A 2ZTJA 1M7OA 5A5WA 3BG5A 3HMJG 1XDLA 2VENA 3R8RA 3QMSA 5FEWA 4MZYA 2Q8ZA 1LCOA 1TQXA 3EWBX 4WX2A 4JS3A 2A7PA 5AHNA 3MUXA 2VFGA 2EPHA 2NUWA 4O0KA 4GC4A 4PEKA 3GAKA 1N55A 3R13A 1GVOA 4MJZA 1W5PA 1SFJA 5L9FA 2C16A 2VEIA 3SGUA 4P2VA 2BSLA 2OCZA 2P1FA 3W7HA 1EIXA 1OFOA 3S42A 1P1XA 2WNQA 1XBZA 5DXYA 4OT7A 5D2XA 4JYEA 1LLZA 4I9AA 5IM51 3G24A 1WAUA 2ZZ7A 2O7QA 4FX6M 3EB2A 4WY0B 4JN6A 1QCWA 1KTCA 5K2ZA 3TW6A 4JGDA 3S9YA 4RXFA 3UY7A 1XBVA 3TNOA 1Q6RA 1TPVA 4LT9A 3NQ7A 4GJ1A 2A85A 5DY2A 3NZRA 1W8SA 3NGJA 3L9CA 3UYCA 1I2QA 3GXTA 3GK0A 1N8FA 2V2CA 5G2HA 3BLIA 3TIMA 1KW1A 4EF9A 3W7QA 5AFDA 1XDMA 1GJPA 5TQLA 1I4NA 1EP1A 2WSQA 4LV9A 3BPWA 3PUEA 1UUOA 1XL9A 1G7UA 2J27A 3W86A 1M7PA 1H7PA 1JQXA 3IEBA 3PUOA 1F7BA 4NNAA 4PODA 4A29A 1SFLA 3YPIA 1G6CA 1XXXA 4MZ1A 2DZSA 3OVQA 2NV2A 4AWTA 5AHMA 1YPIA 3W84A 5AOUA 1YLVA 1C9DA 1RQBA 1R2RA 1GT8A 2V30A 3N9SA 1S5TA 1W31A 5KTLA 1ME9A 3DBPA 4RZ6A 2FQIA 3TC6A 5FI8A 4BWLA 5DN1A 3FEMA 3LRKA 3BG9A 1EP3A 4DF2A 1I2OA 3W88A 3KHJA 2A0NA 3DI0A 1PS9A 3NQEA 3OA3A 3DFPA 2CWNA 3C0JA 4FO4A 1G7VA 3PB0A 1QNVA 4XZ9A 3TAKA 2ISWA 1HO1A 5LHFA 3DHFA 4MFDA 1SSDA 4OWGA 1DVJA 3EXSA 4JIPA 5KSWA 7TIMA 3HGJA 4IGHA 1DQXA 2NX9A 1OVDA 3UWQA 5FF7A 1VZWA 3GAYA 1QWGA 1O60A 3OVPA 3LGEA 4NNCA 2BXVA 4UTTA 1JUKA 1MZHA 5KZEA 3L68A 1YXYA 3GZ3A 2ZZ5A 4TX9A 3PAJA 4FXSA 3UWVA 3W76A 3NQ6A 2ZRWA 4AWUA 1AG1O 1AMKA 1VS1A 4YWIA 3W1MA 3QW3A 3M5ZA 1H7NA 3LTSA 4JD4A 3NEVA 1J5TA 4U28A 3M5XA 2C14A 4J9JA 3MJYA 3TA6A 3LCGA 3DU0A 3TSDA 4X2RA 3A22A 3O15A 5HJLA 1SQ7A 3NNTA 5BMXA 4MOZA 3IV3A 4IPIA 3S1UA 2CZ5A 3GVGA 1I2RA 4XKYA 1RPXA 3FLUA 5F1VA 4FX7A 4EOUA 1ZHAA 1OFAA 2NWSA 3RLVA 4NJIA 4UTMA 2C13A 4O15A 4Z08A 2GQ9A 4X9SA 2Z1BA 3GLCA 3G1HA 1JCNA 5DLCA 1PV8A 3W75A 4TO8A 1ZAIA 1SR9A 4O53A 3ZWTA 3NQGA 5LZLA 1Z41A 3W83A 2E6FA 3E0IA 5LNUA 4RCXA 2ZZ2A 5CZSA 1KM2A 4UTWA 2ZZ1A 1X6UA 1VYRA 1Q45A 4MIMA 3MHUA 4LWWA 1G69A 1L6SA 4IOTA 3PS7A 1TPDA 3NQCA 3I7SA 3G18A 3SW6A 1FWNA 3SY5A 4UR8A 1WOAA 1K7EA 1UJPA 2CLLA 1FCUA 2QCLA 4JR5A 1FX6A 2GOUA 1OG0A 1PIIA 3QYQA 4IJBA 2R91A 3DFQA 3LCLA 4ADTA 4GUGA 3W7KA 2VFIA 1V7YA 3RK8A 4IX2A 3E96A 1F6KA 1NF7A 3W2JA 2CLMA 4K37A 4JEQA 1NEYA 3NM3A 2FPVA 2B7OA 5K9CA 3F4NA 1DQWA 1LBLA 1KTBA 4ZMGA 2B4GA 5D02A 3EXTA 4HT3A 2YR1A 1Q6QA 3PB2A 3DFTA 3T7VA 3CIXA 2H90A 3EEGA 2C1HA 3TCEA 2FPYA 4DO4A 3W7IA 4DO5A 2AAMA 1JJKA 1LRNA 1K7XA 3G0XA 5F1UA 3IGXA 5AYZA 3M43A 5CSRA 4LTSA 1XUZA 3BG3A 1FQ0A 3H53A 3M5YA 5IBXA 3WK3A 3HPSA 1ICPA 3LBMA 3C3NA 2I1OA 4RK8A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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