4GZJ | Genus

Total Genus 115

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	115
sequence length	315
structure length	315
Chain Sequence	QPIGVCYGKIANNLPSDQDVIKLYNANNIKKMRIYYPHTNVFNALKGSNIEIILDVPNQDLEALANPSNANGWVQDNIRNHFPDVKFKYIAVGNEVDPGRESGKYARFVGPAMENIYNALSSAGLQNQIKVSTSTYSGLLTNTYPPRDSIFREEYKSFINPIIGFLARHNLPLLANIYPYFGHIDNTNAVPLSYALFNQQRRNDTGYQNLFDALVDSMYFATEKLGGQNIEIIVSASGWPSEGHPAATLKNARTYYTNLINHVKRGAGTPKKPGKTIETYLFAMFDENEKKGEASEKHFGLFNPDQRPKYQLNFN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
source organism	Solanum tuberosum
publication title	Structures of an active-site mutant of a plant 1,3-beta-glucanase in complex with oligosaccharide products of hydrolysis pubmed doi rcsb
molecule keywords	Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase
total genus	115
structure length	315
sequence length	315
ec nomenclature	ec 3.2.1.39: Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase.
pdb deposition date	2012-09-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00332	Glyco_hydro_17	Glycosyl hydrolases family 17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4gzjA00

1WB0A 4ACYA 1CXHA 1QNOA 3ALFA 4M81A 5JBFA 3SUWA 1GPFA 3VX0A 3TOPA 3OGRA 4CUCA 3L4YA 1JYXA 1V6VA 4F79A 3ZSTA 1M01A 5GNZA 1OGGA 1JIBA 2Y8KA 2BNJA 4EANA 4PUEA 3ZM8A 2CCRA 4IUGA 5JBEA 1D7FA 2BHYA 2DT1A 1OINA 3VM7A 2G8ZA 4MPKA 2HVMA 5JBDA 3G6MA 4U31A 2JEQA 2BY0A 3N11A 1OB0A 5A6BA 4AWEA 2B31A 2TAAA 2FDMA 2V5DA 2BV9A 4PTMA 1VFMA 3WQ6A 3EDFA 2ESCA 1E6ZA 4W7UA 5IFPA 1UWRA 7CGTA 4QCEA 3VKKA 3N12A 4YHEA 1TVNA 1ZB5A 2WCGA 3ZQ9A 1EDTA 4U3CA 5A6SA 2A3HA 4P7RA 1D3CA 2W91A 2GJPA 3GYCA 2VMFA 2JFEX 1ISYA 3B8SA 3ALGA 1ITCA 4BQ3A 1TA3A 3L4VA 4RE3A 3CZEA 3K8LA 1FA2A 1PPIA 3FXYA 1XSIA 3POHA 3GNPA 2YL6A 3BAJA 4P7QA 3SCVA 5EBAA 2VC9A 4X9YA 2VQUA 1H41A 1C92A 2FH6A 3PZIA 1L8NA 2QMKA 1B2YA 5A6LA 1NWTA 3K4DA 1CZ1A 3IAQA 4CU6A 1MW1A 2WKLA 4P8WA 3VIHA 3GDBA 3ZT7A 3BAKA 5LA2A 1NP2A 1PZ2A 1FOBA 1BVZA 1B3YA 1E3ZA 3EDKA 4ZFMA 3CUFA 1YHTA 3W27A 2ZICA 1EQCA 1CXKA 3VIOA 2NSXA 2E8ZA 4Z2IA 4HMDA 1NOWA 4PCTA 1F4AA 1U30A 4AZCB 4J7RA 1H09A 1HP5A 5A8QA 1O7AA 2Y2WA 1CXEA 2ZWYA 4JAWA 4TVCA 5CLWA 1CGYA 4FF5A 3VO0A 4JKLA 1TMQA 3T0AA 3AIBA 4UZUA 3RM9A 4AD1A 4X0NA 3GXMA 2VCBA 3MSDA 1UR9A 2EBNA 3K46A 2YJQA 3CUJA 4CKQA 3VM5A 2XIBA 4JL1A 4HZ7A 3VDCA 4AY1A 1TG7A 1CGXA 4JHZA 3VD3A 4MB3A 4UNIA 2VZUA 4AD5A 1BLIA 2WVSA 2QHAA 1QHPA 4HZ6A 3BXWA 4AC1X 3WY1A 1GHSA 4LQ1A 1J11A 1UG6A 1WO2A 2VRJA 3POCA 2V3DA 4NF7A 3VDBA 4MNKA 4UFLA 1K9EA 3SUVA 4MNLA 2J77A 2YLLA 1XGZA 2GDVA 5A3HA 2GK1B 1W1VA 4W8BA 4ATWA 3AMDA 4CGTA 3WBAA 2E9MA 1E4MM 4MDOA 1JZ7A 3BLPX 5D4YA 3EDJA 2CNCA 4DWSC 4M8UA 1DTUA 3PZOA 3VX1A 1WCGA 2EJ1A 1XV8A 5IHSA 5CSYA 4TX6A 2XWDA 4N42A 3AISA 2OSYA 2DT3A 1EO5A 1C3FA 1Q4NX 1R85A 2WMIB 1ISVA 1UD5A 4M29A 1VAHA 1JL8A 1E6RA 1JGIA 2J7CA 1CGVA 2OLHA 4Z2KA 5DF0A 2GJXB 1A47A 2J7DA 1MW2A 3THDA 2V5CA 1NOUA 5A2AA 2CYGA 2J7HA 3AJ7A 3FY1A 4GO9A 4QLJA 3UG3A 2F61A 3AHXA 3VTRA 2YBTA 2WPGA 4D6EA 1O6IA 1E4NA 1WP6A 2G3NA 1QNSA 1BAGA 5BXSA 3T2PA 2O92A 3F4VA 5A95A 2MANA 1PX8A 3IJ8A 3KWXA 2WZHA 5E09A 2OYKA 4DM2A 4OBSA 5GPRA 2CBIA 1MW3A 1EO7A 3L4WA 1PIFA 1N82A 4TX8A 4AYSA 1W1YA 3QOKA 4M1RA 4UQDA 1UR0A 1Q6FA 3WUBA 3U7VA 2EQDA 1YQ2A 1V08A 1J01A 2FGLA 4DWSD 1JYWA 1US2A 1EOMA 4OKDA 5BRQA 2YA2A 4P7NA 1CXIA 2WHJA 3K8MA 1J0HA 1ZBCA 2CITA 1R7AA 3WH8A 3VGFA 3WIJA 1LL6A 2BVTA 2XFFA 5GQBA 1W2PA 4AIOA 1UH4A 1JYVA 3VD9A 4J3TA 4H2CA 3DHPA 1HN1A 7TAAA 4PYSA 3M46A 1VFFA 1OIMA 1XSJA 1E0XA 1UOKA 1HJXA 4MB4A 4KMQA 1BYAA 5EMYA 1QW9A 3PTQA 2V38A 1OBAA 3VIGA 4UQEA 2YLAA 1WZMA 1CXLA 2DSZA 5E70A 3U5UA 5AC4A 1GW1A 3MUZ1 1B3ZA 2DSWA 2JF6A 3L4ZA 1QI5A 3BCFA 4FLRA 3W29A 4JIEA 3AMKA 1E6XM 1WNOA 3WQ5A 3AIEA 1AQ0A 3IJ9A 3OLEA 1ISXA 3FAWA 1AQHA 2WHLA 2ZX9A 2VTFA 5A8OA 2ZUSA 4HP5A 4PMXA 1Q6EA 3VD4A 1J12A 2UY3A 4J3UA 4OUEA 2DQXA 2VR5A 3SEPA 3GM8A 5ABGA 4BQ4A 5KEZA 3KE0A 2QPUA 3IANA 4M56A 4PSRA 3AXIA 2O9TA 3OLGA 1TE1A 4J3VA 5FOOA 4JFWA 1W9PA 3TONA 4HOXA 3NIYA 1E15A 4CD5A 1E6NA 3LPFA 1U33A 4HMEA 1RH9A 4UQCA 1BGAA 3SCPA 2WVTA 3UETA 4GI6A 1C8XA 2GSJA 4IPLA 2D23A 2QLYA 3CHFA 1IZKA 5BRPA 3TTQA 2E9LA 2ZXAA 4LGXA 2E8YA 3MV01 1E5JA 3L4XA 2E0PA 4Q7NA 3ARYA 1JAKA 4AIUA 5D9MA 4WF7A 2WMHA 1J9YA 1EOKA 3PZQA 3L4TA 1QOXA 4PCSA 2DIJA 2XG9A 2D0GA 2QF8A 5E6ZA 1OGSA 5DT7A 4D6CA 7A3HA 4D6HA 2CHOA 3HJEA 3ZJKA 5LYRA 3GH7A 2YL8A 3OA5A 3U57A 4FMVA 3WD1A 2WC7A 3SUUA 2YL9A 2Y5EA 3PZTA 4B9ZA 2JEPA 4B9YA 1UQZA 3ZIZA 5D8WA 1C8YA 3O6AA 3WH6A 1GNXA 1K9TA 3VIFA 4KGLA 1Y7VA 1S46A 3A4XA 5I0DA 1TA3B 1E0VA 1H1NA 3QGVA 1PJ9A 3BSGA 3T08A 1H0IA 4JFUA 4ACZB 4AZ5A 5HNNA 4C7FA 1V3HA 1X1NA 5E0FA 3AIRA 3BLKA 4B3KA 5IXEA 3S6TA 4LYQA 4IM4A 4RE2A 3D5HA 3B9DA 1IV8A 1V6YA 2VZVA 4GZIA 5D8ZA 3CH9A 1JZ2A 1W2VA 2VZOA 1KXVA 2WANA 3MMWA 6CGTA 3FAXA 1DHKA 3TTSA 3WUFA 3DECA 3DHUA 3PZGA 8A3HA 4M82A 4LYRA 3SUTA 2VX6A 1QNRA 3VD7A 4CN4A 4XV0A 3VGDA 1C8QA 4H8VA 3U7BA 3GXFA 2AOSA 3MSGA 1GOIA 4V27A 2XM2A 2VCCA 3AROA 3AXXA 1GQKA 2A3BA 4LX4A 2X05A 3ZT6A 4KRTA 4UTFA 4F9JA 5FL0A 2DH2A 1JDAA 2JE8A 5F7UA 1QPKA 2WXDM 1CGTA 3ARVA 3ARSA 4WKHA 1DWGM 1V02E 2DIEA 3BMVA 2D22A 1CDGA 5A69A 1OCQA 3VU2A 2CPUA 4JHOA 2ZWZA 1H2JA 1GVIA 3ARWA 1JI1A 3N17A 1H0GA 3SCSA 3QOMA 4W89A 1UKSA 3RILA 4Z2JA 1ZJBA 5CPTA 2VL4A 4MADA 1JNEA 2W62A 3OGSA 1EDGA 2W66A 2J78A 1J0YA 4H8HA 4PMYA 3RCNA 4FLOA 3CO4A 2ZUVA 3DYPA 4AW7A 2XGBA 1I1WA 4HPGA 1R87A 2XTKA 4HZ8A 2Q8XA 4PBGA 4PMNA 4EAMA 1OD8A 1CTNA 4HA3A 1KCKA 1E6QM 4E8DA 1V3MA 1L0PA 3IAPA 5D9PA 4B3LA 1C90A 4MTVA 4D71A 3AOFA 2EPLX 2Y8VA 3W24A 3WQ8A 1XSKA 2VRQA 1BYDA 4D6IA 3WEOA 8CGTA 4F66A 4HPHA 3TP4A 2PWFA 4QFUA 4W87A 3AS0A 5GNXA 3AZTA 1QI4A 3CUHA 5HDRA 1TCMA 5A8MA 4CU8A 5IFTA 1Q6DA 4XUYA 1JYNA 3ARTA 1CWYA 1LL7A 3GTNA 1SR0A 4UFJA 2WSPA 4CD8A 2WLYA 1US3A 5FD0A 2XJ7A 1HP4A 3NJ3A 3VILA 2XGIA 4U3AA 3KL3A 1W91A 3F5JA 2PWHA 1MW0A 4P8UA 4PMDA 1UHVA 1B3WA 1E1EA 2WKGA 4OIFA 1M04A 2CHNA 4W7WA 2D3NA 2C0HA 5E6YA 4ATDA 5D9NA 1LF1A 2CBUA 3N9KA 1CYGA 1K9DA 4AD0A 3NYDA 3WSUA 1E72M 1MYRA 4HU8A 3VDAA 3WF1A 2CKRA 1E1FA 3AIQA 2XSBA 5D9OA 1TZ7A 2VX4A 3BCDA 2A3CA 1W32A 3A4WA 2Y24A 2J7FA 3AIUA 1RP9A 4S3JA 1KGWA 1DWIM 2J4GA 4WKFA 5A8PA 4B16A 1V03A 3W81A 3WELA 3NSNA 4N0RA 1G9HA 2WVUA 2OYLA 5A6BD 3L2MA 1CBGA 1W3HA 5I6SA 4WIWA 3SURA 3VIJA 1WKYA 2XIIA 3NCOA 4AD2A 4W5UA 1GHRA 2V3GA 1HVQA 5AYBA 1X6NA 3APGA 4HMCA 1GQIA 5A6MA 3PBGA 3WDIA 1NQ6A 1HXJA 2J79A 4NI3A 4WJXA 3BAWA 4QCFA 1UUQA 2PF0A 3FHQA 2GDUA 2IUZA 1CEOA 5E0CA 3WFLA 1JNDA 5ECUA 2AMGA 3GNRA 3IK2A 3W6MA 4MJ2A 4BQ2A 2WMJA 5ABFB 3B9EA 3EYPA 1V3LA 4GIAA 4JL2A 3AZSA 3SIMA 2BHUA 1UD2A 3WF0A 4W8AA 2DDXA 1WE5A 2HISA 1EXPA 1DWJM 2BY1A 2CESA 2DT2A 1W9DM 3ZO9A 5EFFA 2PI6A 3LPGA 1XRVA 1BTCA 2VUYA 5A94A 4TTUA 1BGGA 3OIHA 3WNMA 1G1YA 2VX7A 3AYSA 3QR3A 3WDJA 5DT5A 5HPOA 5HXMA 1RPKA 2A3EA 1VEOA 4PTXA 4Z2GA 2O9RA 3AHZA 4JCMA 3WH5A 2C7FA 3VIMA 3BSHA 3WL1A 3RDKA 4K68A 5I77A 1GVYA 1CLXA 3CHDA 3F5KA 4W93A 1EQPA 2VT0A 2F8QA 1KXQA 5JIPA 1VBRA 2WZEA 4YN5A 4J27A 3CZGA 3CMJA 1ITXA 3OLDA 4UFKA 1GZJA 5CG0A 1GORA 1GCYA 2CERA 1H11A 1Z32X 1KXHA 1HT6A 2WVVB 3OG2A 3B9AA 1GOQA 1VENA 3NUKA 3AS1A 3QHOA 1QI3A 1B9ZA 1R7OA 1JDDA 1KWGA 1NH6A 1V0NA 4RE4A 2Z1SA 1V3JA 4GI9A 3WH7A 2CKSA 1KQZA 5BWFA 2VOTA 1DWHM 3VGEA 2WHKA 4TVUA 1AVAA 2DEPA 3WQWA 2E40A 4AIEA 4LPCA 3GBEA 1W9XA 4HU0A 1CIUA 3ARPA 1ZU8A 2BFGA 1R8LA 4HA1A 1UH2A 1QI2A 4W8LA 3RM4A 4PMUA 3SCWA 1UKQA 1BFNA 3O2LA 2NW0A 5BCAA 4CCDA 5A6KA 1MWOA 2YA0A 4GZJA 1JG9A 2YL5A 3GZAA 3UR7A 1HF6A 2CBJA 1CNVA 3WH9A 1FP9A 3WDQA 1B30A 4OOUA 1UD4A 5ABEA 1E4IA 5M3WA 2ZIDA 5JUVA 2DSUA 1BG9A 3PZ9A 3L4UA 4NSBA 1HIZA 1D2KA 3AS2A 5CGTA 2YDSA 3FNDA 4MAVA 5AYIA 3WNLA 1B3XA 3SCNA 3BAIA 3LPOA 1GOWA 2QMJA 1E6SM 2OWWA 4JKMA 3WDPP 4UFHA 3L2LA 3T2QA 3PZNA 4CU7A 3BGAA 1WDPA 4GO8A 1WDQA 1ZS2A 2UY5A 1QVBA 3MUY1 3PZMA 3SCOA 2WK2A 4J28A 1UKTA 2VNCA 3BH4A 2D1ZA 2ZUUA 3I3DA 3FN9A 3M6DA 4WK9A 4UOQA 4MJ4A 3AI0A 1VB9A 1WDSA 3WQVA 3AS3A 1J0KA 3AHVA 6TAAA 4UZSA 4QDMA 5I78A 1VF8A 4UFIA 1NWSA 1HJUA 2DT0A 1F4HA 1KR1A 3WMBA 4AZIA 4S3KA 1RD6A 3KL0A 1JZ6A 4NZCA 3NSMA 1V3KA 5C8BB 1HL9A 4GINA 3THCA 1DWFM 1TUXA 3HMCA 1CXFA 5IDIA 2UWFA 1QNQA 4E2OA 1H5VA 3MO4A 2YDQA 1J0IA 1V6UA 1BVNP 4MB5A 1ZL1A 2J7EA 3DYOA 3VINA 2G41A 4PMZA 4W88A 1OIFA 1HJQA 1V0MA 2GK1A 1DEDA 2WZIA 3WF3A 1JZ4A 1E70M 1OWQA 3N15A 5CLTA 3M07A 4Z2HA 4D72A 1B1YA 3VMPA 4KRUA 4V2XA 1VRXA 4QLKA 5EB8A 1LLOA 2DPEA 2EPKX 2ZOXA 3D3AA 2X09A 4PMOA 4Q22A 3ZJ8A 1LG2A 1LG1A 5A1AA 4PUDA 3AMLA 3FHAA 4X0VA 5JIWA 3T0BA 5CSUA 3CIVA 2WMIA 2WW5A 2W61A 2J8GA 2X2YA 3EDDA 1KWKA 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3AICA 1AQMA 1EDQA 1PX3A 1CGUA 2BY2A 3LPPA 2OWCA 3W4RA 1VEPA 4BCEA 1OM0A 1SMDA 3MMUA 1M03A 1SFSA 5E9AA 5IHRA 3WEMA 5CXPA 3W0KA 1EHAA 4V28A 4DUVA 2CETA 1JI2A 3EBVA 2FHFA 2J8FA 3WNOA 5C70A 1MQPA 1J0ZA 1UA7A 1UR1A 1XD1A 3AHYA 1OT1A 2VURA 2J7BA 1Q6CA 3VPLA 3BAYA 1C91A 1FHDA 1I75A 5FL1A 2ZUWA 2WBGA 1E55A 4AISA 3LMYA 2JIWA 3QHMA 4JKKA 3CUGA 3WN6A 2JIEA 4U2ZA 3WD3A 1UWIA 4JZ5A 2WSKA 1UYQA 1UKPA 2DSVA 1E71M 3ZR5A 1WZAA 2XVLA 5M03A 1CPUA 2XFYA 2CXGA 4TVDA 4P7OA 4F9DA 1UD6A 5BYWA 4UOJA 3W26A 2PBGA 5AC5A 1TVPA 4KWUA 2J62A 4ATLA 3T09A 2YIHA 2WMKA 3OGVA 2W92A 1E3XA 4W7VA 2DGAA 4CCEA 1H49A 2CIPA 3AIVA 3T0DA 4DM1A 4ACZA 3CTTA 3PZUA 2DH3A 1BG4A 2OYMA 5BROA 4NRSA 3VIIA 3W37A 3SCTA 1ODZA 1CENA 1MQQA 1VJSA 1ESWA 3M7SA 2WAGA 3GXDA 4JFTA 2YOCA 4GQQA 1V3IA 3VD5A 5A6AA 1OD0A 4H7VA 3G6LA 4BZYA 3CMGA 3K8KA 3UG5A 4J3WA 3WD2A 3ARUA 1LJYA 3AQUA 3MUIA 1KFWA 5M17A 2F2HA 2ZX6A 2WMFA 1UWUA 3CUIA 3W82A 3OB8A 4MAZA 1XH1A 1E0WA 2G3MA 2WNWA 2VO5A 2X0YA 4NRRA 1C7TA 2WLZA 3W53A 2WYSA 3SCQA 1ZJAA 3PTKA 5DO8A 3UR8A 2JF7A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4GZJA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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