3RLUA

Crystal structure of the mutant k82a of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with the inhibitor bmp
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
220
structure length
220
Chain Sequence
DVMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEAICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Conformational changes in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase: a structure-based explanation for how the 5'-phosphate group activates the enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 83
structure length 220
sequence length 220
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2011-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3rluA00
4NUWA 3W7HA 1F7BA 4LS0A 2QKFA 1K3UA 4MIMA 3TW6A 1XBZA 4UTTC 4O4WA 4IQLA 5BNKA 2YYTA 1YXDA 4GFSA 2A7PA 3O8AA 3B05A 2J24A 1X6UA 2NUWA 1OX4B 3T40A 3M7WA 1IXQA 1GTHA 1LBMA 2G97A 1SZNA 3YPIA 1DORA 3PG8A 1ME9A 3BGJA 1TRIA 3WFAA 1OYBA 1W5OA 2ATSA 1TJPA 4KWWA 1TYGA 5CPOA 2C1HA 5CZJA 2ISWA 1S5WA 3SGZA 4HIBA 1DJNA 4MJMA 3UZ5A 2YCEA 4XQ6A 4FIQA 1KV5A 1ZAHA 1MSSA 5AFDA 4E38A 4I7WA 1AL8A 3ELFA 4AHOA 3L5MA 1SW0A 4JTHA 4N9DA 3N9SA 4UTTA 3PBWA 1VLWA 4WJEA 1KFKA 1JCYA 3NO5A 5CZSA 2HMCA 1N7KA 1VQTA 3NAVA 2DU2A 2WNNA 3EX2A 2HS6A 5AOUA 5IBXA 3G1HA 3P84A 3QPZA 3WJXA 2WV8A 3QYQA 2PURA 1XUUA 2YW4A 4LV9A 3KXQA 3LCFA 1TIMA 1LTDA 2JGQA 1LOQA 1VYRA 3GNNA 1FX6A 3N9RA 4OQVA 4UTHA 2VEMA 4NJJA 2V5LA 3E12A 3NPWA 4QIUA 1LOSA 4JIQA 4DO4A 4Y90A 5D2YA 4TX9A 4DO5A 1JR1A 4ZQNA 1XBXA 3NQMA 3GK0A 1TPC1 1IXNA 2ZTJA 3HF3A 4UNKA 5BW6A 3N2MA 3HO8A 1H7WA 1X1OA 2JBMA 4MYAA 2CLHA 3IIVA 8TIMA 5KITA 4JTLA 1C9DA 4MZ1A 1FDZA 1UB3A 3LV5A 5C54A 5LGXA 1THFD 2CLIA 4LT9A 5F4WA 3PUEA 3P62A 4MFEA 1KFLA 3O6DA 5ABTA 1LOLA 3W74A 2FQIA 2BLEA 4TMBA 5FF2A 3NYZA 3JRKA 2CLLA 5AHFA 3LX9A 1K7EA 1K8YA 1ML1A 7TIMA 5FF7A 2BX7A 4UFMA 1EUAA 2E1DA 3W2JA 3MUXA 3T7VA 3DBPA 2Y89A 2QCHA 4LVGA 1ZENA 1TV7A 3U8GA 1TTPA 4K37A 1XDLA 3QW4B 3BO9A 2QCLA 4DF0A 1W37A 2GJNA 3LXCA 5F1UA 1W5QA 4GE8A 1LM1A 3G8EA 4ZL1A 2E68A 2YGYA 3GYEA 3NNTA 5FEPA 1AW5A 1ZY9A 4U4MA 2GQAA 3W85A 5H91A 1SQ7A 4LUIA 1RD5A 3BLEA 1GYNA 4AAJA 1EP2A 1LORA 1FQ0A 4DBEA 4AH7A 4MFDA 2F7FA 5HWMA 4M6VA 3HB9A 4Q4KA 1ZALA 3GAKA 1TQJA 2X16A 4ADTA 5EY5A 3L68A 1H7OA 2QDGA 3LHVA 1FWTA 2GQ9A 4YXGA 1TB3A 4UUIA 2I1OA 1OG0A 2DZPA 3DFTA 3CTLA 3QW3A 3LHWA 4PL2A 3G24A 1SZGA 5K4XA 1TPB1 4ORIA 4S1FA 4LS2A 5BOOA 1SW7A 3LCIA 3Q2DA 3B4UA 3O16A 3HG2A 1UCWA 2QCNA 4OT7A 4LTSA 1XUZA 3G1AA 3UD6A 3C2VA 3KVMA 1I8JA 1IIHA 1SO6A 3I65A 4D2JA 2QCDA 4B5NA 2RH9A 4ICNA 3W84A 1H1ZA 4E0CA 1ZCOA 1FY6A 3KFTA 4QITA 1H7RA 1M5WA 1QPOA 3TQ0A 3W7QA 3W1AA 5AHEA 3R8RA 2ZA3A 4L4LA 4FX8A 1H50A 4RKAA 3TQKA 2NWSA 4TU1A 4NU7A 2W0UA 3RLVA 3R13A 4JIPA 2GPTA 5KZMA 1WBJA 4N6EA 2YPIA 1H51A 2ZFAA 3B0UX 3TR2A 1RPXA 4UTLA 5AYYA 3OG3A 3BGGA 1H62A 1EUNA 3DHFA 2WNQA 3TROA 4EIVA 1W5PA 3FKKA 5E0KA 1L6YA 2DZUA 3CWNA 3GXTA 3QPYA 4EF8A 3EWBX 4IX2A 3GLCA 3GR7A 4H3DA 1XDMA 3C2FA 1CW2A 1QWGA 3AJXA 3CEUA 3H53A 3TIMA 3S9YA 3R89A 2X30A 3BW3A 1RZMA 2TSYA 4HSNA 1JUKA 2ZA1A 2A7RA 4LC8A 3UWQA 4LOCA 2J6XA 1FWNA 1IXPA 1KTCA 1VCVA 4MOZA 2ZQ0A 4UTIA 5FEWA 2ABAA 3N73A 1F6KA 1KM2A 3OVPA 2DJXA 3MO7A 1OFEA 3C61A 1JCNA 4JYFA 4Z08A 2FPVA 2V2CA 3EXTA 1W1ZA 4AVFA 1WOBA 2CWNA 2C15A 1L6WA 2QJIA 2H90A 2XN1A 3P82A 1W3TA 2CLMA 1G7UA 2CLKA 2DZTA 4P61A 5HR6A 4WZHA 2QCFA 3TNOA 2C16A 2NXHA 1T8XA 5I3FA 3DH7A 4IUOA 1RQBA 1H5YA 2C3ZA 3LCWA 3GR8A 1YTKA 1UJPA 3S42A 2R94A 1FWRA 3ZS4A 4Z0JA 3TK7A 2X1UA 1JQXA 3B06A 3PC0A 3MI3A 4POCA 1JCXA 2HS8A 1FXQA 3GVGA 5I3KA 4AWUA 1AW1A 5AHMA 4DPQA 1SU5A 4O12A 4ZMGA 3NL3A 4M19A 1TPEA 3QMRA 1BEUA 3TSBA 5G2IA 3KRUA 4E2BA 4AEOA 1LRQA 2V82A 1O4UA 3VFLA 4HPJA 1G67A 3LLFA 4RZ5A 2B7NA 3G1YA 1A5SA 3LCXA 3SECA 3DFOA 4M6PA 1HO1A 3GDTA 3NZ1A 3DFSA 1UBSA 4MLJA 3WJWA 1PL9A 3FEMA 4OBTA 4Z1BA 3WJSA 3F4WA 4EVZA 3PB0A 3OHIA 3NM3A 2ISSA 2FB3A 4ZQCA 2FIQA 3MBDA 1CI1A 1ZAIA 1VHNA 2BZNA 1RQEA 3INPA 4HHPA 3ZWTA 4JXCA 3W86A 2FJKA 3W73A 2QUVA 3G0UA 1SFJA 3TAKA 1I2OA 5FF3A 4R34A 3UXDA 3O1NA 2NXGA 3VE7A 4JTUA 2WJZA 4N9EA 3ZR4A 2CLOA 1OVDA 4S2CA 3P74A 3DFPA 2YXGA 4ORMA 2A4AA 2B7QA 3CM4A 2B4GA 3W1RA 3PVFA 5TBOA 3DKLA 1F5ZA 4GBUA 4DELA 4RX0A 3T55A 4JTEA 4QQ3A 2DZXA 3S5YA 4ZQOA 3MWAA 3HBLA 3W2NA 4IMCA 1DQXA 2JKEA 4AF0A 1KLZA 2BSLA 3BG3A 2NLIA 1QFEA 2TMDA 3C2OA 4O8RA 2LLEA 2FLIA 3KVKA 3W1LA 3TMQA 3W71A 1VYPX 1W3IA 4A22A 4LU0A 4UFHA 2A21A 2ISVA 3P61A 1EIXA 1K7XA 3M44A 4CLMA 1KA9F 2V30A 3W3OA 1WXJA 1W8SA 5HUOA 5D32A 2H6RA 1TRDA 3USBA 2J88A 4UC5A 1C29A 5DCEA 4PL1A 1EPXA 3THAA 5CSSA 3W1PA 1Z41A 3MHUA 3N14A 2TPSA 1BTMA 4MZYA 3LTSA 5G5IA 4UR8A 3N2XA 4FX6M 4NXSA 5DCBA 2EKCA 4GUFA 4MY9A 1P4CA 4LVBA 3UNDA 5F2GA 1KV8A 2C13A 3LBCA 4KFOA 3C6CA 2B7OA 3NQ7A 3W88A 1YDVA 5LHEA 2O7SA 5FEZA 2FTPA 5F1VA 2DZSA 5CKSA 1DOSA 2QEZA 2B7PA 5I3JA 2AGKA 5K2ZA 1UUOA 2VFFA 5LNWA 1NAL1 2NX1A 2QAFA 3M9YA 3M5ZA 3HPXA 1VRDA 5F4XA 1GWJA 3MI2A 2Y88A 3UWYA 1YXYA 3B8DA 1N55A 4M5PA 4QNEA 2NUXA 3S5OA 4HKPA 4BI7A 2VFDA 3DXIA 1VGAA 3IRDA 3O07A 2H3BA 3Q37A 3TCEA 3C2RA 4O50A 4MPQA 4XBKA 3SI9A 2CZDA 2E6DA 3QRHA 2CZEA 2F84A 3V75A 4A21A 2NX9A 5DLCA 2A0NA 3W2LA 4S2BA 3BARA 4IMFA 4OGZA 4WXYA 2WKJA 2QJGA 2A1YA 1MEWA 2QCMA 2Z6JA 3QSTA 4NJIA 4FEZA 3W7KA 2TRSA 2Y63A 3NPXA 3LHUA 4O54A 3LBMA 3W9ZA 3S1WA 1GPWA 4JYDA 3KX6A 4QNWA 3EXSA 1QCWA 3UY8A 1AMKA 3SZ8A 2ZZ6A 3W7CA 4DQWA 1KFBA 1ZHAA 3WK3A 3RLUA 1VLIA 4XUGA 3LTPA 3U6WA 1XCFA 3L65A 4GUJA 3EEGA 3W2UA 3NQDA 1MO0A 1VJIA 4ZQMA 2CLFA 2C0AA 1KBIA 4O1AA 3W1MA 2GOUA 4LY8A 3QZEA 1KFJA 3ATZA 4MJZA 4FO4A 2FPTA 4UMAA 3A5VA 4JX6A 1P1XA 3DKJA 5C2XA 1OX6A 1QNVA 3PG9A 3GDMA 5DBUA 6ALDA 4JTSA 1WA3A 3FYOA 3LGEA 4K6AA 4ML9A 1G4TA 1OFAA 1VHCA 1T99A 3TC7A 1PIIA 1R2SA 1QO5A 1T96A 3UWVA 3CWOX 3WJZA 4L4MA 3PF3A 1D3GA 1IF2A 4FIRA 4O10A 3CT7A 4UTKA 3BLFA 5HWJA 5CSRA 4PTNA 3ABRA 4JY9A 3FJ6A 4LV4A 2VEKA 2V0TA 5EMUA 1G6CA 1LLWA 1AL7A 1JUEA 4YMZA 4YCPA 4IMEA 1J5TA 2UV8G 1KTBA 1VC4A 1IIGA 1B3OA 4JTTA 2VC6A 3UWZA 4IOTA 1TQXA 4GNJA 1R46A 3W76A 5DCDA 1HUVA 3MBFA 1X7FA 4FNRA 1TCDA 3W6YA 5CZ0A 2WNZA 1KTNA 5G2WA 4RJEA 4JY8A 1EEPA 3NPUA 2YZRA 4M6QA 2X1SA 3MHGA 4RZ4A 1PHWA 3QQ1A 1DBTA 3RK8A 2QR6A 2Z6IA 4FX7A 3BPWA 2C6QA 2E6AA 1LDCA 4E2DA 2E6FA 5KINA 3RU6A 5T26A 4N02A 2EHHA 4NZJA 1MXSA 4ZVJA 1P0NA 1ALDA 4H6KA 3CLMA 1LBLA 3FYPA 4MUZA 3W1TA 1LCOA 3I6RA 4TO8A 2J27A 3S1UA 3LXAA 4NX0A 5HQEA 2JKAA 1R2RA 2WQPA 2PE4A 1RR2A 1OYCA 1GT8A 3T4CA 2ZTKA 4I7UA 3M5YA 1K8XA 2YX0A 1AW2A 1G4EA 3T78A 1KW1A 3EWWA 1SUXA 4JDBA 4H4IA 4YL2A 1KLYA 3GB6A 3QMSA 3MW7A 3HQ1A 4RZ6A 5D33A 4ADSA 1LROA 3O06A 1Q6LA 4RXGA 1KFEA 3IIXA 5F2MA 3LDVA 4GJ1A 4JTJA 4Y6GA 3N34A 3LERA 3GIYA 5AHIA 1SSGA 4X3ZA 3OA3A 2QDHA 3EKLA 4NNCA 3G8RA 4TR9A 3BVJA 3U2OA 5AHNA 3HMJG 1R2TA 3M0ZA 2Y7DA 3ABSA 3VNDA 3VCRA 3HGSA 4O15A 5AN7A 2Y85A 4UFIA 3DHDA 2R91A 1XFBA 3IIOA 2OCZA 3CU2A 1YDOA 4DEFA 3QQ0A 5GVJA 1TV5A 5EKYA 3TUUA 4NQ1A 4QM1A 3SIZA 2ZZ7A 4LVAA 4GWEA 3NL5A 1QPNA 3LLDA 5A8GA 2GQ8A 3A24A 1JULA 4RCXA 1VZWA 4UMCA 3UWUA 2ALDA 2V2DA 3PBVA 4JX5A 2PRMA 3TW7A 5G4WA 3DI0A 1L2UA 3L21A 4XKYB 1I45A 4JR5A 4JNMA 5DBTA 4YCOA 3L67A 4QISA 3O6CA 1ICQA 1WOAA 3F03K 5DY3A 4UFJA 1O60A 3SJ3A 4NZFA 5EBUA 1FXPA 4AXKA 2BWGA 4NJGA 1FCQA 4LUJA 5HULA 4RLIA 3TV8A 2ZZ1A 4ZZ9A 3HGRA 4RK8A 4K39A 1GVRA 1Q45A 1TSIA 1O5XA 1PS9A 3G1VA 5AYZA 1JVNA 5CPLA 2YR1A 1OFRA 1OABA 5LGZA 1O95A 1PHQA 1SFLA 1CX9A 3E49A 2RDUA 1H63A 1U83A 1I2RA 4UCGA 3UYCA 1SO5A 4DF2A 4JS3A 3GX9A 4DPPA 4GRSA 3G3DA 1FCBA 4RV8A 1KM4A 3LOTA 1OK6A 5D37A 1VR6A 5C5YA 1I4NA 1Z48A 3G1FA 2VEIA 1ICSA 1KM5A 1SSDA 3TQVA 2YFNA 3F4NA 4UMBA 3G0SA 3L0KA 3HG5A 2DP3A 3PY2A 3WJYA 3C2EA 1DJQA 2XN0A 3W07A 3L0NA 3W1QA 5KTLA 1WYIA 3FS2A 4QAIA 1P5BA 5EL1A 3E96A 4O17A 4AHQA 4O1BA 3P67A 1Q3NA 4BR1A 1GTEA 1XC4A 3IIPA 3HOJA 1X1ZA 1QOPA 4ALDA 3OBKA 3PR2A 1SZEA 1DQWA 2J9YA 3PSVA 1Z42A 3I68A 5L9FA 4GUGA 3PULA 4WY0B 1TPWA 1AG1O 2V9DA 2VKZG 4BWLC 1A50A 2G95A 4O19A 4LS1A 4JX4A 4K36A 1FUYA 4TMCA 2VXNA 3DFQA 4LC6A 4FXRA 3DU0A 3LB0A 4O1CA 4Y96A 5KZDA 5BMWA 4MVAA 3RF9A 1BKSA 1QO2A 2DZVA 3IGXA 5CPMA 4OWGA 1G4SA 3M5VA 3QF0A 4OV4A 1MZHA 2BXVA 6TIMA 1KM3A 3NDOA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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