2H3D | Genus

Total Genus 164

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	164
sequence length	476
structure length	465
Chain Sequence	EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKEVYREHFQDDVFNERGWNYILEKYDGHLPIEVKAVPEGSVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGIALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTEAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLDILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKKWSIENVSFGSGGALLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGVNVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGHDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEVRKNAQLN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Structure of Nampt/PBEF/visfatin, a mammalian NAD(+) biosynthetic enzyme. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags	Transferase
source organism	Mus musculus
total genus	164
structure length	465
sequence length	476
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2006-05-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2h3dA02

1OFRA 3CIWA 3A9IA 3W1NA 3STEA 4H6KA 2DU2A 3HGOA 4UTJA 1IXNA 2ZQ0A 2J88A 3PUDA 1QPNA 3N19B 4R7JA 2ZRZA 3LXAA 4ADSA 1TYGA 3QZEA 5DY2A 1JCXA 4Z08A 1YDNA 1H50A 2NX3A 2NWSA 4MYAA 1K8ZA 1L6YA 2CZFA 2TPSA 3FA5A 1E51A 3DI1A 1B57A 5AB3A 4IX2A 3P74A 2H8ZA 3BARA 4FX7A 3LRMA 4IJBA 3WJWA 1TO3A 1VCFA 5K9CA 4IWWA 2RH9A 3GXPA 2CLLA 3CM4A 3LTPA 3R2GA 1KLZA 1KFCA 4XQ6A 4WX2A 2PURA 3HMJG 1LOSA 4IMEA 5FEXA 2CZEA 4J9JA 3TK7A 5LNSA 3PBUA 5T26A 3W7KA 2E6AA 3IGUA 2E5DA 2A21A 3EX2A 3NXFA 3MBFA 3C56A 4LOCA 5D2XA 5H91A 3CHVA 5HR6A 2QDHA 2V2HA 3QRHA 3IGXA 3LTYA 3TKFA 4G1KA 4DF2A 4KFPA 4GUJA 1KW1A 3SZ8A 1UB3A 3TXZA 3A24A 1Z41A 1C8VA 3EXSA 4QNWA 4N6EA 1I2RA 2A85A 4AHPA 1FWWA 4JY8A 5I3FA 3B8DA 3UQNA 2QJIA 3PY2A 1OX6A 3WK0A 1KTNA 2V0TA 4MVAA 1Z44A 4NZFA 2Q8LA 1WAUA 3TAKA 1LCOA 4S1FA 1I2PA 5FF4A 3L68A 3UWVA 1LBFA 4GC4A 4O52A 4HNUA 3DAQA 2H6RA 4ZQCA 1F6PA 1K8XA 1OFBA 1XDMA 2NWRA 1DVJA 4AB4A 1QAPA 3VE7A 1RD5A 1W37A 2GPTA 4TR9A 2F84A 5D33A 4ZQPA 3SFKA 2X2GA 4QQ3A 3T7VA 1JUEA 2ZRUA 3B0UX 1SZEA 5CGQA 1OF8A 2ZZ7A 3P7YA 2ZDRA 3KRSA 1TB3A 5G4EA 1O5XA 3TROA 4BFAA 1F74A 1QDSA 1GT8A 3F4WA 1GYLA 1RR2A 4ZVJA 4ZQOA 1W5QA 2E6FA 3P82A 1ZAIA 4HSNA 4AVFA 3LCGA 3CWOX 5EY5A 1JR1A 1SO5A 5AYYA 3HG5A 4AXKA 2NZLA 2PC4A 3L5LA 1KBIA 1EP2A 3IVSA 4X2RA 1EWDA 5G2HA 2VFEA 1OFOA 4O13A 2DORA 3KVMA 4H3DA 1K3UA 2ZA1A 3G0XA 3P81A 3LX9A 1FY6A 2VC6A 3S5NA 3S1XA 5BW6A 1G4EA 1I4NA 3G3DA 4LWWA 5I3GA 5IBXC 5K9XA 4RK8A 5U4NA 2CW6A 3DGRA 3LHUA 3CEPA 4P61A 3S0CA 4WXZA 2CZ5A 3UWUA 2HS8A 3IGSA 5F2LA 4UFLA 1K7FA 3V75A 2R94A 2Y7DA 1VYSX 5HWMA 3BO9A 1H5YA 1OG0A 1WXJA 5D09A 2C3ZA 3FKKA 5F4WA 4QITA 2Z6JA 2VFHA 3ABRA 4UR7A 3UPWA 3M0ZA 2WV8A 1L9WA 4GRSA 1YXCA 4BWLA 1AL7A 1LRNA 1SZGA 4MOZA 3OVPA 1J2WA 4QIUA 5KZEA 4K6AA 1S5WA 3W7CA 4RZ4A 2CWNA 2Y7EA 1NF7A 3TMLA 3DXIA 1YYAA 4FX8A 1FXPA 3N9RA 3TW6A 3NAVA 3THQA 3WJSA 3NNTA 3FS2A 4JGDA 3INPA 3W1LA 1BEUA 4ZZ9A 3NEVA 3W9ZA 3WK1A 4KWVA 3QW3A 4L4MA 3FOKA 4E38A 3BW2A 3GDTA 1LZOA 2EKCA 4GUIA 4A2SA 2D73A 4R34A 1X1OA 4MJZA 2YW4A 5E93A 1X1ZA 3N34A 2E1DA 4M6QA 5AN7A 3HPZA 1IXQA 3UZJA 5IBXA 2JGYA 2B7OA 2IQTA 4KFNA 4U4MA 1FCUA 3TR2A 1OVDA 2ALDA 2J24A 3NA8A 1WQ5A 1LLWA 4WD0A 4GUGA 1JRCA 3A23A 1TREA 2JK2A 5HULA 3W84A 3KRUA 4K36A 3LCLA 2CZDA 4RXGA 4GNJA 4IOTA 5FF0A 4M7SA 3NVTA 2V30A 4UTHA 3G1SA 3RMJA 4OE7A 3DFTA 4CQAA 3P5ZA 3EWWA 4XKYB 4IX0A 5HWJA 3IVTA 1CI1A 1LYXA 3LXCA 3A5FA 1RPXA 1MEHA 3HGJA 5DBUA 1BTMA 3EXTA 4FNRA 3EX1A 4LNYA 4XUGA 3JS3A 3HO8A 3TIMA 1SW0A 3DHDA 2B7QA 4LS2A 2JKPA 4UFMA 1EUAA 4ZL1A 2A0NA 2Z2UA 2ABAA 4QISA 5LNUA 1YADA 1GTHA 5DCEA 4IUOA 4WZHA 3L0GA 4A22A 4GJ1A 1ME7A 1GTEA 1FBAA 3NM3A 4PL2A 3G1YA 1G67A 3OBKA 4FNUA 3EKLA 3VKJA 3C2RA 3HPSA 3M16A 2PCQA 1H1ZA 3GR7A 2R14A 4LVDA 1XFBA 1X6UA 4E2BA 1FUYA 5C2XA 4QNEA 1F5ZA 4DPQA 1J5TA 4FXSA 3CEUA 4GBUA 1YDOA 2ZRYA 1M7PA 3KX6A 1K8YA 2DZUA 2CLKA 1TPVA 4FO4A 3UWWA 5D05A 3HG2A 5FF3A 1VZWA 4HPJA 3NPWA 4JTEA 3FYPA 3WJXA 2WNNA 2V5BA 4MLRA 2O7SA 2QR6A 3RNDA 5G1YA 2FIQA 4CQ9A 4XTIA 1J4EA 3ZWSA 3O6DA 3W7MA 3E02A 4UTWC 2Z6IA 1H7RA 1PCWA 2E6YA 1OFPA 4NT0A 1JULA 3GZ3A 3TQ0A 4GUFA 4O50A 3LERA 3BK0A 4JTGA 5EL1A 1THFD 2I1OA 1TPC1 3L5MA 1GG1A 2E5BA 3KHJA 2ZRXA 4JTIA 3O15A 3IVUA 2YFNA 2XN2A 3VFLA 4DQWA 3UWZA 1T8XA 2Y61A 5KMYA 4GUHA 3SI9A 4Q4KA 2VFDA 3FYOA 2P10A 3W2MA 1IGSA 3L21A 5GVJA 5HJLA 4Z0JA 3S5OA 4EF9A 2CFFA 2CLOA 3HG3A 1OJXA 4NX5A 1EP1A 5EMUA 3B06A 1SFJA 4D2JA 1H51A 5K9DA 4MIMA 1TTPA 3TSMA 1F73A 1FWSA 2C18A 1Q6QA 3O16A 1IXOA 3NQGA 5LHFA 2EF9A 3P62A 4UTIA 3C2EA 4DXVA 4MY1A 1NAL1 2W6RA 2WO5A 3NGJA 1TPUA 1EA0A 1TQJA 2Y88A 3W7JA 2Y63A 1A5AA 4O0KA 1OFEA 4TMBA 2QCLA 3HJZA 5I3JA 3OVRA 4NVTA 4LVAA 4A21A 4O16A 2BXVA 2NX1A 4UTWA 1Q6OA 1LOQA 1OX4A 1TIMA 3UPBA 5LGXA 3SGUA 4DF1A 2QUUA 2DZPA 2X16A 3I6RA 3NQCA 4HPXA 4ICNA 4LUJA 3UYCA 2XFWA 1PVNA 1T0OA 2C6QA 4GWEA 1VGAA 2HSAA 4FXRA 1CX9A 2WSRA 3PG9A 3RFAA 3LBCA 1OX5A 1YDVA 4UTKA 3G1HA 4ADUA 4A29A 3W3OA 3S5ZA 4GE8A 1S3HA 4AF0A 2DJLA 2P0OA 4BI6A 3QM3A 4RX0A 3PS7A 4JN6A 2Y7GA 1F2JA 1WA3A 3G24A 3WK2A 3E12A 2FPVA 1GQNA 4YWIA 5BOOA 3W86A 3C0JA 1JCLA 3IV3A 3C2FA 1NF0A 1V5XA 1MXSA 1H61A 2TRSA 3LHTA 2PRHA 2FLIA 4OU1A 4FNPA 1ML1A 5EYWA 3PSVA 3QJAA 4Z1AA 3W1PA 2J9YA 1T96A 1P4CA 1JJKA 1VHCA 1Z42A 2B7PA 2ATMA 5LZLA 1SSDA 2E68A 2RKXA 2KZHA 3I65A 4Z1DA 5G2WA 5KTLA 3TW7A 3M47A 3HQ1A 4BI7A 2E77A 3MW7A 2E5CA 1X7FA 3LGEA 3DKLA 4YXGA 5D2TA 3FLUA 3N14A 3W88A 1AMKA 4MYXA 5K4XA 1DQXA 2NLIA 2AGKA 3W7DA 1SW7A 4LRSA 4IMDA 4AHOA 5AC8A 2YFOA 1EWEA 4TO8A 1XL9A 1YTEA 3BG3A 4O17A 5DLCA 4GXMA 1I2QA 3WK3A 2OCZA 1GVFA 3N3MA 2V2CA 1P0NA 3EXRA 1ZCOA 3H54A 1SR9A 3ZWTA 1TTJA 3G1FA 3QW4B 4DELA 3NZ1A 1XBVA 1G7VA 1IIHA 1JQVA 3NZRA 3NR0A 5E0KA 2VOMA 1OX4B 5A5WA 1Q6RA 1IXPA 1W5PA 1R30A 4JNMA 4DO5A 4TX9A 4OT7A 1LORA 3M43A 4NNAA 2YW3A 3UY8A 4Z1CA 3M44A 3ABQA 3QSTA 3EWYA 2TMDA 4MUZA 1RVGA 3EX4A 4OGZA 1JRBA 3B0PA 3MHUA 2GUUA 1F05A 3M1ZA 4YLWA 5EA9A 3QH2A 4O53A 4PCFA 3FIGA 1FWRA 4UXDA 2ATSA 4XTDA 7TIMA 2A7PA 3NQFA 1KM4A 5FF7A 1W31A 2TSYA 3LCHA 4AF0B 3GVGA 4JDYA 3SW6A 3R5EA 4O12A 4PTNA 4OV4A 3U8GA 1MSSA 3G1DA 1QPQA 4N9CA 4O1DA 2FTPA 2GQ9A 3N73A 4Y96A 2ZBTA 2WKJA 2A7RA 1G4TA 2NUWA 4BK9A 3LCFA 1DJNA 3G8EA 4LY8A 3C52A 4EIVA 1ME9A 3S5YA 5EPDA 5FF2A 3BGJA 3PSWA 2FB2A 1OK4A 1O94A 1EX5A 5J5RA 4UFIA 2TYSA 2ZFAA 5C6MA 1W1ZA 1YPIA 1O60A 1PHWA 3MJYA 5F1UA 4LUIA 1NEYA 2G5WA 1XI3A 1G4SA 1UUOA 5G5IA 1LM1A 1G69A 1VJIA 2EHHA 2FJKA 1H1YA 4O18A 4RKAA 1R2TA 1O4UA 5LNVA 3LHYA 3LCWA 1CW2A 2FPTA 3DFSA 3G8RA 5KZMA 3B0VC 2XN1A 4HIBA 3DI0A 1HTIA 1KM2A 2Z0IA 3NQVA 2CLIA 1A50A 1ALDA 3I7RA 3P5YA 2Q3RA 1ZNNA 2CLMA 1M6JA 4CCDA 3MP4A 2Y62A 4IMCA 4UFKA 1H7NA 2J9ZA 4C1KA 2X1TA 3OG3A 4FIRA 3CTLA 5CPOA 3C2VA 2VKZG 2QCMA 1GZGA 3PM6A 3GNDA 4WUIA 3LHWA 4NJKA 3R8RA 3PG8A 1LP6A 1VH7A 4AMAA 3W70A 2DZVA 2NXHA 4MZ1A 1H62A 5TBOA 5E1QA 4O14A 3T78A 2QDGA 3PVFA 2YX0A 2OMAA 3LI0A 3MWAA 1KFEA 2ZCGA 4FIQA 2H3DA 3P8IA 3OHIA 2V82A 3ANYA 5AHMA 3A22A 4O28A 3PUEA 4NJGA 4IXXA 3GDLA 2JKEA 2BZNA 3NQMA 4NZJA 1KLYA 4ADTA 2GQ8A 3GR8A 1K02A 1ONRA 2B4GA 4MFDA 2Y89A 2YPIA 3STGA 3UXDA 4FEZA 4OHQA 4JTJA 4O10A 2QUTA 4I7WA 2RHGA 1GVSA 2ZZ2A 5CZSA 3HOJA 4WOQA 4JTUA 4JDBA 5AYXA 3W85A 5L6UA 3L65A 1VS1A 5A8GA 2ZA2A 1TPB1 1IF2A 5AHLA 3HIJA 3N2XA 5G1TA 3G3MA 3TXVA 3NQDA 4ALDA 3LLFA 4R33A 3GX9A 3W2NA 3T44A 1TTIA 1DHPA 3HBLA 5I3KA 4LC6A 3NQ8A 3GKAA 2V2DA 3FJ6A 3PUOA 1EPXA 1GJPA 5CPLA 4HNVA 5F1VA 1TCDA 2ZA3A 4NXSA 3LOTA 2V5LA 1UUMA 3IIVA 3B03A 3KFTA 2YZRA 3SIZA 1TPWA 4WJEA 3VI2A 2H3BA 1GVRA 1YPFA 4M6PA 5KINA 1LRQA 5D37A 2W0UA 1UCWA 1FDYA 1L6SA 4EF8A 4N9EA 4JYDA 5C5YA 4WY0A 1W5OA 3VCRA 4NX0A 5H2ZA 4QSHA 1W54A 4O1BA 4JEQA 3RK8A 1EB3A 2GVJA 3MI3A 4Y6GA 3CB8A 2RDTA 3NM1A 3M5YA 3DKJA 2HTMA 5AC6A 1OABA 3U2OA 3L2IA 5DCBA 1ZFJA 4HNNA 2C15A 4K37A 4W9TA 4JTSA 3Q37A 5D38A 1DOSA 4RV8A 1FWNA 3UD6A 4QM1A 3PR2A 4YCOA 4CNNA 2AQWA 3LCXA 3HB9A 2OJPA 3PF3A 3GDMA 3MHGA 3C6CA 3GAKA 2CLFA 3TSDA 4U28A 3W23A 4LTSA 4PH6A 3SECA 3HF3A 3QYQA 1EIXA 2WNQA 4E0CA 1GEQA 3OA3A 4FX6M 2WQPA 5CZTA 4IQLA 2B0MA 2VEPA 1OK6A 1JUKA 2OT0A 5DY3A 2QCHA 3EWXA 4GFSA 3S6DA 1KV8A 1ICSA 1VRDA 1K03A 3ATZA 5C55A 2I9EA 3BPWA 1SU5A 1TPDA 2J6XA 1H63A 1XDLA 2CLHA 4WY0F 3T40A 3P8JA 1DORA 3LHZA 3NDOA 1D9EA 4Y8FA 1O95A 5HQEA 2JBMA 1VQTA 2WPBA 4EVZA 5AOUA 2A1YA 1LBLA 1MZHA 5HUPA 3S1UA 4PL1A 1T99A 2E6DA 3SY5A 4X3ZA 3M9YA 1XC4A 3LV6A 3LRKA 1KV5A 3NL5A 3NQAA 3A21A 4HKPA 1TJPA 4TIMA 2WNZA 4UTTC 1I45A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2H3DA

Total Genus

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