1A5AA

Cryo-crystallography of a true substrate, indole-3-glycerol phosphate, bound to a mutant (alphad60n) tryptophan synthase alpha2beta2 complex reveals the correct orientation of active site alpha glu 49
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
268
structure length
255
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLANGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLALPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cryo-crystallography of a true substrate, indole-3-glycerol phosphate, bound to a mutant (alphaD60N) tryptophan synthase alpha2beta2 complex reveals the correct orientation of active site alphaGlu49.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE (ALPHA CHAIN)
total genus 97
structure length 255
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 1998-02-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1a5aA00
1YDNA 2C15A 2A7RA 3EEGA 3JS3A 3T4CA 2X1TA 1K7EA 1SO6A 3MP4A 3HGJA 5AYZA 4FXRA 1K02A 1X1OA 5FEZA 1H7PA 2P1FA 3QW4B 2BXVA 1YLVA 4BWLA 1D3HA 1IXPA 2A4AA 3ABQA 3PVFA 5U4NA 5IM51 2YFNA 2OJPA 5F1UA 3MI2A 4JYFA 1EP3A 4IMDA 4U28A 3STFA 1LOLA 5K9DA 2EKCA 3AJXA 1FCUA 2A6NA 1PV8A 1TJPA 4GWEA 3LHTA 3GLCA 1Z48A 5FF0A 3PF3A 4N4QA 3KVMA 3EX6A 3TH6A 1H60A 4UIOA 3DFPA 3TR2A 1LYXA 1GEQA 4AWSA 4FXSA 4RV8A 4QSHA 3OEXA 4JYDA 4CNOA 4JIPA 3FYOA 1T0OA 3MI6A 3P60A 4Z1CA 3CB8A 1FDYA 4A21A 1JVNA 4GJ1A 1HUVA 1TTIA 3E96A 2J27A 3QSRA 3E9AA 5FF4A 1YDOA 1Q6RA 1OFRA 3N9RA 3E12A 3LV6A 3KRSA 3G24A 3B06A 3P5ZA 2C14A 3NQVA 5U7SA 4TIMA 1VYRA 1G6CA 4RLIA 4NNCA 2WNNA 4KFPA 3NPWA 4RXFA 3GDMA 3S1UA 5FF3A 3L0GA 2CLKA 1PCKA 1BWLA 3UXAA 1QDSA 2R14A 3W86A 2J88A 4UTJA 3GVGA 4QJ1A 3BG9A 1KV8A 1H1YA 1W5NA 4OT7A 3HJZA 2C1HA 2TMDA 3A5VA 3SGZA 1LORA 4NJGA 1G4EA 4CQAA 4WOQA 3LXBA 4RKAA 2OMAA 1LBMA 4EWND 3MUXA 1PCWA 1ZAHA 4UTTC 3UYCA 2CZEA 3M47A 2GQAA 1PS9A 2YX0A 3TW6A 3QC3A 3LHYA 3DENA 1WQ5A 1GWJA 4Z08A 3PG9A 4K38A 2WNQA 4XTDA 4JX6A 4DBEA 3NQAA 2HS6A 3GXTA 1I2QA 1LOSA 1VCVA 3IEBA 5BRBA 2JGYA 2Y7DA 1T8XA 4NJJA 2Z6JA 4XWUA 1D9EA 3V75A 4LVFA 4EOUA 2NV2A 1SQ7A 3M5ZA 4ONVA 5F4WA 3EX1A 3TROA 3DZ1A 1B57A 3STEA 3B8DA 1VC4A 5J5RA 1U5JA 2E5CA 1TREA 5L6UA 1O4UA 4AWUA 2I14A 2DZTA 3UQNA 3UNDA 2RHGA 3VNDA 2YCEA 3FIGA 3G1AA 4FEZA 5LHFA 5D2VA 1QNVA 2QCNA 2QEZA 4MY8A 2A7PA 1SO5A 3MYPA 1DV7A 4O17A 1LRNA 2RH9A 2A85A 2ALDA 3TU9A 3OBKA 1Q6LA 3QJAA 4CCCA 1IIHA 2OX1A 1KLZA 5EY5A 4GE8A 1DKWA 1WV2A 4JS3A 3W7OA 3IRDA 1ZHAA 1Q6QA 4O52A 1DHPA 4AVFA 3A22A 3GK0A 3PBYA 3VE9A 5D33A 4AEOA 3OHIA 2C6QA 5H2ZA 5F4XA 3TV8A 2J24A 2CZFA 4P2VA 3HPXA 1ALDA 1IXQA 2AQWA 1GTHA 3IIXA 3TW7A 2X30A 1FUYA 1JRBA 4NX0A 2X1SA 1LRTA 2CLHA 4ZQCA 4UTHA 4UTWC 3LTSA 1H7RA 4O0KA 3CT7A 1IXNA 1C29A 1W1ZA 2VEMA 3GDKA 1TQJA 2GVLA 1I4NA 1XBXA 3BLEA 4N9BA 2GUUA 4LOCA 1PIIA 3UWUA 2Y7EA 1RD5A 3LBMA 3VCRA 3GIYA 4WD0A 1FDZA 3W7NA 5FF2A 1ME8A 2ABAA 3LTYA 2P0OA 2A0NA 3EWZA 1FXPA 4WQ6A 2ZYFA 4TO8A 2BZNA 3S6DA 4OU1A 1KM4A 3L9CA 2CZDA 3L67A 4K8EA 1JCJA 3R13A 1JUKA 5TIMA 1A50A 1NFBA 2YFOA 2ZZ2A 4Q33A 5D2WA 4DPQA 4ZZ9A 2FLIA 3DHFA 2PC4A 4LVBA 2ISVA 4DELA 1GZGA 5G4WA 5EBUA 5HR6A 4DPPA 3L5AA 3HF3A 3TK7A 5LNWA 3NM3A 2RFGA 5I3IA 3O8AA 4X22A 2H90A 4HNVA 1N7KA 1TTPA 4NXSA 1SUXA 2QCLA 1O94A 2NX3A 2R94A 2ZRWA 3PY2A 1JRCA 1QMLA 5CSRA 1SPQA 3SGUA 4BFAA 4X2RA 5CPMA 3SIZA 3WFAA 1HL2A 1SZGA 3DHDA 4PFMA 1SZNA 4HSNA 4FNSA 3W7QA 2C3ZA 1B9BA 2DZPA 2GJNA 1KM5A 1AW2A 4UMBA 1YPIA 3PR2A 1TTQA 4AMAA 1A5BA 3ZS4A 4UCGA 2VFIA 5D2YA 4M6PA 3UPWA 3S1XA 4A22A 4FB7A 4O14A 4OE7A 3DAQA 4XBKA 3STCA 1XI3A 2ZZ7A 4HIBA 5EL1A 5H91A 2ZA1A 1F76A 3O07A 3W1AA 2J6XA 2V8ZA 2ZRVA 3EKLA 1QCWA 3GX9A 4BI5A 1THFD 3GKAA 2X1RA 1OVDA 1F73A 1G7UA 4UTTA 4AHOA 3C2OA 1TQXA 3CHVA 1H5YA 3IVUA 3DI0A 3W22A 5CZ0A 5E93A 1DQWA 4RZ4A 1YXYA 2E09A 4QITA 4M19A 4CNNA 1W37A 3LCIA 5KZMA 4RZ6A 2Y85A 4M7TA 1KFJA 1I45A 1VRDA 3OG3A 3QRHA 2JKAA 3SSJA 2NXGA 3NL2A 4JX4A 3LRKA 5HJLA 4A3UA 1J2WA 2CWNA 1OABA 4POCA 2FPYA 2H8XA 4UUIA 2DORA 2JKPA 1LBFA 5LGXA 2CLMA 2NWSA 3W1PA 2B0MA 3FEMA 3C8FA 4O16A 4DO6A 1OG0A 4BF9A 2ABBA 1QAPA 1OFPA 5A8GA 3QYQA 1WDWA 1HO1A 3P61A 4BK9A 2Q3OA 1KFLA 3DFQA 5HR7A 3M44A 3KVLA 1YTKA 1MEIA 4GC4A 2X2GA 1KBIA 4O10A 2O7SA 3PSWA 4YWIA 1QOPA 4WX2A 2VFFA 3TA6A 4HNUA 3IIVA 3NNTA 2YYUA 1JULA 5AHFA 3PSVA 3HBLA 4MOZA 5CZJA 2DJXA 3PC0A 3N9SA 2ZZ1A 2V81A 2A5HA 3IVTA 1NEYA 2YW4A 3GAKA 3GXPA 3DFOA 3W7HA 2B4GA 3UWZA 4N9EA 1FWSA 3FKRA 3MMTA 2EF9A 3LX9A 1I2NA 3G1DA 1F74A 1KM6A 3NYZA 4A2SA 3EWUA 4O13A 3LHWA 1H7NA 2TSYA 5HWNA 2FJKA 2Y88A 4O1DA 1W0MA 4FIRA 4OV4A 1H63A 1L9WA 4FNTA 5AHLA 2BX7A 3M16A 3C2FA 5DXYA 3M41A 1FY6A 2E6YA 4RXGA 4TU1A 4M5PA 2V9DA 3USBA 2NX9A 4O1AA 3LLFA 2X1UA 1I2RA 3P62A 5DCDA 1SO3A 1KM0A 2OCZA 3I7RA 1MEWA 4Z1DA 1LM1A 3VI2A 1A5AA 2GVGA 3G1SA 4LY8A 4U4MA 2Z1BA 3C2EA 3MHFA 2W6RA 1FWRA 4WY0F 2UV8G 5DXXA 3G22A 1DOSA 1WA3A 2TRSA 2V0TA 3MWAA 3ELFA 4YMZA 3WK3A 3QW3A 1GVSA 3TIMA 4Y6GA 4MFEA 2QCDB 5GVJA 3B0UX 3WJYA 3L66A 4ZQPA 4IMGA 4LTSA 3HG2A 3W7DA 3FKKA 3PBWA 1W5MA 5F4SA 3R89A 1ICQA 1TPWA 3CM4A 1AMKA 1K7XA 1NVMA 3S1VA 2QCDA 1AK5A 3RU6A 3QSTA 3MBDA 3M5VA 4HHPA 3L2IA 5AOUA 4FX7A 3EX4A 5EPDA 2YZRA 5DLCA 3W2LA 5AC8A 3C56A 1XDMA 3OIXA 1NAL1 4O19A 2GQ8A 3GXNA 3EX3A 2E68A 2XN2A 3T40A 1S5VA 3BW3A 3GNNA 3P82A 2EAWA 1NF0A 3CEUA 2ATSA 1SW3A 4QAIA 1TPEA 4AH7A 1WBJA 1IF2A 2FB2A 2WPBA 5AFDA 1VHNA 1ZCOA 1TPUA 4ZQRA 1F6PA 3W1TA 3HG3A 4MZ8A 5KZDA 1SW7A 1OFOA 3CQ0A 4LV4A 1VLWA 4O28A 4N4PA 2V5BA 4IXHA 4DF0A 2QCCA 1GPWA 3Q94A 4XBSA 1ME9A 3DI1A 5F2GA 3HG4A 3W1NA 1V7YA 4O12A 4XTIA 4UR8A 1GVQA 2QDGA 4YLWA 1F5ZA 3FS2A 3GNDA 3TJLA 1Z42A 3G1XA 4PCFA 3N2MA 1ZENA 3W2NA 3EXSA 3DH7A 4UTUA 3P7YA 2CLLA 4AB4A 3QZEA 4ADTA 1H7WA 3GB6A 2RKXA 4O1BA 1B4EA 1GG1A 1YXDA 3EX2A 1UASA 3C4UA 1HTIA 4A2RA 3P80A 3FJ6A 1EIXA 1SZFA 3VE7A 3UWVA 4PL2A 4TMBA 4IQLA 4YL2A 3TJXA 3LI0A 2G97A 1LDCA 1ZAJA 3P8JA 1VLIA 3LRMA 4JICA 5IBXC 1DVJA 1QR7A 3NO5A 3NXFA 4ZQNA 3DXIA 3HIJA 1GTEA 3GDLA 4UFMA 1GJPA 4YXGA 3LCFA 1TYGA 6ALDA 1XFBA 3TKFA 1EUAA 1RZMA 4XUGA 1QO5A 2QCFA 1XXXA 3W72A 4JDYA 2NXIA 3TQKA 2VEIA 3QMTA 5LNRA 1UUOA 1O95A 2CW6A 2AGKA 3O63A 5AYXA 3SZ8A 5G5IA 1WOBA 2CLOA 2QUUA 3S9YA 3STGA 3QPZA 3HMJG 5CG7A 4WOZA 3TMQA 1F6KA 4YCPA 1U83A 1CW2A 1O5KA 1KTBA 3O6DA 5D2TA 4OBTA 5DCBA 2V82A 4H4IA 1IIGA 3W71A 4UNLA 1I8JA 1NF7A 1ZFJA 3W7GA 5CSSA 4S2BA 1DL3A 2CU0A 4MY1A 5K4XA 2GJLA 4UTLA 1AG1O 1L2UA 5HUPA 2FB3A 3EB2A 4MYAA 1SSGA 3RK8A 3DFNA 3G3DA 1P4CA 1KM1A 3G1FA 3W2KA 5KINA 3LGEA 4K8HA 4MLRA 4JX5A 3LDVA 1AL8A 1O60A 6TIMA 1LZOA 4JEQA 4M7SA 2X16A 5AHEA 4K7YA 3NQ6A 4R7JA 2J9XA 5LZLA 2BSLA 1OX4B 2H3BA 4N6EA 5HULA 1TPFA 4GUHA 3LERA 2KZHA 1JCLA 1TPC1 3P74A 1DBTA 3IVSA 4UFKA 3TAKA 3W3OA 2VC6A 4NZJA 3T44A 1XBYA 3TSDA 4LC6A 3ABSA 1UUMA 5BMWA 4GUJA 2G5WA 1OX4A 2XN1A 1OFEA 3HQ1A 5BNKA 1S3HA 3KX6A 4XZ9A 3QMSA 1W5QA 4RX0A 4K36A 1VQTA 1K8YA 1VHCA 2Y63A 1JQXA 2PRHA 2RDWA 2DZUA 3MJYA 1XKYA 3BV4A 3NPXA 4AHQA 5FF7A 4UTMA 3M5XA 1JCMP 4OHQA 4MJZA 1DQXA 3TNOA 4ICNA 4UFHA 1W8SA 3QPYA 1FX6A 5LNSA 1OK4A 1EA0A 4JTFA 3BLIA 4O53A 3HGOA 4JR5A 3M1ZA 3O6YX 3FLUA 3OA3A 1ML1A 1QPRA 2R8WA 4OGZA 3CPRA 2YR1A 3B0VC 3BO9A 4WY0A 3TQ0A 1JCYA 3A23A 1TRDA 3GYEA 2VOMA 4B5NA 2V2DA 1Z44A 2CZ5A 2F7FA 4UR7A 4IMCA 5EYWA 2RDUA 1JUEA 2WJZA 3SW6A 4JNMA 1WX0A 4IWWA 3TE9A 3HG5A 4K7VA 3W73A 2B7NA 1KTCA 2W79A 1SSDA 3FYPA 4GRSA 1XUUA 3GDTA 5LKYA 2JK2A 4G1KA 3G18A 1ICSA 3ATZA 4NU7A 5CPLA 3W7LA 1A53A 4HT3A 3UWWA 5SWUA 3PUDA 3TX9A 4O11A 2Z2UA 1TRIA 3NA8A 1XCFA 1K7FA 1LROA 4FX8A 1G7VA 1CX9A 1EP2A 2I9EA 3M6YA 3KHJA 4OWGA 1A5CA 5IBXA 3S42A 2TYSA 4IPIA 3SR7A 2ZFAA 4MJMA 3FJLA 3TC6A 4GUIA 4GXMA 3WJZA 3JR2A 2ISWA 1XC4A 4RZ5A 1P5BA 3PB2A 5EMUA 1T99A 3NG3A 5C54A 3NL5A 1BTMA 5G2HA 3W7EA 3B04A 2H6RA 1H7XA 2WSQA 1GOXA 5I3FA 4ZQMA 3AO0A 1E51A 5G2IA 2WSYA 2GPTA 4L4LA 4NVTA 1SU5A 1W5PA 2CLEA 4N02A 3K30A 5G4EA 1PE1A 4UFIA 4ZVJA 2ZZ5A 3LOTA 3W7CA 1FWWA 3CWOX 3H53A 2DZXA 1F7BA 1GYLA 3A21A 1V5XA 5AHIA 3EWXA 4Q4KA 1G4PA 3WJXA 5DBUA 3CWNA 5BW6A 1P0KA 5D2XA 3G8EA 4EF9A 1FCVA 3FOKA 5TQLA 4RK8A 3IGSA 1JR1A 1VCFA 4KWVA 5HQEA 4LS1A 3BK0A 1RQBA 1C9DA 3TCEA 4JTGA 2P10A 1HO4A 2GVJA 3JRKA 3W1UA 4FNUA 2NUWA 3FFSA 4GFSA 1QO2A 1H7OA 2E5DA 4O15A 3PUOA 3INPA 3QEZA 3O15A 5KMYA 1XM3A 2D73A 1K03A 4O1CA 1FWNA 5D37A 1TV8A 2GQ9A 4ADSA 4C1KA 4AHPA 4PTNA 2NUXA 3W70A 3LXAA 3T7VA 2O7QA 3BW2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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