1AG1O

Monohydrogen phosphate binding to trypanosomal triosephosphate isomerase
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
SKPQPIAAANWKCNGSQQSLSELIDLFNSTSINHDVQCVVASTFVHLAMTKERLSHPKFVIAAQNAIAKSGAFTGEVSLPILKDFGVNWIVLGHSERRAYYGETNEIVADKVAAAVASGFMVIACIGETLQERESGRTAVVVLTQIAAIAKKLKKADWAKVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQEAHALIRSWVSSKIGADVAGELRILYGGSVNGKNARTLYQQRDVNGFLVGGASLKPEFVDIIKATQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Anion binding at the active site of trypanosomal triosephosphate isomerase. Monohydrogen phosphate does not mimic sulphate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
molecule tags Isomerase(intramolecular oxidoreductase)
total genus 92
structure length 249
sequence length 249
chains with identical sequence T
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 1997-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1ag1O00
4RR4A 3NDOA 3WK2A 1F73A 3NG3A 4NNAA 4O11A 1LLWA 1AMKA 1HUVA 4O52A 1IXQA 4JTGA 1GQNA 2J9XA 3HPXA 1QO2A 2YW3A 3LCHA 4O10A 1KV5A 3HGSA 1W3NA 3TNOA 1DBTA 2OCZA 3L5LA 3LHVA 1R30A 1MSSA 2VFFA 3TX9A 4J9JA 3BG3A 4C1LA 4RX0A 1B4EA 3NYZA 3GB6A 3NQ6A 4UNLA 3S6DA 2E6AA 1KM1A 4NJJA 1JUEA 1ZJIA 4MJMA 1V7YA 3CC1A 3SGZA 4TIMA 1LROA 1AG1O 4MZ8A 1DJQA 3KXQA 3WFAA 2CLKA 3EKLA 1Z41A 3R2GA 3PUDA 4K6AA 4A2RA 3W7OA 3TK7A 3B0PA 4AAJA 3UQNA 3W2UA 2XN0A 3KRZA 3EX6A 3TJXA 2ZA3A 5FESA 4JD4A 1SW7A 1TPH1 4XUGA 3FFSA 4I7VA 4AF0B 2C1HA 5D38A 5SWUA 1A5AA 3W23A 5EPDA 2ABBA 2J9YA 1XDMA 2BX7A 4E38A 3ABOA 4NU7A 2ISWA 4JNMA 3NNTA 5E93A 3LLDA 4QNWA 2QCNA 2GQ8A 5KITA 2QUVA 1PHWA 4LTSA 5HWJA 1OABA 1QCWA 4O19A 3NEVA 2B7NA 3ATZA 1FWNA 3VE7A 4IX2A 2W6RA 3OEXA 1LRNA 1QDSA 4ZL1A 3QYQA 3S1VA 5F1UA 4MLRA 1SZFA 3PM6A 4O28A 4TR9A 4UC5A 1ZAIA 4KKXA 5TBOA 3W07A 1SSGA 1X1ZA 1T8XA 3SJ3A 4M7SA 5HQEA 3QJAA 3QPYA 2V2DA 3E49A 3HG4A 3DFNA 3B06A 1KM6A 2CLOA 5F2IA 1AW2A 4JTUA 3LTPA 4LS2A 2QCDA 3RNDA 3NQEA 3FJLA 5C54A 4QIUA 1FXPA 3JR2A 1L2UA 2EHHA 4LRTA 2CWNA 2B7PA 1TPC1 2NV1A 3PB2A 1UUMA 1KLZA 1NF0A 4JX6A 5FEZA 3LRKA 3G1SA 8TIMA 4NJKA 4NT0A 5HUPA 3EKZA 4WQ6A 3GXPA 3ELFA 4A22A 1A50A 4RXFA 1MEHA 5F4SA 3W1AA 1XUUA 2Z2UA 1OFDA 4MIMA 5HJLA 5AHLA 1EA0A 4DO6A 4JTLA 1G7UA 4RKAA 3S5OA 3T40A 5K4XA 3W1UA 1BTMA 4MVAA 1JCNA 1FWSA 3NPWA 1I8JA 2V5LA 3TKFA 1IF2A 3G8RA 5F4XA 3FYPA 2LLEA 2BTMA 4O13A 3S8HA 1G67A 3A23A 3M5VA 5D09A 1TCDA 3DI0A 2A7RA 2OT0A 4JTKA 4CQAA 1TJRA 1FDYA 4UFMA 2A1YA 1SW3A 1QMLA 3DFQA 4BFAA 2E6YA 4WY0A 3P74A 3NL3A 3CIWA 1SFJA 3NZRA 4EF8A 1GEQA 4ZQMA 1TSIA 1FCVA 4WZHA 4NXKA 1TV5A 2BSLA 2C0AA 4LV4A 5L9FA 3DFPA 4IMFA 4XQ6A 3QMSA 3NQ8A 2YZRA 1A5SA 1EX5A 2DZTA 1R2TA 1MZHA 5FEXA 3O05A 1FY6A 3WJZA 3W2KA 5D02A 1BWKA 1XBYA 4O53A 2A5HA 2X1TA 5FI8A 5BMXA 4Z08A 2X30A 1X8FA 1JRCA 1ICQA 3LTYA 4LT9A 1K02A 4O4WA 1TPB1 4IMGA 2BXVA 5CSSA 1H50A 4JY9A 3W7HA 1JUBA 4CNNA 3W7IA 3V1PA 1O60A 4N6EA 4UTHA 4WUIA 4RZ4A 5CSRA 4ZQRA 4JY8A 3EWWA 3NVTA 4N2YA 3W86A 3PC0A 4OHQA 4RLIA 5H91A 4NX0A 1T96A 2I9EA 3W75A 4GUGA 1BKSA 2J9ZA 1TTPA 5FEWA 4M6VA 2WNQA 1JJKA 3G1AA 3PG9A 4UFJA 3W7RA 4GE8A 3A9IA 3QM3A 4HNUA 3EX3A 4FNUA 2QCMA 3W76A 1HL2A 5G1YA 5F1VA 3W22A 1MEWA 2QCFA 3DKLA 2QCEA 3STCA 2OZ0A 1LZOA 4CNOA 3NM1A 4ALDA 2GPTA 3EX4A 3L0GA 1JCJA 3AJXA 3DU0A 5I3JA 2ATSA 3C2RA 1EP3A 1VYRA 5LNWA 2ISVA 4M6PA 3HGJA 3QFEA 3GAYA 4MOZA 1HO1A 2J6XA 1O94A 3C2FA 3LXBA 3CQ0A 5AYZA 1QOPA 1LM1A 2PRMA 2OMAA 3DZ1A 2NUWA 3PBYA 1HO4A 3R12A 4FXRA 2FPTA 4O14A 1VS1A 1LBFA 4Q4KA 3CLMA 3NZ1A 3E12A 1R47A 3W1TA 3G3DA 4P61A 4MY9A 3LCGA 1WQ5A 2GVGA 4O1DA 5BRBA 2H6RA 2OX1A 4XBKA 4X3ZA 1S5VA 3LXAA 2JKPA 1TTIA 2YFNA 2VFIA 2JKAA 3L2IA 1QPOA 5HULA 5EBUA 5J5DA 2KZHA 4NZFA 4HN4A 3M5XA 5EKYA 5G2HA 2JGQA 2RDTA 2VFHA 3FA5A 3G0SA 4K7VA 4DF2A 5MHBA 3S1WA 4LNYA 5AHMA 4IGHA 5AHEA 4FXSA 1HTIA 4E2DA 3MHFA 4DPPA 5A8GA 3W1XA 2V8ZA 4ICNA 3NL2A 2A2IA 1F74A 2Y88A 5DY2A 3HG2A 1VZWA 3CPRA 5CG7A 4HNTA 5AC8A 3CWOX 2QKFA 1ZY9A 3G1HA 1QFEA 3MBDA 4JTEA 1QPRA 1OX4A 3HG5A 1GVFA 1MO0A 1ONRA 1QO5A 1J4EA 3OA3A 3W1PA 1KFCA 1GVRA 3O6CA 1H1YA 3KVJA 1M7OA 1V5XA 3LB0A 2C16A 5FEPA 3E0IA 3PR2A 4AWTA 2Y7FA 2A6LA 4FNQA 4EF9A 1F7BA 1B4KA 3K30A 3C2OA 3IIPA 3MP3A 1U5JA 4JDBA 1SQ7A 3TSMA 3NQ7A 2A4AA 3ANYA 1LOLA 3I68A 1FQ0A 1GVQA 2QDGA 2VFEA 3NOEA 2ZDRA 4X9SA 3QSRA 3KRSA 1QNVA 3T44A 3MI3A 1DQXA 3WJYA 4GJ1A 2YW4A 4Y8FA 3C3NA 1GOXA 4GXMA 1FBAA 5DCBA 1H61A 1SO6A 1PS9A 2OJPA 1TPVA 1VGAA 3C8FA 3PS7A 4QSHA 3FKRA 3CHVA 4MKNA 1C9DA 4KWVA 4PL1A 4MY8A 1K7FA 1I4NA 5D2WA 1ML1A 5D2XA 4NJIA 5KTLA 5AHFA 2R14A 2A6NA 4UCGA 5D32A 3LHZA 2CFFA 3TQVA 5CZ0A 1F6PA 2TYSA 4L4LA 2EF9A 1ICSA 4ZQNA 4Q33A 1VCFA 4WY0F 1QR7A 5K9XA 4O8RA 3ABRA 1CX9A 4N9BA 3VKJA 3GKFA 3NAVA 4H3DA 1KLYA 2CLMA 5I3HA 2XN2A 1W3IA 4ZVJA 3THAA 2E6DA 1VJIA 2V82A 2QCCA 4DO5A 2FPYA 3MHUA 1OVDA 4NJGA 1JCLA 3S0CA 3L5AA 3EWYA 4K39A 1YXYA 3BVJA 3STGA 1TPUA 5TIMA 1M6JA 4PFMA 4CCCA 4UR7A 1Q6QA 1OFEA 1PIIA 2WOQA 3EWZA 2VFDA 4G1KA 5F2GA 4MZYA 4XKYB 1RQEA 4AB4A 2Y61A 2IQTA 2YSWA 3GIYA 3W7EA 4E2BA 3V75A 2DZXA 1OFOA 2YDAA 4D2JA 3L5MA 5I3KA 3C52A 1DQWA 2NUXA 1FCBA 4FIQA 1TPFA 1YXCA 1PVNA 1YXDA 4LVFA 2VEIA 4MUZA 1LCOA 1W37A 2EKCA 5DBUA 3W7DA 3N34A 1KM4A 2VEKA 1FWRA 3O63A 1NSJA 2R91A 2ZTKA 1EP2A 2P1FA 5CPNA 1O5XA 4HNNA 5LHFA 1VRDA 5KMYA 5DBTA 3GDKA 3S1UA 2VXNA 1PL9A 3NL6A 1KFBA 4Y9AA 4ZMGA 1KFKA 1LBMA 3FOKA 1QPNA 1H63A 3OVPA 2E5CA 3A22A 3HPSA 2A85A 1RQHA 3GX9A 1DORA 3QH2A 3IV3A 1KTNA 2WV8A 3BLFA 3BV4A 1SO3A 4GUJA 4HT3A 3QSTA 5U7SA 3W84A 2QR6A 1W0MA 4UTWC 3ZWTA 1WOAA 4MFEA 1OJXA 5DCDA 5EY5A 2CLIA 1H7WA 4IXXA 4YCOA 1PHQA 4MY1A 3L65A 5F4WA 1OK6A 3QPZA 3IVTA 4DEFA 4EIVA 1F6KA 2RDWA 3NGJA 3UWQA 1G4EA 1HFBA 5D2YA 1I2OA 2D73A 1WOBA 2CZEA 3ABSA 2BZNA 2E1DA 3LM7A 3TCEA 5DXYA 3KVKA 1LLZA 1AW1A 2CZFA 1B57A 1RR2A 4N02A 1GVSA 2Q8ZA 3UWWA 1GVOA 2CLLA 1U83A 3LV6A 1WBJA 4FX6M 4CQ8A 5IM51 2CZ5A 4BWLA 4B5NA 2C3ZA 5LNUA 5HINA 1L6WA 3P84A 1KV8A 5D37A 2B4GA 3UY7A 3O07A 4RZ6A 3WK0A 3U6WA 2Q3RA 1QPQA 4IXHA 1TRIA 2V2HA 2XN1A 3QRHA 3FIGA 2B7QA 2DZSA 4A29A 1VR6A 2G95A 1SUXA 4UMBA 4LY8A 1JVNA 3P82A 3W7QA 3SFKA 2AQWA 4OWGA 4PEKA 3PF3A 2J88A 3B03A 2H3DA 5DY3A 4JX4A 1H7OA 1IGSA 2O7QA 3RLUA 2NXIA 1R2RA 2EPHA 1VLIA 5LGXA 2E5DA 5EL1A 2X2GA 2AGKA 3SECA 1SW0A 4O12A 3E02A 3W83A 5KSWA 3W9ZA 5BMWA 3LLFA 4IOTA 3JS3A 1JRBA 3LDVA 3B04A 4ADUA 5G4EA 3P67A 2A7NA 3C56A 1XKYA 4NX5A 4UTUA 5CZJA 4UTTC 1WDWA 4ML9A 4AF0A 4CLMA 2RDUA 2Y7DA 3PBVA 3TMQA 4O4VA 3TC6A 4OU1A 4P2VA 3EWBX 4HSNA 4AHPA 1SZGA 3ZFHA 1PV8A 1I2RA 1YPFA 1MXSA 3NQFA 2YGYA 1H1ZA 4AWUA 4UFKA 3PG8A 4UNKA 3GNNA 5G1TA 4N9DA 2JGYA 3N14A 5AHIA 4JIPA 5CKSA 2FQIA 4UR8A 3L67A 4DBDA 1GJPA 5LHEA 4M5PA 1X6UA 2QCHA 3NQDA 1FWTA 3O6YX 3WJXA 1W5OA 4CCDA 5AC7A 4NJHA 1G4TA 4MJZA 2WO5A 4BI6A 2QUUA 1ZHAA 4JDYA 4A3UA 3TFCA 4FX7A 1W54A 2EAWA 1G4SA 3SSJA 5CPMA 2X1SA 5KZDA 4AWSA 2E68A 3EWXA 1ME8A 5BNKA 2E6FA 4M19A 4O54A 3S1XA 4WOQA 3TJLA 3PUEA 4GFSA 1O95A 3FYOA 1FCQA 1IXOA 1K8YA 1S5WA 4AHQA 5L6UA 4O0ZA 4MLJA 1JQVA 4MFDA 1JULA 4OE7A 2YYUA 3WJSA 3NQVA 2NUYA 4RV8A 1OYAA 3MUXA 1K8XA 1W5PA 3B05A 2RKXA 4GNJA 4RCXA 3N9RA 4M6QA 4WOZA 2V2CA 2C14A 4GC4A 3EB2A 3S5NA 5C5YA 4PH6A 3G3MA 1KM2A 2JK2A 3OIXA 2DORA 2CLFA 5F2LA 4H4IA 3DI1A 4IWWA 3G0XA 1SPQA 1XFBA 5AHNA 1WX0A 3LI1A 2FFCA 3RFAA 3TXZA 5HUOA 4UUIA 3RF9A 2TSYA 2Z0IA 1L9WA 1Q6LA 4UIOA 1OK4A 4KFOA 3M16A 3T55A 2CLEA 1Q6OA 5HMSA 1OFBA 3TR2A 1K7XA 3W3OA 4FEZA 1M5WA 2X1RA 3N2MA 5D03A 3L21A 3OVRA 3P7YA 1SSDA 1SZNA 1PCWA 3CT7A 2RH9A 4JICA 4ORIA 4DXVA 4O1BA 3GDLA 4U4MA 1DV7A 4CQ9A 3TFXA 3W7GA 1AL7A 3BARA 2NXGA 3HOJA 4LRSA 3FKKA 3THQA 3F03K 3P8JA 3CIXA 3W73A 2ZZ2A 4BR1A 1L6SA 4O16A 4OGZA 4N6FA 3NQ2A 4UMAA 2Y63A 4O15A 3I7SA 2P10A 2YXGA 3M44A 3M41A 3VI2A 3ZWSA 3H55A 4WXZA 1C29A 4TX9A 4IJBA 4JR5A 4NVTA 3W7PA 2TMDA 1VLWA 3TU9A 5KZMA 3STFA 2ZFAA 3G18A 3RMJA 5FF4A 1XBZA 2DZVA 4GWEA 1WYIA 3UY8A 5AN7A 4CNPA 3ZR4A 3W85A 3B8DA 1R2SA 1H51A 1W31A 2HSAA 1LP6A 3TROA 3SIZA 1TTQA 3W1MA 3NL5A 5K4ZA 1EB3A 2WKJA 2R8WA 3HG3A 1OHLA 3W7KA 1LTDA 3UYCA 3C61A 3P61A 3KOFA 1FWWA 4XZ9A 2WQPA 3N3MA 3L68A 1YPIA 4OV4A 3M5YA 5AB3A 1W8SA 1A5CA 2QF7A 1GG0A 3GDRA 3TE9A 4L4MA 1IXPA 3DAQA 5LGZA 3I7RA 1TV7A 3LRMA 2WSRA 1EWEA 2ZQ0A 4AHOA 1O5KA 2VENA 2E5BA 5IBXC 2FDSA 4DQWA 4E0CA 5EYWA 2H8ZA 1ICPA 3W1QA 2VFGA 5LSMA 3UPWA 3CU2A 3LCXA 4GUHA 3NQAA 4LUIA 3TDFA 2PCQA 3MYOA 3VNDA 4IX0A 1TRDA 5CZSA 2WSYA 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 3ZS4 A;  1YAD A;  1YTD A;  2YX0 A;  3OHI A;  2C6Q A;  2VC6 A;  5DLC A;  4U28 A;  1TB3 A;  2B0M A;  2V5B A;  5AC6 A;  3TC7 A;  3NA8 A;  1TYG A;  3EXR A;  3M1Z A;  4XBS A;  4NNC A;  3PWA A;  3KX6 A;  1NAL 1;  3SI9 A;  2DJX A;  1KBI A;  1KFJ A;  1OFA A;  1GT8 A;  2V0T A;  1LOQ A;  3C2V A;  5TQL A;  4LVD A;  1P4C A;  1S3H A;  4IPJ A;  2NWR A;  4WXY A;  3TXV A;  3IGX A;  3MW7 A;  1G7V A;  4UTJ A;  5T26 A;  3EXT A;  3LHU A;  1OG0 A;  3PVF A;  3BGG A;  3Q2D A;  3R8R A;  1K7E A;  4QM1 A;  1TPD A;  2A21 A;  5EA9 A;  2ZZ6 A;  4GBU A;  3GDM A;  3O16 A;  1Q3N A;  4N4Q A;  2QJI A;  1H7N A;  4RK8 A;  4KWW A;  2NLI A;  3CTL A;  3O1N A;  3QQ0 A;  3G8E A;  3TAK A;  5LKY A;  2ZRX A;  4S2C A;  3DFO A;  1G4P A;  3LV5 A;  2ZZ5 A;  1JUK A;  3U2O A;  3P5Z A;  3GR8 A;  2VEM A;  2YCE A;  5K9C A;  2H8X A;  4FNR A;  2ZZ1 A;  2ALD A;  5HNR A;  4YCP A;  3HB9 A;  4I9A A;  3IVS A;  2C19 A;  4BWL C;  3KHJ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3DGB A;  1XWY A;  1M65 A;  1E4L A;  3NG3 A;  1LLW A;  4H1Z A;  3R4I A;  2X0S A;  1KV5 A;  4A3H A;  3HGS A;  3UW6 A;  4XAZ A;  1DBT A;  3MUA A;  3UEQ A;  4AIU A;  4J9J A;  4B15 A;  1S46 A;  3BG3 A;  3QR0 A;  3GB6 A;  3NQ6 A;  4NZ4 A;  4FOK A;  1BG4 A;  2I56 A;  1U30 A;  1LRO A;  4I3G A;  1DWF M;  3KXQ A;  3OZM A;  4TVC A;  3AS3 A;  3PUD A;  4AX6 A;  2GGG A;  1JNE A;  4C7F A;  5C9Z A;  3UQN A;  1WZL A;  1ZPT A;  3KRZ A;  3TJX A;  2ZA3 A;  1E1F A;  4JD4 A;  1CGW A;  1DHK A;  4XUG A;  1KRB C;  2C1H A;  3W23 A;  4J27 A;  2ABB A;  1XLI A;  2INF A;  1S2U A;  1JPK A;  1YW1 A;  3NZP A;  2FZN A;  3ABO A;  4NU7 A;  3KCJ A;  1QI4 A;  2C0H A;  4PCP A;  5C9W A;  2QF8 A;  4PBF A;  4QNW A;  3OLG A;  2QUV A;  1PHW A;  4L61 A;  1CWY A;  1NIU A;  3B3D A;  1FWN A;  2OO6 A;  2VJX A;  1BYA A;  1QDS A;  1KNW A;  1TZZ A;  3S1V A;  5F1U A;  1B3Z A;  3UJR A;  1XYL A;  2V3G A;  4TR9 A;  1Y65 A;  2TAA A;  4QDW A;  1ZAI A;  1NJJ A;  1RCQ A;  1E0U A;  1X1Z A;  5E0C A;  3JVA A;  4L64 A;  4KMQ A;  4AD2 A;  2QHA A;  4YIW A; 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